2V2GA

Crystal structure of the c45s mutant of the peroxiredoxin 6 of arenicola marina. monoclinic form
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
220
structure length
220
Chain Sequence
GITLGEVFPNFEADSTIGKLKFHDWLGNSWGVLFSHPRDFTPVSTTELGRVIQLEGDFKKRGVKLIALSCDNVADHKEWSEDVKCLSGVKGDMPYPIIADETRELAVKLGMVDPDERTSTGMPLTCRAVFIIGPDKKLKLSILYPATTGRNFSEILRVIDSLQLTAQKKVATPADWQPGDRCMVVPGVSAEEAKTLFPNMEVKAVPSGKGYLRYTPQPKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Crystal Structure of the C45S Mutant of Annelid Arenicola Marina Peroxiredoxin 6 Supports its Assignment to the Mechanistically Typical 2- Cys Subfamily without Any Formation of Toroid- Shaped Decamers.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Arenicola marina
molecule keywords PEROXIREDOXIN 6
total genus 71
structure length 220
sequence length 220
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2007-06-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain2 2v2gA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2v2gA01
3IAS2 2OE0A 2VLUA 3TKRA 5E59A 5IMCA 2R5GA 1JLWA 1PL2A 1PX7A 1YF1A 1T00A 1V9WA 2F51A 3QD9A 4K9ZA 3QFBC 4KX4A 1ERVA 3CSHA 4GLTA 4AJ8A 5EVOA 4FYUA 1IYHA 3GH6A 1HNAA 1GSFA 1SL0B 4KGIA 4TR1B 2TRXA 5J9BA 3I69A 1A0RP 1X9WB 1MDJA 5IMDA 5HFIA 1XOAA 1M2AA 3EU3A 4V2NA 2YWOA 1YZXA 3LQ7A 4QQ7A 1G6WA 1I5GA 3HKRA 2LJKA 2VCWA 5DDLA 1U3AA 5GAPD 2V1MA 1NSWA 4TR4A 3IK9A 3F4SA 4JBBA 6GSUA 2J23A 1T8EB 3KJYA 4NAXA 4XIHA 1G6YA 4MJBA 4IGJA 1RQMA 10GSA 4J2FA 2DJ2A 4KW6A 5J3RA 2H8LA 5CNWA 3TCOA 4JRRA 3S9FA 4QL7A 5A4WA 5FT3A 2F8FA 4K0NA 3G9BA 1SJIA 2PVQA 4MCUA 4HOJA 3M0FA 2G0FA 3H8QA 5DCGA 4OD7A 4K7NA 1WMJA 4I2TA 4J57E 3TRXA 4OO5A 1RW1A 4MABA 1ERWA 3TKPA 5AN1A 1TRVA 1DE1A 4HDEA 2L4CA 