2C0DA

Structure of the mitochondrial 2-cys peroxiredoxin from plasmodium falciparum
Total Genus 54
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
54
sequence length
168
structure length
168
Chain Sequence
LVTKKAYNFTAQGLNKNNEIINVDLSSFIGQKYCCLLFYPLNYTFVCPTEIIEFNKHIKDFENKNVELLGISVDSVYSHLAWKNMPIEKGGIGNVEFTLVSDINKDISKNYNVLYDNSFALRGLFIIDKNGCVRHQTVNDLPIGRNVQEVLRTIDSIIHVDTSGEVCP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords THIOREDOXIN PEROXIDASE 2
publication title Structural and Biochemical Characterisation of a Mitochondrial Peroxiredoxin from Plasmodium Falciparum
pubmed doi rcsb
source organism Plasmodium falciparum
total genus 54
structure length 168
sequence length 168
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.7: Peroxidase.
pdb deposition date 2005-09-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2c0dA00
3ZFBA 4EKZA 2GSQA 3GUSA 5JWOB 1K0CA 1YDKA 1MDJA 4K8MA 1YF0A 3UJ1A 1SD8A 4YAPA 3QFAC 5JWQB 3TOTA 1URMA 1XW6A 4TR3A 5COHA 4IELA 3QFBC 1XWBA 3ZFLA 3VWXA 1ST9A 2LRNA 3F9UA 1E6BA 1R26A 4ILFA 2MMAA 3U6VA 2VD1A 4MDCA 22GSA 1Z7RA 4GWRA 4Q5FA 2J23A 1I5GA 2KP1A 1OYJA 3FZ5A 1SJIA 4FYUA 1Z6NA 4RI6A 1MDIA 1PRXA 4XS4A 3QD9A 4L8EA 4JZQA 5GAPD 2OADA 4I2UA 3QAGA 3CSHA 3KTLA 2DJ0A 1HD2A 1WRYA 2JZSA 1X0RA 2EIOA 4KE3A 2FCHA 14GSA 4O5RA 3F8UA 5HR3A 3HVSA 4KA0A 3IK9A 3L9UA 5CRHA 5A5KA 2ON7A 2Z9SA 2IMDA 4LMWA 4PURA 2MMOA 3ERGA 4LL4B 4POBA 5HR2A 2P5RA 5JCWA 1K3YA 2H72A 3FW2A 1THXA 3BCKA 5FWGA 2V6KA 3Q6OA 4V1Ap 4MF7A 2LUSA 3RHCA 3TKPA 1S3CA 4JU5A 2LS5A 2X8CA 3ED3A 2NBSA 3K8NA 4K0NA 1JZOA 3DKSA 4N30A 3GH9A 2H1GA 1JZWA 1O8WA 2C0DA 2QSIA 4K7OA 4FYBA 2YP6A 2M80A 5AGYA 3TGZA 5ID2B 2OBKA 2K18A 4ZBBA 3FZ9A 5GSSA 4I2TA 