2Z9SA

Crystal structure analysis of rat hbp23/peroxiredoxin i, cys52ser mutant
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
197
structure length
197
Chain Sequence
SGNAKIGHPAPSFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYVVFFFYPLDFTFVSPTEIIAFSDRAEEFKKLNCQVIGASVDSHFCHLAWINTPKKQGGLGPMNIPLVSDPKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITINDLPVGRSVDEILRLVQAFQFTDKHGEVCPAGWKPGSDTIKPDVNKSKEYFSKQK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Rattus norvegicus
publication title Dimer-Oligomer Interconversion of Wild-type and Mutant Rat 2-Cys Peroxiredoxin: DISULFIDE FORMATION AT DIMER-DIMER INTERFACES IS NOT ESSENTIAL FOR DECAMERIZATION
pubmed doi rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-1
total genus 58
structure length 197
sequence length 197
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2007-09-25

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2z9sA00
3IBHA 2PPTA 2AV4A 1TK0B 3S9FA 2OE1A 1OYJA 3Q18A 4L8EA 5G1KA 2V2GA 2LJAA 3A3TA 4GTUA 1J9BA 4ECJA 5A4WA 4MF7A 3DD3A 4FYBA 3L9VA 2R3XA 1B4PA 1WPIA 4MCUA 3W6GA 3FR9A 4XHMA 2V6OA 1A23A 2GSRA 4JRRA 3H8QA 5HFKA 4X0XA 2LSTA 1PMTA 4AGSA 3FEUA 1X5EA 2VLVA 3QFBC 4K9ZA 4V2MA 5H5RA 4HI7A 2H6ZA 4D73B 1XVWA 3MDKA 4ZBDA 2HSHA 1SD9A 1SL1B 3MNGA 3HA9A 3G7IA 3KCMA 1EWXA 1YJ6A 3C1RA 1X5DA 1ML6A 4TN8A 2DBCA 3N5OA 4FYCA 3WGEA 1ZZYA 1YDKA 1OAZA 1V2AA 3GL5A 1C72A 3M9KA 2NBSA 2VUPA 4IQ1A 1MEKA 4KB3A 2OA7A 2EIRA 3A5WA 1R26A 5ECMB 1R5PA 1XXUA 4JBBA 3D4TA 1TK8B 3CTFA 3E3EA 4K7IA 3CMIA 2L5LA 3P8WA 1B9YC 4BVYA 2FY6A 5IIZA 2IMKA 3GMFA 4NV5A 1ON4A 4LA1A 5IO2A 5CO3A 4TKYA 3SWLA 1ZYEA 4N0ZA 5DVBA 2R5GA 2H19A 1BJXA 2GVPA 3GA4A 2AJQB 4DVCA 1ZGNA 3C1SA 1SKWB 2O7KA 5EVOA 