2VLVA

Crystal structure of barley thioredoxin h isoform 2 in partially radiation-reduced state
Total Genus 33
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
33
sequence length
111
structure length
111
Chain Sequence
AEVISVHSLEQWTMQIEEANTAKKLVVIDFTASWCGPCRIMAPVFADLAKKFPNAVFLKVDVDELKPIAEQFSVEAMPTFLFMKEGDVKDRVVGAIKEELTAKVGLHAAAQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structures of Barley Thioredoxin H Isoforms Hvtrxh1 and Hvtrxh2 Reveal Features Involved in Protein Recognition and Possibly in Discriminating the Isoform Specificity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN H ISOFORM 2.
molecule tags Oxidoreductase
source organism Hordeum vulgare var. distichum
total genus 33
structure length 111
sequence length 111
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date 2008-01-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2vlvA01
1Z3EA 5AN1A 2F9SA 1NW2A 5HR1A 2ZCTA 5DVBA 4BL7A 4HU7A 2MBSA 5J41A 3DWVA 1F2EA 2N5AA 2JADA 3P8WA 3F4TA 3CRTA 4MZCA 4BVXA 1F3BA 4EVMA 3A3TA 3VI7A 2MMAA 4PNFA 4F9ZA 2LQOA 4TR1B 1FVKA 2WDUA 2OBIA 1OKDA 2WS2A 1T7PB 2LEGA 3WGEA 2OE0A 1HNBA 5CYYA 4HS1A 2QC7A 2HSHA 1K0BA 4ZBAA 4MK3A 2ES7A 1U3AA 4MJCA 1ZCPA 2H72A 4WKWA 1TK8B 1YZXA 20GSA 1AAZA 2LKUA 3GKKA 1TTZA 2I81A 3TCOA 3R2QA 4MF5A 5ECMB 1PL1A 5F06A 5HFKA 4EKZA 3LWAA 13GSA 6GSYA 3CSHA 3RDWA 5ECLB 2HZEA 3EC3A 3UBLA 3N9JA 4LLRA 2MMZA 3D22A 1OKTA 2B7KA 3UAPA 2O85A 3ERGA 1TRSA 3F0IA 5IIZA 1A2JA 5H5RA 2OADA 2H6YA 1N8JA 1SL0B 4WBRD 3L9SA 4TOPA 1MD4A 4WXTA 3F4RA 3H1NA 4KB3A 4WETA 5ECKB 3GX8A 2LUSA 4GSTA 1BAYA 3C8EA 6GSWA 1TU7A 2C0GA 2GQKA 3TJJA 1V2AA 1SK0A 2TRCP 4KSMA 4G19A 1EOHA 2YPMA 3GKXA 3IDVA 4GWRA 1MD3A 3HCZA 3GMFA 1I5GA 1O7UA 3VURA 2CZ3A 1QK8A 1A24A 4V1Ag 4K2DA 2VCQA 3DGQA 2E2MA 2GQLA 1GSEA 2H1DA 2OKAA 2FA8A 2QGVA 3APSA 4KCEA 3GHAA 1GTUA 4QL7A 2CX4A 3GUSA 4DVCA 2HZEB 5A4VA 5ECIB 2YCDA 2P5QA 5G1LA 5CO3A 4GRFA 3EE2A 4ZB6A 1Z9HA 1G7OA 1R7HA 1X9MB 3VPQA 3DVXA 3H8QA 4KDYA 1GLQA 3KMOA 4MJAA 5EY6A 2HXKA 1R5PA 3WD6A 4Z7XA 2FWFA 4RI6A 3SWLA 4KSOA 5J9BA 1XWKA 4XHMA 3PINA 3I43A 3VWXA 3H4KA 1GSSA 2B5YA 4WBJA 3D4TA 3DMLA 1U6TA 1GSUA 1TK0B 5DQYA 2YWOA 1B4QA 11GSA 2B3SA 3LGCA 1ZMAA 5IPHA 3HXSA 2O89A 5B6MA 2L5LA 2OE1A 2CX3A 12GSA 2IMIA 4MA9A 2C80A 2DJ0A 3IE3A 1PD21 4I2TA 3GIXA 1FAAA 1T1VA 4TVEA 5F0GA 1JZOA 1XWAA 3IXRA 3G7YA 1WJKA 1VF1A 2ON7A 3I69A 1THXA 3RAZA 4DEJA 3ZIVA 3KIJA 1ACVA 2N5FA 2LV3A 3TGZA 2CT6A 1Z7PA 3GRXA 5ECOB 4ECIA 4Q5QA 2ZUPA 5JWQB 3G7IA 2C0DA 5D9TA 3FZ9A 5IPGA 2K18A 4HQZA 1RK4A 1M2DA 1QUWA 5JCUA 2J9HA 2O7KA 2VO4A 1ZL9A 3CBUA 4ZBBA 5HFGA 1A2MA 3HVSA 1GTAA 1XIYA 2GDRA 3ED3A 2R4VA 5IM9A 1RQMA 2DMMA 3GSSA 2EIRA 2VLTA 3A2XA 4HU9A 2DJ2A 2F51A 3RPPA 2GLRA 1PA3A 3HZ4A 3IOSA 1AXDA 2F3MA 3LFLA 2K6VA 2WCIA 2YV7A 1X9WB 3KXOA 3W8SA 1OE8A 2YANA 1PQNA 3FRCA 4JEDA 2KHPA 3NOFA 3N5OA 1TK5B 1AQWA 5ECRB 2VCXA 5KN0A 2C3TA 2QSIA 5J5NA 3WYWA 4RUVA 3MWHA 4EDZA 4K7IA 5G5FA 1MEKA 1AUCA 3TUEA 2H1AA 1JZRA 3D4MA 1PSQA 3GSTA 3ZZXA 2PVOC 2V32A 1FHEA 1EZKA 1YKAA 1GSQA 1M7TA 2LRTA 3KEBA 1YEPA 3A2VA 3IPZA 1SJ6A 4IBPA 4MZWA 1RW1A 4DSRA 4DSQA 3TJKA 3TB2A 1UC7A 4JBBA 2R5GA 4GLTA 3LYKA 1TU8A 4XCSA 1URMA 1B48A 4AJ8A 3L0HA 4ZL9A 5AIVA 1GLPA 4NAXA 3TRPA 3C71A 5C00A 3HY2A 1X9SB 3HZ8A 1TRVA 1OC3A 4JE1A 4I97A 3ZRDA 3QPMA 2IMFA 2CVBA 4ECCA 5IOXA 4O7HA 2YZHA 4MCUA 3WT2A 1AIUA 3Q19A 2NBSA 2FY6A 3GNJA 2NPBA 1JLWA 4BWQA 1F3AA 3O3TA 3GFKA 1WOUA 4TXVA 1ON4A 4MH2A 5D73A 3BBYA 1JFUA 2IJYA 2VLUA 3QAGA 