2VLTA

Crystal structure of barley thioredoxin h isoform 2 in the oxidized state
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
111
structure length
111
Chain Sequence
AEVISVHSLEQWTMQIEEANTAKKLVVIDFTASWCGPCRIMAPVFADLAKKFPNAVFLKVDVDELKPIAEQFSVEAMPTFLFMKEGDVKDRVVGAIKEELTAKVGLHAAAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Barley Thioredoxin H Isoforms Hvtrxh1 and Hvtrxh2 Reveal Features Involved in Protein Recognition and Possibly in Discriminating the Isoform Specificity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN H ISOFORM 2.
molecule tags Oxidoreductase
source organism Hordeum vulgare var. distichum
total genus 32
structure length 111
sequence length 111
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date 2008-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2vltA01
2FLSA 1ML6A 1J9BA 3LYPA 4LLRA 1JFUA 4ECIA 1EGOA 4K7IA 3E9JB 2F8AA 5J9CA 1G0TA 1M7TA 3ZZXA 1G7EA 2FWEA 4GF0A 3RHCA 1AIUA 2DJ2A 1Q4JA 2C0FA 1BEDA 2E2MA 1ZL9A 2I1UA 3FHKA 1N2AA 2JSZA 1TU8A 4LL4B 2CZ3A 1XOBA 4EE0A 2DJJA 3EMXA 2N5AA 3L9VA 2R6KA 2LRNA 4IKHA 4YAPA 4YQMA 2LV3A 1SENA 2K6VA 1F6MC 2CA8A 2XBQA 4EKZA 4NMUA 5DALA 3TRXA 3GRXA 4NWYA 4OFMA 4HJ2A 1PGTA 1U87A 18GSA 3P8WA 4KE3A 4MMMA 4RI7A 4L5OA 3ZIVA 2I81A 3ZMLA 1GSQA 4J57E 2D2ZA 5E4WA 2K8VA 1EEJA 2HI7A 2FA8A 1XWCA 3ERWA 5ECSA 3DWVA 1T7PB 3J7Yk 1UA5A 3V1WA 2G2QA 3FR3A 4DSSB 1ZYEA 1XWAA 2IMKA 3F3QA 3KH9A 4P3YB 3FKFA 3U6VA 3LXZA 2E0QA 5IMFA 4KAEA 4V1Ag 3JCML 2REMA 4JEDA 2IPAA 2K9FA 5JCUA 1GLPA 4ZIJA 4QQ7A 2FWHA 3VURA 4WBJA 3IE3A 3FR6A 1Z7PA 2BTOT 2RM6A 3K8NA 1OC9B 8GSSA 1GSEA 4JR6A 5JCWA 4KW6A 3HHVA 2YZHA 3S9FA 2P5RA 2C4JA 2WB9A 2WCIA 3KD0A 5DAKA 4D73B 5IMZA 3WT2A 5A4UA 2LRCA 