2P0GA

Crystal structure of selenoprotein w-related protein from vibrio cholerae. northeast structural genomics target vcr75
Total Genus 22
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
22
sequence length
78
structure length
78
Chain Sequence
KAQIEIYYCRQCNWMLRSAWLSQELLHTFSEEIEYVALHPDTGGRFEIFCNGVQIWERKQEGGFPEAKVLKQRVRDLI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Selenoprotein W-related protein from Vibrio cholerae.
rcsb
molecule keywords Selenoprotein W-related protein
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Vibrio cholerae
total genus 22
structure length 78
sequence length 78
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-02-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10262 Rdx Rdx family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2p0gA00
2DC5A 1FB6A 3IDVA 5D9VA 3ZITA 1PGTA 5AGYA 2H30A 1SYXA 3DGQA 1XXUA 2MMZA 2L57A 2BJXA 1XFLA 3FK8A 4FIWA 2X8CA 13GSA 1K0MA 4DSSA 1NW2A 5IOWA 1QUWA 3LEFA 2DBCA 1AUCA 5GZZB 3KIJA 4XTSA 3IPZA 3GMFA 3EWLA 3RBTA 1UC7A 2C0GA 4XIHA 2CT6A 4XCSA 3DD3A 5JWQB 2ZUPA 4ZBAA 1J08A 1Z9HA 4JZQA 2IJYA 2LS5A 3CSJA 1A24A 1PKWA 4CW9A 3RHCA 5G30A 4J56E 1QMVA 4RI6A 5HQPA 2L5LA 3W6GA 3GTUB 2FLSA 3A2WA 2FA8A 4K7OA 1GTAA 4KW6A 1BAYA 3VI5A 5ECQB 2JSYA 4GWRA 1EZKA 20GSA 4AF2A 1M9BA 3HJOA 4L0UA 2H6XA 3TJFA 4V1Ag 4LLRA 5JWOB 2GT6A 1XW5A 2EIRA 1AIUA 5CP1A 3WD6A 1TI1A 1TRSA 2H0GA 1USBA 3IR4A 2KLXA 2YV9A 3CRUA 4HEA2 1BJXA 2CAQA 3IK7A 3C73A 3P7XA 4POMA 4HQZA 1SK1A 2YWMA 2A2RA 4NWYA 2L59A 1OKDA 1V57A 7GSSA 4Q5QA 1EOGA 11GSA 2AV4A 1YY7A 4GCIA 3TKRA 2IL3A 1JLVA 2V6KA 2X8GA 3P2AA 2H1BA 2VL3A 3CSIA 3VPQA 2DJ1A 1URMA 1AQVA 2GDRA 4K8MA 5F07A 4YQVA 2FWEA 4KA0A 3L0HA 4FYCA 4JR4A 1V9WA 2PVOC 3IHQA 1Z6MA 3GKNA 5GAPD 1I9DA 4L8EA 4ECIA 2PU9C 3QOUA 4NV5A 1A0FA 5ELAA 3IBHA 4F2IA 4ZXGA 4TRXA 3GUSA 1TDIA 3EINA 3UVHA 1WIKA 4ML6A 5CNWA 2H75A 2MYGA 4JU5A 3N5OA 4MJAA 4K0GA 2YNXA 3FZ5A 1GUMA 2R6KA 4DVCA 2B6MA 2GSSA 1XW6A 3EVIA 3GYKA 2R5GA 1GNWA 3I69A 2AHEA 4G2EA 4LMVA 2E2MA 4ECBA 2VUPA 3DEXA 1B8XA 3ZVJD 3HJPA 