The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
64
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sequence length |
257
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structure length |
249
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Chain Sequence |
IVEGSDAEIGMSPWQVMLFRKSPQELLCGASLISDRWVLTAAHCLLYPPWDKNFTENDLLVRIGKHSRTRYERNIEKISMLEKIYIHPRYNWRENLDRDIALMKLKKPVAFSDYIHPVCLPDRETAASLLQAGYKGRVTGWGNLKEGQPSVLQVVNLPIVERPVCKDSTRIRITDNMFCAGYKPDEGKRGDACEGDSGGPFVMKSPFNNRWYQMGIVSWGEGCDRDGKYGFYTHVFRLKKWIQKVIDQF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
publication title |
2-(2-Chloro-6-Fluorophenyl)Acetamides as Potent Thrombin Inhibitors
pubmed doi rcsb |
molecule tags |
Hydrolase/hydrolase inhibitor
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source organism |
Homo sapiens
|
molecule keywords |
Thrombin light chain
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total genus |
64
|
structure length |
249
|
sequence length |
257
|
ec nomenclature |
ec
3.4.21.5: Thrombin. |
pdb deposition date | 2007-08-27 |
chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
---|---|---|---|
B | PF00089 | Trypsin | Trypsin |
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
---|---|---|---|---|---|
Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | Trypsin-like serine proteases | ||
Mainly Beta | Beta Barrel | Thrombin, subunit H | Trypsin-like serine proteases |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1KXB A; 3SQH E; 1MTV A; 1S81 A; 4E7R G; 3NKK A; 1J8A A; 2ANM H; 1TB6 H; 1IQE A; 2PSY A; 2YOL A; 4I8L A; 3ZVF A; 9EST A; 5LPF A; 1RS0 A; 1H9H E; 2W3K A; 1W13 U; 1GI3 A; 3MMG A; 1JIM A; 2H9H A; 1CBW C; 1L0Z A; 4FUE A; 1Y3U A; 3T29 A; 3LU9 B; 1W7G H; 2A7H A; 1HXF H; 1MMJ N; 3KGP A; 1IQF A; 1TBZ H; 3MH5 A; 4R0I A; 2G5V A; 1HAH H; 1S6H A; 1NES E; 3PRO A; 3S9A A; 3IG6 B; 5FX6 A; 3SOR A; 1C5O H; 2PSX A; 1CHO F; 3SV8 A; 4B2A A; 3RXU A; 