2ZCTA

Oxidation of archaeal peroxiredoxin involves a hypervalent sulfur intermediate
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
240
structure length
235
Chain Sequence
PLIGERFPEMEVTTDHGVIKLPDHYVSQGKWFVLFSHPADFTPVTTEFVSFARRYEDFQRLGVDLIGLSVDSVFSHIKWKEWIERHIGVRIPFPIIADPQGTVARRLGLLATHTVRGVFIVDARGVIRTMLYYPMELGRLVDEILRIVKALKLGDSLKRAVPADWPNNEIIGEGLIVPPPTTEDQARARMESGQYRSLDWWFCWDTPASRDDVEEARRYLRRAAEKPAKLLYEEA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Oxidation of archaeal peroxiredoxin involves a hypervalent sulfur intermediate
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Aeropyrum pernix
molecule keywords Probable peroxiredoxin
total genus 78
structure length 235
sequence length 240
chains with identical sequence B, C, D, E, F, G, H, I, J
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2007-11-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.1020.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 Antioxidant, Horf6; Chain A, domain 2 2zctA02
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 2zctA01
1T4YA 1PN9A 1EV4A 3FKFA 3APOA 2XPEA 5EY6A 5IMZA 5CO3A 2IIYA 2VO4A 5ID2B 5LD0A 1U3AA 2C0EA 3US3A 5DJMA 1JFUA 1GWCA 5ECHB 2RIIA 1WPIA 4EO3A 4MZWA 3FY7A 3RHBA 2RLIA 1GH2A 1ZMAA 3ZITA 3C73A 1GP1A 2C3NA 3GA4A 1XW9A 2VCXA 2I81A 4FYUA 2C0GA 2GS3A 3LSZA 4GLTA 5CYYA 3VLNA 2QC7A 1FOVA 5ECMB 3Q6OA 2DJKA 3IE3A 2V6OA 4BWSA 1MDKA 4TR1A 2YV7A 2IMIA 3EU4A 3D21A 5CP1A 1T00A 2FCHA 4L8EA 4WKWA 1A23A 3HJPA 2L4QA 3KCMA 1GLQA 1GSEA 5AIVA 5J9BA 2H1GA 2LV3A 2ZCTA 4G10A 3UEMA 4X0XA 1K0BA 4ZL8A 5IMVA 2O8VB 4D73A 1T1VA 2HT9A 5IO2A 2IFQA 3M9JA 2AUVA 4I6XA 5B7CA 2H70A 2XC2A 4ACSA 1NHYA 2LRCA 4HQSA 3NOFA 1ERWA 1K0MA 3KIJA 4KB3A 1B8XA 4XCSA 1DBYA 1XVWA 1O81A 