1WRYA 3F0IA 4KAEA 4OFMA 1YEXA 3GIXA 2JZSA 4FO5A 2WGRA 2H66A 2VL9A 1R7HA 4V2NA 1EP7A 2DIYA 2HSYA 2LNSA 2HNLA 2L6DA 3QCPA 2YJ7A 2OE0A 4KX4A 1A2MA 1EEMA 4Q5NA 5CRGA 2L4CA 3QMXA 3F3QA 4X0XA 1ZYEA 3TGZA 3VWVA 2LJAA 3GSTA 4O92A 2FNOA 1PX6A 4N10A 1N2AA 4AGSA 2B5EA 1TKDB 1Z7RA 3ZVJA 2DSAA 4MK3A 3IAM2 1MDJA 1O8WA 3Q19A 2HT9A 4ZL8A 3CTFA 1S3AA 2OE3A 2TIRA 3IOSA 3KMNA 1XIYA 4IVFA 1QQ2A 2AYTA 2LSTA 4V2MA 4ACSA 3IXRA 2PN8A 5ID2B 4KE3A 1W89A 3NZNA 3ISOA 2C8UA 4KCAA 3WGXA 1TU8A 1X9WB 1ILOA 2G0FA 2HZFA 2A4VA 1SKRB 1F37A 1EEJA 3Q18A 3FKFA 1XWKA 3C71A 3D5JA 1Y25A 1T00A 2N5BA 5IPHA 2K8VA 4GRFA 1EWXA 2HZEB 1S3CA 3TJKA 2O85A 1QFNA 1GSQA 1DUGA 3UMAA 3MSZA 1NSWA 1E6BA 5IMZA 1N8JA 3A5WA 2KP1A 4ISDA 1GSUA 3L9SA 3BCIA 1SENA 1BG5A 3LG6A 4NHWA 3J7Yb 1A8LA 3HVXA 3G7YA 4K9ZA 1XWBA 4HZ4A 4MF6A 4BVYA 1FB0A 3LFLA 3TJBA 5IMVA 3I43A 2VM1A 5EVOA 4YQUA 1XPVA 4CHSA 1MTCA 5JCUA 4KDYA 1X5EA 4MJBA 3MWHA 3M8NA 2ZCTA 2KUCA 3ERGA 2AUVA 2LQOA 1OAZA 3GTUA 1TOFA 4YQMA 2R37A 2LRNA 1QXHA 3RDWA 5ECPB 1DE2A 1GTBA 3F4RA 3EC3A 1Z6NA 4TOPA 4GQCA 5D9XA 5ABRA 2WFCA 4NPBA 1MD4A 1O81A 2GZZA 4GF0A 3TKSA 3FHKA 4MP4A 2E2GA 3KH9A 12GSA 1AXDA 2HLSA 4O5RA 2KP2A 1NM3A 2P31A 3HZ8A 4ML1A 1FO5A 3SBCA 2GT5A 1ZZYA 1TTZA 5DQSA 4EKZA 2C0EA 2V6OA 3FZAA 3TJJA 2EIQA 2YWOA 1V58A 3QDNA 3UOMA 1A0RP 1PA3A 2H1AA 1PN9A 4MA9A 3BD2A 4LA1A 3QFBC 4YAPA 4POBA 2D2ZA 4Q5RA 2YP6A 5ECIB 1ON4A 4EDYA 1M9AA 2CZ2A 1PL2A 4PURA 2CAIA 5J41A 4WF5A 4IQ1A 3TRPA 4I2UA 3WYWA 1F3AA 4G10A 5D96A 4LL1B 5IQYA 3L9UA 1SJZA 3ZMLA 4PQHA 2GZYA 4NV2A 1J0FA 1F9MA 1V2AA 4IJ3A 3N9JA 2B1KA 5IMCA 2H72A 4MH2A 6GSYA 3TOUA 1A2LA 5LNKe 3O76A 4KUNA 1YEPA 1OKTA 2GSQA 2FY6A 4I6XA 1PKZA 5EL8A 3IK9A 3SWLA 3QAGA 2OKAA 4GQFA 2J23A 4AJ6A 4IHUA 1FVKA 5C00A 5AISA 1ABAA 3GA4A 4ZB6A 2B7KA 3VURA 3CRTA 2YCDA 1TK5B 1K3YA 5FHIA 5IO0A 3KP9A 1KEBA 3GKKA 1UVZA 8GSSA 4K6XA 2XPDA 5KN1A 4IQAA 1VF1A 1GUKA 5CRHA 1GSEA 2IN3A 4FYUA 4MZBA 3F6DA 2RM6A 2Z9SA 5IMAA 5FT3A 1QGVA 2LQQA 2JADA 4ZB9A 2K6VA 5D73A 5B6MA 3GH6A 3ZLPA 4Q5FA 5B6NA 2X64A 2GSRA 5ECLB 3FZ4A 2CQ9A 4IS0A 1TRVA 2LV3A 1LU4A 