2YN1A

Crystal structure of ancestral thioredoxin relative to last gamma- proteobacteria common ancestor (lgpca) from the precambrian period
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
SIIHVTDDSFDQDVLKADKPVLVDFWAEWCGPCKMIAPILDEIAEEYEGKLKVAKVNIDENPETAAKYGIRGIPTLMLFKNGEVAATKVGALSKSQLKEFLDANL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Conservation of Protein Structure Over Four Billion Years
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Synthetic construct
molecule keywords LGPCA THIOREDOXIN
total genus 34
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2012-10-11
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2yn1A00
4MDCA 5DAKB 4IP6A 2X8CA 2CQ9A 3DRNA 3VWXA 4X1UA 1K3LA 2JZTA 2H66A 1XFLA 3A3TA 3ZFBA 1X0RA 1Z7RA 2WGRA 1R4WA 4XHMA 2DMLA 1NW2A 3TGZA 1OYJA 1F9MA 1GP1A 1GUMA 2B5EA 3N5OA 2YWNA 3GIXA 1SYRA 2LRNA 4TR1B 3HKRA 3KD0A 1F2EA 4TOPA 3EWLA 4V1Ap 3LXZA 1Z6MA 1K0BA 6GSUA 1SJIA 5DAKA 2CZ2A 3WD6A 2VCVA 1VGLA 3GKXA 1T4ZA 4JBBA 1RK4A 4EUYA 5J3RA 3HCZA 3HZ8A 2AB6A 1NHYA 5G5FA 2VM1A 2WDUA 4KE3A 3LEFA 4PNFA 3A2VA 2GSSA 3VWUA 2H1BA 4EKZA 4TR1A 1TXXA 2VL2C 1TK5B 1O6JA 2EIRA 4Q5NA 2IJYA 3TRQA 2QC7A 1I9DA 4MJAA 1PX6A 2V6KA 1ON4A 2VL3A 2WJUA 1SL0B 3M8NA 1QK8A 2GZZA 3MWHA 5DQSA 2H70A 4POBA 4YQVA 1B9YC 4IJIA 4XCSA 2H75A 4TVEA 2C3NA 4I5QA 4KDXA 1GLPA 3VPTA 2HE3A 1ZCPA 5ELGA 1M2DA 3IAM2 5IMFA 4HOJA 2LNSA 4X0XA 1TRVA 3UVHA 1QMVA 1WJKA 2RUEA 4O92A 3ZVJA 2A2SA 2G2QA 3PGTA 5CRWA 4MH3A 3ZIVA 3LWAA 4J2FA 1GSUA 5F07A 4L0UA 1M9AA 4MZWA 4ULXA 2GTUA 1O81A 2GT6A 2HSHA 1TU8A 3C8EA 3TKSA 3ME7A 1T4YA 2OADA 1MD3A 3ERWA 3IOSA 5ECOB 1EEMA 2FCHA 2GSTA 1SJ6A 2N5AA 1O73A 4EDZA 2MMOA 5GSTA 5INYA 2V6OA 4DEJA 2CAIA 