2RIIA

Crystal structure of human peroxiredoxin i in complex with sulfiredoxin
Total Genus 49
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
49
sequence length
184
structure length
184
Chain Sequence
SGNAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYVVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRAEEFKKLNSQVIGASVDSHFEHLAWVNTPKKQGGLGPMNIPLVSDPKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITVNDLPVGRSVDETLRLVQAFQFTDKHGEVSPAGWKPGSDTIKP
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the sulphiredoxin-peroxiredoxin complex reveals an essential repair embrace.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase complex
source organism Homo sapiens
molecule keywords Peroxiredoxin-1
total genus 49
structure length 184
sequence length 184
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2007-10-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2riiA00
1U6TA 1Z9HA 4XHMA 4JEDA 4KAEA 5AIXA 2L6DA 5D96A 3WGXA 3UBKA 3GFKA 2V6OA 4ECIA 5CREA 5CP1A 2C8UA 3TKRA 2CA8A 3S9FA 1PA3A 4POMA 1X5CA 2WULA 4FYCA 5G31A 4KNDA 1WIKA 1M2AA 1VRSD 2K8SA 1PL2A 2HYXA 3F9UA 3QFBC 4ZILA 3O76A 3ISOA 1IYHA 2B6MA 3WGDA 2I81A 1R7HA 1BX9A 1J08A 3IR4A 3QFAC 3E9JB 4IVFA 1XW6A 1JHBA 4KB3A 3MAKA 4Q5NA 2EC4A 2VM2A 2AJQB 4PXOA 4BWSA 3QAVA 4V2LA 3L4NA 4KUNA 3UARA 1EP8A 4AJ7A 3BBYA 4WXTA 4EDYA 5JWOB 1PL1A 1YJ6A 2VUPA 3KH7A 5CAXA 3KGKA 2CAQA 1PX6A 1S3DA 2C3NA 3UJ1A 1YF1A 2L5OA 1GSSA 2QGVA 1TRVA 4NV5A 3TDGA 5DJMA 4IBPA 1TXXA 2F51A 4KSMA 3H8QA 2WB9A 3I6AA 4HJMA 1GLQA 1SKRB 5FHIA 3CRUA 3APSA 5GSTA 5B8BA 4ACSA 4MDCA 2GDRA 3RPNA 1K0NA 1EEJA 5G1LA 1K0OA 2H1GA 2GGTA 2MYGA 2QSIA 1A0RP 3PH9A 4PX1A 19GSA 4GQCA 4GLTA 1TTZA 4JRRA 2YWMA 4IW9A 4PGTA 2H6YA 4MF5A 1YKCA 2X8CA 3GKKA 4PQ1A 2FA8A 3F6DA 3KEBA 2HFDA 2OE1A 3BD2A 3G7IA 3ZFBA 4QL9A 1TP9A 2O89A 1QGVA 4L5LA 1K3OA 4HQSA 4JE1A 1H75A 2I9HA 1T8EB 2FUG2 1F9MA 3KMNA 1I5GA 4JBBA 1OE7A 1U3IA 3DEXA 1QUWA 2FWHA 2E2MA 3IE3A 4J56E 2BTOT 5ECHB 2L4CA 4OCFA 3TB2A 1K0BA 4OMVA 1AXDA 5IO2A 3HY2A 1UVZA 3UL3A 2DIYA 2RUEA 2IJYA 2R5GA 1JFUA 3EU3A 