2YJHA

Thiol peroxidase from yersinia psuedotuberculosis, inactive mutant c61s
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
165
structure length
165
Chain Sequence
TMTQTVHFQGNPVSVAGKLPQIGDKAKDFTLVAKDLSDVALSSFAGKRKVLNIFPSIDTGVSAASVRKFNQLAGELENTVVLCISSDLPFAQSRFCGAEGLSNVITLSTLRGADFKQAYGVAITEGPLAGLTARAVVVLDGQDNVIYSELVNEITTEPNYDAALA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural Characterisation of Tpx from Yersinia Pseudotuberculosis Reveals Insights Into the Binding of Salicylidene Acylhydrazide Compounds.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOL PEROXIDASE
molecule tags Oxidoreductase
source organism Yersinia pseudotuberculosis
total genus 43
structure length 165
sequence length 165
ec nomenclature ec 1.11.1.-:
pdb deposition date 2011-05-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2yjhA00
1OKDA 1O7UA 5CRDA 1SJ6A 2L6DA 2OKAA 5D93A 1URMA 2YPMA 4KAEA 2F51A 2CA8A 3KZQA 2NDOA 4OO5A 3FEUA 3TJBA 5ECOB 3G7YA 3E9JB 5IOXA 2GZYA 2XC2A 11GSA 4X0XA 5AIVA 4PURA 1GUHA 3VWVA 1WRYA 2V6KA 2PBJA 2KOKA 4MJAA 5B6MA 4ZIJA 5IO0A 5CNWA 2MMNA 4PX1A 1PKWA 4YQVA 3LYKA 5IPGA 4MJEA 2LV3A 1ZCPA 2ZUPA 2AAWA 1SD9A 1MDIA 4PUFC 5CP1A 3EINA 2YWNA 2FWHA 2JL4A 1ILOA 2B5XA 2RUFA 4POLA 2AHEA 4WF4A 1GSDA 3QFAC 6GSWA 1JFUA 3FZAA 4DSQA 5DDLA 4J56E 1FB0A 4KX4A 2CZ3A 1FW1A 3HHVA 4Q5NA 4O7HA 2C3NA 3HDCA 4PXOA 4TW5A 1GSEA 1SD8A 4Q5RA 5FWGA 3WGEA 5CO3A 3A2XA 3HVXA 1AXDA 4K2DA 2FY6A 2H66A 1BQ7A 1K0DA 1A2JA 1AQWA 1E2YA 3N9JA 4DEJA 2OE3A 4TN8A 1GTAA 5ECPB 3PH9A 1S3AA 1J0FA 1X5CA 1XOBA 5ECRB 3IA1A 1TRVA 4K7IA 2EIOA 1SENA 1K0BA 1PX7A 1WP0A 2LTKA 3C1SA 4WBRD 2H75A 2XBIA 3D5JA 3IAS2 3GYKA 2DJ2A 3A3TA 1HD2A 1PQNA 3UJ1A 5D9TA 4Q5FA 