2PN8A

Crystal structure of human peroxiredoxin 4 (thioredoxin peroxidase)
Total Genus 62
204060801001201401601800102030405060
Genus TraceResidueGenus

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
62
sequence length
191
structure length
191
Chain Sequence
YFQSMPAPYWEGTAVIDGEFKELKLTDYRGKYLVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFGDRLEEFRSINTEVVACSVDSQFTHLAWINTPRRQGGLGPIRIPLLSDLTHQISKDYGVYLEDSGHTLRGLFIIDDKGILRQITLNDLPVGRSVDETLRLVQAFQYTDKHGEVCPAGWKPGSETIIPDPAGKLKYFDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
EMPTYTIV2 (93-96)S2 (97-102)TII1 (106-109)3H1 (103-106)AH1 (122-140)AH2 (153-161)S4 (143-149)TI1 (179-182)AH3 (183-188)S6 (191-192)S3 (110-115)S1 (89-94)TIV1 (80-83)TII2 (118-121)3H2 (164-166)S5 (176-178)TIV3 (169-172)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
publication title Crystal structure of human peroxiredoxin 4 (thioredoxin peroxidase).
rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin-4
total genus 62
structure length 191
sequence length 191
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2007-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2pn8A00
1ZMAA 3C7MA 3RPPA 3EINA 6GSTA 4L5LA 3BCKA 3NIVA 5CRHA 3I69A 1GSQA 1G0TA 5ECSA 1RW1A 3VI7A 1QK8A 1A8LA 4PX1A 4K8MA 4ZILA 4RI7A 3G7YA 2ON5A 3TKSC 3GV1A 4TR4A 4GTUA 1O73A 2OE3A 2O7KA 2VLVA 2K6VA 5ECLB 2HI7A 1Z6NA 4POBA 3TGZA 1XXUA 3KD0A 3GYKA 1ABAA 5DDLA 3QCPA 5GZZB 4LLRA 3UL3A 4IJ3A 4KW6A 4K6XA 1A2LA 1EOGA 3FHKA 3QR6A 2LQQA 1TRVA 3HZ8A 1SK2A 3LGCA 1CQGA 1S3CA 5J9BA 5IMDA 3HXSA 3D22A 1G7EA 3UAPA 1JZWA 4JRRA 2I4AA 2PWJA 3CYNA 5D73A 3M3MA 2AHEA 5E59A 1GNWA 2XHFA 4HJMA 3FZ4A 1TI3A 1QXHA 3IOSA 4GXZA 4TVEA 5J9CA 2NBSA 2G2QA 4KDXA 2R6KA 5E4WA 11GSA 1GWCA 2ZUPA 1B4PA 