2XPEA

Oxidised thiol peroxidase (tpx) from yersinia pseudotuberculosis
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
TVHFQGNPVSVAGKLPQIGDKAKDFTLVAKDLSDVALSSFAGKRKVLNIFPSIDTGVCAASVRKFNQLAGELENTVVLCISSDLPFAQSRFCGAEGLSNVITLSTLRGADFKQAYGVAITEGPLAGLTARAVVVLDGQDNVIYSELVNEITTEPNYDAALAALK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Characterisation of Tpx from Yersinia Pseudotuberculosis Reveals Insights Into the Binding of Salicylidene Acylhydrazide Compounds.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOL PEROXIDASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Yersinia pseudotuberculosis
total genus 48
structure length 164
sequence length 164
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.-:
pdb deposition date 2010-08-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2xpeA00
2O89A 2YV7A 1GUMA 1ST9A 3I6AA 3FZ5A 3LGCA 2GT6A 4LLRA 2PN8A 3US3A 3TOTA 5HR1A 5GZZB 2VOCA 4NHZA 2G2QA 1X5EA 2C4JA 4L0UA 4IBPA 1H4OA 4TR0A 4QQ7A 1AW9A 1ERVA 2X8CA 5HFKA 1SKWB 5IPHA 1PSQA 3R2QA 5GSSA 3P7XA 1GNWA 2YWNA 1EV4A 5ECNB 4EL1A 3PGTA 3CRUA 5DAKB 2VIMA 5JWOB 1HNAA 3SBCA 2JADA 2H0HA 2CVDA 3KH7A 4CHSA 2H73A 4L8EA 1GWCA 3C1RA 3HYPA 2CQ9A 4HEA2 5J5NA 4NV2A 5IIZA 3ME8A 3NOFA 4OCEA 1T4YA 2VCQA 2PVOC 1E2YA 1T8EB 2PPTA 2N5FA 4DSQA 1LJRA 2H1GA 2XHFA 4TXVA 1YKAA 1H75A 2LQQA 4HUAA 2TRCP 3KZQA 4POMA 1SK1A 1T3BA 4GXZA 4HI7A 3TB2A 1PX6A 1J0FA 3KEBA 1OKDA 4MF6A 4LL1B 4ML6A 2MMOA 4OO5A 3APSA 2O8VB 4HQSA 2H6ZA 4V2NA 1X5CA 1BEDA 3KMOA 3RAZA 3GIXA 18GSA 4AJ6A 1X0RA 1RW1A 3GKNA 1ERUA 3UAPA 3VURA 1JFUA 3IK7A 5D8IA 5FHIA 2PWJA 5KN3A 2FWGA 2B7JA 2K8VA 2PUKC 4NAXA 4POLA 5AIVA 1O73A 3QOUA 4HQZA 4Q5RA 4KAEA 2VM1A 5D9TA 2P5QA 1SK0A 3WT1A 