2VL2C

Oxidized and reduced forms of human peroxiredoxin 5
Total Genus 41
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
41
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
APIKVGDAIPAVEVFEGEPGNKVNLAELFKGKKGVLFGVPGAFTPGCSKTHLPGFVEQAEALKAKGVQVVACLSVNDAFVTGEWGRAHKAEGKVRLLADPTGAFGKETDLLLDDSLVSIFGNRRLKRFSMVVQDGIVKALNVEPDGTGLTCSLAPNIISQL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
molecule keywords PEROXIREDOXIN-5
publication title The Crystal Structures of Oxidized Forms of Human Peroxiredoxin 5 with an Intramolecular Disulfide Bond Confirm the Proposed Enzymatic Mechanism for Atypical 2-Cys Peroxiredoxins.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 41
structure length 161
sequence length 161
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2008-01-08

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
C PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2vl2C00
2O85A 4TR1A 2IFQA 4EE0A 4BL7A 3GKNA 1GSSA 1RQMA 5G5EA 2WZ9A 4BVYA 2B6MA 1ZL9A 1SK1A 5E4WA 2JACA 1M2BA 1OC8A 2LNTA 4TR1B 2LTKA 1OC3A 2XC2A 1HYUA 5DDLA 2ALBA 4POMA 5IOWA 4MMMA 3APOA 4D73A 3RPNA 1G7OA 5IMDA 4MZCA 1FVKA 2IMIA 2WRTA 3P2AA 3D5JA 1B9YC 1QUWA 1G6YA 1AIUA 2DIZA 1GLQA 4K8MA 5LNKe 1TK0B 4MF7A 4D73B 3G7IA 4GSNA 2ON5A 3TKQA 2N5FA 2NVLA 2H8LA 2WGRA 5GAND 2GQMA 3VWUA 3HY2A 4F03A 5DCHA 4MDCA 2DC5A 5J4UA 1FG4A 1B48A 1BG5A 1J08A 3WGDA 5LD0A 1XVQA 5H5RA 2JSYA 4PQIA 1QFNA 2C0GA 2H75A 5DQYA 2H73A 2VCWA 1UVZA 1GH2A 4F2IA 1ILOA 1FVJA 1S3AA 1O6JA 12GSA 4HS1A 1GSDA 2V6KA 1PL1A 3I6AA 3R2QA 5KN0A 2O89A 1SD9A 2C1YA 4IBPA 4PQHA 3ERWA 4IGJA 1EEMA 3CSHA 2JL4A 5COHA 3HCZA 5HR2A 2QKEA 5ENUA 1VF1A 2OKAA 2DMMA 3HVXA 1R4WA 2PU9C 2HSYA 5D93A 4N0VA 1X9MB 2AJQB 