2XPEA

Oxidised thiol peroxidase (tpx) from yersinia pseudotuberculosis
Total Genus 48
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
48
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
TVHFQGNPVSVAGKLPQIGDKAKDFTLVAKDLSDVALSSFAGKRKVLNIFPSIDTGVCAASVRKFNQLAGELENTVVLCISSDLPFAQSRFCGAEGLSNVITLSTLRGADFKQAYGVAITEGPLAGLTARAVVVLDGQDNVIYSELVNEITTEPNYDAALAALK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Yersinia pseudotuberculosis
publication title Structural Characterisation of Tpx from Yersinia Pseudotuberculosis Reveals Insights Into the Binding of Salicylidene Acylhydrazide Compounds.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOL PEROXIDASE
total genus 48
structure length 164
sequence length 164
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.-:
pdb deposition date 2010-08-26

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2xpeA00
5ECNB 4KCAA 1HNBA 1FVJA 3BCIA 3TKQA 4K7IA 1EEJA 1FO5A 3L0HA 4DSSA 1YKAA 2P5RA 1M0UA 3KH7A 5ECHB 4OO5A 3EU4A 3ZFLA 4TOPA 1V2AA 1GUKA 2XPEA 2K6VA 3IAS2 4ZL8A 6GSVA 2GQLA 5J4UA 2HZFA 5A4WA 2VUPA 1X9WB 4POMA 2M80A 3ZIJA 1SL1B 3MDKA 4PXOA 3W6GA 2CVKA 5CNWA 3TOTA 1TI1A 4MZBA 1PX6A 1PMTA 3GTUB 1O85A 2GGTA 1MDKA 3PR8A 3A2WA 4P3YB 1BQ7A 1AAZA 4EL1A 3C73A 4POLA 2V41A 2KHPA 2NTOA 1EV9A 4WR4A 4XS6A 2V1MA 1QQ2A 4ECIA 4ML6A 2AB6A 2N5AA 1PN9A 3ZLPA 1T3BA 3KMOA 3WT2A 1ZZYA 2B1LA 1RK4A 3KEBA 4TR0A 1JZOA 2GSQA 1FW1A 3HVSA 3FW2A 1Z7RA 1E6BA 5HR2A 2IJYA 2N5BA 2EC4A 1SYRA 4GQCA 2B5EA 4HUAA 1UN2A 2J9HA 1XOAA 2G2QA 1X9SB 2C0EA 2JSYA 2FGXA 2GZYA 2I81A 1QGVA 3IAM2 4MA9A 4F82A 2O7KA 1EV4A 5KN3A 1DBYA 1J9BA 4AJ6A 2H6ZA 2JZTA 4HZ4A 1GSQA 3H79A 4V1Ag 3CTGA 3FHKA 1TW9A 1ILOA 3IA1A 3EU3A 1XCCA 4PUAA 