2Z9SA

Crystal structure analysis of rat hbp23/peroxiredoxin i, cys52ser mutant
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
197
structure length
197
Chain Sequence
SGNAKIGHPAPSFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYVVFFFYPLDFTFVSPTEIIAFSDRAEEFKKLNCQVIGASVDSHFCHLAWINTPKKQGGLGPMNIPLVSDPKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITINDLPVGRSVDEILRLVQAFQFTDKHGEVCPAGWKPGSDTIKPDVNKSKEYFSKQK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Rattus norvegicus
publication title Dimer-Oligomer Interconversion of Wild-type and Mutant Rat 2-Cys Peroxiredoxin: DISULFIDE FORMATION AT DIMER-DIMER INTERFACES IS NOT ESSENTIAL FOR DECAMERIZATION
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-1
total genus 58
structure length 197
sequence length 197
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2007-09-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2z9sA00
3UEMA 3S9FA 3CRUA 1V9WA 4ZILA 2IIYA 2FWFA 4YAVA 5C00A 1M9BA 2N5AA 2PN8A 1T00A 2B5EA 17GSA 3QAVA 3P7XA 2PGTA 4WKWA 5F0GA 2WCIA 1A0RP 3WT1A 14GSA 3GYKA 2RM5A 1YZXA 5JCUA 3LSZA 1G6WA 4TN8A 5ECKB 1TRUA 1X5CA 4XS4B 1HNAA 2RUEA 1JZDA 6GSVA 4DVCA 5IMFA 2YV7A 1XW5A 4ZBAA 2LV3A 5A4VA 1V57A 4IS0A 2ALBA 2FA8A 1EOGA 4X1UA 4I2TA 3EU4A 12GSA 4GCIA 4ECBA 3C71A 2L5LA 4BVYA 2LTKA 1ZL9A 4FYCA 2LRTA 5CYYA 5JCGA 7GSSA 2LQQA 1FOVA 1EZKA 4LLRA 1ILOA 2P0GA 5ID2A 4I5QA 4IQAA 11GSA 3IHQA 1R5AA 2MMAA 4MK3A 4POLA 3PR8A 1QQ2A 1XWAA 2N5FA 1XW9A 4HUAA 1KNGA 1DBYA 5ENUA 4KDXA 4KW6A 3US3A 2H1GA 1XWBA 1W89A 2IMIA 3FYGA 2XHFA 3ME8A 5D9WA 4NAXA 2YOIA 4EF0A 2ZNMA 3M3MA 1GP1A 3UIWA 1SK0A 4MA9A 2F3MA 3D22A 4LMVA 1PKZA 5DBQA 1V58A 1S3AA 3F4RA 4FYBA 1URMA 1M2AA 1TK5B 3VI5A 4XTSA 2FGXA 