2BMXA

Mycobacterium tuberculosis ahpc
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
169
structure length
169
Chain Sequence
PLLTIGDQFPAYQLTALIGGDLSKVDAKQPGDYFTTITSDEHPGKWRVVFFWPKDFTFVCPTEIAAFSKLNDEFEDRDAQILGVSIDSEFAHFQWRAQHNDLKTLPFPMLSDIKRELSQAAGVLNADGVADRVTFIVDPNNEIQFVSATAGSVGRNVDEVLRVLDALQS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure and Mechanism of the Alkyl Hydroperoxidase Ahpc, a Key Element of the Mycobacterium Tuberculosis Defense System Against Oxidative Stress.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis
molecule keywords ALKYL HYDROPEROXIDASE C
total genus 46
structure length 169
sequence length 169
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2005-03-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2bmxA00
4QL7A 3QAVA 3LYKA 14GSA 1CQHA 4ZL8A 1PMTA 4AGSA 4RUVA 1SL1B 1SD9A 1Z5YE 1OYJA 1G0TA 1AXDA 2F3MA 2E7PA 4KA0A 4PNFA 4AJ7A 3FZ5A 3UOMA 4K7IA 1BX9A 5B6MA 3LXTA 5FWGA 2CVBA 4L5OA 2YWIA 5CREA 3N5OA 3ME7A 1PKZA 4ML6A 3L0HA 3KP8A 2VD0A 2EIQA 3QOUA 1DE1A 4ZIJA 1S3DA 5F06A 3EC3A 4MH3A 2DIYA 5KN0A 1LU4A 2QKEA 5GAPD 4JU5A 1SD8A 3APSA 3F4SA 4EC0A 9GSSA 1F2EA 2TRCP 4K6XA 3SBCA 2RIIA 3U6VA 3GSSA 2FWGA 2VAFA 17GSA 2HLSA 1EOHA 3C7MA 2EC4A 3LG6A 1T1VA 1YDKA 2H72A 1VF4A 2YJ7A 4CHSA 5EVOA 1AQWA 5DDLA 4O32A 1PL2A 4POBA 3GNJA 5D9VA 3KTLA 3RAZA 1GL8A 3GH9A 4N11A 1O7UA 1GLQA 2VCWA 1UC7A 4ZILA 19GSA 3ZIJA 4WBRD 4DSRA 1A0FA 4Q5QA 3KD0A 1SKWB 4GXZA 2F8FA 3DIEA 3ZLPA 5G1LA 4MMMA 3H79A 3HVXA 2R5GA 3APQA 3TOTA 1VF3A 1XWGA 5CRGA 3ZTLA 1OC3A 1FVKA 2HRNA 5G1KA 5KN3A 1MD4A 2FUG2 2L5OA 1YJ6A 1XW6A 3GH6A 1Z7PA 1NHOA 4L0UA 3QAGA 5ECKB 4EKZA 3ZRDA 4ID0A 2B7KA 3RDWA 3GX8A 2R37A 1ZGNA 1EOGA 1SENA 