4K6XA 1Z6MA 2GVPA 1M7TA 2GZPA 2VCWA 2KP2A 3D4TA 3HXSA 2LSTA 3IBHA 1VF2A 1VF1A 2R3XA 2LEGA 1BQ7A 3CMIA 1K3OA 1J0FA 2OACA 1PSQA 5G5EA 4QL7A 5D8IA 3ISOA 2YZUA 3TKSE 2H0IA 2YN1A 2RIIA 3F3QA 2I3YA 3LQ7A 1V98A 2PGTA 5D9WA 2ZCTA 5J4UA 4RUVA 2JL4A 5DQYA 1YKCA 1F3AA 2F8FA 3ZZXA 5D9VA 1SK1A 4TR1A 1Q4JA 1OE8A 1TRSA 2DSAA 4ID0A 3WT1A 1H4OA 4F9ZA 1U6TA 3WT2A 4IHUA 1XOBA 4PXOA 1OC3A 1W89A 1PMTA 1A0FA 5IMCA 1SD9A 3TJKA 1MD3A 2IPAA 4MZCA 3IXRA 3CTGA 4PUAA 4WKWA 4NPBA 3LXTA 2DJ2A 4IQ1A 2REMA 2KHPA 5IMFA 5IMVA 5CO3A 2YWMA 3TOUA 3TKRA 1A0RP 5AIVA 5CRGA 1JFUA 1WWJA 2O8VB 4PNGA 4QQ7A 4CW9A 1AIUA 1DUGA 1TI1A 4F82A 1XW9A 3FY7A 1T3BA 5L71A 3ZVJD 13GSA 3C73A 1FW1A 2G2QA 1LBKA 4X43A 3KCMA 2DLXA 3EU4A 4GSNA 1X5EA 4KX4A 2O89A 3G7YA 1TTZA 1G6WA 3FZ4A 1EV4A 2MBSA 2QKEA 1NHYA 1PD21 1WP0A 2B1KA 4DEJA 3E9JB 3A2WA 3LEFA 4HQZA 2NDOA 5CREA 3VI7A 2CZ2A 1XWAA 2I4AA 2DJJA 3L4NA 2DIZA 2GQLA 6GSYA 2IMKA 3C1SA 4IS0A 4TVEA 1K0OA 2CZ3A 1TKDB 2LQOA 1DE2A 2C80A 4HI7A 3HD5A 1AC1A 2AHEA 4MF6A 4OCEA 4PUFC 3C8EA 1T00A 2PUKC 2NVLA 3EMPA 1ILOA 1G6YA 2H1BA 4IP6A 1TI3A 2IFQB 2QGVA 3HCZA 4NAXA 1NM3A 3C7MA 3ZIVA 2FWFA 2QC7A 4HJMA 3SBCA 3CBUA 3DWVA 1M2DA 1RK4A 1HNAA 1PA3A 4E8EA 6GSSA 2VCZA 2F8AA 1T4ZA 3C1RA 3F4RA 3TKSC 2FWGA 2YWOA 3FR6A 12GSA 1K3LA 3RBTA 1XVWA 5JCUA 1GSQA 5AISA 4ZILA 1EP7A 5B8BA 4OO4A 3LJRA 5J41A 3GTUB 5IOXA 1NW2A 5IQYA 3GIXA 1UA5A 3D22A 5ECRB 5AIXA 4OFNA 1MTCA 3MSZA 3I9V2 4GF0A 1WOUA 4J56E 2OE3A 1A2LA 3VWWA 1MDKA 2J9HA 3DEXA 4YQUA 3HJOA 2GS3A 4POKA 2VCTA 1T1VA 2E2GA 3HVXA 3QDNA 3UAPA 3NOFA 1Z3EA 3D0ZA 1FB6A 2DJ1A 3GV1A 1OC9B 4EE0A 1QK8A 2GLRA 5ECKB 5DALB 2OBIA 4KDXA 2BTOT 2FGXA 4IN0A 1EEMA 3GX0A 4BA7A 4P3YB 4JR6A 4MK3A 4GSSA 1K0BA 2HRFA 5GSTA 2VM1A 4JE1A 1OKDA 1UN2A 