2RIIA

Crystal structure of human peroxiredoxin i in complex with sulfiredoxin
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
184
structure length
184
Chain Sequence
SGNAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYVVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRAEEFKKLNSQVIGASVDSHFEHLAWVNTPKKQGGLGPMNIPLVSDPKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITVNDLPVGRSVDETLRLVQAFQFTDKHGEVSPAGWKPGSDTIKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the sulphiredoxin-peroxiredoxin complex reveals an essential repair embrace.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-1
molecule tags Oxidoreductase complex
source organism Homo sapiens
total genus 49
structure length 184
sequence length 184
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2007-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2riiA00
4MDCA 1AW9A 3LYPA 1ZMAA 5CP1A 3PGTA 1JZDA 2LTKA 4WEYA 2OE1A 3IAM2 5B8AA 4J56E 1G7OA 4HUAA 2QSIA 2A4VA 2IN3A 2PU9C 4RQRA 2FNOA 3FEUA 2MMAA 3WT2A 1VGLA 4OFNA 3EMXA 5G5FA 2GVPA 1YZXA 2O8VB 2CVDA 2VCQA 1C72A 3DD3A 2IFQB 2LRNA 2IMEA 3ZREA 3DVXA 3QAWA 4PGTA 4MF6A 4POLA 4P3YB 3S9FA 2ZUPA 2KOKA 3CRUA 2PUKC 3WT1A 2AAWA 1GTBA 3D6IA 1TRSA 4XRAA 1M2DA 5IIZA 1TRUA 3LXTA 2B1KA 5F8BA 3F0IA 1AQWA 3GURA 1TU8A 1ON4A 1O8WA 2YV9A 5KN2A 1T1VA 1EEMA 1S3CA 1A2MA 4BWSA 2I3YA 5B6MA 2YWOA 3P7XA 2ES7A 4I2UA 1SU9A 4N30A 1BAYA 2TRCP 4LL1B 2GGTA 5HR3A 5L71A 1ZL9A 2REMA 3EVIA 5ECQB 2DJ0A 3VWWA 1AC1A 3FZAA 4F82A 5ECSA 1AIUA 5KN0A 3UBKA 4POMA 3KH7A 1EOGA 3VLNA 3DXBA 4PQIA 1B4PA 1XWKA 2IL3A 5EL8A 1PMTA 3APQA 3O76A 2F51A 3ZVJD 3TDGA 2CVBA 1A0RP 5ECLB 3C73A 6GSXA 4MK3A 2GQMA 3WGEA 2O85A 3KMOA 3ZITA 3ED3A 2LNSA 1A24A 5FHIA 2NBSA 3GKMA 2X8GA 3ERWA 5ID2A 2H1DA 1JZWA 1XWCA 2FA4A 1R4WA 2FWHA 2VAFA 1QFNA 3I69A 3G7IA 3VWXA 4WKWA 1X5DA 4KCAA 3HHVA 5IPHA 3VPQA 4GXZA 4OWYA 2OKAA 2DBCA 1XWGA 3IDVA 3QOUA 2H0IA 1QQ2A 2R4VA 1LU4A 2H0GA 2G0FA 4GLTA 1GTAA 2PWJA 4K1FA 4Q5NA 5DCGA 1TDIA 3LGCA 2H1AA 4MPGA 4DSSB 2C0FA 5H5SA 2RM6A 2GQKA 3FY7A 1A8LA 3HZ4A 2C80A 1YJ6A 