1A8YA 2B5YA 2JZSA 3LQ7A 1FHEA 5LD0A 4K7IA 4G10A 4IW9A 3PH9A 1AQXA 1F2EA 2MMOA 5B8BA 4TXOB 1IYHA 1TU8A 1ZYQB 1PX6A 2X8HA 2CVBA 3QFBC 4EKZA 1XWKA 3L4NA 1GSSA 1J9BA 3CSJA 3D0ZA 5INYA 2H75A 3F6DA 5DJMA 4K7NA 4OFMA 1E6BA 2NDOA 3HKRA 4MH2A 2D2ZA 4TR0A 3KD0A 2JACA 3HA9A 1WWJA 2DC5A 1O81A 1XBSA 4F9ZA 1ML6A 5J9CA 3W8SA 3GX8A 2PVQA 2F9SA 4N10A 3PINA 4OCFA 1SL1B 5D8IA 1AAZA 2V2GA 2M72A 2GZZA 2DJ0A 4NMUA 2HZEB 3HYPA 5KEJA 5GSSA 1SYRA 2VOCA 3GX0A 1PX7A 5AGYA 4RQXA 4V2MA 3ZVJD 3W8JA 4BL7A 5J41A 1PMTA 1VGLA 4POBA 5CREA 2MMZA 3LYKA 3L9SA 4G2EA 4TR1B 5IPGA 3GFKA 3DVWA 2XBQA 1M9AA 3KH9A 4BPYA 4IJIA 2H76A 1GUHA 2MYGA 3J7Yk 2R37A 2BJXA 4F2IA 2C3QA 1G7OA 5IO0A 5ECSA 1B9XC 4GTUA 4JZQA 2C3TA 3HVVA 1GWCA 2WB9A 3MAKA 1WMJA 3ERFA 4E8EA 1A24A 5FWGA 4F03A 3VWVA 1TW9A 1YEPA 2JSYA 6GSWA 1XOAA 3HZ4A 3E9JB 1K0BA 3FZ4A 2PVOC 2WULA 4K7OA 1SD9A 1V98A 2DJ1A 4HJMA 2IMFA 2YZHA 4PQ1A 3F4TA 2AAWA 3O3TA 2E2GA 4MABA 4V1Ag 4XS4A 2PPTA 2HXKA 1V40A 3CTGA 5JCWA 3UMAA 1TK8B 3U6VA 4HDEA 4TVEA 4KH7A 3IA1A 1XWCA 5A4UA 2NTOA 4ECJA 5G31A 22GSA 3NZNA 1ERVA 2VAFA 3TJFA 3LXZA 1JZWA 4JR4A 2I9HA 3VPQA 2FUG2 2EIOA 1OKTA 1Q4JA 2LRCA 2V6KA 1YJ6A 3KMOA 4F0BA 4J56E 1VF2A 2KP1A 3RAZA 4J57E 1TK0B 4ZL9A 1M2BA 3TCOA 1FW1A 2MBTA 1Y25A 1G7EA 1F37A 2V1MA 1SYXA 1K0AA 3GTUA 1EOHA 4MMMA 1BX9A 1LBKA 4NV5A 2YZUA 5GSTA 2FD3A 1B4PA 4XIHA 2XC2A 1KEBA 2X8GA 5H5QA 1BEDA 1TKDB 4QL7A 3GKNA 1TDIA 1SKRB 1SK1A 4DSRA 4DSQA 5ID2B 3ZFBA 1S3CA 4K1FA 4RQRA 5COHA 3G7YA 4TXVA 4NHZA 2IWTA 2H0GA 1TP9A 4N0VA 2C3NA 3FR6A 1WIKA 4WF5A 3BBYA 1W4VA 1IYIA 2YN1A 4TKYA 3TGZA 1GL8A 1SJZA 5EL8A 1GSDA 2LQOA 2VL2C 1RK4A 3FEUA 3QDNA 4TXOA 4XCSA 1EP7A 4FH8A 2KHPA 1DUGA 2N5BA 5CAXA 1B9YC 3LGCA 4GSSA 4OFTA 4MH3A 3WD6A 4WBJA 4KNDA 2FHEA 4MP4A 