2V32A

Crystal structure of the c45s mutant of the peroxiredoxin 6 of arenicola marina. monoclinic form 2
Total Genus 71
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
71
sequence length
220
structure length
220
Chain Sequence
GITLGEVFPNFEADSTIGKLKFHDWLGNSWGVLFSHPRDFTPVSTTELGRVIQLEGDFKKRGVKLIALSCDNVADHKEWSEDVKCLSGVKGDMPYPIIADETRELAVKLGMVDPDERTSTGMPLTCRAVFIIGPDKKLKLSILYPATTGRNFSEILRVIDSLQLTAQKKVATPADWQPGDRCMVVPGVSAEEAKTLFPNMEVKAVPSGKGYLRYTPQPKS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The Crystal Structure of the C45S Mutant of Annelid Arenicola Marina Peroxiredoxin 6 Supports its Assignment to the Mechanistically Typical 2-Cys Subfamily without Any Formation of Toroid-Shaped Decamers.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Arenicola marina
molecule keywords PEROXIREDOXIN 6
total genus 71
structure length 220
sequence length 220
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2007-06-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain2 2v32A02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2v32A01
2GVPA 5ID2B 1UC7A 1WP0A 1VF3A 1EP8A 5F06A 4H86A 6GSVA 1NW2A 2H6XA 2OE1A 3KJYA 2RLIA 2R37A 5G31A 1I5GA 3EE2A 3UAPA 3L78A 4I8BA 4KNDA 2LSTA 5F05A 4JRRA 3Q19A 4ML1A 5G1LA 4HDEA 4OD7A 4K1FA 5AISA 5D73A 2C3QA 2RUFA 1U6TA 4IS0A 3PR8A 1GUMA 1LU4A 2YANA 3NOFA 4PX1A 1GH2A 5J9CA 1TK0B 2VD0A 2TIRA 2N5FA 4MPFA 3TKSC 3C1SA 2L4CA 3WGDA 1ERWA 1OKTA 1QXHA 2L6CA 2X64A 3M1GA 1YF1A 1QUWA 2GZYA 4OCEA 1GSDA 2IFQB 2A2SA 1TRUA 1PRXA 2CAQA 3IK7A 2BTOT 2YN1A 2YV9A 3L9VA 2OACA 2GS3A 3EMXA 2R5GA 2VM1A 3HJPA 4MH2A 3VWVA 3E3EA 1A2LA 1X9MB 1H4OA 2JADA 2B6MA 5IM9A 4F9ZA 2H0GA 2VIMA 3ISOA 4YAPA 3CSIA 1K0MA 2WCIA 3EURA 3CSHA 3F4TA 3D4TA 2CT6A 1XW9A 5EL8A 