2VAFA

Crystal structure of human cardiac calsequestrin
Total Genus 72
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
72
sequence length
349
structure length
349
Chain Sequence
GLNFPTYDGKDRVVSLSEKNFKQVLKKYDLLCLYYHEPVSSDKVTQKQFQLKEIVLELVAQVLEHKAIGFVMVDAKKEAKLAKKLGFDEEGSLYILKGDRTIEFDGEFAADVLVEFLLDLIEDPVEIISSKLEVQAFERIEDYIKLIGFFKSEDSEYYKAFEEAAEHFQPYIKFFATFDKGVAKKLSLKMNEVDFYEPFMDEPIAIPNKPYTEEELVEFVKEHQRPTLRRLRPEEMFETWEDDLNGIHIVAFAEKSDPDGYEFLEILKQVARDNTDNPDLSILWIDPDDFPLLVAYWEKTFKIDLFRPQIGVVNVTDADSVWMEIPDDDDLPTAEELEDWIEDVLSGKI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Characterization of Human Cardiac Calsequestrin and its Deleterious Mutants.
pubmed doi rcsb
molecule keywords CALSEQUESTRIN-2
molecule tags Metal binding protein
source organism Homo sapiens
total genus 72
structure length 349
sequence length 349
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-08-31
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2vafA03
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2vafA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2vafA02
1TI1A 4QQ7A 3DGQA 2PWJA 5CP1A 2X99A 3JCML 5EPFA 5D9WA 5CREA 4KDYA 4L5OA 3WGEA 3K8NA 3E3EA 3F9UA 1XWKA 3ERGA 3O6TA 2WRTA 5A4UA 4EDZA 3FR6A 1JZWA 3HZ8A 1T00A 3DKSA 3IK9A 2H6YA 3J7Yk 5JCGA 3M1GA 3UVTA 4WR5A 2NTOA 2X8CA 2CQ9A 5DBQA 1N2AA 2HYXA 3KMNA 1GTIA 4ML1A 1PN9A 3GX0A 1SJ6A 5KN1A 3H8QA 1PX7A 3QOUA 2TRCP 4GWRA 3IA1A 4I5QA 3RDWA 2I81A 2H75A 1WOUA 2KLXA 4I8BA 3WT2A 1GLPA 1AIUA 3FK8A 3FZ9A 1U88A 4GXZA 5HR3A 2MMNA 5ECIB 2VCVA 3S9FA 4IP6A 1X5DA 2XPEA 1ERWA 3H1NA 1XOBA 3BBYA 1BYEA 1V57A 2YOIA 4IELA 4QL9A 3EMXA 4N0VA 1TJDA 3TDGA 1Y25A 3D6IA 17GSA 4TW5A 4KB3A 3DRNA 4WXTA 3VWXA 1XZOA 4O7HA 1XW6A 1TW9A 3HKRA 2IJYA 1GSUA 