2H0IA 3CSIA 4EO3A 1V98A 1J0FA 1SL2B 4XHMA 5CRHA 3C1SA 2AJQB 1SL0B 22GSA 5HFIA 1F3BA 3TKPA 4HZ4A 3ZVJA 5JWRB 3E0UA 4RUVA 3Q74A 1B9YC 1THXA 4IP1A 1SL1B 5G5EA 1QFNA 2F51A 3P90A 5B7CA 4F0BA 7GSSA 2KHPA 1GUKA 1ERUA 3F4RA 1AAZA 2WJUA 2EIQA 1TKDB 4Q5RA 3KH7A 5CRWA 2R3XA 2ES7A 4TR0A 4K0NA 5ECNB 4WR4A 2CAQA 2HXKA 2K8SA 1WRYA 3GN3A 1JZDA 3HD5A 2HNLA 1JLVA 2C0EA 1JZWA 1O6JA 2X64A 5G31A 3MSZA 1SYXA 3TKSC 5JWOB 4WR5A 4V2LA 3PR8A 5ELGA 2JADA 4WF5A 1DUGA 4GXZA 3HVSA 2OBIA 5DCHA 5AGYA 4KCAA 4XCSA 3L9SA 5FHIA 5GSTA 4E8HA 2CAIA 4G19A 4WXTA 1R26A 1ON4A 4EDZA 2VL3A 3HXSA 2H6XA 5IO2A 3EU4A 3DVXA 5EL8A 2AAWA 1MDIA 1M0UA 5DALB 4G9HA 2OJLA 2O7KA 3EMPA 2OE1A 3GA4A 6GSWA 1VF1A 3QMXA 2IIYA 1ST9A 4LMWA 1PX6A 1Z7RA 4N10A 1MD4A 3D4MA 5INYA 3D21A 4DSQA 2GS3A 3GL5A 1SU9A 4I5QA 5G30A 2YANA 3IOSA 1K0BA 2PUKC 1SD9A 4FYUA 3QDNA 2OE3A 1K3YA 2AYTA 2VCZA 3ZREA 2VIMA 3I6AA 3UAPA 3I9V2 3MNGA 2FWGA 3MWHA 4IQ1A 3DIEA 5DQSA 5ID2A 3A2WA 5G5FA 1TK0B 3UEMA 3UARA 5IQYA 3ED3A 1SKRB 4PURA 3LEFA 3LJRA 5IO0A 5GZZB 5DAKB 2J9HA 5D93A 1GUMA 1U6TA 1OC8A 3CXGA 6GSYA 3UMAA 3GKMA 5CREA 1YKAA 1NM3A 1QUWA 3WYWA 1LBKA 1K3OA 1NW2A 1S3DA 4L8EA 1WWJA 5ECLB 1OKDA 3PINA 1YJ6A 1GNEA 2H6YA 2WGRA 3EVIA 3C73A 1XWBA 3GH9A 1RW1A 3CBUA 3C1RA 1BAYA 3KXOA 5ECKB 2VCWA 2FD3A 4JRRA 4EVMA 5DQYA 2LJKA 2LJAA 5HFGA 1TJDA 4KB3A 3ME7A 3VK9A 1XVWA 1OE8A 2RM5A 4ZXGA 1F2EA 1XW9A 1GULA 9GSSA 3QPMA 2TRXA 2R2JA 3TJKA 4DVCA 1EP7A 1FOVA 4GTUA 4L5LA 3F63A 4KH7A 3DD3A 5CAXA 5ECHB 4AF2A 3D0ZA 1B48A 5B6MA 4TXOB 11GSA 1XCCA 5D9XA 3FZ9A 2J23A 3ZRDA 2VCTA 2WRTA 1OAZA 2EC4A 4WF4A 3A2XA 3KP9A 4JE1A 4KA0A 4K0GA 5IPGA 4MABA 4WEYA 1YQ1A 2GT5A 2H66A 2K18A 5ABRA 1WJKA 1A2LA 1VGLA 3TKRA 4IW9A 2YZUA 2VM2A 4HZ2A 3TRQA 2HT9A 2HZFA 3HY2A 2A4VA 3RPNA 3W8SA 1TP9A 20GSA 3SWLA 3LORA 5G1LA 3UVTA 3QAGA 5CNWA 3UIWA 3A3TA 2YN1A 1X9MB 3TOTA 1V40A 1YEXA 2IL3A 5IIZA 4MK3A 4ML1A 3E3EA 4ZILA 4OCEA 2H1BA 2B5YA 3O6TA 2V2GA 3CMIA 1PL2A 2CVBA 3FR9A 1DE1A 3O3TA 4POBA 4NXIA 4WETA 4D73A 1A0RP 2ON5A 4GRFA 1HD2A 3GSTA 1W4VA 5B8BA 4K8MA 5ID2B 4GSSA 5DCGA 4IJ3A 3WGEA 2H1DA 5KN3A 3F8UA 4BA7A 1B4QA 3TGZA 3GSSA 4PX1A 1XWGA 3FZ5A 4I8BA 2MYGA 3GNJA 2RLIA 3FZ4A 2DMLA 2VD1A 3IK9A 3LGCA 3OR5A 4QL7A 2FA4A 1W89A 2YWNA 4EDYA 1XW6A 3SBCA 4ZBAA 4JU5A 2C0DA 19GSA 5AIVA 2MBTA 3C7MA 4TW5A 5JWQB 1X5EA 4ID0A 3GIXA 2AB6A 2KUCA 3QR6A 4BVYA 3WD6A 4EF0A 2E2GA 2YCDA 4MP4A 1SYRA 3HVXA 3D4TA 3DGQA 4IELA 3UBKA 4IVFA 2GSSA 5ECQB 2IN3A 3QFAC 1YF0A 3F9UA 3GUSA 1TRSA 5IMAA 1FAAA 2L4CA 1SKSB 2PGTA 3APSA 3CRUA 1K0DA 1HYUA 6GSVA 2C3QA 1TI3A 4I2UA 4JZQA 3APOA 1O8XA 2FHEA 4KX4A 2HLSA 4PQIA 5F05A 1Y25A 2N5BA 5B8AA 1KBNA 2LSTA 1SJIA 3NIVA 3HKRA 2EIRA 2IMFA 1T3BA 5IOXA 3TKSE 2MBSA 3IXRA 4K2DA 2LRTA 2DC5A 2A2RA 3BCKA 4KDYA 1X9SB 2OE0A 1FO5A 1XIYA 2H71A 4ML6A 1OKTA 1GSFA 1T4YA 1QK8A 3LSZA 2AUVA 5ELAA 1K0AA 3HZ4A 3ZFLA 1GLQA 1GWCA 2VLUA 4EC0A 2LS5A 2WDUA 4TRXA 1ERVA 2KP2A 4BWSA 3CSHA 2B5EA 2CX4A 1WMJA 2FWFA 3LG6A 1XWKA 1URMA 4MLYA 4BPYA 1ERWA 5ECOB 3GMFA 2GQKA 2LEGA 1YKCA 2OACA 4XRDA 2CX3A 3ZYWA 2WULA 2BMXA 2M80A 5KEJA 1A8LA 2XC2A 2PPTA 1GSUA 3GURA 2C3TA 5G2ZA 1V2AA 2H72A 2JACA 5D96A 5G1KA 1M9AA 4POMA 2GQMA 5ECIB 1WOUA 2MMZA 2QSIA 4CHSA 4HQZA 2WFCA 3ZVJD 4GSNA 1BG5A 1IYIA 5J41A 3TB2A 1H75A 1JZRA 2VM1A 2CQ9A 4KGIA 3F6FA 2KLXA 4FYCA 3TRPA 1LJRA 3FY7A 4HJMA 2GZZA 2H1GA 1DE2A 4V2MA 4ULXA 4IS0A 1FVKA 2HFDA 1WIKA 4PUAA 3IAM2 3VWUA 4DEJA 4TXOA 2DJ3A 2IMDA 4G2EA 3TJJA 2VOCA 2YPMA 3GTUA 2NTOA 1GP1A 3ISOA 3J7Yb 3HZ8A 3WGXA 1SK0A 3CTGA 1QXHA 5ECRB 3PGTA 5DBQA 1A2JA 1OVNA 5LNKe 3CSJA 2EIOA 2GZPA 1MD3A 1XZOA 3CTFA 3IK7A 4N0VA 3FYGA 2GTUA 3EE2A 2X8GA 1QGVA 5IMCA 1SK1A 5LCZA 3BJ5A 5AISA 3WT1A 1K3LA 4MDCA 3IV4A 2YWMA 4AJ7A 1GL8A 4IHUA 4V1Ap 3EC3A 2CVDA 1ZCPA 5A5KA 2I9HA 4XS1A 2PU9C 2B6MA 1CQHA 3QAVA 2VL9A 3ZLPA 4XRAA 1RQMA 5HR1A 2LJRA 2XPEA 4X43A 5DDLA 4TR4A 2E7PA 2PVQA 2IMIA 1O7UA 2V41A 2ZUPA 1HNAA 4Q5FA 1UC7A 4ZL7A 4ZBDA 3G7IA 1R5AA 1JLWA 4POKA 2C8UA 4IN0A 3NOFA 5F06A 2QGVA 1XOAA 2H74A 1Z5YE 3DYRA 4PUFC 1F9MA 4J2FA 2AV4A 2N5FA 2L4QA 5CP1A 1ZGNA 1PL1A 2PBJA 3P2AA 4F0CA 2YJHA 3F4SA 5L71A 1H4OA 1TXXA 5KN0A 5D9WA 2V1MA 1OYJA 2B1LA 3Q18A 5D9VA 4F03A 2YP6A 1EV4A 4IBPA 1I5GA 1LU4A 2DLXA 4OFNA 5HR0A 1EOHA 5H5SA 4PXOA 4MZCA 3F0IA 2YNXA 3G7JA 3N9JA 4GLTA 3ERFA 5EY6A 1YDKA 4OO4A 1TK8B 3DRNA 4XS4A 1SD8A 2H75A 4FH8A 5CO3A 2OA7A 1V57A 1X5CA 3GKNA 3H8QA 4YQVA 1XVQA 3AY8A 4NHWA 2RUFA 4YQUA 1AW9A 1GSDA 1PSQA 2TIRA 4MH3A 2OBKA 2C0GA 5J5NA 1XBSA 1SJ6A 1TI1A 4LMVA 3IDVA 2DIYA 1CQGA 1EGRA 2PWJA 2JSYA 4WBRD 5AIXA 4NV5A 4IGJA 4AJ6A 6GSSA 1BX9A 1SJZA 3TCOA 1G7OA 2JU5A 1NHOA 2WS2A 4EL1A 5CYYA 1O8WA 1EP8A 1Z3EA 3GKKA 4OCFA 2F3MA 2VLTA 3ZL5A 3GTUB 4PQHA 1G6WA 5J3RA 2NPBA 4IJIA 3N5OA 5KN2A 2R4VA 1A8YA 4JR4A 3BCIA 1M99A 3UBLA 1A0FA 1MTCA 2XHFA 1AUCA 1DBYA 2C3NA 1Z6MA 4MPFA 2O85A 2H19A 4N0ZA 2CZ2A 1T4ZA 5EPFA 4DSRA 1HQOA 1S3CA 3GFKA 4XS6A 4E8EA 3TOUA 2NVLA 2NBSA 5C00A 4KSMA 1PKZA 2LQOA 2O8VB 5CRDA 2VD0A 3M3MA 3ZFBA 1GRXA 2L6CA 4N11A 5HR2A 1EZKA 1PKWA 1PRXA 2YV7A 2IFQB 1E6BA 5A4VA 1VRSD 1ABAA 3DVWA 3VPTA 3KMNA 3UVHA 1UVZA 1U88A 1A2MA 2GT6A 13GSA 1YY7A 2V32A 3HJPA 1QQ2A 3RHBA 2VCQA 2GZYA 2NDOA 2R5GA 1V58A 2P31A 2DJ1A 1ZMAA 2O89A 1WP0A 4K1FA 4YH2A 3GX0A 2PERA 3BBYA 