2ON5A 1CQHA 2X8CA 2GSTA 1GULA 4HS1A 2R2JA 2V1MA 2B7KA 4IGJA 2P5QA 2GZPA 3DEXA 1WE0A 3ZIJA 9GSSA 4IBPA 1OVNA 2HFDA 5J4UA 4E8EA 1NW2A 1QXHA 1Q4JA 4IQAA 1PGTA 3LEFA 1JZDA 1XXUA 1RK4A 4DSRA 3MNGA 4DVCA 2NBSA 1EP8A 2X64A 4JRRA 2IMIA 4EL1A 4V1Ag 3ZZXA 1BX9A 1R7HA 3KCMA 3FY7A 3IE3A 3KTLA 4MPGA 3VI7A 1KBNA 2HYXA 2IFQB 1AC1A 2HXKA 1ZGNA 3IHQA 1GSQA 4CHSA 4J57E 3I69A 1F3AA 4GLTA 3KH9A 1FG4A 4ZB8A 1X5DA 4GWRA 2KHPA 1AAZA 3IDVA 1OKTA 4IKHA 2DJ0A 5IM9A 4AJ6A 1QUWA 2IPAA 5IIZA 1TXXA 2OE0A 4MABA 3E0UA 1B9YC 3O76A 2NVLA 3F63A 2TIRA 5INYA 1HQOA 1K0NA 2DJKA 3TOTA 3TKRA 5H5RA 1FHEA 2VCXA 2AV4A 5LNKe 5JCWA 2CAIA 3UBKA 2ALBA 5ID2A 2HT9A 1XW6A 2C0FA 1VF4A 1TDIA 4IS0A 1GSSA 1R26A 1R5AA 5HFIA 3CSHA 1SYRA 1DBYA 1U3AA 2KUCA 3M3MA 2R3XA 3L9VA 3ZMKA 3GNJA 4GCIA 4IP6A 3NZNA 4GQFA 2GGTA 3EYTA 1AQVA 1UA5A 4O32A 4BWQA 2E2MA 3GH9A 3DYRA 2B1LA 3C73A 2AJQB 3HYPA 4L0WA 4HU9A 4IQ1A 4F0BA 1J08A 4EKZA 5ECLB 3TKQA 5L71A 1BEDA 2CAQA 4EC0A 5HR2A 3BD2A 3TJKA 4XS1A 2VL2C 5LCZA 2F3MA 2H19A 2BTOT 4ZXGA 3HA9A 3CYNA 3APQA 1XPVA 4EE0A 5HQPA 4MP4A 3RPPA 3C71A 3UVTA 3LXTA 1FOVA 3LFLA 1T4YA 2OE1A 4MCUA 3JCML 5A4WA 5IMDA 4YQMA 1AUCA 4JR4A 4X1UA 1MDKA 1EEMA 2J9HA 1ZYEA 3CRTA 2GZZA 4BPYA 1UN2A 1KEBA 4OFMA 2WGRA 4TXOA 5G30A 4HOJA 3KIJA 2C1YA 1FAAA 2EIRA 3TRQA 3GSSA 3D6IA 3FRCA 2PUKC 1A2LA 2PPTA 3E3EA 1MD4A 4H86A 1X9MB 1QQ2A 4KSMA 3J7Yk 16GSA 2YNXA 5ABRA 1U6TA 2YN1A 3F4RA 2VD0A 3C7MA 2KLXA 4MPFA 3RHCA 2L4CA 4AF2A 4YAVA 4PUAA 2NPBA 2VOCA 5ECMB 4J2FA 1U87A 2GQKA 1WIKA 1GNEA 1KTEA 1NHYA 3G7IA 3W6GA 3HZ4A 2IWTA 1SKWB 3P2AA 3GL5A 5D73A 3TKPA 1TRUA 1K3YA 5IMCA 2O7KA 5DBQA 2I3YA 2JSZA 3ZYWA 4XCSA 1GSUA 2VO4A 4MZCA 5C00A 1PMTA 4JEDA 2OADA 4PQIA 4L0UA 1G6YA 1EGOA 4PNFA 8GSSA 3GTUB 