1JZRA 3GNJA 1GL8A 4AF2A 5C00A 4F2IA 1YKAA 4XCSA 1GH2A 2KP2A 5JCGA 1VF4A 6GSYA 2QC7A 2MMZA 3VWWA 1QMVA 4FO5A 3H79A 2RUFA 2BMXA 2WGRA 1YZXA 2P31A 2MYGA 1YF1A 3HXSA 2E2MA 4YAPA 1X0RA 2N5AA 2QGVA 2WCIA 3QFAC 3TKSC 1OKTA 1G7OA 3CRTA 2P5RA 3TJFA 4G9HA 2L6DA 2X8CA 4JU5A 2NDOA 1ZMAA 4MK3A 2B3SA 3IC4A 3NIVA 4EKZA 2GT5A 4GRFA 1TDIA 3ZTLA 4O32A 1MD4A 2H01A 3FYGA 1PSQA 2FA8A 1TU8A 4D73A 4HS1A 3GL3A 4OFNA 4MPFA 1SK2A 4WR5A 2YV9A 3ZFBA 2YJ7A 1THOA 3TKSA 1GUHA 3HJPA 3GV1A 4QQ7A 1ACVA 4IW9A 2OJLA 3EYTA 2WZ9A 3GKXA 3FZ9A 1K0BA 3TKRA 1EV4A 2R2JA 5AISA 3GUSA 3ZIVA 4EE0A 1JZWA 1PD21 1QUWA 3GYKA 1OC9B 3GTUB 3EURA 2ALBA 2CVDA 3EVIA 2AHEA 2PN8A 2C0EA 5KN3A 3GKMA 3WT1A 1OVNA 1DBYA 2X99A 5ELGA 2OE0A 2CX4A 2HFDA 5AGYA 1TK5B 4I97A 3EU4A 5DALB 1PX7A 5F0GA 2JSZA 4QL9A 2IMFA 4IJIA 4OFTA 2X8HA 2VL9A 1YEPA 2LJRA 1XWBA 5A5KA 4WEYA 3L9SA 1AIUA 4KDUA 3EC3A 4RUVA 5J9BA 4GLTA 1SD8A 3HZ8A 1EV9A 1QK8A 3VI5A 1AQVA 1K0AA 1WP0A 5ECOB 3SBCA 3CRUA 6GSTA 2YANA 2J23A 14GSA 4OCFA 5ECKB 4EF0A 1FVJA 2GT6A 3RAZA 3J7Yb 1A24A 2CX3A 3RHCA 3ERWA 4TXVA 4XS6A 1EP8A 2PVOC 2RLIA 2MMOA 2GGTA 3D4MA 3FW2A 3L4NA 4MMMA 1FW1A 2A2RA 1B9XC 2R37A 2YV7A 1XWAA 3QMXA 1PL1A 3C8EA 2JADA 5ECLB 3TKSE 5ECPB 2NPBA 1Z7PA 4Q5QA 2IMEA 5F8BA 3PGTA 5G5FA 1HD2A 1GSQA 3DKSA 1K0CA 4HJ2A 4EL1A 1HNAA 1W4VA 2V41A 4NPBA 1FB0A 3VFIA 2JACA 1OC3A 3FHKA 5HR2A 3CSHA 3PR8A 3TKPA 1M7TA 2OKAA 3RPPA 1EOGA 4XTSA 5GSSA 3OR5A 3QAWA 4MH2A 2OBKA 1TRVA 1FHEA 4IGJA 5ECRB 3N9JA 3HJMA 4V2LA 1WJKA 4OD7A 3J7Yk 2HI7A 3NOFA 1OC9A 1W89A 3GTUA 1SU9A 1OE8A 4KAEA 4YQMA 3Q74A 5L71A 3UOMA 1ERWA 3UVTA 5IMCA 2XBQA 1NHYA 2HNLA 2L6CA 4FH8A 4DSRA 1RQMA 1TI3A 3ZREA 2OADA 4NHWA 4KE3A 1EGOA 2QKEA 3ZMKA 1GSEA 4XS1A 2I9HA 3GX0A 5D8IA 2VCXA 12GSA 3TGZA 4XS4B 