3C1RA

Crystal structure of oxidized grx1
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
110
structure length
110
Chain Sequence
HMVSQETIKHVKDLIAENEIFVASKTYCPYCHAALNTLFEKLKVPRSKVLVLQLNDMKEGADIQAALYEINGQRTVPNIYINGKHIGGNDDLQELRETGELEELLEPILA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Glutathionylation-triggered conformational changes of glutaredoxin Grx1 from the yeast Saccharomyces cerevisiae.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin-1
molecule tags Oxidoreductase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 40
structure length 110
sequence length 110
ec nomenclature ec 1.20.4.1: Arsenate reductase (glutaredoxin).
pdb deposition date 2008-01-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3c1rA00
1JZWA 2CVKA 3P7XA 3FR9A 4MMMA 2CAQA 3LWAA 4I2TA 2CVBA 2NPBA 4N30A 2LJAA 4HJMA 4GSTA 1F37A 4XS6A 2H30A 4JR4A 1FB6A 2KP2A 1GLPA 1PN9A 4F82A 1X0RA 1J9BA 4MPGA 5B6NA 3PINA 1XZOA 2P0GA 4KDYA 1URMA 1PSQA 2AHEA 4EL1A 2L4QA 4GQCA 1NHOA 2FY6A 4LL4B 3QDNA 2EC4A 5JWQB 2H6ZA 1M7TA 1ZMAA 1GUMA 1UA5A 3GH6A 3CSJA 1Z7RA 1ERVA 2BJXA 2LKUA 2HE3A 1PD21 4DSSA 5G30A 5ECPB 5CRDA 1GH2A 5GAPD 4KCAA 3DXBA 2O85A 4HQZA 5AISA 4XIHA 2A2SA 2B3SA 1OKTA 5F8BA 3M3MA 4LA1A 3BCKA 4NAXA 3GNJA 5D9WA 2H74A 4D73B 5HR2A 2O7KA 3F0IA 5FWGA 3GN3A 1Q4JA 1A2LA 3EMXA 2HLSA 1M0UA 4IGJA 5G2ZA 5ENUA 1TRWA 1PGTA 4WXTA 4FYUA 3TJFA 1MDIA 2L4CA 4GSSA 5CNWA 3VWVA 1TKDB 5EVOA 5KN0A 5H5RA 1PX7A 1THXA 2FA8A 4HOJA 5JCGA 1Z6NA 4PQHA 3UMAA 4EC0A 2GT5A 2V32A 2VCWA 4TW5A 1ERWA 4TKYA 4KX4A 2HI7A 4E8EA 3TKSA 2LJRA 2CQ9A 2CZ2A 2ON5A 1TP9A 4PUAA 3VPTA 4RQRA 4JEDA 4IBPA 4F03A 1VF2A 2VL3A 3APOA 4MPFA 4JU5A 2C3NA 2GVPA 2RUFA 4OWYA 2FWEA 3LQ7A 2RLIA 3GYKA 3TRXA 1QGVA 2MMZA 2BMXA 5H5SA 2DJKA 1UN2A 2DJ0A 5G5FA 3DIEA 1WP0A 3GX8A 2B5YA 3QMXA 2LRNA 2J23A 3APQA 5IPHA 2GLRA 1ZL9A 3P8WA 4Q5FA 17GSA 2WZ9A 2AV4A 5CAXA 5IOWA 1EWXA 1AQWA 4FH8A 4K6XA 2VLTA 4TXOB 3QAVA 4NV2A 1BAYA 4KE3A 3HD5A 1YF1A 2QKEA 1FHEA 2LTKA 4MABA 3H93A 4PQ1A 2JSYA 4LLRA 5AIVA 1YEPA 1GULA 1T00A 3US3A 5E59A 2IN3A 5ECMB 1X9MB 2KOKA 2IJYA 3DVWA 3EINA 1U87A 4POKA 4EE0A 2M46A 3ZVJD 2LRTA 5A5KA 4EVMA 4AF2A 20GSA 22GSA 2IMFA 2MBSA 1ZYQB 3P90A 2WFCA 3APSA 1X5DA 1M99A 5CP1A 1B4PA 1PRXA 3FZAA 2YWNA 2C4JA 4IVFA 5HFIA 4KSOA 5B7CA 3HCZA 4X43A 3M1GA 5DALA 1OYJA 4FYBA 2PGTA 2GSRA 2ALBA 1SJZA 4MH3A 1E6BA 4NHZA 2H73A 2LSTA 1ACVA 3TCOA 2PN8A 4MJCA 1GLQA 2HZFA 4OFNA 4OO5A 2LQOA 