4EF0A 4YH2A 3P8WA 3NZNA 5ID2A 4PQHA 2F8AA 1ABAA 4LL4B 2CZ3A 2DLXA 1GSUA 3LGCA 1Z9HA 2DSAA 3GURA 2CX4A 4DSSB 3GSSA 3GX0A 4JU5A 5D9TA 2IMFA 2DJ3A 3TJKA 3KZQA 2V6OA 1ST9A 2YZHA 1E2YA 6GSTA 1ERWA 3TKPA 4POKA 3GMFA 2H76A 2C80A 1O8XA 4FYCA 1Z6NA 3IE3A 4RI7A 4DVCA 4HU7A 4AF2A 3PH9A 3D0ZA 1B9XC 2WULA 3HZ8A 2VCWA 2VL2A 4KDXA 2DMLA 1XVWA 3MWHA 3WYWA 3P7XA 5F8BA 3HY2A 3VI5A 2ZNMA 3ZITA 1SK2A 1EZKA 4GWRA 4XS4A 3BD2A 3W8SA 1B9YC 3LYPA 3KTLA 5GSSA 3WGDA 4EDZA 4HU9A 3IK7A 4IP6A 3JCML 3F63A 2OADA 2LV3A 1GULA 1N8JA 1Z3EA 3AY8A 5A4UA 4K9ZA 2JZRA 1YKCA 3HKRA 3ME8A 1JZRA 4PURA 3UARA 4I2TA 1O73A 1KBNA 4PUFC 1BYEA 5G1KA 1XWKA 4POBA 1IYHA 3GRXA 2L4QA 2C3NA 4KNDA 1QXHA 1UVZA 5F06A 2H0GA 3O76A 5F05A 2VLUA 4OCEA 1TK5B 3KP9A 2FWFA 3A2XA 2IMKA 1OYJA 5ID2B 4XHMA 3RPPA 5IMCA 3GSTA 2HRNA 3P90A 3APOA 5IO0A 4MF6A 2H1BA 4BVXA 5J9CA 3BCKA 1XW9A 2HSHA 3TKSC 2ON7A 2WFCA 3U5RE 1PL2A 1SKWB 3C1SA 2VIMA 4GLTA 1FOVA 2C8UA 2OBIA 3OR5A 1XW6A 5IMFA 2IFQA 1A2JA 4HDEA 4NHZA 1J0FA 3V1WA 1VGLA 2FWGA 3G7JA 4KE3A 5HR1A 5IMDA 18GSA 2L4CA 2FY6A 1QMVA 1F3BA 3KP8A 1XW5A 2YWNA 1YEXA 4WBJA 2R6KA 5IIZA 2OJLA 4GQFA 1PKWA 2B7JA 4JBBA 1NSWA 4TR4A 1A0FA 2LNTA 1GSDA 3R2QA 1C72A 2DC5A 3DIEA 5GSTA 1TRVA 5ELGA 5HFGA 3FY7A 4AJ8A 3TUEA 3DGQA 2IMIA 4ECJA 3KJYA 4ID0A 1U3AA 4PNFA 4RUVA 1JHBA 1VF4A 1BAYA 2H75A 5KEJA 4XS4B 2L6CA 3HJMA 4KAEA 4K6XA 3M3MA 1V58A 2QSIA 2VLTA 3TOUA 2JADA 2O85A 1ERUA 2E2GA 4TKYA 3FZAA 2GQMA 17GSA 2IN3A 1A0RP 3GL5A 1SENA 3IPZA 4PX1A 3UIWA 2I4AA 1LU4A 4JEDA 1EEMA 4ZBAA 3ERGA 5KN2A 4ZBBA 2VL3A 2XC2A 2KOKA 1ACVA 2NBSA 1XWAA 2TIRA 1URMA 1GSSA 4OWYA 3IRAA 4ZB6A 2KP1A 4KB3A 1JLWA 4BPYA 1EP8A 1S3AA 3DXBA 5GZZB 4HZ2A 3GUSA 4K1FA 5IPGA 1X5EA 2H01A 2RUFA 5AIXA 4I2UA 4JE1A 4WXTA 4OFNA 