3IBHA 5JWQB 1SL1B 4XS4B 2L6DA 6GSWA 2KP1A 1USBA 4HS1A 4DVCA 2FY6A 1PL1A 1ON4A 3W6GA 3VWWA 3M9KA 1R5AA 3GL5A 3WGEA 3BCKA 3LXTA 1GSEA 2RLIA 4WXTA 2DLXA 3GTUB 1CQGA 5CRDA 1QUWA 1K0AA 2IN3A 2LS5A 4ZL7A 4EE0A 2RUFA 3D4TA 2C8UA 3KJYA 4RI7A 4KB3A 4BVXA 3M3MA 1GTUA 5J4UA 1M9BA 5CRHA 2M80A 6GSSA 2HFDA 3D4MA 2HE3A 1ZMAA 4HZ4A 2V6OA 1GSFA 4MJBA 2HSYA 4N0VA 1PRXA 5G30A 1TI1A 5GAPD 5DQYA 4D73A 5CRWA 5C00A 3TKSE 1BAYA 1M2BA 3EWLA 1O6JA 1U6TA 1M0UA 3CSHA 4E8EA 5G31A 2LTKA 2DBCA 2FWHA 3WGDA 4F03A 3GH6A 3F3RA 5ECLB 2F8FA 3GL3A 2O7KA 3DD3A 4JBBA 5ECKB 1RK4A 2WB9A 2N5BA 4PQ1A 1AAZA 2HXKA 3TKQA 4MH2A 3DYRA 3ZRDA 1AC1A 5H5QA 2IMFA 3KM6A 4TKYA 5EL8A 2HNLA 1XVQA 1VRSD 2XPDA 4NV5A 2EIRA 5ECHB 2VL9A 1GP1A 3IR4A 2YPMA 4X1UA 5D9XA 2FWFA 1SU9A 4MP4A 3HZ4A 3TJJA 2WJUA 2ZUPA 2CV4A 2VCZA 3H93A 4KSOA 2LV3A 5B6NA 2OBIA 3APOA 4IVFA 5IMAA 1FW1A 2OADA 2CZ2A 4G2EA 3IXRA 1U88A 3F6FA 2H71A 3FR3A 3QR6A 6GSTA 1PKZA 2FHEA 3EMPA 4KSMA 5G1KA 3KXOA 3O76A 1PN9A 1IYHA 4HU9A 1UVZA 3ZLPA 3CTGA 2V41A 2WFCA 2CT6A 3GKKA 3D22A 2NTOA 2LSTA 2MBTA 1F6MC 3TGZA 7GSSA 1DE2A 3EE2A 2I81A 1GL8A 1Y25A 4I97A 1G6YA 4MF5A 4O7HA 1K0MA 2IMIA 2K8SA 5G2ZA 1O7UA 3M9JA 1A0RP 3Q18A 5JCWA 3KP8A 1GH2A 3ZMLA 5J9CA 1SKRB 1GULA 6GSUA 2DJJA 2AHEA 4I2UA 1M2AA 1TU8A 2R2JA 2WDUA 2ON7A 1B9YC 3VPQA 3QFAC 2B1KA 2DJKA 3ME7A 2IFQA 5DVBA 1QQ2A 1Z6MA 3D21A 5DALA 1U87A 2R3XA 3C8EA 4ZL8A 5CP1A 5ECMB 2B5YA 2CX3A 4XS1A 5CO3A 3L0HA 4I5QA 3ZVJD 9GSSA 3I43A 1K0CA 2OKAA 1UA5A 1V98A 1K0OA 1A0FA 3HCZA 4N10A 2DIYA 3IAS2 3P8WA 1TK5B 1OC9B 4OWYA 4ZIJA 3I9V2 3TRQA 3W8SA 5D93A 1M2DA 2XPEA 3RPPA 3EU3A 1WE0A 1WJKA 1GSSA 4TN8A 2LJAA 4ACSA 4KX4A 2ZCTA 2WS2A 3OR5A 4KDUA 3CSJA 1LBKA 2YNXA 4KGIA 3LWAA 3KGKA 1EGRA 1YZXA 1YQ1A 