3FZ9A 1SK0A 3HA9A 2V32A 4HJ2A 2C8UA 4IS0A 3GHAA 3NZNA 3ZITA 3GUSA 2DC5A 4J56E 4BL7A 2AYTA 1K0DA 1QQ2A 4PUAA 3WD6A 1AXDA 1OC8A 3KCMA 5EY6A 1R7HA 1DSBA 3ERFA 2M46A 5DJLA 4IP6A 2LRCA 5ELGA 1IYIA 3O76A 5HR1A 3L0HA 3UMAA 1QUWA 2C0GA 2GT6A 4OD7A 3ISOA 1SYRA 5ECPB 4GLTA 5G1LA 3KXOA 3D5JA 4TR0A 2FWHA 4J57E 5A4UA 4ZB6A 2YZUA 4I2TA 2N5AA 2K9FA 3PR8A 5D8IA 3CSIA 4IJIA 2H0IA 2IPAA 4IVFA 4EF0A 4X1UA 3M1GA 2KP2A 4F2IA 2C3QA 1G6YA 1HNCA 1XW9A 3CMIA 1OYJA 2YN1A 1VF1A 3F3RA 2VCQA 3HVXA 2H6YA 2P5RA 1ZCPA 4DEJA 2DJ2A 4Q5NA 2MBSA 1GSEA 3APSA 5GAND 5F05A 4HZ2A 3ZVJD 4CW9A 4MH2A 2F9SA 4TRXA 2FUG2 5A4WA 4PNGA 5JCGA 4MZBA 4I2UA 4KE3A 3IRAA 4MF6A 3GNJA 2HYXA 4EE0A 5KN0A 2KLXA 3EWLA 1R26A 5F06A 1AQVA 1O81A 1SD9A 1F6MC 1UA5A 4LMVA 3VFIA 2NVLA 2HLSA 4TR1B 4P3YB 4TR1A 2WGRA 3ZREA 3KEBA 3CBUA 2C0DA 3HCZA 4GF0A 2E0QA 1A0FA 1B9YC 1JZDA 3GIXA 4NHZA 2L6DA 2H72A 1NHOA 3VPTA 1PA3A 4BWQA 3UOMA 4ZBBA 5EPFA 20GSA 3VWVA 2B5YA 3BCIA 2JACA 4ML1A 2HZEB 2HZEA 2V1MA 5HFIA 2X99A 2CAQA 4OO5A 1GTBA 4MLYA 5DAKA 4WF5A 4GQFA 1YJ6A 1EV9A 22GSA 3VPQA 2GDRA 1EGRA 5GSSA 3RHCA 4BVYA 1XZOA 3ERWA 3L9SA 3CXGA 1G7OA 2IMDA 4TN8A 3KZQA 2GTUA 4L5OA 1LJRA 3J7Yk 1X9SB 4NV5A 2YP6A 4JEDA 5AN1A 2QGVA 4TKYA 3FR3A 1TRWA 4AJ7A 5ECOB 4CHSA 3GH6A 3ZLPA 1N8JA 4ZBAA 5FHIA 1M9BA 2IMKA 4ML6A 2H73A 4HU9A 4XS4B 3QMXA 4XS4A 3MDKA 4RQXA 1WOUA 4MZWA 2F51A 1CQHA 1TRSA 5J41A 2QSIA 4GSTA 2H66A 4MCUA 1GUKA 2YWOA 12GSA 1HYUA 2X64A 1RK4A 1OKDA 2R5GA 3WT1A 2H1BA 3F0IA 1BEDA 1SJIA 3HZ4A 6GSYA 4F9ZA 1X9WB 1I5GA 1F3AA 5IO2A 3VWWA 4QQ7A 3Q74A 2YCDA 3E9JB 1AQXA 1X9MB 1MDKA 1FW1A 3H1NA 2C1YA 3HKRA 2IWTA 3H8QA 5D9WA 3GFKA 2B1KA 4KH7A 3APQA 1BX9A 1V57A 4Q5RA 3TRPA 3KH7A 2E2MA 3HJMA 1AW9A 4N11A 1B4QA 1SL1B 1ERTA 2HZFA 2LV3A 1O8WA 4GSSA 2EIOA 3FKFA 2DMMA 1HD2A 3IAS2 