1EWXA 3DVXA 1T4ZA 3O3TA 2CAIA 3GA4A 5ECRB 3BJ5A 4ISDA 5D9XA 2OE1A 1AXDA 5D8IA 2LJAA 3C71A 2FD3A 2XHFA 5B6MA 3TJJA 2IFQB 1WOUA 3HHVA 3F9UA 1B4QA 3KMNA 1AIUA 4D73A 3WGEA 1NHYA 3O6TA 1K0OA 1V9WA 4QL7A 3GNJA 3ZZXA 4MK3A 2YV9A 4GSNA 2RM5A 7GSSA 4BA7A 3ZL5A 3ZYWA 4F03A 3A3TA 1GH2A 3GIXA 1EOGA 2MMAA 5B7CA 1A2LA 2HLSA 2C1YA 1LBKA 3GKNA 3G9BA 4NHWA 3D6IA 2O8VB 5JCUA 1BX9A 2NPBA 3IBHA 5F0GA 1HNCA 2H1DA 2WCIA 2ON5A 3UOMA 4GF0A 1FB0A 1TJDA 5G1LA 1SK0A 1RW1A 2R37A 3M9KA 3KIJA 4LMWA 3TJFA 22GSA 1Z6MA 1SJIA 1ML6A 4G9HA 3UJ1A 2LS5A 5KN1A 1AUCA 4V2MA 3N9JA 1YDKA 4LL1B 5HR3A 3F4SA 2GSRA 1MTCA 1K0BA 2H1AA 1ERTA 16GSA 3ERFA 3WD6A 1U6TA 1ZOFA 2RLIA 1QUWA 6GSXA 1W4VA 2C3QA 2QC7A 4WR5A 3A2VA 4JR4A 3TRXA 1TU8A 2FCHA 3TGZA 3ZIVA 3F6DA 3UMAA 3I6AA 1YEPA 4ZL7A 2VLVA 2DJ2A 5CP1A 1DSBA 2IMDA 2L57A 3FKFA 2R3XA 13GSA 5H5SA 3HZ4A 1Z5YE 2I3YA 1KNGA 4EDYA 4BWSA 2KUCA 3SBCA 5G2ZA 2AV4A 4OCFA 2H30A 1R5AA 3KGKA 3RBTA 2YP6A 3GH9A 3M9JA 1MDJA 3IC4A 1O8WA 3SWLA 5ECMB 2X99A 5DCHA 1QK8A 5D73A 4I6XA 2RM6A 1W89A 4OMVA 4D73B 3HXSA 2XBIA 2B1KA 2H70A 1TP9A 4N10A 2GQKA 3GV1A 2GS3A 5AISA 2CT6A 4Q5NA 1TU7A 2EIRA 1TK8B 4F9ZA 1N2AA 3CTFA 1BJXA 2YN1A 1X5CA 4FYBA 3F0IA 3GFKA 1NM3A 5GAND 4I5QA 5ECSA 1ZCPA 4HJ2A 1VF3A 1WIKA 1T1VA 1TRWA 3GKMA 2XPDA 1USBA 3U6VA 1R5PA 4MPGA 2Z9SA 2LQOA 3VWWA 5DAKA 4G2EA 1EP7A 3GX8A 4WF4A 3DRNA 2L5OA 4CW9A 4Z7XA 5G5FA 2PN8A 2PVOC 1XFLA 3QAVA 3QCPA 4MLYA 2F51A 3APQA 4K7OA 4K0GA 2WGRA 12GSA 19GSA 3EVIA 2GT5A 4MH3A 5JCWA 2PWJA 2HYXA 1JFUA 3EWLA 2H1GA 4ZILA 4IQAA 4KSMA 3QAWA 2GZZA 4IVFA 4RQXA 1WMJA 3HJPA 5DDLA 3CYNA 1Q98A 2CA8A 1GSFA 1F6MC 1GNEA 4E8EA 3GN3A 1K3OA 4IJ3A 3ZMLA 4KUNA 5CRGA 2E7PA 1GRXA 1M2BA 4PNGA 1H4OA 2PUKC 6GSSA 4LA1A 1FG4A 2R5GA 2KP2A 4MJCA 3TRQA 