3A2VA 1SENA 2VUPA 1TRVA 3TKSA 1IYIA 2JU5A 2DIZA 5CRHA 1FO5A 3ZMLA 2PMTA 4AGSA 2HZEA 3UVTA 4ZB9A 2YPMA 2YOIA 2CZ2A 4AF2A 1RQMA 1M2BA 4MF7A 5GSSA 4DSSB 3I43A 1JZRA 4ZBAA 1PA3A 2R37A 1TXXA 2C1YA 1GSYA 4DVCA 3A3TA 2DIYA 4PNGA 2KP2A 2CQ9A 1EV9A 4ZBBA 1FG4A 1PL1A 2LSTA 3P7XA 1O73A 5E4WA 2F3MA 1FB6A 1S3AA 3EURA 4XS1A 1CQHA 1F2EA 5C00A 4WF4A 2IN3A 2JZSA 2R2JA 1V2AA 3HJMA 4WEYA 1Z7RA 4Q5FA 2G2QA 3F4TA 5ABRA 5ID2A 1BJXA 2RM5A 1F6MC 1QUWA 3D22A 5GAPD 3F0IA 5DALB 3EE2A 3VI7A 2DJ3A 2DMMA 1SL2B 1PKZA 3VK9A 1MTCA 2LNTA 4KDXA 4TRXA 2B6MA 4K0GA 4I2TA 4QQ7A 2L6DA 2B3SA 1B4PA 3P2AA 3PH9A 1FW1A 4GRFA 2H66A 2MMNA 2VL2C 3TJJA 5KN2A 3TJBA 1WWJA 3HYPA 3LQ7A 2ALBA 2K8VA 2GTUA 3ZZXA 2E2GA 3M8NA 5ECLB 5J3RA 1GUHA 1HD2A 2XHFA 4ZB8A 3A5WA 3CSJA 2H0IA 3QDNA 1K0CA 1K3LA 1AC1A 3IA1A 4IJIA 4ZBDA 4KW6A 3ME7A 3SWLA 5E59A 1WMJA 1PX6A 1RK4A 3K8NA 5CAXA 2X99A 4I2UA 2H0GA 4I5QA 4EF0A 5IOWA 1TRUA 4EDYA 2J9HA 2N5BA 3GTUB 5LNKe 1TW9A 3D5JA 5ECNB 5IPGA 4GCIA 5HFKA 4WXTA 2NBSA 2D2ZA 4MPGA 4G2EA 1DE2A 1JZOA 5D9XA 3IAM2 3DYRA 3ERWA 1FVKA 4QL7A 5G5EA 5G30A 1B9YC 4JZQA 1SU9A 1M7TA 4NMUA 2MMAA 4PQIA 4KDUA 2OBIA 2HXKA 1GTAA 2B1LA 3CMIA 3HA9A 2V6KA 4FYBA 4PNFA 3DEXA 1TI3A 2QKEA 1TRSA 2TRCP 2R6KA 4BA7A 4ECJA 3RPNA 3O6TA 3LORA 4IJ3A 4WETA 2YN1A 4DSSA 4E8HA 4PURA 4JU5A 4AJ6A 2I4AA 5IM9A 1U88A 3HHVA 5B6NA 3EMXA 5DCHA 1YJ6A 2FA4A 3P8WA 2LRNA 2ON5A 5JCGA 3TKRA 3CBUA 1A2JA 1X5DA 2VL3A 3EINA 5A4WA 1USBA 2GQLA 3KP9A 2JADA 1KNGA 2AB6A 2CX3A 1GTIA 2CAQA 2GSTA 2H0HA 1TJDA 1DSBA 2EC4A 1TTZA 3TRQA 1SKRB 4IHUA 1HNBA 2BJXA 5HFGA 1EGRA 3L0HA 4ZIJA 1XFLA 2L4CA 3N5OA 3FZ5A 5HR0A 4RUVA 2VD0A 3DRNA 4LA1A 3ERFA 4OFMA 1QGVA 1JLVA 3FHKA 3CSIA 4KH7A 2P31A 1YEPA 3PR8A 3TKSC 3D4MA 1YQ1A 1ZYEA 3CTFA 11GSA 3TKPA 1V40A 1TU7A 1GLPA 1XW5A 