2N5FA 6GSWA 2IPAA 1GP1A 2H0HA 3D0ZA 1G7EA 1GUHA 2F8AA 3UBLA 2HE3A 5G31A 5ID2A 3TJGA 1G7OA 5D8IA 5LCZA 2CVBA 5J3RA 3H8QA 5DVBA 1WPIA 3QD9A 4OCFA 3PINA 4RI7A 1Q98A 2HRFA 3HZ4A 1G6WA 1X0RA 2O89A 2PUKC 3DVXA 3IE3A 2VIMA 1XOAA 3GN3A 2M80A 2C3TA 4PXOA 1U88A 1K0NA 3W8SA 3DIEA 1MDKA 2FWHA 5AN1A 1YJ6A 2HZEA 3PH9A 3APSA 2QKEA 2YOIA 5KN3A 4TR1B 4RQRA 1U3AA 3HCZA 3ZL5A 3VWXA 5G1LA 4LMWA 4QL9A 4I97A 4J57E 5KN2A 3P8WA 2LEGA 4V2LA 4ID0A 2C80A 4FH8A 1VRSD 1ERTA 1HD2A 2IFQB 5DAKB 3TOTA 5CAXA 1YF1A 3OR5A 1FHEA 4XS1A 4XRDA 4ZBDA 2MMNA 3US3A 1XVWA 1GSFA 4L5OA 1F2EA 4EUYA 1DSBA 3HA9A 2I1UA 4BA7A 2H0IA 3LYPA 3LQ7A 3EMPA 3QAWA 2GQKA 4P3YB 2WRTA 3IRAA 1T1VA 2NDOA 5F0GA 2IMDA 1M0UA 19GSA 1O6JA 4HZ2A 2K8SA 4IJIA 4MPGA 3KMOA 3HD5A 1EP8A 3A2XA 2LRTA 4MDCA 4TVEA 1A8YA 4N30A 3R2QA 1V40A 2GS3A 4IBPA 4OO4A 1JZRA 4EE0A 5AIXA 5ECSA 1VGLA 2B5XA 4I2TA 1Q4JA 2ON7A 4TXOB 1X9SB 4TW5A 4MLYA 5HR3A 2H6YA 1GTUA 3RHBA 4N0VA 4PNGA 1X9MB 3M3MA 6GSSA 3VI7A 3UVTA 5F06A 3H93A 5J9CA 9GSSA 4TR4A 2NBSA 2K9FA 4GTUA 2XBIA 1T4YA 4L5LA 3APQA 4K1FA 2TRCP 2V1MA 1FAAA 1GULA 1O8XA 3GX0A 1R5PA 3KTBA 5HR2A 1WMJA 1TU7A 2VL2A 2JZTA 1K0DA 3DMLA 5H5SA 1J9BA 2PVQA 4EC0A 2OBIA 1ERWA 4E8EA 1B4QA 2C1YA 3ZMKA 3RPNA 1AAZA 5HFKA 1W4VA 2XHFA 2FHEA 1TRWA 3TCOA 1T3BA 1XWGA 2FCHA 1MEKA 1B48A 1ZL9A 5DBQA 2E7PA 3QFAC 4X1UA 5B8BA 3LYKA 1WP0A 1NHOA 3TDGA 3RAZA 2AB6A 3GURA 5GSSA 2YZUA 3FZ9A 2FD3A 3G7IA 1SKWB 4OWYA 1SJIA 1WE0A 3VFIA 2PPTA 4WXTA 2PERA 5FWGA 2I4AA 2X99A 4WR5A 4EDZA 2G2QA 3QPMA 1K0BA 1TK8B 1ACVA 2H76A 1RW1A 2KHPA 5CRDA 2LKUA 2VAFA 2FGXA 2DJJA 5DCHA 3TRXA 4K7IA 5GSTA 3S9FA 4HOJA 2WJUA 2L5OA 3KTLA 1BEDA 4POLA 4PUFC 1XWCA 2WZ9A 4ZB8A 3F63A 1WWJA 3GNJA 1K0OA 1X5CA 1K3OA 2DJ2A 3HYPA 2HRNA 3KJYA 3C8EA 1GRXA 3E0UA 2VD1A 2FWGA 4DSQA 3WGEA 3H1NA 4QL7A 1PSQA 4EL1A 1BYEA 1Z7PA 3Q74A 4F9ZA 2JSZA 1DE1A 3E3EA 1SKSB 3CBUA 5COHA 2GGTA 2OBKA 4KB3A 2GQMA 3ZTLA 3KCMA 3CXGA 4MJEA 4N11A 5E4WA 1GSSA 1IYHA 2P5RA 1FOVA 3BBYA 1ST9A 4XS4B 4IP6A 4WKWA 18GSA 5F05A 2C0FA 4ECCA 1O85A 3GFKA 1EV4A 1SL0B 2IIYA 3EE2A 3CSHA 1DBYA 4IP1A 3ZIVA 