2P31A

Crystal structure of human glutathione peroxidase 7
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
QDFYDFKAVNIRGKLVSLEKYRGSVSLVVNVASECGFTDQHYRALQQLQRDLGPHHFNVLAFPCNQFGQQEPDSNKEIESFARRTYSVSFPMFSKIAVTGTGAHPAFKYLAQTSGKEPTWNFWKYLVAPDGKVVGAWDPTVSVEEVRPQITALVR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of human glutathione peroxidase 7
rcsb
molecule keywords Glutathione peroxidase 7
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 50
structure length 155
sequence length 155
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.9: Glutathione peroxidase.
pdb deposition date 2007-03-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00255 GSHPx Glutathione peroxidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2p31A00
1VRSD 4J57E 2FLSA 2IMEA 4BL7A 2YANA 3O3TA 1O85A 2YP6A 5ABRA 3J7Yk 4CHSA 4F82A 2GLRA 5KN3A 1SENA 2C1YA 3TRQA 2R2JA 1BQ7A 4ZXGA 5DAKB 2GSQA 3DYRA 3FZ4A 1GULA 1JLVA 4ISDA 3F9UA 4ECCA 1X5CA 4DSQA 2GSRA 1UC7A 3TOUA 11GSA 1O6JA 3DD3A 2G2QA 1KTEA 3GRXA 1HNCA 1GH2A 3DGQA 1XWAA 2KP2A 1NHOA 1K0BA 3ZL5A 2KOKA 2X99A 4TXOA 2JACA 3MNGA 1BG5A 1EWXA 3AY8A 4PQIA 2KP1A 5EVOA 4KAEA 1FO5A 3KGKA 3BD2A 3Q6OA 4V1Ag 4HZ2A 1FAAA 2M72A 1QMVA 5J41A 3IAS2 2YJ7A 2D2ZA 3FEUA 3KH7A 2FHEA 2PU9C 3F4SA 3KEBA 1YKCA 2WS2A 2GZYA 4KH7A 4V2MA 2LSTA 1A2MA 3VWVA 3RHBA 3CTGA 2X8GA 4D73A 1RW1A 2I81A 3APOA 2R5GA 3QFAC 2BMXA 4MMMA 4HU9A 1MTCA 1K3OA 2LJKA 4N0VA 5ECMB 4MA9A 1QQ2A 3UARA 4GWRA 5GSTA 2C0FA 3GMFA 3DEXA 4ML6A 4P3YB 2H71A 4V2LA 1M9BA 3GFKA 3GIXA 2LRCA 3UBKA 1TK0B 3L9UA 2DLXA 2GZZA 2YNXA 1M2DA 3CRUA 22GSA 1GSSA 2E7PA 3D21A 1GLPA 5FT3A 4WKWA 1XPVA 8GSSA 2XC2A 3TKSC 2OKAA 1SJZA 1YF0A 1OC9B 1X5DA 3GNJA 1GUHA 3QAVA 1R4WA 2IFQA 2VD0A 2FCHA 1X9WB 2CVDA 4I2TA 1TI1A 1IYIA 4IQ1A 5ELAA 4YAVA 3SBCA 5ELGA 3TKPA 3PGTA 4POLA 2JADA 2DMLA 1QK8A 4MPFA 3V1WA 3QD9A 5G30A 2H72A 1YY7A 2YN1A 3FK8A 2K8SA 2MYGA 1I9DA 5ECRB 2VO4A 1B9YC 4GLTA 4K6XA 1TK8B 1NHYA 5L71A 2GTUA 4MJCA 2DJ3A 2VM2A 4JE1A 1ERVA 2H01A 2IMDA 1THOA 4EO3A 4FYUA 2L5LA 3UIWA 1EEMA 3HJPA 