1FHEA 4HS1A 4H86A 5D96A 3BOAA 16GSA 2B7KA 3MAKA 1K0NA 5F05A 3ZVJA 5AISA 1QMVA 4TR1B 1AW9A 4GSSA 3ZFBA 5IO0A 1C72A 1HQOA 6GSWA 1G7OA 3E0UA 1VF3A 4KSMA 5HFIA 3CYNA 2IL3A 1WIKA 3GUSA 1N8JA 5AGYA 2OE1A 3VWXA 1ABAA 3GKNA 3FW2A 3LWAA 3C8EA 4LLRA 3CTGA 5CRDA 5G31A 1THOA 5DDLA 1SK2A 3GTUA 3GX0A 1WRYA 1TI1A 4MDCA 1OKDA 1R7HA 4BWQA 3QOUA 3L9SA 2X8GA 2YWMA 1YEXA 2P5RA 4Q5NA 3ZIVA 4IQAA 1X5CA 4KCAA 2XPDA 4NAXA 2MZCA 4GTUA 4K1FA 1TK0B 4K2DA 5D9VA 2H01A 2RM6A 4LMWA 4NXIA 1DUGA 4F82A 4RQRA 3H8QA 1W4VA 3BCKA 3JCML 2FGXA 1GRXA 3FRCA 3L4NA 3HVXA 4GXZA 9GSSA 4NHZA 2DJJA 3BCIA 3P90A 2BTOT 1RW1A 4PQ1A 5HR1A 2MBSA 2DLXA 1WP0A 1GSQA 5G2ZA 4HI7A 4WR5A 3GN3A 4ML6A 4ZB6A 2HRFA 3VPQA 2OKAA 4V2MA 2AV4A 1W89A 1EP8A 3M3MA 1THXA 4LL1B 4V2LA 3D4TA 4WBRD 5HQPA 4HOJA 2WS2A 5KN3A 2GSSA 1G7EA 4XHMA 1YDKA 1F3AA 1EOHA 4HQZA 3RPPA 2VLUA 22GSA 1EEMA 2BMXA 3DVWA 4J57E 3ZYWA 1GSUA 4KAEA 2B1KA 2YANA 3FK8A 4O92A 3ZMKA 1AQXA 1SL1B 5ECOB 1XWBA 3GMFA 4G9HA 3IPZA 3GL3A 1R4WA 4O32A 3QPMA 1SD8A 2VM1A 1PSQA 4IBPA 4ZILA 2CZ3A 6GSUA 3UBKA 2PERA 1YY7A 2DJ2A 3QAVA 2VD1A 5GZZB 2VCQA 4YAVA 4V2NA 3I6AA 5KN0A 5KEJA 4POKA 3ED3A 3HDCA 3WGXA 5ECPB 1SD9A 4YQUA 3WYWA 4V1Ap 1J08A 1OC9B 3E3EA 5A4UA 1NW2A 3CXGA 2YCDA 4XRAA 1B4QA 3R2QA 4XS6A 2A4VA 3GYKA 1YF1A 1R5PA 1OKTA 3QAGA 2LS5A 2AHEA 4RQXA 2OE3A 3GV1A 1LBKA 1PMTA 1ZOFA 4GQCA 1XBSA 6GSSA 2XBIA 4F2IA 4MZBA 5FT3A 5DAKB 2Z9SA 1QK8A 1YKAA 2FNOA 3KTBA 4XTSA 4CHSA 4MH2A 5GAND 1Z9HA 4N0ZA 4N10A 1V58A 4MABA 2V1MA 2OBKA 1AQVA 2O7KA 5D8IA 1K0OA 2VCVA 1X9WB 1ERTA 4EKZA 1F37A 5DVBA 4GF0A 3QFAC 4IKHA 4IGJA 4IN0A 1UVZA 1Y6EA 1Z6NA 1E6BA 2LUSA 1OVNA 4EL1A 3F3QA 3KM6A 3F8UA 2PUKC 2I1UA 2EIQA 1EGOA 2DBCA 2YJHA 4TVEA 1IYHA 4MZCA 2I9HA 1G0TA 1JZWA 2FWHA 2GVPA 10GSA 4TW5A 2IMFA 4O7HA 3ZTLA 