4EC0A 2VUPA 5ENUA 2DJKA 1BYEA 1GH2A 2PMTA 1TDIA 2GSTA 3LGCA 2YJHA 4ZIJA 3FZAA 5INYA 1ACVA 2IWTA 2I1UA 1IYHA 1H75A 1TP9A 2PWJA 3DXBA 2WB9A 4XS6A 3ERFA 3IK7A 1VF3A 2V41A 4IVFA 3VI5A 5F06A 2F9SA 2YNXA 4ZBAA 1SKRB 3GKXA 3H4KA 1G7EA 3PGTA 1OC9A 5ECIB 2B5YA 6GSWA 1ON4A 4X0XA 5DALA 2RLIA 4MZWA 3KD0A 1SL0B 2EC4A 3VPQA 20GSA 4CHSA 2LNTA 3BD2A 1XFLA 1FAAA 2XBIA 4RQXA 4AGSA 2IMIA 4NWYA 1Y25A 1Q98A 1V40A 3TUEA 2VCXA 4HU9A 4KW6A 3QOUA 5IPGA 2MMZA 4K0GA 5ECQB 2VLTA 2VLVA 1WE0A 3O76A 2L59A 3HVVA 4MZBA 2H0GA 2VO4A 2R6KA 3GL5A 2H6XA 3Q74A 3KEBA 4ZXGA 5ABRA 4NV2A 2FLSA 1PKZA 6GSUA 3DD3A 3IDVA 2VM2A 3DIEA 4K7NA 4RI7A 4CDOA 4IW9A 2L57A 2V2GA 3F6DA 1XZOA 1NHOA 5FHIA 2BJXA 1B4PA 1YJ6A 5DJLA 4OWYA 3BJ5A 1CQGA 4WBRD 1EZKA 3UMAA 3EC3A 2JU5A 2DMLA 3QPMA 1F9MA 3M9KA 4ML1A 4I6XA 3ZMKA 4E8HA 2ES7A 2GQMA 3W6GA 5CRDA 3LYKA 3KXOA 2H6YA 3ZMLA 1GSDA 1FVJA 2HZEA 4KGIA 3H1NA 1TU7A 2IIYA 4OO5A 3IV4A 4EUYA 2MYGA 7GSSA 4FYCA 3KP8A 3F4TA 2LJRA 2CX4A 2RM5A 2VCQA 4MA9A 2C1YA 4TKYA 2A2RA 2TRXA 4FIWA 1U87A 3OR5A 2H73A 4PQHA 1M0UA 1EWXA 2TIRA 2HSHA 3GN3A 1ZYEA 3J7Yb 3J7Yk 3I6AA 3CYNA 1SJ6A 3DVWA 1GLQA 1TK0B 3CRTA 1OE7A 1ML6A 3C71A 5J5NA 3UBLA 4AF2A 1TW9A 3LORA 4F2IA 3EINA 3I43A 2HRNA 5DBQA 4BPYA 3W8JA 3MNGA 3GYKA 4XHMA 10GSA 3VURA 2IJYA 3HYPA 1EV9A 4NMUA 3UARA 3UL3A 1XCCA 4HU7A 4KH7A 4J57E 2P5QA 5F07A 3D5JA 2OE1A 5B7CA 2EIRA 4X1UA 4K9ZA 4KCEA 5EL8A 4BVXA 1OVNA 1JZDA 1Y6EA 1M2AA 5LCZA 2WDUA 3A3TA 3KTBA 5DAKB 3ZRDA 3MAKA 3VK9A 3DYRA 1PN9A 3IHQA 3SWLA 1KTEA 4JRRA 3G7JA 2R37A 1GUKA 1SK0A 6GSXA 3ZREA 3CSIA 3KMNA 1YKAA 4EXJA 2B3SA 5DJMA 2C3NA 4PGTA 2F3MA 1JZRA 3QCPA 5IPHA 4KB3A 2OJLA 3GSSA 1SJZA 1DSBA 5ID2A 1EOGA 2LRCA 4V2MA 1SKSB 2H8LA 2L4QA 2I81A 1F3BA 3TRPA 3UIWA 2C3TA 1EEJA 