2RM6A 3GKXA 1SJIA 3GN3A 4J56E 5ECIB 5G5FA 4CW9A 4IHUA 3TOUA 1HNBA 1A24A 1O81A 1TKDB 2FA8A 2CAIA 3ERGA 4GLTA 4BA7A 2LNSA 6GSYA 4TXOB 2O85A 1TK0B 2EIOA 1PA3A 1XOBA 5DAKA 1F9MA 2DJ2A 1PMTA 3N9JA 4PURA 4WEYA 5D73A 1ZYEA 4POBA 4OFTA 2VUPA 4TR1B 2YZUA 2AJQB 3CXGA 1NSWA 1GSYA 1VF2A 3A2WA 3C1SA 4ML1A 4MCUA 3LFLA 3U5RE 3IA1A 1FHEA 4K7NA 2I3YA 2H6XA 2H0IA 4ISDA 5F06A 3KTBA 3IDVA 2DIZA 5DDLA 1ABAA 1Z7RA 1AIUA 4DSRA 5LCZA 1ACVA 3MWHA 2H01A 1F37A 1LU4A 1VGLA 2IL3A 5HR0A 1DUGA 5CREA 1A2JA 3HZ8A 2A2SA 2NPBA 2CZ3A 4Z7XA 1VF1A 5KN1A 1SENA 4IQAA 1XIYA 5F07A 2VCXA 3DRNA 1G7OA 4WF4A 4NWYA 1DSBA 4GSTA 2JZSA 16GSA 1AXDA 2AYTA 5DCHA 4V1Ag 4YQVA 5IMFA 2WZ9A 4BWSA 1M7TA 2OACA 1SKSB 2YWOA 4GCIA 2H1BA 1F3AA 3GURA 3O6TA 1XWCA 4X0XA 1OC8A 2F51A 1Y6EA 2DMMA 3HA9A 4XS4A 2ZNMA 4L5OA 4PGTA 3FR6A 1XZOA 4V2MA 3G9BA 1NHOA 2JZRA 4IN0A 1HQOA 2C0DA 3LEFA 4KDXA 1V40A 4GSSA 1F3BA 4QL7A 3LORA 4K2DA 2H70A 5DQSA 3ZMKA 3GTUA 3ZYWA 1WIKA 2DJ1A 2H8LA 5HFGA 3LYPA 1ERWA 1EP8A 1PL2A 3F8UA 3MAKA 4XTSA 4MJEA 2L57A 2GZPA 1XW9A 2YOIA 3UOMA 3GA4A 4ILFA 5ENUA 5JWRB 3LJRA 3HVXA 1TK8B 5IO0A 3I69A 3TKPA 4HDEA 1J9BA 3KTLA 4EUYA 2YANA 5ECRB 5IMVA 3RHCA 3ZFLA 4ID0A 2C0FA 1R5PA 2L5OA 3MSZA 4WR5A 3VWXA 5J3RA 1ILOA 2OJLA 2KOKA 1WWJA 3D0ZA 3M8NA 1MD4A 3D5JA 3CYNA 1IYIA 5IO2A 3FK8A 3KP9A 4CDOA 1EEJA 1OAZA 2AAWA 2GZYA 2REMA 2MMNA 1FB6A 1A8LA 4G19A 5HFIA 3AY8A 1ZGNA 3CSIA 3RDWA 5CNWA 4F0CA 1Z7PA 3TDGA 4JRRA 4XRDA 1MEKA 1V57A 4KNDA 3WYWA 1BX9A 3WGXA 2GS3A 1V58A 1A8YA 1Z6NA 3BOAA 4RI6A 5A4VA 1AQXA 2V6KA 3NZNA 2J9HA 3FZAA 2GVPA 2DMLA 2O87A 2K6VA 4YAVA 2QGVA 4FYCA 5CRGA 1MD3A 3HHVA 4LMWA 2NDOA 3UL3A 3ZREA 4F82A 2LJRA 4NPBA 2MBSA 1UC7A 2RM5A 3LXZA 2X8HA 4K8MA 4EF0A 3ZL5A 2IMEA 3DEXA 4X43A 1FB0A 