2YN1A

Crystal structure of ancestral thioredoxin relative to last gamma- proteobacteria common ancestor (lgpca) from the precambrian period
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
SIIHVTDDSFDQDVLKADKPVLVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIAEEYEGKLKVAKVNIDENPETAAKYGIRGIPTLMLFKNGEVAATKVGALSKSQLKEFLDANL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Conservation of Protein Structure Over Four Billion Years
pubmed doi rcsb
molecule keywords LGPCA THIOREDOXIN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Synthetic construct
total genus 34
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-10-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2yn1A00
3UAPA 1XWGA 5B8AA 2B3SA 5A4WA 3GX8A 4PQ1A 3TOTA 1V57A 4ULXA 5IIZA 1EGRA 4IN0A 1A0FA 1JZWA 4MJBA 3L9SA 3KMNA 3HZ8A 1PRXA 1T4YA 5DQSA 3SBCA 2ZNMA 3TKSA 16GSA 3WD6A 1G7EA 1JZDA 3M8NA 1M2AA 2C0FA 2B5YA 1O85A 3U6VA 4K7IA 2DJKA 2LEGA 2MMOA 2PGTA 2RUEA 1JHBA 1X5DA 4K6XA 5L71A 4GSNA 3ZZXA 2KP2A 1HYUA 3GKMA 1GULA 4XS4B 3CTGA 2IWTA 1SK1A 2HYXA 5IMDA 3OR5A 2GS3A 2H6ZA 2JL4A 1A2MA 2V2GA 2JZSA 3C71A 2V32A 3HD5A 4IBPA 1DUGA 2YV9A 1C72A 2AJQB 1B4PA 1ERVA 3WGEA 2HFDA 2N5BA 3ISOA 1HNBA 1KTEA 4HJMA 3Q74A 2RLIA 2H0IA 3K8NA 2BMXA 1M9BA 4WR4A 4EO3A 2GQMA 3QAVA 3H93A 1K0CA 5CRDA 2LS5A 1AQXA 2X8CA 2XBQA 2H1DA 5JWRB 3IAS2 1OKDA 2P5RA 1IYIA 3F6FA 2B1KA 3FR3A 4HU7A 3WT2A 5J9BA 2YOIA 3RDWA 1ERUA 4QL7A 1Z9HA 4JE1A 4KE3A 4ZBDA 5F07A 3MDKA 4ECJA 4N11A 1VF2A 3QAGA 2CZ2A 4PXOA 3ZYWA 1K0DA 3L0HA 1A8LA 5F8BA 2OJLA 2L5LA 4JBBA 1S3AA 1TXXA 1ML6A 2VLUA 2CVKA 3ZTLA 2EIQA 2GTUA 5CNWA 4IP1A 4XS1A 5DBQA 2CAIA 2H0HA 4YH2A 2H1GA 1SL1B 1X5CA 1O81A 4L8EA 17GSA 2YPMA 3ERFA 3IXRA 2PN8A 2OE0A 4OD7A 2PWJA 4PNFA 4HU9A 2IMKA 3US3A 3TJFA 1QUWA 3EU4A 1TRWA 2P0GA 1HQOA 5CRWA 7GSSA 2O8VB 2CV4A 2IN3A 1BEDA 4HS1A 3ZVJD 1XPVA 3CBUA 4HDEA 2AUVA 3HHVA 1E2YA 3P7XA 1A24A 1BQ7A 2KUCA 1DBYA 3GV1A 5D73A 2IMEA 3LORA 4FIWA 3L9VA 2C1YA 5A4UA 4NV5A 4KDYA 4TR0A 3QR6A 2FY6A 1YF0A 2H73A 2IMDA 3J7Yk 1O8WA 