3L4NA 5GSSA 4KCEA 5DCGA 1WPIA 3TGZA 1K0NA 5ECPB 4PQIA 2LSTA 3FZAA 3VK9A 3Q19A 1UVZA 4RQXA 5LNKe 2P31A 2P5RA 4RI6A 2JSZA 4MLYA 2I3YA 3KXOA 4ECBA 1XVWA 2N5AA 5IOWA 4KE3A 4XS4B 4KDUA 2P0GA 3KH7A 2RLIA 1SKSB 4HU7A 1GSFA 1NHYA 4EVMA 22GSA 1G7EA 2EC4A 2YP6A 3SWLA 1DE2A 4PQHA 4KX4A 1PD21 3TJFA 1LJRA 1YF1A 2L6CA 6GSWA 4ZXGA 1HNBA 2C0EA 1XPVA 3VI5A 2B3SA 4GTUA 1VGLA 4RUVA 2XHFA 3TRPA 4MZBA 1PMTA 4POBA 4ZL7A 1OKTA 2O8VB 4CHSA 1YQ1A 4HOJA 5ECQB 2CA8A 4X0XA 5IIZA 3C7MA 3KH9A 3FZ5A 2LKUA 5J4UA 2H1DA 3BJ5A 2HE3A 2AAWA 2QSIA 1GH2A 2Z9SA 3F3QA 2L5LA 3IRAA 2H71A 1S3DA 2KOKA 1YKAA 2E2MA 3D22A 2LJKA 3G7IA 3KGKA 5CRHA 3RAZA 1XXUA 2H0GA 1O81A 1TTZA 3ME7A 1AQWA 18GSA 1ZYQB 1ZGNA 3UAPA 2XPDA 4WKWA 1JHBA 4XS1A 4QL7A 4GCIA 5HFKA 5J5NA 3FEUA 5J3RA 1TU7A 1MDJA 1TOFA 4JR6A 4MMMA 3DIEA 1I9DA 3QMXA 3GHAA 1PGTA 2V6OA 4J57E 4V2MA 3EINA 4AF2A 1K3YA 2FCHA 4KDXA 4NV2A 3EU4A 1XCCA 3EYTA 1OC3A 5LCZA 2VCXA 1RK4A 1OC8A 4MDCA 1KEBA 4K6XA 3D5JA 5HQPA 2VUPA 1ERUA 3APOA 5ECLB 2YN1A 2DJ1A 2LUSA 4KAEA 3NOFA 3UMAA 4F9ZA 5A4WA 4ZIJA 3GL3A 1YDKA 1THXA 3ZFLA 4AJ8A 4GQCA 3LGCA 2JSYA 2QC7A 3U5RE 6GSSA 3D21A 4XCSA 1HNCA 5KN3A 4OD7A 6GSVA 1U3AA 4EE0A 4K1FA 4BWSA 1ACVA 4MZCA 3VWUA 1FHEA 2JACA 1K0MA 4OWYA 5INYA 3GL5A 3VWVA 2BTOT 1H75A 2DC5A 1K3OA 4ZL9A 1A8YA 2LRNA 3IV4A 4KA0A 1GL8A 2K9FA 2GSSA 2FY6A 2KP1A 3UIWA 3ME8A 5G5FA 2PPTA 1ZOFA 5ID2A 3A3TA 1K0OA 4GLTA 5G1KA 3GUSA 3GN3A 2GZPA 2E0QA 3QFAC 3LWAA 1ILOA 2B5EA 4ZB8A 3KTLA 4ZB6A 1XW5A 2ZCTA 2LNTA 5ELGA 4YQUA 3W8SA 3CBUA 2CZ3A 1GUKA 2LJAA 1Z9HA 1MD4A 4WR4A 1B48A 3A2XA 4IKHA 5F06A 2LRCA 1QK8A 1AAZA 3OR5A 1B8XA 4N10A 3ZTLA 1YJ6A 4MF6A 2CT6A 2H8LA 1X9MB 1R5AA 3MWHA 2GVPA 1M2BA 2DIZA 2H30A 4HS1A 3H93A 1QQ2A 2A4VA 5DJLA 3FY7A 3APSA 1K3LA 2DIYA 5GAND 3F63A 4HUAA 1BEDA 