3UBLA 6GSSA 2XPEA 4GRFA 1ERVA 3EVIA 2L5OA 1OC9A 2VLTA 3ED3A 3LJRA 1C72A 4ZILA 2K6VA 2K9FA 4HI7A 4N10A 3ME8A 4GSNA 4TXVA 1SL2B 2DMMA 3FR9A 1VF1A 4BVXA 2IMFA 2HZEB 3WT1A 3ZITA 2XHFA 2LEGA 1GTIA 4DSSA 5IPHA 1B8XA 5DALB 1MEKA 2O85A 1TTZA 5D96A 1TOFA 19GSA 1M7TA 5HFKA 1M2BA 1IYHA 3V1WA 2YJHA 4XS4B 2F8AA 2VL3A 2K8VA 1HNBA 1TW9A 2A4VA 1O73A 2C0DA 3N5OA 4WF5A 2DIZA 2O8VB 3UARA 4L5OA 3TGZA 3IXRA 4JBBA 2I81A 1XWCA 4TR1B 1NSWA 2H1DA 2WJUA 4ZBBA 4ECIA 3M8NA 1A24A 5KN1A 5E59A 4N11A 3DRNA 5KN3A 3TKSC 1GH2A 5CRGA 1QMVA 1X9SB 2VCZA 5D8IA 1G7EA 4ZB6A 1N2AA 2VUPA 3KJYA 3C1RA 2LRNA 3I9V2 1R4WA 1SU9A 4MF6A 2OBKA 4MJCA 3CTGA 1A2MA 5ECHB 3IC4A 2JZTA 2DJ3A 4NMUA 2OJLA 4RUVA 3CBUA 2DLXA 4GTUA 4KA0A 3FZ9A 2CX3A 4D73A 3KMOA 1W4VA 3UL3A 3EMPA 2H76A 2IJYA 4KCAA 2H1BA 1GNWA 2R37A 4TR4A 1OE8A 2GSQA 4KB3A 3GKKA 3CSJA 5A4VA 1WOUA 3MSZA 2LKUA 1S3DA 1A23A 2FA8A 2N5AA 2N5FA 3D21A 4ML1A 2V32A 3QFBC 4JZQA 3WD6A 5C04A 2YCDA 5JWRB 1MTCA 2FWEA 5CYYA 5GSSA 3ZTLA 4GQCA 4JR6A 3EU4A 2H1AA 1Z5YE 2J23A 1GLQA 3RBTA 1THOA 4ZL8A 3US3A 3M1GA 3U6VA 2IN3A 3LGCA 4MK3A 3R2QA 3P8WA 1TK5B 1VRSD 2BJXA 2AB6A 2YWOA 1GWCA 1LU4A 3HVSA 2F8FA 3KM6A 1B4QA 1TU7A 2YZUA 3AY8A 5JWOB 1Y25A 3TOUA 3DXBA 1XW5A 3FR6A 1O81A 2CT6A 3H4KA 2X8HA 1TI3A 2CV4A 5FHIA 2IIYA 3UMAA 2CX4A 2TRXA 5CRWA 2GT5A 4KCEA 1A8YA 2V41A 1KNGA 1OAZA 1W89A 2P31A 4N30A 5AN1A 2EC4A 2VAFA 2YP6A 1XWGA 1TJDA 3VK9A 4XS6A 3QMXA 3IAM2 2MZCA 4HU7A 4QQ7A 2LJRA 3VPTA 3H1NA 2YWIA 4EDZA 4RI7A 5FT3A 1AIUA 4ILFA 3QAWA 4POKA 4YAPA 2H01A 2GT6A 3ME7A 4RI6A 1GLPA 4PGTA 1YDKA 4IP1A 7GSSA 3GH6A 2L6CA 3WT2A 4YH2A 3D4TA 1QGVA 4ZBDA 1AW9A 2A2RA 2JZRA 2HI7A 4WBJA 1T00A 5G1LA 3KD0A 5A5KA 4IJ3A 4KDUA 3TRPA 1SJZA 2GLRA 3QAGA 4ZL9A 3HJOA 