4NXIA 5CRDA 5HFKA 5IOWA 3CSHA 2HI7A 1R5PA 2IFQA 1K3LA 2L5OA 5E4WA 2H75A 1G0TA 2IMKA 4ZBAA 1HYUA 2EC4A 4GWRA 3TRQA 1PL2A 1Z7RA 4HQSA 5ABRA 2YZUA 1K3YA 1ERVA 4ZXGA 5JWOB 4GTUA 3LFLA 1LBKA 3GL5A 3D5JA 3J7Yb 3CMIA 4IP6A 2FWGA 1Z6NA 1GUMA 3BD2A 1GL8A 3DKSA 5IO0A 3ZMLA 2B5EA 4EE0A 1R7HA 1O8XA 5EY6A 3KCMA 1TJDA 2CVKA 1CQGA 2M46A 4F9ZA 4O5RA 2A2RA 1AXDA 2E0QA 2VD0A 4GQFA 2FLSA 4I6XA 3UAPA 1ZZYA 3FZ4A 5J3RA 13GSA 2LKUA 3C1RA 2V32A 2OJLA 2LNTA 2HZEB 4KB3A 5CYYA 1I5GA 2YWIA 3IK7A 3GH6A 4V1Ap 5A5KA 5DCHA 4F0CA 1K0MA 5AN1A 1BG5A 2LRTA 1B8XA 1PX7A 1ZCPA 2DIYA 4ECBA 2C8UA 3QFBC 2P5RA 3CSJA 5ELAA 2PVQA 4WF5A 3HJPA 4PQHA 7GSSA 1EEJA 5AGYA 3WD6A 1PA3A 2X8HA 4GSNA 4XIHA 2FWFA 4L5OA 5INYA 2P31A 4MPFA 1V57A 2CQ9A 1U3AA 1PKWA 1T8EB 2GLRA 4ZBBA 5IM9A 4KDXA 2VLVA 2I4AA 2VL2C 3QCPA 5H5QA 2BMXA 3RPPA 2LJKA 3FR6A 2J9HA 3Q18A 2V1MA 1FVKA 5G30A 3ZTLA 2OA7A 3GRXA 2DJ3A 2KUCA 4FYBA 2BJXA 1DE2A 1HNAA 1W4VA 2F3MA 3LWAA 4EVMA 3HVSA 1UC7A 1Y6EA 4DSSA 1XW9A 3HA9A 5J41A 4BWQA 2QKEA 1I9DA 4JRRA 3L4NA 1GUHA 2HSHA 1BX9A 2JACA 2K8VA 5JCGA 3UOMA 3ERFA 4QL9A 3QR6A 1VF1A 2MMOA 3CTFA 1MDIA 5DAKB 2N5BA 2VCWA 4L0UA 5CAXA 1BEDA 4GSTA 1USBA 2X64A 5ECNB 2DIZA 5J9BA 5D9TA 4IJ3A 4TXOB 3VPTA 2Z9SA 5J9CA 3TOUA 2H76A 1ACVA 2M80A 2CZ3A 5GAPD 4J57E 3EINA 1SENA 1U3IA 2HRFA 1GH2A 3GSTA 1V2AA 1TOFA 2B3SA 2VL3A 3IOSA 3HDCA 1V98A 4RUVA 4MZCA 4XS4B 2GTUA 3ZL5A 5E59A 5EVOA 3FKFA 1OC8A 1K0CA 5IMDA 2L4CA 3KJYA 1FB6A 2HZEA 1T4ZA 3HJOA 1IYIA 1GRXA 3EC3A 3HXSA 1FO5A 3UMAA 4KW6A 2GZPA 1T3BA 2GSRA 2L5LA 4RI7A 1TK8B 3LG6A 4WF4A 4IW9A 2H30A 5FT3A 4JE1A 3D21A 4I2TA 4HQZA 1FAAA 3A2XA 4IJIA 4JR4A 4GCIA 2YNXA 2L6CA 3IK9A 3Q19A 3APSA 1HD2A 1F2EA 2WB9A 5IOXA 3I43A 2H0HA 1M9AA 5G1KA 2IPAA 2I81A 1OKDA 3BOAA 1XZOA 3FHKA 1YQ1A 5A4WA 1GSYA 1TK0B 3EURA 4NV2A 4OCEA 5G31A 3FR3A 3GKKA 1TKDB 2LRCA 3HZ8A 3ME7A 3I9V2 2HYXA 5IQYA 4O7HA 3C1SA 3IA1A 4OFTA 5DBQA 2RIIA 3F4SA 2RM5A 5LNKe 3GH9A 1RK4A 4ID0A 5ECHB 4IKHA 3GHAA 4DVCA 3QAVA 2JADA 2MYGA 3IHQA 2H8LA 3AY8A 2HNLA 2JZRA 4Z7XA 3PH9A 5DAKA 5B8BA 1SL2B 2LJRA 2CX4A 3GA4A 4N0ZA 3ZYWA 2V2GA 3HJMA 1T4YA 3G7JA 3ZZXA 2FY6A 1OE7A 5D9VA 5IMZA 4EC0A 1EWXA 2XBIA 4TXOA 2H6ZA 4XRDA 3VWUA 1DUGA 2WZ9A 1BQ7A 1HQOA 4PNGA 1JLVA 3U6VA 1U88A 2YP6A 3FYGA 4HU7A 1F6MC 1UN2A 2OACA 2L6DA 3DWVA 1MD4A 3GYKA 3TCOA 1UA5A 3KD0A 4XTSA 5JWQB 1GSFA 2GDRA 4IP1A 4KDUA 3VK9A 1IYHA 5IMFA 3JCML 2AJQB 3M9JA 1E2YA 5KN3A 3BCIA 4IS0A 5D9WA 2E2GA 3VURA 11GSA 5G2ZA 1GTUA 3D0ZA 2ON5A 3HVXA 3QDNA 3IE3A 3L9SA 3APOA 2XPDA 4KGIA 2BTOT 3KH9A 2H72A 2R6KA 5G5EA 3KEBA 3GNJA 4IN0A 4L8EA 2QGVA 1SYRA 2AB6A 2HFDA 2LJAA 1K0BA 1S3DA 5IO2A 19GSA 1YDKA 2P5QA 2RUEA 4MJCA 4YQMA 2H1GA 3H79A 1GSDA 4HEA2 1TP9A 1ST9A 6GSSA 4IBPA 1ML6A 4XS6A 2HLSA 3NZNA 4MJAA 3TJBA 2CX3A 5ECKB 1TU7A 4ISDA 3F4TA 4K0GA 4AJ8A 1XWBA 3EYTA 5DALA 3FK8A 4K8MA 1PL1A 2IMIA 3F63A 2L57A 5LD0A 4DEJA 4X0XA 2WGRA 3TKSC 4GRFA 3CBUA 3CXGA 3W8SA 2EIQA 5C04A 2GT6A 4H86A 1TI3A 5LCZA 1AQXA 3HCZA 1UVZA 1EZKA 3UARA 1TTZA 2A2SA 2LSTA 2JZTA 4TXVA 3H4KA 2FGXA 3UVTA 2J23A 4ACSA 4FIWA 1T7PB 1URMA 4KSOA 2LV3A 4MP4A 2C0EA 5ECIB 3W6GA 4D73B 3ERGA 3EU4A 1SJIA 3TGZA 1OKTA 5DVBA 1SL0B 2WDUA 1X0RA 4X43A 2VCVA 4WBJA 3TJFA 3C8EA 3LQ7A 4KAEA 4ECJA 3ZFBA 4TR4A 4OO4A 3LJRA 3G9BA 2YPMA 4F0BA 1EGRA 2NVLA 4KA0A 4KSMA 4BL7A 4WBRD 2FUG2 1XPVA 4ZIJA 2ALBA 1TK5B 3LXZA 2DSAA 5IMAA 5KN1A 3I6AA 4I97A 4F03A 1NHYA 2EIRA 2R3XA 3IR4A 4OFMA 2B7JA 1BYEA 2B5YA 4JEDA 1OE8A 2LQOA 1MDKA 5A4VA 2DMMA 4GF0A 4IVFA 22GSA 4QL7A 3H1NA 4FO5A 2WULA 2VM1A 1OC9B 2YANA 5CRHA 3VI7A 4KUNA 1QGVA 3MAKA 1TRWA 3QD9A 2V6KA 4CDOA 2IMDA 1YKAA 4G10A 1NHOA 4IHUA 4EO3A 5AISA 1M9BA 5ENUA 2K6VA 2I1UA 2H66A 2WS2A 1XWAA 5CREA 4TW5A 2KLXA 3GSSA 3VWVA 1F9MA 3GUSA 1AQVA 2GSSA 1QMVA 4ZBDA 2YWMA 3IAS2 4MF7A 4MH3A 2F8FA 3IBHA 3SWLA 1EV4A 2HE3A 1FB0A 3ME8A 1YF0A 4AJ7A 1K0NA 2H6XA 3K8NA 3TB2A 3IPZA 1PN9A 4OD7A 3GIXA 4TR1B 3A2WA 4BPYA 3TKRA 1XFLA 5HR0A 3HVVA 4YH2A 5JCWA 1WJKA 3KGKA 3D4TA 1OAZA 3E9JB 3PINA 4MABA 5EPFA 1EP7A 5CO3A 1JZOA 2DLXA 3F6DA 4AGSA 1B4QA 3E0UA 4TR3A 5D9XA 1GSSA 2VLUA 4HU9A 4ECIA 2X99A 1CQHA 1J9BA 3NIVA 4OMVA 2EIOA 2DMLA 4IQ1A 2PGTA 2VL2A 3FZ5A 1QK8A 4V2NA 1XW5A 2PPTA 3ZMKA 5CRWA 1SKWB 4KNDA 4AJ6A 2C3QA 2FHEA 2NTOA 2LEGA 2V41A 2YZHA 2CA8A 4WETA 5ECRB 3RPNA 2VM2A 4NHWA 2K9FA 3LYKA 4LA1A 4I5QA 2CZ2A 1F37A 2R2JA 4TRXA 2YWNA 3FW2A 1SD8A 1VF4A 4HZ2A 1LJRA 3WYWA 5D96A 4ZL8A 4FYUA 3TJGA 2YJ7A 2FCHA 4YAPA 1Z3EA 1NM3A 3OR5A 1XVWA 4ZB8A 3ZFLA 1GSUA 6GSUA 4ML1A 1OC9A 1KTEA 5ECOB 1ZYEA 3UIWA 2GQLA 3GN3A 4KE3A 2K8SA 1FVJA 2HRNA 2DJKA 3ZRDA 4TOPA 3PR8A 5JCUA 2GSTA 1OC3A 2N5AA 1V58A 2VD1A 1N8JA 20GSA 1TRVA 4NAXA 1KBNA 2NPBA 4V2MA 3TJJA 2M72A 5ECPB 4PXOA 4V1Ag 3TJKA 5DDLA 5DQYA 2WCIA 2I9HA 2AUVA 5ELGA 4OCFA 4G19A 3U5RE 1XCCA 5F0GA 4PURA 2VO4A 3A5WA 3KTBA 3KZQA 4TR0A 1WMJA 12GSA 3EE2A 2FA8A 4N11A 4ZILA 1NW2A 3RAZA 1YEPA 3M3MA 1TXXA 4FH8A 3QPMA 4I8BA 5COHA 2O87A 3ZVJA 2GZZA 4Q5FA 4TKYA 3GKXA 1PD21 1QXHA 3L9VA 1YY7A 3M0FA 2JU5A 4XHMA 2PVOC 2C0DA 5D73A 3LEFA 3KIJA 1GLQA 2F8AA 2PBJA 4ECCA 1Z7PA 3ZIJA 2MBSA 2XPEA 2MBTA 2C3TA 2IIYA 3BJ5A 1JHBA 4EL1A 4K9ZA 3FR9A 3H93A 1HNBA 4POBA 1PX6A 3EWLA 2K18A 3N9JA 1FG4A 4PQ1A 2B6MA 2WRTA 2O89A 5HR2A 2C4JA 2MMZA 1K0DA 2P0GA 4PUAA 3DIEA 1N2AA 2CAIA 3Q6OA 1DSBA 1SK0A 4HDEA 2VCXA 5AIXA 3ZLPA 1ERTA 4L0WA 4NWYA 18GSA 2RLIA 5GSTA 3EU3A 1EGOA 1WIKA 1EV9A 4O32A 1R26A 4TVEA 3ZIVA 4EDYA 1MD3A 5J4UA 1SKSB 4DSRA 2R37A 3L78A 3IV4A 2VLTA 4JZQA 3W8JA 4MMMA 3SBCA 1YEXA 4XS4A 2AV4A 5DJMA 3MNGA 4PNFA 3GMFA 1SYXA 4ULXA 3VI5A 3P2AA 3E3EA 3CTGA 2H71A 4WR5A 5AIVA 1K0OA 1XIYA 1PRXA 5D93A 2HXKA 3DRNA 2C0GA 2HSYA 3CRTA 2D2ZA 3KMNA 2PMTA 5CNWA 4ZL7A 3GTUB 2JSZA 4Q5RA 1SJ6A 1X5CA 1XBSA 1O6JA 4MZWA 1M7TA 3TUEA 1PSQA 3G7YA 1ZYQB 1BJXA 4G9HA 3O6TA 3FRCA 4J2FA 2GS3A 2IMFA 2H73A 1TW9A 5HQPA 5F06A 3M9KA 2FD3A 4NV5A 2C1YA 3F8UA 3V1WA 16GSA 4BVYA 4KCEA 5HFGA 1X9WB 1E6BA 3GKNA 4G2EA 2OE3A 1V40A 5DQSA 1X9SB 1S3AA 3QMXA 1FOVA 2B7KA 3GX8A 4MLYA 2OBIA 1VRSD 3L0HA 2IJYA 6GSYA 3HYPA 5B7CA 4HOJA 2VCZA 2CV4A 4BA7A 2MZCA 1Z9HA 2ZCTA 4HZ4A 1OYJA 4MA9A 5FWGA 1NSWA 1ABAA 2B5XA 2KP2A 1Q4JA 3RBTA 2ZNMA 2O7KA 4KX4A 4NMUA 1B9XC 2B1LA 2AYTA 4EXJA 2GSQA 2YOIA 4CW9A 2JL4A 3TKSA 2KP1A 3N5OA 4N0VA 4LLRA 2PERA 1ERWA 4BVXA 1XW6A 1AAZA 3HY2A 3DMLA 1A8YA 4TN8A 2GT5A 4IQAA 3DVWA 3EMPA 2VL9A 