2CX4A

Crystal structure of a bacterioferritin comigratory protein peroxiredoxin from the aeropyrum pernix k1 (form-2 crystal)
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
GLVELGEKAPDFTLPNQDFEPVNLYEVLKRGRPAVLIFFPAAFSPVCTKELCTFRDKMAQLEKANAEVLAISVDSPWCLKKFKDENRLAFNLLSDYNREVIKLYNVYHEDLKGLKMVAKRAVFIVKPDGTVAYKWVTDNPLNEPDYDEVVREANKIAGELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a bacterioferritin comigratory protein peroxiredoxin from the Aeropyrum pernix K1 (form-2 crystal)
rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Aeropyrum pernix
molecule keywords bacterioferritin comigratory protein
total genus 38
structure length 161
sequence length 161
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2005-06-27

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2cx4A00
2XC2A 5LCZA 5D96A 5H5QA 4HU7A 3EWLA 3PR8A 1F3BA 4Q5FA 4LL4B 2HYXA 3BCIA 3SBCA 1M99A 3M3MA 1Q98A 3QFAC 4ZL7A 5DAKA 3GKXA 3GUSA 1KNGA 2KLXA 2N5AA 3HVVA 1G0TA 3C8EA 3I69A 3WT1A 3ZIVA 3FZ4A 5FT3A 4X43A 5HFKA 4HQSA 2NDOA 2L59A 4HI7A 2OA7A 2NVLA 1IYIA 2BMXA 1SKSB 3EMXA 3QPMA 4XTSA 4X1UA 2H74A 6GSWA 4AF2A 3TKSE 4POKA 1FB6A 3HYPA 3DXBA 5D9XA 3CMIA 3DYRA 3IK7A 3BD2A 3P90A 3F8UA 4WBRD 4MDCA 1EEMA 1RQMA 5C00A 2VLUA 1GULA 2PVQA 2JSYA 4IJIA 1PL2A 1LJRA 4WR5A 5AIVA 1ZCPA 3LQ7A 3QCPA 5L71A 2RIIA 2I1UA 2DJ2A 1OVNA 3WGDA 1K0MA 3QR6A 4MZCA 3WYWA 5IO0A 3D4MA 5D93A 1FW1A 2HRNA 2GZZA 2H66A 2VM2A 2PERA 1JHBA 2AV4A 5GSSA 1GSFA 5DDLA 3QOUA 2H0GA 1O73A 3HHVA 17GSA 3KXOA 3FK8A 1QUWA 4KNDA 5ELGA 3QDNA 5AGYA 5EY6A 2OE3A 2PMTA 4FYBA 5FWGA 4ZBDA 3WT2A 2HSYA 1URMA 4WR4A 10GSA 3GL5A 4OFNA 5G1KA 2CAIA 2MMOA 1XWKA 2VL2C 5ECSA 1B4QA 3HCZA 4O5RA 3TOUA 3F4RA 3EVIA 3IRAA 