2VUPA

Crystal structure of a type ii tryparedoxin-dependant peroxidase from trypanosoma brucei
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
AASSIFDFEVLDADHKPYNLVQHKGSPLLIYNVASKCGYTKGGYETATTLYNKYKSQGFTVLAFPCNQFGGQEPGNEEEIKEFVCTKFKAEFPIMAKINVNGENAHPLYEYMKKTKPGILKTKAIKWNFTSFLIDRDGVPVERFSPGASVKDIEKKLIPLLEST
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Trypanosoma brucei
publication title Structural and Mechanistic Insights Into Type II Trypanosomatid Tryparedoxin-Dependent Peroxidases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords GLUTATHIONE PEROXIDASE-LIKE PROTEIN
total genus 48
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 1.11.1.9: Glutathione peroxidase.
pdb deposition date 2008-05-28

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00255 GSHPx Glutathione peroxidase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2vupA00
3HJMA 3ERGA 2H6ZA 1FO5A 4POKA 1ON4A 3CSHA 1J9BA 4XRAA 3CMIA 3WGDA 3QPMA 2OBKA 1QMVA 3F4SA 4K7IA 3LFLA 1YKAA 1SK0A 4MABA 3KH9A 3HXSA 4DSSA 1A8LA 3QAVA 3DYRA 1HD2A 1PQNA 1C72A 1OKTA 3ZMLA 2ZUPA 5CRHA 3GSTA 1R4WA 2HYXA 5FWGA 2IPAA 3RHBA 1FB6A 1F6MC 5EPFA 3GKMA 2VL9A 1GH2A 4V2LA 1GSUA 1ZMAA 5JWRB 2VD1A 3A2WA 1XW5A 3P2AA 3VLNA 2VLVA 2F51A 3C7MA 4N0VA 5B8BA 1ERUA 3FK8A 3D21A 1B4QA 1V57A 5DDLA 2JL4A 2DSAA 5AGYA 5DAKB 2H76A 2X8GA 3I69A 4XHMA 1JLVA 4BVXA 5AIVA 1ACVA 3BBYA 1GTUA 3KCMA 7GSSA 1KBNA 3ZZXA 3F63A 5ECSA 3IPZA 1N2AA 4MPGA 2RM5A 2JSZA 4PNFA 3LJRA 1O8WA 2HZEB 2DIZA 4KUNA 3TJKA 3GN3A 2B7JA 2YZUA 4EUYA 5CRDA 1Z7PA 1W89A 3H1NA 3TB2A 3HKRA 8GSSA 2MZCA 4E8EA 2CAIA 5HFIA 3WD6A 2FD3A 4PQHA 1GRXA 2PU9C 1XOBA 2ZCTA 1OC9A 4TR1B 1PA3A 1GUKA 4ECIA 1TRSA 3Q6OA 1EOGA 2BTOT 