2NBSA 5FWGA 3KM6A 2LJKA 1PL2A 2LSTA 3LJRA 4LMWA 1A2JA 4HQZA 5IOWA 3JCML 5G1KA 5AISA 4BVYA 3HYPA 5ID2A 2EIOA 3CYNA 1GL8A 4YAPA 5C04A 3VWXA 1NHOA 2OBIA 4CDOA 4TXOB 4KSOA 3KTBA 1KEBA 1T1VA 3UBKA 3ZIJA 4EL1A 5CP1A 4KUNA 2HT9A 3VK9A 3GH6A 1T8EB 1UN2A 3FR9A 2TIRA 4ZL7A 4OFMA 5A4VA 2GSSA 4HZ4A 2VL2A 4K7NA 2LQQA 3IRAA 4GQFA 3BJ5A 5A5KA 3ZFLA 4HZ2A 1GTIA 2GGTA 2WDUA 4PURA 5D9XA 2KP1A 1J0FA 5DAKA 1XWCA 1TTZA 4TR3A 18GSA 3FK8A 4HEA2 3LXTA 1XOBA 3ZRDA 1X9SB 4I8BA 4ZL8A 2J9HA 5HFIA 4D73B 1K3OA 1MDKA 2H66A 2B6MA 3HY2A 2BJXA 5EY6A 1F3BA 1X9MB 2OA7A 2HNLA 2IMIA 1XOAA 3UVTA 1PSQA 3D5JA 2WGRA 5KN2A 1ZGNA 6GSVA 1GSQA 4V2MA 1K0AA 2M72A 4F0CA 1G7OA 3H1NA 4K1FA 1SK0A 1TW9A 3UJ1A 1X9WB 2X8HA 1EV4A 4IS0A 1V58A 4L0UA 3FYGA 5J4UA 2IL3A 2J23A 2D2ZA 4KH7A 4PGTA 2HSHA 2C3TA 3TKRA 2BTOT 1B8XA 3HA9A 4Q5NA 3UIWA 1JLWA 1MTCA 2GSRA 5J41A 4GF0A 2LRTA 2DJ1A 2ALBA 5B7CA 2YCDA 4ID0A 1U3IA 3TKQA 1I9DA 6GSSA 3ZL5A 2L6DA 2LRNA 4F03A 3APQA 1XBSA 2DJ2A 2MMAA 1GSDA 3HKRA 1SL2B 3P8WA 5DALA 2YANA 3Q19A 3M1GA 5ECOB 3LYPA 4ISDA 2X8GA 1M9AA 4FYBA 1W4VA 2AYTA 2VD1A 3S9FA 1QXHA 3IC4A 5ECHB 2H72A 1GWCA 2Z9SA 5CAXA 1OE8A 2G0FA 1X0RA 4EUYA 2FD3A 3GH9A 5DJLA 2IFQB 5H5QA 3GUSA 2CQ9A 2JZRA 3VPQA 1T3BA 3I69A 1OC9B 4TR1A 4POBA 4CHSA 1WIKA 5H5RA 3LEFA 4BVXA 2GQKA 4IELA 2REMA 1UC7A 4DVCA 3APOA 3G7YA 3HZ4A 2LJAA 5G31A 1K0BA 2VCXA 3TJBA 1R5AA 3D22A 2OADA 4NV2A 2GZYA 3HDCA 1X5EA 2LUSA 1GSEA 4Z7XA 5ECKB 4N30A 3E3EA 2HZEA 3UL3A 5IOXA 1M7TA 3H79A 1FHEA 1WOUA 4JR4A 3LG6A 3LYKA 4ECBA 1TK5B 1ZCPA 4KDXA 4YQVA 4KCEA 4F2IA 2DMLA 2FCHA 5DQYA 4PNGA 1H75A 3P2AA 2GQLA 4FYUA 3KCMA 2F9SA 4DSRA 3GL5A 1A8YA 1N8JA 4MF7A 4X0XA 1VF4A 1WJKA 4JRRA 1THXA 2H6YA 1GNWA 5ABRA 4MLYA 3KH9A 4N0ZA 5HQPA 2YNXA 1O6JA 2OACA 2GZZA 3KTLA 1OC8A 3LWAA 2RM5A 3BCIA 1VRSD 4MJEA 5ENUA 5KEJA 1A0RP 4MP4A 2VM1A 4ZBBA 3I43A 4RI7A 4RUVA 2H70A 4PQHA 1B9YC 2KOKA 3DWVA 5ECRB 4AJ6A 1URMA 5IO2A 1BG5A 1XW9A 2C0EA 3DYRA 4TXVA 1WWJA 1SKSB 4L0WA 1Z6NA 1OVNA 4XRAA 3BCKA 1F3AA 5JWQB 3F6DA 4JR6A 3FR6A 1NHYA 4Q5FA 2X64A 2VO4A 3TCOA 3KIJA 