1SU9A 4BVYA 3HKRA 3ZIJA 1KEBA 2WJUA 3KH9A 2XPDA 4KSOA 2H01A 1MEKA 5ECNB 1XOAA 3VFIA 2ALBA 5HR1A 3N9JA 2FA4A 5ECMB 1GLPA 4OMVA 1K0DA 2G0FA 4XRAA 4MLYA 4KCAA 1VGLA 2GTUA 3UOMA 2JADA 3EMXA 1J9BA 5CRWA 3VWVA 4EF0A 5GAND 3TJFA 4EVMA 3RDWA 2V6OA 4I5QA 3AY8A 5EPFA 5ELAA 3KIJA 5CYYA 4NV5A 1BEDA 2MZCA 4HOJA 5B8AA 2V32A 5ECLB 5J9BA 3WD6A 1A24A 3MWHA 4EDYA 1AW9A 3GKNA 4O32A 3V1WA 2JZRA 2IL3A 2H76A 5DDLA 1XW5A 3QAVA 1S3DA 3GHAA 1W4VA 2V1MA 3EU3A 2H74A 3TB2A 4EL1A 4DVCA 4XS1A 5H5QA 2ON5A 3DMLA 1EOHA 1UVZA 1T7PB 5IMDA 4ZB6A 4BWQA 5AN1A 4HZ2A 3DGQA 4JBBA 3BOAA 4OCFA 4KDYA 3L78A 4G10A 3S9FA 2JSYA 3N5OA 3KJYA 4DSSB 4GRFA 2LV3A 4Q5RA 5JWRB 4WEYA 1YF1A 3P2AA 3FHKA 1T8EB 2A2SA 4ACSA 1XVQA 4GQFA 4MF5A 1OKTA 2H66A 2A4VA 2R5GA 4AJ8A 3A5WA 4V1Ag 5C04A 3Q18A 3FEUA 1ERWA 3M1GA 3HY2A 3M9JA 4L0WA 2YZHA 1K0MA 1SK2A 4LA1A 3GNJA 3W8SA 1M2BA 1HQOA 1V58A 3D21A 1BX9A 1K0AA 5HFIA 2LJKA 3G9BA 5D93A 1GSSA 5IIZA 4PQIA 4O7HA 2ZNMA 2E7PA 3EE2A 1QUWA 4MH3A 3WGDA 2LRTA 2K9FA 1PKWA 4MABA 1N8JA 2GT5A 4K2DA 1V57A 3P7XA 2B5EA 1ZMAA 2CQ9A 4DSSA 3IR4A 2H75A 3ME8A 3WYWA 3IC4A 4EO3A 3TKSA 4ZL7A 3LG6A 3M8NA 2DC5A 2X8GA 5KN0A 3LFLA 2C0FA 2X99A 4NHZA 2IFQA 4YH2A 3PINA 3GL3A 3GURA 1VRSD 1SL1B 2K6VA 1YEXA 1GTAA 2GSSA 1X9MB 2HSYA 4HZ4A 1GUMA 4ISDA 2YPMA 5GZZB 4L5LA 2JACA 5JCGA 2MMNA 2VL2C 5DCHA 2HZFA 5D9TA 1PL2A 2L5LA 1F2EA 4KUNA 3KM6A 4JR4A 1PL1A 2IMEA 2LJAA 5ECPB 2DBCA 4PQ1A 1B8XA 3L9SA 1R5AA 3GTUA 3G7IA 5G30A 1DE1A 3LWAA 1AUCA 4RQRA 2HE3A 4IJ3A 3HJPA 3WGXA 2P31A 2B7KA 19GSA 1O85A 1XPVA 4XCSA 4MJEA 3UBKA 16GSA 5J3RA 1XWGA 2PPTA 3ERWA 2L6DA 1JLVA 4N0VA 1DBYA 3DVXA 3FR9A 5F05A 2LNSA 4HJ2A 1ZZYA 2E2MA 5J9CA 4WF4A 2KOKA 2DMMA 4PNFA 2XHFA 4MCUA 3HDCA 3APSA 3TRQA 2FNOA 5D9XA 5EY6A 