4X0XA 3DXBA 3IK9A 4F0BA 2RM6A 1HNCA 4KDYA 4K8MA 1UVZA 3FHKA 3GTUA 1JZWA 3GX8A 2F3MA 4WXTA 1B8XA 3UL3A 1M2AA 1ERWA 2MMOA 3IC4A 3GL3A 4QL7A 1TK8B 4CDOA 1MDKA 2LQQA 4PGTA 2F8AA 3LXZA 6GSSA 4FH8A 3FKFA 1F3BA 2LTKA 3APOA 4N0ZA 4NPBA 2CZ2A 4AJ7A 5ELGA 5G2ZA 1YEPA 1EEJA 2YV9A 4KDUA 18GSA 1EOHA 1AXDA 2H72A 4RQXA 5B6NA 2LRCA 3UJ1A 1TKDB 4V2NA 4KCAA 4RI7A 4K0NA 4OCEA 3GMFA 2LNSA 2J23A 3UVHA 1ZL9A 2X64A 3VPQA 4KCEA 2WCIA 2BMXA 1SL0B 1ERTA 3C73A 3IV4A 1I9DA 4DSSB 2R37A 4F0CA 3CBUA 1SJZA 4LMVA 3TDGA 4YQVA 1SJ6A 4G2EA 2HSHA 2E2MA 4KNDA 4IELA 4ZL7A 3KEBA 2GVPA 4GRFA 1N8JA 2KOKA 1TTZA 2VAFA 4MPFA 1THOA 2IMDA 2H8LA 2DJ1A 1U3AA 4K1FA 5F0GA 4PXOA 3I6AA 3BD2A 2FWGA 3VK9A 4HQSA 5B6MA 4Q5FA 2OE1A 4MH3A 1NHOA 2GT5A 1ILOA 3D6IA 3RHCA 1XWKA 2C3NA 3MNGA 4O7HA 1JZOA 3F3QA 5DQYA 4XS4A 1O8XA 4WF4A 4IHUA 4LA1A 3APSA 1EP7A 5ECLB 3TJJA 3I43A 3BCIA 1ZZYA 1USBA 1NSWA 4HUAA 2IFQA 3M3MA 4IBPA 4GF0A 2VLUA 1I5GA 2A2SA 2M72A 6GSUA 3RBTA 2KUCA 3GKKA 4MZCA 3F6FA 1AQXA 1X0RA 3E0UA 3L0HA 1WMJA 5IO0A 3F4TA 3KD0A 2YWOA 3ZIVA 3ZRDA 1NHYA 1AC1A 1M0UA 2K9FA 2LKUA 2GSSA 1K3YA 1U3IA 3PGTA 3IK7A 5JWQB 1WE0A 4ILFA 2H75A 4PNGA 1K3OA 2FLSA 5D9WA 1OKDA 2QC7A 6GSVA 1ML6A 3OR5A 4ISDA 5COHA 2VCZA 1XXUA 5DCHA 2LUSA 4LLRA 3GTUB 3ZL5A 3LG6A 2YOIA 4ZL9A 1URMA 3KM6A 1YZXA 3ZLPA 4X1UA 4MJAA 4XRDA 4DVCA 3TUEA 4K9ZA 2JACA 1QFNA 5INYA 5ECQB 2AAWA 4IKHA 3ZIJA 1OE8A 5IMFA 4TOPA 1PKWA 2P5QA 2WULA 1PMTA 2LNTA 4JR4A 2VD0A 3GA4A 2OADA 1O81A 3E9JB 2LJAA 1WWJA 4N10A 1MEKA 4XS6A 5DJLA 1YY7A 2JZTA 2WJUA 2OKAA 2HSYA 2OJLA 4WBRD 2HLSA 2YWMA 4MF7A 1K0NA 2LRNA 1FAAA 3QD9A 3A2XA 3PINA 2L4QA 2REMA 3ZTLA 4EF0A 2IJYA 4BWQA 4QQ7A 2H1AA 1SL2B 4J57E 3GRXA 3EE2A 6GSTA 3M8NA 4MLYA 2P31A 4OFNA 1GWCA 3WGEA 2CVKA 