1TRWA 5CRHA 2JSZA 3D6IA 3GKKA 1SK0A 2OADA 1AAZA 1J08A 4GQFA 2H8LA 1THXA 3CMIA 2LQQA 2VO4A 4N10A 3Q19A 4ILFA 1GULA 2TIRA 4H86A 4XRAA 5AGYA 5FT3A 3D5JA 1R7HA 4PQIA 1QGVA 2H66A 1NSWA 3O3TA 2P0GA 3TGZA 2YWMA 5DCGA 2GGTA 4OD7A 1SL0B 1XBSA 4X0XA 4TXOA 2DSAA 4L0WA 5H5RA 4IELA 2H70A 4HDEA 1Y25A 3VWWA 3KZQA 5ECMB 1C72A 4ACSA 4ISDA 1SJIA 4GCIA 3FZ4A 4IS0A 5G2ZA 4HQZA 5ELGA 4OCEA 4RI7A 5HR3A 2WB9A 4HJ2A 2OKAA 5CO3A 3TRXA 1H75A 3NIVA 2R4VA 1KEBA 1XVWA 1UA5A 1OKTA 2V6KA 1K0DA 3IK9A 1G6YA 1YY7A 4DVCA 2GT5A 1XZOA 2WJUA 1A8LA 1V57A 2YJHA 3F4TA 5EPFA 1Y6EA 3AY8A 4O5RA 1SJ6A 4ECCA 4TR3A 2QSIA 4JR6A 3KM6A 3IBHA 4ZBDA 3N9JA 3TJJA 5ID2A 4IHUA 2FCHA 4MABA 2H1GA 5F0GA 4LA1A 4IVFA 2YP6A 1OC8A 1X5DA 3HXSA 3RPPA 2JL4A 1OKDA 4EXJA 3M9KA 5G5EA 3ZL5A 4ZBAA 1ML6A 3F6FA 1GTAA 4KNDA 3H8QA 5DALB 3Q74A 3UMAA 5IOWA 2VIMA 4K9ZA 2O85A 4JRRA 5ECPB 2LSTA 3ZREA 4YH2A 5J9BA 1WWJA 13GSA 2ZUPA 1O8XA 1B4QA 2DBCA 3HKRA 2MBSA 1T00A 3BJ5A 2DJ2A 2V1MA 2HYXA 2B5EA 2E2MA 2AV4A 2R2JA 2JADA 4MA9A 1K3OA 3EU3A 2H6YA 4ECJA 1ILOA 2PBJA 2L6CA 1XCCA 1BEDA 1B9YC 1GTUA 4X1UA 2YZHA 1JLVA 5HQPA 1BQ7A 2YZUA 3D21A 2HZEA 4MF5A 1T4ZA 4MZCA 2H0HA 3WGDA 3LWAA 2KP2A 1O81A 2IN3A 2HSYA 1LJRA 3TOUA 1ZCPA 4OWYA 1DSBA 4ZXGA 2RLIA 5IIZA 3IR4A 3ERWA 5LCZA 2IFQA 3EURA 5DJMA 4XS6A 1ACVA 1G7EA 5F05A 1WJKA 1GWCA 2LQOA 1YKAA 2VLUA 2C0EA 3LYPA 5ECHB 1TKDB 1CQGA 2MMNA 5F8BA 3VPTA 1U3IA 1AW9A 2C80A 4I97A 2LKUA 1M99A 3O76A 4YQMA 1J0FA 5DJLA 2ON5A 3ZIVA 3GL5A 4L8EA 1AC1A 1JZOA 5H5QA 3HD5A 1ERWA 3UBLA 2O89A 3DKSA 5IMZA 6GSYA 2VL9A 4PQHA 1TW9A 1FVJA 2IMFA 1YEXA 1N2AA 4HQSA 3GTUA 1SKSB 3KGKA 2CA8A 3LXZA 2FY6A 1QXHA 3G7JA 3J7Yk 2X99A 2VUPA 5F07A 4OFMA 4YQVA 1J9BA 2GSTA 4KDUA 12GSA 1SYXA 3GX0A 4QQ7A 