2RM6A

Glutathione peroxidase-type tryparedoxin peroxidase, reduced form
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
GMGSSIFDFEVLDADHKPYNLVQHKGSPLLIYNVASKCGYTKGGYETATTLYNKYKSQGFTVLAFPSNQFGGQEPGNEEEIKEFVCTKFKAEFPIMAKINVNGENAHPLYEYMKKTKPGILATKAIKWNFTSFLIDRDGVPVERFSPGASVKDIEEKLIPLLGSARL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Structural basis for a distinct catalytic mechanism in Trypanosoma brucei tryparedoxin peroxidase
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutathione peroxidase-like protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Trypanosoma brucei
total genus 35
structure length 167
sequence length 167
ec nomenclature ec 1.11.1.9: Glutathione peroxidase.
pdb deposition date 2007-10-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00255 GSHPx Glutathione peroxidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2rm6A00
1TU8A 4YQUA 1TP9A 4KNDA 4PQIA 1YQ1A 4HDEA 4TVEA 3TKSC 4ZL7A 1SU9A 2DIZA 3UL3A 2VM1A 1TKDB 1BJXA 4K0GA 2LJKA 1VRSD 3LWAA 2TRXA 3ZIVA 3ERGA 3H1NA 1WP0A 4Q5RA 4NAXA 2DC5A 3UEMA 3TB2A 3DIEA 1UN2A 3TOUA 1V40A 1LBKA 2LQQA 2RM5A 4IN0A 3SBCA 3F4TA 4L5OA 1E6BA 4POMA 5D9WA 4ZXGA 1FOVA 3ZLPA 6GSUA 2C4JA 2OE1A 3GUSA 2IJYA 4V2LA 3BCIA 4GSTA 3UVTA 1A0RP 2X8GA 2H73A 11GSA 3LYPA 5ECRB 4ZIJA 3TKSE 1M9AA 3ME8A 2ZNMA 4OCFA 1J9BA 1S3AA 2A2RA 4ML6A 4LL4B 3TKSA 2C3TA 5HR0A 1UVZA 2I3YA 3KH9A 4MZWA 2IMDA 3ZIJA 1O6JA 2IWTA 2HRFA 3WD6A 2VIMA 2L6CA 16GSA 4KB3A 1K0BA 3QMXA 5HFKA 2FHEA 3TUEA 3LXTA 1X9WB 2C80A 5ECPB 1YKAA 1R4WA 1IYIA 1W89A 2M72A 3WGEA 4KUNA 2F8FA 3N9JA 1ERWA 5A5KA 2H0GA 3TDGA 4IVFA 3PH9A 4LMWA 2VL3A 4KSMA 1TK8B 1GUHA 2LV3A 1FW1A 3C7MA 2DIYA 3KXOA 2X8HA 5CRGA 2IN3A 3Q18A 3FYGA 