2DSAA 1Z3EA 3GN3A 1UA5A 2C3NA 2K8SA 3D0ZA 4LA1A 1TDIA 3GA4A 5D9TA 1AIUA 2VCWA 4BPYA 5DVBA 2YWOA 3ZREA 3GKXA 4QQ7A 2R4VA 1RQMA 5CYYA 2LTKA 4MF5A 2H1BA 1HNCA 1PKZA 2F8AA 5DCGA 2KHPA 3CRTA 4GRFA 1W89A 3RPPA 1PA3A 1WMJA 2JACA 1GNEA 5KN1A 1T7PB 1MDJA 1GSSA 1XFLA 2H6XA 2HI7A 2H74A 5DAKB 2DJ0A 2YWNA 2FA4A 4IJ3A 1ZZYA 4KDUA 2I3YA 2QC7A 2MMZA 1QK8A 4X43A 2L6CA 1B4QA 3DXBA 4HQSA 1AAZA 2WCIA 3WGXA 3C7MA 2R5GA 4J57E 2VL3A 5EPFA 1Z6MA 4EXJA 2VCTA 3IR4A 4ZB9A 1YY7A 1Z7RA 2YZHA 2FWGA 3TB2A 1TKDB 3MWHA 2YJHA 4EE0A 1J08A 5B6NA 2JU5A 4HJ2A 3GMFA 4RQRA 3QMXA 2R3XA 11GSA 1PQNA 4I97A 1A2LA 2EIRA 1YKAA 3DKSA 2PERA 4ML1A 3UMAA 4V2NA 4LL1B 4KB3A 4WKWA 4I2TA 3APSA 1TU8A 4GXZA 1XZOA 1GTAA 3HJPA 1GUHA 1GTUA 2H76A 3FRCA 3F9UA 4MDCA 1HNAA 3P90A 4ECIA 4K0GA 1K3YA 3KD0A 3F3RA 3FY7A 2PUKC 2O87A 2GSTA 3D4TA 2WB9A 4RI6A 1XCCA 2H01A 3QCPA 1MD4A 3TJGA 2K18A 3J7Yb 1MDIA 1AC1A 4GSSA 4AGSA 3CRUA 3FZ4A 5IMAA 3TRXA 3GX0A 5DALB 2L57A 2LNSA 1AXDA 1U3AA 3U5RE 4OO4A 2MZCA 2ON5A 3CSIA 5AGYA 5DJMA 3EMPA 3A5WA 2VLVA 3UARA 2M80A 2HSYA 2TRXA 2MMNA 4G9HA 1V9WA 1FO5A 5HFKA 4V1Ag 5DCHA 4GWRA 5J3RA 3WT1A 3W8JA 4TR1B 5HR3A 1WE0A 3F8UA 5AN1A 5IMCA 2CZ3A 4NPBA 4TKYA 4XCSA 3C73A 2B5EA 3PR8A 3ZVJA 2IMFA 3CTFA 3F63A 3IHQA 3KZQA 1NM3A 1USBA 2LNTA 1SL0B 2ES7A 3FZ5A 3A2XA 4ZIJA 4AJ7A 4CW9A 5J9CA 3QDNA 2WFCA 2HZEB 3G9BA 3LQ7A 3DIEA 4BWSA 3KMOA 2PVQA 2JADA 1OAZA 5ECIB 2XHFA 3TKSC 4O32A 1TI1A 4GCIA 4MJCA 1VF1A 1SYRA 2FWEA 12GSA 4JU5A 4TR4A 4ACSA 1CQHA 4ZL9A 4E8HA 1EP8A 4K9ZA 3VLNA 3VI5A 3QFAC 5G30A 2YZUA 1FB6A 4HI7A 3E0UA 2H1AA 4P3YB 1U88A 5D9WA 1F9MA 2HRNA 4TW5A 4WF5A 2K9FA 2HZFA 4Q5RA 2FWHA 1OE7A 4YQUA 2VCZA 2O7KA 5IMZA 4KAEA 2I9HA 2PMTA 1UVZA 3KJYA 1TJDA 1SU9A 6GSTA 4IJIA 4IVFA 1I5GA 2B7JA 1QFNA 1PMTA 3VWWA 4WXTA 1ZYEA 1N2AA 4IKHA 3SWLA 1SK2A 1EGOA 3IV4A 3QFBC 3FW2A 4WF4A 5LD0A 6GSWA 4KGIA 4O5RA 2V41A 1JLVA 3GSSA 4O92A 5JWOB 1SD8A 3GURA 4EKZA 4KW6A 2H19A 2L4CA 1SJIA 1SJ6A 1BJXA 2TRCP 2FWFA 1YZXA 4TN8A 5J5NA 3IBHA 1AUCA 1T4ZA 1E6BA 3ME7A 5EL8A 3MAKA 1AW9A 4K7OA 2HE3A 2LRCA 2QGVA 1Y6EA 