1FB0A 3DIEA 2RUFA 1X5DA 2FWHA 4H86A 3TJJA 5G5FA 1JZDA 5F06A 4JU5A 5ECPB 2A4VA 1U87A 1Z7RA 1AW9A 4MJEA 1U3IA 2FA8A 4EDZA 3N9JA 3F6DA 1ZMAA 1Z7PA 4WKWA 4MJBA 2FD3A 2YZHA 3GH9A 3HZ4A 1I9DA 3DVWA 4KSMA 4WEYA 4IBPA 2ALBA 3IBHA 4N11A 1SL1B 5CYYA 3NIVA 1GUHA 1O8XA 4BVXA 1PKWA 1PL1A 4OFMA 1PX6A 3A2WA 3CSHA 3WGXA 2VOCA 1FVKA 2LNSA 1O6JA 4PURA 3HY2A 1GLPA 5J3RA 1EOGA 4K6XA 2X8GA 3P2AA 2DIYA 4MF5A 2JSZA 2FUG2 3IV4A 2C0GA 2O7KA 4HZ4A 4XS1A 5D73A 1GTBA 2YZUA 4JR6A 2EIOA 3FR6A 1XWCA 4DEJA 3L9SA 2E7PA 3GYKA 16GSA 2CX3A 1UC7A 1J9BA 1V9WA 3RPPA 3QD9A 3UIWA 2LQQA 3HKRA 20GSA 1GSSA 3GRXA 3G9BA 1TOFA 4NV5A 3UVTA 9GSSA 8GSSA 4QQ7A 1ZL9A 2OJLA 4MZBA 5IQYA 2J23A 2JZTA 3HJMA 3LWAA 4O92A 3TJGA 1T3BA 3I6AA 4GF0A 2FLSA 4IQAA 2M46A 2NPBA 2OKAA 1X9SB 2XPEA 1V57A 2Z9SA 1QFNA 5DALB 1OC9B 3IHQA 5LD0A 4WETA 4CHSA 1T4YA 1U6TA 4J2FA 3KEBA 4KAEA 2VD1A 3QAWA 4E8HA 5IM9A 1N2AA 1AQVA 2PGTA 2RM5A 1QK8A 3P8WA 4GSNA 3WD6A 4IELA 1YKAA 1OE7A 2KUCA 2PVOC 1X0RA 3CXGA 5B8BA 2C0EA 2H19A 5DQYA 1PMTA 3HVXA 4NAXA 4KA0A 4X0XA 3CSIA 3ZIJA 2IJYA 3TGZA 5DALA 1OC9A 1PA3A 4TXVA 3ERWA 1F3AA 3LYKA 4NHWA 1V98A 5CRWA 2K8VA 4TR4A 5B7CA 2NTOA 1UA5A 1HD2A 1HYUA 4ML6A 4IHUA 1XBSA 2N5FA 1S3DA 3HJOA 3H1NA 2ES7A 2QKEA 5ECNB 3VI7A 1TDIA 3EE2A 2L6CA 1NHOA 4PQHA 2DMLA 2GVPA 3A3TA 2CQ9A 4V1Ag 1SKRB 3DRNA 4YQVA 3NZNA 2KHPA 4KSOA 3M1GA 3HVSA 1DBYA 2B5XA 5IPGA 3UOMA 5JWOB 2MZCA 1IYHA 2REMA 2IWTA 3F4TA 4KE3A 3M9JA 5EPFA 2LRTA 5A5KA 1BJXA 1BX9A 3TRXA 3TKSA 3ZL5A 4ID0A 5D9TA 2JU5A 2R5GA 3MNGA 2QC7A 4Z7XA 1TU7A 4KDXA 2C80A 1SENA 4G10A 2JADA 3GV1A 5KN3A 4MK3A 5ECKB 5D9WA 2YOIA 12GSA 4IP6A 1A8YA 4HS1A 2GZPA 3KP9A 1RW1A 3KH7A 5C04A 2ON5A 1ERVA 2DIZA 2L4CA 1FAAA 2CAQA 4PUFC 1ILOA 1G6WA 2H73A 2X64A 