1TRWA 1TW9A 4PGTA 5GAND 3WGDA 1ACVA 2H0HA 2AHEA 4FO5A 3BOAA 2L5LA 4O92A 3TJBA 2VCVA 3FK8A 1KTEA 4HU9A 3A5WA 2L57A 2A2SA 4XS4B 2YWIA 2LKUA 3FZAA 1B9XC 1J08A 3QOUA 2H73A 4KSOA 1PQNA 1Z9HA 2LNTA 2H0GA 2M72A 1TOFA 3D22A 2RIIA 2HSHA 5GSSA 3IA1A 1VF4A 2L59A 4X1UA 1A24A 2JL4A 5D9TA 4CW9A 2VL2A 3DXBA 3ZIJA 3A2VA 3QFBC 1ZYQB 1E2YA 2ALBA 3DKSA 2G0FA 2VAFA 3L0HA 6GSXA 5F8BA 2L6DA 1NSWA 4F2IA 1TU7A 3IC4A 2B5XA 2PMTA 5LD0A 4TOPA 4N30A 2PN8A 3GKXA 4XTSA 3LYKA 1GTUA 4GQCA 1GUHA 2FNOA 3DEXA 3FRCA 2HE3A 4GCIA 2H70A 2B7JA 1GH2A 2I4AA 4O7HA 1SKWB 1F37A 4HS1A 1G6YA 2ZCTA 3KJYA 3H93A 1GTIA 3KMOA 3QAWA 1R7HA 3I69A 1GSYA 5J4UA 1Z6NA 4TN8A 2VUPA 2B1KA 1VF3A 4BVXA 2DBCA 3UL3A 4LA1A 4TR1A 1TK5B 4FIWA 2X8HA 4J56E 4RI6A 3KP8A 1PD21 3MDKA 2IWTA 4O5RA 5ECMB 1SK2A 4LL1B 1JZOA 4IQAA 5H5QA 3D5JA 4RQXA 2X8CA 1AXDA 3EWLA 16GSA 2WZ9A 1OC3A 4HU7A 1BJXA 1FW1A 2ZNMA 3VWXA 3KIJA 3UOMA 4HQSA 4NPBA 3FEUA 5D8IA 5ECPB 4MJAA 2VCXA 4MPGA 2HYXA 3VPQA 1TRUA 1N8JA 1TTZA 3HDCA 2B7KA 2JZTA 5ENUA 3M1GA 4KUNA 1HNBA 1X9WB 4Q5QA 1ILOA 1K0MA 5AN1A 5H5RA 4MJEA 5COHA 2GSQA 5DVBA 2I3YA 2V6OA 2H76A 4MCUA 2HZEA 3M0FA 5KN1A 4TXVA 2IJYA 2H6ZA 3G9BA 3L4NA 2YV9A 1YEPA 2F8FA 4HOJA 3BD2A 2QC7A 1R4WA 3HYPA 4ZL8A 2HRNA 3EYTA 3L78A 4ZL9A 1O73A 3F3RA 5HFKA 2JZRA 2HSYA 4K9ZA 2GSRA 3VI5A 4MF6A 4OD7A 3LWAA 2DIZA 1XPVA 2P5QA 4POLA 5D73A 14GSA 2GGTA 3EURA 3TJFA 3CRTA 1MDKA 1AC1A 5IPHA 5FWGA 2VO4A 4BWQA 1EWXA 2MMNA 4I2TA 3CYNA 2H30A 5IOWA 2RUEA 1GSSA 1IYHA 5EVOA 1BQ7A 1RK4A 5F07A 3RPPA 1FVJA 12GSA 2PVOC 4K7OA 3KCMA 3RAZA 1T8EB 1V9WA 4NV2A 2CVKA 4F82A 1EEMA 1B8XA 4ECBA 4MZWA 3W6GA 2HRFA 3MAKA 3M9JA 6GSUA 4HUAA 1PA3A 1GNWA 5GAPD 4KDXA 3TJGA 2YWOA 1GTBA 3APQA 1M2BA 4OMVA 4TR1B 1FG4A 3H79A 1XW5A 2IFQA 2O87A 1JHBA 3F4TA 1XXUA 4K6XA 1I9DA 2JZSA 2C1YA 3F6DA 2M46A 4F9ZA 3VI7A 5IMVA 4ZB9A 4ZB8A 4MA9A 1K0NA 4AGSA 3LXTA 1R5PA 1MDJA 1NHYA 3KTLA 4KCEA 3GL3A 4PNGA 3TKSA 4KDUA 1ZOFA 6GSTA 3UJ1A 4I6XA 4CDOA 3H4KA 5DJLA 5DJMA 3ZMKA 4KNDA 4BL7A 2DJKA 1GTAA 4TR3A 1FB0A 2C80A 3VWVA 2DMMA 1TRVA 1O85A 3VFIA 1EOGA 4QL9A 1USBA 3NZNA 4TVEA 2ON7A 3RDWA 3KGKA 3H1NA 1O81A 3L9UA 5C04A 2HZEB 3US3A 3C71A 2LUSA 4X0XA 2FUG2 4MJBA 2QKEA 3IRAA 1Q98A 2LTKA 4MF5A 1M2AA 2R37A 5IMDA 1Y6EA 3P7XA 2FGXA 3R2QA 5J9BA 2GSTA 2LQQA 1M9BA 1F3AA 2CV4A 1PN9A 2H8LA 3G7YA 5E59A 3GX8A 3PH9A 2KP1A 2LNSA 10GSA 5IM9A 1T1VA 1AQVA 2GDRA 1U3IA 2KOKA 4MJCA 4NHZA 4ISDA 4I97A 4H86A 3C8EA 2BJXA 4V2NA 1S3AA 1FHEA 3QCPA 3ERGA 2MMAA 4K7NA 3TDGA 1M2DA 4HEA2 4ZB6A 4EUYA 4PNFA 1ERTA 2GVPA 3GV1A 4TKYA 3VLNA 1WE0A 4L0UA 4HI7A 4OO5A 1KNGA 4O32A 1HNCA 2GLRA 3TUEA 5HQPA 1K0CA 2L5OA 2VLVA 1YF1A 4PQ1A 3ME8A 5F0GA 3TKQA 2YOIA 1VF2A 3Q6OA 4MZBA 1MEKA 2XPDA 1B4PA 1OE7A 3KZQA 5JCGA 2IMEA 2X99A 3O76A 5A4WA 3VWWA 3HA9A 4AJ8A 2FCHA 2MZCA 5HR3A 1A23A 1U3AA 2B3SA 4OFTA 3HVVA 3KTBA 1EV9A 5FT3A 3EU3A 1K0OA 4Z7XA 1KEBA 1DSBA 4G10A 4XIHA 3HCZA 2Z9SA 4GQFA 4DSSA 2OADA 3LFLA 2DJ0A 2V6KA 1AQXA 3U5RE 1FB6A 2XBIA 4RQRA 3M9KA 3GH6A 4Q5NA 3IR4A 2TRCP 2DSAA 1X5DA 2VL2C 4ZBBA 3IBHA 4ECCA 3W8JA 2F9SA 1PX7A 1YZXA 3I43A 4NAXA 3IPZA 1WPIA 5CRGA 1THOA 3DMLA 1C72A 3IAS2 3FW2A 3GYKA 1OC9A 2YJ7A 2MMOA 3KEBA 4GSTA 1XFLA 3D6IA 4WKWA 4YAVA 4IP6A 3M8NA 1ZZYA 3ZTLA 2H01A 5B6NA 3HJOA 3RBTA 1X0RA 2GQLA 4MH2A 3ZITA 1PMTA 3Q19A 3GHAA 1BYEA 1QMVA 4L0WA 4ACSA 4ILFA 4JBBA 17GSA 4OWYA 3IHQA 4FYBA 3HJMA 2OKAA 4MF7A 4EXJA 4ECJA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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