2XBQA

Crystal structure of reduced schistosoma mansoni thioredoxin pre- protein at 1.7 angstrom
Total Genus 32
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
32
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
SELIELKQDGDLESLLEQHKNKLVVVDFFATWCGPCKTIAPLFKELSEKYDAIFVKVDVDKLEETARKYNISAMPTFIAIKNGEKVGDVVGASIAKVEDMIKKFI
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and Functional Characterization of Schistosoma Mansoni Thioredoxin.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Schistosoma mansoni
total genus 32
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.1.8: Protein-disulfide reductase.
pdb deposition date 2010-04-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2xbqA00
3RAZA 4ZIJA 1QUWA 2DIZA 3DVXA 2LRCA 2K9FA 3DGQA 5ID2A 2A2SA 1WOUA 4PNGA 3FR6A 1U87A 1SD9A 4POLA 4IS0A 5AGYA 4TR0A 4AGSA 1PA3A 5KN2A 4OMVA 1Z6MA 2LKUA 3RHCA 2R5GA 2KHPA 1TI1A 1TP9A 5INYA 4ZBAA 2PBJA 3C71A 1U6TA 1EGOA 2B5EA 1M9BA 1K3LA 2OE3A 1JFUA 2N5FA 8GSSA 4LL4B 3AY8A 3EU4A 1XXUA 5J4UA 5ELAA 1ERVA 2M72A 2FNOA 4YAVA 1NM3A 2E7PA 3G7YA 5ECMB 3M1GA 5ECRB 5FWGA 1R7HA 2REMA 2VO4A 3VFIA 1U3IA 4ZB6A 4K7NA 2HFDA 2GZYA 1VRSD 2VLTA 4IQAA 4KE3A 5GAPD 4EDYA 5HFGA 3F4TA 4IQ1A 1EV9A 5COHA 4MH2A 1N2AA 1Y6EA 4E8HA 4MABA 2B5YA 2BMXA 2OE0A 5AN1A 4Q5NA 2DJ0A 3D6IA 2GDRA 3QR6A 1OC9A 2GT5A 4IN0A 4PQHA 2DMMA 1B4PA 3C8EA 7GSSA 2OE1A 3TJJA 1K0OA 4IVFA 2IPAA 4TRXA 4XRDA 2LTKA 4F82A 3CYNA 1SYXA 2IFQA 2YPMA 3DWVA 1R26A 3TGZA 3D22A 4L8EA 5F0GA 3CSJA 5CRHA 1HNAA 2L59A 1RQMA 3LJRA 3LGCA 4WF5A 3MAKA 4HJMA 3F8UA 4ZB8A 1T4YA 4PURA 2VCVA 2WGRA 3DXBA 4WBRD 2RM5A 3ZIJA 3K8NA 1JLWA 4DVCA 4IHUA 4OO5A 1QFNA 4K1FA 1Z5YE 5EPFA 3MDKA 2PVOC 1G6YA 3HVVA 2MMZA 2LQOA 1GTBA 2P31A 1MDIA 4TW5A 1FG4A 2F8AA 2O8VB 1TU8A 5AIXA 4PX1A 1ERTA 2AYTA 4KA0A 1QK8A 3GH9A 4WXTA 2H1BA 1TKDB 3H4KA 3ERWA 4LMVA 1GP1A 1J08A 4MPFA 2YJ7A 5JWRB 4GSNA 3GTUB 4FYUA 1KTEA 4L5LA 4G10A 3FR3A 2CVDA 1ZL9A 2P0GA 1O7UA 4Q5RA 1RW1A 1WIKA 1JZDA 1PD21 1SJIA 3KH7A 5C00A 2GSTA 4XHMA 4EF0A 2VCTA 3GRXA 4PUAA 