5GAND 1WWJA 2PN8A 1QUWA 2VUPA 1WPIA 4RI6A 4LMWA 8GSSA 2AHEA 2FWEA 3KM6A 1GP1A 2E7PA 2XBQA 17GSA 4ZL9A 4WR4A 1THXA 2RUFA 1VF2A 1M0UA 3UBLA 4GQCA 1GLPA 5IPGA 2DJJA 1U87A 1ZOFA 3F6FA 5H5RA 4K7OA 1W89A 2LUSA 4K7NA 3H8QA 2XHFA 2X8CA 2WJUA 2JZSA 1GWCA 1B48A 4ILFA 3F4RA 1SK1A 4K6XA 1EOHA 2VOCA 2H6YA 5D8IA 4QQ7A 2XC2A 1B9YC 2ON7A 4EF0A 1J08A 5GZZB 3TRPA 3WGDA 3IRAA 4K2DA 1MDJA 4IGJA 1K0AA 5F05A 1G6WA 1WRYA 1O7UA 4K0NA 3RDWA 1PKZA 3TKSE 2JSYA 2F9SA 3D22A 1H4OA 1XXUA 3DYRA 1DE1A 3GTUA 3LORA 2G2QA 4E8EA 2TIRA 1Q98A 3DEXA 3CSIA 3TKPA 3D4MA 5IMCA 3MDKA 4CHSA 2DC5A 3O3TA 1XOBA 4GSSA 5KEJA 1GULA 3US3A 5J5NA 3F9UA 1F3BA 4YAVA 1GNEA 1PGTA 2YN1A 2N5FA 1V9WA 1YF1A 2VIMA 3GX0A 1O73A 3WGXA 2R5GA 4Q5QA 3L9UA 4NHZA 2DJ2A 2L59A 1FHEA 1YKCA 3GFKA 4FYCA 1M2AA 3KP9A 4YQVA 2CAQA 9GSSA 2CT6A 1TI1A 1PQNA 1JLWA 3KTLA 4ZB6A 5B6NA 5GSSA 4L5LA 4EUYA 1MEKA 1H75A 1Z6MA 4K7IA 3TKQA 5G1LA 5IMVA 2H70A 1SD9A 1KEBA 1DBYA 3FZ9A 1XOAA 4MZBA 1SL1B 5DJLA 2YV7A 1SK2A 3R2QA 1K3OA 3NOFA 4HI7A 4JBBA 3P90A 1X9MB 4V2LA 1JFUA 2NDOA 3TOTA 2H19A 2OADA 1R5AA 4D73A 3F3QA 3C7MA 4XCSA 3BCKA 2TRXA 1Z5YE 3J7Yk 1THOA 1EP8A 10GSA 3C71A 1O85A 2C3NA 2VCTA 3QAGA 3DGQA 3UL3A 1M99A 1T00A 3UJ1A 4EKZA 3KP8A 1HNCA 1M2BA 1GSEA 3IXRA 2IWTA 1WE0A 4HJ2A 4N10A 3A3TA 4PX1A 4MCUA 4AF2A 1A2LA 2LQQA 4MJEA 4MJBA 1GTIA 4IELA 1SKRB 3HD5A 1XVQA 1ZGNA 1FW1A 4WXTA 4HJMA 4NPBA 4LL4B 4POKA 1SJZA 4ZB9A 4MF5A 3RHCA 3BBYA 1GNWA 3GV1A 4E8HA 2H74A 1JZRA 2E2MA 4DSQA 4MH2A 4O92A 2OBKA 14GSA 2HZFA 3TRXA 1A2JA 4HS1A 5JWRB 3KXOA 4KH7A 1X5EA 5ECMB 2GZYA 2H01A 4F2IA 2H1BA 5HR1A 1O81A 5CRGA 1F3AA 1RW1A 1AUCA 2HT9A 3QFAC 4EDZA 2QC7A 6GSWA 4KDYA 4X1UA 2LS5A 3Q74A 1KNGA 2DJ1A 3A2VA 1A0FA 2MMNA 4TR1A 1G7EA 3LSZA 3GL3A 2OE0A 2KHPA 1G6YA 3UEMA 5C00A 4RQXA 2WFCA 4OO5A 3RHBA 1GSQA 6GSVA 4JR6A 3UVHA 3MWHA 3M1GA 3M8NA 5A4UA 3P8WA 5HFIA 4ML6A 4PUFC 1Y25A 1VF3A 3MSZA 1WOUA 2V6OA 1OVNA 1WP0A 5F07A 2L4QA 1U6TA 4YQUA 1ILOA 3F3RA 1A23A 4XS1A 1GUKA 1J0FA 5DALB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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