3MAKA 2GS3A 3GHAA 1SD9A 3FHKA 2H75A 2LKUA 4L0UA 2VIMA 3ZZXA 3FR9A 2YWOA 4ZL9A 2FWFA 3CTFA 4DSRA 2M80A 2H01A 5KN2A 1WWJA 2GSSA 2GLRA 2LSTA 2DJ3A 4O32A 5CNWA 3VPQA 3HJPA 4MA9A 4ECIA 1N8JA 1SD8A 2YWNA 3C73A 3A2VA 3DEXA 1Z3EA 5IIZA 2HI7A 4IJ3A 2CVKA 2J9HA 3U6VA 4LLRA 5F0GA 2HZFA 1GSUA 2OBIA 2HZEB 5JWRB 5B6NA 4F82A 4TR1B 4N30A 4RUVA 1M9BA 1SK2A 5COHA 3FEUA 1K0BA 5DAKB 2FCHA 1GUMA 3LYPA 4RI7A 4BA7A 2DJKA 3W8SA 1YEXA 1W89A 4K8MA 1R5AA 2GQLA 1AUCA 3L9UA 2GSQA 5H5RA 11GSA 4OFTA 5A4VA 1GUKA 2HFDA 1TU8A 4K0NA 1A23A 4J56E 3ME8A 5ENUA 4O7HA 2YWIA 2HZEA 3FZ9A 2XPDA 1GNWA 1JLWA 3I43A 5DVBA 3D4TA 3GTUB 3FW2A 4TR1A 4F9ZA 4GCIA 3ZITA 1G7OA 2RM6A 1A2MA 3F3QA 1RK4A 1XIYA 1JZRA 2AHEA 4I2TA 1WPIA 2VCXA 1OC3A 1QQ2A 2PN8A 2VD0A 3VPTA 4RI6A 2WS2A 6GSTA 2O85A 4P3YB 1GH2A 2H71A 4Q5NA 1WMJA 3F0IA 3LGCA 3TKRA 3O3TA 1UVZA 3GTUA 1GNEA 1OAZA 1SU9A 1XXUA 2MYGA 3TDGA 3ZMLA 2VL3A 3KH9A 3GSTA 5DCGA 3KCMA 1EGRA 1OKDA 4TXOA 3SWLA 1DE1A 2DLXA 3C7MA 2MBSA 1AAZA 2GTUA 1ABAA 1XW5A 4ZBBA 2FGXA 3KMNA 1SL2B 4XHMA 1NSWA 1BYEA 5JCWA 2YNXA 3BJ5A 2B7KA 4DSQA 3GN3A 3L0HA 4FH8A 4IN0A 2YCDA 4LMWA 3G7YA 2R3XA 2VAFA 2B3SA 2I3YA 4MPFA 2CZ3A 4AJ8A 1ZGNA 2H30A 1S3CA 1YF1A 5JCUA 1GTAA 2IMDA 4JBBA 2IMEA 4K2DA 5DJLA 1WE0A 2VL2A 4KCEA 1K0NA 1Z6MA 2H6ZA 4EKZA 1LBKA 3QMXA 1AIUA 3KZQA 2OE1A 3VFIA 1KTEA 3UBKA 3BOAA 3PINA 2K8SA 4ZL8A 1TRWA 4ZBAA 1SL0B 1K3YA 2DBCA 3RBTA 1GL8A 3LXTA 5IOWA 3GKKA 1B4PA 1PGTA 3JCML 3TJKA 3EU3A 4N0ZA 2LJAA 2EIQA 2ON7A 13GSA 2P5QA 3D0ZA 4KUNA 1XCCA 2PUKC 4I97A 4IQ1A 1TW9A 5B6MA 4PXOA 4BVYA 2P5RA 1G6YA 1SK1A 1ERUA 1S3AA 2PWJA 2DMMA 3GKMA 1TRSA 2DJ0A 1X9MB 2H0HA 1KBNA 5AISA 4EO3A 4EC0A 1K0DA 2BTOT 3HD5A 5ECRB 2TRXA 3E0UA 1B48A 3FYGA 2I81A 1SKWB 3P7XA 5J41A 