1TW9A 3A2VA 1M2BA 2KLXA 2PMTA 2PVQA 2WFCA 1R7HA 3WT2A 1OAZA 3C1RA 4E8HA 1T4YA 2PERA 3FZ9A 2QGVA 5AN1A 5GSSA 1OE8A 1H75A 1MD4A 5IMFA 3VWVA 4N0ZA 4MDCA 2AHEA 2REMA 3IOSA 2VCVA 1GP1A 3P7XA 2PN8A 4OO5A 1Y25A 1A24A 1QUWA 2WULA 3W8JA 1GWCA 4ZB6A 4GQCA 2HYXA 2VL9A 4MF5A 4MJBA 5F06A 2R37A 2YOIA 3ZFLA 4MJAA 1B4PA 3UOMA 1HNBA 3C1SA 3NZNA 2X64A 3APOA 3KJYA 2V6KA 5IOWA 2YNXA 2LJRA 3UBLA 1G7OA 1Z5YE 3MWHA 4PXOA 4RQRA 4DVCA 2HFDA 4WBRD 3CRUA 3HY2A 2JSYA 2L5OA 5FWGA 4YAPA 1EGRA 4IS0A 1ML6A 1ERTA 1V57A 1QGVA 5HR1A 3FZAA 4F0CA 4IW9A 1EEJA 2WGRA 5A4VA 4CHSA 3C73A 1X5EA 9GSSA 2HZEA 3C8EA 2LQOA 5DCGA 3GX0A 1EV9A 2VO4A 5EY6A 4LL1B 3ED3A 5D73A 1SJIA 3EURA 3FW2A 2P31A 4MP4A 3UAPA 5LNKe 5ECOB 1A2LA 4DSQA 1SENA 1ST9A 1TK5B 4KGIA 1KEBA 4NV2A 4K9ZA 4I5QA 2B1KA 3PGTA 2HXKA 2HZFA 2B1LA 2XPDA 1ZCPA 3G7IA 4GWRA 2L57A 1B48A 3UVHA 3IAS2 3O76A 5KN1A 5J5NA 3ZZXA 1JZWA 5KEJA 2GZYA 4KDYA 3J7Yk 2K18A 1EP7A 5E4WA 1GUKA 2PU9C 5CREA 3VI7A 4CW9A 2WDUA 3HD5A 4IJIA 1VF1A 5J9CA 4CDOA 3HVSA 2VCTA 4MABA 3BD2A 2H71A 3MNGA 2FWHA 1V9WA 2JU5A 4V2MA 2YANA 3W6GA 2H75A 2DLXA 1CQGA 3QAWA 2BJXA 4ZILA 3APQA 4MK3A 4MCUA 2OBIA 1M0UA 4QQ7A 1THXA 2FA8A 1X9MB 4I2TA 1OC3A 1B9YC 3CBUA 1TU7A 4JZQA 3CTGA 2JACA 2G0FA 5ID2B 2V2GA 2CX4A 3D4TA 3ZL5A 1JLVA 1ABAA 2CVBA 4G10A 1ZMAA 2C0EA 4OWYA 3IK7A 4PNFA 2YWOA 1URMA 1YY7A 4TW5A 18GSA 3HXSA 1OE7A 3GURA 2JZRA 4K8MA 2FD3A 1FG4A 4GTUA 2O89A 6GSTA 14GSA 1QMVA 4IQ1A 1BG5A 3HVVA 4MJCA 4RI6A 5ENUA 1TI3A 1V2AA 3F6DA 3TKRA 1MTCA 1O85A 1PA3A 1AW9A 1T3BA 2ES7A 1U87A 3LJRA 1A2MA 2OKAA 4ECJA 1LU4A 3TKQA 3CRTA 5G1LA 5J9BA 3JCML 2B3SA 4IGJA 5IMAA 5G30A 3CYNA 4XHMA 2VCZA 2AUVA 4Q5QA 1F3BA 1PQNA 2YWIA 1JLWA 3DVWA 3ZITA 2H19A 4ZBBA 2YV7A 4KDUA 3VK9A 3EU3A 3GTUB 2YWMA 3V1WA 