2F9SA 4K2DA 5HFKA 1FOVA 4TVEA 3TRXA 22GSA 1TU8A 3KTLA 3MDKA 1B4QA 3FZAA 2E2GA 4TRXA 5G5FA 5ECQB 1PA3A 3D21A 3O76A 1WE0A 3FYGA 3NIVA 2VCQA 5CRHA 2VCVA 2M80A 5J9CA 2YZUA 1MEKA 4IKHA 3C71A 4KNDA 2H01A 1X5CA 1XW5A 3GKKA 1YJ6A 4FYCA 4DSQA 4MJAA 5ECHB 1U3IA 1DUGA 2PPTA 2L5LA 4PUAA 2CQ9A 6GSWA 5J5NA 4NPBA 3QFAC 2H74A 5JCUA 3ZZXA 4GCIA 1V9WA 1EGOA 3PH9A 4AF2A 2V2GA 5A4WA 3P90A 5IPHA 2VCZA 2CVKA 3DEXA 4J2FA 4ZIJA 3D4MA 4BWQA 2PBJA 2R4VA 3QAVA 1J0FA 1SYXA 1ML6A 4RQRA 2H76A 4HU9A 3H79A 1EWXA 2TIRA 3ZREA 3TB2A 3WT2A 2PUKC 1XBSA 1PQNA 1SK2A 2GZPA 19GSA 3WYWA 3A3TA 4YH2A 4E8EA 2QGVA 4KUNA 4JZQA 4CDOA 2LQQA 1WP0A 5B8BA 4WXTA 4LMVA 2PVQA 3WT1A 4HI7A 1SJ6A 3IK9A 3IR4A 2JU5A 2LNSA 5ID2A 4GRFA 4BVXA 3IOSA 4DSSA 2G0FA 2GZZA 5ECIB 4N0ZA 5IO0A 3TOTA 2K18A 2O8VB 1JZDA 3L78A 1OC9A 4XIHA 3J7Yb 2L6CA 3KM6A 3DYRA 4DSSB 4L0UA 4N11A 2H1AA 4IP1A 4ECIA 3N9JA 1M2DA 5ECOB 5FT3A 1X5EA 3GNJA 3QAGA 6GSSA 2AB6A 1OC9B 2TRXA 2GDRA 3TJKA 4LA1A 5DJLA 1RW1A 2GS3A 2LRCA 3ZFLA 1FHEA 3FR9A 1K0DA 2OBIA 1XWGA 5KEJA 2IWTA 3GTUB 5GAPD 2K9FA 5F06A 4PNFA 3ZYWA 1PSQA 1SK0A 3ZVJD 1F3AA 3IV4A 2H6ZA 4GQCA 3RBTA 4TR0A 1Y6EA 2GSTA 3FRCA 5ELAA 1N8JA 3F63A 1A8YA 4IW9A 2NDOA 2H1BA 1WWJA 5JCWA 5IO2A 1MD4A 4V1Ap 3DGQA 4FO5A 3F8UA 3I43A 1XOAA 1ERUA 2CAIA 2DJ2A 1Z6NA 2FCHA 3TKSA 2H19A 2H1DA 1Q4JA 4AJ6A 1WIKA 1PX6A 4ZXGA 2PGTA 1JFUA 1YF1A 3GURA 3Q6OA 1U3AA 2VL2C 2FUG2 2H6YA 2MZCA 2EIQA 3A2XA 1NSWA 2F8FA 4N10A 5EL8A 4KB3A 2GZYA 4TN8A 5CP1A 4NMUA 2A4VA 3BJ5A 4OO4A 3KEBA 2YOIA 2BTOT 2YWMA 3FZ4A 2OA7A 5A5KA 2VL2A 4HJMA 7GSSA 4XRDA 5CREA 1GNWA 2X64A 4GQFA 1N2AA 2H6XA 2V1MA 3GUSA 1TTZA 2HT9A 1AXDA 5D9WA 1QQ2A 5IM9A 5JWOB 4J56E 4H86A 6GSUA 2MMNA 2C0FA 3TKRA 1V40A 4G2EA 1EZKA 3UBLA 4ZBDA 1TRWA 1U6TA 2DJ1A 