4POLA 3FW2A 2OBIA 3QCPA 1Z6MA 1AQVA 3HYPA 1JZRA 4KH7A 2I3YA 2LS5A 1A2JA 4N11A 4AJ6A 4MMMA 2FA4A 3IAS2 1S3CA 4YQMA 3DRNA 3ZMKA 3U5RE 4ZBDA 3FZAA 5D9XA 1RQMA 4F82A 1KTEA 3HZ4A 3H93A 2RIIA 2O7KA 1A8YA 1X5CA 1K0MA 1DE2A 4K7NA 5IPHA 4WF5A 1WP0A 2K18A 3A2VA 5A4WA 4G10A 3APQA 3GYKA 1SKSB 1DE1A 4ULXA 5FT3A 1AQWA 2YWIA 3UMAA 19GSA 2EIQA 4OO5A 3UEMA 2AYTA 3VWUA 1Z9HA 4G19A 1M9BA 2YCDA 4ZBAA 3O76A 2DMLA 4IGJA 3FR6A 3KH7A 1QXHA 3LYKA 2V32A 1F2EA 2L5OA 1PD21 1G7EA 5F8BA 2ALBA 1PSQA 3G7YA 3EC3A 3GKNA 4J2FA 3C8EA 4TN8A 2HZFA 1GLPA 3TKPA 3EU4A 1YF0A 3MWHA 3R2QA 4TVEA 3EINA 6GSYA 2Z9SA 1V9WA 1VF4A 2V1MA 4HZ4A 2MMAA 2PERA 1BG5A 4OO4A 2GSRA 1M2BA 4JE1A 2KP2A 2DJJA 4OFTA 4MZBA 3Q19A 3SBCA 10GSA 1Z5YE 1IYIA 2DIYA 1MD3A 2OE3A 1XVQA 2MYGA 2OACA 2WB9A 2C0GA 2IMEA 4MH2A 1FG4A 1XW9A 5IMDA 1O7UA 2WGRA 2B1LA 2AB6A 4MK3A 2IMFA 1YKCA 3W8JA 4KGIA 4EC0A 1HNBA 11GSA 1R5AA 4I97A 3H8QA 2XPDA 4GWRA 1EEMA 1AW9A 4IP1A 2P5RA 5DJMA 2H1BA 1VRSD 3O6TA 2KLXA 1ZYEA 3J7Yk 2V2GA 4HEA2 2AHEA 1YEXA 1F37A 1U88A 2XHFA 1GSQA 3D4MA 3IA1A 3QFBC 4ZXGA 2O8VB 3DMLA 1TRVA 5D96A 3VWWA 2VUPA 1TI3A 4TKYA 4BVYA 5FHIA 3O3TA 1X5EA 3IR4A 2WFCA 3HVSA 3US3A 4GQFA 2G2QA 1XBSA 5C00A 3VWVA 4PQIA 4LMWA 1GNWA 3QOUA 2VCQA 3F4RA 5CRWA 3C1RA 3A3TA 1XZOA 4JRRA 2DLXA 5IOWA 2FY6A 4IQAA 5F07A 2NTOA 4WETA 2JADA 3IAM2 2GLRA 4GSNA 3DKSA 2GTUA 3LWAA 3TKSC 4L5OA 3DVWA 4H86A 2IL3A 2LQOA 3L78A 4K0GA 4K6XA 4ECCA 2HT9A 3CYNA 4NMUA 1BQ7A 2HXKA 1HQOA 2CAQA 4Z7XA 1THXA 4L0WA 4ML1A 5ECIB 2E2GA 2H01A 4E8HA 2VM1A 5IOXA 1XIYA 4LL1B 2YV7A 4OCFA 4L8EA 4OWYA 3RAZA 4FO5A 4ZB8A 3LQ7A 3ZITA 1V2AA 1XCCA 2PUKC 2K6VA 1OC3A 1GL8A 2VO4A 4AJ8A 1A24A 4HDEA 5ID2B 4ZBBA 2X8CA 2VLTA 1CQGA 3GFKA 1SJIA 4ZIJA 3NOFA 4DSQA 4ECBA 4ZB6A 