4TVEA 5EL8A 8GSSA 1F6MC 2FWFA 5IMDA 3TKPA 2OACA 2VL2C 4ZBAA 1VF3A 3R2QA 2RUEA 2HSHA 5G31A 2GQKA 1R26A 4EO3A 5A5KA 2I4AA 19GSA 5ECMB 2WULA 1EOGA 4FIWA 3KP9A 4MCUA 3PINA 1EGOA 3P7XA 4N30A 2PMTA 4PUFC 4OFTA 3TKQA 2YZHA 4YH2A 2H1AA 2DJKA 4RI7A 3O3TA 2GLRA 3IAM2 4POMA 1UC7A 1A8LA 1O73A 3HZ4A 1GSEA 4MJCA 3FHKA 2K8SA 2LS5A 4G9HA 1MDIA 5B6MA 1C72A 1FG4A 1Z3EA 3J7Yb 4N0ZA 3DYRA 3GH6A 4IP1A 2NVLA 4PGTA 1WP0A 1RQMA 2DLXA 2LRTA 3MAKA 4YAPA 4MP4A 2GT5A 2FWEA 1TK0B 1Z6MA 2WGRA 6GSYA 1SKRB 4TOPA 3DEXA 4POLA 1XWCA 2KHPA 1UA5A 1CQHA 2HLSA 3HJOA 1HNAA 3LORA 4ECJA 3IXRA 4HJ2A 2RM6A 3LFLA 2FNOA 2H0HA 3ZITA 1SK0A 1E2YA 3I43A 4RQRA 1YZXA 4FO5A 4LLRA 3ZYWA 3VLNA 4OMVA 4TN8A 2HZEA 1KTEA 4NXIA 1XW9A 1V98A 5ECKB 1QXHA 2BMXA 5ID2B 2HNLA 5H5QA 1XVQA 1EGRA 3RPNA 4MJAA 1PX6A 4EF0A 1G6WA 2YV9A 4TR1B 4G2EA 1XWGA 2X64A 3GH9A 5B8AA 3LSZA 3CXGA 2IPAA 3KEBA 4NMUA 4J2FA 1S3CA 2CVKA 4DVCA 2FA4A 2FUG2 2MMAA 2H76A 4L0UA 4EKZA 2J23A 3M9KA 5IMVA 3LYPA 3WYWA 1G0TA 1GULA 3FYGA 5J9BA 3QR6A 3FZ4A 5D73A 3KTBA 3EU3A 3NIVA 2YWIA 3LYKA 1JLWA 3QAVA 3DVXA 1YEPA 3ZVJD 4ID0A 1EP7A 4MABA 3EMPA 4MK3A 2IMIA 5DCHA 2ZUPA 3FR9A 3NZNA 4K7IA 3KIJA 1XFLA 1AQXA 3ZRDA 1BAYA 2FWHA 1F3AA 3F4RA 1IYIA 3BCKA 2FWGA 2MBSA 5IO2A 4MH3A 3HXSA 1JLVA 5DAKA 1B9YC 1Z7RA 1KBNA 2WCIA 1LBKA 1RW1A 3RPPA 1M9AA 4F03A 2LV3A 1X9SB 4MZWA 3UJ1A 1G7OA 3US3A 1V40A 5ENUA 3TOTA 1MDKA 1FAAA 1W89A 3BCIA 2B1LA 2H74A 1Q98A 1PL2A 4XS6A 4I97A 4OFMA 4WBRD 4IGJA 3KM6A 1OYJA 1TKDB 1GUHA 3AY8A 3G7YA 2O87A 3F6DA 2R6KA 1DSBA 2E2GA 4EDYA 1OVNA 4AJ6A 5CRDA 3UOMA 1WE0A 2LTKA 2MMOA 3O76A 3VWWA 2V32A 2ES7A 5ECHB 3N9JA 4ULXA 1QGVA 1ZCPA 2ON5A 2R37A 5IMFA 20GSA 4IHUA 2IFQA 4PNGA 4GRFA 2MBTA 3VFIA 1WIKA 3GKMA 5HR0A 4BVXA 4X43A 1EV4A 3WGDA 4ECIA 4I2UA 5DALA 2D2ZA 1KNGA 4IS0A 