1NM3A 4AJ8A 1O6JA 2LRTA 2YWIA 1EOGA 1UC7A 3ZRDA 3M9KA 3QCPA 3L9UA 3N9JA 5CRWA 1EP7A 3EWLA 1SJZA 3KJYA 4POLA 2JACA 3TGZA 2WJUA 1HNCA 3LYKA 3C71A 3F3RA 3LXZA 3FR3A 4EC0A 3BJ5A 5FHIA 4F03A 3TB2A 3UJ1A 2JZTA 2QGVA 4K9ZA 3BD2A 2DC5A 2ZNMA 2AJQB 2EIOA 1AQWA 1MEKA 5H5SA 3HXSA 3F4RA 4OCEA 2A2RA 3KH7A 3LXTA 3GNJA 5ECRB 1V98A 5DCGA 5GSTA 4POMA 3VWWA 2HFDA 2KHPA 4DSRA 1TK8B 1EWXA 3UMAA 4WF5A 1DE1A 1WE0A 3RHCA 3J7Yb 3WT1A 5ECSA 3C1SA 3MSZA 1M2DA 2OACA 4XS4B 1V57A 2GLRA 1SK0A 1K0AA 3Q18A 3DWVA 5F06A 1OC9A 4DEJA 3FEUA 2OJLA 1YKCA 2LJAA 2H73A 1I5GA 4MLYA 1BAYA 4FYCA 1YZXA 3H79A 2OA7A 4E8EA 6GSYA 4I97A 2YP6A 3ZVJD 4NHWA 2CA8A 2GT5A 2HSYA 4MJAA 2B5YA 2H75A 5DAKA 1QXHA 2CVDA 4KNDA 5J4UA 1A0RP 2HYXA 2HI7A 2VCTA 3TRPA 2H6YA 3ZREA 4JR6A 2C3TA 4L5OA 17GSA 2H6ZA 1S3DA 2HRNA 4X43A 1BYEA 2H74A 1SYRA 2N5AA 1U3IA 3IXRA 4AJ7A 1GUKA 6GSTA 5D93A 4N30A 1M0UA 2H6XA 3H1NA 5B8BA 4TXOB 3M0FA 5DQYA 3KTLA 1VGLA 3F6FA 1N2AA 1XZOA 1M99A 2K9FA 4ISDA 1O8XA 2JZRA 1SKSB 5IMDA 5EPFA 4X1UA 3HY2A 4KA0A 2WRTA 3A2WA 4NV5A 5HR2A 1UA5A 3FZAA 4L5LA 4GSTA 3LGCA 1XIYA 4XIHA 5H5QA 1XCCA 1SKWB 5D9WA 5JWQB 4PQHA 2HNLA 4POBA 2PGTA 2P5QA 3EVIA 2KUCA 3KEBA 3IK7A 4OO4A 1ML6A 2TIRA 3VPTA 1T8EB 7GSSA 1MDIA 3Q74A 3D0ZA 2AYTA 5FWGA 3FZ9A 1UN2A 2F9SA 5DBQA 3IAS2 1GSSA 1Z7PA 2H71A 3FZ4A 3WGDA 3WT2A 4BVYA 4PX1A 4EE0A 1GSFA 3LG6A 3GFKA 5IMFA 2H72A 2WULA 2C8UA 3I69A 2R3XA 4Q5RA 1V9WA 5INYA 2IMEA 2V41A 14GSA 3KMOA 3RDWA 4HZ4A 3L9VA 2LJKA 2ON7A 5F07A 1OAZA 4IS0A 3GH9A 2X8CA 3HD5A 3C1RA 2IJYA 5JCWA 1S3CA 2DSAA 5JWRB 1O7UA 2J23A 4XS4A 4J56E 4IVFA 2B5XA 4O5RA 4P3YB 2NTOA 5D9TA 2YV9A 3IHQA 4OCFA 2GSQA 2F8AA 2HE3A 2JL4A 3J7Yk 4MA9A 5C04A 2FY6A 4F0CA 2JSZA 5J9CA 2B5EA 4K0NA 5DQSA 3MWHA 1MD4A 3IRAA 2LEGA 5IIZA 1O85A 2IMKA 3I9V2 2NPBA 3F6DA 3W6GA 1YF0A 2YNXA 1K0DA 4ZL7A 2FHEA 3MNGA 3UAPA 3QAWA 4EUYA 1U87A 3ZIJA 1XPVA 1X9SB 2FWEA 2C0DA 2KLXA 2GQKA 5G1KA 1Z3EA 4HZ2A 5KN1A 1TOFA 4MK3A 2DJ0A 5A5KA 1GL8A 4L0WA 4TXOA 4IP6A 3HCZA 3VURA 5G5FA 3LYPA 3A2XA 2OE0A 4YQMA 4N11A 3D6IA 2LQOA 1A8LA 3FYGA 2WB9A 1TU8A 2O85A 1HNAA 1I9DA 2E7PA 1O8WA 1ILOA 4IQ1A 2VCZA 4OD7A 4ZXGA 4ID0A 2L6CA 5ECQB 3ERGA 3GURA 3DD3A 2WFCA 12GSA 3OR5A 2YWNA 4MJBA 3DMLA 1GNEA 1Z6MA 3C7MA 5A4VA 1FB0A 2H19A 5B6MA 3U5RE 3QFBC 5EVOA 1GTUA 4RI6A 2EIRA 3EC3A 2C3QA 1ERUA 3GL5A 3TOUA 5COHA 3UVHA 2GZZA 2LQQA 4F0BA 4HU7A 4PUAA 4OFNA 3W8SA 1SJ6A 4KUNA 3IV4A 5AN1A 2K6VA 1VRSD 1SYXA 3QMXA 4K7OA 1PRXA 1ZCPA 4MMMA 3WGEA 1M2AA 4TR0A 4PGTA 2MMZA 2F51A 2HZFA 5L71A 2VL9A 1PKWA 4TR4A 2H1BA 1R5AA 1BG5A 18GSA 2CX4A 3TCOA 3RBTA 3HVVA 4OMVA 3FR9A 4DSQA 2H8LA 1OC3A 3GRXA 3FR6A 3TRXA 4ULXA 3QD9A 1LJRA 3TJFA 3G7YA 1OC8A 4MH3A 1K3OA 4CDOA 3GSTA 1CQGA 4ECBA 1R26A 1TRWA 1EZKA 2N5FA 1A8YA 1XWAA 3IC4A 3KH9A 5IMAA 2LJRA 2FD3A 4K8MA 4BVXA 2QSIA 1MD3A 2X8HA 2G0FA 2E2MA 2ZUPA 3ZFLA 1GUMA 1JLWA 5CRGA 2R5GA 1XWKA 3VI5A 5J5NA 3GX8A 4F9ZA 2FWGA 3LJRA 4ML1A 2MYGA 1EEJA 3EMPA 4ECCA 3EYTA 2V2GA 2H1AA 3HZ8A 3LEFA 3TUEA 1TK5B 2YJ7A 3CSHA 2P0GA 1QQ2A 4NV2A 1J9BA 3VFIA 13GSA 4IP1A 2X64A 4MP4A 4TKYA 4Z7XA 3DKSA 4CW9A 2WCIA 1PL2A 5AIXA 3E9JB 5EL8A 1E2YA 4BPYA 1JZDA 6GSVA 2KOKA 2DMLA 2M46A 1PGTA 2FWFA 3VWUA 4FO5A 2PN8A 2RUEA 3H4KA 3V1WA 1HYUA 2A2SA 1H4OA 4GQFA 3G7IA 4K7IA 4GSNA 1AUCA 4JBBA 2TRXA 4WR4A 1XOAA 2VOCA 4HJMA 4NWYA 1XXUA 6GSXA 3EU3A 4V1Ag 2CVKA 1M9AA 5HR3A 3SBCA 4EDZA 5ECKB 1TP9A 4ECIA 3O76A 2VLVA 2CVBA 5CREA 1AXDA 4HUAA 3ME8A 2PU9C 3KMNA 3S9FA 2F8FA 1NHOA 3NIVA 2FA8A 3TKSE 4HEA2 2K8SA 2WGRA 1SL0B 5G1LA 3NZNA 5D73A 4YQVA 3ZL5A 1FAAA 3F63A 1GULA 3AY8A 3ISOA 2HSHA 5IOXA 