4OFTA 3TJKA 4NPBA 1PRXA 3GA4A 2H70A 4IQAA 1JLWA 3WT1A 3C71A 5A4VA 2AJQB 3RBTA 1SKRB 4CW9A 4G10A 1Y25A 2HSHA 1WE0A 2DJJA 3K8NA 3W8SA 3D22A 4MF5A 4EE0A 2JZRA 2KUCA 1M0UA 2M80A 1T1VA 1RQMA 5ECSA 2G0FA 1A0FA 4EDZA 6GSVA 1IYHA 2YV7A 2IL3A 2O87A 5ECIB 2CA8A 4FYCA 2H1BA 2F3MA 3TJJA 1X5EA 2HZEA 3BCKA 3KJYA 1X9MB 3D4MA 2LJAA 2OACA 2IPAA 4ML1A 1AC1A 3QAWA 1SK2A 4XS1A 3ZVJA 1BYEA 2OJLA 1FG4A 5G2ZA 2F51A 3TUEA 2VIMA 4IELA 3FZ5A 5E4WA 5A4UA 1OKDA 4O5RA 2V6KA 4ZBDA 4DVCA 2XBQA 4IN0A 1PQNA 1BAYA 2WCIA 4ID0A 4F03A 2K9FA 4EKZA 3LYPA 3ZTLA 2MZCA 2FY6A 1TU7A 1GUKA 3HY2A 1A2LA 5LNKe 4WBRD 1S3DA 2VLTA 3QR6A 2F9SA 5CRHA 5DCGA 5IMAA 4G19A 4X0XA 1O8XA 4IS0A 2VL2C 1E6BA 1GTIA 1JZDA 1O8WA 1Z7RA 5D93A 5ENUA 1J0FA 3MDKA 1AIUA 4PQHA 4PUAA 3TKRA 1TJDA 3RPPA 3HA9A 2IMKA 2CVKA 1G7OA 1WPIA 3A2XA 1EOHA 3LEFA 4N30A 3FY7A 1URMA 2P0GA 3I43A 5GAPD 19GSA 1X0RA 3C1SA 1EGRA 1ERWA 1KEBA 1TRSA 2N5FA 4MP4A 2H30A 2CZ2A 5JWQB 2NBSA 1T00A 1OC3A 3IA1A 4Z7XA 4RQXA 2LJRA 1ZZYA 2KHPA 3F4TA 1XW9A 5DVBA 4ZL8A 3F0IA 1QXHA 3APQA 3KM6A 2DBCA 2JZTA 2V2GA 2BJXA 2E2MA 2OBIA 2VUPA 4I8BA 1GL8A 3WGEA 5DDLA 1R5AA 2C3QA 3G7IA 1PMTA 2QKEA 3QDNA 2GT6A 5IOXA 5DQYA 3D6IA 2B5XA 2NVLA 2FA8A 4ECIA 2B1KA 4KSMA 4KDXA 1XW5A 2O85A 3ZLPA 4OWYA 2VD1A 5ECNB 1ML6A 4FIWA 5IQYA 5FHIA 4AF2A 3D5JA 2MMAA 2H6YA 4TXOB 1TI3A 2LTKA 3G7YA 1SL2B 5EY6A 4PUFC 3M8NA 3H93A 3IK9A 4F0BA 2PPTA 3EU4A 3TKSA 1GSFA 1XIYA 4HS1A 1O73A 4XCSA 2O8VB 1XWBA 1V98A 1F2EA 2CAQA 2I1UA 4D73B 3NIVA 3F4RA 3ZFLA 4O32A 5CRDA 3BJ5A 3IPZA 1WIKA 2C0EA 2FWFA 1ST9A 4JBBA 1GRXA 1B9XC 1UA5A 4PXOA 1EP7A 4K0NA 4POBA 2E0QA 4QL9A 1AQXA 4O7HA 3ZIJA 2P5QA 4ZBAA 1TRVA 2LRNA 5F07A 4YQMA 4KGIA 5ECPB 2MBSA 5COHA 4HDEA 2CZ3A 3ZREA 1K3LA 3FRCA 5EPFA 5IMCA 5D9XA 1K0AA 1XWKA 5IPHA 1M9AA 2F8AA 1SJIA 3GHAA 4GQFA 1M7TA 4AJ8A 1M99A 3F8UA 2IFQB 1PL2A 5A4WA 1YZXA 1XVQA 3N9JA 5IOWA 3KD0A 1EV9A 1ERTA 2H8LA 4MZBA 5DALA 4FO5A 2FA4A 3JCML 1ZMAA 3E3EA 3EURA 1LBKA 4N0ZA 1ZYQB 4PNGA 4I97A 3IXRA 6GSTA 3LWAA 5J9BA 3F3QA 2WRTA 3QOUA 4PNFA 4IJ3A 1VF1A 4F2IA 2YPMA 4KCEA 4TRXA 4IP6A 