5DJMA 1SK1A 1EEMA 3HCZA 1AUCA 3ZIJA 1K0BA 3I9V2 4OCFA 1B4PA 4K7OA 3GURA 4ZILA 2DJ2A 3LXTA 2H1GA 3ZMLA 1FB6A 1EWXA 1PKWA 1WJKA 2GS3A 3QFBC 4V1Ag 5B6NA 1QUWA 1THOA 3CTGA 1XOAA 2P5QA 2L5OA 2O7KA 3F4TA 1A0RP 3D4MA 4E8HA 3KD0A 2X8HA 1OE7A 1SU9A 2I1UA 2VO4A 4I6XA 5F8BA 1A2JA 4HDEA 4PNFA 2G0FA 2HZEB 2VOCA 4OO4A 4G10A 5D8IA 5G5EA 4IJ3A 3GKNA 2JZTA 2GSRA 4Z7XA 1SD9A 2RM5A 5B7CA 2C80A 5J41A 3QDNA 3LEFA 1FW1A 2YPMA 1ZL9A 2L6DA 4H86A 1M7TA 3TKSA 5GAPD 2VLUA 2CVDA 4HJMA 4V1Ap 3PGTA 3TB2A 1JZRA 4Q5QA 4AGSA 1K0AA 5IOXA 2HT9A 3LJRA 3HYPA 4HZ4A 4NHWA 2YWOA 4K2DA 1T1VA 1USBA 2PVQA 7GSSA 3KCMA 2OE0A 2RIIA 2YNXA 4DSSA 4HQSA 4TRXA 1SL2B 3E0UA 2H72A 2OE3A 4EC0A 1ZZYA 3V1WA 4LMWA 3VPTA 4OO5A 2PUKC 5DAKB 1M0UA 1O8WA 4KSOA 3ERWA 3DD3A 2H66A 5G2ZA 2H19A 4PX1A 2B5YA 2H70A 5ECNB 4GSSA 5FT3A 2V41A 2E7PA 3IBHA 4LA1A 1O85A 3GKXA 5CAXA 2YV7A 1TRUA 5DQSA 4WETA 2VM2A 3QAWA 2JZSA 4JBBA 5J9CA 4ZB9A 1DBYA 2B5XA 5ELAA 2LJRA 3KZQA 5E59A 2GTUA 5H5RA 1TK5B 3IHQA 2AV4A 2H6ZA 3TRQA 2VCTA 3I6AA 1SJZA 3W6GA 2B6MA 3ZREA 2G2QA 2VIMA 1PRXA 4XRAA 4JU5A 5ECRB 2DBCA 4IQ1A 2MMZA 4XRDA 2IFQB 1YEXA 2L4CA 5C00A 3IC4A 3U6VA 4Q5RA 2F51A 5DALB 3QD9A 2LQQA 4JRRA 3GA4A 4HI7A 1MTCA 5IMZA 3KJYA 1ZMAA 1TI3A 2DMLA 4JE1A 1DE1A 5C04A 3CSHA 2MZCA 3CSJA 4F0CA 1OE8A 3EWLA 2DJ0A 5KEJA 2AB6A 5KN2A 1GTBA 2CX4A 2M72A 2N5FA 3C1SA 2IL3A 2IMFA 2QKEA 1JFUA 2YZUA 2K6VA 1V58A 3CRTA 5IMAA 3RHBA 3UARA 4KSMA 2C3QA 4CW9A 1XWAA 5HFIA 1GUMA 5F07A 3MSZA 3TJGA 3F4SA 4NHZA 1X0RA 3GSTA 1Z7PA 4X1UA 3CSIA 2GZYA 1B9XC 1SYRA 2JZRA 2C0GA 2OKAA 3APQA 1NW2A 1J0FA 4FH8A 2YJHA 3GV1A 3UL3A 2EIQA 4LMVA 1V2AA 2CAQA 2WFCA 2IMDA 1X9WB 1NHOA 2H1BA 14GSA 1LU4A 2IN3A 2PERA 1GNEA 4XIHA 2FA8A 2R4VA 4DSSB 4GF0A 5KN0A 3L0HA 1WRYA 3A2WA 3P90A 4L0WA 3PR8A 4HU9A 4HZ2A 5ABRA 