3A5WA 3GSSA 4HS1A 3IDVA 1A8LA 2GVPA 2FWGA 1PKWA 2K8SA 1XIYA 3TDGA 3ZFLA 2MBTA 3MDKA 2GQKA 4POMA 1F3BA 4MH2A 4LL4B 3GV1A 3DXBA 1YDKA 2IMKA 3BBYA 3UARA 1MDKA 2EIQA 3DD3A 2O8VB 4ZB6A 4OWYA 3WT1A 3L78A 3GMFA 1UN2A 3LGCA 4EO3A 4V2NA 2X99A 5ECKB 2H0GA 5IPHA 2K6VA 1YKAA 1S3DA 1GUHA 4ACSA 4JU5A 2H6ZA 4ML6A 2VL9A 3H93A 1XBSA 1K0CA 4KNDA 2B6MA 3CTFA 4TRXA 1BJXA 4ZXGA 1GNWA 3TRXA 4GTUA 1HYUA 1PGTA 3RPPA 3HZ4A 2LJAA 1YY7A 2LUSA 1A23A 2C1YA 2HT9A 2VD1A 4AJ7A 4POLA 1WOUA 3GSTA 1K0DA 3HJOA 2YWMA 1TTZA 1EP8A 1FG4A 4WF5A 2RM5A 4JZQA 4ZL8A 1OKDA 2HZEB 2DJJA 2VO4A 20GSA 1A2JA 4JEDA 1GRXA 4KSOA 2OE1A 2R6KA 3R2QA 4FYCA 1T00A 1VF3A 1EP7A 2YZUA 2YNXA 3CTGA 4I97A 2WZ9A 3W8SA 2JADA 3A2XA 5HFIA 2F51A 1SYXA 5ECIB 1U87A 1XWKA 3K8NA 2H0HA 4QL7A 5IIZA 1KNGA 2C80A 2H19A 4Q5FA 5HR1A 3FYGA 3TKPA 1J0FA 4OFMA 1X9MB 4IKHA 3F0IA 2GLRA 2B1LA 2HZEA 4GSSA 3HXSA 2C4JA 4ISDA 2CVKA 3UL3A 4EE0A 2YV7A 1SL1B 1XCCA 5J9BA 4IGJA 3FEUA 1V57A 1TJDA 3QAVA 2OACA 2KLXA 1XWGA 2VCZA 2C3TA 1GSDA 3OR5A 2YWIA 5IO2A 2VAFA 1F37A 1GSSA 3KP9A 1A0FA 4NWYA 1A0RP 3UVTA 8GSSA 5ENUA 3DKSA 2OBIA 3ERGA 1PRXA 5C04A 2VCQA 5ABRA 3KMOA 4ZILA 2IFQB 2WS2A 2FHEA 2PMTA 2NDOA 2LTKA 3ISOA 4BL7A 2RIIA 2YANA 1ZOFA 2H73A 3TOUA 1PD21 3UEMA 1T3BA 2P5RA 5JWRB 2RM6A 3GUSA 4IELA 1Q4JA 3EE2A 3FHKA 1SD9A 3CBUA 2AUVA 2LQOA 3LORA 2F8FA 3LSZA 3FZAA 4NXIA 1XOAA 2IFQA 3F6FA 2L4CA 4G19A 5IOXA 3TKSC 2K8VA 4RQXA 3ME8A 3ZTLA 1ACVA 1H75A 1OE8A 6GSTA 1Q98A 3ZMLA 1ML6A 2E7PA 2HZFA 3VWWA 1RW1A 2X8GA 2NTOA 5ECPB 1OC9A 4TR0A 2REMA 2YN1A 3WGEA 2H0IA 1TK0B 5EY6A 3TKQA 4F2IA 4BWSA 2K18A 2M72A 3D21A 1WP0A 2OBKA 1J9BA 2MMZA 1B9XC 3J7Yb 5EL8A 5DCHA 1WIKA 2N5FA 3FK8A 1S3AA 3DVWA 2TRXA 1GTBA 1YEPA 1E2YA 1FAAA 2H6XA 5DALA 2H1AA 4Q5RA 4D73B 3VPQA 3PR8A 1RQMA 3GX0A 2PVOC 4DVCA 1PX7A 1QGVA 1U3AA 2LEGA 19GSA 1N8JA 5KN2A 3QFBC 5ID2B 3TOTA 2H30A 3BD2A 5KN1A 4NAXA 2JACA 4N11A 1U6TA 3MAKA 1ILOA 3DWVA 3L9UA 3IC4A 1E6BA 4GCIA 3Q19A 1OVNA 1SJZA 3FR6A 4ZBBA 3GRXA 1X5DA 4FO5A 2XC2A 2JSZA 1M99A 2M80A 1SENA 1THXA 2O87A 1USBA 3HJPA 4N0VA 4D73A 5IMZA 4MLYA 4GSNA 4OO5A 3AY8A 3APQA 2ZCTA 2J23A 2LNTA 1O8WA 2HNLA 3US3A 2H71A 1K0NA 3F4TA 1XOBA 1MEKA 3TJFA 3D4MA 1TK8B 5HR0A 1Z5YE 5ID2A 2AAWA 9GSSA 2NBSA 2V1MA 4QL9A 3DIEA 2GDRA 4IBPA 4XS1A 2GQLA 4IVFA 5D9VA 2L57A 4K0GA 2FWFA 3F8UA 4XRAA 3HDCA 4ZL7A 4HUAA 1TRUA 4KB3A 4K8MA 3O6TA 3LFLA 1YEXA 2KP2A 5ECHB 5L71A 2M46A 3BCKA 2NVLA 1X9SB 4JR4A 2P31A 4K1FA 2AHEA 5AISA 2O85A 1DUGA 3HY2A 2TRCP 2XPDA 2B7KA 2QSIA 3KJYA 5F06A 1K0MA 4Z7XA 3C73A 4TR4A 3EURA 3E9JB 3H1NA 4MF5A 10GSA 1TRWA 1ZYEA 1YZXA 5AN1A 3WYWA 5HR3A 1DE1A 4WETA 3TB2A 1BEDA 2ON5A 3EMPA 4GQFA 3TRPA 2VCXA 4IW9A 3D6IA 3HD5A 2F8AA 5G30A 1GSQA 3UMAA 5IMVA 2PUKC 2XHFA 5IO0A 3LQ7A 3D0ZA 1JLWA 5DCGA 5D9WA 3VLNA 1KBNA 4LMVA 2C0EA 1OC3A 4HU9A 1WMJA 2P5QA 4YH2A 2L5OA 3V1WA 3QPMA 2I1UA 4MA9A 3APSA 1NSWA 5DJLA 4KDYA 1ZYQB 5G5EA 1F3AA 4OFTA 4MZBA 3HJMA 3J7Yk 1JZDA 3I6AA 12GSA 4I6XA 3IA1A 3F4SA 3F6DA 1BX9A 3I69A 3G7JA 2GS3A 4L8EA 4WR4A 1VF1A 4H86A 1WPIA 2VIMA 3UIWA 1DBYA 2PERA 5F0GA 5A4UA 4ECBA 2HXKA 4FH8A 4AJ6A 1HNBA 1V2AA 2H1DA 2I81A 2JSYA 2YV9A 1AQVA 1MD4A 2RUFA 1AC1A 3U5RE 3TJBA 5JCUA 5CRHA 1GULA 2XBIA 3M9KA 2AJQB 4BVXA 4OMVA 2VM2A 4MF6A 1THOA 2HRNA 2PN8A 2VCTA 4ZBAA 3QD9A 3UOMA 4O5RA 4RI7A 3GN3A 1R5AA 1JZOA 3SWLA 4XTSA 5A4WA 4JR6A 4HI7A 2XBQA 2DMMA 2NPBA 3O76A 4N10A 3TJKA 1H4OA 4IHUA 5J41A 3FR3A 5COHA 4LL1B 3C1SA 1M9BA 2J9HA 2AYTA 4X43A 2FNOA 1WWJA 2BMXA 4EF0A 2MMAA 3GKMA 1ST9A 1KEBA 4N30A 5D96A 5IM9A 1G7OA 1EOHA 2DSAA 1AAZA 3KH7A 4YAPA 3RPNA 4F9ZA 3MNGA 3ZITA 3ZZXA 3Q6OA 3NOFA 5D9TA 1HD2A 4MZCA 1O85A 2CV4A 2H74A 4ZL9A 2MBSA 2VUPA 2B3SA 17GSA 1T8EB 3ZREA 3F3QA 4AF2A 1FO5A 4HEA2 1GSEA 2ALBA 4IP1A 4WXTA 1VF4A 3CRTA 1M2BA 1Z3EA 1GSFA 1ERUA 4GXZA 5JWQB 1XW6A 3P2AA 1EEJA 1OAZA 6GSSA 4NV5A 3PINA 2AV4A 1G6WA 2HSYA 5D9XA 4V2LA 1QUWA 5ECMB 4WBRD 5IMDA 5J9CA 2L6DA 3H79A 4HJMA 5LNKe 2P0GA 1NHOA 2DJ1A 5GZZB 4ILFA 3EU4A 5HQPA 4HDEA 3D22A 3FR9A 2DJ3A 3ZVJD 1ERWA 1SL2B 4XRDA 1F6MC 4AGSA 2R5GA 4PUAA 4MF7A 2I9HA 3NIVA 4PXOA 1SK0A 3DGQA 3IXRA 4OFNA 2RLIA 5CNWA 1K3YA 4BA7A 2A2RA 4G10A 4I2TA 1O8XA 3I43A 2DJKA 2L4QA 2C3QA 3FRCA 3VURA 1A2LA 5KN0A 1UC7A 1BG5A 2G0FA 2KHPA 1X5EA 4RI6A 4E8EA 2I3YA 5G2ZA 1FB0A 5ECRB 2LKUA 4NPBA 3CSIA 1SD8A 2H1GA 3F63A 1X9WB 1LU4A 4IN0A 3HYPA 2V41A 1CQHA 1FOVA 2H76A 3KGKA 4TXOB 1XWAA 2EIOA 4PUFC 3ZYWA 5DJMA 3DMLA 5B7CA 4L5LA 3IHQA 2OE3A 4IQAA 1PMTA 5CREA 1XZOA 1YJ6A 3C71A 4RUVA 1I5GA 4Q5QA 4NHZA 3BJ5A 5DBQA 1G7EA 1AUCA 3GKKA 4YAVA 4XS4B 5FT3A 11GSA 1SK2A 1OC9B 3IK7A 1EGRA 2IMEA 2DLXA 4OCEA 3RDWA 3GURA 1U88A 2L59A 1B4QA 4TXOA 2VLTA 2CVBA 1FW1A 5IMCA 2CX4A 3EU3A 3LYKA 3D5JA 4GF0A 1SU9A 3UJ1A 4EL1A 5DALB 4EDYA 2DC5A 5EVOA 3N9JA 3DEXA 2VD0A 2Z9SA 4DSRA 4AJ8A 1HNCA 1FVKA 4XIHA 4XS4A 1IYHA 2L6CA 2VLUA 1ZL9A 1PKZA 3IK9A 4NMUA 1V58A 1Z7PA 2PPTA 4LA1A 3KTBA 2CX3A 2HI7A 2X8HA 3TKSE 2QGVA 5G31A 3GH6A 2KUCA 4N0ZA 4IS0A 1PA3A 1TOFA 3TCOA 4EXJA 3Q18A 4G9HA 4BWQA 1QXHA 18GSA 2IN3A 4OD7A 3ZL5A 5FHIA 2N5BA 3HVXA 4K9ZA 1HQOA 1G0TA 2WFCA 3QAWA 2PGTA 3FZ5A 1ZMAA 1SK1A 5DDLA 5JCWA 7GSSA 4K7NA 4F0CA 2IMIA 4CDOA 3UBKA 3EYTA 4YQMA 3P90A 1XWBA 1V98A 3M0FA 3F9UA 4JE1A 3E0UA 4KX4A 4KDUA 4K7OA 5B8BA 4PGTA 3G7YA 2IMDA 1SKSB 2DBCA 4LLRA 3LYPA 4HQSA 3IPZA 2E2MA 3WGDA 1T7PB 3U6VA 2FLSA 3H4KA 3LXTA 2HLSA 4CW9A 5E4WA 1R5PA 1MDJA 3QCPA 4K0NA 1J08A 2PBJA 1TI3A 5HFGA 4KGIA 5DVBA 2QKEA 4KUNA 4IQ1A 4KAEA 2FWEA 1O7UA 3IR4A 1Z9HA 3KZQA 5HFKA 5GAPD 3TJGA 2C8UA 4E8HA 2H6YA 1GLQA 1ABAA 5B6MA 5H5QA 2R37A 4TKYA 4JRRA 4KSMA 1WE0A 6GSWA 4PQ1A 1KTEA 3W8JA 1AIUA 2V2GA 4PNGA 2DJ2A 1TI1A 3CSHA 3VK9A 1TW9A 2R2JA 3I9V2 3QMXA 1X5CA 1GTAA 2OA7A 5EPFA 4MJCA 1CQGA 3EINA 3WT2A 1OKTA 4I8BA 2C0FA 4K6XA 3IE3A 2FWHA 3BOAA 1DSBA 3ZRDA 3EVIA 3DVXA 1TDIA 4KA0A 4MMMA 4HJ2A 1DE2A 1BQ7A 5IMAA 5JCGA 2YCDA 1XPVA 2C0DA 3RHCA 4MP4A 1K3OA 4ID0A 3RBTA 1LBKA 4HQZA 2CA8A 5E59A 1EZKA 3HVSA 1GWCA 2B1KA 4NHWA 3H8QA 4MJEA 2X64A 3D4TA 1W89A 2LSTA 3GNJA 2YJHA 3KTLA 3TKRA 3KP8A 5B8AA 2F3MA 1VF2A 2DIZA 2OJLA 2VLVA 5C00A 3S9FA 3ZIJA 4K7IA 1U3IA 3L0HA 2F9SA 5DQYA 1AXDA 4LMWA 5LCZA 3MSZA 2B5XA 1JLVA 1PL1A 4TN8A 3QFAC 3TUEA 2WULA 3UBLA 1FHEA 1Y6EA 1PQNA 2WCIA 1QQ2A 3VWVA 4ECCA 1XVQA 2B5YA 1LJRA 3KMNA 5HR2A 2BTOT 2E0QA 4KCEA 1W4VA 3GA4A 3ZMKA 2KP1A 1AW9A 4HU7A 3KIJA 5D8IA 4ZIJA 3SBCA 3O3TA 1A2MA 4V1Ag 2LRCA 3CRUA 1M0UA 5ECLB 2FUG2 1GH2A 4F0BA 1WRYA 5IPGA 2GZPA 4WF4A 2DIYA 5A4VA 4MCUA 2BJXA 3GL3A 4K2DA 5ECNB 5CO3A 3PH9A 1EOGA 1ERVA 1R26A 2V32A 3F3RA 3EC3A 3ERFA 2PVQA 3FZ4A 2YP6A 1URMA 1GUKA 3CMIA 1XVWA 3GH9A 1SKRB 1YQ1A 2MZCA 2EC4A 5A5KA 5J5NA 5AIXA 4DSSB 2YWOA 1GNEA 1FB6A 2VOCA 3GL5A 4FYUA 5CRDA 3M9JA 4KW6A 2IPAA 2YZHA 2R3XA 3P7XA 3GTUB 4YQUA 1NM3A 2GSQA 3CXGA 3VI5A 2YPMA 3TJJA 2CVDA 4L5OA 1Z6NA 4MABA 1OC8A 2GGTA 2GT5A 2DJ0A 2VCWA 5CYYA 1ZGNA 3FY7A 3P8WA 4FYBA 4J56E 3CSJA 4O32A 1S3CA 3IBHA 4MPGA 3GHAA 4NV2A 4ZB8A 4DSSA 2LS5A 1A24A 4GSTA 2LJKA 3GKNA 4ECJA 1EGOA 1XW9A 2ES7A 2FD3A 3IV4A 2K9FA 4PQIA 3KEBA 6GSVA 3GTUA 5CRGA 2PU9C 1PN9A 2FY6A 2L5LA 1K0AA 1Y25A 4XS6A 3FKFA 4J57E 3GX8A 1GSYA 3JCML 5F05A 13GSA 1HNAA 1IYIA 4TXVA 1XW5A 1ERTA 3NZNA 2B7JA 2LQQA 2CAQA 1C72A 2YOIA 3HVVA 5H5SA 1EWXA 5J4UA 1GTIA 1XWCA 4MK3A 4KH7A 3VI7A 2H01A 1TP9A 4MPFA 3M3MA 2R4VA 22GSA 2IMFA 6GSYA 4CHSA 2JZRA 1V9WA 2CZ3A 2TIRA 3L4NA 5KEJA 3ED3A 4QQ7A 4L0WA 2IL3A 2OKAA 3GFKA 2E2GA 2VL2A 2I4AA 3E3EA 4BPYA 4F03A 2FGXA 3HHVA 5IOWA 3G7IA 1TKDB 3IRAA 4EC0A 5GAND 3QOUA 1UVZA 3IAS2 5ECQB 3FW2A 1JHBA 3KCMA 2HFDA 5ELAA 1PL2A 2WRTA 2H72A 2ZUPA 3LG6A 3KM6A 2LJRA 4V2MA 4WBJA 3QDNA 4IJ3A 1XXUA 5B6NA 3DYRA 1R7HA 3Q74A 1N2AA 2D2ZA 3ZLPA 1BAYA 2ZNMA 3CYNA 4ML1A 4WR5A 4GQCA 4POKA 4I2UA 1VRSD 2IIYA 4PURA 14GSA 1B48A 2GSRA 2ON7A 2GQMA 1B4PA 1TRSA 3A2WA 4GRFA 1OE7A 4ZBDA 3APOA 5LD0A 4ECIA 4DSQA 4TW5A 3M1GA 2C0GA 5G1KA 2MMNA 2JZSA 4GLTA 4FIWA 5G1LA 3BCIA 4BVYA 1M2AA 5H5RA 4PX1A 3HA9A 1BYEA 1YF1A 5JWOB 1UA5A 3QAGA 2FA4A 5F8BA 3VFIA 4HZ4A 2JL4A 3F4RA 5CAXA 3C7MA 3G9BA 4MJBA 1PSQA 2FA8A 1K0OA 3C1RA 2PWJA 4P3YB 2MYGA 3L9SA 1V40A 2IWTA 2A4VA 5D93A 3FZ9A 5KN3A 1TU7A 1SKWB 1JFUA 1JZWA 2CT6A 2OE0A 3EMXA 5ECSA 1JZRA 1QFNA 3L9VA 5FWGA 2LRTA 4F82A 4G2EA 4RQRA 2LV3A 4HZ2A 16GSA 5GSSA 5IQYA 3W6GA 3RAZA 1GTUA 1MTCA 3RHBA 1YKCA 2H8LA 1T1VA 2GZYA 1GL8A 5D73A 4O7HA 1M7TA 4WKWA 1ZZYA 1B8XA 1YF0A 4EVMA 1EV9A 3GYKA 3UAPA 4TR3A 2KOKA 3KH9A 4PQHA 3QR6A 4GWRA 3KXOA 2JU5A 2HRFA 2HYXA 1AQXA 4KCAA 6GSXA 2XPEA 1EV4A 2O7KA 5AGYA 1G6YA 3LJRA 1AQWA 5AIVA 1A8YA 5CP1A 2YJ7A 1FVJA 4WEYA 4ZB9A 3WGXA 2O89A 2WB9A 4OCFA 4OO4A 1MDIA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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