4AF2A 1O85A 3GMFA 1BQ7A 2G0FA 1YEPA 2H0GA 1YY7A 3HVVA 3F6DA 2LRTA 3QFBC 1GRXA 2L59A 10GSA 2Z9SA 1PQNA 3ZFBA 17GSA 2ES7A 3CMIA 2EC4A 2YJHA 5B6MA 1JZWA 2F9SA 4JE1A 4WKWA 2IJYA 1FOVA 5DCGA 3FY7A 2AUVA 1ZZYA 4TR4A 4WBJA 4V2LA 5L71A 4EKZA 2IWTA 3GV1A 4GQFA 2M46A 2MYGA 3L9VA 5AISA 1S3CA 3FRCA 3VLNA 3GRXA 1AUCA 5C04A 2VCWA 4MZBA 4ZB9A 2H19A 1SJZA 2PGTA 3F4SA 5F05A 2CVKA 1UN2A 2H6YA 2PVQA 1KTEA 5ECOB 3HJMA 1OC9A 3E0UA 3F4TA 3RHBA 2MZCA 14GSA 2R37A 3G7YA 3O3TA 1EGOA 2XC2A 4FYBA 1GLQA 5G1LA 3W8JA 1R26A 1XPVA 5KEJA 1SYRA 4N0ZA 3H79A 4KCAA 2XBQA 4O5RA 4ZXGA 1ML6A 2H1DA 4IS0A 1EWXA 4I6XA 4O32A 1SD9A 1GNEA 1QMVA 3PR8A 2VL2C 2I4AA 1TW9A 2NVLA 2K18A 1EOHA 3KIJA 3K8NA 2CAQA 1TJDA 3M1GA 1JZRA 2C1YA 3TUEA 1XWBA 4TXOA 1EZKA 4IQ1A 4JEDA 3MDKA 2HZEB 1K3YA 2P31A 3LQ7A 3C73A 4OFNA 3LG6A 2VCVA 1Z5YE 2VLTA 1K3OA 4XCSA 3HVSA 4TR3A 2NBSA 1TTZA 2R5GA 4EC0A 4KE3A 2P0GA 4TR1A 2C3TA 2CVBA 1FVKA 4JU5A 4XIHA 2GSQA 1T7PB 3NIVA 5COHA 1X5DA 2H75A 4DSSA 1FVJA 2LUSA 4I8BA 2L5LA 5LD0A 2GQKA 19GSA 3ZTLA 3TRPA 1XWGA 4AJ8A 1KEBA 3HD5A 1HD2A 1C72A 1U3IA 3CRTA 1W4VA 3G7JA 2HYXA 3JCML 1HNCA 3DGQA 4N30A 3F4RA 1NHYA 2VM2A 1QFNA 3QD9A 2JU5A 3UARA 6GSXA 3EVIA 4POKA 4YQUA 2E2GA 1X9WB 2MMZA 3QMXA 4LMVA 1XVWA 4IKHA 1B9XC 1K0NA 4XRAA 4MDCA 5F0GA 3VI5A 4P3YB 1EOGA 3L4NA 3Q19A 3P2AA 4PNFA 2YJ7A 2BTOT 1RQMA 3GSSA 1A23A 2B7KA 4RUVA 3P90A 3HJOA 2A2RA 4TVEA 1JLVA 3KMNA 5ID2B 3F3QA 5GSTA 3TJFA 4WF5A 1B4QA 3BJ5A 3QAWA 1XWKA 4E8HA 4ZILA 4MABA 2GT5A 3KH9A 3U6VA 2YV9A 5ECPB 1PX7A 1KNGA 4HZ2A 2LNTA 2GLRA 1MDIA 1I5GA 1ZL9A 3ERWA 2HRNA 1OVNA 2LJKA 3UIWA 4F2IA 5IOWA 2VCTA 3F9UA 5KN0A 4WETA 4TW5A 2YN1A 1TDIA 4NMUA 4GWRA 3A5WA 3IAM2 4FH8A 3IV4A 22GSA 5IMCA 3EINA 2B6MA 3ZZXA 4GTUA 4V1Ap 1DE1A 