1PX6A 3EMXA 3FZ9A 1SL1B 3D0ZA 1GSDA 4IJ3A 1ZCPA 4NWYA 5D9VA 2CQ9A 1JZDA 2C3TA 1FW1A 5F05A 2CZ3A 2CVBA 3GURA 3TGZA 5HR1A 1LU4A 3HCZA 3P7XA 5JCWA 2GQLA 1GUHA 4EXJA 1BX9A 2CA8A 2PVOC 1R5PA 5DALA 4I2TA 2CX4A 3M0FA 1XW6A 5CREA 1X9MB 3TKSE 3C1SA 2IMIA 4IQ1A 4XCSA 3BJ5A 1XOAA 1S3AA 2GQKA 2TRXA 4FYUA 4TR0A 4ACSA 2B7KA 2VIMA 1XWAA 1YQ1A 1TDIA 5ENUA 2H0HA 5KEJA 3UBLA 5CP1A 5GAND 3HVVA 5JWOB 14GSA 2H30A 4FYCA 2NBSA 2PPTA 4HZ2A 5AN1A 4YAVA 1T4YA 2AJQB 1GSSA 4O5RA 3UBKA 3TKSA 3KXOA 2FNOA 3KMOA 1Q4JA 3FEUA 3CTGA 3SWLA 3EURA 4K2DA 3GIXA 3VFIA 2HNLA 2XBQA 4L5LA 4HJ2A 4YAPA 3LXTA 1SKRB 4OFMA 1EP8A 1SYRA 2N5FA 2HRFA 3EVIA 1TRUA 1UA5A 5G5EA 3WYWA 1OYJA 2QSIA 2FWFA 2MBSA 3ME7A 2EIRA 5B7CA 2DJ2A 2RLIA 2GZZA 1FHEA 3LORA 3EU3A 3DVXA 4TXOA 3M9KA 3UARA 1QQ2A 5D9TA 1AAZA 5HR2A 4ID0A 4KSOA 3HZ8A 5CYYA 5J5NA 3V1WA 5IQYA 2P0GA 2YJHA 1DSBA 4Q5QA 5D8IA 2PGTA 1OC9B 1AIUA 3VWXA 5ABRA 1K3LA 1NM3A 1SD8A 3HY2A 2H1DA 2XPEA 3GH9A 4JU5A 2VCXA 3ZFLA 5GSSA 1XPVA 2LEGA 1R7HA 2AUVA 2LSTA 4POBA 3ISOA 3HJPA 4TRXA 5A4UA 1EGOA 2YP6A 2VCWA 2M46A 5DQSA 4ZL8A 2ON7A 3CTFA 4PUFC 5H5RA 2QKEA 2YJ7A 1EGRA 4I6XA 1GSEA 4GLTA 5J41A 4EVMA 1PN9A 1T4ZA 4NV2A 2R3XA 2I4AA 1VF2A 5LCZA 4JZQA 1BEDA 2JSYA 1K0AA 4PQ1A 1HNAA 2RUEA 1MDJA 3KIJA 3IOSA 3LSZA 5EL8A 2H71A 3UOMA 3I9V2 2YZHA 4WR5A 3F8UA 1B9XC 5DAKA 5ECMB 3QMXA 4YH2A 5IM9A 2H74A 3E3EA 3ZVJD 1SYXA 5GSTA 5DALB 1TXXA 4ECJA 3PH9A 5CRGA 2B5EA 3WT1A 1B4PA 5G30A 2L59A 1FOVA 2DJKA 1X9WB 3GUSA 4BL7A 1GSYA 5GAPD 3UVTA 4WBJA 3ERWA 4KB3A 3CRUA 4X43A 3D4TA 2PMTA 2ES7A 4GTUA 3CSIA 3UAPA 4OMVA 4GSTA 4NAXA 2H66A 1K0DA 2EC4A 4I8BA 1LJRA 3TJGA 2GGTA 5A4VA 1J08A 3TJBA 3D5JA 3IE3A 1SKWB 1O6JA 5H5SA 1V58A 1QUWA 1WIKA 4HJMA 5LD0A 4TR1A 1UC7A 4HS1A 4KA0A 