3Q19A 2IL3A 2PVQA 4CDOA 3FZ4A 5J9CA 4HUAA 4KUNA 5F8BA 3TCOA 1XBSA 3TB2A 1E6BA 2YZHA 3FHKA 5HR3A 1SJIA 1OE7A 1F3BA 2N5BA 2X99A 1G6WA 2R4VA 1FVJA 5EL8A 4OFNA 1PL1A 4K9ZA 1PKZA 1TK8B 1V57A 2ZNMA 3ZL5A 1F2EA 2C3TA 3GKXA 1K0OA 4TVEA 2RM5A 3RDWA 3KXOA 2L4QA 3GSTA 4K1FA 2B1KA 3D22A 4MF7A 4FH8A 5COHA 2C80A 3SWLA 1O8XA 2YWMA 1JLWA 2C4JA 3QAVA 3IR4A 1ZZYA 4OFTA 4NV5A 1TI1A 4I2TA 3HJPA 1VGLA 5CAXA 3BCKA 1G0TA 2HRFA 3H8QA 5D9WA 2LRTA 5IQYA 4IVFA 3KEBA 4ZL7A 3PGTA 4WETA 1FB6A 5G5FA 3F3RA 4G2EA 1HNCA 4WXTA 1V98A 5DVBA 5DAKA 5LD0A 1EEJA 5D9XA 4GF0A 3ZMLA 4L8EA 2LNSA 3P7XA 2WZ9A 2YV9A 2P5RA 3M9KA 2HSYA 3GFKA 4K7OA 5DJLA 3LG6A 3OR5A 4AJ8A 2MBSA 4GXZA 4PQHA 2ES7A 2LJAA 4ECBA 3O6TA 2E0QA 2MMOA 1HNAA 2H6XA 2FA4A 4OCEA 4EF0A 1M99A 3VI5A 4ECJA 1TRSA 5F06A 3QOUA 1O8WA 1Q98A 1OC3A 2HZFA 3LORA 2AYTA 1EV4A 1M0UA 4Z7XA 3O3TA 2DMLA 3FR3A 3TKSA 2GTUA 5F07A 3F0IA 5H5SA 4NHZA 4ACSA 4AJ7A 5J3RA 4MA9A 3GX0A 1Y6EA 3L4NA 4POBA 3LYPA 2D2ZA 1U88A 3QPMA 4G10A 1LBKA 2WRTA 2CVBA 2FGXA 3FW2A 1SYXA 3GTUA 1ST9A 1PL2A 20GSA 2VD1A 2H70A 2C0GA 3HVVA 4TRXA 5JCGA 3IK9A 3C8EA 3GKNA 3L9UA 2FCHA 4K6XA 3DVXA 1A0RP 2CVKA 3HJMA 3HCZA 1PSQA 3GRXA 4HDEA 4I6XA 5GZZB 2GVPA 2HNLA 1EP7A 4K0NA 1GRXA 2MMZA 4ID0A 5ELGA 4MZBA 1PA3A 1TRWA 5A4UA 4IW9A 1T3BA 1XIYA 1SK1A 1I5GA 4V2LA 3RHBA 3F6FA 1U3IA 3APSA 3Q74A 2I4AA 1ABAA 1V58A 5EVOA 1K3LA 1XWKA 1J9BA 1X0RA 4XS4A 2A2SA 5ECNB 5B7CA 1XVQA 2OA7A 4GSTA 1K0AA 5HR0A 1BJXA 1UC7A 4NPBA 3EURA 2LS5A 4PNGA 3CRUA 5ECKB 4N0VA 2O87A 2R5GA 1JHBA 3G9BA 4NV2A 2IMKA 3D0ZA 3I6AA 4ZBAA 3GA4A 2WULA 4EVMA 6GSYA 3J7Yb 1XW9A 2X8GA 1YJ6A 2GQMA 3ERWA 3ZREA 1Z7RA 4ULXA 4RQXA 2PGTA 1K0MA 4V1Ap 5AGYA 3ZLPA 1ON4A 4EUYA 1SL1B 1YY7A 2DIYA 2H30A 1WPIA 1XWAA 3LXZA 