1XWKA 3TJJA 2L6CA 1U3AA 5DCGA 4HEA2 4ULXA 1JHBA 2E0QA 1GSEA 2WGRA 3M0FA 2AJQB 1RW1A 4XS4B 2I9HA 1GSFA 1WJKA 2VCVA 3I69A 4N11A 1Z7PA 2KUCA 1IYIA 1ERVA 1O81A 2C8UA 4GTUA 3ZVJA 5EVOA 3US3A 4D73B 5A4VA 1A8LA 1XIYA 1GRXA 1KBNA 2WRTA 1XXUA 3TRXA 4TN8A 1FG4A 1SL2B 2YANA 4ECCA 1X9SB 1B9YC 4MJAA 3VWUA 3GRXA 2B5XA 2EIQA 2H71A 1AQXA 5H5SA 1BG5A 1TRVA 4FO5A 3H93A 2PN8A 5LNKe 4H86A 2WULA 4WXTA 3RHBA 2FWHA 3PR8A 1RQMA 3IE3A 3MDKA 4BL7A 3UEMA 1G7OA 2R4VA 3APQA 4TR0A 1SENA 5IO0A 2HYXA 4V2NA 3LXZA 2PU9C 2CA8A 4LMVA 2VAFA 3H8QA 3CTFA 1I9DA 1B9XC 3IOSA 3E3EA 3ZYWA 4IKHA 4BWSA 5IOWA 3R2QA 5E4WA 2DIYA 2FY6A 1X5DA 5HR0A 4Z7XA 4HQSA 5CP1A 5KEJA 3IAS2 2YV7A 2F51A 1AXDA 2HFDA 4ZB8A 3HZ8A 5IM9A 1A8YA 5HQPA 2ZUPA 3U5RE 4D73A 2XPEA 2FA8A 1SYRA 5CNWA 1E2YA 2LKUA 4EDZA 5G31A 4YQMA 1ZCPA 3P90A 1HNBA 1GP1A 3GKMA 2GGTA 4OFTA 3TJGA 3F6FA 3KP9A 2H19A 1QMVA 5E59A 2D2ZA 2FHEA 1WIKA 2H6ZA 2H0HA 2HI7A 1M99A 3EWLA 4KDUA 4IQAA 3IRAA 2M72A 1A2MA 2K8VA 3FRCA 1M9AA 4I97A 3CXGA 1GNEA 4KNDA 1CQHA 3GA4A 4TR1B 2FWEA 2X8HA 2GDRA 1B4QA 1ZYQB 1FOVA 5D96A 1V9WA 4TW5A 4DSRA 1WPIA 1BJXA 5IMAA 1EGOA 5A4WA 3UVTA 2C0EA 5DVBA 1N2AA 1XBSA 3GKKA 2B1LA 4N0ZA 2RUEA 3NZNA 4L5OA 5D73A 1USBA 5B6MA 2AAWA 2CVDA 1OAZA 1GNWA 2CAIA 2IMFA 2JSZA 2O87A 3D4MA 3DRNA 4MJBA 2XC2A 2PVQA 1S3AA 2HLSA 3F4SA 4POLA 1O73A 1TXXA 4TOPA 2NTOA 1T4YA 4QL9A 2L5OA 1QGVA 2H30A 3KGKA 4F0BA 4WF5A 2GZZA 4HDEA 1FVKA 3HZ4A 2CVBA 5KN3A 1AAZA 2BMXA 2R2JA 1X5CA 5IMZA 2M46A 1TK8B 2HT9A 1HYUA 4FH8A 11GSA 3CSJA 4YQVA 4F0CA 4MMMA 1GUHA 1K0NA 3H79A 4Q5NA 2GZYA 2MBTA 1ZL9A 2VL9A 3JCML 1TU8A 3WGEA 2C3QA 2WS2A 5DAKA 3HJMA 1QXHA 3F63A 4TXOB 5G5FA 4GSTA 4MPGA 5A4UA 6GSTA 3A2VA 2C4JA 1ABAA 3IA1A 1NSWA 4ZL8A 5ECOB 1SYXA 3GH6A 2P0GA 2WCIA 