3QAVA 1GRXA 3V1WA 1XOAA 3K8NA 4I6XA 3UEMA 2F51A 1B8XA 2IPAA 4YAPA 2C0FA 5ECOB 1SJZA 14GSA 2ZCTA 2LTKA 2R6KA 4JZQA 1HNBA 1EZKA 4XS6A 3A2XA 4OO4A 1E2YA 4I8BA 1DUGA 2OBKA 4YQMA 1M9AA 2ZNMA 3M9KA 2PBJA 2OADA 4HOJA 4POMA 1GWCA 1MTCA 2V2GA 3R2QA 3TJBA 2TRCP 2DSAA 4ECBA 5IMAA 4EL1A 5FHIA 1M0UA 4FIWA 3J7Yk 1YKCA 4MMMA 3G7JA 1TJDA 1TRUA 5CREA 3QAGA 2I9HA 5D8IA 4D73B 4GWRA 1WRYA 3GA4A 1CQHA 1ACVA 3M8NA 1YDKA 4MABA 1YJ6A 2L57A 4DVCA 5IMDA 4PNFA 2WULA 4NPBA 4IKHA 2XBQA 5LNKe 4ECCA 2VM1A 1AQWA 4YH2A 3VWUA 3TCOA 5HQPA 1YZXA 2FWEA 1QXHA 3FR3A 2WB9A 3GX8A 2CV4A 3LORA 4I2UA 4NHZA 1JFUA 4DSSB 4JEDA 5CP1A 4GXZA 3GX0A 1K0OA 1Z9HA 4GSTA 2F3MA 4D73A 5IMFA 2FY6A 1U3AA 4MJAA 2NBSA 1K0CA 3CYNA 2GGTA 3H79A 1HQOA 4PNGA 3APQA 2HLSA 5CO3A 1JZWA 2H72A 1PD21 4OWYA 5E59A 2G0FA 1O85A 4LL1B 2HSHA 2CZ2A 5DBQA 2LQOA 2V41A 1THXA 5HR1A 2MMAA 3IA1A 1VF3A 4DSSA 1J08A 3IAM2 4CDOA 2VO4A 1PRXA 1MD3A 1TI1A 2B6MA 3EMPA 1SYRA 4LA1A 2GSRA 3F9UA 3MSZA 3HDCA 2OE0A 3NOFA 5E4WA 2L5LA 5ECIB 5INYA 3KM6A 1WOUA 2YJHA 4ULXA 1F9MA 1ZZYA 3FZAA 4HZ2A 2B1LA 3TKPA 1T7PB 3Q19A 5HR0A 4FYUA 3D22A 1YF0A 4MF7A 3GIXA 4I5QA 3GURA 4OCFA 2FHEA 1K0AA 3L9VA 3IDVA 2C0DA 2L5OA 3UJ1A 4GTUA 3LG6A 3UARA 1XWGA 1PX7A 3Q74A 4OO5A 1USBA 3EURA 2AB6A 2RUEA 5G1LA 4YQUA 1YQ1A 3LFLA 2H6YA 2QSIA 3D21A 4PQ1A 4KDYA 3RDWA 3UL3A 4QL9A 5GAND 4TOPA 5HFGA 2ZUPA 2VCWA 2LJRA 1THOA 2LJKA 2GDRA 3AY8A 4YAVA 1R26A 3Q6OA 2H1DA 2RLIA 1XOBA 4MZWA 4FYCA 5GSTA 2VUPA 3IPZA 2YN1A 3ZFLA 2H0IA 3ERFA 5GZZB 1GP1A 2IIYA 3FRCA 5H5SA 4AJ7A 4HJMA 3H8QA 4IGJA 4L8EA 1KEBA 3CTGA 4XRAA 2L6DA 3RHBA 5D9VA 3VWVA 1VF1A 4HUAA 3N5OA 3HA9A 4N0VA 3TKQA 3TOTA 1OE8A 5ID2A 1PN9A 4L5OA 2XBIA 3C1SA 2YV9A 2B5EA 1F37A 3TB2A 3EYTA 4IP1A 3GKNA 5KEJA 