1F3BA 5ECIB 1ACVA 1X5EA 1KBNA 5CNWA 4TOPA 1OYJA 1WOUA 3BBYA 2AAWA 1BQ7A 3ZLPA 4OWYA 3GIXA 1M9BA 4G19A 1ON4A 4BL7A 3F9UA 3IR4A 1X0RA 2O89A 1TDIA 4TXVA 5J41A 4I8BA 4KE3A 2I3YA 1KEBA 2VCWA 4N0VA 1VF1A 2C4JA 4KCEA 3G9BA 1BX9A 4MJEA 2XBQA 3IOSA 5B8AA 4L0UA 1G6WA 4KX4A 1Q4JA 3UOMA 4KDYA 3F4SA 3GKKA 3GKXA 1H75A 1ST9A 3GH6A 3GSSA 4QL9A 4EVMA 1T4ZA 2H76A 2RUFA 1LU4A 2PVOC 2KP1A 2YZHA 2VAFA 2PBJA 4WBJA 3M1GA 2R4VA 2IPAA 5IPHA 1T7PB 1KTEA 3G7JA 1X9MB 3H93A 4K6XA 5H5RA 1AAZA 2WDUA 4RI7A 1FVJA 1JHBA 1XWGA 5IQYA 4K7NA 2HLSA 3GHAA 2WZ9A 2L57A 5F8BA 1Z5YE 4LMVA 1Y25A 2H30A 2CV4A 4JE1A 2LKUA 1OE7A 1MDJA 3DVXA 1XW6A 1GSDA 2DJ1A 2MBTA 3Q19A 5F0GA 2FUG2 2IWTA 4IW9A 3O3TA 1ERVA 3LFLA 5JWOB 2GQMA 1PQNA 2M72A 3HZ4A 3VWVA 3UL3A 1G6YA 4NPBA 20GSA 2V32A 3KXOA 2NDOA 1ZL9A 4HJ2A 4IELA 4MJCA 1B9XC 4HDEA 5DJLA 2VLTA 4JRRA 3KGKA 1XWCA 3U6VA 5ENUA 5DALA 4FH8A 3W8JA 2REMA 3MDKA 2GSRA 4Q5QA 4LL4B 2GDRA 3WD6A 3APQA 5LCZA 4ZL9A 2FLSA 3DXBA 8GSSA 5ELAA 2L59A 3APSA 3PINA 2OADA 4MCUA 3HJOA 1ZZYA 3CRUA 19GSA 2O87A 1ZGNA 3HKRA 4J2FA 2GZYA 1A24A 4FIWA 4KSOA 1Q98A 1PD21 5ELGA 1NSWA 1VF2A 3UIWA 3IK9A 3DGQA 4JR4A 1F9MA 4PXOA 2VIMA 2NVLA 1T3BA 4D73B 2L5LA 1GNWA 1GTBA 2LNSA 1SJIA 4OFTA 2IFQB 2K18A 2M80A 3HVSA 1A2MA 1K3YA 1A0FA 2PPTA 3QR6A 3TJGA 1A2LA 3RAZA 2C80A 4KGIA 4EXJA 2CAIA 2GZPA 2L5OA 2MMOA 3L78A 2VM2A 3UARA 4PUFC 1PX7A 2IMDA 3TOTA 1J0FA 3IDVA 4MPFA 3TKQA 3GKMA 1TKDB 1SK1A 1AIUA 3CRTA 4ILFA 5JCUA 4TR3A 3UBLA 1ZYQB 1QFNA 2CT6A 4MF6A 2HZEB 2E0QA 3IBHA 3KP8A 3KD0A 1XVQA 2VL2A 4HU9A 2C0FA 4TN8A 1VF4A 3TJKA 3TDGA 1XOBA 5IMCA 2YZUA 4MF5A 1URMA 2PVQA 1BEDA 1OE8A 4YH2A 1U6TA 2B7JA 4YAPA 3PGTA 2GGTA 4OO5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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