4H6T A; 5F8X A; 1SGN E; 4JMY A; 1NN6 A; 4HI3 A; 3EQ0 H; 1UTK A; 1Y5U T; 2GKV E; 4NWK A; 1GJ7 B; 3I29 A; 1O3O A; 4E7N A; 5JBA S; 1O35 A; 1OP0 A; 2QF3 A; 3QX5 H; 4MQA A; 3UNS A; 2VID A; 2EST E; 4WMF A; 2ZGX H; 4A6L A; 3ZZ6 A; 1TNH A; 3RXQ A; 2AYW A; 4JZ1 A; 1GBC A; 2AMQ A; 1E36 B; 3ZZ7 A; 1GHY H; 4BOH A; 2O8T A; 1BOQ A; 1SLU B; 1GCT C; 2ZFS A; 3GIS B; 3SNA A; 4Y6D A; 2OTV A; 1HPG A; 2PUQ H; 2J38 A; 4FVB A; 3EA9 A; 1P2N A; 1OP2 A; 3QLP H; 3RC4 A; 1SQO A; 3SGB E; 3SNC A; 1O3P B; 4X6N A; 3TIU A; 5LH8 A; 1HAV A; 3LIW A; 1TA6 A; 1BIO A; 3BTD E; 4Y0Y E; 1PQ8 A; 5HXF A; 3U8O H; 1P2K A; 4GHT A; 1LMW B; 1O2K A; 4OS6 A; 3A8D A; 1FY4 A; 3RUO A; 4NA7 A; 5EQS A; 3H7T A; 4KTU A; 1TX8 A; 1YCP M; 2GDE H; 1FUJ A; 1XUK A; 5DP5 A; 1C5M D; 1CVW H; 2ZTX A; 4X2X A; 1GHB G; 1GHV H; 4ZRO A; 1C1P A; 1FON A; 1A0L A; 2PGQ B; 2R9P A; 2BQ7 B; 1S0Q A; 1KLI H; 4WXV A; 3FAN A; 2ZWL H; 3ODD A; 2A1D B; 1BTY A; 2ZTZ A; 1GJ6 A; 1T4V H; 2BD9 A; 1V2R T; 2C90 B; 1LPG B; 3O8B A; 3TVJ B; 1O2X A; 5C20 A; 4INH A; 2ZU5 A; 3KL6 A; 1ARB A; 4CRG A; 2XC0 A; 1UTM A; 1BRC E; 1S85 A; 4K60 A; 1T8O A; 3RMN H; 3OU0 A; 1MBM A; 3EA8 A; 2OP9 A; 4OS1 A; 1HB0 B; 1YPM H; 2B7D H; 2H6M A; 1CGI E; 3GY6 A; 3NUM A; 4KP0 A; 3BTQ E; 3U8R H; 4CRF A; 2G4U A; 4U30 A; 3DT0 H; 5DP8 A; 4BXW A; 4IBL H; 1GI7 B; 1NTP A; 2ZPR A; 1PFX C; 5DP3 A; 4E05 H; 1GHA G; 4Y8X A; 1B5G H; 3KHV A; 4J1Y A; 1D3Q B; 1P12 E; 1O2G H; 5GCH F; 2JH6 D; 4DJZ B; 1MKX H; 1ELA A; 2C4F H; 2FOA A; 4FVD A; 1YPG H; 1NY2 2; 1GBA A; 2GV6 A; 4TWY A; 3TGJ E; 1H1B A; 3E3T A; 1A7S A; 3BG4 C; 4AB9 A; 1EAS A; 4DVA U; 1AHT H; 1UVO A; 3RC5 A; 5L2Z H; 3MH6 A; 1UJ1 A; 2BZA A; 4OS2 A; 1PQ7 A; 1PPG E; 1MTN C; 1HAY B; 2FI5 E; 2STB E; 2YNB A; 2RA0 A; 1HAG E; 1G3E A; 1HJA C; 3IWM A; 4I32 A; 3VB7 A; 2BVR H; 4JZI A; 1RGQ A; 1DT2 A; 3BIU H; 4JYT A; 3ZZC A; 1NRQ H; 4NIV A; 3T28 A; 3SI3 H; 3SU2 A; 1GJ9 B; 5IYT A; 1D9I A; 3SN8 A; 3M61 U; 2ZF0 H; 1CA8 B; 1PJP A; 2Z9G A; 5DG6 A; 1C2I A; 4VGC C; 2VU8 E; 1WTH D; 7LPR A; 4MLF B; 2YNA A; 1J16 A; 3PMA B; 1LKA A; 2TGP Z; 1H4W A; 1AWH B; 2Z3E A; 3KQD A; 4NSY A; 4LZ4 B; 3A80 A; 1PYT C; 2HPP H; 3PTN A; 3S7H B; 2THF B; 1GI6 A; 1SHY A; 3UQO A; 2AH4 X; 3BEI B; 1IOE A; 4EST E; 2ODQ A; 1KYN A; 1YPK H; 1SB1 H; 1FY1 A; 4ABA A; 1GDU A; 2IOT A; 2VWO A; 1JXP A; 1ETS H; 2DE9 A; 1HNE E; 1VGC B; 3STI A; 4DW2 U; 3ZZ8 A; 1WTG H; 3OY6 U; 3PB1 E; 2QV1 A; 1JMO H; 3PV4 A; 2ZEC A; 1DIC A; 2AIQ A; 1FPH H; 4ZMA H; 1TGC A; 5I25 A; 5EST E; 1JOU B; 1UVS H; 1FNI A; 3VXE H; 4ABI A; 1TOC B; 3PMJ A; 2OC7 A; 1C2D A; 3QZR A; 4I31 A; 3URE A; 1FZZ A; 3S69 A; 1AQ7 A; 2PGB B; 1DIT H; 3F9E A; 2BD3 A; 4KTS A; 3I78 A; 3RXD A; 2HWL B; 3KQB A; 1MTS A; 4WMD A; 1O3I A; 1TPS A; 1W10 U; 1GBK A; 2XNI A; 4XE4 A; 1LCY A; 4YLU A; 5AHG H; 1TPA E; 2C8Z B; 2W7S A; 1T8N A; 2FS8 A; 5CMX H; 2FDA A; 1C1Q A; 1FY8 E; 4XDE A; 2RG3 A; 2BXU H; 2AMD A; 4X2Y A; 6CHA C; 5CE1 A; 5C5O A; 3S7K B; 3CP7 A; 4Y8Z A; 1QB9 A; 1UHB B; 3OSY A; 2P59 A; 3BTH E; 3UNR A; 1DSU A; 2WPJ S; 2PTN A; 1FY5 A; 4Y8Y A; 2ZFT A; 1QCP A; 3RXO A; 4INL A; 1SGR E; 1TOM H; 4WVP E; 4HZH A; 3RP2 A; 1IHS H; 3ZYE A; 4HGC A; 1K1O A; 1DUE A; 1O2H A; 5C1Y A; 1A5G H; 1CSO E; 1DXW A; 3M3V A; 1FN6 A; 2UWP A; 2CN0 H; 4X1N U; 2F3C E; 2AGG X; 1XKA C; 1NT1 A; 1G3D A; 1ORF A; 1NU7 B; 3ZVE A; 3TH2 H; 5C5N A; 1T7C A; 1ZPC A; 2FI4 E; 2VVC A; 1TNI A; 1TLD A; 1DY9 A; 3RXI A; 3LC5 A; 2PV9 B; 1EQ9 A; 3BIV H; 1CHO G; 1KSN A; 2W7U A; 1GGD C; 1BTU A; 2WUC A; 3AVZ A; 3LGV A; 1YPH C; 4Y79 A; 1F2S E; 2ZDN A; 1O5G H; 4X8U H; 1BRU P; 2TPI Z; 3P8F A; 3NCL A; 3Q3Y A; 1ZLR A; 3ZVA A; 1NRO H; 1ANB A; 1IQM A; 1VCW A; 1V2T T; 3Q76 A; 3FAO A; 2OD3 B; 2BB4 A; 1W11 U; 3SU3 A; 4IMQ A; 1NFW A; 2FLR H; 3GOV B; 2ZCL P; 1H8D H; 1ABI H; 5HYO A; 3ZVB A; 3C1K A; 1G3C A; 3VB5 A; 2TGA A; 1RIW B; 3T2N A; 1C2G A; 2R0K A; 4M7G A; 2QXI A; 5AF9 H; 1MKX K; 2ZHD A; 3HKJ B; 2Q6G A; 1TE0 A; 5C1U A; 4WXI A; 2WPM S; 4H4F A; 2VH0 A; 3TK5 A; 3ZZD A; 1ZHP A; 1FMG A; 4O9V A; 2GCT B; 2G00 A; 1BHX B; 3ZZ3 A; 1BTH H; 1P57 B; 3Q77 A; 1DPO A; 4ABE A; 1XM1 A; 1WBG B; 1EKB B; 1KXA A; 2HNT E; 4B2B A; 4CRA A; 2BXT H; 1OWK A; 3GY5 A; 3L6P A; 2SFA A; 2Y80 A; 3MNS A; 1XX9 A; 4Y76 A; 1P11 E; 4KGA A; 2BD8 A; 1OYT H; 3BTG E; 3PO1 C; 5DPA A; 1B0F A; 1THS H; 1O3C A; 2GZ9 A; 1GVL A; 4GUX A; 3GY7 A; 3M3T A; 5FBE A; 4O3U A; 4AG1 A; 1F0T A; 2I6S A; 2P3T B; 1MKW H; 1O5F H; 2GMT C; 3A7X A; 3SBK A; 1D6W A; 2O8M A; 2Q6D A; 5A0A E; 1BA8 B; 5EQR A; 4Q7Z A; 2Y7Z A; 2UWO A; 3TGK E; 5EW2 H; 1K1M A; 1GHA F; 2Q1J A; 1WU1 A; 1AFQ B; 2F9V A; 1QL8 A; 2FO9 A; 1GBL A; 1S5S A; 1UTJ A; 2WPK S; 3O8D A; 2ZP0 H; 4K2Y A; 4X1S U; 4ZUH A; 1G2M A; 5TJX A; 3EGK H; 1F92 A; 2ZG0 H; 3TJN A; 3LDX H; 3S0N A; 5E0J A; 1IQG A; 1XUJ A; 1YGC H; 5EXL A; 1BBR E; 1FDP A; 1ETR H; 2D26 C; 2V35 A; 2PR3 A; 5FXL A; 1XUI A; 5GCH G; 1FY3 A; 1YC0 A; 2A5K A; 7GCH F; 4Q80 A; 3M7Q A; 2AER H; 1AGJ A; 2AEI H; 1C5Y B; 4U01 A; 3TJU A; 1ZOM A; 4F4O C; 1AFE H; 5DP6 A; 3VGC B; 3U69 H; 4CH2 B; 1ZMN A; 1EOL A; 3TK6 A; 5T6F A; 1BML A; 3V0X A; 2M5T A; 1O3E A; 1THP B; 1SLX B; 1XUH A; 3KQC A; 1ZPZ A; 2JET B; 1J15 A; 2B5T B; 2ZC9 H; 3A83 A; 1H8I H; 1SHH B; 1TON A; 1G3B A; 2G52 A; 5LGO A; 1W7X H; 2BDH A; 3LON A; 1A0J A; 3E8L A; 3C27 B; 1GI2 A; 1QA0 A; 2BOH B; 1UTL M; 3E6P H; 2BD7 A; 2TIO A; 3D49 H; 3EYD A; 4AGJ A; 3ATK A; 3ZVD A; 1TQ7 B; 5JB8 S; 3LH3 A; 3UQV A; 2OC0 A; 3F68 H; 2F83 A; 2NU1 E; 2VNT A; 1QRX A; 3MYW A; 1LVB A; 2CV3 A; 1Z8R A; 1BB0 B; 1GJC B; 2A45 B; 1C1M A; 2C8Y B; 4ISO A; 3HAT H; 1P2I A; 1D4P B; 5GIB A; 4B2C A; 2Y6T A; 1E0F D; 5I46 H; 4DG4 A; 3LJO A; 4BAO B; 1DUA A; 1DAN H; 2FOG A; 3P95 A; 1BRB E; 1ZJD A; 3EDX B; 3W94 A; 1LDT T; 3MO9 A; 1O3M A; 2ANK H; 2BTC E; 2TRM A; 1T31 A; 2PFE A; 4HTC H; 4UFE H; 2ZPQ A; 3SJO A; 3FZZ A; 4ZKN U; 2HGT H; 1TWX B; 4GLY A; 1L1J A; 1QR3 E; 3M5M A; 1EP6 A; 5FBI A; 3WY8 A; 3SW2 B; 3KCG H; 3FVF B; 5GJ4 B; 3GCT F; 2GV7 A; 1CO7 E; 5DP7 A; 2FS9 A; 1C5T A; 1C1W H; 5F03 A; 1Z1I A; 4B76 A; 3F9F A; 4YT7 H; 1Z8J B; 1MQ5 A; 2FM2 A; 5LPE A; 5C67 A; 1AY6 H; 1Y3X A; 1ZYO A; 2EI7 A; 3QDZ B; 2P8O C; 2XXL A; 1O5D H; 3B23 B; 1TGN A; 2BQW B; 1RFN A; 1KTT B; 5HMA A; 2FOF A; 2RA3 A; 1L1N A; 3RXH A; 3U1I B; 2ZDV H; 5A09 A; 4LOY H; 2WPI S; 2VIW A; 2VGC C; 1PPC E; 5DP9 A; 1ANC A; 1E34 B; 2AMP A; 2ZEB A; 2Z9L A; 1V2U T; 5JYI A; 2Z7F E; 1V2K T; 1KDQ B; 1RTK A; 1FIW A; 2O8U A; 2NU3 E; 1C5L H; 4BAN B; 1GBH A; 1UO6 A; 1TMT H; 3TIT A; 4K1S A; 1O3N A; 4THN H; 1A46 H; 2A31 A; 2TBS A; 1T4U H; 4XSK U; 3KEE A; 1O5C B; 2J94 A; 3TGI E; 3MU8 A; 3EE0 B; 3Q00 A; 1O31 A; 5EPY A; 4JCN A; 1C1T A; 5H4I B; 1TNK A; 1ZSJ A; 1O2S A; 1P3E A; 1VJ9 U; 3AAV A; 3VPK A; 2SNV A; 1C1V H; 1RXP A; 3SI4 H; 4ISL A; 1SG8 B; 2AS9 A; 4AFS A; 1B7X B; 4NIY A; 3EA7 A; 1P04 A; 3U9A H; 1LHD H; 5K7R A; 3A84 A; 3LKW A; 2CHA C; 1LO6 A; 4CH8 B; 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3SV6 A; 1MZA A; 1TIO A; 1HYL A; 4IW4 E; 1Y5B T; 1SPJ A; 1KXE A; 2LNC A; 4RSP A; 2BLV A; 1P06 A; 1OSS A; 1Y5A T; 1CA0 C; 1K1J A; 4YOJ A; 1SI5 H; 2Z94 A; 1VIT G; 2ZFR H; 1O2P A; 3PWB A; 4UDW H; 3R3G B; 3D23 A; 3Q3X A; 2F9U A; 2OIN A; 2R0L A; 1UK4 A; 1LVM A; 2NU2 E; 4X1Q U; 1GG6 B; 2UWL A; 2P93 A; 3F1S B; 4AG2 A; 3S9C A; 5L30 H; 2A5A A; 1LVO A; 1YBW A; 3T26 A; 2P94 A; 1IAU A; 1QJ7 B; 4SGB E; 3M3S A; 4TYD A; 4XFQ A; 4FU8 A; 4CRB A; 1DM4 B; 2VWM A; 1NM6 A; 3RMO H; 1GBI A; 1NRP H; 1GVK B; 2VIO A; 4DOQ A; 3JZ2 B; 1F0U A; 2A5I A; 1O39 A; 5F8T A; 4XOJ A; 1O0D H; 3SGQ E; 4CBN A; 3STJ A; 5PTP A; 1J17 T; 3UIR A; 3BSQ A; 7GCH G; 1V2N T; 4D7F A; 2OCV B; 1GJA B; 2D8W A; 3BV9 B; 1QJ1 B; 1PPF E; 1KLJ H; 1C5R A; 5EG4 A; 4YO9 A; 3ZV8 A; 2XBY A; 4MNX A; 3T27 A; 2QIQ A; 1QTF A; 3RXR A; 2QGR A; 1SBW A; 1GI5 A; 2OBO A; 1LVY A; 2ZFF H; 4XBB A; 1EJN A; 2KAI A; 1ETT H; 1J14 A; 1CBW B; 1PPZ A; 2F9N A; 1BMA A; 3L33 A; 7KME H; 4K3J A; 4BTI B; 4RKJ B; 1NZQ H; 2PW8 H; 1C2J A; 2AGE X; 1TAB E; 3RXV A; 1UMA H; 2EA3 A; 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