2H6YA 2HE3A 2B5YA 4XS4B 2LJRA 1QK8A 5D73A 5DBQA 3TJFA 4Q5NA 1X9SB 2H0GA 1PL1A 2M80A 2A2RA 2IFQB 4KSMA 3HA9A 3W6GA 3QR6A 3TOTA 2J9HA 1TJDA 1AUCA 4V1Ag 2FCHA 4P3YB 2L6DA 3KMNA 2ON5A 4IN0A 3J7Yb 1TK0B 2C0EA 2JZRA 1MDIA 1KNGA 4BPYA 4TXOB 3QDNA 1GTAA 3JCML 3NZNA 3DGQA 5IIZA 2C4JA 2G0FA 4PURA 2VCVA 5H5QA 2OE0A 2GT6A 9GSSA 5G5FA 4KE3A 4EE0A 4D73A 2JU5A 5KN0A 3UIWA 1J0FA 1H4OA 4AGSA 3KP9A 2I1UA 2R6KA 2WDUA 1BYEA 1RW1A 3RPPA 2WZ9A 3VI7A 3ERFA 3GKXA 5CAXA 1ZGNA 3FRCA 3TKQA 5C04A 1A2LA 3M1GA 3QAGA 1U87A 1O85A 1DBYA 4EDYA 1EZKA 1BAYA 1MD4A 2C0DA 3KTLA 3WT2A 5HQPA 1TK5B 5IMAA 2ZNMA 1Z3EA 1R26A 2FWEA 3DD3A 4WEYA 5KN3A 1M7TA 4NHZA 2GS3A 3KJYA 3NIVA 3FR3A 3FYGA 6GSWA 2L5LA 2X99A 1Y25A 2V6KA 3MDKA 3GNJA 3HDCA 3L9VA 2VL2C 1PX7A 5JCUA 3GSSA 2IIYA 2DC5A 3QAWA 4RQRA 4PUAA 1XWCA 3W8SA 3RPNA 3TRPA 5HR3A 3IXRA 5HFGA 2B6MA 3ED3A 1IYHA 5J9BA 1F9MA 5EY6A 3TKRA 5D93A 2C3QA 3FZ4A 3FY7A 1B9YC 4ML6A 1WOUA 2YANA 3WGXA 5J3RA 1PKZA 2DJ0A 5HFKA 2YPMA 1GUMA 2R2JA 2H73A 1G7OA 5ECPB 5ECNB 4DEJA 3KGKA 3GH6A 1OE7A 4MF6A 2IMKA 3S9FA 4V1Ap 1HYUA 1EV4A 3G7IA 4BA7A 2N5BA 4HI7A 1G0TA 1PL2A 5GZZB 1E6BA 4EL1A 4HU7A 3HVXA 1SD9A 5IO2A 1GSFA 1ERVA 3ZYWA 2E0QA 2O89A 2EIOA 4HOJA 4IP6A 1VF1A 2R4VA 1JHBA 3F0IA 2V6OA 4CHSA 4F03A 5CO3A 2H70A 5F06A 2LJKA 1GTIA 2B1KA 1Z7RA 2CV4A 1U6TA 3QFAC 1A0RP 5L71A 4MCUA 1T00A 2BJXA 5ECKB 1UN2A 5A5KA 3L4NA 3KTBA 3HJOA 2B3SA 2CVDA 1MTCA 2IN3A 2F9SA 1RK4A 3IBHA 3TOUA 1M9AA 4FIWA 3PR8A 13GSA 2VL2A 4QL9A 4IS0A 1SENA 1DUGA 4O32A 4J56E 4D73B 2C0FA 4NXIA 3M9JA 1WJKA 16GSA 4WR4A 2FGXA 3CXGA 5G1KA 1F3AA 4KAEA 5G31A 2YN1A 4MDCA 3CSJA 1ST9A 3ME8A 6GSXA 2CT6A 1Y6EA 17GSA 4EKZA 1BJXA 2F8FA 2FUG2 2FHEA 2C1YA 1JFUA 5J9CA 1Q98A 4G9HA 1W4VA 2D2ZA 3U6VA 1G6YA 