3UVHA 2CAQA 1OAZA 1WRYA 1PSQA 4EC0A 1R7HA 5C00A 1T00A 3TJGA 4EUYA 2DIYA 3NOFA 2M46A 1R26A 5HFIA 3VURA 1XWCA 20GSA 3VWVA 3LQ7A 1M9BA 4RI6A 4PQ1A 2N5FA 1SJZA 2VO4A 1F2EA 1SKRB 3QFAC 2AAWA 1ZYQB 3K8NA 3QR6A 3TDGA 3GYKA 2IPAA 4RQRA 4MH2A 1CQHA 2H0HA 3EC3A 4ZL9A 2YOIA 3H93A 3CSHA 4YAVA 3VFIA 2MYGA 2OBKA 2A4VA 3ZMKA 1G7OA 4F0CA 2WJUA 5IMAA 1T7PB 3ZRDA 4GCIA 2YWMA 5DVBA 4HS1A 3TCOA 1SU9A 4N0VA 2M72A 2ALBA 1TOFA 1SD9A 4KCEA 3GKKA 1HYUA 2IL3A 5DAKB 3RPNA 3EYTA 2LRNA 2DJ1A 4MJBA 3LJRA 1SK1A 2GDRA 2PERA 1JZWA 2GTUA 5CRDA 2KLXA 2GSSA 2H66A 1G7EA 1TRUA 1M99A 4G10A 1PX7A 1TKDB 1ZL9A 2CX3A 2PVQA 1PRXA 1XZOA 2L59A 5J9BA 1TDIA 4ML1A 2LTKA 1OVNA 2O89A 5JCGA 2K18A 3RAZA 5B8AA 2ZCTA 1MDIA 4GRFA 3FEUA 2LNSA 5JWOB 4KA0A 3EMXA 3WT1A 4HEA2 1GSEA 1OC3A 2VD0A 4XCSA 2H8LA 4LMVA 2QKEA 3TJBA 1A8LA 1U88A 2TRXA 3UL3A 2RUEA 5HFKA 4H86A 1YF0A 1TTZA 5IM9A 3Q18A 5ECPB 3G7YA 3UBKA 5IOWA 5AGYA 5FWGA 2OKAA 1XPVA 1IYIA 2K9FA 9GSSA 1TI3A 2H6XA 2PBJA 2DBCA 4KX4A 3UVTA 1X0RA 1XXUA 2E2MA 5G31A 4WEYA 2P31A 4TN8A 3EMPA 3ED3A 3J7Yk 3M0FA 3DKSA 2B3SA 1Z7PA 5IMZA 2LJRA 3FZ9A 1G6YA 2CZ2A 2X8HA 5INYA 5C04A 2H71A 1GLPA 4IJIA 4KDYA 3DWVA 2PPTA 1YQ1A 4XIHA 3FR3A 5G5EA 2HI7A 2F3MA 1PD21 2HSYA 2MBTA 4MZWA 4CDOA 2R4VA 1Y25A 2YWIA 5E59A 4IP1A 4NPBA 2LRCA 1Q4JA 5ECQB 5J5NA 2JACA 2I9HA 2DIZA 1A2MA 2B6MA 4ECBA 2BJXA 5A5KA 1F3AA 3N5OA 3F8UA 2F9SA 4MJEA 4NMUA 2GVPA 4LLRA 3VPTA 2DJJA 4EKZA 4MPFA 1QFNA 2LUSA 3HDCA 2VOCA 1WJKA 2WDUA 3F4RA 2C0GA 3J7Yb 2FA8A 2PU9C 3Q74A 3ZVJD 5EVOA 5COHA 3H8QA 2IMEA 4N11A 4OFTA 3G7IA 1M7TA 1GLQA 2VAFA 3KXOA 1GP1A 4BWQA 3LEFA 1O7UA 5ECOB 2X8CA 3NIVA 1GTUA 1I5GA 4NXIA 5H5QA 2AJQB 4IELA 3MSZA 4G19A 5LD0A 1OKTA 3M8NA 2LRTA 4V2NA 1F9MA 1THOA 1S3DA 2HFDA 2YJ7A 4YAPA 