3GL3A 3KXOA 4K0NA 3D6IA 1AXDA 5ECNB 4QL9A 1PD21 2LJKA 1DE1A 4DSSB 3M1GA 3I69A 2GTUA 4NPBA 4GF0A 2REMA 3E3EA 1GTBA 2H74A 4KDUA 2GSSA 2E7PA 1A2MA 1B4QA 5KN1A 1QMVA 3SWLA 8GSSA 1F9MA 5HR1A 3TDGA 4HU7A 2WJUA 3BCIA 2HZEA 1LJRA 2YWIA 4NV2A 2CA8A 3HY2A 3KMNA 3CRTA 5G1KA 5G30A 1MDJA 4RI6A 4N11A 1XFLA 1N8JA 5IMDA 4GQFA 3RHCA 3GSTA 2DLXA 2AB6A 4Q5QA 2CAIA 2PBJA 4NHWA 3BCKA 4D73B 1PA3A 2L5OA 2HFDA 4KCEA 3IAM2 2GT5A 3IXRA 1GNWA 5J4UA 1O7UA 4ZBBA 3C7MA 4TR3A 1U3AA 1K0CA 3TB2A 1U87A 3AY8A 5F05A 3TKSC 1ST9A 2B1LA 2QKEA 4TOPA 1AIUA 3V1WA 4OMVA 2VL3A 2GVPA 1M99A 4HQSA 4ZXGA 3VK9A 2A2RA 4I6XA 3IPZA 3L9UA 1GSQA 2LNTA 2V41A 1THXA 2X8CA 3P8WA 2WDUA 3HJOA 2HZFA 3DRNA 5A5KA 4LA1A 2YWOA 2H1BA 3JCML 1HNCA 1XOBA 4ID0A 2OADA 2OACA 3FZ5A 3GIXA 4XS1A 5JWRB 3KZQA 3E0UA 4TR4A 4IJ3A 1ERTA 2VL9A 2PU9C 2GQLA 3M0FA 1SD8A 4OO4A 3BJ5A 1GSFA 4ML6A 5KN2A 3FKFA 4ZBDA 2R3XA 1GLPA 4O32A 2H72A 3QD9A 3LG6A 2H66A 2IMKA 1U3IA 3GL5A 2IL3A 4HS1A 3C8EA 3UVTA 1ZYEA 1K3LA 1SJIA 2ON7A 5CRWA 1PN9A 4WF4A 5ECMB 2OA7A 2YNXA 2H8LA 2KP2A 5D9XA 1S3DA 4KDYA 5CNWA 3R2QA 2PMTA 4EC0A 3H1NA 3GH6A 2B6MA 1QK8A 3A5WA 1XZOA 4PNGA 1PQNA 1SK2A 3UJ1A 3W6GA 4MLYA 4GRFA 1X9SB 4Q5RA 2OBIA 1O8WA 1YKAA 1EGOA 4PNFA 2VLUA 2R2JA 3HXSA 2DJ3A 4WXTA 1GTUA 5ECLB 3HJMA 3H8QA 3HD5A 1V2AA 5CRDA 1RW1A 2LNSA 2IJYA 3FZ9A 2VL2A 3GTUB 5ABRA 2O7KA 3EU3A 4O7HA 1EGRA 1TRSA 2H73A 2NPBA 3N9JA 2YP6A 2J9HA 3RPNA 2O89A 1SL0B 3RBTA 4HOJA 4V1Ap 5DCGA 5B6MA 19GSA 2H1DA 5HFGA 3ZFLA 4KCAA 5KN0A 3WGEA 4L0WA 4V2LA 1EEMA 4IKHA 3Q18A 1EV4A 3PGTA 4DSSA 4BWQA 4PQHA 2GZYA 4Z7XA 2H19A 3KH7A 1A0FA 5D73A 5F07A 4JU5A 2VLVA 3FW2A 2CQ9A 4MF6A 3ZL5A 2JZTA 4OCEA 1N2AA 5ECQB 4L5LA 1T4ZA 1OYJA 2G0FA 2VLTA 2K6VA 1Z7RA 3KP8A 2VO4A 1K0DA 2LJAA 4HI7A 5HR0A 