1XCCA 1S3AA 2PMTA 1TK0B 5HFKA 2V6KA 1PX7A 1FG4A 2IFQA 1M0UA 1SYRA 4HOJA 4XRAA 1AAZA 2EIQA 2IMDA 2WS2A 3BOAA 4X1UA 2JZRA 3VK9A 4LLRA 1XFLA 3L78A 4HUAA 3FZ5A 4I5QA 3GKNA 5GZZB 3TKPA 5IQYA 2ZNMA 1NW2A 1M99A 3TKSE 3IXRA 2DIZA 1A23A 5DCHA 1WMJA 3ME8A 4LL4B 3W8JA 3E3EA 4YQMA 4MF7A 4PQHA 1EOGA 2HZFA 4ZXGA 4EE0A 3HCZA 3CRTA 3M9KA 5HFIA 1ZYEA 1GSDA 1JZWA 1QMVA 5INYA 2GQKA 4JR4A 5J9CA 4Q5RA 6GSXA 1B9YC 1ZMAA 3VFIA 3LYPA 3ERGA 1BQ7A 3GNJA 1BJXA 2FNOA 2PPTA 3E0UA 1TW9A 2FD3A 4YQVA 3L9VA 4NPBA 5G2ZA 4FO5A 3ZREA 1BAYA 3UVTA 3LXZA 3FR9A 1T00A 2K6VA 2VCVA 2NTOA 1OE8A 2IMKA 3TJFA 3P2AA 1XIYA 3VPQA 3F4RA 2CVBA 2HI7A 2DMLA 3ED3A 1X9SB 2ON7A 5D9XA 4PQIA 2CAIA 2XHFA 4ZB9A 1OYJA 2L59A 4GF0A 3ZLPA 3VI5A 4WEYA 3GIXA 4L0UA 4WF5A 4KDYA 4G2EA 4F2IA 1ABAA 3M3MA 3MDKA 2HRFA 6GSSA 3KH9A 5IMDA 2I1UA 2VD0A 3EE2A 3HZ4A 1UA5A 2AYTA 3Q74A 4KDUA 3IBHA 4IELA 5IOWA 1SK2A 1R5PA 4AGSA 1GSYA 5GAPD 2K9FA 1GULA 4ML1A 2PN8A 1B9XC 3ERFA 1T1VA 5HR1A 1EOHA 3G7JA 2M46A 3TJBA 3IOSA 5D93A 1Z3EA 4DSSB 4J57E 3KP8A 1THXA 3U6VA 2H1BA 2DSAA 1A24A 4N0VA 2OACA 4MK3A 2DJ2A 1ERWA 1E6BA 3RAZA 3MWHA 1PKZA 4F0BA 3IA1A 3KXOA 4OFMA 4I2TA 4IQAA 5H5QA 3FKFA 3ZIJA 4DSSA 4POBA 1GRXA 3W8SA 2G2QA 3FR6A 3UOMA 1XPVA 2GS3A 1B4QA 2R2JA 3C73A 4JZQA 1WJKA 4TR3A 1YKAA 2PVQA 5ECKB 2L6CA 1FO5A 3GL3A 3VWUA 3TRPA 3LG6A 1PQNA 5IMAA 4H86A 3G7YA 4O5RA 2JSZA 2OE3A 2XPDA 4MMMA 2LQOA 3LORA 4TR4A 4N30A 5ECSA 22GSA 2YWIA 2H8LA 3DMLA 2PUKC 2HSHA 1YQ1A 3ZL5A 4OO5A 1TI1A 2NDOA 4ECJA 2H71A 3GSSA 5IO0A 3TKQA 5EY6A 2O7KA 4BL7A 1M9BA 3BCIA 1SK0A 4IS0A 2VCTA 1XOAA 4V1Ap 4PNGA 4WBJA 1XOBA 2PWJA 2YOIA 1Q98A 2YANA 3NOFA 3UAPA 3Q6OA 1JZDA 2LRTA 4NWYA 5AN1A 4EXJA 3KTLA 1EWXA 5F06A 1FOVA 1HNAA 3HKRA 3HVVA 1AIUA 5B6NA 3UVHA 2I3YA 4K0GA 4WBRD 3TJKA 3Q18A 2FCHA 3GRXA 1KBNA 5ECPB 2A2RA 4ZL8A 4NAXA 5G5FA 2B1KA 3US3A 4DSRA 5GSSA 2R6KA 1AQVA 1TU8A 5IPGA 1TDIA 5ECOB 2HLSA 5KEJA 1XVWA 1VF4A 3KM6A 4O32A 5LD0A 1B48A 3IHQA 1K0AA 4OO4A 1DSBA 4WR5A 1SD9A 2B1LA 2LUSA 1GH2A 4MZBA 1WRYA 3RHCA 1THOA 5ELAA 1PRXA 2VCZA 2GZYA 1FVKA 2NBSA 2TIRA 1ERUA 2VL9A 1MD4A 3M9JA 3C71A 4X0XA 3GSTA 1G6WA 3KZQA 1ERTA 5B6MA 5AGYA 4J2FA 17GSA 16GSA 3RHBA 3GKMA 3ZFLA 4Q5FA 2CX4A 5EVOA 1V2AA 2GQLA 1UN2A 3F0IA 4O7HA 4EL1A 2E7PA 1SYXA 1XW9A 1W89A 3I9V2 2IL3A 3CYNA 5FWGA 1PSQA 18GSA 1OC9B 2VCQA 1F6MC 1B8XA 1BYEA 1AC1A 2PBJA 3LGCA 4N0ZA 2KUCA 2CX3A 5D8IA 1XXUA 2H75A 2ALBA 3F63A 3IK7A 2V41A 4XCSA 3PR8A 2V2GA 2WZ9A 4XS6A 4BVXA 4TRXA 2VCXA 3ZIVA 3ZVJA 3U5RE 4G9HA 5ENUA 2PERA 1Z6MA 2F8FA 2FY6A 3QAGA 1OC9A 4IHUA 3F8UA 2H6XA 2R4VA 2VLTA 1U3AA 1KEBA 4GSTA 2C4JA 1BEDA 1TKDB 2LJRA 3A2XA 4IP1A 1ON4A 3GX8A 4ID0A 4MJAA 5J41A 2CVKA 3DWVA 4F03A 4G19A 1DBYA 4XTSA 1M7TA 2F9SA 2LNSA 2PVOC 4KCAA 2H01A 1AW9A 4YQUA 4ZIJA 2GZZA 4KE3A 4EF0A 1O85A 2GZPA 5D9VA 2YWNA 2R37A 2AAWA 2AB6A 3DVWA 1TRUA 2MMOA 2FA4A 2FGXA 2H74A 3C8EA 5EL8A 1URMA 2DC5A 3ZRDA 1GTIA 1VF3A 1OAZA 3Q19A 4IJ3A 4XS4B 5F05A 3M0FA 2YZHA 2JZSA 2HZEB 4V2MA 5DQSA 5B8AA 2KHPA 3J7Yk 1TI3A 2YJ7A 2VM1A 5IMVA 2HNLA 2M80A 1GLPA 4TXVA 2IMEA 2VL3A 2B7JA 3KMOA 3EMXA 1M2DA 1MEKA 1R4WA 3MNGA 1ZOFA 2B3SA 6GSTA 2HXKA 3MSZA 3F4SA 5JCUA 2TRCP 3GURA 2DBCA 3FZ4A 4XS4A 1SENA 2FLSA 2HZEA 2YNXA 2CVDA 4TKYA 5KN2A 3IV4A 3HD5A 3F4TA 3A2WA 5ECLB 1RW1A 2IFQB 5JCGA 2P31A 5C04A 5ABRA 4FYUA 3F3RA 1X9WB 1HD2A 1V9WA 1JLVA 2VL2A 5HR2A 4FIWA 4DVCA 3F6FA 2H70A 1W4VA 3D22A 3P7XA 3FEUA 1DE1A 3KD0A 4F9ZA 3EU4A 4GTUA 2EIOA 3TOUA 1SU9A 1FHEA 3L0HA 1T7PB 1V57A 2VAFA 3JCML 3A5WA 5H5SA 3N5OA 5A4UA 3P90A 4K7IA 3LFLA 3TRXA 2XBQA 3GHAA 4LL1B 4OWYA 3I43A 3HJMA 4TXOA 2OA7A 1HQOA 4K2DA 2X8HA 1Y25A 1RQMA 2HSYA 5A4WA 3A2VA 1PMTA 3GTUB 5IMFA 1X5EA 2YN1A 2C3QA 5A4VA 2JSYA 4V2NA 2JADA 3H93A 4PUFC 5G5EA 2VCWA 1DUGA 4HU7A 3A3TA 3DD3A 2YPMA 4NV2A 1Y6EA 1MDJA 1SJZA 4ZB8A 5IMCA 3IPZA 3GTUA 5FT3A 2H0HA 5DJLA 2KP1A 4EVMA 1G7OA 4FH8A 4MZWA 4F82A 2HT9A 1ACVA 1LU4A 3GA4A 1YY7A 2GT5A 4MJBA 2WRTA 4KW6A 2YV9A 4K0NA 3FYGA 1R26A 1USBA 1CQGA 3HYPA 3UEMA 2BJXA 3ZITA 3H1NA 3HVXA 2AHEA 4DSQA 3CSIA 3EVIA 3KCMA 2PU9C 3FK8A 3GH6A 1QQ2A 2LV3A 4N10A 1I9DA 3FHKA 1UC7A 4N11A 2IPAA 1V40A 4ZBAA 3CMIA 4NHZA 4MABA 4KA0A 3C1RA 1EV4A 4ECCA 3WGEA 2C0GA 1OC3A 5DDLA 4JR6A 4AJ6A 3GYKA 4WF4A 2M72A 3N9JA 4L5OA 1JZOA 1EGOA 1Q4JA 2JU5A 5CRGA 2ZUPA 3D4TA 2OBIA 3SWLA 2GSRA 1XWCA 4KSOA 2C1YA 5D9TA 4O92A 2O85A 4LMWA 2B5EA 4G10A 4PURA 2WFCA 4YH2A 4GRFA 1ERVA 4GSNA 1N2AA 5A5KA 2RIIA 4ZL7A 4I6XA 3D4MA 1CQHA 3PGTA 5ECIB 2H73A 1N8JA 3CTFA 2F8AA 4I2UA 3KIJA 2CZ2A 1GL8A 1A2MA 1GUKA 1QK8A 5DALB 4BA7A 2B5YA 1SL1B 3LSZA 1SJ6A 1K3LA 3EINA 3IRAA 1AUCA 2JL4A 1GSQA 3TKSA 2NPBA 1MDIA 2ZCTA 2YV7A 5DCGA 2LSTA 4JU5A 1YZXA 1VF1A 3C7MA 4GQFA 2V32A 3D6IA 5CNWA 2OJLA 4XRDA 4HZ4A 1LBKA 5DALA 3VPTA 2KOKA 3OR5A 1LJRA 3QD9A 2CT6A 3EURA 2L4QA 5COHA 4EO3A 4FYBA 4ULXA 2XPEA 2KP2A 4DEJA 1SL0B 1XWBA 2L57A 1V98A 1JZRA 2LNTA 2QKEA 3ZMLA 2YZUA 3GV1A 3HJPA 4KH7A 3ZTLA 1V58A 2MBTA 1X9MB 3KJYA 5J4UA 9GSSA 1A8LA 1XWKA 4MZCA 2H72A 3UMAA 2AUVA 3C1SA 3IDVA 3L9UA 1OVNA 2YJHA 4K9ZA 11GSA 3GX0A 1WPIA 2H6ZA 3ZYWA 2LQQA 2TRXA 5CO3A 2WGRA 1TRWA 1MD3A 4BVYA 3DGQA 4K7NA 2GSQA 4I97A 4HI7A 2DJ0A 5JCWA 4MJCA 2V1MA 1EZKA 4ILFA 5ECRB 6GSWA 2CV4A 5DQYA 2HE3A 2G0FA 4XIHA 2IN3A 2AV4A 3ZVJD 5JWRB 2E2GA 2GSSA 2LTKA 4QL7A 1F2EA 3BCKA 4OCEA 2C3TA 1GNWA 4L0WA 4PNFA 4MP4A 2DJ3A 1XVQA 2WDUA 4NXIA 4OD7A 1Z5YE 5KN3A 3GH9A 1TK8B 2N5BA 3L9SA 2MZCA 4MA9A 3M8NA 4AJ8A 8GSSA 2C0FA 2N5FA 2O87A 2DJKA 5LCZA 2REMA 4Z7XA 3FW2A 2H30A 4HDEA 5DBQA 2X8GA 1O6JA 1QFNA 2MMAA 3LEFA 2LKUA 2OKAA 2MBSA 3FZAA 4HU9A 2WCIA 4NHWA 2LRNA 4IJIA 1MDKA 1WOUA 1ZL9A 1T4YA 2ES7A 4GWRA 2VLVA 3P8WA 4X43A 3EC3A 5CYYA 2R3XA 1C72A 1K0CA 4RUVA 5J5NA 5GAND 4MLYA 5HR3A 1SK1A 4KGIA 1MTCA 4RQRA 2GQMA 5ELGA 1M9AA 2CZ3A 3HJOA 2WJUA 1TOFA 3QMXA 4AF2A 3LYKA 1A2LA 3APQA 4KCEA 1NM3A 5J3RA 1GUMA 3G9BA 4IGJA 4TW5A 3QAWA 6GSYA 2D2ZA 3GL5A 1H4OA 2CQ9A 3HVSA 3VURA 1TK5B 1ZGNA 1O7UA 3CBUA 4GSSA 2MMZA 4OFNA 4HJ2A 5D73A 1KTEA 4CDOA 3H4KA 5IM9A 1GWCA 1A2JA 3TUEA 2LEGA 2C0DA 1RK4A 3QDNA 2IMFA 5KN1A 3HHVA 3R2QA 4GXZA 4HQZA 5CRWA 3TOTA 2YP6A 4TR1B 2A4VA 1G7EA 2H0IA 2VO4A 5IOXA 5E4WA 1SJIA 2P5RA 2J23A 4EC0A 2H76A 3D5JA 2H1AA 2OE0A 3TGZA 5LNKe 2P0GA 4D73B 3GMFA 1ML6A 2RLIA 4YAPA 3LJRA 1AQXA 4POLA 1OKDA 1B4PA 3DVXA 3H79A 2DJJA 5HFGA 4TR1A 2LJAA 1G0TA 1GSFA 5HR0A 1O81A 4MH3A 1R5AA 3QPMA 5HQPA 2ON5A 5IMZA 2IMIA 4MH2A 4D73A 4I8BA 1ST9A 7GSSA 2OBKA 3FR3A 4WR4A 3O6TA 1S3CA 3UBLA 1O73A 3NZNA 2GSTA 4WETA 2KLXA 4EDZA 3CSJA 2DLXA 3RDWA 3V1WA 4RI6A 4IP6A 1A8YA 1NSWA 3QCPA 3WT1A 5J9BA 3VI7A 2XC2A 2B5XA 3CSHA 1WP0A 1X0RA 3TJGA 5H5RA 5E59A 1ILOA 1PD21 2VOCA 3PINA 1FAAA 3TRQA 3DXBA 4K1FA 1XZOA 4K8MA 4KX4A 4TXOB 3GUSA 4ZBDA 4PUAA 1F3BA 2L5LA 4L8EA 4TN8A 3K8NA 3VWVA 1A0FA 2H19A 1SKWB 4BWQA 1E2YA 1ZCPA 3D0ZA 2LS5A 4E8EA 2VIMA 4ECBA 1NHOA 2K8VA 1GTAA 5CRHA 3KTBA 1HNCA 2PGTA 3GN3A 1FB0A 2P5QA 1J9BA 2BMXA 3DRNA 1HNBA 2JACA 12GSA 3W6GA 14GSA 3CXGA 4MPGA 2VL2C 1EGRA 2RM5A 1YDKA 5G30A 4K6XA 3DYRA 1DE2A 4WKWA 1PKWA 2NVLA 2EIRA 2I4AA 3WD6A 5CRDA 1XBSA 1GUHA 2VD1A 1EV9A 3RPPA 4E8HA 1SL2B 4YAVA 2X64A 2XBIA 1ZZYA 1SD8A 2YWOA 1X5DA 2E0QA 2YCDA 3ERWA 3I69A 2FWFA 2DJ1A 2FHEA 2OADA 1KNGA 4XS1A 4IKHA 4TVEA 4K7OA 1GP1A 1K3YA 10GSA 1F3AA 6GSUA 1IYIA 1U88A 4OFTA 4CHSA 5F07A 2LJKA 1Z7PA 3AY8A 1PN9A 5ID2B 4HEA2 3WYWA 1GSEA 1GSUA 1T4ZA 1XW5A 2H1DA 4BPYA 3EMPA 3WT2A 3LWAA 2B7KA 4EKZA 5ECMB 5DAKB 3O3TA 1TRSA 5ECNB 3CTGA 1K0MA 1NHYA 1JLWA 4IQ1A 4MPFA 5ID2A 5KN0A 3IC4A 3RBTA 4CW9A 5D9WA 3QR6A 5AIVA 1T3BA 2IIYA 1YF0A 5B7CA 1QXHA 1FW1A 2X99A 1HYUA 5DAKA 5F0GA 3IAM2 3FY7A 2GVPA 4EUYA 3IK9A 1OKTA 4NMUA 1K0DA 20GSA 1ZYQB 2F3MA 4P3YB 2VLUA 4KDXA 1EEMA 3HA9A 4ZB6A 4Q5QA 1XWGA 3HZ8A 2N5AA 4HZ2A 5F8BA 4RI7A 5DVBA 4ZL9A 4MF6A 2C0EA 2Z9SA 3SBCA 5AISA 3F3QA 4MCUA 2A2SA 1YEPA 4V1Ag 13GSA 1GTUA 4QQ7A 3J7Yb 2GLRA 1Z6NA 2H0GA 3EYTA 1O8XA 2DMMA 3M1GA 3TJJA 5IIZA 4ZBBA 2RUFA 2FWGA 1G6YA 1WE0A 5IPHA 3VLNA 4ML6A 1Z7RA 1XWAA 4TR0A 3VWXA 1O8WA 5C00A 4TOPA 3FZ9A 1VF2A 1VGLA 4F0CA 2MMNA 1F37A 5L71A 3APOA 4LMVA 5JWQB 4ISDA 2FWEA 4RQXA 3TKSC 5EPFA 4HS1A 5G1KA 4GCIA 2K18A 1AQWA 3ZZXA 2J9HA 3DKSA 1U87A 2C80A 3D21A 3ZMKA 2IWTA 4IN0A 2JZTA 3BJ5A 1EP7A 1TU7A 1YEXA 1FB6A 1J0FA 3DIEA 2HRNA 3QOUA 2LRCA 3KP9A 4MJEA 1SKSB 5ECQB 3IAS2 3NIVA 3LXTA 3VWWA 1OC8A 1GTBA 4POKA 3TCOA 1BG5A 2H66A 3HDCA 3LQ7A 3EWLA 1WWJA 3UIWA 1PGTA 2RM6A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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