1XVQA 4ZB8A 1XW9A 1I5GA 1BG5A 5ECLB 1T8EB 2C3NA 2IFQB 3IXRA 1H75A 5CRDA 3PGTA 2BJXA 2O8VB 4TVEA 4BPYA 4TR0A 4PGTA 3F4SA 2LS5A 2O89A 2B1KA 4EXJA 1A0FA 3DMLA 2AUVA 1XWBA 3RPNA 1O7UA 6GSUA 7GSSA 2V6KA 1U88A 1YY7A 5ABRA 2GT6A 2E0QA 4JRRA 1PQNA 2G2QA 5HR2A 1EGOA 1GTIA 2IMIA 1OC8A 5HFIA 5G5EA 3DD3A 2IFQA 1JLVA 1FOVA 1VF2A 4EE0A 4TXOB 1A2LA 22GSA 5J5NA 2PU9C 3IE3A 2YV7A 1O81A 2H8LA 1JZOA 2A2SA 3IOSA 2AYTA 1VGLA 1OKTA 4RQRA 4POLA 4OCEA 1K3OA 3ZVJA 4HDEA 5GAPD 2LRCA 4V2NA 2JACA 1MDIA 3FKFA 3F3RA 1EV9A 4MF6A 1NW2A 3ZVJD 2JZSA 3Q18A 1Y6EA 2P31A 4ZB9A 1X5EA 2KOKA 1H4OA 1Z5YE 2R37A 4NWYA 2C1YA 3CRUA 1MD4A 2VCTA 2A2RA 2E2GA 2WFCA 3MWHA 2L4QA 1LU4A 5F05A 2P0GA 1CQGA 2FNOA 3H4KA 2V32A 1M7TA 2B5YA 3ED3A 1VF4A 4MP4A 2H1GA 5ELAA 3L78A 2JZRA 1M2DA 1V2AA 2H1BA 4TRXA 4N10A 3MDKA 2FWGA 1GSEA 5IOXA 2X99A 4KDUA 1M2BA 1J0FA 1GSDA 1Q4JA 1ERWA 1TK5B 1HNCA 1EEJA 2O87A 5ECHB 1G7EA 1EP8A 3CRTA 2AJQB 1A24A 2F8AA 2IMFA 3GMFA 4KX4A 3TRPA 1OYJA 2MBTA 2DJJA 2VCQA 1DE2A 2LV3A 3D5JA 1T4ZA 4V2LA 4MPGA 1B9XC 2YJ7A 4PQIA 1EV4A 5IMCA 3APSA 1YEPA 1UN2A 1SJIA 3L4NA 3UMAA 3RAZA 2R4VA 2YPMA 2CX4A 3J7Yb 4ZILA 1WP0A 2HXKA 5G2ZA 3APOA 5G30A 2WJUA 4XIHA 3A5WA 4POBA 4ILFA 1NM3A 4BWQA 2PPTA 2X8HA 4AJ6A 5J4UA 1Y25A 1FO5A 4MJCA 2HRFA 4XS4B 4L5LA 3VWWA 2EIRA 4K7IA 3ISOA 1F6MC 1T00A 3CBUA 3ZTLA 3RHCA 2HE3A 2H1AA 3DVXA 4BL7A 4ZXGA 2D2ZA 4FO5A 3KJYA 2MMZA 19GSA 3UBLA 4EVMA 4IS0A 1XW6A 3LXZA 4K0GA 4CW9A 4WBJA 3O76A 1AQXA 2GQKA 2AAWA 1XFLA 2VLVA 5ECMB 2C8UA 3LJRA 1R4WA 3I9V2 5DQSA 3D6IA 3GSSA 4BWSA 3ZFBA 2F8FA 1V40A 1QMVA 3IK9A 4XS4A 1SK0A 4PX1A 2LEGA 2GZYA 2MMNA 1EP7A 5HR3A 2N5BA 1SYXA 2EC4A 5AN1A 2K9FA 3VWXA 6GSSA 2HNLA 2KP2A 2YANA 1XPVA 5JWQB 3S9FA 3VLNA 5ECQB 2B7JA 2WDUA 