1J08A 1SL2B 1OYJA 2OE1A 1SD8A 5DJLA 1THOA 3EURA 1SK2A 1S3DA 4F0BA 3GHAA 4DSSB 1G6WA 2OA7A 2WCIA 4BVYA 3IHQA 5E4WA 3SWLA 2LEGA 4Q5QA 1SJ6A 1R4WA 1TRSA 2JACA 4ULXA 3FZ9A 2J23A 1B4PA 3GKMA 2H76A 3FKFA 2IMDA 2ALBA 1YKCA 1EEMA 2EIQA 4EXJA 3QCPA 2HRFA 4KDYA 2JSZA 2VL3A 1WPIA 2LKUA 8GSSA 3GSTA 3RPNA 1XWAA 3FHKA 2HZFA 4G9HA 5ELGA 6GSVA 2GQLA 1BJXA 5FWGA 1WRYA 1DBYA 1I9DA 5FT3A 3IC4A 3EMXA 3IOSA 2X99A 2B1LA 1YDKA 3QAVA 1XW5A 1G7EA 2L4QA 1NM3A 2VLUA 1YF0A 4IELA 1ZYQB 3ISOA 3V1WA 4OO4A 5ECSA 2WGRA 2H1AA 5EPFA 2XBIA 4ZB6A 3GUSA 4ECBA 1SYXA 5B8BA 2X64A 1O8XA 1GTAA 4KUNA 2YZHA 1SL0B 2VAFA 1GUHA 5E59A 1FAAA 2JSYA 5JCGA 2FNOA 2JZTA 1E6BA 2PERA 3EYTA 4XHMA 1M99A 3UBKA 1ZCPA 1JLWA 4MZWA 4PUFC 3VWVA 3APQA 1O8WA 2BJXA 2YCDA 2HI7A 3DXBA 4WBRD 3VK9A 1GSUA 1V9WA 3FEUA 1Q4JA 2N5AA 3KD0A 1TRVA 1QK8A 5GAND 5IPGA 4OD7A 3ERFA 1PD21 4ZBAA 1W89A 3Q74A 2QC7A 4PX1A 2KLXA 2V1MA 1A2LA 1URMA 2F8AA 3GNJA 4JZQA 3VFIA 1OC3A 2R6KA 3F63A 2B3SA 3PH9A 3UEMA 3EC3A 2FWEA 2KP2A 4ECIA 5A5KA 2TRXA 2A4VA 4MZCA 2C3QA 1TI3A 4N11A 1OE7A 4MA9A 1FG4A 2AB6A 2E0QA 1S3AA 2AV4A 2GSTA 4ZBDA 3C7MA 2H72A 5A4WA 3GH9A 3TRXA 4OFMA 3ZVJA 3VWUA 4OCFA 1PGTA 3FR9A 2C80A 2LRCA 3TJBA 2FCHA 4ECJA 2PMTA 4L5LA 1XXUA 2FA4A 1GSQA 3TKRA 4ECCA 5ABRA 1MDKA 2GZZA 1GTIA 3ED3A 4PNGA 3ZIVA 4F9ZA 2GQMA 4GQCA 3G7IA 2H66A 4BL7A 1BG5A 2F3MA 5LNKe 4ZBBA 2GDRA 4RQRA 2DC5A 1NW2A 12GSA 1GLPA 2I9HA 2JL4A 4PXOA 4O92A 2FGXA 2RUEA 3GYKA 4MPFA 3DVWA 3TJGA 4JR6A 5DJMA 4EDZA 2BMXA 4PQHA 2GSSA 1MDJA 1QXHA 2HZEA 1XBSA 3FW2A 1JHBA 4KA0A 4J2FA 3IE3A 3HXSA 3TCOA 2OE0A 4MJAA 2GGTA 1N8JA 5D9VA 1VF3A 5DBQA 2H30A 4EDYA 3PINA 1XW6A 2R4VA 4LA1A 1X9MB 3ZITA 1M9AA 2QKEA 3DWVA 1YEXA 4GRFA 4HOJA 2C0EA 1B48A 1R7HA 2B5EA 3CTFA 3L78A 