2PWJA

Structure of a mitochondrial type ii peroxiredoxin from pisum sativum
Total Genus 39
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
39
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
LSAASNVSLQKARTWDEGVESKFSTTPVNDIFKDKKVVIFGLPGAYTGVCSSKHVPPYKHNIDKFKAKGVDSVICVAINDPYTVNAWAEKIQAKDAIEFYGDFDGSFHKSLELTTDLSAGLLGIRSERWSAYVVDGKVKALNVEESPSDVKVSGAETILGQI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Pisum sativum
publication title Structure of a mitochondrial type II peroxiredoxin from Pisum sativum
rcsb
molecule keywords Mitochondrial peroxiredoxin
total genus 39
structure length 162
sequence length 162
chains with identical sequence B, C, D, E, F
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2007-05-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2pwjA00
4L8EA 3ZRDA 6GSXA 4X0XA 3HVVA 3EMXA 1XWCA 1I5GA 4MZCA 1ZMAA 2IFQA 1WRYA 4HU9A 3GA4A 4XRAA 2F8AA 1DE1A 5J3RA 2H70A 2VD1A 3APQA 2YWIA 4PGTA 1AQXA 3F4TA 4LMVA 5HFKA 2VOCA 5D9XA 4MZBA 3I43A 2GSTA 1OKDA 2F8FA 5CRHA 3QD9A 5C00A 3DIEA 2LRNA 4RI7A 4JR6A 2YN1A 3DVWA 2IMEA 3ZTLA 4NMUA 5HR1A 1EEJA 4FO5A 4XIHA 5ECSA 3Q18A 5KN1A 1XWAA 4Q5FA 1XW9A 1TOFA 5L71A 2H73A 4HZ2A 3WGEA 3ISOA 3G9BA 1M99A 2PVOC 1SD9A 3CMIA 3ME7A 1OKTA 1EP8A 4K0GA 2VM1A 2K8SA 2LJKA 2A2SA 5FHIA 1Z7RA 4TR0A 5ECOB 4FYBA 1X5EA 3UJ1A 4QL9A 4ZBBA 5F05A 3TB2A 2PWJA 1FB0A 3IOSA 1XOBA 4IHUA 1K3YA 4G2EA 4TVEA 5LCZA 1TP9A 2KUCA 1PKWA 1ZYEA 1SJ6A 3TGZA 3J7Yk 1VF1A 4QL7A 3ZITA 2AB6A 4MPGA 4WBJA 2DJ2A 5ECQB 1B8XA 3NZNA 1XZOA 4ZBDA 4RQRA 3SBCA 1F6MC 3ERFA 5INYA 3IRAA 4V2NA 2CA8A 2XBQA 4XS4B 1GSYA 4N11A 1VRSD 3WT2A 5HR2A 3LEFA 3ME8A 5KN0A 5DQSA 2FY6A 1BAYA 5ID2B 1HD2A 1TDIA 3LG6A 1R5AA 2GSRA 3LORA 2O89A 4TRXA 1JZRA 4WF4A 2ON7A 3LYKA 3GIXA 1OC9B 5IO0A 3VFIA 5JCWA 1QUWA 5IMAA 3LYPA 3IAM2 2H75A 3QAGA 2IIYA 4NWYA 2WDUA 3P2AA 2ALBA 3E3EA 3IE3A 2ZNMA 4IELA 4J57E 2GS3A 3LFLA 5ECMB 2ZUPA 2FUG2 2VCTA 4GSSA 3FHKA 1I9DA 2HLSA 3VWUA 3A3TA 4GXZA 2HFDA 1U88A 5DQYA 3KP9A 1TK8B 2YWOA 4I97A 4KA0A 1EP7A 2H71A 4CDOA 1SK1A 2NPBA 2R4VA 1V9WA 3VK9A 2EIOA 1M9AA 1SK2A 2AUVA 5IMDA 2TIRA 3TJGA 8GSSA 4ZBAA 1LJRA 3D6IA 4PURA 5D9TA 2CT6A 1YQ1A 4J2FA 1V40A 2L6CA 2R3XA 4DVCA 1RK4A 4ACSA 4KSMA 1G0TA 1EV9A 1WJKA 4ZB8A 5IMCA 3EYTA 5AIVA 1B48A 1LU4A 3UVHA 2PPTA 4O5RA 2HXKA 2JZRA 4OMVA 1C72A 4LLRA 3TOUA 4PNFA 3DGQA 2H72A 2DJKA 3L9UA 3VI7A 5B6MA 2PERA 3GUSA 4ZB9A 1V2AA 1KNGA 3EMPA 1MDIA 2YCDA 1K0CA 2JADA 5DCGA 2K9FA 4KSOA 1YY7A 3QOUA 5IMFA 1A8YA 1YEPA 2C80A 2MBTA 5B8BA 5DALA 3FR9A 1USBA 4WEYA 3FY7A 1GTAA 5G5EA 1SJIA 1UC7A 3EVIA 4BWQA 2VM2A 3GN3A 2H19A 1TI3A 4K7OA 2MBSA 4K0NA 1O8XA 1R4WA 3FYGA 1TXXA 3DWVA 3I6AA 4N0VA 1B9YC 3D22A 1O8WA 3KEBA 3H1NA 3L4NA 2P5RA 4PX1A 3TJBA 2Z9SA 3NIVA 4MJAA 3LWAA 4MP4A 5G1LA 2KLXA 2C3QA 2V2GA 1ERVA 5IOXA 5KN2A 1G7EA 2C3TA 2A2RA 4IW9A 3TKSE 2YPMA 1YJ6A 4NPBA 1SK0A 2DLXA 4TR3A 3LQ7A 1TU7A 3TJKA 3MDKA 3HYPA 3GH6A 3VWWA 5A5KA 5DAKB 4KDUA 1ZZYA 3G7JA 4MF7A 3O6TA 5EPFA 2YANA 3IV4A 2M72A 2C0FA 4HU7A 2WZ9A 1ERTA 2H0HA 3L9VA 4TW5A 4HQSA 4JBBA 1A2MA 1XWBA 3UBLA 1SL1B 1SU9A 2RIIA 4F03A 5JWOB 1XVQA 1XOAA 1MTCA 4MF6A 1BG5A 3RDWA 5D8IA 1TRVA 1DUGA 4TKYA 5DBQA 11GSA 2E2MA 2AHEA 4PUAA 5D9VA 1GLQA 4LL4B 1JZWA 3Q74A 4AGSA 5F07A 3IXRA 5CRGA 2JSYA 4WR5A 2X8CA 3RHCA 4IP1A 3C73A 4XTSA 4K6XA 2B7KA 2BTOT 1PL2A 4POKA 4YQUA 2IJYA 1F3AA 5AGYA 1NW2A 1JZOA 2LKUA 3O3TA 5CRWA 2MYGA 3ZIVA 3QCPA 2VCXA 2LSTA 2KHPA 1ZL9A 3CTFA 1F9MA 3DD3A 3ZFBA 5LD0A 3TCOA 1FVJA 1QK8A 3IA1A 1SKSB 1EZKA 1F2EA 2C3NA 1NM3A 2WGRA 4OCEA 3BJ5A 1JLVA 10GSA 2K6VA 2X8HA 2P5QA 5FT3A 1UVZA 2HZEB 3IC4A 1ACVA 4BWSA 3GL3A 5EL8A 4MLYA 3HHVA 4MH2A 1PQNA 4ZL9A 3FR3A 5GSSA 2XBIA 1YF1A 1ZYQB 2GGTA 2F51A 3UIWA 1S3DA 3L78A 3TRQA 3LXTA 4RI6A 18GSA 2NVLA 2F9SA 2D2ZA 4X43A 1SL0B 2WS2A 3CTGA 1T3BA 5H5QA 4F0CA 2V32A 4HI7A 4IP6A 1E2YA 3HDCA 5EVOA 2HYXA 4MCUA 2CAIA 4ID0A 2OE3A 1SD8A 1S3CA 1WIKA 1VF3A 5ECKB 2H6YA 3H93A 4GCIA 2E7PA 5F8BA 2CVKA 5G31A 5ABRA 3TJJA 4N10A 2EC4A 1ZCPA 4TN8A 1HYUA 5H5RA 1GUMA 2FNOA 1PKZA 1XFLA 1R26A 2CVBA 2HI7A 3HA9A 6GSUA 2YNXA 1K0DA 1PSQA 2CVDA 1T1VA 1OE7A 1RQMA 2JSZA 1ML6A 2X99A 3N9JA 1TI1A 4Q5QA 2H1DA 3F9UA 1W89A 1ILOA 3KJYA 3WGXA 4EDYA 2JZTA 1XPVA 2GTUA 3D0ZA 4RQXA 3TKQA 1YKCA 2ON5A 1XXUA 1TRWA 1OAZA 20GSA 4X1UA 1NSWA 9GSSA 3UARA 2LQOA 2DJJA 3RPPA 4TXOB 3EU3A 3L0HA 1YKAA 2B7JA 2GZZA 5J9BA 1CQGA 1V58A 4L5LA 5D73A 2P0GA 4TR1B 1LBKA 1OC3A 2YV9A 3RAZA 4DSSB 5CREA 5COHA 3TUEA 3IR4A 2VAFA 2VCWA 2FWHA 3F0IA 1CQHA 7GSSA 3WT1A 2RUEA 3CBUA 1OVNA 1EOHA 2FGXA 3HY2A 1O81A 3M1GA 2QSIA 1M0UA 4MMMA 2HSHA 4D73B 4WXTA 1EGRA 4XRDA 5CYYA 1TU8A 3QDNA 3UEMA 2REMA 3GKNA 3HXSA 2I81A 3FK8A 1IYHA 4YAVA 4K9ZA 5ECNB 4EF0A 2LNTA 4V1Ag 5JWQB 4DEJA 2H01A 2LNSA 4MDCA 2DC5A 5IO2A 1A2JA 17GSA 4MZWA 5IQYA 4E8HA 1Z6MA 4O7HA 5J4UA 1NHOA 2JACA 4EKZA 2FWGA 3ERGA 3MSZA 1SKWB 2AJQB 1J08A 1TJDA 4ZB6A 3IDVA 3ZREA 3J7Yb 4GSNA 1M2DA 2LEGA 4POLA 2R6KA 3PR8A 3M8NA 1AQVA 3VWXA 1XW5A 2AAWA 2J23A 2IN3A 3HCZA 3LSZA 3EWLA 4I6XA 3C8EA 5D96A 1MD3A 3MNGA 2VUPA 3WGDA 2MZCA 4PNGA 2VCZA 5C04A 4KUNA 3R2QA 4MK3A 2DJ3A 4AJ6A 4KE3A 5ENUA 2R37A 4ECBA 1U6TA 2B1LA 3F3RA 1A2LA 2PVQA 5CNWA 3RHBA 4J56E 4OFTA 1RW1A 5AN1A 4PQIA 1K0OA 2I3YA 2FWFA 3ZVJA 4KH7A 1AUCA 2YWMA 3UMAA 4L5OA 1GSQA 5B8AA 5JWRB 4KCAA 2AV4A 1GULA 1O73A 4YQVA 12GSA 3G7IA 5LNKe 1BJXA 4HEA2 4KCEA 4MH3A 3ZYWA 1ON4A 1A8LA 3FZ4A 4KB3A 1K0MA 5IMVA 2ZCTA 2PGTA 4DSQA 1XWKA 5DCHA 2H6XA 1EEMA 2HT9A 2CV4A 2GQLA 3DYRA 4ZL8A 4GWRA 2YWNA 1S3AA 3GTUB 3GFKA 1FG4A 2J9HA 1OE8A 2OE1A 3TRPA 2H8LA 3BD2A 4ULXA 1SYXA 2M80A 4KDXA 3EU4A 4OD7A 3GNJA 3GL5A 1TKDB 1X5CA 4HDEA 3V1WA 6GSYA 4TOPA 1T00A 4I2TA 1U87A 3W8SA 3TKRA 2QC7A 1MDKA 4LMWA 3U6VA 1UN2A 1WMJA 3F6FA 4IN0A 4OWYA 2XPEA 4F9ZA 2WB9A 4F82A 1YEXA 1PRXA 1PX6A 2HE3A 3HD5A 3QAVA 4O32A 4PUFC 2NTOA 1V98A 4GRFA 3GX0A 2RUFA 3KH9A 14GSA 2IMFA 5F0GA 1KBNA 3C71A 2IFQB 2IMDA 1HNBA 3MAKA 1GSSA 1GSEA 3KZQA 1K3OA 3UL3A 1AW9A 2FWEA 1URMA 2OADA 3WD6A 1PN9A 3KTLA 4XS4A 3RBTA 3C1RA 2OKAA 2H1GA 4EDZA 3LGCA 4K7IA 4PQ1A 1OYJA 3KM6A 2RM5A 2L5OA 5ID2A 2EIQA 2JL4A 2VCVA 1WP0A 13GSA 2H30A 2WFCA 2K8VA 1Z6NA 2CZ2A 3G7YA 2TRCP 3N5OA 5HQPA 3Q19A 4Q5NA 5B7CA 2YZUA 1OC9A 3UVTA 1Z9HA 4OFNA 2KOKA 4OO5A 5IIZA 2H76A 3F6DA 2DBCA 2MMOA 1GTBA 3UAPA 2B1KA 2CX3A 1BX9A 4OO4A 3Q6OA 5CRDA 1J9BA 1FOVA 4IS0A 3BCIA 4HUAA 2VL2C 3D5JA 1QFNA 1VF4A 2DMLA 3LXZA 1Z7PA 3I9V2 3VI5A 3U5RE 2VLVA 5DJMA 1WWJA 2C0GA 4GQCA 4RUVA 1H75A 4BL7A 3E9JB 4HJMA 2GQMA 5ECRB 4G9HA 3C1SA 5ECHB 2HZFA 3GH9A 4BVYA 2X64A 4GQFA 4F2IA 2N5AA 2BJXA 3IBHA 2DIYA 2C0DA 3C7MA 4L0UA 4I8BA 1KEBA 2O87A 5A4WA 2YJ7A 3KGKA 3TKSA 5IPGA 3AY8A 4XCSA 2KP1A 5D93A 2VLTA 3WYWA 1JHBA 3APOA 4HJ2A 1M7TA 2C0EA 3UOMA 1F3BA 1GUKA 2HRFA 4IJIA 1B4QA 1G6YA 3HVSA 2M46A 3M3MA 2FD3A 2IPAA 2TRXA 2B5YA 3KIJA 3GV1A 4BVXA 1TRUA 3BBYA 1T8EB 3QFBC 1ZGNA 4NV2A 5B6NA 3A2XA 1AQWA 3KP8A 2NBSA 3TJFA 5KEJA 4YQMA 2PU9C 3FZ9A 1GNEA 1PX7A 3GMFA 2OBKA 3GRXA 1GH2A 4JU5A 4OFMA 4KNDA 4AJ7A 1EGOA 4IBPA 2DSAA 5J41A 1Q98A 2VL9A 3EC3A 3FZ5A 4MPFA 1GSDA 3US3A 1Z5YE 1J0FA 4ZIJA 1THOA 1VF2A 1ERUA 1G6WA 3D21A 4FYCA 3VPQA 3DMLA 4FYUA 2H1AA 3F4RA 1QGVA 3P7XA 1XCCA 3GHAA 2AYTA 3O76A 5EY6A 1MD4A 1YZXA 4YH2A 4F0BA 1N2AA 1EV4A 2VIMA 2LQQA 4ZL7A 2IMKA 5KN3A 3ZMLA 1GTUA 1ERWA 4K8MA 2R2JA 1A24A 4NHWA 5A4UA 3E0UA 2WULA 1PGTA 3GSSA 2LTKA 1HNAA 2XHFA 5DAKA 3DEXA 1X9WB 4AF2A 5GZZB 2I9HA 1R7HA 1T4ZA 1SJZA 6GSVA 2GZYA 3CSIA 1QXHA 3GX8A 3UBKA 4V2MA 5DALB 1TK0B 3EE2A 1HQOA 2VL2A 2EIRA 1V57A 3ZMKA 1YDKA 2YOIA 5JCUA 4JRRA 4P3YB 1SL2B 3IPZA 2GLRA 3QAWA 1WPIA 2B5EA 3S9FA 1GRXA 4QQ7A 1T7PB 2GZPA 4Q5RA 4WETA 3IK7A 3ZL5A 5ELAA 2IWTA 2PUKC 6GSTA 6GSSA 16GSA 2KP2A 1SENA 2YV7A 4V2LA 5DVBA 2E2GA 1A0RP 2QKEA 3FEUA 3F4SA 3QR6A 2L59A 3ZVJD 2IL3A 3ZZXA 5ECLB 2DIZA 1M2BA 3CXGA 1SYRA 2H74A 3VWVA 2GVPA 2YJHA 3L9SA 4N30A 1WOUA 1XVWA 3LJRA 1T4YA 3F63A 1THXA 4BA7A 2VLUA 1Y6EA 3W8JA 4PQHA 1EWXA 5J9CA 2X8GA 3HZ8A 4H86A 3IHQA 4IGJA 1H4OA 1W4VA 2V6KA 3KD0A 3RPNA 2DJ1A 5G5FA 4ZILA 3FRCA 5IMZA 4HQZA 3BOAA 1G7OA 1IYIA 5G1KA 3DKSA 5J5NA 2B3SA 2OA7A 5IPHA 2VL3A 1FB6A 2RM6A 1Q4JA 1K0AA 1K0NA 4IQAA 2HZEA 2V6OA 4DSRA 1GSUA 2K18A 3GURA 5ELGA 3M9KA 4ZXGA 2L4QA 2VO4A 4KX4A 1MDJA 1FAAA 3GKMA 4ML1A 2HNLA 2GT6A 4G10A 4IJ3A 4POMA 4CHSA 2YP6A 1K3LA 3PGTA 3H4KA 4JR4A 3A2WA 4K1FA 4XHMA 1GL8A 1FHEA 2PBJA 2PN8A 3BCKA 4ECCA 3HVXA 2LRTA 4E8EA 3FKFA 1X9SB 2ES7A 2FCHA 2N5BA 5F06A 4K2DA 4Z7XA 4EUYA 1E6BA 2LRCA 2LJRA 3W6GA 3KXOA 4GF0A 1X9MB 1N8JA 2IMIA 3OR5A 3D4MA 4JZQA 2CQ9A 4K7NA 3VPTA 3HJMA 4MABA 1GSFA 1PD21 5GAND 2MMAA 4MJCA 5E59A 6GSWA 3TKSC 3D4TA 3TKPA 3GSTA 3FR6A 1O85A 4GLTA 3JCML 3F8UA 2H66A 1B9XC 2P31A 2L57A 3HKRA 5HFGA 2GSSA 1PA3A 2A4VA 1YF0A 1X5DA 5IM9A 3TDGA 3EURA 2OE0A 3NOFA 2GT5A 1GWCA 1GP1A 4OCFA 3SWLA 1OC8A 3HJOA 5A4VA 2HSYA 1ABAA 1U3AA 4I5QA 2CX4A 2VCQA 4ECJA 2I1UA 1GNWA 2CAQA 4ECIA 22GSA 1HNCA 5AISA 4L0WA 1KTEA 3FW2A 2C8UA 3HZ4A 5HR3A 1GTIA 5GAPD 3TRXA 4TXOA 3HJPA 5FWGA 3GYKA 5ECIB 1A23A 4O92A 1DBYA 4MJBA 2O7KA 5G2ZA 1PL1A 1XWGA 5AIXA 3ZIJA 1PMTA 1ST9A 4TR1A 3VURA 4ML6A 1K0BA 2LJAA 2H1BA 4I2UA 2OACA 4DSSA 4AJ8A 2LS5A 4NAXA 1ZOFA 1UA5A 3M0FA 4CW9A 2OJLA 2JU5A 5H5SA 4D73A 5HFIA 4WR4A 3VLNA 4KW6A 4MA9A 4PXOA 4HZ4A 4XS6A 4WBRD 4NXIA 1Z3EA 3KTBA 19GSA 1M9BA 1GUHA 1O7UA 4IVFA 3QMXA 1SKRB 1A0FA 2WCIA 1O6JA 2V41A 3QFAC 3CSHA 4WKWA 4HOJA 2FHEA 3ZFLA 4MF5A 2L5LA 2JZSA 2B6MA 2O8VB 2MMZA 2HRNA 5GSTA 4LL1B 4LA1A 4V1Ap 3ERWA 4EO3A 1B4PA 5JCGA 4WF5A 2RLIA 2WJUA 1BEDA 1XIYA 1AXDA 3IK9A 4EE0A 3ZLPA 3DVXA 4YAPA 3I69A 5DJLA 2QGVA 3CRTA 1JZDA 2G2QA 2CZ3A 1X0RA 3KMOA 5ECPB 4HS1A 5G30A 2L6DA 3FZAA 3TOTA 2GSQA 1TTZA 1FO5A 2G0FA 2XC2A 3CYNA 4IQ1A 2O85A 2F3MA 3PINA 2B5XA 3F3QA 4BPYA 4EL1A 3APSA 1TW9A 4NV5A 4XS1A 2PMTA 1EOGA 3EINA 2DMMA 3ED3A 4JE1A 2L4CA 1BYEA 1M2AA 1VGLA 1QQ2A 4TR4A 3H79A 1TRSA 3DRNA 2E0QA 1NHYA 1BQ7A 5E4WA 4JEDA 2FA8A 3MWHA 5CO3A 2DJ0A 2WRTA 3IAS2 3P90A 5HR0A 1R5PA 2N5FA 3GKKA 5CP1A 1MEKA 4G19A 3H8QA 1QMVA 1TK5B 2VD0A 5IOWA 4GSTA 4FH8A 2FA4A 4KGIA 1AIUA 1WE0A 3GTUA 4NHZA 2FLSA 2LUSA 3P8WA 4KDYA 4EXJA 1XBSA 4ISDA 1U3IA 1JFUA 3PH9A 3QPMA 2I4AA 2H6ZA 3GKXA 4GTUA 2GQKA 2C4JA 4EC0A 1AAZA 2OBIA 1FW1A 3KH7A 1DSBA 2MMNA 1F37A 2C1YA 2YZHA 4KAEA 3CSJA 5CAXA 2XPDA 3M9JA 2H0IA 2H0GA 4POBA 5DDLA 4FIWA 4EVMA 3CRUA 1Y25A 1DE2A 4TXVA 4ILFA 1AC1A 2R5GA 3A2VA 2GDRA 3A5WA 3KMNA 4MJEA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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