2CA8A 5GAPD 2RLIA 4HUAA 3GSTA 3GRXA 3FKFA 4Z7XA 3LXZA 4ZB8A 2K8SA 1FVJA 4TXOB 2VD1A 2PPTA 5AIVA 2IFQB 5DAKB 4QL7A 4XS4B 4HOJA 3O3TA 1XFLA 3VPTA 3UMAA 2EIQA 5A4UA 3HHVA 4DEJA 4YAVA 5HR3A 3GKMA 1F37A 4PUFC 1W4VA 3KTLA 2MZCA 2O8VB 3TCOA 3BOAA 4RUVA 5AISA 5G1KA 3EU4A 4K2DA 4HQSA 1M99A 2IIYA 3MSZA 2PGTA 4OD7A 1Q98A 2N5FA 2CX3A 3C71A 3L9UA 5ABRA 5ECIB 4NXIA 3M9JA 2KHPA 2DJ3A 4KDXA 2GTUA 2B5YA 4EVMA 1XWCA 2B5EA 3RDWA 4D73B 3ISOA 3CXGA 3EWLA 3D6IA 5COHA 4OFTA 3GH6A 2OADA 2CV4A 2HSYA 2MMOA 4IKHA 3WT1A 4TR1A 4OMVA 3GL3A 2LNSA 5G31A 6GSVA 1WMJA 4EDZA 2YN1A 1BQ7A 5L71A 1K0CA 2PWJA 1O8WA 4KAEA 1TRUA 2HE3A 4BVYA 4IJ3A 5ELAA 4F0BA 3G7JA 3F4SA 4N30A 5IQYA 2DJJA 2XBQA 3DXBA 3FRCA 3GX8A 3CMIA 3QAVA 3KCMA 3GKNA 4EE0A 2VLTA 2KP1A 2H6XA 1THOA 3Q74A 4I8BA 20GSA 3MDKA 2C8UA 1PN9A 1I5GA 1ZYEA 4FO5A 4IQAA 1AQVA 2O87A 2R6KA 4KH7A 1MDIA 5FHIA 4X43A 4WF4A 2B7JA 3WYWA 2R4VA 2O7KA 3P8WA 1G7EA 3F63A 1K0OA 1XWKA 1GSDA 5AGYA 3LQ7A 1UC7A 2CVKA 2I4AA 2C0FA 3BBYA 3E9JB 1MDKA 2PVOC 5IO0A 3U5RE 1XWAA 4V1Ap 3TJGA 4POLA 1AAZA 1Z6MA 3GFKA 2OE3A 3UJ1A 2TRCP 4AGSA 3ERWA 5CRWA 1GTIA 1TDIA 3F0IA 4AJ7A 2X99A 3L9SA 2LRNA 2GZPA 2N5AA 2J9HA 3HKRA 1SD9A 4TOPA 1XOAA 3D21A 1SD8A 3WGXA 5JCWA 3KD0A 1TXXA 1BEDA 5ECSA 3KZQA 3GMFA 4HS1A 1H4OA 1M2DA 5DALB 2KOKA 3CSIA 2AB6A 2YZUA 4PX1A 3QOUA 4GSNA 4KSOA 5HFIA 3GH9A 3E0UA 1PSQA 5IPGA 4TRXA 4I6XA 4XTSA 1Z6NA 2EIOA 2JSZA 4GLTA 1XXUA 2C1YA 8GSSA 3FR3A 4WF5A 1BX9A 2GQLA 3KMOA 4HU7A 2F3MA 1OKDA 3TRQA 1WJKA 1XOBA 4ECBA 2GQMA 2RIIA 3KIJA 3M8NA 4EC0A 1OC9B 2H1AA 4GCIA 3I43A 5HFGA 2CVDA 3DRNA 3KP9A 2P5RA 1BAYA 2GZZA 4MZBA 4OFNA 1SL0B 1PX7A 3DKSA 3RBTA 4L0WA 3LFLA 1Z7RA 2LRCA 3IK9A 2GQKA 4JRRA 3PINA 4EO3A 3HZ8A 2EIRA 3L9VA 2M80A 6GSWA 2H76A 2IL3A 5IMZA 4ECIA 4AF2A 1SKRB 2LTKA 3TRPA 2GDRA 1B4QA 4G19A 4PNGA 2DJKA 2XPEA 1VF4A 1AQWA 1M7TA 3F4RA 2VCQA 5CNWA 3M1GA 4J56E 4Q5NA 4O5RA 1FHEA 4MLYA 3RAZA 5IIZA 2HNLA 2FWFA 1JZDA 2B7KA 2FLSA 4PUAA 2EC4A 5CO3A 4JBBA 4MPFA 2K8VA 3N5OA 1GNWA 4EL1A 4KE3A 1SK0A 2H0IA 3QAGA 3LSZA 2L5LA 1GSSA 4FH8A 5DJMA 1OVNA 1HQOA 5EL8A 3M0FA 5C04A 1HNAA 10GSA 3GSSA 12GSA 1PMTA 4FYCA 3F8UA 5D9TA 3LG6A 4G2EA 3FK8A 3R2QA 3DEXA 4IP1A 1EZKA 3IR4A 2GSSA 4V1Ag 4KA0A 1GSEA 3KTBA 4LMVA 4HU9A 5C00A 2IMIA 1C72A 4IBPA 2H8LA 4ML1A 2WZ9A 4XRDA 2ALBA 2IMKA 5IO2A 2K9FA 5GZZB 3IC4A 4NHWA 2DJ1A 4H86A 2CT6A 2LNTA 1YF0A 3GKXA 3L0HA 2FGXA 1GSYA 3F6FA 5A4WA 5D96A 4F2IA 1GLPA 1XBSA 4EXJA 1S3CA 4V2NA 4PQ1A 3ERFA 3FZ5A 2H1DA 1QK8A 4E8EA 1TJDA 3ZVJA 4BPYA 1F3AA 2FWEA 2CAQA 2YPMA 1GL8A 1YJ6A 5G2ZA 2GSRA 1GULA 3GNJA 2YP6A 2H0HA 1T8EB 1K3LA 1HD2A 3TRXA 4YH2A 3VFIA 2MBSA 4TR0A 1VGLA 4WBJA 5B6NA 1EOGA 2O85A 1T7PB 1K0AA 2OACA 2K6VA 13GSA 2OBKA 4MA9A 1CQHA 1GTUA 2C3QA 2N5BA 3IRAA 5ID2A 5D8IA 1YF1A 6GSYA 5ECHB 1F6MC 1PD21 4WR5A 5LCZA 1XWGA 1J0FA 2PUKC 3U6VA 4MPGA 3FEUA 1EP8A 5J41A 1FB6A 5DQYA 5ECLB 1JZOA 4YQVA 4X0XA 2BTOT 1YEXA 2MMAA 5INYA 4DSSB 2H6YA 4F9ZA 3OR5A 1F9MA 3HJOA 4ZBDA 1SKWB 1Z3EA 3HCZA 1QXHA 2DJ2A 4FIWA 2H30A 1SKSB 1T00A 3ZRDA 1PX6A 2ON7A 1TRSA 4MZCA 1HNCA 2ZUPA 4QL9A 1R26A 2GLRA 2GT5A 1U6TA 4NPBA 4XIHA 4AJ8A 2GGTA 7GSSA 1T1VA 1Z7PA 4N0VA 3M9KA 6GSXA 3CSJA 2YCDA 3HVXA 3VWXA 1V58A 2HT9A 1NHOA 1YZXA 3TGZA 1V98A 3P2AA 2WJUA 1XVWA 2NPBA 2L4CA 1PL1A 1QFNA 1AXDA 3RHCA 5IMDA 4L0UA 5JWRB 2H1BA 3QDNA 5HR2A 4K1FA 4PQHA 3DMLA 4X1UA 4O7HA 2H74A 2E2MA 3EE2A 3ZMKA 3GTUA 3HA9A 2QKEA 2J23A 1B8XA 3KMNA 3K8NA 3H8QA 4N10A 4ZL8A 4HI7A 1X5CA 2D2ZA 3EINA 1KNGA 1KTEA 2PBJA 1R5AA 2C3NA 1MEKA 2I9HA 4TXOA 