2QGVA

Crystal structure of hydrogenase-1 operon protein hyae from shigella flexneri. northeast structural genomics consortium target sfr170
Total Genus 23
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
23
sequence length
121
structure length
121
Chain Sequence
TPFDALWQRMLARGWTPVSESRLDDWLTQAPDGVVLLSSDPKRTPEVSDNPVMIGELLHEFPDYTWQVAIADLEQSEAIGDRFGAFRFPATLVFTGGNYRGVLNGIHPWAELINLMRGLVE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of hydrogenase-1 operon protein hyaE from Shigella flexneri.
rcsb
molecule keywords Hydrogenase-1 operon protein hyaE
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Shigella flexneri 2a
total genus 23
structure length 121
sequence length 121
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-06-29
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2qgvA00
8GSSA 4EDZA 1SJ6A 4JEDA 3H79A 4KW6A 1OE7A 1F3BA 1AAZA 1VF4A 2VL2A 2VM2A 3GSTA 1PX6A 5G5FA 3FHKA 1BX9A 3W6GA 2N5FA 4WBJA 1GUMA 3ERGA 2A2RA 4POMA 4MPFA 3ZVJA 4GF0A 1EOGA 2H73A 2KP2A 3H93A 4GSSA 1YJ6A 1GNEA 5G1KA 2H74A 1X5CA 4WEYA 2PU9C 3ZREA 2G0FA 3EC3A 4F9ZA 5D73A 2MYGA 2LV3A 1K3YA 2VAFA 2IFQB 3DVWA 2IN3A 2H72A 2A4VA 1LU4A 2BJXA 2C0DA 1ACVA 5HR0A 1YEPA 5IPGA 1FHEA 3L78A 3TRXA 2PVQA 3IR4A 3HZ4A 1TI3A 1Y25A 2OKAA 1O7UA 2B7KA 4FYCA 4GWRA 3A5WA 4ZL7A 3H8QA 1MDJA 4XCSA 3GRXA 3IK9A 2FD3A 4OMVA 2L4QA 5KN3A 4XS1A 2LQQA 1MDIA 2MBTA 1X5DA 2OBKA 1Z6NA 3TKRA 2LS5A 2VL2C 1WOUA 2WGRA 2LJAA 2LRTA 1T4YA 5G1LA 2VCVA 1H4OA 2A2SA 4KSMA 1VF3A 2LRCA 2VIMA 1YEXA 3KZQA 1VGLA 3J7Yk 2H8LA 1OYJA 5IMFA 3VK9A 3HVSA 5A4UA 4IKHA 1TW9A 2DJ3A 1LBKA 3QR6A 1ZMAA 2VUPA 5IOXA 1AXDA 1V57A 2CVBA 2R37A 5GAPD 1FVKA 1K0NA 3ZFBA 1CQGA 5ABRA 3IE3A 2GT5A 2Z9SA 3CSHA 4ZXGA 1X9WB 5E59A 2XPDA 3GX8A 5FWGA 4PQHA 3Q18A 3APQA 3UBKA 1A8LA 1RQMA 1THOA 4PGTA 1JLWA 2LNTA 3Q6OA 4TR1A 2H0GA 4FO5A 3WD6A 2LSTA 2H30A 2PERA 4L0UA 3KH7A 3GSSA 4K2DA 1B9YC 1ABAA 1FOVA 1XBSA 3RHBA 1NW2A 1J08A 3BCIA 1JZDA 2VO4A 1PSQA 4I8BA 3TOUA 4AJ6A 1VF1A 2OE1A 3KP8A 1XW9A 4EXJA 1GSSA 5CRDA 3F0IA 1O73A 3R2QA 5JWOB 2H0IA 4DSSB 1ML6A 4OO4A 2FWEA 2YJHA 4IQAA 4F0BA 2R5GA 2I4AA 1TK5B 4XS6A 4V1Ag 3GTUB 3EYTA 3QAGA 4I2TA 5CNWA 2P0GA 2RIIA 3K8NA 4GLTA 1TDIA 5F06A 4RI7A 2C3TA 2K9FA 1MD3A 2L59A 3RDWA 4TR3A 2DMMA 2R2JA 2OBIA 5CRHA 2CAQA 1DBYA 4IN0A 4BL7A 5KN2A 2IJYA 2C80A 1PD21 3GURA 4POBA 3FZAA 4O5RA 4TR1B 4ACSA 5B6MA 4TXOA 3GHAA 3WT1A 1E2YA 2FA8A 5G2ZA 4YH2A 1WP0A 4MZBA 1EV4A 3TKSA 3MDKA 5ECQB 3EMPA 1V98A 2D2ZA 4O7HA 4D73B 4JR6A 5AISA 4AJ8A 2HZEA 2E0QA 4TOPA 4OFMA 4V2NA 1AUCA 1GSDA 1H75A 2VOCA 1TRVA 2B5EA 3LEFA 3HVVA 2L4CA 9GSSA 2JSYA 2N5AA 5ECPB 2L5LA 3GH6A 1B4PA 2HXKA 5J5NA 1UN2A 4IJ3A 5EVOA 5F07A 1M9BA 5G5EA 4ILFA 1WPIA 3L9VA 1ON4A 1QK8A 1YKAA 4K1FA 3QFBC 4I97A 5IOWA 3UARA 1O6JA 2YCDA 5EPFA 1QQ2A 2EIRA 3GNJA 3FK8A 2QKEA 1R4WA 1HNBA 4MH3A 1SK0A 2YWIA 4PNGA 5DQSA 5DVBA 2LTKA 3LXTA 1GTAA 1HYUA 1TXXA 4GCIA 3CBUA 2DC5A 1WJKA 4GXZA 3TKSC 2GVPA 2F8FA 2GSTA 2NDOA 3D22A 1GUHA 2FGXA 5E4WA 4OO5A 4KE3A 1PL2A 2P5RA 3RBTA 5HQPA 1QXHA 3P8WA 2C1YA 4QL9A 5LD0A 1JZRA 2NTOA 3KD0A 1WIKA 2YANA 1SU9A 2CQ9A 1PQNA 3D4MA 4ISDA 4N11A 3M3MA 2NVLA 2GTUA 5GAND 3MNGA 4JR4A 2GLRA 2J9HA 1GL8A 3IHQA 4EUYA 1WE0A 2PN8A 3BD2A 3VFIA 2TIRA 1Z5YE 1SL2B 1XFLA 6GSXA 4LMWA 1SK2A 1B48A 1AQVA 3VI5A 2WDUA 3HY2A 1OAZA 1BAYA 4IP6A 1TRSA 4XRAA 1DUGA 1K0CA 3L0HA 2FNOA 1GNWA 1T3BA 5HR2A 4ZL8A 4MZWA 1RK4A 2ON5A 4YAVA 3M9JA 5L71A 1YQ1A 1ZYEA 5DQYA 5ELGA 2OACA 3KJYA 4JBBA 4DSRA 12GSA 1SKRB 3QPMA 10GSA 2H6ZA 4QL7A 3IAS2 3KP9A 2FA4A 5DCHA 4MH2A 1GP1A 4WF5A 4DEJA 4LL4B 3TRPA 1A2LA 3M0FA 5DJMA 5LNKe 3EU4A 3FR6A 4K6XA 3DMLA 1XCCA 3NOFA 5F8BA 2VL3A 2HRNA 11GSA 2YP6A 3IA1A 1JHBA 2RM6A 1G6YA 3EWLA 3LYKA 2FUG2 1ZZYA 1MEKA 4F82A 2DJ2A 3ZFLA 4BVXA 1A23A 3UIWA 3MAKA 4F0CA 4RI6A 3QCPA 1ZCPA 3GMFA 1K3LA 5B8AA 2HI7A 4PQIA 3ZLPA 4MDCA 1N8JA 3IOSA 5AGYA 5EL8A 4GQFA 2LQOA 1U3AA 2VCZA 3VURA 5IQYA 3IXRA 4XS4B 4BWSA 1IYHA 6GSWA 3DWVA 2BTOT 4K8MA 2PWJA 3FZ9A 4DVCA 4ECBA 2DJ0A 2DSAA 1S3DA 5ECOB 2FWHA 3GH9A 2QSIA 4IQ1A 1SKWB 2KUCA 3ZIJA 4N30A 4MF5A 4F2IA 2B5XA 3LJRA 4ZILA 3ISOA 2C0GA 1XW5A 2K18A 2HLSA 1F6MC 1HNAA 4MF7A 2X8CA 4CW9A 4ULXA 1XPVA 3IRAA 2VCWA 4O92A 2ALBA 4F03A 2V2GA 3FEUA 2I1UA 1M0UA 2AV4A 4Q5QA 4JRRA 4IVFA 1I9DA 3APSA 1TOFA 2V6KA 1FB6A 4HI7A 3DYRA 4X0XA 4HEA2 1FAAA 3LSZA 3EMXA 4XTSA 1JFUA 4RQXA 3UAPA 3HXSA 1Z9HA 2HFDA 2JACA 1UA5A 3TOTA 3D4TA 1UC7A 3GL5A 1EWXA 2CT6A 2O8VB 2XC2A 3NZNA 1GLPA 3MWHA 3E0UA 3S9FA 3KXOA 1MD4A 4KDUA 3ZITA 3VPTA 4DSSA 4JU5A 2H01A 2GSQA 2DBCA 3ERFA 3RHCA 4Q5NA 3GTUA 3I69A 1M2BA 2I3YA 1XWGA 2GZPA 3CXGA 5J9BA 3NIVA 2GSRA 3ME8A 2CVKA 3TKPA 1F37A 1T1VA 1XOAA 1QGVA 1WMJA 4TN8A 1GULA 3N9JA 5H5QA 5IIZA 3ZMKA 4YQUA 1JZWA 2IPAA 1VRSD 2OJLA 2JU5A 4PNFA 3I6AA 3KGKA 1T00A 4KCAA 2M72A 4WBRD 4OCFA 2IIYA 4LA1A 2LJRA 3QD9A 4OFTA 1A24A 3VWXA 2C4JA 2FWFA 2GDRA 4D73A 4MK3A 5D96A 3AY8A 4K9ZA 1EZKA 3GIXA 1AC1A 3EINA 3GYKA 4V2MA 1M99A 1QMVA 5KN1A 4ZIJA 5ECLB 2J23A 2MMZA 3TKSE 1Q4JA 3KIJA 2OA7A 4TW5A 1A0RP 3VWVA 1G0TA 3N5OA 2B7JA 6GSSA 4E8EA 2IMKA 3VPQA 3TJJA 2H71A 4CHSA 1O85A 3GV1A 1FB0A 3KEBA 5CAXA 5J9CA 4GSTA 3CYNA 3TGZA 4AJ7A 1OC8A 3FR3A 4MJAA 2L6DA 1GUKA 3BJ5A 1XW6A 2JZSA 2DJJA 4KAEA 5IMZA 3F9UA 2HSHA 1ERTA 1GSQA 1C72A 2EIOA 4L0WA 3QAWA 1X0RA 2P31A 4N10A 5ID2A 1HQOA 2DIZA 2F51A 4ZB9A 3RAZA 4ECJA 4EE0A 3C1RA 2H1AA 4K7OA 2DJKA 3ZMLA 1TKDB 1U88A 3D5JA 2YV9A 3W8JA 5ECSA 3LWAA 1XWBA 2PPTA 1F9MA 1PRXA 4AF2A 2FCHA 3U5RE 3E3EA 3GKNA 1EV9A 4IP1A 3ZRDA 5ECNB 3HKRA 1FVJA 3A3TA 1UVZA 3CMIA 4PURA 2B5YA 2LJKA 2KOKA 4KSOA 2ZNMA 3HDCA 2CX4A 3KH9A 1GH2A 4HQSA 1NHYA 1PKZA 5D9WA 1X9MB 4MA9A 1K0MA 3CRUA 2FWGA 1J0FA 3D6IA 4HJMA 2ZCTA 1NSWA 3TRQA 1T4ZA 1OKDA 4E8HA 4V1Ap 3CSIA 2YV7A 1IYIA 3KCMA 1XVWA 4MZCA 1PL1A 3G7JA 3CTFA 2AB6A 3LQ7A 1XXUA 4LLRA 1SJIA 5AN1A 3IC4A 2CX3A 5J3RA 1EEJA 2NBSA 1PN9A 2R3XA 1A0FA 1M9AA 3HJOA 4KDYA 3ME7A 2GGTA 5DJLA 1EP8A 3F4TA 5COHA 4K0GA 3PINA 4YQMA 5ID2B 1SJZA 3FZ5A 1SD9A 2L5OA 2IMEA 5DALB 2V41A 6GSYA 3HHVA 4ECIA 1A8YA 4HZ2A 3G7IA 1QFNA 2XBIA 2HYXA 1FO5A 5KN0A 6GSVA 2OADA 3H4KA 1GTUA 3D0ZA 6GSTA 3GN3A 5FHIA 3LXZA 1PA3A 4LMVA 1KTEA 16GSA 1SYXA 2AJQB 3TKQA 5IMCA 2JADA 1GSFA 3J7Yb 4G9HA 1YY7A 5JCWA 2DMLA 3GFKA 1G7EA 4TR0A 1R5PA 3L9SA 3M1GA 1GSEA 3TUEA 2WZ9A 5ENUA 1B4QA 3VWUA 2YN1A 3PGTA 1XZOA 1THXA 1TRWA 5D8IA 4NV2A 4ZB8A 3P90A 1U87A 1JZOA 2YZHA 1HD2A 3EURA 2HSYA 2VCQA 1G6WA 2M80A 2WCIA 1SKSB 1OKTA 5KEJA 2VCXA 1CQHA 2M46A 4KCEA 5CRWA 4KB3A 3VI7A 5CO3A 4OCEA 1F3AA 3C1SA 4KDXA 2GSSA 3O76A 3KM6A 3BBYA 1W89A 1E6BA 2O7KA 1XIYA 2VLVA 2KLXA 2PBJA 1ZGNA 2GQLA 5A4WA 3TJBA 2HNLA 4XS4A 1SL0B 4BVYA 3A2XA 3WGXA 4KGIA 3GL3A 2CAIA 4I2UA 3IV4A 4AGSA 1FW1A 4GRFA 1T7PB 4HZ4A 3F3RA 5HR1A 3LFLA 3LORA 3F4RA 4NWYA 4FH8A 4P3YB 5ECMB 2F8AA 2LEGA 3DKSA 1TJDA 4IJIA 5HFGA 5HFKA 3TJGA 3H1NA 2K8SA 2H75A 4IW9A 1YF0A 1KNGA 1TU7A 3GKXA 4RUVA 1ERWA 4MJEA 2WB9A 1U6TA 3IAM2 3IK7A 3CTGA 3EE2A 5DAKB 4POLA 19GSA 3PR8A 4PQ1A 1GTBA 3IDVA 2VCTA 4HU9A 5IM9A 4EL1A 2VM1A 1Z6MA 2GZYA 1DE2A 2PVOC 1K0AA 3C7MA 3DIEA 4EO3A 2B3SA 4JE1A 3E9JB 2I9HA 2WJUA 4X43A 4MF6A 3F8UA 2EC4A 2JZRA 2C3NA 1F2EA 1ERVA 2X64A 1R7HA 4L8EA 4NXIA 4MP4A 4WR4A 4BPYA 20GSA 2GQMA 5G30A 1M7TA 1QUWA 5IMDA 2FHEA 4DSQA 2DIYA 3UBLA 2MMAA 2P5QA 4MMMA 1TK0B 3QDNA 4YQVA 1DE1A 2R6KA 4BA7A 4TRXA 1W4VA 1TRUA 2IL3A 1J9BA 1XOBA 4XRDA 4I5QA 1OC9B 3C73A 2HZFA 4PUAA 5ECKB 2WULA 1EGRA 1WRYA 1BYEA 3RPNA 5JCGA 2TRXA 1DSBA 1HNCA 3OR5A 3DVXA 1S3CA 3DGQA 2MMOA 1YF1A 1FG4A 1Z7RA 3M9KA 4NHZA 5FT3A 4KX4A 2LUSA 2X99A 3FZ4A 2VD1A 1Q98A 2XHFA 2H0HA 4MJCA 4LL1B 3F6FA 3WGDA 3HD5A 1NM3A 2RLIA 4N0ZA 3FR9A 5D93A 4FIWA 4L5LA 4G2EA 4WF4A 1U3IA 1SENA 1AQXA 2H76A 1BEDA 1AQWA 3TJFA 1A2JA 2NPBA 4BWQA 3SBCA 2V32A 5GZZB 2H70A 3HJMA 4CDOA 4FYUA 3BCKA 5IMVA 1XWCA 14GSA 3RPPA 3ERWA 3ZL5A 4TXVA 2V1MA 1AW9A 4KNDA 4MLYA 2L6CA 2C3QA 4ID0A 4TR4A 1USBA 2H66A 4EDYA 2YZUA 1OC3A 4ECCA 4MJBA 5DCGA 5JWQB 3US3A 1S3AA 4XHMA 4EF0A 4K0NA 4MCUA 4K7NA 7GSSA 3FY7A 4G10A 3UL3A 3DRNA 2HT9A 2QC7A 2YWOA 3F4SA 5ECHB 4WR5A 3UVTA 2JSZA 3IPZA 2I81A 1V40A 4ZB6A 3UEMA 4OFNA 1V9WA 3F3QA 3Q19A 4IHUA 2HRFA 1KEBA 4GSNA 4V2LA 3KMOA 5JCUA 3KMNA 2LKUA 4O32A 3TB2A 3HVXA 2GQKA 2C8UA 5HFIA 1B8XA 2H1BA 2ZUPA 4RQRA 5LCZA 1GRXA 2JL4A 1V2AA 5ECIB 13GSA 1XWAA 4MABA 4EKZA 4GQCA 2GZZA 1GSYA 5J4UA 1T8EB 3TDGA 2GS3A 4KA0A 2XPEA 1M2AA 2RUFA 5J41A 2REMA 2IWTA 3U6VA 3ZZXA 1ERUA 22GSA 4PX1A 3HZ8A 5DDLA 2IMIA 3JCML 1R26A 4Q5RA 3I9V2 4YAPA 4TVEA 4J57E 3FKFA 2IMDA 2V6OA 3HJPA 3APOA 2YWMA 5AIXA 5D9XA 5B8BA 4IS0A 2AUVA 2IMFA 2G2QA 3KTLA 2JZTA 3EU3A 2FY6A 1XWKA 2VD0A 2H6XA 5D9VA 1YKCA 3VWWA 2VLUA 3ZIVA 3ZTLA 3EVIA 3LGCA 3F6DA 5F0GA 1YZXA 4PUFC 1BJXA 1O81A 1AIUA 3GUSA 1O8WA 4KH7A 4N0VA 3LG6A 2C0FA 1PMTA 3ED3A 4TKYA 3WT2A 2FLSA 1K0BA 5DALA 2WFCA 4NHWA 1G7OA 4WETA 1PKWA 2AHEA 1BG5A 1Z7PA 1X9SB 2BMXA 4Z7XA 4HUAA 3C71A 3GA4A 3FW2A 3A2WA 3C8EA 2OE3A 3UVHA 4IGJA 1SK1A 3QOUA 4POKA 1Z3EA 2MMNA 2RUEA 2QGVA 5H5SA 5IO0A 1ZOFA 2R4VA 1EOHA 1ILOA 4QQ7A 4ML1A 3HCZA 4OD7A 4NMUA 5CREA 2CZ3A 3TCOA 1V58A 2YWNA 4G19A 1GWCA 2B1LA 5C00A 2L57A 3GKKA 5IMAA 1GTIA 4Q5FA 4NAXA 1N2AA 2GT6A 2AAWA 2E2MA 1R5AA 3P7XA 4X1UA 1PX7A 3DEXA 4GTUA 3L4NA 1MDKA 1SYRA 1K0DA 2O89A 2OE0A 5F05A 2N5BA 4L5OA 1TU8A 3M8NA 4ZBBA 1VF2A 5EY6A 5B6NA 4HU7A 5GSTA 2WS2A 4EVMA 2MBSA 5DBQA 2HE3A 5C04A 3DD3A 5H5RA 3FRCA 3F63A 2LRNA 4TXOB 2YOIA 1MTCA 1ST9A 5IPHA 3TJKA 1OE8A 3DXBA 2DJ1A 4EC0A 4OWYA 3IBHA 1A2MA 3SWLA 4ZBAA 4HDEA 4ZBDA 2CZ2A 2K6VA 2O85A 2B6MA 3LYPA 2RM5A 3VLNA 3G7YA 1KBNA 5ECRB 2CVDA 2HZEB 1EP7A 1JLVA 4HJ2A 1URMA 1OVNA 2H1DA 3KTBA 2DLXA 2ES7A 1RW1A 4H86A 1ZL9A 2YJ7A 1NHOA 3FYGA 3W8SA 3ZYWA 2O87A 4KUNA 1M2DA 3HA9A 4PXOA 3UOMA 5DAKA 2WRTA 3CSJA 2X8HA 5B7CA 1K3OA 2E2GA 1TTZA 4HQZA 1O8XA 3HYPA 2E7PA 5IO2A 4HS1A 5A5KA 5A4VA 5AIVA 3O6TA 5GSSA 4HOJA 4NV5A 5CP1A 1TP9A 2KP1A 2VL9A 18GSA 2VLTA 2F9SA 3GKMA 1TI1A 5G31A 3A2VA 3QFAC 1B9XC 1PGTA 4IBPA 3UMAA 2KHPA 1X5EA 17GSA 4ML6A 4WXTA 4J2FA 3QAVA 2K8VA 1GSUA 5CRGA 2EIQA 1EGOA 3PH9A 2CA8A 4NPBA 3UJ1A 1I5GA 4K7IA 5D9TA 2PGTA 1SL1B 6GSUA 1OC9A 3GX0A 2CV4A 5JWRB 1ZYQB 3O3TA 2MZCA 1BQ7A 4I6XA 3D21A 5HR3A 1Y6EA 1WWJA 2ON7A 1YDKA 4IELA 2YNXA 4XIHA 5ELAA 3L9UA 5CYYA 2XBQA 4ZL9A 3Q74A 2LNSA 1SD8A 3ZVJD 3WYWA 4FYBA 2IFQA 2PMTA 1LJRA 2AYTA 3BOAA 4JZQA 2H6YA 3I43A 2C0EA 3MSZA 2F3MA 2B1KA 3V1WA 2YPMA 2X8GA 1K0OA 5INYA 2PUKC 2H19A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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