3GURA 5G5EA 5H5SA 2HRFA 4J2FA 4JR6A 1PL1A 1Z6MA 2L57A 5CRHA 3Q6OA 4HEA2 2CZ3A 4KE3A 3O6TA 2RM6A 2AYTA 3A2XA 1K3YA 2M46A 2MMNA 3QOUA 1BJXA 4GXZA 4K9ZA 4O92A 2O8VB 3IK7A 3DVXA 4HZ4A 4OD7A 3FR3A 1GUMA 3ZLPA 2O87A 2VCVA 3H4KA 4D73A 3IBHA 3ZZXA 1PKWA 1XIYA 4IELA 2R5GA 4TRXA 1OC9A 3TKSA 1QUWA 5ELGA 6GSUA 1T7PB 2K9FA 1MD4A 4P3YB 3UVHA 2EIQA 1PL2A 4PUAA 3CBUA 3ME7A 5CP1A 1MDKA 2NVLA 2X99A 1M0UA 3KIJA 4L5OA 3DGQA 3ZMKA 3GUSA 4JEDA 3FHKA 3QFAC 1H75A 4WBRD 1NHOA 1Z6NA 2L6CA 3LXTA 3TRXA 1R7HA 2VM2A 2X64A 1J0FA 1U88A 4ZIJA 2MZCA 5IOWA 2FA4A 5IMZA 3F0IA 5ECRB 3VWXA 3GKXA 1B48A 1YQ1A 2O85A 5J9BA 1Z5YE 5DCHA 1F6MC 3HHVA 4EO3A 3H79A 3VWWA 4H86A 2C0GA 4G19A 3C73A 3ZREA 1BQ7A 1FAAA 3O76A 1M2DA 4ULXA 2C0EA 4IGJA 2H71A 2P5RA 4CHSA 2HRNA 1ERWA 2CX4A 3F3QA 6GSYA 4PURA 2OBKA 20GSA 1RQMA 5F8BA 4ISDA 1Z9HA 2OE3A 4ZB9A 4PQIA 1EEJA 3CYNA 2AHEA 4KGIA 1J08A 1A8LA 1ZOFA 4Q5FA 3GMFA 5G5FA 2QSIA 4AF2A 2FLSA 2Z9SA 4FYUA 3ZMLA 1LU4A 3UBLA 5FHIA 2RUFA 2H0HA 1O73A 3VLNA 1O8XA 1R4WA 3F4SA 2QC7A 5A4WA 5DDLA 3GHAA 2IPAA 4POKA 5HFIA 3UOMA 4RUVA 3APOA 3DD3A 4MPFA 1AUCA 4IN0A 3L78A 1JZRA 1QXHA 1C72A 1GUKA 2DIZA 4MF7A 4HQZA 2P5QA 3UARA 1BYEA 4YQMA 4I97A 1GH2A 5D9VA 1XVQA 2WGRA 2B7JA 2HI7A 2RIIA 3F6FA 1TTZA 2CAQA 2I4AA 2KUCA 4EUYA 3D4MA 1UA5A 2VUPA 1OE8A 3M9KA 5EPFA 5C04A 2HT9A 1OAZA 3FR9A 1XXUA 3TJBA 2AJQB 2F8FA 4K8MA 1XWGA 1WRYA 2E2MA 2G2QA 3BD2A 1MEKA 4ML1A 5IIZA 5D96A 4ZB8A 3KP9A 4YH2A 2H6YA 2I1UA 2OE0A 2C0FA 4EDYA 1ZZYA 5HQPA 2J23A 3IRAA 2H30A 5IMVA 3HVXA 1HYUA 4ECCA 4KAEA 6GSSA 2V32A 3C1RA 4KUNA 3KCMA 1OC3A 1USBA 5G2ZA 2LJRA 3SBCA 1EWXA 2YV9A 2B7KA 1SU9A 3QMXA 2ZUPA 1K0OA 4OFNA 1F3BA 3EMXA 3NIVA 3QAGA 4FIWA 3K8NA 1AW9A 2FWGA 1ABAA 2WRTA 4TW5A 2CVDA 1GSYA 2L59A 1GRXA 4PX1A 