1OC3A 3VPQA 3ZIVA 2VCZA 1SK0A 3F6DA 5HR3A 4Q5QA 2A4VA 1HQOA 1ILOA 1FOVA 1X9MB 3GX0A 4GLTA 5IMCA 3KH9A 17GSA 3QCPA 3EMXA 2DJ2A 1ABAA 2HRNA 2V2GA 3D4MA 2EC4A 5CO3A 5ECNB 1PKWA 3IHQA 2LEGA 1UA5A 1XWAA 5JWQB 1YDKA 5HR0A 2DC5A 4HDEA 5G30A 4JRRA 5HR2A 2AHEA 2BTOT 2N5BA 2I9HA 5ECQB 3A2XA 3APSA 1DBYA 3BOAA 3VK9A 2NVLA 4CDOA 2I4AA 4YH2A 2FY6A 2H6ZA 1U3AA 1EEMA 2HT9A 3KGKA 4JE1A 1Z3EA 3IV4A 1T7PB 3P90A 3G7IA 3UOMA 3ZFBA 1T4ZA 4BA7A 2IWTA 5LD0A 3BBYA 4AF2A 2EIOA 4TR1B 3HJMA 13GSA 3ZREA 2IIYA 3TKQA 1PSQA 5DQYA 4IP6A 1T8EB 2EIRA 3GX8A 4WR5A 3FZ9A 2TIRA 2HXKA 4GSTA 1SKSB 3QOUA 2KLXA 1GLQA 5E59A 1KEBA 1X9WB 1THOA 2J9HA 1A0FA 2MYGA 5IMAA 2XBQA 4HQSA 3ZRDA 1SKWB 4MP4A 1XOAA 3CMIA 1ZGNA 4ULXA 3V1WA 4P3YB 3KZQA 3CBUA 3RDWA 3UARA 1K3OA 1R4WA 1XW5A 4XIHA 1WE0A 3QFBC 1TRWA 2HZFA 1XWCA 5G5EA 1V2AA 4TR3A 1AIUA 1ZYQB 1WP0A 3EVIA 2CT6A 2YV9A 2JSYA 4N0VA 2XPEA 1BQ7A 3I43A 2H76A 1EP7A 2LJAA 4RI7A 4KW6A 1GTIA 2XHFA 1AAZA 3I6AA 3QAVA 5B6NA 1T1VA 5IPHA 2H6YA 5D96A 1PL2A 5DALB 3LYPA 3RBTA 2RM6A 4GF0A 3H1NA 3ZVJD 1B48A 4POKA 1PGTA 3MNGA 2B6MA 2JZSA 1AXDA 4JZQA 1XW9A 3WYWA 5ECPB 1X5EA 4F0CA 2VCWA 5DAKB 2NPBA 4RI6A 5HFIA 2HYXA 4OWYA 2IL3A 4EXJA 4ZBDA 2YWIA 2E2GA 3QFAC 4TVEA 1M2DA 16GSA 3R2QA 1Z7RA 1ZYEA 1B4QA 1ML6A 2H73A 1B9XC 4K9ZA 2KUCA 2C0FA 2OBKA 4PUFC 4N0ZA 1PL1A 3HHVA 2CV4A 4ML1A 1BX9A 1OAZA 1TRUA 1A2MA 4E8EA 5IO0A 2GQLA 4MF7A 4PXOA 5DBQA 2WFCA 3LSZA 1YZXA 1AUCA 1SKRB 4XS6A 4FYCA 4YQVA 2PERA 1K0DA 1O85A 2DJ1A 1XWKA 3L9UA 1ZCPA 2L57A 5AIVA 5F8BA 4H86A 4HZ2A 3QMXA 3IA1A 3FYGA 3O3TA 1E2YA 3FK8A 3PGTA 2AUVA 5HQPA 1DE1A 3L78A 2ON5A 3IXRA 5ECHB 6GSYA 5DDLA 1V58A 3DMLA 1HNCA 1K0MA 4MLYA 3M9KA 2F3MA 4V2LA 2OKAA 4DSSB 6GSTA 3J7Yk 2FA4A 5EL8A 2MMNA 4MCUA 2GT6A 1TXXA 1U88A 3G9BA 3GKKA 1ZOFA 2R2JA 3GYKA 5IMDA 2IN3A 4X1UA 1F3BA 4ILFA 3TJBA 2JZTA 1LU4A 1EZKA 5D9TA 4MA9A 3WT1A 2RIIA 3L9VA 2Z9SA 3ME8A 5HFKA 2V41A 3LXTA 1UN2A 1M99A 5D73A 2YV7A 2H0GA 5IO2A 3ERGA 1WMJA 4KB3A 3VI5A 1M7TA 1GSFA 5J3RA 3HYPA 3IR4A 5B8BA 3EWLA 2X8GA 5G5FA 4FH8A 3FR9A 2IFQB 2B5XA 2FLSA 4RQXA 