5IQYA 3HJOA 2NBSA 1ZYQB 3W8SA 4AJ7A 4IJ3A 2I3YA 1R26A 4POKA 3F4SA 4MF6A 4CW9A 2GT5A 6GSVA 3J7Yk 5D9TA 1U88A 3C1SA 18GSA 4PURA 5ECPB 3CTGA 5CRDA 2H0HA 2YCDA 2KP2A 1WMJA 4WBRD 2HXKA 5A4UA 2AHEA 3CYNA 4NAXA 1AQWA 2CV4A 4HQSA 3FR6A 2PWJA 3ZIVA 3QCPA 1KNGA 1GRXA 4MF5A 1GSFA 2E2MA 2VIMA 4ZB8A 1PN9A 1T4YA 1G7EA 2YNXA 4GF0A 1TI1A 3US3A 4ZBAA 1EEJA 2HZFA 3LG6A 3LEFA 5ECRB 4HZ4A 5CRGA 3IBHA 4EUYA 4J57E 5D9XA 4KCEA 3G7YA 4PGTA 2VLUA 4WF4A 5J41A 3VLNA 1PMTA 3VI5A 2YJHA 1ZCPA 1XW6A 4GTUA 1K3YA 4OWYA 4IN0A 2YP6A 2V41A 1XPVA 3HJPA 1R5AA 3IDVA 5IIZA 2WS2A 2JZSA 3FHKA 1LBKA 2FA4A 4DSRA 1HNCA 4KDXA 1PGTA 5DVBA 2MMAA 3FEUA 4RUVA 3DVWA 2YV7A 3LORA 4ZB9A 2E7PA 5ABRA 2AAWA 2H0GA 3HZ4A 3F6FA 4MJBA 2DJKA 3KD0A 1B9XC 5HR3A 1IYIA 4K7IA 1GSEA 2HE3A 4WF5A 1O85A 3CBUA 3CRUA 1GSQA 3ZIJA 2HSHA 3F9UA 4IS0A 4XRAA 1IYHA 3F0IA 2CAQA 2K6VA 2LUSA 4GLTA 1T8EB 2KP1A 3TJFA 4G19A 3DMLA 3V1WA 5CNWA 1T7PB 2N5BA 3APSA 3UMAA 2K8SA 4ZBBA 3UIWA 3GL5A 2YWNA 2WCIA 3PINA 4OFNA 3TRPA 2B5XA 1VRSD 1Z7PA 4EC0A 3RHBA 5IMZA 3HYPA 1TK5B 1W89A 3FZ5A 3HXSA 1VF2A 4MK3A 5G2ZA 5IOXA 4PXOA 5D73A 3RHCA 5JCGA 5AISA 4ID0A 2RUEA 2BMXA 3UJ1A 5GSSA 2WB9A 4YAPA 4ECBA 3QPMA 3MSZA 2C3NA 3H4KA 1TXXA 3EMXA 5DAKA 1OKTA 3H8QA 3QMXA 4I2UA 2VM2A 4ML6A 1M9AA 1MDIA 3M1GA 1C72A 3OR5A 2REMA 5GSTA 3DKSA 4OCFA 4HEA2 2H66A 2GVPA 1XW9A 5DAKB 2IL3A 5IMAA 4JR6A 1F3BA 3GSSA 5F05A 1AQXA 3VPTA 3KCMA 2PMTA 4ECCA 1OE8A 1Y25A 5DJMA 4OCEA 4K6XA 1GL8A 3BOAA 2I1UA 1VF4A 3BCKA 4MZWA 3ME8A 5LCZA 3HHVA 1FB0A 4EF0A 1GP1A 1SENA 3KXOA 3L4NA 3EMPA 1A24A 6GSXA 1TJDA 2LRNA 2FWEA 3GA4A 3KP9A 1ZOFA 1MDJA 3GX8A 1M0UA 4IQ1A 3BBYA 2WFCA 3W8JA 3ZMLA 5CAXA 1OVNA 3GKXA 2I81A 5HFGA 2MMZA 5EY6A 4JU5A 3MWHA 3IK7A 5HR0A 2F3MA 1GUHA 3UVHA 3BCIA 1YZXA 4XTSA 4MZBA 1XFLA 3LXTA 4QQ7A 4HQZA 3UOMA 1TRSA 2CZ3A 2MBTA 2YV9A 5B7CA 4OD7A 1K0CA 4TR4A 1EOGA 2NPBA 2VUPA 2XHFA 4KW6A 1K0OA 5IMFA 5AIXA 5CRWA 1EOHA 2B7KA 1H75A 1JLVA 2ZNMA 3GN3A 5G1KA 3ZL5A 4V2MA 4IVFA 1AQVA 1X0RA 3C8EA 4TW5A 5IMVA 2GT6A 2JZRA 4NV2A 4O92A 4PQ1A 2LS5A 2LSTA 2QC7A 4FH8A 4TOPA 13GSA 2IMEA 1CQGA 3G7JA 3ZVJA 4V2LA 1V98A 2L59A 4KSOA 4KX4A 2HFDA 2LQOA 8GSSA 3TKSE 2YWOA 3WD6A 3M3MA 4TKYA 2VD0A 1EV4A 4JBBA 3M9JA 4L5LA 2JADA 3GHAA 3L9UA 4EL1A 3KH7A 3WGXA 2I9HA 2VOCA 5B8AA 1AC1A 4K0NA 1VF3A 1YDKA 3GTUA 4O32A 5ELGA 5ECKB 3GH9A 5G30A 4ZB6A 4PNGA 1QXHA 3WGEA 4Q5RA 1OAZA 2VCTA 5J9BA 1BJXA 1GSYA 1XWAA 2ZCTA 4WETA 2IMDA 2R6KA 4Q5FA 3VPQA 3HKRA 3VI7A 4OFMA 4I97A 2WDUA 4NHZA 3O3TA 1R5PA 1K0NA 2PERA 3JCML 5G31A 1USBA 3PGTA 1S3CA 4ACSA 2H30A 4EO3A 4IJIA 3C1RA 3GX0A 5G1LA 5C00A 4Z7XA 2YANA 3CTFA 3FZ9A 3TGZA 2DLXA 3IAS2 1Z9HA 4YQUA 1ON4A 5HFIA 1XXUA 4LLRA 1O8XA 2VL3A 2RM5A 1KBNA 3EE2A 2R5GA 2M46A 5ECNB 1T00A 2IN3A 4Q5NA 5EPFA 5GZZB 4TXVA 1JLWA 3M8NA 3KIJA 4KAEA 3MAKA 2A2RA 1QK8A 3GKMA 2GQKA 4XCSA 4WBJA 2V6OA 5AIVA 4MH2A 3KJYA 4IELA 4G10A 2KLXA 4K7OA 1F37A 1I5GA 5ECSA 2GGTA 3QDNA 1YY7A 2C4JA 3F4RA 20GSA 3GYKA 1WJKA 3ME7A 2CZ2A 2GSRA 1PKZA 1AAZA 2VCXA 3G9BA 1SL0B 1DE1A 1ERWA 1EV9A 1PL2A 14GSA 2FWGA 2WJUA 2C3TA 4I8BA 4MLYA 1BYEA 1GWCA 3MNGA 3TCOA 11GSA 3FY7A 3SWLA 3S9FA 1A2LA 1M99A 4QL9A 4MJCA 1GTAA 1J9BA 3KH9A 4KDUA 3D0ZA 4XS4A 4CHSA 5HR1A 3LJRA 1A0FA 1K0BA 2L4CA 4NWYA 4QL7A 1SKSB 5AN1A 4EXJA 4RI6A 4XS4B 1XZOA 3ERFA 4LL4B 2K8VA 1K0AA 4I5QA 4KDYA 2IMFA 4AJ8A 2QSIA 3Q74A 1O8WA 3F3RA 2O87A 2FD3A 2FHEA 4ZILA 3A2WA 3IE3A 2KHPA 2XPEA 1BAYA 3GH6A 5ECMB 1MDKA 4XS6A 1GUKA 4MABA 3C73A 4F0BA 1V57A 2I4AA 1FO5A 2OADA 5IMCA 2C0EA 3HD5A 5F0GA 2FLSA 4WR4A 1TOFA 4BWSA 4X0XA 5D8IA 2DJ0A 1TKDB 4JEDA 1G0TA 4WKWA 4FIWA 1T3BA 1G6WA 4WEYA 2RM6A 6GSYA 1SL2B 1ERTA 3A2VA 3IC4A 1TU7A 2NTOA 1SD8A 3ZTLA 2OJLA 3UBKA 3VFIA 2MBSA 1ZYEA 3QOUA 5B6MA 4MCUA 1EP8A 4KCAA 3FK8A 4ULXA 2WULA 4K7NA 1GSUA 1XWBA 1E2YA 2IPAA 3QR6A 3LFLA 1QGVA 1SL1B 1V2AA 4ISDA 1YKAA 3ERGA 2B1LA 1DE2A 1SYRA 4NV5A 1X5DA 2LV3A 3ISOA 2RLIA 2VD1A 3LXZA 5E59A 4KE3A 3ED3A 2ON7A 4F82A 1CQHA 1TRUA 4ILFA 3LGCA 2B3SA 3DD3A 1ZZYA 2IFQB 2JSZA 3Q18A 4F0CA 3LWAA 1XIYA 2AYTA 3EU3A 2XPDA 2OBKA 5D96A 3U5RE 2CVDA 5IPGA 4BA7A 3VWWA 1TP9A 3IRAA 3GV1A 1MD3A 3VWVA 1Z6MA 2FWFA 1TRVA 5H5SA 4GWRA 4O7HA 1KTEA 3KMNA 16GSA 5H5QA 1ST9A 3E3EA 2ES7A 5DQSA 3L0HA 3CXGA 1GULA 3UL3A 1OE7A 1A2JA 4O5RA 2F8AA 1ABAA 3A5WA 1A2MA 1W4VA 2DBCA 4G9HA 1NHYA 3F4TA 1YKCA 3RAZA 4E8HA 5J3RA 1H4OA 1XCCA 2XBQA 4POBA 1X9SB 5CYYA 2MYGA 2YPMA 4LMWA 1XWCA 2DJ3A 1A0RP 1T1VA 3KGKA 3NZNA 4ECJA 2PVOC 2H0IA 2LRTA 2GSQA 2OE1A 3QD9A 1AW9A 1I9DA 2P5QA 1B8XA 4OFTA 2DJJA 2H1GA 1FAAA 1ZGNA 3GIXA 2X8CA 3M0FA 1Z7RA 5A4VA 5B6NA 3TOUA 3LQ7A 2KUCA 4DEJA 4MPFA 1M7TA 4ZL8A 3AY8A 5FHIA 3FKFA 3IHQA 4MJEA 2VO4A 1PX7A 2EIRA 17GSA 1SJZA 3EINA 3H1NA 3NOFA 3L9SA 2IMKA 2J9HA 3FR3A 3D4TA 3GL3A 4POLA 5JWQB 4EVMA 3W6GA 2HRFA 2GLRA 3DRNA 4K0GA 5KN2A 5HQPA 1PRXA 1ZMAA 3KMOA 4WR5A 2HYXA 2OE0A 4HDEA 2M72A 3LYPA 1VGLA 4FYBA 3APQA 5L71A 2X8HA 3TJBA 2J23A 5DALA 3ZFBA 3EURA 1M2AA 4HUAA 1YEXA 1URMA 1JHBA 3DXBA 3KZQA 4FYUA 4DVCA 4GSTA 4BPYA 1K3LA 5DALB 4P3YB 4ZL9A 1O7UA 5F8BA 1NM3A 5ECLB 1WPIA 4YQVA 4F9ZA 2FGXA 1TDIA 5JWRB 1TK8B 3K8NA 2P5RA 2YJ7A 1GUMA 1F2EA 4AGSA 1HD2A 1DSBA 3I9V2 4IHUA 1O81A 3GSTA 1MTCA 2O7KA 1M9BA 4EDZA 4TXOA 3ZITA 1UN2A 4NHWA 2N5AA 4PUFC 4MA9A 1JZRA 1SU9A 4K1FA 1TW9A 2RIIA 2YN1A 2VL9A 4MPGA 1ERVA 4L5OA 4TXOB 1B4PA 1Z5YE 5KN3A 1R7HA 1YEPA 4OO5A 3Q19A 4Q5QA 1GTUA 4I2TA 2BJXA 2V32A 1A8LA 2OACA 3SBCA 1WRYA 3PR8A 1PD21 2LJKA 4GSSA 1KEBA 2CA8A 3HA9A 3L9VA 1E6BA 4MP4A 5ID2B 2F51A 3H93A 1LJRA 4HU7A 1LU4A 6GSTA 2GQLA 3BD2A 2LKUA 4NXIA 3VK9A 4PX1A 4HZ2A 3ZMKA 2IIYA 1T4ZA 2XBIA 3M9KA 4RI7A 1O73A 4HOJA 2EIOA 1WOUA 2G2QA 3E0UA 1NW2A 5DCGA 3U6VA 3CSIA 3TJJA 4IQAA 4KSMA 4YQMA 4GXZA 3KTBA 3IPZA 2GSSA 3TDGA 2H70A 3EC3A 2H71A 4RQXA 2HI7A 1U87A 1FW1A 1RK4A 3N5OA 3TKSC 2KOKA 3TRQA 4HJ2A 4JRRA 2R3XA 5KN1A 5INYA 3TJGA 3RDWA 4XHMA 2P0GA 1QMVA 3LSZA 4X1UA 4TR3A 1NHOA 2HLSA 3UVTA 2AUVA 4MH3A 2L4QA 3FW2A 3GRXA 1V58A 3KP8A 2EC4A 1SKWB 2VM1A 3DVXA 4V1Ag 1A23A 1OYJA 3QAWA 3O6TA 3HJMA 1XWKA 1BX9A 2C0DA 2LJAA 1BEDA 1HNAA 9GSSA 5F07A 1PKWA 3TKPA 3ZLPA 4JR4A 3D22A 3LYKA 2ZUPA 5C04A 1EGRA 2JZTA 3RPPA 4K9ZA 1THOA 1GNEA 4L0WA 4V2NA 2R2JA 4ZL7A 2L57A 2FY6A 2X8GA 2L5OA 4IP6A 3F6DA 1K0MA 2D2ZA 1AUCA 1XVWA 2C8UA 1UC7A 1SJIA 1GTBA 4YAVA 2C3QA 3VWXA 4I6XA 3TUEA 3IXRA 2DIYA 2Z9SA 3P8WA 4ML1A 2C80A 4LL1B 3CRTA 4XS1A 1BQ7A 1UA5A 3EU4A 2FNOA 1X9WB 3HZ8A 1Z3EA 3UAPA 1DBYA 3EWLA 3GFKA 2CX3A 4KGIA 1S3DA 2FWHA 2RUFA 2P31A 2FA8A 1SKRB 5CO3A 3D6IA 5D9VA 3HVVA 1GTIA 2MMOA 1F9MA 3I69A 3GMFA 3CSJA 2LEGA 3DIEA 1K3OA 3IAM2 2LJRA 2HZEA 4OMVA 1OKDA 2L6DA 3DWVA 1YF0A 1HQOA 3UEMA 4X43A 2DSAA 1YQ1A 2B5YA 1XOBA 3CMIA 3IA1A 2VAFA 3HVSA 2E0QA 3E9JB 3F3QA 2X99A 2HZEB 2PN8A 2A2SA 2YZHA 2VLTA 2HRNA 1HNBA 2B7JA 1Q98A 2CT6A 4KH7A 3EYTA 2VLVA 2DMLA 4KA0A 2GTUA 2CX4A 5FWGA 1JZWA 1THXA 4L8EA 2IJYA 2B1KA 1FB6A 2OE3A 1GLPA 3HDCA 2TRCP 4EDYA 2YWIA 2R37A 5EVOA 3C7MA 2B5EA 2AV4A 3EVIA 2CVBA 3QFBC 2HNLA 1F6MC 1ACVA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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