4ZL7A 3PR8A 2M46A 4TR1A 3WT1A 1FVJA 3HDCA 2ON5A 2QC7A 22GSA 3D22A 4XRAA 1AW9A 2YZHA 4OCEA 5ECKB 3APOA 1TW9A 5HR0A 1ERVA 2QSIA 2LTKA 2NTOA 4WEYA 4MMMA 2VD0A 3W8JA 1T4ZA 3ZYWA 2IFQA 2AJQB 2F8FA 5DAKA 2H71A 1SD8A 3TB2A 2GSTA 5IO2A 4OFNA 1I5GA 3EURA 1CQHA 4MZWA 5B7CA 1TRUA 2HYXA 1ZCPA 3H79A 1XVQA 2DJ3A 2B3SA 4PNFA 2MMAA 4IW9A 1EGRA 3D4MA 4GXZA 3UJ1A 4JBBA 1OVNA 5A4WA 1SL2B 4K2DA 2B5YA 4KGIA 1ZMAA 2I81A 5JWRB 1THXA 2P5QA 1GH2A 4BWQA 1WOUA 3U5RE 1HNCA 3ME8A 4MF5A 3DYRA 2F9SA 5IMFA 4MCUA 3ZIJA 1THOA 2O8VB 3KEBA 4AJ7A 1OE8A 2RLIA 3KD0A 3TRQA 2ES7A 3DVWA 3VK9A 5KN0A 1VF4A 1M2BA 2C4JA 4GSTA 3H4KA 4YAVA 1F3BA 4MPFA 4G9HA 4GSSA 3MNGA 3TUEA 1UN2A 2VOCA 1B9XC 1PRXA 3O6TA 2VLTA 4NMUA 2MBSA 1PD21 2F51A 5IOXA 1WJKA 1YKCA 5INYA 2LUSA 3F3RA 4TKYA 1CQGA 4PUAA 3U6VA 4KNDA 3TKSE 4I5QA 4E8HA 2H01A 3FRCA 2OACA 1TP9A 2X8HA 5L71A 1TK0B 3A3TA 1FG4A 3HY2A 4G19A 5ELGA 1ERUA 3CTGA 4HI7A 1KBNA 2H8LA 1TJDA 16GSA 4HU9A 2CZ3A 2HI7A 2I3YA 1E2YA 1XWAA 4IN0A 3EYTA 2DJ0A 3DRNA 4JRRA 4NAXA 4F0BA 4GLTA 5J9BA 1A23A 3LORA 3CMIA 5A5KA 1JZOA 14GSA 1SL1B 4X43A 4RQXA 2O87A 3ZRDA 1O73A 4WBJA 4PX1A 2O7KA 1K3LA 3CYNA 4J2FA 3WGDA 3J7Yk 1GL8A 2CX3A 1SD9A 3KGKA 1OC3A 3DXBA 2QGVA 1T8EB 1T7PB 2H1GA 1JLWA 2DJKA 2RUEA 3EU3A 2WS2A 2LJKA 4DSRA 1GLPA 4TR0A 5F8BA 2I9HA 1OC8A 1M2AA 5DJLA 4L0WA 5G1KA 3P90A 3UL3A 3F4SA 4IELA 4MZCA 4EVMA 3GL3A 5ECOB 2BTOT 3EU4A 2K18A 2C3QA 2H74A 4IKHA 4D73B 2DIZA 5EPFA 3VLNA 3NOFA 3FEUA 3ZFBA 3ZFLA 2WULA 1ZGNA 1Z5YE 1V98A 2VL2C 3ERFA 3VWUA 5ECNB 3WT2A 3UBKA 5CO3A 2VO4A 2VM2A 2GLRA 2RIIA 4HDEA 4XS4A 2PBJA 3ERWA 1FW1A 1B9YC 5B8AA 2J9HA 3ZREA 1S3DA 6GSUA 5ENUA 2R3XA 3EMXA 2A2SA 4TXVA 1ZOFA 3FW2A 3Q6OA 2VCZA 5JCGA 2VCWA 3PGTA 10GSA 4RUVA 4MABA 1K0CA 4EXJA 1OC9B 4PQ1A 5D9TA 2V2GA 3O3TA 3IA1A 3BOAA 4MJCA 3M0FA 1YF0A 4OO5A 1NHYA 4KDUA 3L9VA 3GRXA 2R2JA 4IGJA 5D9WA 2IMEA 4XHMA 5AIVA 4ECJA 3L78A 5EY6A 5DDLA 5DALB 1HNBA 3L4NA 5IIZA 3LJRA 2YN1A 2DMLA 4TN8A 5G2ZA 4BPYA 3UARA 4KH7A 1ML6A 2EC4A 2GVPA 4QQ7A 1EV9A 3UIWA 4ZILA 3MDKA 3ME7A 1YKAA 4XS6A 1BQ7A 3LXZA 3VPTA 2VCTA 4TR3A 2GZPA 