3LYPA 3KZQA 3ME7A 3GSTA 1PGTA 1GULA 2YJ7A 4HUAA 3FR3A 2VL3A 1GSUA 2B6MA 4JEDA 1GTIA 1R7HA 2GT6A 2YCDA 2L4CA 1FB0A 4XRDA 3FYGA 4MJCA 3VLNA 3KMOA 3CRUA 2H1DA 1THOA 3KH7A 3D6IA 2HXKA 1F37A 3TJBA 2AUVA 1KNGA 1A2JA 2PERA 1G0TA 2H1AA 3L0HA 1GTBA 3FKFA 3TDGA 1WMJA 3ZL5A 4TXOA 3LSZA 3GFKA 2N5BA 4XTSA 1QFNA 1R5PA 5ECSA 2C0GA 3APOA 1O7UA 4NHWA 4WR4A 3VPTA 3ZLPA 2LQQA 1TOFA 5G1LA 4GCIA 2KLXA 2CX3A 4WR5A 2H70A 3Q19A 2JZTA 1MD4A 1YZXA 2GSRA 5HFKA 1TK5B 1VF4A 2IN3A 3M3MA 4WBJA 2CAQA 1TRWA 2YV9A 1YY7A 2TRCP 4MPFA 2PVOC 1U3IA 2GQKA 1FHEA 5IO2A 2AV4A 1YQ1A 2N5FA 2N5AA 18GSA 1XWCA 4IJIA 2RM6A 4F03A 17GSA 3IPZA 2K8SA 5HFGA 3A2XA 4L0UA 4ZBDA 4IGJA 5FT3A 1V2AA 4K7IA 2XBQA 4Q5QA 2YOIA 4AJ6A 1Z5YE 3IAM2 3O3TA 1C72A 1PX6A 1O8XA 1ERUA 1J08A 5CAXA 9GSSA 4POMA 1M9BA 4NXIA 4AJ7A 2X64A 3QMXA 2WFCA 3E0UA 3HA9A 4LL1B 4ECJA 1BAYA 2CVKA 2FD3A 3RPPA 5G1KA 3RPNA 4IP1A 1X9WB 1OC8A 4K1FA 2NPBA 3QR6A 1ZOFA 5DQSA 4ECIA 2CV4A 4OFMA 4G2EA 3RAZA 3TCOA 1Z9HA 2LTKA 3GX8A 3NIVA 2YWIA 2DJ3A 5F8BA 5B6NA 5H5RA 4GQCA 2HNLA 3GMFA 3P8WA 4MP4A 1QQ2A 3EURA 3EYTA 4GLTA 2VLUA 4GXZA 1R4WA 3PH9A 4ZL9A 4OD7A 1GTUA 1UC7A 1FO5A 4IBPA 2VIMA 1EP8A 5G2ZA 4J2FA 1PQNA 1TRUA 2AB6A 5KN1A 4ZB9A 1ERTA 2OA7A 3TKQA 1AQWA 2FUG2 1YEPA 3FK8A 2CT6A 2VL2A 1PX7A 3UVHA 2B7JA 3ZTLA 5ECHB 4XIHA 4MH2A 2O7KA 4TR4A 4ECBA 2VOCA 3BCIA 4O92A 4YAVA 4V2LA 1B48A 2O85A 4TXVA 4DSQA 2OE0A 3QAWA 4WETA 4TRXA 1A23A 4LLRA 2AYTA 1SKWB 1F6MC 4KAEA 4HS1A 3F0IA 3BBYA 1ZGNA 5KN2A 4ML6A 1EGRA 1GL8A 1U88A 6GSVA 3F3RA 5C00A 3HHVA 1TJDA 1JLWA 2WZ9A 5ELGA 1GWCA 2RUFA 3L9VA 2YWNA 1LU4A 5F0GA 4I8BA 3ZITA 2VD0A 2PBJA 4G9HA 1GSYA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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