2QGVA 3G9BA 4POMA 2XBIA 2WRTA 3DIEA 2I81A 1KEBA 2XC2A 5E4WA 4HU9A 2B5XA 2VOCA 3CRTA 3K8NA 1A23A 1K0OA 5ELAA 3H79A 1WPIA 1PGTA 2N5AA 3LEFA 1T7PB 3IHQA 1GLQA 1YF1A 1GP1A 4GCIA 5EVOA 3IRAA 3VI5A 2A4VA 1TP9A 1A0FA 3EYTA 2H1GA 4I2UA 3TRXA 5KN1A 4LL4B 1X5DA 2RUFA 3N9JA 2VL3A 4N30A 2IWTA 5AIXA 1K0CA 2MBTA 2PVQA 2AV4A 4YQUA 2GQMA 5IMZA 3RDWA 4K7OA 5CNWA 3FR9A 4FYBA 2K8SA 5G1LA 4TR4A 4XS1A 22GSA 1Z6NA 1YJ6A 4MA9A 2H19A 5B8AA 1E2YA 2K8VA 4KW6A 4DSRA 3AY8A 1GNEA 4XIHA 3L9SA 3EWLA 1S3DA 4ZB9A 4V2MA 2TRCP 4BWSA 2O87A 4MP4A 3TCOA 1SK1A 4KDXA 2L4CA 2TIRA 2MMZA 4WKWA 4F9ZA 1OAZA 4ZILA 1SU9A 1TU7A 3ZREA 1OC8A 4OD7A 2X8HA 2OA7A 2MMNA 4TW5A 3BCKA 2PWJA 2CX3A 2NDOA 4EDZA 1YDKA 2GZPA 2KHPA 3IDVA 1WRYA 2GZYA 4HQZA 1NW2A 3F3RA 4TR3A 2L57A 20GSA 2JZSA 1K0BA 1VGLA 3DWVA 4GSSA 3TRQA 3Q18A 5JCGA 3LYPA 2L6CA 5DVBA 4TXVA 2NVLA 2VM2A 1T3BA 3VPTA 12GSA 5IMVA 4JBBA 3GHAA 3GV1A 2GDRA 1A2MA 3C71A 4RI6A 5LNKe 4JEDA 1ZOFA 3L9UA 4GXZA 1JLWA 1EV9A 2FWHA 1EWXA 4GQCA 4IVFA 2WS2A 3P90A 4IJIA 2R5GA 2NPBA 4EO3A 3KP8A 1GTBA 2DMMA 4Q5RA 3D22A 1V98A 1VF3A 3HD5A 5J4UA 2O85A 2V41A 2HI7A 2GSQA 3F6DA 3VURA 1TRWA 1OVNA 5HR0A 3EMPA 1CQHA 2YNXA 4I5QA 2KP1A 2H6XA 1TU8A 4MZWA 3GX0A 4MJEA 5KN2A 3BOAA 2DBCA 2LV3A 2E7PA 2HZEA 2I9HA 4MJBA 1XWBA 3DEXA 1ZYQB 2GSTA 4L0UA 1FVJA 4O92A 4NHWA 5IMCA 1XVWA 4JR6A 3FZ5A 3N5OA 1M99A 1FVKA 3MSZA 2LRTA 1LBKA 2PBJA 5DCGA 3A5WA 3LGCA 4MF5A 3ZFBA 4MJCA 4AF2A 5ECHB 3ZVJA 4XTSA 1B48A 1XFLA 1T8EB 1XWGA 5IPGA 2C8UA 3F9UA 2VCTA 4KX4A 1H75A 2H0IA 1GULA 3MAKA 1O73A 2PN8A 1V40A 3KZQA 3H4KA 1FB0A 3Q74A 1M2DA 5AISA 2DJ3A 3HHVA 4NV5A 1TW9A 3GL5A 5ECOB 1PRXA 1TOFA 4F2IA 1TI1A 1QGVA 3P8WA 2HFDA 4RUVA 4CW9A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite