2VAFA

Crystal structure of human cardiac calsequestrin
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
349
structure length
349
Chain Sequence
GLNFPTYDGKDRVVSLSEKNFKQVLKKYDLLCLYYHEPVSSDKVTQKQFQLKEIVLELVAQVLEHKAIGFVMVDAKKEAKLAKKLGFDEEGSLYILKGDRTIEFDGEFAADVLVEFLLDLIEDPVEIISSKLEVQAFERIEDYIKLIGFFKSEDSEYYKAFEEAAEHFQPYIKFFATFDKGVAKKLSLKMNEVDFYEPFMDEPIAIPNKPYTEEELVEFVKEHQRPTLRRLRPEEMFETWEDDLNGIHIVAFAEKSDPDGYEFLEILKQVARDNTDNPDLSILWIDPDDFPLLVAYWEKTFKIDLFRPQIGVVNVTDADSVWMEIPDDDDLPTAEELEDWIEDVLSGKI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Characterization of Human Cardiac Calsequestrin and its Deleterious Mutants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CALSEQUESTRIN-2
molecule tags Metal binding protein
source organism Homo sapiens
total genus 72
structure length 349
sequence length 349
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2vafA03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2vafA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2vafA02
2PWJA 1H75A 2YWNA 5F05A 3NIVA 1SL1B 4LL1B 2I4AA 2MMAA 5G31A 2XPEA 2OADA 5ABRA 3C7MA 4V1Ag 2LV3A 2C0EA 2R6KA 1S3DA 1MEKA 3EU4A 2ZNMA 4G2EA 2DJ1A 2VM1A 3AY8A 2K8SA 4I97A 5DQYA 2H1GA 3EINA 1NHOA 1YY7A 1XBSA 4KSOA 4HZ2A 4O5RA 4GCIA 2C0DA 1RQMA 4D73A 2VAFA 3FZ5A 1X5DA 3GX0A 2ES7A 4O92A 1TRSA 2H1DA 3SWLA 1X9MB 2B6MA 4BPYA 1KTEA 14GSA 3L9VA 5FWGA 3L78A 1O8WA 8GSSA 11GSA 2OA7A 2G0FA 4Q5NA 2K9FA 5E59A 1O81A 4GF0A 3CSJA 5AN1A 3M9JA 1YZXA 2FGXA 5C00A 3BBYA 5FT3A 1J08A 5GZZB 4K6XA 5IO0A 1TRWA 3CXGA 5JCGA 3UJ1A 20GSA 4F03A 4ZB9A 1ZYQB 1W4VA 4TN8A 4NXIA 3VFIA 2TRXA 4KDXA 4H86A 2H8LA 1VGLA 4BVYA 1O85A 3GTUB 3VWWA 3GNJA 3FYGA 4G10A 5F8BA 5GSSA 4XTSA 3RAZA 4GSTA 3P8WA 2H73A 1AXDA 1B9XC 5JWQB 1WPIA 2XBQA 1SJIA 4KAEA 1UN2A 2VM2A 1EV4A 2ZCTA 3VWVA 1YKAA 2NDOA 5CYYA 1UC7A 2H71A 2I9HA 1E6BA 3VWUA 3KM6A 1B4QA 1X5EA 2LKUA 1QK8A 1F3AA 2YZUA 1EP8A 1HYUA 2E7PA 5JCWA 2R5GA 1AQXA 2R3XA 4KSMA 6GSXA 3DGQA 2VOCA 3Q18A 5GSTA 1OE7A 2HRFA 5D93A 5DDLA 1PRXA 1JHBA 13GSA 5IMVA 3VI5A 2VCVA 3LFLA 2V41A 3QAVA 2CZ3A 4RI6A 3A2XA 3Q6OA 2V6KA 2L4CA 3MNGA 4EDYA 3GX8A 4V2MA 3CTGA 2CT6A 1SJ6A 2IMIA 2H1BA 3EE2A 6GSSA 5CRHA 3W8SA 1TI3A 2AAWA 4IJIA 3IA1A 1LU4A 4XS4A 5KEJA 3HZ4A 3IK9A 4MH2A 3PINA 4F0BA 3LJRA 3ISOA 5G5FA 4CDOA 1FB6A 3D5JA 4PNFA 4MABA 3UMAA 3HVXA 3HKRA 1XW5A 2MBSA 3RPPA 1AAZA 3P2AA 4FYUA 1SYRA 9GSSA 1GUKA 4AGSA 5G1KA 1OE8A 1YDKA 3BCKA 5EPFA 4EO3A 3NZNA 4MK3A 3ME8A 4V2LA 4ZB6A 2OJLA 1Z9HA 1GLPA 4PQIA 1R7HA 1RW1A 3HJPA 2YJ7A 2YOIA 3RPNA 1X9SB 4IBPA 3GL5A 3OR5A 4KGIA 3EWLA 3UVTA 1EGRA 1ZL9A 2CVBA 1OAZA 2MZCA 2X64A 2KOKA 5EY6A 4IGJA 4K7NA 1EGOA 2HXKA 1GTAA 2IMDA 2LS5A 2XC2A 3QR6A 1M99A 1PD21 1TDIA 2YPMA 3I69A 5DVBA 3D4MA 4MJBA 4JU5A 3FKFA 2IFQA 1NW2A 2M72A 4MP4A 4ZBBA 4RI7A 3CSIA 1PQNA 2DLXA 3MAKA 1GP1A 5INYA 6GSUA 5D96A 4JEDA 3ZLPA 2K18A 3DRNA 2K6VA 3GFKA 4ZXGA 3CYNA 1AIUA 3IAS2 4O7HA 1EV9A 2EIQA 3IXRA 3TRPA 1FHEA 3UOMA 4D73B 1M9AA 1PX7A 3HXSA 3QAWA 2H75A 4IP6A 3GUSA 5IMDA 3PGTA 3VURA 4FIWA 4QL9A 3FW2A 5H5RA 1PGTA 3WD6A 1SL0B 5ID2A 1M9BA 4KCAA 2DJJA 1ZCPA 1XW9A 3IRAA 1TXXA 1OC9B 4HQSA 4FYBA 1TRVA 4N10A 1CQGA 1YEPA 4NMUA 5DAKA 1QMVA 4WR5A 1XFLA 3P90A 4Q5FA 1HD2A 3DEXA 4N30A 3I43A 4RQXA 2I1UA 1JZRA 4EL1A 2YWMA 1VF3A 3D21A 1GRXA 3A5WA 4RUVA 1XPVA 3IPZA 4N11A 1A2JA 5B8AA 1MDIA 1XWKA 4ML1A 2YJHA 3BCIA 4ZBDA 5AIVA 3APQA 2KUCA 3SBCA 2HSYA 2WRTA 3ZFLA 2LQQA 3LG6A 1J9BA 2JACA 1R5AA 2ON5A 4XIHA 3HHVA 1Z5YE 2C0FA 2L4QA 2PMTA 2O7KA 1U3IA 5A4VA 1GTIA 16GSA 3ZFBA 5J9CA 