5HR2A 2YN1A 3H4KA 1JFUA 2G2QA 1DSBA 3A2WA 4G2EA 3IOSA 1EP7A 3F4SA 2E2MA 1K0MA 2YV7A 5JCUA 4KA0A 1EOHA 4POMA 4EF0A 2NDOA 3F0IA 1F6MC 3Q18A 4EDZA 4BWQA 3L78A 2EC4A 1ON4A 2GT5A 2ZUPA 1U87A 3QPMA 1BYEA 3EE2A 4ILFA 3EWLA 1PX6A 3EYTA 2NPBA 3PGTA 4TVEA 2AB6A 5ECNB 1YF1A 3LFLA 1U6TA 1IYHA 2GLRA 2H71A 3CMIA 1MD3A 2PPTA 2RUFA 4XTSA 1F37A 2O89A 4F0BA 4MH3A 1SD9A 3NOFA 2A4VA 4XS6A 1V2AA 2L59A 4JEDA 14GSA 3IK7A 4IQAA 6GSUA 1K0NA 4O7HA 4WEYA 1AQVA 1YDKA 3HVSA 3MSZA 2FA8A 4ZB8A 2I1UA 1R7HA 3WGDA 1ABAA 2DLXA 4MK3A 2B5XA 1Z7PA 4YQMA 3N5OA 3C1RA 5GSSA 1BX9A 3IAM2 1WP0A 3RPNA 2C8UA 5B6MA 4LMVA 5F06A 3VFIA 1ZYQB 3CSHA 4WETA 4FO5A 4KX4A 4N0VA 5ECMB 3D4MA 4AF2A 3M0FA 3LSZA 2WZ9A 1S3CA 5GAPD 1B48A 1EWXA 3EU3A 1GUKA 1YEPA 4EDYA 5GAND 4IP6A 1FW1A 3H8QA 4H86A 2VL2C 2HLSA 1TU7A 2K8VA 4NAXA 2HXKA 4D73A 5LNKe 2VOCA 1PX7A 1PN9A 3WYWA 5JCGA 5IMFA 2XPEA 1TOFA 4GLTA 1G6YA 2N5AA 3RHCA 5ELAA 1MEKA 1DE2A 2CAQA 3GRXA 4ZB6A 3ED3A 1XVWA 1V98A 1SENA 2E0QA 13GSA 4MPFA 1XWBA 4ECCA 1FVKA 2OE1A 3EVIA 1RK4A 5G2ZA 1TK0B 5ID2B 1KNGA 1K0OA 3GIXA 1HD2A 1CQGA 3C1SA 4POKA 3TUEA 1YJ6A 3TRQA 4I2UA 2OBKA 5KN3A 4MF6A 5H5SA 4V2LA 3FZAA 5EVOA 2HRFA 2KLXA 1GUMA 3Q6OA 1PGTA 1O7UA 3A2VA 5FT3A 4GTUA 3ZLPA 2CX3A 3MNGA 2MBTA 3R2QA 3GTUA 1EOGA 2FLSA 5G5FA 2I4AA 2L4QA 3KEBA 2MBSA 2WS2A 1VF3A 1KBNA 3D6IA 1M0UA 3N9JA 3VURA 1QGVA 3TKPA 3CXGA 4F9ZA 3ZMLA 4K0NA 5ECQB 3GNJA 3UVHA 5ECSA 5ELGA 1OC3A 3IK9A 3TKSE 2V6OA 1M2DA 3V1WA 3RAZA 3TGZA 3DGQA 3M9KA 1SYXA 1AQWA 1JZRA 2IFQA 3L4NA 2R2JA 3TJKA 3GFKA 4OMVA 4DSSA 1OC9A 4PUFC 1WPIA 1YEXA 1XWAA 3GKKA 4EVMA 5F05A 1NSWA 1QQ2A 5DDLA 4MZWA 5IPGA 1ZMAA 2R6KA 3ZMKA 1R5PA 5KN0A 2PU9C 1DE1A 2E7PA 2P31A 3G7IA 1ZOFA 3RHBA 5E59A 2B7KA 2A2RA 2C0GA 2L5OA 4EC0A 4WBRD 2XPDA 1GH2A 1GRXA 3TOUA 6GSYA 4I6XA 2GDRA 2CX4A 4GQCA 4AJ8A 1GSUA 3QAWA 1GTBA 4N10A 5AIVA 5IQYA 4OFNA 1H4OA 2C4JA 1RW1A 2A2SA 4RQXA 4IGJA 5IMVA 4NMUA 1GLQA 2C0DA 4MCUA 2IJYA 4NHWA 2FHEA 2PVOC 1TK8B 2H8LA 4XIHA 3E9JB 2I81A 3HVVA 5C00A 2FUG2 3F4RA 3EC3A 4G10A 2IIYA 2VIMA 5ECLB 1FAAA 2FNOA 1Q4JA 2X99A 