2EIQA 3FR9A 6GSUA 2WRTA 5HR0A 1KTEA 3ZREA 4GTUA 1ERVA 8GSSA 1UC7A 4QL9A 1UA5A 2HE3A 1VF2A 1GUHA 2VCZA 3F3RA 4XTSA 1FVKA 2JU5A 2OE0A 3LXZA 4XRDA 5ECLB 5JWRB 3QFBC 2VL2C 2FUG2 5IO2A 3H1NA 1GSYA 2DMMA 4JZQA 1ZGNA 3VLNA 3E0UA 2VCTA 4V1Ap 1K3YA 3DYRA 4AJ7A 2GSTA 3FRCA 3LWAA 5CYYA 1K0DA 4NV5A 3ZFBA 4FO5A 4O32A 3GH6A 5G30A 1K0NA 1EGRA 3VI7A 3L9SA 5L71A 1NHOA 3A5WA 4ECCA 4TR1A 3DD3A 3TKSA 2WB9A 1AQVA 1PGTA 1BG5A 1V98A 4HOJA 4KGIA 3TRPA 1XVQA 1CQGA 4L0UA 5IMVA 2C3TA 4MF5A 5FT3A 1M9AA 2VM1A 1HNAA 2TRCP 3APSA 4EXJA 2X8GA 1SJ6A 2E0QA 2OACA 3IHQA 1O81A 1MD4A 4WBRD 2C0DA 3C8EA 2BTOT 3EURA 3HYPA 4IKHA 1GNWA 4MP4A 4WKWA 5D93A 3KCMA 2H6YA 3I9V2 4NAXA 2G0FA 4TW5A 2K8SA 4GXZA 1WE0A 2VCQA 5CAXA 3ERWA 4ULXA 3GKXA 3CSIA 3HVVA 3TKSE 3CRTA 3HJOA 1J08A 4IGJA 3PINA 3FZ4A 2YZUA 1XOBA 2VL9A 5E4WA 2X64A 3TKRA 1OKDA 5ECKB 2OA7A 2HNLA 4J57E 3QMXA 2QGVA 4K8MA 1YF1A 4EVMA 3QPMA 2A2SA 2HZEA 4E8HA 3D22A 3L9VA 1B8XA 5F07A 4OFMA 4GSSA 3S9FA 1WP0A 1A8YA 1ZYEA 3L4NA 3GHAA 2VD1A 4N30A 3VPQA 1V57A 3D4MA 4YQUA 2GLRA 2PGTA 5DALA 2PMTA 5DBQA 2VM2A 2P0GA 1VF1A 5D9WA 1WPIA 3CMIA 2XBQA 3RDWA 3VK9A 4K2DA 1OE8A 1A24A 4DEJA 1AC1A 1JLVA 3I69A 2FNOA 4MZCA 4J56E 1FAAA 2F8FA 2FA4A 3MAKA 3FR6A 4TR1B 3WGXA 3LG6A 4I97A 2HRFA 2AYTA 2LQQA 2A2RA 2LKUA 5LNKe 3FZ5A 4XS1A 4MCUA 5H5RA 4O5RA 4IQ1A 1THXA 5DJLA 1HD2A 1GUMA 2DJ0A 3US3A 4ACSA 4EE0A 4TXOA 1VRSD 3I43A 2C4JA 1V40A 2HXKA 2FWHA 3HA9A 2YWOA 3RHCA 2REMA 2MMNA 2ZUPA 4FIWA 3IOSA 4JRRA 5CRHA 2V32A 4N0ZA 2O87A 3ISOA 3L78A 4I8BA 3CRUA 3VWXA 3DVWA 3ZVJA 1B4PA 2YJHA 3LFLA 5B6NA 2LSTA 4X1UA 3TB2A 10GSA 2YV7A 4L8EA 3UBLA 2BMXA 1JZDA 3Q19A 2MMZA 2IWTA 4YQMA 1WWJA 2MZCA 1SD8A 4WETA 2IIYA 1EOHA 1Y6EA 6GSYA 2NDOA 3LXTA 3F4TA 1F37A 5EY6A 1KEBA 5IOXA 