4L5LA 4FYUA 3VLNA 2REMA 3QDNA 1YF1A 3KP9A 4IN0A 1MD3A 1QFNA 4K7NA 3BJ5A 1M9AA 2VM1A 1ACVA 4HQSA 1F6MC 3MAKA 2H6ZA 4K0GA 1A0FA 1YKCA 2XBQA 1SK2A 2IMEA 1NHOA 2VLUA 3GUSA 2Z9SA 1YEPA 4JU5A 1PN9A 4EDYA 1DE2A 1NM3A 3Q18A 1B4PA 2LQQA 5J41A 3FYGA 3VFIA 3K8NA 3DMLA 1JZOA 4DSSB 2GSRA 2OACA 5CRHA 1T1VA 1PX6A 4F2IA 2CQ9A 1HYUA 4LMWA 2BMXA 4F03A 2JADA 2DJ1A 1F37A 1Z6MA 1GP1A 1X9WB 2FNOA 1DSBA 5IMVA 3CMIA 1Z7PA 2QSIA 2C8UA 4IHUA 4O5RA 4O92A 2G0FA 4OWYA 3ZFLA 4TOPA 3U5RE 4KSOA 5B8BA 3HKRA 2RLIA 2GS3A 3DKSA 1X5EA 6GSUA 3GV1A 1VF3A 4WR4A 3FZ5A 1XFLA 1OC8A 3MDKA 3L0HA 4G19A 3UEMA 1T8EB 3ERGA 4HEA2 5DCGA 2E2GA 3EMXA 2L59A 4KDYA 1M2DA 3ZIVA 4LA1A 4YQUA 4ZB9A 4CW9A 2PN8A 2HLSA 3KP8A 2H6YA 4AGSA 1ZYQB 3A2WA 3A2VA 1A8LA 12GSA 3WYWA 4MMMA 1WWJA 2GQLA 3F9UA 2DJJA 4MZWA 1QK8A 4JE1A 4LL1B 2KP1A 3TDGA 2OBIA 1DE1A 2WS2A 2L57A 1PD21 5IMZA 4MJBA 2TRCP 1ERWA 5F05A 4D73B 3QCPA 2C3QA 2WFCA 3W8SA 4KH7A 5B6NA 1ZL9A 3H93A 1GTUA 5EPFA 5KEJA 5DJMA 1JLVA 1EV9A 2GDRA 3L78A 4XHMA 4OD7A 2B6MA 4E8HA 3ISOA 1BAYA 2YOIA 1K0CA 2IFQA 1YZXA 2PERA 1JZRA 2XPDA 3GN3A 2VL2A 4RQRA 5H5QA 2GSSA 3BOAA 4LL4B 4I8BA 3KMNA 4MF5A 2PWJA 1TK0B 4ISDA 1B9XC 1TU8A 3TJGA 3FKFA 3M9JA 6GSTA 5J9BA 2JU5A 2EIQA 4KW6A 1GL8A 1USBA 4IELA 1S3CA 5ELAA 2RUEA 3UVHA 2AUVA 3GURA 1T7PB 5G1KA 2H72A 2QC7A 1PRXA 4N0ZA 5D9VA 3W8JA 1WJKA 4WEYA 2B3SA 1IYIA 4XTSA 2LRCA 1H75A 2P0GA 1RW1A 2JACA 1Z6NA 4GSSA 4F0CA 3IBHA 2FHEA 2LUSA 1EZKA 1V9WA 4V2MA 17GSA 2RM6A 3DD3A 1M2AA 4TR0A 3VWXA 3KH7A 2IMDA 2HSHA 3ZFBA 4BWSA 3LSZA 6GSVA 2MYGA 2JZSA 4ECCA 1VF2A 1ERTA 1THXA 1WMJA 2K18A 5GSTA 5CREA 3TJFA 3RAZA 4ML6A 1N8JA 1O6JA 3GX8A 3LWAA 2KP2A 3DIEA 1K3OA 5AIXA 2YANA 5DQYA 1SKRB 3HZ8A 3UAPA 4HQZA 2H73A 3KTBA 3DGQA 10GSA 