3TOTA 3F4RA 1V98A 4POMA 2HE3A 3UBLA 1XWCA 1PSQA 4AF2A 2Z9SA 3JCML 3QFBC 5ECPB 2HLSA 4LL4B 1IYIA 1GSFA 2LJAA 4HEA2 5D9XA 4TOPA 2X8CA 2CX3A 3KTBA 4PQHA 5DCGA 10GSA 4MPGA 3GIXA 2F3MA 2ALBA 1PKZA 3KZQA 3M3MA 2GQMA 4OO5A 2A2RA 3TB2A 1SKWB 4XS4B 1J0FA 2OBKA 4EVMA 4ECIA 5ECMB 5A4WA 7GSSA 2GS3A 2A4VA 1A8YA 3TKRA 3CSHA 4ECCA 1FVKA 1K0BA 2H74A 4ISDA 4DSSA 1G6YA 1XIYA 4F82A 3US3A 4OMVA 4CHSA 5J9BA 4PUFC 5G2ZA 1G7OA 2KLXA 5CNWA 1VF4A 4WR4A 2LRCA 4TW5A 2MBTA 5HR1A 5IOXA 5ELAA 3IBHA 3A2WA 1A0RP 1QUWA 5CRDA 1BYEA 1GH2A 2JSZA 4DEJA 3WGEA 1OKDA 5HFGA 2REMA 2OE3A 5IOWA 2GZPA 5J5NA 4NHWA 1XWGA 4IHUA 5JWOB 2VCZA 4FH8A 3PH9A 5B6MA 5EVOA 4NPBA 4GWRA 4V1Ap 2MYGA 1R4WA 4IELA 1BAYA 4PX1A 2HSHA 3GMFA 3HVVA 5FHIA 1SU9A 3CMIA 2OACA 4MDCA 4J56E 4BL7A 1EEMA 4LMVA 1GUMA 4L8EA 1GNWA 5JWRB 1K3LA 4TXOB 2E0QA 4KDYA 2AHEA 4OFMA 2CVKA 5HR2A 2EC4A 1K3OA 4EXJA 2LTKA 2PUKC 4TKYA 1JZWA 1TW9A 5HR3A 3DWVA 5IMFA 4GQFA 1T3BA 1WOUA 4K7IA 2OKAA 4KNDA 4WETA 3N5OA 3FY7A 3ERFA 3GHAA 3ZIVA 4I2UA 2RM5A 5LCZA 5KN2A 5D9WA 1PL1A 3O3TA 1MDKA 3GN3A 4JRRA 1EWXA 3L4NA 2HNLA 1OC8A 4GRFA 4JE1A 3HYPA 5F0GA 5ID2B 1G0TA 1SYXA 4P3YB 2NTOA 3KTLA 1BEDA 1PN9A 2H0HA 1CQHA 5ECHB 5IMZA 1OKTA 3F9UA 3E0UA 3EU3A 1EOGA 1JFUA 2P0GA 1PL2A 2VLTA 1TU7A 2H30A 2PGTA 2C3NA 3M9KA 5F07A 3KMNA 4HU9A 1W89A 2B7KA 2VCXA 1B4PA 4WXTA 1V40A 2VD1A 3C8EA 4KA0A 1SD9A 4ECJA 4K1FA 3WT1A 2PVQA 3ERGA 4RQRA 4N0VA 5A5KA 3KIJA 3M1GA 2WFCA 3IOSA 3KP8A 1IYHA 1GSSA 1GULA 4KE3A 2HZEA 3F3QA 1SKSB 4MJEA 2LNTA 1V57A 2KP1A 2E2MA 2B1LA 3GH9A 5HQPA 3I6AA 3S9FA 1ERUA 2YNXA 4NV5A 4AJ7A 3QFAC 2GGTA 2PVOC 2GSQA 3RBTA 3TRXA 1F6MC 4Q5QA 5G1LA 3E3EA 4ILFA 5D9TA 5IM9A 1XOBA 3P7XA 4MJCA 5IQYA 1K0OA 5ECQB 1XW6A 4HS1A 3C71A 4PQ1A 2X99A 2LEGA 3FR9A 2L6CA 5DALA 2IMKA 3ZRDA 3TKSE 3QD9A 1KBNA 2IJYA 4OFTA 4X0XA 2L5LA 3ZITA 2JZSA 4X1UA 2RUEA 3GURA 1GSUA 4MF6A 6GSWA 2QGVA 4OFNA 3HY2A 2NVLA 3ZL5A 4L5LA 1K0CA 2GZZA 3UEMA 4POBA 1PMTA 2YANA 2B7JA 1TOFA 4EE0A 4ZIJA 1GSYA 5DBQA 4E8EA 1ML6A 1ZGNA 4ZILA 1GTUA 4WBJA 3L0HA 2H1AA 2LJRA 1FO5A 1FVJA 2DIZA 2HYXA 2AJQB 5ECRB 2H6ZA 2D2ZA 4TXVA 2CZ2A 5DJLA 2C3QA 4HZ4A 5ECSA 2MMOA 4HJMA 1FOVA 2O8VB 1EZKA 2KP2A 3DMLA 2LNSA 2EIOA 5HFKA 4POLA 1ABAA 4MPFA 5CRGA 2ON7A 4AJ8A 2AB6A 4MZWA 4ZL8A 3D0ZA 1WMJA 4I8BA 2EIRA 4MMMA 2VL2A 1K3YA 2P31A 3W6GA 2PPTA 5DQSA 3LWAA 1BG5A 4IS0A 4ZB8A 5J4UA 5IMCA 3BJ5A 3H8QA 3GKKA 3L9UA 5IO2A 1ACVA 4PURA 5ELGA 4PGTA 2N5FA 5DCHA 1V58A 2WZ9A 3ED3A 1NM3A 2HI7A 3TJGA 3GKMA 2CV4A 1AQVA 1HNAA 2IN3A 1A0FA 2V6OA 1PKWA 2TRCP 1PX6A 1ERWA 4E8HA 3CRUA 5KN1A 3CRTA 2K8VA 3N9JA 3EC3A 4G19A 1SK0A 2DJ3A 3TJKA 1AC1A 2FLSA 3F63A 4K7OA 3APOA 2VCQA 3PR8A 1TK0B 2GVPA 3QCPA 4O32A 3UL3A 3L9SA 2YP6A 1EP7A 2JADA 2VUPA 1QQ2A 4MJAA 1B8XA 5JCUA 3FZAA 3C1SA 3KD0A 3CTFA 4EUYA 4YAPA 4GTUA 2PU9C 1WWJA 6GSVA 1ON4A 1UVZA 1B9YC 3LEFA 4WEYA 1WRYA 1XCCA 5B8BA 1QFNA 2VL2C 4XRAA 2XHFA 5HFIA 2CAQA 1JLVA 1C72A 3G9BA 1Q4JA 4TVEA 2IMFA 2DBCA 3E9JB 4Z7XA 5E4WA 4BA7A 1SJZA 3J7Yk 3MDKA 2HT9A 1S3AA 1ZMAA 1WP0A 1AW9A 1TRUA 4IQ1A 1A2MA 1VRSD 2J23A 2WJUA 3H93A 2GQKA 2H76A 3C73A 2X8HA 1SKRB 4TRXA 2WDUA 2IL3A 1DUGA 2M46A 1O7UA 1WJKA 2F51A 2O87A 1GLQA 3ERWA 1THXA 4FYCA 2FNOA 2VD0A 2FA4A 2BMXA 3J7Yb 3ZZXA 4ID0A 2LJKA 2R4VA 2M80A 5CP1A 4EC0A 2XPDA 2DJ2A 4K2DA 1JZDA 1G6WA 4POKA 2B1KA 4ZL9A 4MCUA 3HVSA 4DSRA 2B5YA 1K0MA 4YH2A 3C1RA 2FUG2 2WCIA 4OCEA 2WULA 2YCDA 2J9HA 3WGDA 3UBKA 1RK4A 5LD0A 4HJ2A 4X43A 4GQCA 2F9SA 3IAM2 2JU5A 3GA4A 4OCFA 12GSA 5G5EA 1HNCA 3LORA 3FR3A 4YQMA 4PNGA 4ECBA 2C3TA 4I5QA 2IWTA 4KW6A 1TP9A 22GSA 1Y6EA 2BJXA 4XCSA 2A2SA 5J3RA 1A24A 4G9HA 3HJMA 5GAND 3KP9A 3TUEA 1TTZA 3KH7A 4MF7A 3FRCA 1XWBA 1ZZYA 3KCMA 4MZCA 3ZVJD 4OD7A 2MMNA 5A4UA 2GT5A 4JZQA 3VK9A 1XVWA 1GTBA 4HOJA 1XOAA 4I6XA 1GSDA 1F3BA 2HZFA 2H66A 4GSSA 4LA1A 5ECLB 3QDNA 1EOHA 4NWYA 1DSBA 3VWXA 1G7EA 3W8JA 1ILOA 4YQUA 2TIRA 3MSZA 3APSA 2V1MA 3DVXA 4GLTA 2MMZA 3FZ9A 2C8UA 3IC4A 1U6TA 1Z6MA 4F2IA 2E2GA 1X5CA 1YKCA 2JZTA 1A8LA 2IFQB 1BX9A 1M2DA 2V32A 3TKSC 1THOA 3IK7A 1MDJA 1XXUA 3HJOA 4JR6A 5ENUA 2DSAA 2VO4A 5CRWA 1ERTA 1TK5B 2H6YA 1TU8A 2CX4A 2C80A 4WF4A 3KXOA 3FR6A 5L71A 6GSTA 1PA3A 2YV9A 1MD3A 3RDWA 3HD5A 2GZYA 4KH7A 5CAXA 3LYPA 4K9ZA 1A23A 2GSTA 2QC7A 3EURA 4DSQA 2C0GA 2LRTA 2JZRA 4XS1A 3KEBA 2FY6A 3D4TA 1F37A 3H1NA 3K8NA 1OC9A 3EMXA 3VPTA 1M2BA 1FAAA 1QXHA 2WS2A 3U6VA 3ZTLA 1GSQA 2IIYA 2H19A 1DBYA 4NAXA 1T7PB 1HNBA 2X8GA 5DAKB 5D9VA 1SK1A 3A3TA 1DE1A 4YQVA 3KH9A 5EL8A 5F06A 4HQZA 3KMOA 4NV2A 2O85A 3GYKA 1OVNA 1YF1A 2G2QA 3VI7A 4HDEA 2B5EA 3G7JA 3ZYWA 1FB0A 3GSSA 3F6FA 4J57E 1Y25A 1V2AA 2FA8A 1LBKA 2OE0A 1GUHA 3IE3A 2CA8A 1SK2A 2C1YA 4L5OA 1BJXA 1Z7RA 3I9V2 4MA9A 3HCZA 5AISA 2N5BA 4IP1A 1K0AA 1T00A 2V2GA 2VCWA 2AUVA 1T4ZA 2YWIA 2B3SA 1JZOA 1B48A 4MH3A 2FCHA 1GWCA 1KEBA 4CW9A 4ACSA 3DXBA 2LUSA 1T1VA 4KDUA 2L5OA 4TR3A 4AJ6A 19GSA 4MLYA 1YF0A 2IMEA 3ZIJA 1HQOA 3FHKA 4JBBA 4L0WA 3G7YA 4TR1A 5GAPD 2VLUA 3M8NA 2AYTA 3UVHA 4F9ZA 3HDCA 3IDVA 4EF0A 2P5QA 2PN8A 2HFDA 2LQOA 5LNKe 1SL2B 4KX4A 1FG4A 3VPQA 2YV7A 4JR4A 1ERVA 5COHA 3D22A 1NSWA 3FEUA 2DC5A 4LMWA 1QGVA 4DSSB 4EKZA 3KJYA 1F9MA 1U3AA 2CAIA 1FW1A 5H5SA 4TR4A 3WYWA 1XZOA 3DD3A 1XWAA 5DJMA 4GSNA 2JSYA 1GNEA 2YWOA 3F8UA 4HI7A 3TDGA 5ECIB 2OE1A 3O6TA 4MF5A 1E2YA 1URMA 1TK8B 4K0NA 2B5XA 2RLIA 5KN0A 1DE2A 4XHMA 1M2AA 5J41A 3U5RE 3UAPA 1MTCA 4ZL7A 4QL7A 5IPHA 4IN0A 3KGKA 3LYKA 1ZOFA 5CREA 1YJ6A 4K8MA 1X9WB 3LGCA 1Z3EA 5D8IA 2CVDA 2OBIA 1UA5A 4OO4A 2DJKA 3WGXA 3TJBA 3TOUA 2RM6A 2FD3A 4TXOA 4MZBA 1OC3A 2FWEA 3M0FA 5G30A 1USBA 2O89A 3BOAA 1R5PA 2ZUPA 1TJDA 2WB9A 1OYJA 4FO5A 1N2AA 1KNGA 2GSRA 1O8XA 5IMAA 2RIIA 3RHBA 4PUAA 3EYTA 2JL4A 2I3YA 2H72A 1WE0A 3QPMA 1T8EB 4IQAA 4F0CA 2FWHA 1GSEA 3ME7A 4HU7A 4TR0A 3TJJA 4IVFA 2VIMA 3GL3A 4PXOA 2I81A 1A2LA 2N5AA 1O6JA 2AV4A 2QKEA 3D6IA 4WF5A 4XRDA 3F6DA 2RUFA 3IV4A 3LSZA 3F4SA 18GSA 2C4JA 1M0UA 3LXTA 2GQLA 2QSIA 1NHYA 3CBUA 3GTUA 2H0IA 3ZMKA 4WKWA 2CQ9A 4N0ZA 2GLRA 5AGYA 3VLNA 1O73A 2YN1A 4I2TA 2GSSA 3F0IA 5ECOB 3TRQA 2FHEA 2GTUA 4QQ7A 4L0UA 1Z7PA 1K0DA 4IJ3A 1I9DA 3GKNA 2F8FA 2WGRA 2DIYA 3TGZA 5HR0A 3F3RA 1I5GA 1SENA 5ECNB 3GKXA 3EVIA 2DJ0A 5AIXA 5B6NA 4WBRD 4Q5RA 4XS6A 3TKQA 4GXZA 2R37A 4IW9A 3WT2A 2R2JA 1XVQA 1YQ1A 5ECKB 3R2QA 2HZEB 2GT6A 5CO3A 3ZMLA 4OWYA 3HZ8A 4ULXA 1U87A 4EDZA 2NPBA 2GDRA 4HUAA 1M7TA 2VL3A 3IR4A 2BTOT 3BD2A 3UARA 2L57A 4IKHA 1VF1A 1Q98A 1SD8A 1LJRA 3ZVJA 4YAVA 3TJFA 4BVXA 1V9WA 3H4KA 3G7IA 1WIKA 3LXZA 3DYRA 2L59A 3NOFA 4NHZA 2L6DA 3DVWA 1BQ7A 3H79A 1TI1A 3ZREA 5IPGA 2PERA 5DALB 3EMPA 3TKSA 3DKSA 3LQ7A 1U88A 4ML6A 1F2EA 3DIEA 1ZYEA 4DVCA 3F4TA 2H0GA 3TKPA 5IIZA 4BWSA 2LSTA 1YEXA 3TCOA 1GL8A 3GH6A 5H5QA 2NBSA 3QMXA 4TR1B 1TKDB 3O76A 3UIWA 2KHPA 1N8JA 2HRNA 2F8AA 1S3CA 2DMLA 3FZ4A 2XBIA 1R26A 6GSYA 3QOUA 1AQWA 3GRXA 2LRNA 5C04A 5KN3A 1VF2A 1X0RA 2VLVA 3Q74A 1T4YA 4KCEA 4K0GA 3RHCA 5D73A 2VCTA 4ZBAA 3HA9A 2VL9A 2H01A 3MWHA 3IHQA 1JLWA 3V1WA 17GSA 3QAGA 1H4OA 3FK8A 4KUNA 1AUCA 1EEJA 4BWQA 2FWGA 4J2FA 4LLRA 2DMMA 1ST9A 2FWFA 3GV1A 3Q19A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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