3KP8A 4MJCA 1GULA 5ABRA 2ZNMA 4JZQA 3GMFA 1GRXA 1XOAA 4HOJA 5HFGA 2X8CA 4XRAA 3OR5A 1TU7A 4FYBA 1EOHA 3QFAC 3D0ZA 4POKA 3C1SA 5L71A 1HNAA 1O6JA 2DJJA 1T3BA 4EVMA 2VD0A 2PERA 4I5QA 5CNWA 1O8XA 2R37A 2ON7A 5IO0A 3QAWA 3A2VA 4WBJA 4ULXA 1E2YA 1XWBA 3TDGA 1YF1A 4K2DA 2C3NA 3FK8A 1ZGNA 1C72A 5H5RA 1F2EA 2PMTA 3F9UA 3VURA 4GRFA 1T00A 5IMCA 4K7IA 1UN2A 2EIQA 2B7KA 1EEJA 5IOXA 4YQMA 1GTAA 2YZHA 4E8EA 3GRXA 1EP8A 1VF2A 1XVWA 3RPNA 2RLIA 5IPHA 4RI6A 4JE1A 1EGOA 4ID0A 2B5EA 2XBQA 2K8SA 4PXOA 5FWGA 3IA1A 1SK1A 1XWCA 3TJFA 1YQ1A 1WMJA 4MP4A 1NM3A 3KM6A 5DQSA 1UC7A 3KMOA 1PRXA 3MAKA 2YJHA 4OFNA 1K0BA 2GZYA 4KUNA 2VO4A 4OMVA 3DWVA 4N30A 3HVVA 3D4TA 4ZL7A 5IMZA 4KX4A 4GCIA 1PN9A 3KJYA 2LJRA 9GSSA 2LTKA 1MDJA 5C00A 1WWJA 3FZAA 2C80A 2CV4A 2RM5A 1SENA 2MMAA 3KTLA 2O85A 3GX0A 4YAPA 1YKCA 1XWKA 2VAFA 3DXBA 1R5PA 3EE2A 2H6ZA 3I6AA 3M9JA 1PKZA 4V2LA 1T4YA 3A2WA 4NAXA 3KH9A 3DD3A 3F4SA 6GSWA 2LRTA 1PX6A 5COHA 1T8EB 1FOVA 3LQ7A 1A2JA 1NSWA 1XVQA 4OFMA 4LA1A 2PU9C 1PGTA 3HD5A 4WR4A 2I9HA 2OA7A 1GLQA 4MH3A 2VD1A 1MD4A 2PGTA 4WETA 2VCTA 3I9V2 5ID2B 3ZMKA 2H0HA 3PINA 5B6NA 1ACVA 2K18A 2M80A 4EC0A 1SKWB 2P31A 3DIEA 2J9HA 1PSQA 1W89A 3DYRA 2L59A 2XC2A 3A5WA 5GSTA 5KN3A 3SWLA 3GL3A 1JHBA 5EVOA 5H5SA 3ME7A 1EZKA 3L4NA 1HNBA 1SL2B 5DALB 1K0AA 2H19A 2CQ9A 2DIZA 3LXZA 5AIXA 5ECQB 4GQCA 1JZRA 1Z6MA 1URMA 1M99A 4L0WA 3MNGA 5HR2A 1ZYEA 2GZPA 2X8GA 4WBRD 3HY2A 3IC4A 2VLTA 2YWNA 2LJKA 6GSSA 1Z3EA 2YWIA 3D21A 5F0GA 2EC4A 2LS5A 2JSZA 3S9FA 4EL1A 1BAYA 2FCHA 2JZRA 2H01A 2LQOA 2V41A 1WRYA 3BBYA 4JBBA 5FT3A 3ZFLA 5CAXA 3FR9A 3IR4A 4O32A 4AJ6A 3GKNA 3APOA 1THOA 1YDKA 2HNLA 3BD2A 4QL7A 1DE1A 3HVSA 1GSFA 1YEXA 1MEKA 3K8NA 2R4VA 2V6OA 2E2GA 1X0RA 1NW2A 3GURA 4TW5A 4MF7A 1K0NA 2XPDA 5IM9A 3WGEA 3CSHA 3RDWA 1FVJA 4HQSA 2HT9A 