2MMAA 1S3CA 2LKUA 1KEBA 2HLSA 2IMDA 1A8LA 1GSUA 4TOPA 1ILOA 1O8XA 1ZL9A 3P2AA 4K8MA 4OO5A 4X1UA 4MJBA 3TB2A 3TKQA 1XWCA 3HHVA 3EE2A 1Z3EA 3APSA 2HRNA 2PWJA 4EC0A 3LEFA 5E4WA 5ECSA 2CV4A 1A2MA 1VGLA 2VM1A 4J57E 4KDXA 1NHOA 6GSSA 1GSFA 5FT3A 3GURA 2A2SA 4TVEA 1WE0A 4ZIJA 2REMA 6GSWA 1GWCA 4Q5RA 1JFUA 1GTIA 2VCZA 2IN3A 2M46A 5DJMA 2H1BA 3QCPA 3F6DA 2CVKA 1MDJA 1T1VA 4ZB6A 4KSOA 3L9UA 1U3AA 1PA3A 2RIIA 4PQHA 4L0UA 3ME7A 2ZCTA 3ME8A 4AJ8A 1GNEA 3KEBA 1SJIA 4KCEA 2V32A 2TRCP 1Y25A 2H1DA 2JZSA 1M9BA 5INYA 4GQCA 1USBA 3IA1A 4F03A 2HSYA 4ID0A 1AW9A 2ZUPA 6GSVA 1YEXA 2VCQA 3KXOA 3APQA 4HU7A 2M72A 2X64A 1ERUA 4EDYA 2KHPA 1WIKA 2YWIA 3DYRA 1LU4A 2GSSA 1B48A 4O5RA 1MTCA 1IYHA 1T4YA 4JEDA 1AQXA 1UVZA 3CYNA 5IMVA 22GSA 4EXJA 4XRAA 1QQ2A 2R4VA 4MF5A 2VCWA 2OACA 5D9VA 4FYUA 2HE3A 3KP8A 1K3OA 5AN1A 3G7JA 2DJ0A 2LRTA 3ZYWA 3KH9A 5ECHB 3TJJA 2GQMA 3W8JA 3A2XA 3G9BA 3IXRA 4BWQA 1TTZA 5IMFA 4YQVA 3GSSA 5LNKe 3QPMA 2YJHA 1F6MC 2C0FA 1A2JA 3FZ4A 5IOXA 5GSTA 3EMXA 4ZL8A 2YWOA 4HEA2 3ZIJA 4KDYA 1Q4JA 1XIYA 4MZCA 1V57A 5CREA 2YCDA 5ECQB 5F07A 1GLQA 2O87A 2CAIA 5DQYA 3KJYA 2VIMA 1XBSA 5CAXA 1AUCA 1GSSA 2WS2A 2BJXA 1M2AA 3RPNA 1M0UA 4IKHA 3TRQA 3EINA 4ILFA 4WXTA 2IPAA 2XC2A 1XZOA 3LYPA 1EGRA 1TRSA 5DAKB 1BX9A 5ENUA 5GAPD 1JZDA 2FD3A 3F63A 4F0CA 2C0GA 3ISOA 4K7NA 5J4UA 20GSA 3LORA 5HR1A 4JZQA 1K0MA 3LG6A 2H73A 2HZFA 1WMJA 3MWHA 3ZZXA 3CBUA 3DGQA 4MABA 3IDVA 2GDRA 1I5GA 4K6XA 2H8LA 4IELA 2VLUA 2YNXA 4HQZA 2YZUA 4QL7A 3HVVA 4BVXA 1XOBA 4XIHA 2CAQA 3WD6A 3FK8A 4L5LA 5DBQA 4FIWA 4WF4A 2FWGA 1O73A 3U6VA 4KA0A 2WJUA 4TR0A 1EP7A 2O89A 5JWRB 3KMNA 2O85A 4POLA 3K8NA 2DIYA 1YF0A 3ERGA 5CRWA 4ECCA 3IR4A 11GSA 3Q6OA 1XOAA 3ERFA 3KTLA 3QAGA 5IM9A 3IAS2 3VK9A 13GSA 1T3BA 3HJOA 5D9TA 3RDWA 2FCHA 4K0GA 3F9UA 2DJ2A 1XCCA 2C3QA 3QOUA 1XVQA 2KOKA 5CRHA 2PGTA 1PN9A 2RUEA 5IPGA 1ZOFA 3LFLA 3D0ZA 4I8BA 3UBLA 2YWMA 3GX8A 3M9JA 5EL8A 1G6WA 1XW5A 3F0IA 3UL3A 3TCOA 3FY7A 5F05A 3QAVA 4PGTA 4NWYA 2LS5A 1FAAA 1YY7A 5JCWA 1XWKA 1UA5A 2YZHA 16GSA 2I1UA 5HFIA 4F82A 4N0VA 3QD9A 4KW6A 4ACSA 1Z6NA 5G1LA 3HYPA 2VO4A 1SKRB 2B5EA 1VRSD 3QR6A 1U6TA 1TJDA 2NTOA 2P0GA 5JCUA 4NHZA 4K7OA 2N5BA 3O76A 3EWLA 5G31A 10GSA 5B8BA 3GRXA 2VAFA 2KP1A 3TRXA 4HUAA 2GZYA 2B7KA 1PL2A 1QGVA 3P7XA 3JCML 1M99A 3TJGA 4TXOB 2EC4A 1SL2B 4RI7A 1ZYQB 5DCGA 3FZAA 3L0HA 19GSA 3F4RA 4MZBA 4F9ZA 1N8JA 2H1AA 5F06A 1MD3A 5DCHA 3GFKA 2HXKA 3F3RA 5ABRA 3BD2A 2F9SA 1Z5YE 2HRFA 1EOHA 5D93A 4V2NA 5KN1A 1JLWA 5GAND 2DC5A 3FR6A 3IPZA 1K0NA 4DSSB 4CHSA 1KBNA 1KNGA 3GIXA 1GRXA 4ZL9A 2A4VA 8GSSA 2GTUA 1A2LA 3GH6A 3IHQA 1Z6MA 4RQXA 1T8EB 3KIJA 4OWYA 3EU3A 2ON5A 3H93A 3APOA 4PURA 2LTKA 5J5NA 4K2DA 4GSSA 4H86A 1GTBA 4TR4A 2FHEA 4G10A 9GSSA 4ZB9A 5IOWA 3I69A 1AC1A 5IMZA 4MZWA 1G7EA 1T7PB 2E0QA 2GLRA 1AQWA 3LQ7A 1RK4A 2VL2C 1X9WB 3ZMLA 2AYTA 1QXHA 4HZ4A 2MBTA 4Q5FA 4IN0A 2H0IA 2E7PA 4K1FA 3LYKA 3UAPA 5B6MA 5KEJA 3IRAA 3LWAA 3CTGA 3A2VA 4MDCA 2C1YA 1ST9A 2B1LA 2FGXA 2H0HA 1LJRA 2B1KA 4IS0A 4ZILA 4Z7XA 2CZ2A 1ERTA 2V6KA 1PRXA 4LMWA 2KUCA 5DALA 4MP4A 1Z7RA 3DVXA 2L57A 3UEMA 5B6NA 4WBRD 2VL2A 5DQSA 1F37A 1S3DA 1FOVA 4ZXGA 2VCTA 3DMLA 3E9JB 2R6KA 3C7MA 3UJ1A 5LD0A 2IL3A 5IPHA 2FWFA 3WGXA 1V40A 2C8UA 2H71A 4BWSA 2CZ3A 3KZQA 2MZCA 3IV4A 3LJRA 1GUMA 4TXOA 2HT9A 4K0NA 3TOTA 4EO3A 3TUEA 3CSIA 1A0FA 4IP1A 1V58A 4ECBA 5ID2B 4EUYA 4KGIA 2OBIA 3UIWA 3EMPA 2QSIA 3HD5A 3ZLPA 2K9FA 1BEDA 4GSTA 3RBTA 2B7JA 2I81A 1FVKA 2PUKC 2XPEA 5IO0A 2GSQA 2VOCA 2VD1A 4I5QA 3GN3A 1SL0B 1X9MB 2IWTA 5HQPA 1SKSB 6GSUA 4HZ2A 3A2WA 5A4VA 4DSSA 2L5OA 3KGKA 3KTBA 4OFMA 1YQ1A 1HNBA 4N11A 2IIYA 3IOSA 1G6YA 2LNSA 4O92A 1B8XA 4PX1A 4MJCA 2DLXA 1EEJA 1M2BA 2AAWA 4GSNA 1B4QA 3KP9A 2C4JA 2AUVA 3C71A 2F8AA 5GZZB 2AB6A 3QDNA 2D2ZA 4KH7A 1O8WA 2XBIA 2XPDA 3VWXA 3VWVA 1TOFA 2CVBA 2PMTA 4ISDA 4NXIA 3F6FA 3NZNA 1WRYA 4MLYA 4IQAA 4V1Ap 4MJAA 4YQUA 3E0UA 1UC7A 3ZFLA 3L78A 4BL7A 3TJBA 1BG5A 3D5JA 1U88A 3VWUA 3LSZA 2GSTA 1SYRA 1F3BA 2LNTA 1AAZA 2JL4A 3DRNA 1TP9A 1EEMA 2H70A 3HKRA 3DEXA 5EPFA 4KNDA 3IAM2 3VPQA 4TRXA 5E59A 2TIRA 2B6MA 2J9HA 5IMDA 3CXGA 3TRPA 5HR0A 2WFCA 3I43A 3UBKA 3W8SA 5JWQB 4XS4A 4GWRA 4ZBBA 1OE7A 2I3YA 4N10A 3TJKA 3D21A 2DJJA 3U5RE 1DE1A 4POKA 3DXBA 2B5XA 1VF2A 5ID2A 4WETA 1TW9A 5CP1A 3F4TA 4MJEA 2PBJA 3R2QA 3BCKA 1XWGA 3F3QA 4WF5A 4JR4A 1JLVA 4HQSA 5COHA 1MDKA 5G2ZA 3KMOA 1U87A 4F0BA 4ML6A 4CW9A 4KCAA 4WR4A 1DSBA 2LQQA 5G5EA 2C3NA 4XRDA 1OC8A 1VF1A 2HZEB 1Z9HA 1CQHA 3GKKA 2VD0A 2LEGA 1BQ7A 5HR3A 3I6AA 1ABAA 4MPGA 4PXOA 4Q5NA 2WB9A 3ZVJA 1OKDA 4HDEA 1F9MA 4P3YB 4L5OA 1Y6EA 3FRCA 2C0DA 2F8FA 3VLNA 1IYIA 3MAKA 1HNCA 3LXZA 2C3TA 1V9WA 1NM3A 2YP6A 2CT6A 2FLSA 1X5CA 3P90A 2CA8A 5D9XA 4ECIA 2FWHA 1YKCA 2H74A 3IK7A 4LL4B 2V1MA 4NMUA 18GSA 1NSWA 1GTUA 4DEJA 4LLRA 2JU5A 3M0FA 5D73A 1DE2A 1O6JA 2H6XA 3H4KA 2H66A 2FNOA 4NV2A 1LBKA 1SJZA 17GSA 2OE3A 2P5QA 2GQLA 3LGCA 3KM6A 1PQNA 5J9CA 3UMAA 3G7YA 4EVMA 1GP1A 4X43A 5CYYA 3F8UA 2M80A 3M1GA 2JZTA 3ZITA 3I9V2 2ES7A 1JZOA 2H6YA 2RM6A 1XFLA 4PNFA 1SK0A 3D6IA 2ON7A 1FO5A 2JSYA 4LMVA 5DDLA 3D22A 5G30A 1G0TA 5A4UA 1XPVA 1PKZA 4I6XA 3BJ5A 1KTEA 1TRUA 3ZRDA 2IFQB 2B5YA 4RI6A 5CNWA 1BAYA 4MF6A 2H1GA 4O7HA 3CSJA 3FZ5A 1J08A 4RQRA 2L59A 1GSDA 2FA4A 2X8GA 2KLXA 3FKFA 3HVXA 2HZEA 4JR6A 5FHIA 3ED3A 1JHBA 2N5FA 2L4QA 2DJ3A 1A8YA 4MH3A 4KX4A 4TR1B 2NVLA 3DIEA 1BYEA 5KN2A 2DMMA 5ECIB 4IJ3A 1K0OA 5J3RA 2WRTA 4IVFA 4MA9A 5DAKA 2H75A 2VL3A 2H0GA 1O7UA 4CDOA 4IP6A 3TOUA 2DSAA 5KN0A 1E2YA 3HDCA 4IHUA 2DIZA 2YWNA 2L4CA 1F2EA 3UARA 4I2TA 2FUG2 4KSMA 3M8NA 1PGTA 1HQOA 5JWOB 5LCZA 1I9DA 1WOUA 5D9WA 5FWGA 4ZL7A 2K18A 1M2DA 2YN1A 2H72A 1XW6A 3GSTA 2I4AA 2ZNMA 2K8SA 3H1NA 3IK9A 1CQGA 1GTAA 1R5AA 1PX6A 3HVSA 4PNGA 5IQYA 1EZKA 3C73A 2LQOA 1QFNA 1PKWA 2EIQA 3LXTA 3WYWA 1TI1A 5AIVA 4PUFC 7GSSA 1Q98A 1ZCPA 5B8AA 4ZBAA 2WDUA 1RW1A 1X9SB 1R4WA 3RHBA 5HFGA 3O6TA 4KUNA 2WULA 3PINA 5AIXA 1H75A 5CRGA 3TDGA 2Z9SA 2F51A 2LUSA 4DSQA 3Q19A 2GQKA 1ERVA 4OMVA 1GSYA 3AY8A 3UVHA 1GULA 6GSXA 2IFQA 3O3TA 4POBA 1TU7A 1K3LA 3GHAA 4J2FA 3M3MA 5H5QA 2O8VB 2G0FA 1O85A 2DJKA 2PU9C 1U3IA 3F4SA 3WT2A 1TXXA 2JZRA 4WKWA 2YOIA 4PUAA 4TR1A 1NW2A 4NAXA 2K8VA 2LRNA 1K0DA 1SYXA 2MBSA 3DVWA 1M9AA 2TRXA 3GH9A 1GNWA 1SENA 4WBJA 1UN2A 4HU9A 2EIOA 1XW9A 1V98A 1THXA 4E8HA 4ML1A 1FB6A 2VLTA 1R7HA 2H30A 5H5SA 1URMA 4N30A 3FR3A 5DJLA 2H76A 1S3AA 4ULXA 3PH9A 1SK1A 3VPTA 2VM2A 3DWVA 1GLPA 3BBYA 3ZL5A 2LV3A 4HJMA 4GXZA 4ZB8A 1F3AA 2PERA 5CRDA 2F3MA 2HYXA 4POMA 1HYUA 3US3A 2BTOT 3VURA 3ZVJD 4YAVA 3VI7A 2G2QA 2VCVA 1E6BA 2IMIA 2E2GA 1O81A 2LRCA 4V1Ag 4GQFA 1T4ZA 4GCIA 4TW5A 1A0RP 2DJ1A 1K3YA 1N2AA 5C04A 3V1WA 4AJ7A 4L0WA 1SJ6A 3HZ4A 4OCEA 3IE3A 4AJ6A 1TRWA 5D96A 3GKNA 2CQ9A 2XHFA 1FG4A 2LJKA 4EDZA 5EY6A 1MDIA 5J41A 4GF0A 2GS3A 4TR3A 4BPYA 4IBPA 3WGDA 1H4OA 5IMAA 2YPMA 2IJYA 4LL1B 4PQIA 4HOJA 1T00A 1TKDB 4PQ1A 4I2UA 2DMLA 2C80A 1AXDA 4G19A 2PVQA 2RM5A 1GUKA 3BOAA 4BA7A 2K6VA 5ECNB 2GZZA 4YH2A 2GZPA 4J56E 1DUGA 1VF3A 1J0FA 5B7CA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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