3BBYA 4J56E 2H0GA 1XIYA 2VUPA 6GSXA 5D96A 4BA7A 2VL9A 4I5QA 1B9XC 3D21A 1Q98A 4KSMA 1XWKA 2LKUA 1XW5A 2DJJA 1M99A 4PX1A 2CA8A 4E8EA 5G5EA 5CRGA 2DIZA 4OCFA 2ZCTA 2LJRA 4LLRA 3TRPA 4FH8A 3W8SA 1FG4A 2XC2A 2YWMA 1R4WA 3KH7A 2CVDA 4L5OA 2F51A 4L5LA 5HR0A 2R37A 5JCWA 3GL3A 1OKTA 5GZZB 1EEMA 3HCZA 4NXIA 2GSQA 2K6VA 3KP8A 4XS4A 8GSSA 3GYKA 2V6KA 2VD0A 2AV4A 3VPTA 3UEMA 4OFTA 2F3MA 1R26A 3CSJA 5F0GA 2IPAA 3ZITA 3KXOA 4IW9A 4MPGA 1ACVA 3PINA 2LV3A 1ILOA 1FB0A 1EZKA 1FVJA 4HUAA 3FHKA 3GHAA 2XBIA 4MA9A 2NVLA 3IPZA 1ZL9A 1LBKA 4XHMA 3VI7A 4PQIA 4PUAA 3DRNA 2JSYA 3RBTA 3FKFA 2VM2A 5D9VA 1ST9A 4DEJA 3FZ9A 1Y25A 5D93A 5IM9A 2DIYA 9GSSA 2NTOA 1ERWA 3QD9A 2OE3A 1TRUA 3UBLA 4DSQA 2B1LA 2VCQA 3F3QA 3HJMA 4K8MA 2P5QA 10GSA 2LQOA 1SKRB 3GSTA 3IA1A 1T00A 1J9BA 2DC5A 1TI3A 5B8BA 1NW2A 4IQ1A 3DEXA 2PBJA 5GSTA 4TOPA 2C80A 1QMVA 1O73A 2CT6A 5CRHA 4MH2A 19GSA 5CREA 3LGCA 2YP6A 2V1MA 3BD2A 3IE3A 3TDGA 2H75A 2M46A 2AHEA 4FYCA 3PH9A 1F2EA 4BL7A 1PD21 4ZXGA 5CO3A 2F8FA 1K3LA 5E4WA 2H30A 1GSFA 2DJ3A 4J2FA 3DVWA 2C3QA 3I9V2 3O76A 4MMMA 3NZNA 3EMXA 4ZBAA 1THOA 2DMMA 2QKEA 2RM6A 3O3TA 4JZQA 3GTUB 1GLPA 4HOJA 2RIIA 3BOAA 3M3MA 2CVBA 1XVQA 2VAFA 1GSYA 1TP9A 4ML6A 5INYA 3VWUA 2ON7A 5LCZA 3EINA 3ERGA 2GZPA 3QOUA 2JSZA 1TRVA 4TRXA 3DVXA 1EEJA 4GSTA 2E2GA 3ME8A 3HXSA 3KGKA 1FOVA 1G0TA 1LU4A 3TJJA 4F82A 4WR5A 5HFGA 2WULA 5FHIA 1XXUA 4POLA 5ECPB 3ERWA 5D8IA 1TRSA 4MABA 3HJOA 2DBCA 1G6WA 4G19A 4LL4B 1SKWB 4IHUA 3FEUA 4KNDA 4DSSB 5G1LA 3ZIVA 4NHZA 1GP1A 2FGXA 4KCAA 4TXOA 1VGLA 3L9UA 1XW6A 1A23A 4OCEA 2VCVA 2YJ7A 1SJZA 4Q5QA 1S3DA 5AIXA 4YAVA 1LJRA 20GSA 3GKNA 1O8XA 2WRTA 2GVPA 2O85A 2QSIA 4NWYA 3A3TA 1BAYA 3AY8A 4QL9A 1EV9A 3ZFBA 4WBJA 3UOMA 4V1Ap 3W6GA 4MJAA 5COHA 2MYGA 2OKAA 3LXZA 1YKCA 4X1UA 2AAWA 1YQ1A 1OYJA 3C8EA 2N5FA 1WRYA 3DD3A 1Z5YE 3KP9A 4ZILA 1V40A 3DMLA 3F4TA 4XRDA 4OWYA 3O6TA 2YWIA 1ERTA 5HR1A 3HVXA 4MZCA 2WJUA 3NIVA 4K2DA 3VWVA 22GSA 2GT6A 3M9JA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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