1DBYA 5DQSA 1FG4A 3BOAA 3LSZA 1MDJA 5E4WA 1MDKA 2MZCA 3D4TA 4KUNA 3K8NA 5AIVA 1K0OA 3QD9A 4KE3A 1QMVA 3HY2A 3H1NA 2K8VA 2B1KA 1GSSA 2AHEA 4TR1B 3U5RE 3ZITA 2RUEA 1PQNA 5ECOB 3GKNA 4K8MA 4Q5FA 1K0CA 1A2MA 4E8HA 3ZYWA 3JCML 2AUVA 2K6VA 4PXOA 4KSOA 3UEMA 3IRAA 1KBNA 1GSEA 3MWHA 2C3QA 3F9UA 5GSTA 1X9MB 4MK3A 3IAM2 4K0NA 3QMXA 1WOUA 1T3BA 1FOVA 2B1LA 1WMJA 1A24A 4K2DA 4ZL7A 4LL4B 4MZBA 1TU7A 2DMLA 2V6OA 2WRTA 1VGLA 3KXOA 3IXRA 1TJDA 2C3TA 3FZ9A 1NHYA 1HNBA 3GUSA 3ZMKA 4FO5A 2KHPA 4HS1A 1ST9A 3Q6OA 3L4NA 2J9HA 3UAPA 1K3YA 2X64A 2B5XA 4PURA 1QUWA 5KEJA 4D73B 1ON4A 2DC5A 3LFLA 1U87A 2LRTA 2AYTA 1MEKA 1K0AA 5GAND 3W6GA 4G2EA 3CSHA 3TUEA 2YANA 4IJIA 1HNAA 3ME8A 1GSYA 1MD3A 1URMA 4MPFA 2REMA 3KMOA 2H6ZA 3EU4A 1S3CA 1E6BA 2I3YA 1GNEA 1HD2A 4TRXA 3IAS2 1JZDA 2VL2A 2I9HA 2DJJA 5A4WA 1SK2A 3UIWA 2H71A 4GLTA 1G7OA 2DJ3A 3RBTA 2N5BA 2ZCTA 2PMTA 10GSA 2JZSA 2M46A 4KAEA 1TI3A 1ZMAA 5EY6A 1TI1A 2MMOA 3KEBA 3NZNA 2GZZA 2VD1A 2M80A 1GH2A 3MNGA 3C71A 2JU5A 3CSIA 4HZ2A 4XS4B 2GQMA 5IMDA 2VL3A 3P2AA 4POLA 1PRXA 3W8SA 5JWQB 3TJBA 1U6TA 3HZ4A 5IPGA 5E59A 1WP0A 3FW2A 3NOFA 3W8JA 3KMNA 1KTEA 4JZQA 1R4WA 1KNGA 1E2YA 5IMCA 2VOCA 4N0VA 2PERA 4GRFA 2HFDA 2ALBA 1GP1A 3P7XA 2C0FA 3VK9A 4GWRA 4TOPA 4Q5NA 4HI7A 3D22A 4AJ8A 3GIXA 5ECRB 1XPVA 4HJMA 1YEPA 4Z7XA 5JWRB 3F6DA 4TN8A 3ZFLA 2H73A 2JZRA 1I9DA 3TDGA 4FIWA 3KH7A 1XIYA 3CRUA 2YNXA 3IV4A 1GTBA 4V1Ap 2CAIA 3WT2A 1TRVA 5FHIA 4CW9A 3M1GA 3APOA 2WCIA 2GZYA 2OBKA 5INYA 4TW5A 2XPEA 5B7CA 4MJAA 2GSRA 4ZBBA 4IN0A 4MP4A 3DYRA 4TXVA 1T7PB 3KTBA 3TJKA 3G7YA 5D93A 2FNOA 1GLPA 4OMVA 1GTIA 3G9BA 4BVYA 2XBIA 1SK1A 4MCUA 4I2UA 3QFAC 5AISA 3QDNA 1FAAA 1V40A 4ZB6A 3EYTA 6GSWA 4PGTA 3VFIA 5C00A 2ES7A 3LORA 4RQXA 