4CHSA 1O6JA 3Q6OA 2B7KA 2HZEB 2CVBA 4QQ7A 4BL7A 4KDUA 1RQMA 1OC9A 1DUGA 3H4KA 1OC8A 3ME7A 1ZMAA 2B5XA 3D4TA 2CV4A 4ZIJA 3FYGA 11GSA 3QOUA 2YNXA 1S3CA 5DALB 4DSQA 3LSZA 3RHBA 5B8BA 4IHUA 1M2AA 2K8VA 14GSA 5LCZA 1ON4A 2GZPA 2P5QA 4MMMA 1SL0B 3CSJA 2CQ9A 3UEMA 3QD9A 4ILFA 3EE2A 4HQSA 3E3EA 5FHIA 5GAPD 1GL8A 2AUVA 2AHEA 2CVDA 2LJKA 2YANA 2H19A 2V2GA 2B5YA 1M2DA 3D21A 2C0FA 1H75A 3KH9A 3F6FA 4JR6A 5DCGA 3KD0A 6GSWA 2I1UA 4L0WA 4EO3A 5CREA 4NV2A 4HI7A 4TXOB 4KW6A 1GTIA 4MDCA 2H0IA 3M1GA 3PGTA 5CRWA 5DQSA 1SKSB 2WS2A 4O7HA 4TVEA 4O92A 4ZBDA 2H74A 1U87A 3HCZA 4F2IA 3CBUA 4GSTA 3IDVA 1GTBA 1TK0B 1GTAA 3F3QA 5A4VA 5D9VA 4V2LA 5IQYA 1FB6A 4Q5RA 3LYKA 5KN0A 1MD3A 3L9UA 2FWEA 1T4YA 4FH8A 4ZB8A 4HJMA 1TRSA 2OE3A 1X5DA 4YQVA 1XBSA 1DE1A 3CXGA 2JL4A 2YCDA 1EGOA 1AW9A 5EL8A 1MEKA 2LEGA 4OO4A 4TRXA 3DEXA 3E9JB 2GT6A 1DE2A 3D5JA 1AQXA 1YJ6A 1FHEA 3DMLA 1G6WA 5J41A 2MBSA 1X9MB 3W8JA 1A23A 5D96A 4DSRA 2VCXA 4Q5FA 4IBPA 3QDNA 1OC9B 3GL3A 4HQZA 1PA3A 3KM6A 3FK8A 1OE7A 3ZTLA 1XIYA 5J3RA 2JSZA 2NVLA 1T8EB 3IXRA 2FLSA 2WZ9A 4OD7A 4XRAA 3KTBA 4KH7A 1K0MA 1YZXA 4FYUA 3P2AA 1K0CA 2ES7A 5ABRA 1PQNA 3VWUA 3LORA 3BOAA 4BVYA 1K0AA 4IS0A 3EINA 5DJMA 5JWQB 2H72A 5ECIB 2YPMA 4L5LA 3BBYA 1XWBA 4ZXGA 4K0NA 1G0TA 5CO3A 3HD5A 1SYXA 4AGSA 1I9DA 4IW9A 4WF5A 3GTUA 4L5OA 5AN1A 1BEDA 2RIIA 5HQPA 4MF7A 4NWYA 1LJRA 4K7NA 1YY7A 4TR3A 4MJAA 3MNGA 4KSOA 1HQOA 2VCVA 2D2ZA 2JZSA 5EPFA 2L5LA 4Q5QA 3QAGA 4TXVA 1R4WA 2R2JA 4J2FA 3IK9A 3C7MA 1AQWA 2H73A 1NW2A 2DJKA 1GWCA 1K3LA 4F0BA 1PL1A 3C1RA 5ENUA 4X43A 5AIVA 1PKZA 1U3IA 4ZB9A 2MMOA 5DQYA 1TXXA 2L6DA 1SL2B 4PGTA 4MABA 3IR4A 5IPHA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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