1FVKA 5FT3A 4EKZA 3ME7A 1SL2B 1USBA 2IFQA 1PKWA 5CP1A 5DAKA 1BYEA 4XS4A 3IE3A 5ECMB 5CAXA 3APSA 4TKYA 2Z9SA 1NHYA 3QFBC 2F9SA 1FO5A 1WRYA 2M46A 2RM6A 1MD3A 3GN3A 1PGTA 1EWXA 2F51A 5DDLA 5KN2A 3US3A 5ECNB 2KUCA 3IDVA 4KCEA 5F8BA 4ACSA 3DWVA 3LEFA 2P5QA 3VLNA 1OKTA 4HZ2A 1RK4A 3QFAC 2V41A 1U3AA 1U88A 3O6TA 5J4UA 1ZOFA 2IPAA 1VF2A 3EMPA 4AJ6A 4D73A 4HJMA 1B9XC 4TR4A 2LRTA 3ZREA 2L6DA 4NWYA 1SYRA 2VAFA 3QD9A 1XW5A 2LS5A 3TOTA 3EC3A 2VD0A 1TTZA 1XZOA 3GV1A 4YQMA 2L4QA 1YEPA 1GRXA 2OJLA 5G5FA 1OYJA 3DYRA 5F07A 5IMCA 2QC7A 2XBIA 4XS6A 5HQPA 1VF3A 1EV4A 3D22A 2HI7A 3D4MA 2B5XA 4F03A 2C0DA 2YJ7A 5B7CA 1M2AA 17GSA 2YV9A 3ZFBA 4O92A 4K7NA 4HJ2A 4KX4A 4BL7A 1YDKA 1JFUA 4N11A 1A0FA 3A5WA 1GTBA 4XS1A 1QQ2A 3HDCA 4GF0A 5F05A 4HQZA 4POBA 2R5GA 3F3QA 3KGKA 3LGCA 2QSIA 1DE1A 1DUGA 2B6MA 4OCEA 1O73A 4IP6A 2FNOA 1ZYQB 2WRTA 3I6AA 2E2GA 4OFMA 3MAKA 2MYGA 5G5EA 4WXTA 2LSTA 1GSQA 5DCHA 1G0TA 4BWSA 3GA4A 3BCKA 2JADA 22GSA 1J08A 1Q4JA 1WWJA 4TXVA 2F8AA 2NBSA 3H79A 5D9XA 3A2WA 2A4VA 1A8YA 3UARA 5JWOB 5DVBA 3ZYWA 3FR9A 1TRWA 2VL2C 3QCPA 4GRFA 5DALA 4ID0A 4ISDA 1K3OA 2VOCA 2YZHA 1YKCA 2CZ3A 3L78A 1SL1B 3A3TA 2CZ2A 3BJ5A 1ZGNA 3G7YA 4IHUA 3H4KA 1WE0A 1T4ZA 1ERUA 1K3YA 2TIRA 1GH2A 5DBQA 1GLQA 2AAWA 3Q19A 4TN8A 1AIUA 2LEGA 3M3MA 3LYKA 3ZMLA 1AQXA 1SK2A 3IA1A 2RUEA 2X8CA 1M9BA 5D9VA 4BA7A 4ULXA 4LLRA 5KN0A 2E0QA 2H72A 3HZ4A 1OC9A 3ZVJD 1KBNA 4Q5FA 2FWGA 1GSFA 5EPFA 2V6OA 1ON4A 1X5DA 2WS2A 5F0GA 2HSHA 2MMZA 4LA1A 2NDOA 1XVQA 3E3EA 5ECQB 3WGDA 2FY6A 2VL2A 4ZB9A 3IPZA 2R2JA 5H5RA 4G9HA 4EDYA 1PRXA 1SJ6A 3IBHA 2R3XA 3P90A 2I81A 5IOXA 4TR3A 1U3IA 3LORA 4MMMA 2GT6A 4PGTA 1K0MA 4IELA 1K0DA 3EYTA 3CSHA 3IV4A 3VWUA 3GYKA 4FYBA 2DJ0A 1GNEA 4K0NA 1A2JA 4MF7A 2HRNA 2WCIA 