4I5QA 20GSA 3BBYA 2WZ9A 3M8NA 1V9WA 1SKRB 4BWQA 4IQAA 3V1WA 2O7KA 2GVPA 4G10A 4F0CA 2CX4A 2LJRA 5IM9A 1IYHA 5DALA 5CAXA 2ZNMA 5LNKe 2VCZA 3PR8A 1PX7A 2F9SA 2BTOT 3CXGA 2JSYA 2LNTA 4KX4A 3P90A 2OJLA 1Z3EA 4PQ1A 1AIUA 4KH7A 1F6MC 1PX6A 2H30A 2XHFA 1GSFA 4ULXA 4FYUA 5ECSA 2D2ZA 2V41A 3HJOA 2GT6A 2EIOA 5LD0A 2IWTA 1B4PA 2OE3A 2P5QA 1XW5A 1XOAA 3LJRA 2ON7A 1TK8B 1TK5B 2NTOA 5IPHA 2V2GA 1GNWA 3IOSA 3QFBC 1HNCA 4KSMA 1X5EA 1K0BA 5J9CA 5ECQB 2L59A 4TXOB 4PUAA 4NAXA 2L4QA 2P5RA 1BYEA 5COHA 1YZXA 2CVKA 2C4JA 3TKSA 3ERGA 1A23A 2L57A 2FD3A 3VURA 2PU9C 3LGCA 5A4UA 3KCMA 4LMWA 4EVMA 1A2JA 2J23A 1FB0A 3PH9A 3E0UA 4FYBA 1I5GA 1G6WA 3IHQA 4POMA 3CSJA 5G5FA 1OC9B 5J3RA 2PPTA 3VI7A 1ERUA 3UVHA 4IJ3A 2VM1A 4MF6A 2FHEA 2OE0A 1M9AA 2YPMA 2AB6A 5D9WA 4I2TA 2C0DA 3KP9A 4O92A 1AUCA 4WETA 3BD2A 4RQRA 1ZZYA 3CRTA 2C1YA 3F63A 3UVTA 1WPIA 3HZ8A 5HR0A 5C04A 3L9SA 2B7JA 4BVXA 2C3NA 3DMLA 4HZ4A 3DVXA 1NW2A 5DAKB 2PUKC 2X8GA 4J56E 1MTCA 1M2DA 3C73A 1Z6MA 3EINA 4X43A 1XWKA 5IOXA 1OE8A 1B9XC 2AJQB 2L6DA 3DGQA 4KDXA 1BAYA 3OR5A 2KUCA 2YCDA 1JLWA 1IYIA 3FRCA 3UARA 3S9FA 4TR1A 2WULA 3HCZA 4KCEA 4MJCA 5IO2A 4MJEA 1TRUA 4GQCA 2H19A 4XHMA 4AF2A 3TRQA 1TOFA 4BPYA 1OE7A 1PL1A 5KN1A 7GSSA 2JZTA 1UN2A 3J7Yb 4KW6A 5J4UA 1X9WB 2WDUA 2YV9A 4F03A 3DWVA 2CX3A 3VLNA 2CAQA 1V2AA 4K7NA 1QQ2A 4EDZA 1RK4A 2H0IA 1R26A 1B48A 2E0QA 1V98A 2IFQB 1GSQA 3GURA 2GZPA 3DD3A 4GF0A 3A3TA 3I6AA 2IJYA 2BMXA 3EMPA 2V32A 2F51A 1EEJA 3E9JB 1BG5A 1ABAA 3VPQA 1RW1A 4I8BA 2FGXA 5D96A 5EL8A 4D73A 5JWOB 1TRSA 3IK7A 5DQYA 2L5LA 2K18A 1Q4JA 4WR5A 3BCIA 1ZL9A 4GTUA 3GHAA 1EP8A 3GA4A 2DJ1A 1QK8A 1X5CA 4EUYA 1TP9A 4V2MA 3HA9A 1VF2A 2VL2C 1XFLA 3GYKA 1NM3A 2B6MA 3F3QA 5D73A 1JHBA 1F37A 3QPMA 4CDOA 