3VFIA 1X9MB 2DJKA 2C0DA 2B5XA 4LMWA 4XRAA 1SKWB 2GZPA 2H6ZA 2HYXA 3DMLA 1OC9B 1X9WB 1ACVA 1JZOA 2I3YA 3TJJA 2P31A 2M80A 2OE1A 3F3RA 2GSTA 2IN3A 3ED3A 5DQSA 1YEXA 2JZRA 1PRXA 2OJLA 2GSQA 5ECOB 1FVJA 5LCZA 4YAPA 4MF5A 2DJJA 4IP1A 2L6DA 1QFNA 1AC1A 4JBBA 1FB6A 1FG4A 2ON5A 1TXXA 2RLIA 1H4OA 3WYWA 2VM1A 1DE2A 2IFQB 2LS5A 1GSUA 1JFUA 3TKQA 4GLTA 5CO3A 2GT6A 2ZCTA 1SENA 5D9TA 1XW6A 1OVNA 3IDVA 4K6XA 1WJKA 2K8SA 3Q74A 5DQYA 2CV4A 3G7JA 2FCHA 5EY6A 1A23A 3IE3A 1AQWA 5E4WA 2JSZA 1OE7A 4X43A 4EVMA 2C8UA 1X5EA 3CSHA 2VCWA 3P2AA 3RHBA 3GA4A 1T1VA 1XVWA 2H01A 5AIXA 3QPMA 4OO5A 3EURA 2TRXA 5GAPD 3KTBA 4XS6A 2NBSA 2VIMA 4Q5NA 5DALB 4XRDA 3UL3A 3IAS2 3HCZA 5F06A 4WR5A 5DAKB 2A2SA 1TI1A 3VURA 3C1SA 2R6KA 1R26A 1I5GA 1U6TA 1BAYA 3DKSA 4KA0A 1O6JA 3CMIA 1E2YA 3F9UA 3TOTA 2DJ2A 5JWQB 4HZ2A 2PWJA 4I2UA 16GSA 5ECPB 1FO5A 2QGVA 1K0NA 4NXIA 3EINA 1R5PA 1X5DA 3IOSA 5D93A 3ZITA 4HJ2A 2AV4A 4GQCA 1M7TA 1MD3A 1Z3EA 3TOUA 3G7IA 2OKAA 4NWYA 1VRSD 13GSA 4YQVA 2VD0A 2DMLA 1SJ6A 2GQKA 2DMMA 2IMEA 1A2JA 5B8AA 4GWRA 2GDRA 4GSTA 2JADA 2H1AA 1FB0A 1I9DA 1GULA 3CXGA 3FK8A 5L71A 2GS3A 3FY7A 3GKKA 5HFKA 1T8EB 1TI3A 2V6OA 1JLVA 4XHMA 4WR4A 4YQUA 2CVKA 4KSMA 1UN2A 4JE1A 1YY7A 1DSBA 4E8HA 2HLSA 2FWHA 3GV1A 2HE3A 3F63A 3HJPA 1KTEA 5ELAA 2YJ7A 3EVIA 3RDWA 4MZWA 4MPGA 5FT3A 4EL1A 1TRWA 1K3OA 1GSEA 4BVXA 1ERUA 3UAPA 5HR3A 2XBIA 4MZBA 2CX3A 3TJGA 1K0MA 3P90A 4IVFA 4CW9A 2EIRA 3G9BA 2YCDA 4L8EA 2C1YA 4MJBA 3UBKA 1TOFA 5IPHA 2LEGA 3Q19A 3WGXA 1EP8A 2VCQA 5AISA 4LL4B 4EXJA 1Q98A 3N5OA 1G0TA 3EYTA 2DIYA 2E0QA 3ZIVA 4MCUA 2YWNA 4AJ8A 2GLRA 3J7Yb 4ACSA 3IV4A 3DEXA 4K2DA 3TUEA 4FO5A 6GSTA 3ISOA 2GGTA 3RPPA 4QQ7A 2LRNA 4F0CA 2H70A 2IFQA 18GSA 4MDCA 4AJ6A 3GN3A 3MNGA 4KSOA 1HD2A 4G9HA 3MDKA 4IBPA 2JL4A 2KOKA 2K18A 4LL1B 4ZB6A 1G6YA 2HSYA 1GTAA 3ZTLA 5IOXA 3DIEA 2H0IA 1XCCA 1Z7PA 1TU7A 5DJLA 2JU5A 3DXBA 1XPVA 3LJRA 3LWAA 1TJDA 3H93A 2HNLA 4IQ1A 3D4TA 2ES7A 3I9V2 1CQHA 3APQA 5J5NA 3EMPA 4N30A 2AUVA 3VI7A 1AQVA 1UC7A 5B6NA 3HDCA 4MZCA 2VCTA 2CT6A 3ZYWA 2VCXA 2K8VA 2C80A 5E59A 5DALA 3A3TA 1NW2A 4ECIA 2EC4A 1TRVA 2FY6A 2LSTA 5KN3A 5DAKA 3D5JA 4POMA 1WOUA 1SKSB 5HR2A 1X0RA 3FRCA 4F82A 3IC4A 2L4QA 1A2LA 1OKDA 5G1LA 3LFLA 5ECHB 1ZGNA 3F8UA 2YWMA 3KM6A 2WFCA 3DWVA 4KX4A 4DEJA 4IHUA 3D21A 2BTOT 1MTCA 2GQMA 3GKMA 3KTLA 1HQOA 1HNBA 4MJAA 2VCZA 4BA7A 2F51A 5JWOB 1BG5A 4CDOA 3APSA 5IM9A 3QR6A 4L0UA 5CRGA 2TIRA 3CSIA 3WGDA 3HZ8A 2B1KA 4JRRA 1NSWA 5IQYA 3I43A 1GNEA 1Y6EA 3A2VA 2VD1A 5IMCA 1WPIA 3KEBA 3U5RE 2H6XA 2L4CA 2YJHA 3GNJA 1THOA 1VF3A 3M9JA 2A4VA 5DVBA 1GLQA 1ON4A 4PXOA 5J3RA 3L9VA 1VF4A 1EV9A 5AN1A 1UVZA 2YANA 2R4VA 2KLXA 5H5RA 2HSHA 1YDKA 3EE2A 1YKCA 3TRQA 1GTIA 3VWUA 1KBNA 3KGKA 4WETA 4V2NA 2FNOA 4BWSA 1JHBA 1PGTA 3EWLA 1PSQA 5EVOA 1NM3A 4RI7A 2I81A 3GSSA 1YF0A 3I6AA 2C4JA 4GSNA 5ECIB 2XPEA 5GZZB 2LUSA 9GSSA 1VF1A 3L0HA 3NOFA 1YF1A 5IMAA 3FZAA 2PERA 2YPMA 3EC3A 2MBSA 3MWHA 3TJKA 1CQGA 4I8BA 5IO2A 4AJ7A 3LYPA 2IMDA 1SL2B 3ZVJA 3CTFA 4N0ZA 4MJEA 3ZRDA 3TRPA 1FVKA 4IP6A 1MDIA 4AGSA 4OWYA 3TKSE 2F8AA 2FWEA 2LKUA 2WZ9A 3IR4A 1NHYA 1OC8A 3M8NA 3LEFA 3DYRA 4TR1A 1ZCPA 3OR5A 4O5RA 3QCPA 2DBCA 3GRXA 3A2WA 4ZL8A 3ERGA 3VPTA 2GSRA 1B8XA 3KJYA 4PGTA 1T3BA 3IK9A 1JLWA 3TKRA 4K0GA 4MJCA 1WP0A 1ZMAA 3MSZA 1O85A 4X0XA 5GAND 2PUKC 2TRCP 2WS2A 3QAWA 1WE0A 3BOAA 1F3AA 6GSXA 3HVSA 1T4YA 4EDZA 2CZ2A 4PUFC 5AIVA 5B7CA 4WEYA 10GSA 4ILFA 5LNKe 4KB3A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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