5CAXA 2IJYA 2MZCA 1M9AA 2TRXA 3Q19A 1GH2A 4I8BA 3CTGA 1B9YC 3LFLA 9GSSA 2WULA 3W8SA 3QAWA 2PGTA 2YWNA 2HE3A 3F6FA 2V6OA 2ZNMA 19GSA 2CQ9A 4HZ4A 2K8VA 2L5LA 5LCZA 2MBSA 1NHOA 1X5DA 1MTCA 2IMDA 5IQYA 5G2ZA 4DEJA 2CVKA 4BPYA 5IMFA 2A2RA 3ZTLA 3GKNA 2CVBA 2OACA 3KM6A 1EGRA 4XTSA 4KX4A 3RPPA 2JL4A 3UJ1A 4PQ1A 1K0BA 1N8JA 4ACSA 2QC7A 2C8UA 2CAQA 4I5QA 1JLVA 3M9JA 1Q4JA 2DLXA 4GRFA 4OO4A 4KDYA 1OE8A 1GSQA 1SJZA 2YZUA 4BWSA 4KNDA 2HRFA 4ML6A 2BJXA 1V98A 1K0CA 3HJOA 3A2WA 1JZRA 2L5OA 2O89A 4HEA2 3TCOA 3GSSA 2X8HA 2GGTA 2D2ZA 3FRCA 1AQVA 2DBCA 2H66A 3GFKA 4N10A 4ISDA 1K0NA 2GQKA 3DRNA 2JZRA 3BCIA 2NDOA 4K8MA 3QD9A 5DCHA 4NHZA 2VL3A 2FUG2 2VLVA 4QL9A 2K6VA 4JBBA 1PQNA 2O87A 3APOA 3D5JA 5IOWA 2H1GA 1G7OA 1HD2A 4O7HA 3Q6OA 2LUSA 2MMOA 3E9JB 2L4CA 2DMLA 3TKPA 3TKSA 2LV3A 4KCAA 1YKCA 2OJLA 2M80A 3HKRA 2L6CA 3NIVA 1F9MA 5ELGA 3W6GA 3DYRA 1TTZA 2B1LA 1ST9A 4FYBA 1F6MC 1FAAA 3GL3A 4KGIA 1GUHA 3FY7A 2QKEA 1GLPA 3O76A 5FHIA 1TW9A 3ZL5A 3U5RE 3C7MA 5KN0A 4BVYA 4AJ8A 2OADA 4OFNA 5ECLB 3MSZA 2DJKA 20GSA 3TRPA 2YZHA 1A23A 1XZOA 4O5RA 2FGXA 4LL1B 2PVQA 1I9DA 1X5CA 1XPVA 5D9WA 2AAWA 5J9CA 2JSZA 4ZL9A 2VD0A 2JACA 3C73A 3LORA 2FWGA 4ZB9A 3NOFA 4G19A 4Z7XA 3D21A 2L6DA 3FZ4A 3P7XA 1SL0B 1V9WA 2JU5A 2KP1A 4FO5A 2C0GA 3HD5A 4MZBA 2H6XA 5CRDA 5J5NA 5DVBA 1WWJA 5H5SA 2WCIA 3P2AA 1BAYA 1TJDA 1NSWA 4NXIA 1OC8A 3BD2A 3L4NA 1Z6NA 3VI7A 4PNFA 1SK1A 2FHEA 4L0UA 3PINA 1G6WA 3EC3A 1V40A 5J9BA 1S3AA 1USBA 2VAFA 3I9V2 1YF1A 4HOJA 6GSVA 4D73B 4JU5A 1OYJA 1R5PA 3FKFA 5DJMA 1JZOA 4K0NA 5CRWA 4LLRA 4HJ2A 1ERUA 3UVHA 2HLSA 4HU7A 3IBHA 2LJKA 3TUEA 3QAGA 2NBSA 3IDVA 1RK4A 1TDIA 1UC7A 1TK0B 3N9JA 5C04A 1SU9A 1EOHA 2K8SA 1PX6A 2VM2A 4XS1A 1IYHA 4RQRA 4J57E 2H71A 1PMTA 2C0EA 3J7Yb 3M8NA 3S9FA 2I1UA 3DD3A 3DKSA 1XWBA 1S3DA 3VWWA 3H79A 2VUPA 3Q74A 1TK8B 1GSEA 3GN3A 3C1SA 3PH9A 3GIXA 1VF3A 1OKDA 3GTUA 3CRTA 3FHKA 3TRXA 4YQUA 2DIYA 2X64A 3APQA 4V1Ap 4GQFA 3QDNA 2IMIA 1GTAA 1FVKA 6GSUA 4TOPA 3JCML 4F9ZA 2HZEB 1VF4A 4TXOB 2H74A 4YAPA 2FWFA 1YEPA 3KJYA 2ZUPA 1GNEA 1AQWA 1FW1A 1M0UA 4IW9A 2H30A 2XBIA 4YQMA 3EU3A 3F63A 2OBIA 4RUVA 3ERFA 4OFTA 1QGVA 4MMMA 5B7CA 4HUAA 2YNXA 2GLRA 2H1DA 3IAM2 1H4OA 2C3QA 4F03A 2B3SA 3DVWA 2DJJA 2WDUA 4AJ6A 1JZWA 3E0UA 4G9HA 2V1MA 3O6TA 4ECCA 3L9SA 4G2EA 1LJRA 4TN8A 2VCQA 5G31A 3A2VA 3WD6A 3C1RA 4WEYA 2X8CA 2PU9C 1XVQA 3H8QA 4X0XA 12GSA 5A4VA 4K2DA 3I69A 1XIYA 1Q98A 1CQHA 3IE3A 3TRQA 2YWMA 3W8JA 5F06A 1EV4A 2VOCA 3HDCA 3GSTA 5ID2B 4XRAA 3TB2A 1BG5A 3U6VA 1VGLA 2AJQB 4PGTA 4XS4A 4TR1A 2B1KA 5HR1A 2H70A 4GTUA 1EOGA 2G2QA 3D4TA 3GL5A 3FEUA 5JCUA 1YKAA 2HSYA 5JCWA 5IPGA 4KSOA 1O8WA 1TRSA 5FT3A 4GXZA 4L5OA 1HYUA 5E4WA 2H72A 1SL1B 5A4UA 2LRTA 2OA7A 3IPZA 1O6JA 2C4JA 4LMWA 1EEJA 2ES7A 2H0IA 2LRNA 4EKZA 3GUSA 1KBNA 4N11A 1XVWA 3F3QA 1GUKA 3KTLA 4MJBA 1MD3A 1SK2A 1H75A 4ZXGA 3ZLPA 4V2NA 4JR6A 2C3TA 5A5KA 3ZVJA 4MJCA 4ECBA 3HXSA 4KCEA 3F4SA 4MF5A 2LS5A 1EWXA 3TKSC 5CYYA 1PRXA 1B8XA 3GMFA 3IRAA 2E2MA 5DALA 5CREA 4NV5A 2X99A 3EE2A 1OC9B 1FB0A 1M2AA 3RHBA 3EINA 2RUEA 1YQ1A 1AQXA 1GL8A 4KAEA 4TXVA 5DAKA 3F9UA 3TJFA 5ENUA 1BYEA 2VM1A 4GCIA 3UBKA 3UEMA 22GSA 2AB6A 3GA4A 3UIWA 1SENA 4OFMA 2I3YA 4ZILA 3VPTA 2WRTA 4JR4A 1OVNA 2E0QA 3OR5A 3WGDA 4L0WA 2LQQA 3TDGA 4IKHA 3ZFLA 1OE7A 2PN8A 1J0FA 5CRGA 1WPIA 2GQMA 2B7JA 2HI7A 4MDCA 2V6KA 4F2IA 1ZMAA 1CQGA 3F0IA 1SL2B 5ECSA 3WT2A 1QXHA 3MWHA 4ECIA 5ECKB 4TKYA 1GTUA 4MJAA 4K6XA 5ECIB 2DSAA 4ID0A 3G7JA 4MZWA 2XPDA 2IMEA 4WF4A 2EIQA 2H19A 2VCXA 3TKSE 1THXA 3VWVA 1XOBA 4Q5FA 2YANA 1GNWA 1X0RA 3KTBA 5JCGA 1SYRA 2GS3A 2PUKC 4MJEA 5F07A 3GKMA 1MD4A 3KD0A 1O81A 3HVXA 4MH3A 3KMNA 1DE2A 3RPNA 1J9BA 1EP8A 4DSSA 3VWUA 2RUFA 2YP6A 2PMTA 1A0RP 5G1KA 3UMAA 2R37A 3UBLA 1T00A 4EUYA 1SD8A 4HI7A 5CP1A 1PN9A 1TOFA 2C0DA 1Z7PA 2R4VA 1C72A 5KEJA 4J2FA 3FW2A 1XFLA 2KP2A 3SWLA 2FD3A 1YF0A 5D8IA 5IMZA 2GTUA 1XW6A 3GNJA 2C80A 4V2MA 4X43A 3TJGA 1T3BA 2AV4A 4I2TA 2YOIA 1E6BA 2GSQA 5A4WA 1GWCA 3LXZA 2ON7A 2YWOA 3TOUA 5DJLA 3VLNA 1TRVA 3HZ8A 2P5QA 3ZITA 1A8LA 3KP8A 3IC4A 2CZ3A 18GSA 1V57A 5J41A 4F0BA 4OCEA 4EL1A 4XCSA 1AW9A 2LSTA 3SBCA 2KOKA 2VIMA 3A5WA 4NPBA 1K3YA 4IBPA 4PQIA 