5ECNB 1F9MA 5GSSA 4XIHA 4PNGA 2GLRA 2C8UA 4GSNA 5IMFA 2GS3A 4I6XA 2CT6A 3FR3A 4XS4A 4J2FA 2VM2A 11GSA 2H6XA 3HJMA 4IGJA 3A2VA 3FR9A 2A2SA 2C0GA 4WEYA 1MDIA 1AQVA 3P8WA 4IP1A 1V58A 1GUKA 4DSSB 2VLTA 4XS1A 4XCSA 2I81A 1ZYQB 1YF1A 5HFIA 1JZRA 5A5KA 1T8EB 1TXXA 2O87A 4OCFA 4K1FA 2LEGA 4WF4A 1SL2B 4V2LA 2XBQA 2FWHA 2FA8A 3E3EA 4N0ZA 1UVZA 4DSQA 4ECBA 5DBQA 1R5AA 1PGTA 3Q18A 3ERFA 5H5SA 4FH8A 4KCAA 5JCUA 1TTZA 2LJAA 5JCWA 5CRWA 2NBSA 1W4VA 1XXUA 5CNWA 1EP7A 1M7TA 3FYGA 5CRDA 1OVNA 1Z9HA 4GSSA 1M2BA 5IQYA 4TKYA 4ZL9A 6GSUA 3F0IA 3SWLA 1XWCA 3RHCA 2H75A 4NWYA 2IMIA 3M3MA 3LQ7A 1VRSD 4BL7A 3US3A 3RPNA 1ERVA 1GUMA 5KN2A 2H1DA 2LUSA 3EVIA 3CBUA 2VCQA 3WT1A 3I43A 2PVQA 2YN1A 3I69A 3FR6A 5HR2A 1EZKA 2YWNA 2XC2A 2GSSA 1PN9A 5AN1A 2B3SA 5J41A 4JR4A 3O6TA 4F82A 2HRFA 2Z9SA 3GFKA 4L5LA 2BJXA 3M0FA 3L78A 5D8IA 4KGIA 2HE3A 5GZZB 1K3LA 2MYGA 1FW1A 4OO5A 2XPDA 4IQ1A 5AIXA 4EL1A 3L9UA 4NHZA 5ECIB 5B8BA 2IMEA 1XW9A 5IMVA 2K8SA 2MMZA 2CV4A 2H1AA 3KJYA 2HNLA 2IMDA 6GSSA 16GSA 2FA4A 2FLSA 3VWUA 4F2IA 4IKHA 3IDVA 2OA7A 2HT9A 4POKA 4HEA2 4OFTA 2DLXA 3MAKA 1XOBA 2LS5A 18GSA 4F9ZA 3G7IA 1F3AA 4Q5RA 5DCHA 1SYRA 4BA7A 2VLVA 1EGRA 2RUFA 2DIZA 2HXKA 4MPGA 2IL3A 5IO0A 3MDKA 3HHVA 2MMAA 2L4CA 1N8JA 2HI7A 2CZ3A 3DXBA 4MF7A 1EV4A 4WR4A 4IP6A 4JBBA 1X0RA 1Z7RA 4GSTA 4O7HA 1X9SB 3C1SA 2I4AA 1QFNA 3IE3A 1GSDA 1AQXA 2FWFA 5G30A 2QGVA 1DUGA 3WGEA 1ERTA 3VWXA 3UJ1A 3GRXA 3HVSA 3TKSC 1LBKA 4NV5A 4PX1A 1USBA 3WD6A 1A0RP 3F8UA 3FHKA 3FEUA 2DJ0A 3VI5A 5HR1A 2DMMA 2WS2A 3F4RA 1OC9A 4WF5A 1WIKA 3GL3A 4AJ6A 4OFNA 1ZOFA 1RQMA 4KDYA 4G19A 3TRPA 2DJKA 4LMVA 3GN3A 4P3YB 2IPAA 1HYUA 2RM5A 2G2QA 3QCPA 1K0MA 4WBJA 3TB2A 2GSQA 1HQOA 3TKQA 5ENUA 3TKSE 4NHWA 6GSTA 1M9BA 1PKWA 1GRXA 1PA3A 6GSXA 1YQ1A 5A4VA 1O73A 4HOJA 2R3XA 5DAKA 1Q98A 2HZFA 3GKXA 5HFKA 5CP1A 4LL1B 3FKFA 4NXIA 4JEDA 1R5PA 4EE0A 1EV9A 4WXTA 3WYWA 2CZ2A 22GSA 4XRDA 2E2GA 2P31A 4EF0A 3ZVJA 1FO5A 2LRNA 3ZMLA 2YV7A 4LLRA 2RM6A 4MLYA 2X8HA 4NV2A 1XVQA 4FYCA 5ID2B 2WFCA 1WE0A 2A2RA 1PD21 1U3AA 2GTUA 2OE1A 4QL9A 4ML1A 2LV3A 3DEXA 2H0GA 2F8AA 2O8VB 5DVBA 1TK0B 1XWAA 4V1Ag 1TDIA 3H93A 5IMAA 1M2AA 2NDOA 4ZB9A 3TJFA 3VWVA 2PWJA 5D9TA 4E8EA 2AAWA 4HUAA 3IA1A 2LTKA 1H4OA 4KB3A 3A2XA 2PVOC 4HU9A 2IIYA 3EWLA 2FWEA 1EEMA 1ZYEA 1THOA 3HYPA 3EE2A 3CTFA 5ELAA 3I9V2 1EGOA 1XWBA 1FHEA 3UL3A 3PGTA 4RI6A 3HJPA 2CVDA 3IC4A 1YKCA 5ECLB 5ABRA 3ED3A 2EIRA 5L71A 2LNSA 1JFUA 2NPBA 1A2LA 2HZEB 1M0UA 2TRXA 4ZB8A 4NMUA 2A4VA 5B8AA 3F3RA 3TKRA 1GUHA 2N5FA 1SJZA 2KOKA 4V2NA 4BWSA 3TJGA 3HVVA 2PN8A 4YAVA 2M72A 2H76A 3A2WA 3DVWA 3GV1A 1JZWA 2H74A 3BCKA 3DRNA 4ECIA 4TVEA 2H01A 4JE1A 2R6KA 3KIJA 3KH9A 2GQKA 1GSUA 4IBPA 3GKMA 1SU9A 1Z6NA 2VCTA 5HFGA 2LRCA 2WGRA 1DE2A 3D0ZA 4YQUA 4HU7A 3LEFA 3A5WA 2OACA 2QC7A 1F3BA 2HSHA 2PGTA 5CYYA 3TCOA 1S3AA 2G0FA 3MSZA 1O85A 3ZZXA 2KLXA 3C1RA 4K7OA 6GSVA 1TU8A 3FY7A 4TR4A 4MZWA 2B5YA 4TR0A 3H4KA 3UBKA 1W89A 1B8XA 2KP1A 2K9FA 3FK8A 2VCVA 3GTUB 4NPBA 1OAZA 1PSQA 5D9XA 3TKPA 2YWOA 4OO4A 4J57E 4DSSA 5G31A 2H1BA 3ZVJD 3L9VA 3GMFA 2JACA 4DEJA 3QAWA 3D4MA 4N30A 4F0BA 3M9JA 2GDRA 1A8YA 3RHBA 5B6NA 4WKWA 1YF0A 4EDYA 3HDCA 4IW9A 1WRYA 1EWXA 3R2QA 1O6JA 3IPZA 1BJXA 3FZAA 3ZFBA 4EO3A 3QR6A 2NVLA 2LJKA 4MDCA 2YOIA 4MH2A 2CQ9A 1T4YA 2X8CA 8GSSA 1FB6A 5J5NA 1VF1A 3ISOA 3CTGA 2OBIA 4XTSA 2IMKA 2MBTA 2N5AA 3GSTA 3WGXA 1O8WA 2GQLA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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