3W6GA 2VO4A 5C04A 2IMDA 1ERVA 4RI7A 3KH9A 3KXOA 2FWGA 5B7CA 4MPGA 3QMXA 2FNOA 1EEMA 1FVKA 2PWJA 1TOFA 1RK4A 3M9JA 1TP9A 1URMA 2WJUA 1XWAA 1HQOA 3FY7A 1AIUA 1ST9A 1XW5A 1EGOA 3IE3A 4MDCA 1PSQA 4ZB9A 1GSQA 3IC4A 3QOUA 5CAXA 4K2DA 1FB6A 3GX8A 1FOVA 3WGXA 2YPMA 4ZL8A 6GSTA 2PU9C 2CVDA 2WZ9A 4BWQA 4KH7A 1ERTA 3O3TA 3C1RA 5IOXA 4BPYA 3LGCA 4MMMA 2B5YA 3UEMA 5D93A 4EL1A 1W4VA 3ED3A 4YAVA 1IYHA 2PVOC 2HLSA 3TKSE 1B4PA 2B7KA 2V6KA 5LCZA 3EC3A 1GLPA 5G30A 3QCPA 5GAND 2PBJA 4I6XA 5J5NA 1TI1A 3LEFA 3Q74A 1PX7A 3KM6A 4EXJA 4GQCA 2R4VA 5KEJA 1ZYEA 2H30A 1TRSA 1K0DA 1E6BA 3HJMA 5A4UA 1CQGA 3A2WA 4LL1B 3ZITA 3V1WA 3EU3A 4PUAA 4DSSB 1ABAA 11GSA 2VL2C 1YDKA 5C00A 4FYBA 2E7PA 5ECLB 3LYKA 2OKAA 1O7UA 2PUKC 4RQRA 3TKPA 2OADA 4OFMA 5IO2A 2VLUA 1T4YA 3AY8A 1AXDA 4RUVA 2NVLA 4ECIA 4ZL7A 4WKWA 3TOUA 4WR4A 4TXOA 1X5EA 3GHAA 3FZ4A 4XCSA 1XBSA 3VLNA 1XXUA 3IA1A 1V58A 3UL3A 4IGJA 4YQUA 3FHKA 2LUSA 4POLA 1WWJA 1SJIA 3KP9A 5HR3A 3WGEA 1Z6MA 2V32A 4YQMA 1U87A 5GAPD 2LJKA 3FEUA 3ZYWA 4MABA 4KB3A 2NBSA 1JZWA 1BQ7A 4F0CA 2HRFA 4G9HA 2OBKA 3G7IA 3VFIA 1T1VA 4N10A 4TR3A 1WE0A 3HZ4A 17GSA 4GQFA 4BA7A 2A4VA 3D0ZA 4ML6A 2LJAA 4XS6A 1AUCA 1B9XC 1XWBA 3TJKA 2GGTA 1TRWA 3DEXA 3FYGA 3DYRA 2J23A 5D9TA 2I3YA 1HYUA 4V1Ap 3BOAA 1AAZA 1ZCPA 3S9FA 3ZREA 3BCIA 2C4JA 2LNSA 2OJLA 3IXRA 2C0DA 3D4MA 3RBTA 2YJ7A 5A4VA 2NDOA 1O73A 3ZLPA 2QSIA 4MF7A 4AJ7A 3BCKA 3FZAA 1QGVA 1NM3A 1F3BA 2M72A 1S3DA 3GIXA 1OAZA 4ZILA 1SJZA 1EV9A 1H75A 3M8NA 5J9BA 3EU4A 1TXXA 5DJMA 2QC7A 3UARA 4KCAA 2VAFA 4BWSA 4F82A 1QFNA 4KW6A 4RQXA 1K3YA 1PL1A 3HZ8A 3MDKA 1WOUA 2P5RA 4KSOA 3VWWA 3EVIA 2YP6A 1THOA 3J7Yk 4NPBA 5COHA 4PQ1A 4WF4A 2MBTA 3GSTA 3HJOA 4HQZA 4OO4A 1XPVA 2X8CA 3IHQA 1R5AA 4MJAA 3VPQA 2NTOA 1PQNA 2FLSA 2L4QA 4KX4A 4HZ4A 4OO5A 2F9SA 3MNGA 4F03A 2HYXA 4MLYA 1G7OA 1FW1A 3TJGA 5IMZA 1PMTA 4NV5A 5D9XA 5E59A 4ZB8A 2C0GA 2HNLA 4I5QA 1XWCA 3ZL5A 4K7OA 4MZCA 3EYTA 3F4RA 3TJJA 4AF2A 2CVBA 2FA4A 4K9ZA 4POKA 5LNKe 3P90A 4TR1B 5ECPB 5DVBA 3ME8A 3ZFBA 3MSZA 4WEYA 5F8BA 2X8GA 2FCHA 3J7Yb 8GSSA 3U6VA 1EGRA 1SKWB 3LXZA 4TW5A 3UOMA 2H0IA 4K0GA 1ML6A 1DSBA 5HR1A 2JU5A 2YWIA 5AN1A 4ZBDA 2GZZA 3CTFA 2NPBA 1Y6EA 2C0FA 3R2QA 2I1UA 4K0NA 4ECCA 3RPPA 1K0AA 1PL2A 2H66A 2YZUA 3DGQA 2L59A 1B9YC 5B6NA 1T8EB 4Q5QA 2VCWA 1X9SB 4V2MA 1JZRA 2Z9SA 5D9VA 5DQSA 2N5BA 2MBSA 2M46A 2P31A 2H1GA 1O81A 4GCIA 2K18A 3LQ7A 2VCXA 2JACA 1ZL9A 1SJ6A 2LS5A 3CRUA 2ES7A 4K6XA 3DWVA 1KBNA 4IN0A 2DJJA 1A0FA 2XC2A 2H73A 2KP2A 1M2DA 3M0FA 2LEGA 2KUCA 5ECIB 1Y25A 2KLXA 3LG6A 4ZB6A 1GNEA 2VUPA 3N9JA 5B8AA 2I81A 1TRVA 4IHUA 2JZTA 3L9UA 4BVYA 3GNJA 3VWUA 19GSA 5D8IA 4GSTA 4OCFA 1SK0A 4OFTA 5G5FA 3FW2A 16GSA 1YKCA 2H6ZA 3FK8A 5G5EA 2CV4A 4DEJA 2LQQA 1K0NA 5D9WA 4N30A 7GSSA 2O87A 2H0HA 1UN2A 1WRYA 2F8AA 1XW6A 4IW9A 2BMXA 4Z7XA 2B3SA 2QKEA 1HNAA 4X0XA 2PVQA 3C73A 4N0ZA 4PNFA 2RUEA 5ECQB 4JEDA 4O7HA 1ZGNA 2CZ2A 1G0TA 4HJ2A 1ERUA 2GSQA 1GTIA 3M3MA 3HA9A 4LL4B 6GSXA 1Z3EA 3RHBA 1YQ1A 2IIYA 5LD0A 3BD2A 3F0IA 1K0OA 5HFIA 5JWQB 2XBIA 2OE3A 3FKFA 4XHMA 1G6YA 5ELAA 2EIRA 3C7MA 1WMJA 1S3CA 4TRXA 4N0VA 4YQVA 3ZIVA 1PX6A 1XVQA 3FR9A 2YWNA 3TJBA 1ZOFA 2VL3A 1M2AA 3D6IA 3ZIJA 2B7JA 4K7NA 5DCGA 3L9SA 2AAWA 3PINA 2F3MA 3G9BA 4GTUA 1A2JA 5ECHB 1SL1B 4MZWA 1B8XA 1YF0A 3DD3A 4QL9A 1AQWA 4PUFC 4O32A 3HVXA 1O85A 4MH3A 5IPGA 1FG4A 4DSSA 1TKDB 3P2AA 3IOSA 4AGSA 3M9KA 4FH8A 5EVOA 1I9DA 4KDYA 1K0BA 5B8BA 4GSSA 1M7TA 4EKZA 2J9HA 5IQYA 3Q6OA 5ECKB 4EO3A 3DRNA 4GRFA 4POMA 2FA8A 2GSRA 4GXZA 2K9FA 4ISDA 1RQMA 3TRXA 5ECOB 3ZFLA 2V1MA 4D73A 1UVZA 3IV4A 3KTLA 2XPEA 3TDGA 6GSSA 3LFLA 1NHOA 5IPHA 1OC9B 2EIQA 1HNCA 1YJ6A 1GUKA 4CHSA 2DJ0A 4TVEA 5JCGA 4WR5A 4IVFA 1PA3A 4NV2A 3IR4A 5DAKA 4Q5NA 1GL8A 3IAM2 4L5LA 4XS4B 3N5OA 3F6FA 3H8QA 1WJKA 4MA9A 4EUYA 3APQA 3I43A 1AC1A 1LJRA 2OA7A 1R26A 2EIOA 2M80A 1SK2A 4J56E 3ZMLA 2C80A 2MMZA 5H5SA 4PURA 2FWFA 1JLVA 1Z5YE 3QAGA 3I6AA 3O76A 3HHVA 1SENA 5ECRB 1XWKA 4TKYA 3GL3A 1DE1A 2OE0A 4ZXGA 3KP8A 3UJ1A 2IN3A 4EE0A 2C0EA 3UBLA 1TTZA 1OYJA 4TN8A 1X5DA 2I4AA 2YJHA 2V6OA 2B5XA 5DCHA 4JBBA 2KOKA 1VGLA 5J3RA 1WPIA 4LMVA 1GSSA 4QL7A 1F37A 3IAS2 3UVTA 5DALB 3F63A 4MF5A 4XS1A 4JZQA 3UMAA 1R7HA 4HUAA 1XVWA 4PGTA 4E8HA 2V2GA 3VURA 5KN0A 4ZIJA 4L5OA 3RHCA 2FHEA 2X99A 14GSA 3UVHA 4OMVA 1ILOA 4D73B 3GFKA 3GL5A 2I9HA 1ZYQB 3QAWA 2FWHA 1SK1A 3I69A 5H5QA 1GTAA 2HXKA 1RW1A 1U3AA 1GSEA 4L0WA 1AQVA 1Z6NA 2A2RA 2DMMA 3VWXA 5ELGA 3G7YA 3L0HA 4DSRA 2LRCA 4MJEA 4BVXA 3ME7A 5DAKB 2N5AA 2AYTA 4ECJA 3LJRA 4Q5FA 5CNWA 4ULXA 2R2JA 2PN8A 5ECMB 4IELA 1M0UA 3HVSA 1TK8B 5KN2A 3BBYA 3H79A 4K7IA 3A3TA 1SD9A 1XIYA 2LNTA 4HS1A 5B6MA 3GH9A 2LRTA 1TU7A 2JSZA 5CRWA 1EWXA 2B5EA 2P0GA 3WD6A 2K8SA 4TR1A 4ZL9A 2LQOA 2R3XA 4HU9A 3VPTA 1Q4JA 4HU7A 1Z9HA 4MJCA 2GSSA 3FZ9A 1O8WA 4O92A 2VCVA 4ZBAA 4JU5A 4L8EA 2AHEA 3GRXA 4ID0A 4PNGA 3U5RE 2CAIA 4K8MA 3A2XA 3GYKA 3KH7A 2L5OA 4HQSA 3E0UA 1A24A 3K8NA 1DE2A 2GQKA 1UA5A 3ZZXA 1PKWA 4I2TA 5G2ZA 1FB0A 1SYXA 1MDJA 4MK3A 4JE1A 2H01A 1BYEA 2ON5A 2MZCA 3NZNA 1J9BA 4TOPA 4WF5A 3CMIA 3TKRA 1GTUA 2B1LA 1AW9A 2H74A 2IWTA 5FHIA 1VF2A 4LMWA 1A0RP 2IJYA 1OKDA 2MMAA 5IMCA 1FHEA 1VRSD 2GZPA 4IP1A 2HZFA 1QK8A 3SWLA 1F6MC 4KDXA 5AIXA 4KGIA 1G7EA 2D2ZA 2DJ3A 1XCCA 1T3BA 1BX9A 2H6YA 2VL2A 2IPAA 3IK9A 5IMAA 5FWGA 1DUGA 1CQHA 1MTCA 4V2NA 4F0BA 2MMOA 3GV1A 1V98A 4ILFA 4F2IA 4IBPA 1SYRA 1NSWA 4POBA 1YKAA 4XIHA 2ZNMA 1VF4A 2CQ9A 1SL0B 4MJBA 3EINA 3ZTLA 2GT6A 5HQPA 1J0FA 1XZOA 2WFCA 3RAZA 3UIWA 3FR6A 2IMIA 3KD0A 4J2FA 2PMTA 4TR4A 1K3LA 5D96A 3G7JA 3D22A 3I9V2 1TJDA 2YWOA 3FZ5A 2HZEB 1KNGA 2G0FA 4QQ7A 12GSA 2YV7A 2ZUPA 2YWMA 2VLVA 1ACVA 1BG5A 4IP6A 2LTKA 2IMFA 3KTBA 1BJXA 5CO3A 1GWCA 2VCZA 3F6DA 3F4SA 4V2LA 3CBUA 5IMDA 3L4NA 1XOBA 4AJ6A 2F51A 4KSMA 3GTUB 3ZVJD 5ECSA 2YCDA 5ABRA 2DJ2A 2FGXA 2E0QA 3GUSA 4BL7A 4KDUA 1FO5A 3GKNA 2GT5A 4J57E 2RM6A 2RIIA 3D21A 5CRHA 4N11A 3C71A 3GMFA 1OC3A 4X1UA 2GLRA 4EF0A 1X9WB 2X8HA 3TRPA 3GA4A 5ENUA 1VF1A 1Z7RA 1QMVA 2VCQA 4IJ3A 1GLQA 3CSJA 4I2UA 3ERWA 1Q98A 3O6TA 1XFLA 3LSZA 1THXA 4NHWA 4E8EA 3GKKA 2DIZA 1MEKA 1MD4A 5KN1A 1OC9A 3WT1A 3RDWA 1N2AA 1GUHA 2HFDA 1ZMAA 2BJXA 2P5QA 2LRNA 3CYNA 4CW9A 4IQ1A 1K3OA 3HXSA 2TRCP 4XS4A 3F3RA 2E2GA 3VK9A 4KCEA 5JWRB 3FR3A 2DJKA 5IIZA 1GP1A 2WGRA 1YZXA 4V1Ag 2DMLA 3KMNA 2CZ3A 5CYYA 1XWGA 3KGKA 4WBRD 1R4WA 3IPZA 1E2YA 4FO5A 3CTGA 1EZKA 1ON4A 3JCML 2C3TA 2C1YA 1TW9A 4CDOA 5F07A 5H5RA 1JFUA 3RPNA 3PH9A 5DDLA 1JZOA 1F3AA 5JWOB 1M99A 3LORA 3GKXA 2LKUA 3HD5A 3H93A 3DVWA 1A8LA 3TCOA 1HD2A 1F9MA 5FT3A 2O7KA 3CXGA 2MMNA 1SKSB 1TI3A 3LYPA 1FVJA 4FYUA 5HR2A 1GTBA 4OFNA 1TU8A 4OWYA 4PXOA 3QD9A 4Q5RA 2DLXA 2VOCA 5DALA 3TUEA 1GNWA 3EWLA 3SBCA 2C3NA 1J08A 3HKRA 3IBHA 3HYPA 2IMEA 4GWRA 5DJLA 2TRXA 4NXIA 1YEPA 2HE3A 4XRDA 3QFBC 2ON7A 1GSFA 2HSHA 3PGTA 1YEXA 4P3YB 5AIVA 3KIJA 2L57A 1V9WA 5IMFA 5IMVA 2AUVA 1JZDA 6GSUA 5CREA 1W89A 1TK5B 3QDNA 2XHFA 3KCMA 2HRNA 1V40A 5EY6A 3W8JA 2B1KA 2L5LA 2H70A 4MF6A 4L0UA 1X5CA 2MYGA 3E9JB 4IKHA 2F8FA 1U88A 1Z7PA 4IJIA 2H1DA 1S3AA 5A5KA 3GX0A 2JL4A 2GQMA 2JZRA 1M9BA 1EOHA 1MDKA 2GDRA 2ALBA 1EOGA 1GULA 3W8SA 2LJRA 1JLWA 2VL9A 2HSYA 3TKQA 3TOTA 1KEBA 5F0GA 1V57A 20GSA 2AJQB 3F3QA 2G2QA 4JR6A 4X43A 3TKSA 4DSQA 4ZBBA 2WDUA 3CRTA 5E4WA 2DBCA 4LLRA 1PN9A 2FY6A 2L6DA 1MDIA 3H1NA 6GSYA 1QQ2A 4ACSA 4I97A 1HNBA 1M2BA 1WIKA 3LWAA 3IRAA 1O8XA 5DBQA 1BEDA 4TXVA 3VI5A 3HCZA 2O85A 2R6KA 1BAYA 2DSAA 2DJ1A 1OE7A 3TRQA 3VI7A 4WETA 4KAEA 4DVCA 1XOAA 2IL3A 2GTUA 2GQLA 3WT2A 2YNXA 2H71A 2H19A 3ERGA 2ZCTA 3DXBA 3A5WA 3NIVA 4HI7A 4HOJA 2VM2A 5KN3A 1IYIA 2H75A 2H76A 2HI7A 5CP1A 1PGTA 2VLTA 1PD21 2O89A 3QAVA 13GSA 1GSYA 1TDIA 2XBQA 3TJFA 4NWYA 3HVVA 4WXTA 1EV4A 3QR6A 5J41A 2H72A 2WULA 3ZVJA 4EDYA 1AQXA 1MD3A 5L71A 3DKSA 2DC5A 4NAXA 1GRXA 3KEBA 3DVXA 5GSSA 1M9AA 2QGVA 5A4WA 4MZBA 4TR0A 18GSA 5INYA 5GZZB 4GLTA 3LXTA 1A23A 3ERFA 3IDVA 4EDZA 2JSYA 3DIEA 1F2EA 2K8VA 1LBKA 3QFAC 1C72A 2HZEA 1T4ZA 1A8YA 1OC8A 3ZRDA 1T7PB 3OR5A 4KA0A 4HJMA 2DIYA 2H1AA 5IOWA 4WBJA 4GF0A 4LA1A 5IO0A 2KP1A 3APOA 1O6JA 1EP7A 2CVKA 5ECNB 2XPDA 5JCWA 2YOIA 2CX4A 1PKZA 4FIWA 2PGTA 1SL2B 4TXOB 5DQYA 3GH6A 3APSA 4MP4A 2C8UA 3TB2A 4MCUA 5G1KA 2E2MA 2WRTA 2HT9A 4YH2A 5HFGA 4ECBA 3HY2A 3GKMA 3FRCA 2VCTA 1N8JA 4NHZA 2KHPA 3WYWA 2CX3A 1X0RA 5HFKA 3DMLA 3P7XA 4XTSA 1ZZYA 1U3IA 3GTUA 4EC0A 1DBYA 1JHBA 5J4UA 2H1BA 4G19A 1USBA 4EVMA 3BJ5A 2JZSA 5HR0A 9GSSA 4AJ8A 1GSUA 1R5PA 22GSA 4FYCA 3GN3A 6GSWA 5ID2A 1K0CA 1YY7A 4HEA2 1NHYA 5AGYA 2FWEA 2AV4A 3GURA 3H4KA 4G10A 3TGZA 5CRGA 3A2VA 4O5RA 2AB6A 5CRDA 5JCUA 2H8LA 2IMKA 2RM5A 2OBIA 3MAKA 4GSNA 2WB9A 3C8EA 3HDCA 3QPMA 3P8WA 4PQIA 2VD1A 4KUNA 3KMOA 4JR4A 4PQHA 4HZ2A 4G2EA 2PPTA 3F8UA 2EC4A 2REMA 3D5JA 1OE8A 2O8VB 1SU9A 4IQAA 2K6VA 1OVNA 1B4QA 2IFQA 3KZQA 4RI6A 1T00A 1B48A 3ZMKA 1G6WA 2WS2A 1V2AA 3UBKA 1SD8A 1A2MA 1EEJA 3MWHA 1SKRB 4XRAA 2V41A 10GSA 5GSTA 2GSTA 2LV3A 3Q18A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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