3QFBC 1XWAA 1WJKA 2LNTA 1A8LA 4HJ2A 3DGQA 4EF0A 3ERGA 4NMUA 4ZB6A 2CVDA 4GRFA 3F6FA 3PH9A 5J9CA 1TK0B 2I4AA 3H93A 4ML1A 1BEDA 4J57E 3ZLPA 1TTZA 4F03A 4MLYA 4F0BA 1A2JA 4EUYA 3ZREA 5IMVA 4ACSA 3KTLA 4PUAA 3TJFA 4K1FA 2GSTA 4GQFA 1MDKA 4G9HA 5G31A 1K3LA 3BBYA 5B8AA 1AC1A 3E3EA 6GSXA 1TI3A 2H70A 1Z6NA 2YWMA 2V1MA 3EU4A 4HEA2 3KIJA 3HZ8A 3ZMKA 3HXSA 3KMOA 4V1Ap 4K7NA 1ERTA 3VURA 3C1RA 3W8JA 4IVFA 5IO2A 2XHFA 3M0FA 4NV2A 1ZYEA 3EC3A 1W4VA 2X8CA 3G7IA 1QGVA 3BCKA 1TK8B 5J9BA 2QGVA 2DJ1A 4G19A 4KH7A 4KB3A 4LMVA 4K7OA 3KGKA 1B9YC 1GTUA 2H6XA 4QL7A 3VI5A 1HNAA 3E9JB 4NXIA 3WGEA 3LSZA 1BQ7A 4L0WA 4K9ZA 2C3QA 4V2MA 4JE1A 2VCZA 2OACA 2V6OA 1GSQA 2WCIA 3OR5A 5KN0A 5F07A 3VK9A 4KCAA 1R5PA 1X5CA 1GSYA 1XZOA 2F9SA 4GQCA 1C72A 4XCSA 4E8EA 3ZRDA 3TUEA 1O8WA 4F0CA 2HT9A 2K6VA 2TIRA 1NHYA 3UVHA 1A0RP 18GSA 2VCVA 3DWVA 2WZ9A 3C71A 4ECJA 3IAS2 1FHEA 3ZYWA 4WF5A 5AIXA 3GFKA 5A4WA 1ML6A 3GNJA 4MH2A 6GSYA 5F8BA 1MEKA 2C3TA 1R7HA 4OD7A 5ID2B 3FZ5A 4ZIJA 4JR4A 4F2IA 4HU9A 3KP8A 1PKZA 3GH6A 3TRQA 1XVWA 3O6TA 2M72A 2C4JA 1ZOFA 5IPHA 1EWXA 6GSVA 4EDYA 3U5RE 3TKSC 3KD0A 1WIKA 3US3A 4G2EA 1TP9A 3W6GA 4KW6A 2CA8A 3FY7A 2GT5A 4HQZA 3F63A 2R2JA 2GQMA 1AXDA 4AGSA 3IC4A 1ON4A 5IMZA 1X9WB 1GLQA 1FG4A 4MH3A 3DKSA 5EVOA 4GSSA 4WXTA 4Q5QA 1ZYQB 2E2MA 2JL4A 2IL3A 2DC5A 4OMVA 1TXXA 3IR4A 4ISDA 5DJMA 5JCGA 1T1VA 1EOHA 3GL3A 3ME7A 2LUSA 2K18A 4TR3A 2VL9A 4MCUA 4RQXA 4TW5A 5CAXA 5CRGA 2IN3A 2CT6A 4GLTA 1FVJA 2H76A 2WRTA 1BAYA 4IW9A 2WGRA 4Q5RA 1V58A 3KTBA 2FA4A 5CRHA 5A4UA 5KN1A 5EL8A 1SJ6A 3UAPA 4XRDA 3EINA 4TN8A 2KP1A 2CVBA 1TKDB 2LRNA 1M2AA 1E6BA 4WF4A 2YP6A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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