3VPQA 5H5SA 3GH6A 4PURA 3ME8A 4EF0A 5H5RA 1PKZA 2AB6A 1ERUA 2L6CA 1SD8A 2PVOC 4MH2A 2C4JA 2HT9A 2VCWA 3Q19A 5J3RA 1O81A 2HRFA 3LYKA 4G9HA 3Q18A 3VLNA 1Z3EA 5CAXA 4EC0A 1GSYA 4LLRA 4KSOA 1ABAA 9GSSA 1YDKA 3RDWA 3HCZA 5C04A 4YQVA 4NAXA 3IRAA 2VL2A 4GSSA 1FVKA 2QC7A 3KIJA 3GX0A 2K8VA 1TW9A 2HZEB 5B8AA 2B6MA 2J9HA 3EMPA 2PN8A 3FR6A 1F6MC 4ZB9A 5DJMA 5GSSA 4L8EA 4BVXA 4HOJA 1U87A 2GS3A 3P7XA 5CYYA 1XVWA 2K6VA 2MBTA 2H0HA 2REMA 2EC4A 4LL1B 4NV2A 3WD6A 5J9CA 4J56E 3APSA 4RI6A 3LXZA 4ZL7A 1SU9A 1GP1A 1K0OA 4NHZA 5KN1A 3FKFA 2OE1A 2A4VA 2IWTA 3CSIA 4TVEA 1EP8A 4KB3A 2X64A 2ZNMA 2GDRA 5J4UA 3I69A 2FGXA 4L5OA 14GSA 2OA7A 3ZFBA 2L59A 2JSZA 4K1FA 1UN2A 3ZMKA 1K0MA 4K9ZA 3UVTA 3S9FA 1R26A 3IV4A 4K0GA 3C73A 1Z5YE 3UVHA 2WGRA 2VLVA 1F3BA 3I9V2 3UMAA 3WGXA 4MJBA 4OCFA 1TKDB 1GTUA 2V1MA 2YV9A 2YZUA 3M3MA 3GKMA 1F3AA 3I6AA 2YWIA 4V1Ap 3L78A 2H6ZA 3N5OA 2HSYA 4MK3A 1QGVA 5B6MA 5CREA 3L9VA 1BX9A 4LMVA 4HI7A 3TKQA 2EIOA 2VCVA 5HR1A 4KNDA 3HD5A 6GSWA 3GSSA 4LL4B 3KCMA 1SK1A 1TP9A 2FUG2 2B7KA 3MAKA 4JZQA 2IN3A 1T4ZA 3HHVA 2HYXA 4IBPA 1NW2A 4RQRA 2N5BA 3U5RE 4OCEA 2VAFA 4Q5QA 4NMUA 4TN8A 1T8EB 1PGTA 2B5YA 4TXVA 3GUSA 2L57A 4FYBA 2R4VA 5ECQB 2L6DA 2GSSA 4HUAA 3ZZXA 1TDIA 3P2AA 1B4PA 1KNGA 1V2AA 5CRGA 5AIVA 4E8EA 4IJIA 2NTOA 4KDYA 1R5PA 2WFCA 5A5KA 3TJGA 2IIYA 5C00A 2HI7A 4MF7A 1GNEA 3LG6A 4TKYA 3O6TA 2TRXA 3QMXA 4I2UA 2V41A 3ZITA 1WWJA 5G5EA 1XZOA 2NDOA 3F6FA 1HNAA 1YQ1A 4AJ6A 4TR4A 2ES7A 4F9ZA 2FNOA 4XRDA 5ECOB 1Q4JA 5JWOB 3TOTA 3IC4A 4JEDA 5DQSA 1AW9A 2C8UA 3FW2A 3P90A 1OE7A 1XCCA 13GSA 2HFDA 4I5QA 3KTBA 3C7MA 1LU4A 5FWGA 1TK5B 3LSZA 4PX1A 4BWSA 2L4QA 3O76A 4TW5A 5ECHB 5D9VA 5IM9A 4LA1A 3IK7A 4OMVA 2RM6A 2OE0A 4AJ7A 6GSYA 1JZWA 3VI7A 4ZIJA 4GXZA 1B48A 1FB0A 1I5GA 2VCZA 1AUCA 4X1UA 1TRUA 4E8HA 1USBA 2H0IA 1FB6A 1E2YA 1H4OA 1W89A 5KN2A 1Z9HA 4IVFA 17GSA 5DBQA 3US3A 2CT6A 5H5QA 4WF4A 6GSSA 5DALB 3UBLA 4EXJA 4AGSA 2WZ9A 4Q5RA 3GSTA 5D9WA 5B7CA 3A2WA 3TRXA 3FR3A 4XTSA 2GQMA 2JL4A 1Z6NA 3H8QA 2J23A 1AQVA 1BJXA 2VLUA 3HXSA 1FVJA 3TCOA 3HVVA 3ERFA 5JCWA 1TTZA 18GSA 3GX8A 4Q5FA 4MLYA 1DE2A 3DKSA 5JCUA 3TGZA 1SL0B 1FW1A 1YEPA 2EIQA 2YCDA 4YAPA 1N8JA 3VWXA 4GSTA 1R7HA 3ME7A 1PX7A 4ULXA 2H1AA 4K7OA 1U88A 1V9WA 4HU7A 1PKWA 4IGJA 3EC3A 1MEKA 4QQ7A 3QPMA 5F05A 4V2NA 4HJMA 1G6WA 2E2GA 5E59A 4ZL9A 1NM3A 1WMJA 1JZOA 3EYTA 1TRWA 4WBJA 2L4CA 1U3AA 1DBYA 3ISOA 4ZBBA 1MDJA 1PA3A 4ZILA 3UJ1A 1Y6EA 1N2AA 5HR3A 2V6OA 3LQ7A 4YQUA 4MJAA 4Q5NA 2DJ0A 5ECLB 1AAZA 1ACVA 2X8HA 2V32A 2F8FA 2L5OA 4RUVA 1OKTA 1OC8A 2DJ1A 2MMZA 2HRNA 3A2VA 1HQOA 1XW6A 4XHMA 3J7Yb 1SYRA 5AGYA 5B8BA 3LGCA 6GSXA 1RK4A 4GSNA 1CQGA 2OBKA 4QL7A 1DE1A 3D4TA 3CTFA 4MF6A 6GSUA 5HQPA 1GSQA 3MSZA 3PINA 2JSYA 3CBUA 2WULA 3HDCA 4WEYA 3VURA 1XOBA 2ZUPA 1ZL9A 2I9HA 1SK0A 3CYNA 3EE2A 4XS4A 3W6GA 1J08A 2KLXA 3FZ9A 3WT2A 1H75A 3G7JA 1DSBA 4O92A 4K8MA 4WF5A 2H76A 1XBSA 4GTUA 4GCIA 3M9JA 4EUYA 4N11A 2R37A 1GWCA 5D8IA 3A3TA 4TOPA 3GH9A 3G9BA 3KP9A 2ON5A 5IMDA 3QCPA 4MPGA 2PGTA 1JZRA 1K0DA 3EVIA 2H74A 4K2DA 5ID2A 3RHCA 2HXKA 4H86A 1OAZA 5ECKB 1G7EA 3GL5A 4OD7A 3E9JB 2OADA 3LORA 5GZZB 1FOVA 4ECBA 4ZB8A 4OO4A 2FD3A 3NZNA 4ACSA 3GYKA 2GZPA 1SD9A 20GSA 1XXUA 5AISA 1YKAA 2IMFA 2XHFA 2LUSA 1B4QA 3GTUA 1WOUA 3LFLA 3HVXA 4TR3A 3KMNA 3HKRA 2CVBA 3DXBA 2DSAA 4MDCA 5D9TA 3IHQA 4KA0A 5KEJA 1ON4A 5EL8A 1GSDA 4J2FA 1SL1B 1V40A 2DC5A 5JCGA 3DMLA 2B1LA 4F0CA 1GTBA 5IMVA 4KX4A 3GURA 3BCIA 3IE3A 4KDUA 3RPNA 2O7KA 4PGTA 4RI7A 1ZGNA 3E0UA 2WJUA 1V58A 3HZ8A 1DUGA 1GSUA 2VL3A 3EU3A 2H1DA 4NXIA 1XFLA 2X8CA 2M46A 2WDUA 4NWYA 3DRNA 4OO5A 2CX4A 3M9KA 2TRCP 2GVPA 2GT5A 3P8WA 1T4YA 2CV4A 2C3TA 3IBHA 3GL3A 3VPTA 4OFNA 1KBNA 4MZCA 2PMTA 1W4VA 2WB9A 4MABA 1ILOA 5AIXA 4ECJA 4BA7A 4XIHA 1PL1A 3CMIA 2DIYA 2RLIA 1K3YA 3OR5A 1K0CA 4WR4A 5G1KA 2H0GA 2LQOA 4IW9A 3ZRDA 4OFMA 1A8LA 2K18A 1GNWA 4MZWA 3D0ZA 1MDKA 4DSSA 1EV4A 1EGOA 1A24A 1SKWB 1HNBA 3DVXA 4POKA 2AAWA 4G2EA 3C1RA 2LS5A 2XPDA 3KH9A 1EEJA 2VOCA 4TR1A 2LRTA 5D96A 3UAPA 3VWWA 1F9MA 4EDYA 2LEGA 1OVNA 2R6KA 4EL1A 5DCHA 3ZVJD 3VFIA 2C0GA 1ZCPA 1EZKA 2MMOA 2C3NA 4HJ2A 3SWLA 1S3AA 5CRWA 3UOMA 4BWQA 3DWVA 4JR4A 3BBYA 3MWHA 3ZYWA 1ZOFA 2XBIA 