4GQCA 1R5AA 3CTFA 2L4QA 2VL2A 2FCHA 2WZ9A 2FA8A 2YJHA 2YN1A 4O92A 3ZMLA 3ISOA 10GSA 1GSYA 2FWHA 2WS2A 5EVOA 2NTOA 1XCCA 3GH6A 4MZCA 4GSSA 3IK7A 4WR4A 2MMAA 3ZZXA 1YJ6A 4MF6A 3UVTA 1BJXA 2V32A 5L71A 2O7KA 2F9SA 1GULA 4FIWA 5GAND 5KN1A 1Z9HA 2N5AA 4V1Ag 5DQSA 2ALBA 4CHSA 1F37A 3LG6A 4MPGA 3A3TA 1WRYA 2H75A 2G0FA 3UAPA 4IJ3A 5IMVA 2F8FA 3KCMA 1G0TA 4NWYA 4ZL7A 4O32A 3KIJA 2J23A 2WB9A 1DUGA 2H0HA 4OCFA 1K0AA 3DEXA 4WKWA 3CSHA 4EVMA 2GVPA 2VLUA 1A8YA 3CSIA 3GHAA 4K7IA 5F05A 3NZNA 1A24A 2R3XA 4CW9A 3CXGA 5CNWA 1FO5A 1ACVA 2IMFA 1NW2A 2TRCP 3KMOA 4KDUA 2ZCTA 1GSDA 2GZPA 3FZ5A 1XWGA 1TI3A 3GKXA 2CA8A 1F2EA 4POMA 3HJPA 2YCDA 3ED3A 5H5QA 3E3EA 2H1AA 1ON4A 2CX3A 2CX4A 3EMPA 4I6XA 4KUNA 1HNBA 4POBA 1URMA 1UVZA 2LNTA 1NHYA 2PWJA 3WGXA 5D9VA 4QL7A 2O85A 3IK9A 4XS4B 4IJIA 4IELA 1W89A 2CAIA 4K7OA 4EE0A 3F4RA 3M0FA 1TK5B 1YY7A 3HCZA 5B6MA 1GSSA 5GSSA 4BL7A 5GZZB 4HS1A 4HQZA 1A2LA 1OKTA 3LEFA 4IGJA 3US3A 3HY2A 1VF1A 3LYKA 5H5RA 4I97A 4NMUA 3PR8A 4NV2A 1QMVA 3F3RA 2B7KA 4BVXA 4MK3A 4OD7A 3BJ5A 5KN3A 5JWOB 2I81A 3TKRA 1KNGA 3HVSA 3ME7A 2VD1A 5IIZA 4WBJA 2PPTA 3H93A 1FVJA 3DIEA 1BEDA 4QQ7A 3UL3A 1G7EA 4I2UA 4EO3A 3ZMKA 4IP1A 1MDKA 5LNKe 4DSRA 3HZ4A 4TR4A 2R6KA 4D73A 3HA9A 2RLIA 1M2BA 1SJ6A 5DCGA 1GUMA 14GSA 3M3MA 3N5OA 1ERWA 3CRUA 4NAXA 4GWRA 4EC0A 5ABRA 5AISA 4EDZA 4KSMA 1S3CA 3LQ7A 2GSRA 3WGEA 4J56E 2QGVA 1MDJA 1F3AA 2FWEA 3L0HA 6GSXA 1AC1A 2K18A 2HNLA 5ECOB 1DSBA 1ZZYA 1IYIA 1FHEA 3FZAA 2VL9A 3QPMA 2MBTA 2LNSA 2F51A 4KDXA 2XC2A 4ZBBA 1PKZA 1LBKA 4WETA 3LWAA 2GZZA 4ZL8A 1JHBA 3IAS2 5IOXA 3TOTA 3VWXA 4AJ7A 1PX7A 3D0ZA 5G1LA 5B8AA 3Q18A 1YEXA 1WJKA 5D9XA 4ECJA 4HU9A 1FB6A 2IMKA 1MEKA 2C1YA 3ZYWA 3EYTA 3KEBA 4BWQA 2HZEA 3GV1A 4TXOA 3BCKA 5IM9A 3KXOA 6GSSA 4K0GA 1QQ2A 3KP9A 1O73A 1TU7A 3GURA 1GRXA 1XBSA 1X9SB 5D93A 11GSA 2JADA 3VURA 3IOSA 2H8LA 3P8WA 2GSSA 2H01A 2CZ2A 5EY6A 6GSWA 4KH7A 1W4VA 2HSHA 5GSTA 2QSIA 1O8XA 4JEDA 4N30A 2C3NA 2DJ3A 3TJKA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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