3GIXA 5G1LA 3CRUA 3N5OA 2YANA 3F6FA 2C8UA 3RBTA 1M99A 2YJ7A 2HRNA 1GSSA 2F9SA 1T8EB 1O7UA 2C0DA 5JCUA 1JZOA 3GFKA 2VAFA 5AIVA 2OADA 4EUYA 2DJJA 1M2DA 5D93A 2VL2A 1GTUA 1V9WA 2B1KA 3DVWA 5EVOA 4MH2A 1OC9A 2C4JA 5EY6A 1YF0A 1TRWA 5COHA 2I9HA 3W8JA 4BVYA 3ZVJA 4PUAA 3UBKA 2VCWA 2FHEA 2VLTA 1GSQA 3C73A 2NDOA 1A23A 1U6TA 5IPHA 4LL4B 4IBPA 3ZFBA 1A0FA 2C3NA 4MA9A 4F82A 1FVJA 2DSAA 2ON7A 2HXKA 4L5LA 1HD2A 5JWOB 1BX9A 1MD3A 4ILFA 2PBJA 3H4KA 4NWYA 3ERFA 2OBKA 4ZBBA 5E4WA 2R2JA 1GSDA 2OA7A 3PH9A 6GSTA 3CMIA 4KGIA 3TJJA 3P8WA 2REMA 1T7PB 2VM1A 1U3IA 3HY2A 1YY7A 2ZNMA 3UBLA 3G9BA 1EV9A 2WJUA 4CDOA 4GQFA 1W4VA 1AQVA 3GX8A 2B7JA 2VL3A 3IDVA 1TK8B 3IAS2 5HR2A 3DXBA 2VCQA 5L71A 2AHEA 5F0GA 1ST9A 1TDIA 3M3MA 2CAIA 3ZIVA 2JL4A 4FYCA 3M0FA 2HRFA 1SKWB 5D9TA 3TCOA 2KUCA 1F37A 2PN8A 2VD0A 1O8XA 3E9JB 4POKA 2GGTA 5IO0A 5IM9A 1M2AA 2M80A 4BL7A 1Y6EA 3LG6A 3DMLA 4V2LA 2GQMA 5AGYA 4EXJA 2WB9A 4K8MA 2GQLA 4F2IA 1M9BA 2XBQA 3TUEA 2RUFA 2IIYA 1O6JA 3MNGA 2GSQA 2OE1A 3GSSA 2NBSA 4XTSA 1ON4A 4Q5FA 1N8JA 3FR3A 3HHVA 1J9BA 1A2LA 5G30A 2WDUA 1Z6NA 2HSYA 2GZZA 2CX3A 4TXOA 2WS2A 1JZDA 4KUNA 3TOUA 5CNWA 1EZKA 3HVVA 3FKFA 1X5CA 4P3YB 4D73A 5D9XA 5IMCA 3KP8A 2QGVA 1X5EA 3C1RA 4ML6A 4IVFA 3G7JA 4MJEA 2H01A 2BJXA 3TKSE 3UEMA 1A24A 1VRSD 4FYBA 3L78A 4J56E 3HA9A 4BA7A 1Q4JA 4NV5A 3F3RA 2LEGA 3QPMA 4IQAA 4O5RA 4YQVA 3F0IA 1XBSA 1EP8A 4PURA 4YQMA 2F8FA 2LQOA 1T4ZA 3EVIA 3IR4A 4XHMA 4PQ1A 1EEJA 3TKSC 4MF5A 16GSA 1A2MA 5D96A 3QAGA 4HQZA 4TXVA 2R3XA 5D9VA 3GTUA 13GSA 4K9ZA 5LD0A 1XWBA 2EIRA 5HR1A 4NPBA 2V1MA 1R7HA 5JCWA 3WT1A 10GSA 1OC9B 2YWMA 1GP1A 5AISA 3IPZA 3M9JA 5AIXA 4IJIA 5DVBA 1J08A 3VURA 1FVKA 5IPGA 3KMOA 4WF4A 3GRXA 3MDKA 4N11A 3LQ7A 5CRWA 6GSXA 1TXXA 1WWJA 2PU9C 1BG5A 2HFDA 2J9HA 2OBIA 4NAXA 3BOAA 4FYUA 5GZZB 1SL0B 3HJPA 1T4YA 2CZ2A 2VD1A 1ERTA 2AYTA 2K8VA 1SJIA 3ZL5A 4BWQA 2AUVA 4OCEA 4IW9A 1R5PA 3HVSA 2HI7A 5CYYA 1HQOA 3GYKA 2JU5A 5JWQB 3ZLPA 5H5SA 3VPQA 1FB0A 4EL1A 1YKCA 1TP9A 1OKDA 1QFNA 2XBIA 3HVXA 2JADA 3WGXA 3EURA 2DMMA 4JEDA 1WMJA 5DDLA 2TRXA 1U87A 5GSTA 1MEKA 1GSYA 5F05A 2K18A 3F8UA 3DWVA 3SBCA 1XIYA 3L9UA 5CO3A 4DEJA 4TR4A 1SL1B 2C1YA 1GLQA 2PGTA 3TJBA 1SD8A 4ZL8A 1ABAA 1IYHA 1AW9A 3D4TA 4KCAA 1PKZA 4YAVA 4JZQA 3I69A 4TR3A 4L8EA 4O92A 2L59A 3WD6A 2B7KA 2OJLA 2FGXA 4WEYA 3HD5A 1PQNA 1TU8A 2V6KA 2A2RA 4TXOB 5JWRB 1VF1A 4MPFA 1TRVA 4F0BA 2F8AA 1FO5A 4D73B 3Q18A 4KW6A 2H6XA 5B8BA 1NSWA 2HZFA 1CQGA 5ECSA 3CTFA 11GSA 4E8EA 1F3BA 2IMEA 3QCPA 1EOHA 1I5GA 3BD2A 4G19A 4TR1A 2GDRA 4K0GA 2YCDA 2X8GA 4ACSA 1GRXA 2DJ3A 1R4WA 1SENA 1VF2A 1URMA 1NM3A 3RHCA 3ZMKA 1BJXA 4AJ7A 4WF5A 2EIOA 2XC2A 2F3MA 1T3BA 4I2TA 1ML6A 4OFNA 5A4VA 3LXZA 2VCZA 1ERVA 1F9MA 5FHIA 1OAZA 4O32A 5DQYA 2IWTA 3GTUB 3IOSA 4MPGA 3EC3A 2H73A 4LL1B 4IN0A 3IE3A 2FLSA 3M8NA 3GMFA 1GWCA 1UN2A 5FWGA 2A2SA 1Z5YE 4ZBDA 1SK2A 1B4QA 3C8EA 2TIRA 3C71A 4TKYA 3VI7A 1PA3A 2FD3A 3FW2A 3HDCA 3GNJA 3ZZXA 2CVBA 5HFGA 2V2GA 2R5GA 4GSNA 3A2VA 3ISOA 4GSTA 1K0CA 1ZYEA 3ED3A 2YWNA 4KH7A 3TKRA 3GKKA 2KP2A 2NPBA 3CYNA 4DSRA 4KNDA 3HJMA 1TRSA 2AJQB 4K7NA 4V2NA 2WZ9A 5CRGA 5AN1A 3EE2A 1AXDA 2VLVA 4XS4A 4MF7A 3H79A 3Q6OA 4ISDA 4K0NA 4PXOA 2IMKA 3L9SA 4ECCA 1GNWA 1DUGA 3TRXA 2VL9A 1E6BA 1F2EA 2N5BA 2GT6A 5IQYA 3L9VA 2CV4A 3IK7A 3A5WA 4Q5NA 2M46A 2MYGA 1SYXA 1HYUA 2L4QA 2ALBA 9GSSA 2LNSA 12GSA 3UVHA 3Q74A 1FOVA 2L57A 4JR4A 3FRCA 4MJBA 4TR0A 2GSTA 2O89A 4HEA2 2C0FA 4DSQA 2PVOC 3P2AA 1BQ7A 2H0IA 1H4OA 3TJKA 3D0ZA 1VF4A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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