2HZEB 5JCGA 5JWQB 3NIVA 4WR4A 2AJQB 3FHKA 4RI7A 4KW6A 1ZZYA 4BWQA 1GUMA 2H1GA 1N8JA 1RW1A 1AUCA 3EMXA 3FR6A 1ERVA 2LKUA 2DMLA 1XW6A 3F9UA 1XIYA 4JR6A 1XWBA 1PKZA 4BVXA 4RQXA 3HJMA 2DMMA 5DQSA 3F3RA 1OC8A 5DJLA 2VCWA 1SJZA 5CRHA 5H5SA 1AC1A 2H66A 4NV5A 4FYUA 4ECCA 3KEBA 4L8EA 5LD0A 4MJEA 1TRVA 2VM2A 4I97A 1EGOA 1FB0A 1I9DA 5E59A 3Q6OA 3ZTLA 4POKA 3QR6A 3TJFA 3I69A 3UIWA 1XPVA 2ZCTA 1SYXA 1S3DA 2KP2A 2V32A 1O81A 4J2FA 1ACVA 4I2UA 4GXZA 2VUPA 1EEMA 1SK1A 2G2QA 4F82A 3AY8A 3CTFA 1R5PA 1XCCA 5IM9A 1UA5A 4XCSA 1X9SB 2MMNA 4ILFA 4K7IA 3NOFA 4J57E 4NHZA 2P0GA 2AV4A 5KN3A 3RHBA 5GAND 4KCAA 1G6YA 1LJRA 2VLUA 5J3RA 3TJKA 1Z9HA 3RPPA 4EUYA 1N2AA 2NTOA 3GKKA 1G6WA 2H01A 1GTAA 4GSSA 3FY7A 1JZRA 1JHBA 2V1MA 3H93A 4HEA2 1X0RA 2ON5A 2GSQA 2JZSA 3D5JA 2I1UA 2GS3A 4EF0A 2CQ9A 3IXRA 1A23A 2OA7A 1EOHA 2YWNA 2E7PA 4XRAA 4NMUA 2JL4A 2DSAA 4ZL9A 3QPMA 4WETA 2L59A 2JZTA 3DGQA 2VCXA 1K0NA 1GSUA 4JEDA 4JR4A 1IYHA 1Y6EA 1TK0B 3GL5A 4ZBAA 4JU5A 5AIXA 1NSWA 3VWWA 4MF6A 4DSSA 1RQMA 2H70A 5B8AA 3IAM2 5EVOA 1FAAA 1A8LA 3I9V2 4DSRA 3J7Yb 4WEYA 2XC2A 4GQFA 5B6MA 2OE0A 3FZ4A 4OO4A 3TJBA 2HLSA 1XW9A 3TKPA 3HJPA 4WKWA 5IPHA 2LJAA 3KH7A 2GSTA 5B8BA 4L5LA 4MH3A 2MBTA 3EVIA 5IMVA 3HYPA 5H5QA 1PL2A 2CAIA 3VI5A 3PR8A 2BMXA 2H6ZA 3D0ZA 1ZL9A 1WPIA 1NW2A 1WOUA 3RPNA 4MH2A 3GHAA 3W8SA 1MDJA 1F2EA 1O7UA 3GIXA 5CRDA 2XHFA 3G9BA 3IHQA 4P3YB 5ELGA 3DD3A 3DVXA 1DE2A 1E2YA 4O32A 5CYYA 4JE1A 2LUSA 3TJJA 3VURA 2NVLA 2C0GA 3VPQA 2RUFA 2IMEA 1TOFA 1NM3A 3KM6A 2FA4A 3KP8A 2YJHA 5D93A 5JCUA 3UBKA 4K6XA 1ILOA 4PURA 3S9FA 2FCHA 2AYTA 1O8XA 4K7OA 2FUG2 2WB9A 3A2XA 2IMFA 1WIKA 2GVPA 3SWLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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