3MNGA 1X9SB 4IGJA 2WRTA 4IJ3A 4XS6A 2L4CA 1T4ZA 1PKWA 2OE3A 2ON5A 1F2EA 5IOXA 2H74A 1TRWA 3LYKA 5HR3A 3H8QA 4OMVA 1GUKA 3KCMA 5INYA 4J57E 2GTUA 4I2TA 2FLSA 2C3NA 1GTBA 1MTCA 3L9UA 3QDNA 1CQHA 2LRNA 4EVMA 5ID2A 1THXA 2GSRA 3DMLA 4MK3A 2IIYA 3RBTA 2E7PA 1B8XA 2K9FA 2HLSA 3M0FA 1TOFA 20GSA 4MMMA 5B8AA 2VD1A 1GSDA 4MPGA 2P5RA 2VL2A 4NHWA 3UBLA 4GF0A 5J41A 2QSIA 5D9WA 3FYGA 4H86A 2TIRA 4K6XA 3TKSC 3TKSA 5IMZA 5AN1A 1XOAA 4K7OA 4GSNA 2C0GA 4L0WA 4YH2A 4MF7A 3LSZA 3BCIA 1YJ6A 2E2MA 1OKTA 3HKRA 2DSAA 1ZOFA 2RIIA 1XCCA 3J7Yk 4FIWA 5D96A 4Q5NA 2HSHA 5IMDA 2IMKA 4AGSA 2M72A 5HR2A 4ZL9A 2VO4A 4FO5A 4KW6A 3E3EA 1TU7A 4K9ZA 2B5XA 2FD3A 3D6IA 4PUAA 2VD0A 2VLVA 3F0IA 3HY2A 1T00A 4D73B 2L6CA 2YWMA 5J9BA 1JZDA 3VI7A 1YF1A 3A3TA 5KN2A 4KCEA 1T1VA 4DEJA 4PQIA 4YQMA 4LL4B 5IQYA 4KH7A 4IP1A 5B7CA 4YAPA 4K1FA 2D2ZA 4IP6A 5A4UA 2YWIA 1TXXA 2HT9A 2CX4A 2V2GA 5G5EA 2OBKA 2DJ0A 3HJPA 4BWQA 3GX8A 1VF4A 1FO5A 2CA8A 2MMAA 1AQVA 3WT2A 2FUG2 5CAXA 1BYEA 4TOPA 3C71A 3J7Yb 4BPYA 1KBNA 3L9SA 1QGVA 3BBYA 13GSA 3UJ1A 3BD2A 5CYYA 3FZ4A 1XFLA 4MH3A 2I1UA 4FYUA 4QL9A 1EV9A 3EU4A 2YP6A 4NXIA 3HDCA 1EP7A 2PBJA 1K3LA 2LQOA 4IW9A 3IPZA 3QAGA 4AJ7A 2KHPA 5ELAA 3Q6OA 1WP0A 3A2XA 4HJMA 1WMJA 3CBUA 1JZOA 5JCUA 5H5SA 1Z3EA 2V32A 1N2AA 3H4KA 2WULA 4IJIA 5AIXA 1HYUA 3DKSA 2PU9C 4MJCA 1OE8A 5H5RA 2IPAA 3IRAA 4Q5FA 3N5OA 3IK9A 3DVXA 2DJ3A 4RQXA 1AQWA 3E9JB 5F8BA 1K0DA 1A2MA 3UVHA 5HQPA 1G0TA 5EVOA 1K0BA 3QPMA 1Q98A 2IFQB 4K0NA 3UMAA 1Z9HA 5EY6A 5IM9A 5DALB 11GSA 4JR4A 3WD6A 1U3AA 4WR4A 3A2VA 5ECQB 1V2AA 3S9FA 4K7IA 3GX0A 1WOUA 3DIEA 4MLYA 3ZIJA 3VPTA 4K0GA 3TJKA 1ERTA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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