3L4NA 4KCAA 2NPBA 3HVSA 4ZB6A 1WRYA 3KZQA 2PWJA 1QFNA 5B6NA 1HYUA 3H4KA 2B3SA 2Z9SA 1XWGA 5F0GA 5LD0A 4HQSA 3PH9A 4CDOA 2HLSA 4JRRA 5G1LA 1Z6MA 3KTLA 3HZ4A 3RAZA 2LV3A 2AYTA 3FYGA 4WETA 4FH8A 2VM1A 4TR0A 2LNTA 1GSEA 4HQZA 2LNSA 3GV1A 1WP0A 4IP1A 2P31A 5GAND 3DIEA 5DAKA 1QUWA 1J9BA 2AHEA 2GGTA 7GSSA 2CX3A 2YWMA 3WGDA 3VWUA 4ILFA 1SKSB 4IHUA 3FHKA 4WXTA 5LCZA 4GRFA 1PSQA 1MD4A 4WR5A 2R3XA 3H1NA 3TRPA 2A2RA 1C72A 2PVQA 3ERGA 2C0DA 3NOFA 5IMFA 2H6XA 1VGLA 2BTOT 2HE3A 2VCXA 2YJHA 1JFUA 1MDIA 5JWRB 1NSWA 1Z7PA 2H73A 4L0UA 5F8BA 3ZMLA 4K7IA 3TB2A 3VI5A 1MD3A 4MCUA 2AV4A 5HFGA 1F37A 4EVMA 4POMA 1XOAA 3CSJA 5DJLA 1OE8A 2LQQA 5HR0A 1Q98A 2TIRA 2XPEA 5F06A 1M2BA 3L0HA 2ZCTA 4GF0A 4BVYA 3TDGA 4DEJA 2QGVA 2O89A 2RUFA 4MH3A 3M0FA 1K0NA 1EOGA 4KW6A 4MJEA 2MMNA 4L0WA 2N5AA 2I4AA 5D73A 3TJBA 5KN0A 4XS4B 2YZHA 3LXTA 3WYWA 4IKHA 1XWCA 3EMXA 2EIRA 5CP1A 3KP8A 3QFBC 1A2JA 3ZIVA 3F6DA 4L5LA 5IPGA 5IIZA 1THXA 3GKNA 3FZAA 1B8XA 2DMMA 1VF3A 1AXDA 2GSTA 2JU5A 1AQWA 1OC9A 1VF2A 4LMWA 2FWEA 5ID2B 1X9SB 1S3CA 5IMZA 1VF4A 1SJ6A 2GQLA 2A2SA 2H19A 4K7NA 5IO0A 2FWHA 4HEA2 5AN1A 2YWNA 2B7JA 3CSHA 2CQ9A 4NHWA 2ALBA 3GTUB 5HR2A 1G0TA 2IJYA 1UVZA 1GTAA 3GKXA 2HNLA 1WJKA 2YOIA 3UEMA 5CO3A 3EINA 1HD2A 5INYA 3F3RA 2H66A 3KMOA 1TXXA 1U3IA 4BPYA 1YF1A 3PR8A 2JZSA 3A5WA 1OYJA 1A0RP 5IO2A 3TJFA 2QSIA 2VCTA 2RIIA 1PX6A 2GQKA 2RUEA 3EWLA 4JU5A 4NV5A 1TOFA 2FWGA 2DJ2A 3ED3A 3H79A 3R2QA 3GN3A 1O7UA 4JR6A 3U6VA 4DSRA 1SYXA 2OE3A 2DIZA 1A8YA 1PN9A 5G5FA 3M1GA 3ERWA 4X43A 1TU8A 3HYPA 1A23A 2VCQA 1YEXA 3C8EA 3IR4A 1V57A 2ON7A 2H75A 2P5RA 3LJRA 3W8JA 3KXOA 1YJ6A 2RM5A 2PUKC 2YWOA 2C80A 4N10A 3HJOA 1GLQA 4I6XA 3QAGA 1G6YA 3IOSA 4DSSB 3FR9A 1T7PB 2PERA 1JHBA 3TKSE 2B5EA 3GKKA 3IDVA 2AUVA 3VK9A 4XS6A 1FHEA 4PQ1A 3IAM2 3L9SA 2VL9A 4TR1B 2IMIA 10GSA 3CXGA 1CQHA 1LJRA 2DJKA 4KUNA 2CAIA 3F63A 5J5NA 12GSA 1M2AA 1BEDA 4KE3A 3DVWA 4HZ4A 16GSA 1PD21 1T3BA 5HFIA 3CRTA 2LKUA 3HJMA 2I3YA 5HFKA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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