1Z3EA 1QK8A 6GSVA 4LL4B 4ZIJA 5IMDA 3V1WA 2ALBA 3FR9A 4KDXA 1H4OA 3D21A 4FYBA 3M1GA 2REMA 4BWSA 3LGCA 3HXSA 1YDKA 1U3IA 2H19A 3BCKA 3A2VA 6GSTA 5ECRB 1PMTA 6GSXA 1PQNA 1EOHA 2OE1A 3BJ5A 2IMFA 2WB9A 2FA4A 2DLXA 3M9KA 1JZWA 2VLVA 3F4TA 2OADA 5DCGA 3TKPA 3ZZXA 1U87A 3G9BA 2M72A 4JR6A 2KOKA 3LXTA 2FUG2 2XPEA 3KXOA 5G5FA 3RPPA 1XZOA 2CV4A 5J5NA 2OA7A 1K0AA 3DWVA 3G7JA 3HVVA 1KTEA 5H5RA 2JL4A 3NIVA 2MZCA 4HUAA 1YQ1A 1LJRA 1RK4A 1X5DA 1AC1A 4POKA 1GWCA 1SYRA 3VWWA 2XBQA 4DSSB 1VF3A 3D4TA 3TKSC 3IV4A 4K7NA 1JHBA 3AY8A 2C0DA 4ILFA 4KSOA 1M7TA 1A2JA 3MAKA 5CRWA 3F9UA 3K8NA 5KEJA 1R26A 2VCXA 5C04A 2HXKA 5E59A 2E0QA 3I6AA 4BVXA 1BX9A 3JCML 4O32A 1HQOA 1HNAA 2V41A 3UEMA 3F8UA 2JZRA 1G6YA 3LWAA 2YWNA 4F0CA 3C7MA 2P0GA 4KSMA 4PQIA 4YH2A 2GTUA 3C1RA 5GAND 1UA5A 1C72A 4NXIA 2CX4A 1ZYQB 4WBRD 5HR1A 3FR3A 4V1Ap 1OYJA 1XBSA 3HHVA 4ZL9A 2JU5A 1M2DA 2V32A 1XW9A 4HJ2A 2LRCA 2YANA 1R5AA 3FR6A 4DEJA 4WETA 2XC2A 5JCWA 1HYUA 3TKQA 3GHAA 2RM5A 2AAWA 5HFIA 1B4PA 3I9V2 4MF7A 2B1LA 4OMVA 4F82A 2PMTA 4H86A 3KM6A 2NVLA 1H75A 3GX8A 1PL1A 4EF0A 1M99A 2C3NA 4HQSA 1JFUA 5D93A 4GSNA 3C1SA 4ULXA 5J4UA 1XCCA 2YWIA 4HJMA 2WCIA 4O7HA 2GQLA 1GSYA 3M9JA 3HJMA 3KP8A 3HKRA 4D73A 1Y6EA 3GL5A 3GSSA 3KZQA 3ED3A 4N0ZA 5A4VA 2L6CA 3HVSA 4I8BA 1GLQA 3LSZA 2DMMA 2VCVA 1SU9A 2LJRA 5DQYA 2ZNMA 1MD3A 2H6ZA 2JACA 4CDOA 5ECMB 2MMOA 2BMXA 2EIOA 4HU7A 4PGTA 4ZBBA 3QR6A 17GSA 5H5QA 3GKMA 2YPMA 1TXXA 2MBTA 1OE7A 4MH3A 1LBKA 2N5AA 3KH7A 3DKSA 1R4WA 1OC9A 5ECHB 4K0NA 3IC4A 2H1DA 2F3MA 2WDUA 3E9JB 4BL7A 4F03A 5LD0A 2NPBA 1YZXA 4TXOA 4OD7A 4Z7XA 4AJ8A 5DALA 1SK2A 5HFGA 1SJ6A 4NHZA 3D6IA 2OJLA 2H73A 1KNGA 1O7UA 1IYIA 1G0TA 3F6FA 3GV1A 2H70A 4KCEA 2HSHA 1MDIA 5CREA 1SK0A 4EO3A 1TI3A 3QAVA 4HS1A 1F6MC 2B7JA 2VCQA 3IAS2 2YJHA 2L4QA 1PX7A 3FYGA 2VLUA 3FY7A 2CVKA 2YV7A 1VF2A 5IM9A 2PWJA 2RUFA 1AQXA 1GNEA 5DJMA 5IPGA 2IMIA 4WF4A 1XOBA 5CYYA 3GKXA 2HFDA 1JZDA 2LNTA 5G5EA 1GTIA 4JEDA 2IWTA 2R4VA 1EGOA 2FWFA 1RQMA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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