3DWVA 3GKMA 2H1GA 3LFLA 5IMVA 4EVMA 2GQKA 1T4ZA 4NV5A 4JU5A 1O85A 2YV9A 1PRXA 5F06A 2LRCA 3TDGA 5IM9A 1VRSD 1XCCA 2L5LA 1MDIA 1SD9A 2K8VA 13GSA 4MJAA 4XS1A 2OACA 1GLQA 3GSTA 5ECHB 2IMFA 4MPFA 1VF1A 5CAXA 3VPQA 2O8VB 4PUFC 4KE3A 4FO5A 5DCHA 1Z6NA 1A2MA 1XVQA 3FZ5A 2IWTA 3FRCA 2A4VA 5L71A 5C00A 4XS4B 5IO0A 3MDKA 5D9WA 2EIRA 4O92A 2ALBA 4PXOA 1HNCA 2DJJA 2IL3A 5F07A 3L78A 2NVLA 1TK8B 2MBTA 2H1AA 2QSIA 3HCZA 1TTZA 2FY6A 1QFNA 5DALA 4LMWA 3UIWA 2C0DA 1T7PB 2LV3A 2FA4A 3GYKA 2B6MA 3TJBA 2AAWA 8GSSA 1KEBA 4IKHA 5HR3A 1XFLA 2H30A 1LBKA 2I9HA 3CMIA 1XZOA 4MLYA 2M72A 5HR1A 5J5NA 1M2BA 2RUEA 2HZEA 5IMZA 3C1SA 4NWYA 3LJRA 2IFQB 5EL8A 3HVVA 4MJEA 3LYPA 5DQYA 1A8LA 2RLIA 1SKRB 2EC4A 3UOMA 3GA4A 2HXKA 5C04A 2RM5A 4K0GA 5D9VA 1G7EA 1K0OA 2PVOC 2LJAA 1GP1A 1YQ1A 3GMFA 1ACVA 1Z7RA 3GTUB 3KCMA 2C80A 2RUFA 2K18A 4J56E 5G1KA 4ZL7A 1O8WA 5ECKB 2F8AA 4TR0A 1FVJA 3ME7A 2C1YA 1GSUA 2E2GA 5IO2A 3GKNA 2R37A 1ZMAA 4WKWA 3TJGA 4EL1A 5CP1A 5B6MA 1O8XA 1X5CA 2L6DA 2WB9A 3UJ1A 4Q5RA 5G30A 4MMMA 4ILFA 2FGXA 1WPIA 2H19A 1AUCA 1WOUA 2IMDA 3MAKA 3D6IA 2JL4A 4JR4A 1QQ2A 5DAKA 1FO5A 3ZFBA 1S3CA 2VM1A 5AISA 2WDUA 1SK0A 3GIXA 2VCVA 3W6GA 1GUHA 4Q5FA 1T3BA 4I8BA 4RUVA 1EOHA 4ZBAA 2OE1A 4YAPA 5AIVA 2H0GA 4KSOA 3W8JA 4IN0A 2WCIA 3CRUA 5H5RA 4DSSB 1ZZYA 2DLXA 3WT2A 1YKCA 2AUVA 1AAZA 2LJRA 2WRTA 3DIEA 1XWGA 5J4UA 2GZPA 2FWEA 1XW5A 3HDCA 3HYPA 4TXOA 1TK0B 1PGTA 4POMA 1A2LA 1PKZA 4HJ2A 2LS5A 2P5RA 4IELA 3KGKA 1YJ6A 5ECOB 2GZZA 2G2QA 3ZZXA 4OFTA 4HUAA 3U6VA 2C3QA 4CHSA 3RHCA 4YH2A 2H1DA 2CVBA 1UC7A 2O89A 1GULA 2H73A 4MF5A 2V6OA 2FNOA 3CBUA 3TKQA 1TRSA 5ECMB 1ERTA 1WJKA 4WBRD 1K0AA 3WGXA 3TRPA 5D9TA 5F05A 2JZRA 1DUGA 5D93A 2CAQA 2YANA 5IMAA 4F0CA 2GSSA 2H74A 5IMFA 4D73B 2YWMA 1DSBA 1OC9B 4XCSA 4HQSA 2B7KA 1K0BA 5H5SA 3ISOA 5IPGA 3ZMLA 4TR1A 2L6CA 4L5OA 3H93A 4PUAA 2RIIA 1XW9A 2PUKC 4EDZA 1BX9A 1R4WA 1YEXA 1EEJA 18GSA 2KOKA 1YKAA 1SK2A 1GTUA 2Z9SA 4MF6A 2PGTA 1UA5A 4WBJA 1DBYA 2VD1A 2BMXA 1TI3A 2JADA 3BCIA 5D8IA 1PMTA 5HFGA 4ULXA 3ZIVA 1OE7A 4GXZA 2LSTA 1QXHA 1TP9A 22GSA 1TK5B 2IN3A 2ON7A 2N5BA 3KD0A 4OFMA 1FOVA 3IAM2 1M0UA 2DMMA 4XRDA 2CQ9A 1JZRA 3KM6A 4K7OA 1GNEA 2H75A 2LNTA 4ECCA 2VO4A 3L0HA 4CW9A 3PGTA 19GSA 2V2GA 4HZ4A 2TIRA 1NW2A 2CZ2A 1KBNA 2DC5A 1B9XC 4Q5QA 3F8UA 1EEMA 5FHIA 3VWXA 5HFKA 5B8AA 1OVNA 2H0HA 4N0VA 3QCPA 3NOFA 4DEJA 2ZNMA 2M80A 2FUG2 1K0DA 3VWVA 1ZCPA 1IYIA 3L9VA 1JFUA 1HYUA 5H5QA 2AV4A 3TOUA 5EPFA 4NXIA 3TJKA 2R3XA 3Q18A 3ZITA 1F9MA 3CXGA 3ZL5A 1A2JA 4IHUA 3F3QA 4BA7A 3PH9A 5J9CA 3GKKA 2FWGA 2KUCA 4H86A 1U6TA 2K8SA 4K7IA 3C8EA 1ZYEA 4IQ1A 3ERWA 4XS4A 2GLRA 4BL7A 5HR0A 2GTUA 4BPYA 1ST9A 1OC3A 1HD2A 4HEA2 3APOA 5FWGA 3LGCA 4MK3A 3TKSC 1X9SB 1AXDA 3IOSA 3FK8A 3QMXA 1WP0A 3GKXA 5ECNB 1SL1B 2EIOA 5CRGA 2H66A 2LRTA 4GWRA 1M9AA 1HNBA 1U88A 2L59A 1GLPA 4IBPA 3I6AA 2XPDA 5B7CA 5ECRB 5ENUA 4LMVA 2YN1A 1TI1A 4I6XA 4ECBA 3IR4A 2BTOT 1USBA 3QFAC 4HJMA 3IC4A 3O6TA 1A0FA 5GZZB 2ZCTA 2DSAA 2IFQA 2GSRA 2VLVA 4EO3A 4WR5A 1THOA 4V1Ap 4Q5NA 2GS3A 4V2LA 2LNSA 2MBSA 1W4VA 1F37A 4X43A 2H72A 5ECSA 1F2EA 5G2ZA 3GTUA 2DJ0A 4LL4B 2AB6A 2C3TA 2ZUPA 3UMAA 4MF7A 2IPAA 1OKTA 3RAZA 1K3YA 3PR8A 3J7Yk 4YQMA 3D4MA 1S3AA 3M3MA 2V32A 2FD3A 1J0FA 4K6XA 2LQQA 2VCXA 5KN3A 3TJFA 1X5EA 5G31A 4TRXA 3GURA 2R4VA 3LG6A 4MZWA 2YZHA 2ES7A 2F9SA 4NMUA 1XBSA 5D96A 2LTKA 2HT9A 4ZB6A 4PURA 3N5OA 4JZQA 2YPMA 4GCIA 2GDRA 1I9DA 1EV4A 1PQNA 3TRQA 1OAZA 5ID2B 1JZDA 4EDYA 1GL8A 1RK4A 2B5YA 3F6DA 3C73A 4NV2A 3ZMKA 4V1Ag 2A2RA 2JSZA 3FEUA 1URMA 3FKFA 2H0IA 5CREA 2L5OA 2CX4A 2DIZA 3GUSA 5GSTA 1BYEA 3QAVA 2X8GA 1K0CA 4F0BA 1B4PA 1C72A 4O32A 5E4WA 2CV4A 2MMAA 4DSSA 4WETA 4CDOA 1GSDA 2C8UA 3VLNA 1J9BA 2L4QA 2FHEA 1PD21 3GL5A 5CRDA 3P7XA 2I1UA 1Q98A 2YJ7A 3GH9A 3IE3A 9GSSA 1Z9HA 4X1UA 2B7JA 1Q4JA 1EP7A 2HRFA 1TOFA 2YP6A 3D22A 3QOUA 4YQVA 3ZREA 4MZCA 3KXOA 3KIJA 3H79A 3FYGA 4TR3A 1B8XA 1ERUA 3KH7A 3APQA 4KA0A 5DVBA 2X8CA 1A23A 2QGVA 3HJPA 2HE3A 3VK9A 3P90A 3IBHA 1GSSA 2DJ3A 4G10A 3UBLA 3Q19A 3ZVJD 1KNGA 4POBA 1E2YA 2KHPA 4PQHA 17GSA 4TVEA 2GSQA 2CVDA 1M99A 3D4TA 4ID0A 3QR6A 2PWJA 1OC9A 3FZ9A 3IA1A 4I97A 1QUWA 2NPBA 5JCGA 4MZBA 4IVFA 3M1GA 3N9JA 1FVKA 2R2JA 1VF4A 2XC2A 4GRFA 3EMPA 4ECJA 4TN8A 3IPZA 3VPTA 2DJ1A 4O5RA 1XPVA 4OMVA 5ECPB 1K0MA 1ZL9A 4KSMA 1PN9A 1QMVA 1Z7PA 5AIXA 4RI7A 4PQIA 3A3TA 5A4VA 6GSXA 3SWLA 2VD0A 2OE3A 3FW2A 5A4UA 1V40A 1BJXA 1B48A 1XWCA 1FAAA 4I2UA 2KLXA 3HVSA 5F8BA 4E8EA 2VLTA 4DSQA 6GSTA 3FR3A 3FR6A 3WD6A 4RI6A 1R7HA 1Z5YE 1SYXA 3LSZA 2JACA 20GSA 1FHEA 1F3BA 1EOGA 3FZ4A 3LEFA 1PX6A 1AQWA 3QAGA 1HQOA 3WYWA 1M9BA 3LYKA 5KN1A 3DD3A 3I9V2 2V6KA 3VI7A 1X5DA 4LLRA 4DSRA 2FWHA 4JEDA 3GFKA 3JCML 2NBSA 1GTIA 5CRWA 3DGQA 1GSQA 2HSHA 3IV4A 3TGZA 5KN2A 4MJCA 1YEPA 2IMKA 3H4KA 4GQFA 1GTBA 1PL1A 4GTUA 4HU7A 4ZBBA 5AGYA 2VL2A 1U87A 4WXTA 3VURA 3A5WA 2CA8A 4MPGA 4F82A 3KP9A 4ZXGA 3HVXA 3MNGA 3E0UA 3BD2A 1XWAA 4YAVA 3F0IA 1ML6A 3L9UA 4P3YB 2YCDA 1MD3A 1VF3A 4TXVA 3P8WA 1TXXA 1ILOA 4ECIA 2K9FA 3UVHA 1GRXA 4EC0A 2O87A 1SD8A 4EKZA 3NZNA 4QL9A 2OKAA 2WJUA 3K8NA 3GV1A 3MSZA 3EC3A 1ON4A 1PA3A 2GT6A 1EP8A 1N8JA 1FB6A 2C4JA 2E7PA 3CYNA 4POLA 1O73A 3DKSA 1H75A 1U3IA 5A5KA 4TOPA 4IW9A 3M9KA 2I81A 4EUYA 3BOAA 2LEGA 3CTFA 1YDKA 1YF0A 3RPNA 4Z7XA 1TRUA 5ECIB 1R26A 3IK7A 3F4RA 1TU8A 4EF0A 1GUMA 3CTGA 3DXBA 4IP1A 2JZSA 3A2XA 1QGVA 3UEMA 5ELGA 5GAND 2P5QA 1NHOA 4MP4A 1SJZA 3EURA 2H1BA 3KTLA 2HSYA 4XHMA 1EWXA 2CX3A 4OO4A 4AJ6A 3EVIA 4ZILA 4IJIA 2N5AA 3E3EA 1F3AA 2V41A 3HY2A 2HI7A 2C0FA 2HYXA 3O3TA 5D9XA 3F63A 1GSEA 4FH8A 4IP6A 1CQGA 3F6FA 3TUEA 1MEKA 3ZLPA 2X64A 1SJ6A 4BWSA 1QK8A 2L57A 1VGLA 3DMLA 2IMEA 2NDOA 2GZYA 4MH2A 2RM6A 3HXSA 2JSYA 3F3RA 1FG4A 2O7KA 2I4AA 3KTBA 5ID2A 4JE1A 5KN0A 1F6MC 2OADA 2PERA 4L0WA 2XPEA 4KCEA 2B5EA 1TDIA 3Q6OA 1AW9A 3TKSE 3M9JA 1SK1A 2QKEA 1MDKA 2IJYA 3DRNA 1A8YA 4N11A 3OR5A 1OC8A 5IOXA 3MWHA 1NHYA 5ABRA 3DVWA 2IMIA 11GSA 4ZIJA 4XTSA 3EE2A 3I43A 4KB3A 1ZYQB 2H70A 3A2VA 3TB2A 2TRCP 1XOBA 2VAFA 4NHZA 2HZFA 2XBQA 4FIWA 3D21A 4GQCA 2YZUA 2OA7A 1SENA 3FY7A 4ACSA 4KDUA 2HFDA 2K6VA 3HJMA 3G7YA 1S3DA 4E8HA 1XWKA 2B1KA 2OBIA 1NM3A 4N10A 4OCEA 4L8EA 4ML1A 2CZ3A 3CRTA 1Y25A 4OFNA 5DJLA 1V57A 12GSA 1OYJA 1R5AA 3ZYWA 3US3A 2H71A 2CVKA 3QDNA 4TW5A 2X8HA 4V2MA 3EYTA 1GSYA 1BAYA 4F2IA 5IPHA 3EMXA 2PMTA 2VIMA 1CQHA 3EWLA 1UN2A 2CT6A 3GL3A 1TKDB 2IIYA 5JWRB 4L5LA 5LD0A 4TKYA 4DVCA 2YNXA 5CRHA 2OJLA 2LQOA 3RHBA 3L4NA 5CYYA 1EV9A 3GRXA 2P0GA 3BJ5A 1EGOA 1A24A 4X0XA 3LXTA 2C3NA 2HRNA 2WZ9A 5F0GA 4NPBA 4G9HA 4OWYA 2VUPA 4PX1A 2VCTA 1G0TA 3ZVJA 5EY6A 4EXJA 2VOCA 3GX8A 1GH2A 3G7JA 5B8BA 2LUSA 4K8MA 1J08A 3IXRA 4ZL9A 1TRWA 5JWQB 4HS1A 4PQ1A 1X0RA 1SYRA 3G7IA 1ZGNA 5KEJA 2DBCA 3HJOA 1SKWB 2CAIA 3Q74A 3CSJA 3HA9A 1MTCA 1O6JA 1VF2A 2DMLA 5HR2A 1AC1A 4WF5A 2HNLA 3IHQA 3W8SA 1GUKA 3APSA 5DQSA 1JLVA 4KDYA 4NHWA 2J9HA 2PN8A 1TJDA 4HQZA 2GQMA 2BJXA 1GTAA 1V2AA 5G1LA 2N5FA 3U5RE 1AIUA 4AJ7A 4K1FA 1ZOFA 3F4TA 1O7UA 4GSSA 2MMZA 4XRAA 2GSTA 2WGRA 5J41A 5CO3A 4G2EA 4EE0A 2H6YA 3D5JA 1JZOA 2FA8A 4F03A 1OE8A 4D73A 4KCAA 5GSSA 3HZ8A 1TW9A 4POKA 2AJQB 1KTEA 3RPPA 4WR4A 4HZ2A 1K3OA 1YY7A 1UVZA 2R6KA 3TOTA 3RDWA 4KNDA 1XW6A 2DJKA 3CSIA 3FHKA 2P31A 2XHFA 3NIVA 4N30A 1MD4A 5IOWA 1T1VA 3WGEA 4MA9A 1O81A 1SU9A 2VCQA 4AGSA 3EINA 4BVYA 2MZCA 4BVXA 3R2QA 3WT1A 4N0ZA 2VCZA 3M8NA 4MDCA 14GSA 2PBJA 2M46A 1H4OA 2NTOA 4XS6A 4L0UA 3ED3A 2D2ZA 2H01A 1GNWA 3ZTLA 5DJMA 1WE0A 1BEDA 2B5XA 2YWIA 4MH3A 2GQLA 3LXZA 3KH9A 4LA1A 3KZQA 3KP8A 4HI7A 3DYRA 2FLSA 3C71A 1M2DA 3ZFLA 2X99A 2LKUA 5IIZA 1V58A 3WGDA 4GF0A 3BBYA 2HLSA 4JR6A 3PINA 2KP2A 2GGTA 3UAPA 1TU7A 4K2DA 3FZAA 3UVTA 2GT5A 3DVXA 6GSVA 3EU4A 2WS2A 1ABAA 4PNGA 1PSQA 2MMNA 3IDVA 3E9JB 4YQUA 5INYA 3A2WA 2FWFA 3O76A 2H6ZA 3GX0A 5JCUA 2ON5A 5LNKe 3ME8A 3VWUA 3KEBA 1XIYA 2VL9A 1B9YC 3L9SA 5ELAA 4GSTA 1DE2A 1LJRA 5ECQB 4KUNA 5DALB 2FCHA 2C0EA 2F3MA 3AY8A 4GSNA 4O7HA 3F9UA 4KH7A 2WFCA 3HD5A 1B4QA 5D73A 3VWWA 2JZTA 1JZWA 4IQAA 2YOIA 3J7Yb 2A2SA 6GSWA 2HZEB 4RQXA 1AQVA 4PNFA 1E6BA 2H6XA 1OKDA 1AQXA 1G7OA 5COHA 4RQRA 4PGTA 1XVWA 1W89A 1BG5A 2DIYA 2EIQA 1WWJA 3D0ZA 3ERGA 1THXA 2I3YA 2YWNA 2B3SA 3C1RA 3TJJA 2B1LA 3H1NA 3LWAA 4ZB8A 3ZIJA 3LORA 3C7MA 3KMNA 6GSSA 1Z6MA 16GSA 3IRAA 3RBTA 3GNJA 1EZKA 2XBIA 2MYGA 5DBQA 3HHVA 3DEXA 1WRYA 3TKSA 5G5FA 4G19A 1SL2B 4ML6A 1R5PA 2E0QA 2GVPA 4WF4A 1SKSB 4I5QA 3GSSA 1LU4A 4ZL8A 5B6NA 1K3LA 3VI5A 1FW1A 1WIKA 1Z3EA 6GSYA 1T4YA 5JCWA 4FYCA 3P2AA 1Y6EA 2MMOA 2PPTA 2QC7A 3HZ4A 1N2AA 5DAKB 4IJ3A 4FYBA 2AYTA 1M7TA 1XWBA 1XXUA 3FR9A 1PKWA 4ZBDA 3ZRDA 5G5EA 2KP1A 1K0NA 2REMA 2OBKA 3SBCA 4OCFA 1JHBA 4WEYA 4ISDA 3GHAA 4HU9A 2VL2C 2WULA 4IS0A 3QPMA 2O85A 3V1WA 3BCKA 3KMOA 7GSSA 2PU9C 2E2MA 2YV7A 3VFIA 3UARA 2AHEA 4TXOB 3UL3A 4AF2A 5IQYA 5HQPA 4LL1B 2H76A 2VM2A 5ECLB 5JWOB 1BQ7A 1X9MB 5LCZA 2YJHA 4F9ZA 3ERFA 2LRNA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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