3GKXA 4DSSB 4DSSA 4J2FA 1SYXA 2CZ3A 2V6KA 3CRTA 4K7OA 1UVZA 1O7UA 1XIYA 2XBIA 2OBIA 2H71A 3F3QA 4MJBA 4QL9A 2TRCP 5D9VA 1AQWA 2F8AA 4XTSA 2H75A 3F4RA 5D9XA 2O87A 4MPGA 1YF0A 2WFCA 2I3YA 4K9ZA 2LSTA 5J4UA 2QC7A 4ZBDA 5C04A 3IBHA 1PL2A 4V1Ap 3IV4A 4KSMA 2VCWA 2Z9SA 1T1VA 2GSQA 3UBKA 5INYA 4HQZA 5B8AA 1WIKA 4HU7A 2DLXA 2VM1A 5G2ZA 1ZOFA 2QKEA 2FWEA 3L78A 4F0CA 4IP1A 3ZIVA 3IHQA 5F8BA 3WGDA 3M0FA 4KDYA 1GSDA 2NTOA 3ZRDA 1K0CA 2RM6A 2PVOC 4JR6A 1FHEA 3Q6OA 1H75A 3V1WA 1A24A 3LYPA 2A2RA 2HFDA 1PKWA 3QAVA 4PNFA 4EXJA 1B48A 1FO5A 1J0FA 4DSQA 5IPGA 2HXKA 1GUMA 1O85A 1AIUA 2VIMA 3F8UA 1VGLA 3FEUA 2MMZA 3WYWA 5A5KA 2M72A 4KDUA 4O92A 4MDCA 2NDOA 4NV2A 2N5BA 4YQUA 1K0MA 3DRNA 5JWRB 1TK0B 3HYPA 1GSYA 1LBKA 1XWAA 5CRGA 2GSSA 3Q19A 4LMWA 1JLVA 2ZCTA 5ECIB 2DBCA 4WXTA 3F63A 1AUCA 1TK8B 2CVKA 1J08A 4FYCA 2H74A 2JL4A 1A8YA 3DVXA 4IGJA 3KMNA 4L8EA 4MK3A 4LL1B 3GL5A 6GSUA 3E3EA 1WJKA 2PVQA 2OJLA 1TRUA 4N0ZA 3VLNA 2FA4A 4HDEA 4V1Ag 1YY7A 2FWFA 3GKKA 1K3YA 3DGQA 4WF4A 2K8VA 1X5DA 4Q5QA 1GNEA 4BPYA 2IN3A 3TRQA 4JU5A 4TXOB 5DVBA 4TXOA 4YQVA 2LRNA 1BJXA 4ZXGA 1GTIA 5IMAA 1OC9B 3TKRA 2H70A 3ZTLA 13GSA 1ERVA 1OC9A 2AUVA 2V2GA 2L4QA 1BG5A 3KTBA 3P7XA 5CYYA 1XW6A 4KGIA 2LNTA 4I6XA 1A2MA 2B7JA 3Q18A 1TTZA 2P5QA 3HDCA 1GUHA 2OKAA 3E0UA 2VL3A 5IOWA 2CT6A 4HEA2 2F8FA 1R4WA 1W4VA 3IXRA 2MMNA 2CA8A 3N5OA 3TUEA 2YV9A 5DCHA 1BYEA 4XCSA 5LCZA 4ZB9A 4JR4A 3ZZXA 4YAVA 2GQLA 3EU4A 3H4KA 4I97A 3IK7A 1GP1A 1G6WA 4DSRA 2CVDA 3GTUB 5KN1A 2IFQB 2GSRA 3GTUA 2IFQA 1U3IA 3IAM2 2H30A 3QFBC 2VCZA 3LJRA 1H4OA 4MABA 1V40A 2RUEA 1SU9A 4FIWA 1A0RP 1V9WA 4HZ4A 3KGKA 2KHPA 18GSA 3W8JA 3TRXA 3MWHA 2FD3A 1SL0B 2MYGA 1M7TA 1BQ7A 4KSOA 1Q98A 1MD3A 1IYHA 2JU5A 2GLRA 4E8HA 2GS3A 2IJYA 3UARA 3P8WA 2A2SA 5J3RA 5H5QA 4XS1A 1THXA 2OACA 2JZTA 2IMIA 5G1KA 2WB9A 1GSUA 1GLPA 4IQ1A 1B8XA 3TOUA 1SKSB 1RQMA 2OE0A 3L9VA 1EWXA 3WT2A 3TCOA 3ZL5A 3WGXA 2IIYA 3H79A 4FH8A 1TW9A 2CX4A 2MMOA 3LG6A 1SJZA 1USBA 2DSAA 4OCEA 4NXIA 5B7CA 7GSSA 3LEFA 4IHUA 3G7IA 2WULA 2I81A 4ZB8A 4EO3A 14GSA 2N5FA 3KP9A 4MA9A 1OVNA 3TKPA 4XIHA 4AF2A 2VL2A 3UBLA 1XFLA 5B8BA 2CZ2A 1PQNA 2E7PA 4K1FA 4I8BA 1AAZA 1Y25A 5HR3A 1QGVA 2MZCA 2VL2C 4AJ8A 3US3A 3KIJA 2B5XA 2HRNA 2MBTA 3J7Yb 2H0GA 1KEBA 2L5LA 2YNXA 3IDVA 1F3BA 4PQ1A 2H1AA 1F9MA 1ON4A 4D73B 4D73A 3FZ5A 2LJAA 2C4JA 2H1DA 1V58A 4IBPA 3TKSA 3ME8A 3PH9A 4FYUA 4XS6A 4V2MA 4LL4B 5J5NA 1KNGA 4GSNA 3EYTA 2VLUA 2I1UA 3DVWA 4PURA 3TJKA 1WE0A 1TKDB 5CRDA 2GSTA 4ACSA 3HJOA 5CO3A 3N9JA 3TJGA 1JLWA 5GAPD 2IMEA 10GSA 4POMA 4XRDA 2GGTA 3UIWA 1GSSA 5ID2A 4N0VA 1Z9HA 1I9DA 3I43A 3O3TA 4ECCA 2ALBA 5IIZA 4IW9A 4X43A 2YPMA 2TIRA 2EIRA 5CREA 5ENUA 4L0UA 2FGXA 3UEMA 1XBSA 2LEGA 1ERWA 4KNDA 3QPMA 2REMA 3QD9A 2VUPA 3TOTA 3LORA 3VI5A 5CRWA 1WP0A 4OFTA 4TOPA 1TI1A 4OO4A 4F03A 5DALA 5G30A 1FG4A 5DBQA 2FLSA 1OE8A 2DMLA 1VF4A 3RBTA 5DJMA 4HUAA 4IKHA 5LD0A 1YKAA 5D93A 5G31A 1TOFA 2KP1A 1FB0A 17GSA 1VRSD 5KEJA 2KUCA 2YWMA 2H6XA 1HQOA 1SJ6A 3LYKA 3DEXA 5IMFA 1NHYA 2J23A 3ZFBA 3IK9A 4ILFA 5ECMB 3U5RE 2ES7A 4MJEA 2WCIA 1M9AA 1K3LA 2VCXA 2WJUA 4NMUA 3VWUA 1XW5A 5ECNB 3UVHA 4PQHA 1K3OA 1PMTA 5HFKA 3UVTA 1U6TA 3FY7A 1ST9A 1EEMA 3A2XA 2GVPA 2WS2A 4ECBA 4AGSA 1MTCA 4ZIJA 3ZVJA 2CVBA 4MMMA 3C71A 3H93A 3TKSE 3RHBA 4KCAA 2BTOT 16GSA 2DJ1A 3D6IA 3M9KA 1OKTA 8GSSA 3F6DA 4PQIA 3IE3A 1SD8A 4Z7XA 3HHVA 4WEYA 3FRCA 2WZ9A 1M0UA 4CDOA 1GTUA 4FO5A 3FYGA 4BWSA 4BA7A 4PGTA 1DE2A 2KOKA 2H1GA 4G2EA 3JCML 4ZL9A 2YJ7A 5JCWA 4N10A 4WR5A 6GSVA 1PL1A 3ZYWA 1Z5YE 4K7NA 3M8NA 2CAIA 3F4TA 1J9BA 3G7JA 2IL3A 2YV7A 2JZSA 4GWRA 2G0FA 1XOBA 2OE1A 1T7PB 2C0EA 2HRFA 2DIYA 4KB3A 5G5FA 5HQPA 2D2ZA 5F07A 2GQMA 2L5OA 1EP7A 2TRXA 4WKWA 4H86A 2C3TA 3EMPA 2H76A 3EMXA 4IQAA 5B6MA 1JZOA 5DCGA 3UJ1A 5AIVA 3R2QA 1MDIA 3U6VA 4KA0A 3HJPA 3GA4A 1X5EA 1ZYQB 1KBNA 5G5EA 3BOAA 4ECJA 3GSSA 2PUKC 2RUFA 2BJXA 2FY6A 3VK9A 1N2AA 2X8HA 4F0BA 5JWOB 3O6TA 5A4VA 3IPZA 5JWQB 3CSJA 3TB2A 2HSYA 2O8VB 2XPEA 2DJKA 4YH2A 3D4MA 4TR3A 5DAKB 3P90A 2B6MA 4O7HA 1M2DA 3ED3A 1QMVA 3SBCA 1U88A 1F37A 3GSTA 3L9UA 3F6FA 4MJAA 2AAWA 5HR0A 1GL8A 1KTEA 5ECRB 1PD21 1FAAA 4KCEA 1OC3A 3C1RA 3TJBA 3ERGA 2B3SA 2CX3A 2DJ3A 2L4CA 1B9XC 5AISA 1DBYA 3NOFA 1S3AA 3FW2A 2LKUA 4NPBA 2PN8A 3LXTA 3EC3A 1ZL9A 1XPVA 4RUVA 3TKQA 3EU3A 1K0OA 3W6GA 1Q4JA 1TXXA 1TU8A 2PBJA 2WRTA 3P2AA 3EVIA 4OWYA 1JFUA 4G9HA 4ISDA 2H8LA 4ZL8A 4G19A 3FR6A 2FA8A 4F82A 1A23A 1M2AA 2BMXA 1U87A 1T4ZA 4IELA 4IN0A 2O89A 3DKSA 3LFLA 4G10A 1S3DA 2YANA 3ZMLA 4OCFA 1WPIA 1EV4A 5AGYA 4DVCA 2DJ0A 1ERUA 2GT5A 3AY8A 4O5RA 3QDNA 2AV4A 1M2BA 5IQYA 5D96A 3TJJA 1OAZA 4EKZA 5ECKB 4MPFA 1LU4A 3GX8A 3ZIJA 1TP9A 2NPBA 4ECIA 5D9TA 1Z7PA 5CP1A 1X5CA 2AB6A 3LWAA 4HI7A 4NWYA 1TK5B 2PPTA 5KN2A 4K0GA 4K0NA 2YOIA 5JCUA 1TJDA 1U3AA 3GH9A 4MF5A 3VWXA 2HSHA 1TDIA 4HS1A 1V98A 2OBKA 3CRUA 1FB6A 4KAEA 3C73A 1SKRB 2VOCA 3GKMA 2VM2A 4BVXA 3DMLA 2JADA 3LSZA 2FWGA 1VF3A 1Z7RA 4V2NA 3A3TA 5IMVA 4TXVA 1ZZYA 3CTFA 1ML6A 4RQRA 2LNSA 2LUSA 4XHMA 1FVKA 4EDZA 4POLA 2R3XA 2C0FA 2GQKA 3EURA 2IMFA 2B1LA 3W8SA 2OADA 2WDUA 4Q5FA 2JSYA 2FNOA 2A4VA 3QAGA 5ECHB 1ILOA 1XCCA 3CTGA 2P0GA 2GZZA 3GN3A 1YEPA 5DQYA 2VL9A 2AJQB 4X0XA 1GH2A 3QOUA 3C8EA 3PGTA 2VCVA 3BJ5A 19GSA 1AC1A 3RAZA 5LNKe 1XWGA 1R5AA 6GSXA 1QFNA 5ELAA 2R2JA 1Y6EA 2L6CA 1YZXA 1E6BA 4NHWA 1DUGA 3MSZA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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