1O6JA 5ECHB 1GUMA 5CRGA 3ZITA 1B4PA 2VM1A 1ZYQB 4YH2A 4KNDA 5CP1A 3FW2A 2B1LA 4L5LA 5D8IA 5DALA 3AY8A 1QFNA 2E7PA 6GSTA 4NMUA 3DVWA 5GZZB 4PXOA 2VL9A 5LD0A 4LMVA 4XIHA 1XFLA 1VGLA 3ME8A 3D6IA 3I6AA 2LJRA 1YQ1A 1ST9A 2YZUA 1A2LA 4GTUA 4KGIA 2H73A 4N30A 2MYGA 3US3A 3O6TA 1KNGA 3KH9A 4FIWA 3HA9A 4E8EA 4ECBA 1VF2A 2GZYA 1SL2B 1IYIA 3HDCA 1GTBA 2IMDA 3BCIA 1K3LA 2VM2A 2I1UA 3CYNA 2I4AA 3IA1A 2AB6A 4IN0A 2FD3A 2VL2C 4YQVA 3NZNA 2LRCA 2R2JA 4O92A 3PH9A 2O87A 3CSIA 2NTOA 4PGTA 5AISA 3ZMLA 3DEXA 4GSNA 1F6MC 2MMOA 1XPVA 1TXXA 3GTUA 3KMNA 1K0OA 2MMNA 3M3MA 5KN1A 2HLSA 2MZCA 4NHWA 4AJ6A 1HD2A 1SK2A 5DALB 3BCKA 3KGKA 1EP7A 2AJQB 1R4WA 1CQHA 2LTKA 2HT9A 2YWNA 2RIIA 3HJPA 4NV2A 2B1KA 4POMA 1XOAA 3IAS2 3KD0A 4Q5NA 4TRXA 5B8BA 1WPIA 1EGRA 3FHKA 5INYA 5ECPB 4L5OA 1B9YC 2VOCA 1GRXA 2IPAA 4LL4B 2G2QA 4KDUA 2B6MA 3ISOA 2L59A 3VPTA 16GSA 5KN2A 4H86A 3HD5A 3L9UA 3L9VA 3V1WA 3FZ5A 4MP4A 1X0RA 2H66A 2CZ2A 4HUAA 4KDXA 1LBKA 1HNCA 4ILFA 2CV4A 1DUGA 3LORA 5ID2A 2FUG2 4MZBA 2C1YA 2GSQA 4IQ1A 4CHSA 4KAEA 2G0FA 1U88A 1SU9A 2OE3A 2WFCA 2FA4A 2Z9SA 1XVWA 1WMJA 4G9HA 3M1GA 4ZXGA 1DBYA 1NM3A 3M8NA 2VL2A 1TP9A 5CAXA 3GTUB 1GSYA 4OO5A 4POBA 2RLIA 1PKWA 4NHZA 2DBCA 4ZL7A 1G6WA 2GS3A 5ELGA 1UVZA 5G1KA 1ZOFA 2GSTA 4EC0A 3HKRA 4KW6A 4L0WA 1XOBA 1YEXA 1G0TA 2EC4A 4WR4A 4TKYA 3P2AA 4KX4A 2LNTA 5L71A 5HR3A 5ELAA 4Q5RA 4PUAA 3EYTA 3DD3A 2DIYA 3GV1A 1JLVA 2J23A 2DJJA 3MNGA 1A0FA 5G30A 1SKRB 1THOA 2K9FA 1XW9A 3HJOA 2N5BA 2P31A 1AW9A 5FHIA 2L5OA 4GSSA 4ZB8A 5FT3A 2FGXA 1O81A 5KN3A 3KP9A 4NWYA 2YJHA 4IGJA 1BX9A 1GTIA 5DJMA 4OFNA 5ID2B 1DSBA 1SD9A 3TKRA 6GSVA 1FO5A 3WGDA 2JSYA 1KTEA 1A8LA 4GQCA 4XRDA 1TKDB 3EU4A 4K0NA 2VCVA 5F05A 1ZGNA 4WEYA 1S3DA 3VLNA 2LNSA 1T8EB 1Y25A 5IMAA 1K0CA 3ZYWA 1Z6MA 2XBIA 1SKSB 3IK9A 1I9DA 2FNOA 3FYGA 2L6DA 3GH9A 1JHBA 1K3YA 3KJYA 4IP1A 2FWEA 5CRDA 3QAVA 1EEMA 1F9MA 3FR3A 4MF6A 1XCCA 4O32A 3FR6A 1V98A 10GSA 2GTUA 3DRNA 4MJEA 2F8FA 1Q98A 2VUPA 1M9AA 5DCHA 1J0FA 4Q5FA 2WZ9A 1ILOA 1KEBA 5DAKA 2GZZA 1E2YA 3VK9A 1YF1A 3EURA 1XWGA 2X8HA 3TKPA 4K7OA 2M46A 1YDKA 1BEDA 1FOVA 5ECQB 2R6KA 3GN3A 4CW9A 5GAPD 3UARA 1OC9A 3DYRA 5EPFA 5F07A 1X5CA 5CRWA 1PRXA 4DSSA 4IQAA 1LU4A 3ZTLA 1AC1A 2YWIA 2PN8A 5AIXA 5IQYA 4ZBDA 2YOIA 4GF0A 5C04A 3IC4A 2QKEA 3FY7A 1K0AA 1BG5A 4G10A 5JCGA 3F8UA 4NV5A 3CTGA 1B8XA 1SJIA 4HEA2 4PQIA 3C1RA 2IL3A 4X1UA 2EIQA 1QQ2A 3RHCA 1WE0A 3LQ7A 3IAM2 1K0NA 2B5EA 3LSZA 3UJ1A 3CSJA 3TOUA 3QMXA 1GH2A 3LJRA 3U6VA 2VL3A 3UVTA 1FB6A 1R5AA 2NVLA 4I5QA 5GAND 1PKZA 4J57E 2DLXA 7GSSA 2PERA 3ERWA 3TJFA 2DIZA 3I9V2 5DAKB 1Q4JA 2VCZA 3HYPA 2L4QA 5CREA 4XS4A 3VWUA 3ZVJD 3GYKA 4IW9A 5JCWA 1T4YA 1T3BA 2IMKA 5FWGA 2OA7A 3ZIJA 3GURA 4XRAA 4K6XA 4MH3A 2DC5A 2LRNA 2HYXA 4L8EA 1OC9B 5JWOB 2VCTA 2I3YA 3M0FA 2HZFA 5IO0A 1XW6A 1TOFA 4DSSB 1J08A 5HQPA 2FWHA 1HYUA 3GL3A 3UOMA 2OACA 3C1SA 1VRSD 4PQ1A 3Q74A 1ERVA 3L78A 4XTSA 3GKNA 2H0HA 3WGXA 2K8VA 1UN2A 5COHA 2V6KA 5DDLA 1MTCA 3PGTA 2GT5A 5JWRB 2FWGA 2LSTA 3ERFA 2KP1A 1YKCA 1FB0A 18GSA 1EGOA 3EMPA 3IR4A 1V40A 2BMXA 2WJUA 2XPEA 2X8GA 1TRWA 4ML6A 1OYJA 5EL8A 3NIVA 1BQ7A 1A23A 2REMA 4EF0A 4HI7A 3LXTA 3BD2A 2VAFA 4F2IA 2PPTA 3ZMKA 1OVNA 5IMVA 2H74A 1OC8A 1Z5YE 1EEJA 4XS4B 3IK7A 2VCWA 4TXOA 4K1FA 5D9WA 4J2FA 2OBKA 1R26A 2WRTA 2C4JA 2H30A 4MMMA 3TRQA 4MABA 5DJLA 4XS6A 1FW1A 2O8VB 4JR4A 4I2UA 3H79A 3H93A 4HJ2A 4EO3A 3E0UA 2P5RA 1G7EA 3IV4A 5HR0A 2FHEA 4PNGA 5ABRA 2R37A 1NHYA 2AAWA 3VI5A 1K0MA 2PBJA 3F4SA 3FEUA 5H5SA 4F03A 1SENA 4OFTA 4LA1A 2CQ9A 2AHEA 2YJ7A 4BA7A 1GUKA 2H0IA 2PWJA 3EMXA 2AUVA 1G6YA 2GZPA 3QFAC 4FYCA 5B8AA 2A4VA 1GWCA 1TI1A 5G5EA 2JL4A 2GSSA 2B7JA 4NXIA 3UL3A 2IWTA 1XWCA 5IOWA 4V2LA 1GL8A 19GSA 1E6BA 4LMWA 4WF4A 3FZ4A 4BPYA 3MAKA 1S3CA 5IMFA 4YQUA 4PQHA 2M80A 2RM6A 2RM5A 4E8HA 4I6XA 4LL1B 3HVVA 4TXOB 4GXZA 2H70A 3E9JB 2DJ1A 2IN3A 2PUKC 3LG6A 4ULXA 4ZB9A 2IFQA 1TW9A 2FCHA 3RPNA 1ABAA 4OCEA 3QD9A 5IMZA 3A5WA 9GSSA 2E2GA 1FG4A 1S3AA 1H4OA 3F63A 4EUYA 4KE3A 3HHVA 4QQ7A 1XZOA 1M99A 4FYBA 2C3QA 4KH7A 2V6OA 1SYRA 3BJ5A 2H6ZA 5AGYA 2PU9C 1EWXA 3KCMA 2C3NA 3GX0A 2YWMA 2OJLA 1GULA 3L4NA 5IMDA 3F3RA 4V1Ap 4HZ2A 4ML1A 3QFBC 5GSSA 2H0GA 3TKQA 1OAZA 4TN8A 3QCPA 1O8WA 5B6NA 2HE3A 2YP6A 2H1BA 5A5KA 2TRXA 2HNLA 2H71A 4IVFA 1ERUA 2YN1A 1EV9A 4FH8A 1X5EA 2CAIA 1TDIA 2GQMA 1Z6NA 1IYHA 2I9HA 3TDGA 2A2RA 3ME7A 5J3RA 4RQXA 1WRYA 2D2ZA 4TW5A 3OR5A 3UEMA 3PR8A 3P90A 4OD7A 2JZSA 3UIWA 1PGTA 2V1MA 4MPFA 3SBCA 3FK8A 3RHBA 3WT1A 6GSUA 2KLXA 4OMVA 3EWLA 4ISDA 2L57A 3JCML 4EXJA 4IJ3A 3F6DA 2IFQB 1WP0A 3O76A 2R3XA 2BTOT 2HSYA 3ZLPA 1SYXA 3EU3A 3IRAA 4V2NA 2GGTA 1EP8A 3A2WA 3G9BA 1X5DA 4MDCA 1MDKA 2XC2A 1K0DA 5E59A 4F0BA 1GUHA 2V41A 1GNWA 5EVOA 2H01A 4YAPA 3ZL5A 4K0GA 2TIRA 4HDEA 3HVXA 3C73A 2LJKA 1M9BA 1UA5A 2L6CA 5KEJA 3QOUA 1NHOA 4K7NA 2DJKA 5A4WA 3ZFLA 3D21A 2LQQA 3KH7A 1SJZA 3Q18A 4MJBA 4NPBA 2YV9A 2C8UA 3G7JA 3F6FA 4HZ4A 1XVQA 1ML6A 2V2GA 1V9WA 2H19A 1QGVA 1FVJA 3MDKA 2MBTA 3U5RE 1N2AA 4IKHA 2H8LA 4ECJA 3FR9A 5J4UA 1AQXA 4F82A 2HFDA 3TJGA 2DSAA 3CMIA 4MF7A 4N10A 1BJXA 4AGSA 1AQVA 1PN9A 2X64A 17GSA 2JSZA 1GSDA 4ACSA 4RI7A 3D5JA 1T4ZA 4YQMA 4D73A 2CAQA 5G31A 3DKSA 4TR0A 1SL1B 2H76A 1Y6EA 4L0UA 4FO5A 5D9VA 1HNAA 2GSRA 8GSSA 3TRXA 5IMCA 5H5QA 4J56E 5F8BA 3Q6OA 3GKMA 4KA0A 4V2MA 2WB9A 3TKSC 1KBNA 3C7MA 1EV4A 2RUFA 5DBQA 2C0EA 4POLA 3UMAA 2CVDA 2HRFA 2K8SA 1EOGA 5ECNB 1DE1A 3M9KA 1TI3A 4GQFA 1OE7A 1T00A 2BJXA 3UBKA 2RUEA 2KP2A 4F0CA 2IMEA 2AYTA 4WR5A 3APOA 1NSWA 2WGRA 4PUFC 4YAVA 3RBTA 4N11A 4I8BA 4ZIJA 2PGTA 1YY7A 2PMTA 1YJ6A 1TRUA 2HRNA 4EDYA 2ALBA 4AJ7A 1WIKA 1O73A 3ZREA 4D73B 4IJIA 5GSTA 2VIMA 3HJMA 5DCGA 5LNKe 1H75A 4BVYA 1V58A 1XW5A 1MDJA 1JZDA 4EL1A 1GP1A 3J7Yk 3VWWA 5D93A 3KZQA 1O8XA 2GT6A 2XBQA 2C0FA 3QR6A 22GSA 2XPDA 2VD1A 4X43A 3ZVJA 1SK1A 4O5RA 4KCAA 3KP8A 1GSFA 2HI7A 1O85A 3S9FA 1ERTA 4OWYA 1ZYEA 1W89A 3J7Yb 1ZZYA 2E0QA 2B5XA 1V57A 3LYPA 3TKSA 1J9BA 3LXZA 2VLVA 4IHUA 3P7XA 4JZQA 3CRUA 1PX6A 4ZL8A 1XXUA 6GSXA 1U87A 4N0VA 4HOJA 5A4UA 1M0UA 3F3QA 1BYEA 3GL5A 1TJDA 4JR6A 4TR4A 3D0ZA 5G2ZA 2WULA 3IBHA 2FLSA 4FYUA 2X99A 5HR2A 2LS5A 4K9ZA 2NDOA 1B9XC 1GNEA 3BOAA 4IP6A 5B7CA 1VF4A 4JU5A 3VFIA 3GH6A 3W8JA 1W4VA 1CQGA 3TJBA 3ZFBA 1M2AA 1SD8A 3LEFA 5D9XA 4MPGA 3KTBA 6GSSA 3QDNA 2M72A 2H75A 3W6GA 3GA4A 1PL2A 1XBSA 2ON5A 3KM6A 4WF5A 4OFMA 1F37A 2DMLA 2EIOA 2JZTA 3K8NA 3IHQA 2CA8A 1A8YA 1QMVA 4G2EA 2P0GA 4QL9A 2H1GA 2L4CA 5D96A 1C72A 3FKFA 3EINA 5IO2A 4PURA 4HJMA 1LJRA 4XS1A 14GSA 2KUCA 5E4WA 1VF3A 1SKWB 2XHFA 4OCFA 3TKSE 4HQSA 1USBA 3M9JA 1XWBA 5J9CA 3UVHA 3MSZA 3EVIA 5ENUA 2JACA 1A0RP 1DE2A 4X0XA 4TR1A 2H6XA 1YF0A 2YNXA 3DIEA 4ID0A 1U3IA 2F8AA 1PMTA 3CTFA 4OO4A 3F9UA 4PX1A 5ECSA 4N0ZA 1PX7A 1M2BA 2A2SA 5LCZA 4P3YB 2CVKA 4GCIA 1HQOA 3E3EA 4K8MA 4KUNA 5CRHA 3APQA 2VD0A 4ZILA 4RQRA 2ZNMA 5HFIA 4MLYA 5DQSA 4CDOA 2DJ3A 1QXHA 2PVQA 3TOTA 1WWJA 4BWSA 3VWVA 1ERWA 2GVPA 3FZAA 1K3OA 1JZWA 2LJAA 3QAWA 4IS0A 2JU5A 1Z7RA 4IELA 4JRRA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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