3EWLA 2DBCA 2WCIA 4P3YB 3FK8A 2QKEA 2MMAA 4EO3A 3DVWA 1LJRA 1YKAA 3QD9A 4MH3A 1GSFA 1GUMA 5GAPD 4TR3A 3TKSE 2VCQA 1XVWA 3VPQA 1Z3EA 3NOFA 3WGXA 4NWYA 5ENUA 2C0EA 3IK7A 2HRNA 3CXGA 5ECQB 1FVKA 2M80A 4HJMA 2RIIA 3D4MA 3G7JA 1I9DA 3GHAA 3H79A 4HZ2A 4EXJA 3LQ7A 4F82A 3IOSA 4G9HA 2QGVA 2VCTA 5IO2A 3PINA 5DCHA 3F4TA 6GSXA 5JWQB 2HE3A 4FYCA 4HJ2A 4KNDA 3HD5A 3GIXA 1SL0B 5ECSA 4OO4A 4NAXA 1OYJA 2F9SA 1GSYA 1SKSB 3EU3A 4X43A 2H0HA 4XRAA 5HFGA 2VIMA 5G2ZA 2DC5A 3GKMA 5ID2B 5B8AA 2ZCTA 2JSYA 3EE2A 4MH2A 18GSA 1EOHA 3GL3A 1B48A 1AQXA 3I43A 2VLVA 1GTBA 5DQSA 2PMTA 5ECIB 2MBTA 2B5YA 4FYBA 1TP9A 2V2GA 3UOMA 2H0GA 2PVOC 2VM2A 2R6KA 1XOAA 1CQGA 2V6OA 4FO5A 3ERFA 5AISA 1Z9HA 4BL7A 4LMVA 4I2UA 4OCFA 1FO5A 3IPZA 4MDCA 2L5LA 2I9HA 5GAND 1JZWA 3TRXA 3ZVJD 2VL9A 3PR8A 1R5PA 1YF0A 3TUEA 5KN0A 3VWUA 1EOGA 4PQ1A 3HY2A 4V2NA 3WGDA 2DSAA 3HXSA 3BBYA 1G7OA 2LNTA 1RQMA 1O85A 3CSIA 1F9MA 2LSTA 5G5EA 5DAKB 5F0GA 3DWVA 1V40A 2FUG2 14GSA 2PU9C 3CTFA 2H1GA 2E7PA 2O89A 3TJJA 3ZVJA 2H0IA 1GUKA 1ZMAA 3S9FA 2CVDA 4OMVA 3RPNA 1MDJA 3IRAA 3M0FA 4F9ZA 4K8MA 4HZ4A 3GMFA 3APOA 2YJ7A 3P90A 2HZEA 4I97A 3VURA 2LJKA 2ON7A 3VWWA 4NHWA 4TXOB 1DUGA 2FWGA 3UIWA 1BG5A 1ERUA 2NTOA 1ZOFA 2LQOA 3F6DA 5DALA 2WB9A 4FIWA 3MWHA 2FD3A 2B5EA 2WDUA 2H8LA 4KE3A 4POMA 2K8SA 3A5WA 4TKYA 4KGIA 2I1UA 1XZOA 1UVZA 2B7JA 1YEXA 3KGKA 3IV4A 4KDXA 5KN2A 2FLSA 5IOWA 5JCUA 5G31A 4TR1A 5HR1A 1SK0A 5J5NA 4BA7A 4LLRA 4WKWA 3F3QA 5IMAA 1T4ZA 3ZRDA 2CZ2A 3NIVA 5EY6A 1XCCA 4WR5A 2M72A 1M9BA 2FWFA 3L9SA 3BCIA 5E4WA 4I5QA 4XRDA 1EWXA 2YV7A 1ML6A 2VCVA 4BVYA 4Q5QA 1EGRA 4XIHA 3F4SA 4QL9A 1TKDB 2M46A 4QL7A 1XWBA 3QR6A 3Q6OA 1H4OA 3F8UA 4IJIA 2VCWA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite