2YWMA

Crystal structure of glutaredoxin-like protein from aquifex aeolicus
Total Genus 76
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
76
sequence length
228
structure length
228
Chain Sequence
MLLNLDVRMQLKELAQKEFKEPVSIKLFSQAIGCESCQTAEELLKETVEVIGEAVGQDKIKLDIYSPFTHKEETEKYGVDRVPTIVIEGDKDYGIRYIGLPAGLEFTTLINGIFHVSQRKPQLSEKTLELLQVVDIPIEIWVFVTTSCGYCPSAAVMAWDFALANDYITSKVIDASENQDLAEQFQVVGVPKIVINKGVAEFVGAQPENAFLGYIMAVYEKLKREKEQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of glutaredoxin-like protein from Aquifex aeolicus
rcsb
molecule keywords Glutaredoxin-like protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Aquifex aeolicus
total genus 76
structure length 228
sequence length 228
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature
pdb deposition date 2007-04-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13192 Thioredoxin_3 Thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ywmA01
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2ywmA02
2LNTA 2HXKA 1PL2A 3F3RA 2KOKA 3GFKA 3GMFA 2CAQA 2G0FA 2CV4A 1O8XA 3F9UA 3G7JA 1M2BA 4N10A 2HE3A 2YCDA 3NOFA 3DMLA 2K8SA 3C71A 3TOTA 5DDLA 1NSWA 4E8HA 3HHVA 3ZIVA 2LUSA 1BJXA 19GSA 2GTUA 3VK9A 1TP9A 4HS1A 2HZEA 3GRXA 1F2EA 2P31A 4Z7XA 3HVXA 2B1LA 3GKNA 4FYUA 3IHQA 3SWLA 2BMXA 2F51A 1WOUA 5D93A 2MYGA 1XW5A 4AJ7A 1MTCA 2DBCA 4P3YB 4I2UA 17GSA 4HJ2A 4NMUA 1X5DA 2OBKA 2HZEB 4GWRA 3GH9A 1ERTA 5AIVA 3KTBA 2C1YA 4LL1B 2NTOA 4BA7A 3ISOA 2FLSA 3CRTA 2MBTA 1GSQA 3UAPA 3V1WA 2H73A 1THXA 1MDIA 2GS3A 4HQZA 2QC7A 20GSA 2HI7A 2KLXA 2H30A 3TKSC 1PGTA 5G1LA 2ON5A 2PERA 5DALB 3LYKA 2L4QA 3HA9A 2VLTA 5J9CA 4MMMA 3BBYA 2JZRA 3UARA 3M8NA 3EWLA 3HJOA 4POBA 3HJMA 3KEBA 4KH7A 1F37A 1XBSA 3IPZA 6GSSA 1GWCA 3FR6A 5JCGA 1GNWA 1A0RP 5FT3A 1B9YC 2X64A 3Q74A 1YF0A 1TU8A 5DJLA 5D9WA 4KDUA 2H8LA 2A2RA 3TDGA 2YOIA 2FNOA 5L71A 3FR3A 5IPGA 4TR3A 3HVSA 1JHBA 2RM5A 2DJ2A 1J9BA 1Z9HA 1XXUA 4ZB8A 2PU9C 3G9BA 3WGDA 5DBQA 4PGTA 2AB6A 3GIXA 2F9SA 2CVKA 3LWAA 4GSSA 4TR0A 1AXDA 2VIMA 1UC7A 3P90A 4FYCA 5DAKA 5JWRB 1TRUA 2K6VA 4IVFA 4HDEA 1LJRA 2YP6A 3EINA 3WGXA 2DJKA 1FW1A 1TRVA 2LS5A 5A5KA 2CQ9A 3M0FA 2NVLA 1VF3A 1I5GA 5DAKB 3VPQA 1SKRB 2FHEA 4BVYA 2GSRA 3F63A 3KZQA 4LLRA 4E8EA 3GSSA 4MPGA 3F4SA 2YWOA 3ZMKA 4FO5A 2JL4A 2YZHA 2L6DA 3DKSA 1FOVA 4O32A 5GSSA 2LTKA 1JLVA 3APQA 3CSIA 4GSTA 5F8BA 1BEDA 2IMIA 1GH2A 4KX4A 3S9FA 4H86A 4ECJA 5ECOB 2GSQA 1SJ6A 3E0UA 9GSSA 4EF0A 5DQSA 1MD3A 2B5XA 3PR8A 1EWXA 3ED3A 1GRXA 1Z7PA 3IC4A 5A4VA 4ZL7A 5ECNB 4FIWA 3PGTA 3IBHA 3LSZA 3RPPA 2C3NA 2JACA 5JCUA 2WGRA 1KNGA 2K8VA 3P8WA 1MD4A 3GKXA 3LYPA 2B5EA 2KHPA 1X9WB 1VRSD 3IRAA 3MNGA 4G9HA 1NHOA 1R7HA 6GSVA 2CAIA 2AAWA 3I69A 4N0VA 4AJ6A 1SKSB 1XFLA 4ZBDA 5HFIA 4MDCA 3A5WA 1FB6A 1RK4A 1ZL9A 2YWNA 1K3OA 4WBJA 4XS1A 1A23A 3BCIA 2H72A 1RQMA 1ZGNA 5IQYA 1X9SB 2IMKA 4XS4A 1VGLA 2X8CA 3ME7A 2DLXA 5D9TA 4K7IA 5CAXA 1FVJA 4N30A 3UJ1A 3ZVJD 2M46A 2R5GA 4RQXA 4EO3A 3CBUA 2H71A 2NBSA 5FWGA 4Q5RA 3Q18A 3WD6A 4TXOB 1ZOFA 3F4TA 3DVWA 1PQNA 1F3AA 5G1KA 2L5LA 2C3TA 3GKKA 3QFBC 2VUPA 1XCCA 4MP4A 3ZLPA 1SK1A 4BL7A 1EOGA 4FH8A 18GSA 2DJ0A 2AYTA 4WF5A 4TN8A 3MWHA 1IYHA 2H1BA 3A2XA 2ZCTA 3QAWA 1FVKA 1T7PB 2DSAA 1B4PA 3TOUA 2OA7A 4PNFA 4F0CA 1O6JA 4RI7A 2WRTA 5H5RA 4K7NA 3PINA 1YJ6A 4OFTA 4K7OA 2KP2A 1KBNA 5DCGA 2PVOC 4TR4A 2XBIA 1J0FA 1O73A 5FHIA 3Q6OA 2VCTA 2VD0A 5DQYA 1MDKA 1TJDA 5CP1A 5C00A 2GQMA 3NIVA 2R6KA 1GULA 2GT5A 5F05A 3H4KA 3UIWA 4BPYA 1IYIA 4MF5A 3ERFA 5D9VA 3LG6A 1GSSA 2V2GA 5B6NA 1XWBA 2ZUPA 1JZRA 5LCZA 3BOAA 3UVTA 1XVQA 6GSXA 1XWCA 5CRDA 1XW6A 3G7YA 4JRRA 5H5QA 1AQVA 2EIRA 4X0XA 3TKSE 3W6GA 1URMA 1AAZA 3FZ4A 3JCML 3CRUA 1HQOA 4YQVA 2WCIA 3SBCA 4PQIA 1GP1A 3U5RE 2JADA 2B3SA 1U6TA 2IMDA 4LMWA 5B8AA 1YEXA 1NM3A 2JZTA 1GSDA 1MDJA 2MMNA 5LNKe 3QAGA 4HI7A 1SYXA 4ISDA 3VWVA 4N11A 3RBTA 2L4CA 2CZ3A 2XPDA 1K0BA 2I81A 3OR5A 5GSTA 1ZCPA 2H6ZA 1B4QA 5ENUA 2FWFA 2E2GA 2QKEA 4MJBA 1KTEA 2IL3A 1QQ2A 2GQKA 1GLPA 2DC5A 4MJAA 2OE1A 4L0UA 5EVOA 4TKYA 3KM6A 3RPNA 5IMCA 3GURA 4WF4A 3VI7A 2H0IA 1GUKA 4PUFC 1TRSA 1TDIA 4IJ3A 2VD1A 5KN3A 3G7IA 4K2DA 1FG4A 1V2AA 2PVQA 5J9BA 1SD9A 2H76A 1HD2A 1O85A 4WR4A 1OKDA 5INYA 2KUCA 2VLVA 5ECQB 1K3LA 5HR1A 2OKAA 1H75A 2XPEA 1K0CA 4IW9A 2VM1A 5EPFA 5JWQB 2HYXA 4DVCA 1AIUA 2WDUA 1M0UA 3E9JB 3ZITA 1M2DA 4FYBA 1UVZA 1M9BA 1ZYQB 5IMFA 2VOCA 1HNBA 2K9FA 3HVVA 1GLQA 2YWMA 2DJ3A 4QL7A 4ECCA 1U3AA 5KN2A 2JZSA 3TUEA 1GSFA 1QFNA 2CZ2A 4G10A 5LD0A 3KP8A 2PPTA 3KCMA 5JWOB 3KMOA 4MJCA 2RUEA 4NWYA 2LJRA 2R2JA 2EC4A 4KW6A 5ECRB 3LGCA 1V98A 1GTBA 2FWEA 4G19A 3HD5A 3GA4A 4DEJA 2M72A 3D4TA 2EIOA 4CDOA 4O5RA 3GKMA 1TK0B 3FW2A 4ZL8A 3C73A 4DSSA 2YANA 1OC9A 3MSZA 4NPBA 4I2TA 3GUSA 4GTUA 5J4UA 3IK9A 3H8QA 2O7KA 2LSTA 5KEJA 3VWUA 1K0MA 3Q19A 3DEXA 2LKUA 2X99A 3EMXA 4N0ZA 5A4WA 12GSA 1THOA 1ACVA 4ECIA 3EMPA 5JCWA 1XOBA 5CRWA 2H70A 3ME8A 3GNJA 1OC9B 5IMVA 2VCQA 1YDKA 4NV5A 1OC3A 4I97A 1S3CA 2OE3A 3DXBA 2OE0A 4RQRA 4JZQA 4NHWA 1EP7A 3CYNA 1XVWA 4MF6A 4MZBA 4OMVA 1XWKA 5G30A 4JU5A 1T4YA 5KN1A 3L0HA 4MZWA 1QGVA 3D22A 1JFUA 2RUFA 2X8HA 4POKA 4GQCA 2L57A 1Z3EA 1AQWA 4ZBBA 2LJKA 5GAND 3QR6A 1AQXA 2M80A 2H01A 5J5NA 2R3XA 1PA3A 2C8UA 2DMMA 4MPFA 4YQMA 4LL4B 2O87A 3FZ5A 1YF1A 1FB0A 1ZYEA 6GSWA 1VF2A 4O92A 2GDRA 2RM6A 5ECMB 4XIHA 3IV4A 1QK8A 4JR4A 4MZCA 4EUYA 2E2MA 4POMA 5ECIB 6GSTA 4IP6A 5CNWA 4EE0A 2WS2A 1PN9A 3AY8A 2H1DA 2L6CA 2VL3A 3GTUA 1PD21 1YKCA 1ERVA 2YJ7A 4LA1A 2MBSA 2HSHA 3TB2A 4AF2A 5J3RA 2O85A 1EEMA 4KSOA 3A2VA 3DWVA 3FEUA 1ON4A 4HOJA 3HZ8A 1CQHA 5B6MA 3CMIA 4WR5A 1JZDA 4J2FA 4ZILA 3TRPA 4F03A 4RUVA 3F6DA 2O89A 2XHFA 1TOFA 2TRCP 5F06A 1GTAA 3EU3A 2X8GA 1PMTA 1XWAA 3LFLA 3IAS2 4XRDA 1DSBA 3TKQA 3M9KA 4OD7A 3APSA 3UL3A 3D21A 1LBKA 3ZREA 2QSIA 4TOPA 3GH6A 1EV9A 1PRXA 4MF7A 4POLA 3C7MA 5D96A 4QL9A 3D0ZA 1O8WA 1EGOA 1DBYA 2H75A 3TJFA 3ZZXA 3D6IA 4I5QA 2GLRA 1C72A 5G31A 2L59A 4NV2A 3DD3A 3FY7A 5HR0A 1N2AA 4HZ2A 4DSRA 3WT1A 1V9WA 4KE3A 3A3TA 4BVXA 2TIRA 1XZOA 3IK7A 2F8FA 2N5AA 2PMTA 4NHZA 3L9SA 4IQ1A 4JBBA 4MJEA 3L9UA 3HCZA 1OAZA 4V2LA 2FWHA 5CRHA 5ECKB 5IMZA 4KDYA 1OE7A 1XOAA 3DGQA 2IWTA 2G2QA 3TCOA 3I6AA 1JZWA 4V1Ap 4PURA 1SD8A 4XS4B 5GAPD 2MMAA 1KEBA 1S3DA 3C8EA 1TTZA 2FA8A 14GSA 1BG5A 2WB9A 2CVDA 3IOSA 1SKWB 1A2MA 4LMVA 4EVMA 2YZUA 4CW9A 3FZAA 4MH3A 1GTIA 1U88A 3U6VA 3H93A 3IDVA 2EIQA 3HZ4A 4WETA 1SYRA 2AHEA 1Z6MA 3FKFA 4GRFA 1SENA 5AIXA 1Z5YE 1ML6A 2LRTA 3KH7A 1R26A 2FWGA 3WT2A 2V6OA 2IPAA 2O8VB 4ID0A 3LORA 2VO4A 2PUKC 2CT6A 2N5BA 3FR9A 3I9V2 2GZPA 2C0DA 1V58A 2IFQA 4ACSA 4OWYA 2FGXA 3D4MA 1WRYA 2I9HA 2P5RA 2FA4A 4L8EA 5DJMA 5KN0A 2J23A 4KDXA 2GT6A 3RAZA 1G0TA 3IA1A 1V57A 3DIEA 4HUAA 2REMA 4OO5A 4TVEA 4KNDA 4HQSA 4AJ8A 2HSYA 2NDOA 4IGJA 2E7PA 2GZZA 1ERWA 2PGTA 2WZ9A 7GSSA 1GUMA 1W89A 5ECHB 2IFQB 5IO0A 1GSEA 1TI1A 5ABRA 4GSNA 4PXOA 4EKZA 3KD0A 2H6XA 4HJMA 3TJJA 5DCHA 2LEGA 1YY7A 1BAYA 3D5JA 4NXIA 1CQGA 2DJ1A 3UVHA 5IM9A 1K0NA 2H66A 4MCUA 1M99A 1TK8B 1TRWA 3ZRDA 4PQHA 1B9XC 4ULXA 2A2SA 2VM2A 2LNSA 4O7HA 3KXOA 5E59A 4YAVA 4X43A 1ABAA 3HXSA 1PKZA 1M2AA 1YZXA 2JSZA 5F0GA 4K6XA 1SK2A 3W8JA 4MABA 1OVNA 1ERUA 3EE2A 1T1VA 2XBQA 3QD9A 2IMEA 4OCEA 3GSTA 1RW1A 3IXRA 2MMZA 5HFKA 5G2ZA 4BWSA 5CO3A 3CTFA 4QQ7A 3TJBA 2HNLA 3VLNA 4L5LA 22GSA 5ID2A 3TKPA 3FRCA 3L78A 5IMDA 2B7KA 4K0NA 5AGYA 1F6MC 3BD2A 3RDWA 1A24A 1TK5B 3KTLA 4IELA 2WULA 4JE1A 13GSA 3LXZA 3WGEA 1J08A 4GCIA 2C0GA 2H0HA 1BYEA 5ID2B 2C3QA 1SL1B 1OKTA 3HYPA 1AW9A 3LJRA 3MAKA 4L5OA 4YQUA 4EL1A 3O76A 3P7XA 4EDZA 2YJHA 5HR2A 3TGZA 3EYTA 2YV9A 4ZIJA 4EC0A 1SJZA 1WWJA 2Z9SA 2R4VA 5B8BA 2LV3A 4G2EA 4PX1A 4JEDA 5IIZA 2CA8A 2E0QA 2TRXA 1Q4JA 3CTGA 2PWJA 4IN0A 3VWXA 4HU9A 5COHA 3VWWA 5C04A 3F4RA 4OO4A 1FO5A 3KH9A 4HU7A 4IKHA 3EVIA 2HFDA 1YKAA 4KAEA 3VURA 4I6XA 3GV1A 1WJKA 1GL8A 1Q98A 2VAFA 2HRNA 3GN3A 2F8AA 3ZVJA 3E3EA 2OADA 2B6MA 3VFIA 2ES7A 3ERWA 1GSYA 4ILFA 3ZFLA 5DALA 6GSYA 1JLWA 1A2JA 4DSSB 2GVPA 1XIYA 3P2AA 3O3TA 1ST9A 1PX7A 3GYKA 4NAXA 2V32A 2DMLA 3ZIJA 2BJXA 2PBJA 3US3A 1K0OA 4WXTA 1F3BA 1R5PA 5AISA 5DVBA 3UMAA 2C80A 3ERGA 3RHBA 1NW2A 2H0GA 2RLIA 4K9ZA 4WKWA 3A2WA 5ELAA 3QPMA 2YWIA 2LQQA 2VCXA 2QGVA 2OBIA 3HJPA 3TRQA 4KGIA 1ILOA 1TXXA 11GSA 1DUGA 1K3YA 1UA5A 1M7TA 4Q5NA 4Q5FA 3HY2A 4KUNA 2VL2A 1BQ7A 1QUWA 3FHKA 2ON7A 3FYGA 2GSSA 2B7JA 4K1FA 2P5QA 1O7UA 3GL5A 3C1SA 4KA0A 5CREA 1ZZYA 5A4UA 1EP8A 4J56E 1GNEA 4IP1A 4ZBAA 1YQ1A 1G7EA 3KIJA 3TJGA 1A2LA 2C4JA 3HDCA 3ZTLA 4WEYA 3VPTA 1OE8A 1WIKA 3DVXA 3CSHA 3M1GA 2LRNA 5CRGA 4TRXA 1UN2A 2ALBA 4IBPA 3TRXA 1EEJA 1BX9A 5D9XA 4IQAA 5GZZB 2C0FA 3N9JA 2CX3A 3I43A 2YNXA 1T00A 1K0AA 2LRCA 2RIIA 2CVBA 4OFMA 3WYWA 1EZKA 4PNGA 3R2QA 3M3MA 4Q5QA 3BJ5A 4TR1A 4ECBA 3GTUB 4ML6A 4AGSA 4GQFA 1AC1A 2YN1A 4ML1A 3HKRA 4ZXGA 5G5EA 1SJIA 5IOXA 2HLSA 4KCEA 2WJUA 2MZCA 3FK8A 2K18A 4TR1B 16GSA 5CYYA 1WPIA 3TJKA 2DJJA 2V6KA 2V41A 2R37A 4BWQA 4MH2A 4IJIA 1T4ZA 3LXTA 3W8SA 3VI5A 1O81A 3IE3A 1Y6EA 2VLUA 4F82A 3K8NA 2I1UA 2VCVA 3QMXA 4XCSA 1X5EA 2VL9A 4WBRD 1OYJA 2ZNMA 2DIZA 1S3AA 3ZFBA 1YEPA 2H6YA 3BCKA 6GSUA 3KMNA 3QCPA 5B7CA 2I3YA 5D8IA 2B1KA 3TKSA 3EC3A 3M9JA 3F8UA 4TW5A 1PX6A 2C0EA 2H74A 1PSQA 1TI3A 2A4VA 1VF4A 4F2IA 1FHEA 2V1MA 4EDYA 5G5FA 1A8YA 3KJYA 4IHUA 5HFGA 1N8JA 4YH2A 1SU9A 5J41A 4V1Ag 4TXOA 2FCHA 4XS6A 2N5FA 2DIYA 1PKWA 3H1NA 2OJLA 1XWGA 4GXZA 1TW9A 1B8XA 2JU5A 2FUG2 4K8MA 4OCFA 3H79A 5AN1A 2AUVA 5ECPB 2GSTA 1WP0A 1H4OA 1U3IA 1V40A 3UEMA 3QAVA 1EV4A 3IR4A 4KCAA 4XRAA 1USBA 3PH9A 1GUHA 1DE2A 1R4WA 3IAM2 1T3BA 2PN8A 1TU7A 1XW9A 3APOA 4YAPA 1HNAA 1ZMAA 1GSUA 2OACA 3KP9A 1E2YA 3UBKA 1R5AA 2HZFA 1HYUA 2IIYA 3CSJA 1WMJA 1M9AA 3LQ7A 1SK0A 4D73A 2FD3A 2GQLA 4JR6A 5EL8A 1GTUA 3GHAA 3DYRA 2P0GA 3ZYWA 1FAAA 4ZL9A 1SL0B 3F3QA 1HNCA 1G6WA 2YPMA 4CHSA 3N5OA 2VCZA 1SL2B 2H19A 5H5SA 1DE1A 2LJAA 2HT9A 3L4NA 5F07A 1JZOA 2J9HA 3QOUA 1W4VA 4D73B 1F9MA 3NZNA 4ZB6A 2H1GA 2AV4A 3UBLA 1QXHA 2L5OA 1PL1A 2VCWA 1EGRA 1NHYA 1U87A 1MEKA 4EXJA 10GSA 2IN3A 5HQPA 4GLTA 2YV7A 4HEA2 3GX0A 2D2ZA 1Z7RA 5IMAA 5HR3A 4I8BA 3F6FA 4XTSA 3QFAC 5ECSA 1K0DA 4K0GA 4F9ZA 2KP1A 5IOWA 3GL3A 1X5CA 3CXGA 2XC2A 4HZ4A 1X0RA 1AUCA 3EU4A 1VF1A 5IO2A 3DRNA 2I4AA 5E4WA 2BTOT 1Y25A 3ZMLA 1I9DA 3C1RA 3EURA 4OFNA 1G6YA 1Z6NA 3LEFA 1LU4A 3L9VA 3TKRA 2GZYA 1A0FA 1XPVA 1EOHA 3UOMA 4J57E 4TXVA 4V2MA 3KGKA 1A8LA 3MDKA 4F0BA 3FZ9A 4GF0A 2F3MA 1E6BA 1QMVA 5IPHA 3F0IA 8GSSA 2AJQB 4RI6A 2NPBA 2FY6A 4L0WA 5ECLB 2WFCA 2VL2C 4PUAA 2JSYA 2IMFA 1WE0A 4PQ1A 5EY6A 3ZL5A 3RHCA 4X1UA 4DSQA 3O6TA 2LQOA 3J7Yk 1G7OA 2IJYA 1T8EB 3GX8A 4KB3A 5D73A 2GGTA 4V2NA 5ELGA 1OC8A 4KSMA 2B5YA 3J7Yb 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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