3M8NA 3F4RA 2GSSA 2V2GA 2VD1A 3GRXA 2H0HA 5ECHB 4PUFC 2HRNA 2HNLA 2FHEA 1YJ6A 1SL1B 3LYPA 1JFUA 4K1FA 2HYXA 2R5GA 1B4QA 4XTSA 3IBHA 4H86A 2LUSA 3IDVA 2XPDA 5HQPA 1DE2A 4KUNA 3DRNA 2H0IA 3ZZXA 4IW9A 2WJUA 3QD9A 4IP1A 1A8LA 4MH2A 1KTEA 2VOCA 1GUKA 4Q5QA 2WS2A 2HRFA 4X0XA 2QC7A 3CRUA 4NHWA 5E4WA 5EPFA 4XCSA 3HVXA 2LEGA 2WGRA 4J2FA 3D21A 5D96A 5ECQB 2DIZA 4V1Ap 1AXDA 4PNGA 3IRAA 2ZCTA 5ECLB 1GSQA 1OVNA 5CREA 4I97A 2A2RA 1BEDA 3HZ8A 2K8VA 3UVHA 4HS1A 6GSSA 4GCIA 3PH9A 5D93A 4RQXA 2H72A 4CHSA 4KAEA 2GZPA 3K8NA 3KMOA 2HSHA 2AUVA 2B7KA 4JRRA 3BCIA 4IP6A 2E7PA 3F3QA 5IMVA 2DBCA 2PMTA 1EP8A 4XRDA 2L5OA 3L0HA 5HR1A 5F07A 4MF6A 1ZCPA 1S3DA 3GH9A 2XPEA 2GT6A 4TR4A 5HR3A 3HJPA 4O32A 3UOMA 1XW9A 5HR0A 3TB2A 3W8JA 1R26A 3I69A 1O73A 4K7OA 4OCEA 1RW1A 2Z9SA 1GWCA 4KDUA 5IMCA 2MMNA 2EIOA 2YOIA 2FWFA 2MBTA 5D73A 4DEJA 2PVOC 5ABRA 3HVVA 4O92A 4XHMA 1A24A 3F3RA 3RBTA 4ECIA 5G1KA 2JADA 2MYGA 3IHQA 3RPNA 1K3LA 4N0VA 2G2QA 2FD3A 5ECNB 1ZYEA 2IFQB 10GSA 2HZEA 1OAZA 2JSZA 2PUKC 2IIYA 2DJ1A 2EIRA 3ERWA 2OKAA 5J9BA 2K8SA 1HD2A 1NW2A 4MF7A 5IMAA 4GF0A 4K2DA 4JZQA 1GTUA 2OJLA 1BG5A 1YDKA 4OO4A 1ON4A 4CW9A 2GTUA 1EOGA 4F2IA 1MEKA 3Q18A 4BWQA 2C8UA 4GTUA 1PKZA 19GSA 2L6CA 3FK8A 5J4UA 1YEXA 1AQXA 2ON7A 3DEXA 1GTIA 3FHKA 1EZKA 1XWGA 2YZUA 1XWKA 3KP9A 3WT2A 1YF0A 5LCZA 2PPTA 3KIJA 3SBCA 4PX1A 3L9SA 4MA9A 5AIXA 2AYTA 3D6IA 1G0TA 9GSSA 2GSTA 4J57E 2MMOA 3GA4A 4LMVA 2PERA 1FAAA 1E2YA 3SWLA 3EURA 4K9ZA 1TU8A 3IAM2 2OA7A 2OE0A 5COHA 2CV4A 4ZL8A 2DJJA 1X5CA 18GSA 2F51A 1X9SB 1T3BA 3Q6OA 1QXHA 3D4MA 3QCPA 1WPIA 3HHVA 3HXSA 2VD0A 1MD4A 1X5EA 1T8EB 2K18A 2IMDA 3I43A 4ILFA 2YV9A 5ECSA 3GKMA 5KN2A 1EP7A 2YWMA 2I81A 4JBBA 3U5RE 5ID2B 3A3TA 5LNKe 2DIYA 1U88A 1T1VA 3IOSA 4ZBAA 2YP6A 4HU9A 3GTUA 4IQAA 3IXRA 1GSEA 1WJKA 1GSFA 4OCFA 2LQQA 2VCXA 5IQYA 1K3YA 13GSA 1XOAA 2ES7A 3IC4A 3TOTA 4ZILA 2F9SA 3GV1A 1FVKA 1SJIA 5HFKA 3TKQA 3ZMKA 3HA9A 5JWRB 3N5OA 2B5EA 1VF1A 3RHCA 1Q98A 2PWJA 5CO3A 3GKXA 3CYNA 3WGXA 4QL7A 3KMNA 4LL1B 2I9HA 3UJ1A 2VM2A 3UBKA 1B48A 5ECOB 1AC1A 1XW6A 4V2MA 1BJXA 4BWSA 3N9JA 3GFKA 1GRXA 3ZFLA 2VAFA 5IMZA 16GSA 1TI1A 5EL8A 4RUVA 4JR6A 5DAKB 1SJ6A 2EIQA 1DUGA 3M9JA 1Z9HA 2X8HA 3CXGA 2H66A 3IK9A 2TRCP 3HJOA 4BL7A 5ECIB 5EY6A 3KTBA 1TW9A 4KW6A 4V2NA 6GSYA 4I6XA 3BJ5A 4TR1B 1LBKA 3HZ4A 2JL4A 3GSTA 4BVXA 1OC3A 3ME7A 3QFAC 4XS4B 5G5EA 11GSA 2IMIA 2XC2A 2GDRA 3UEMA 5CRGA 1SYXA 2B5XA 3O6TA 3KD0A 3GSSA 2XBQA 3G7JA 3TJGA 1K3OA 3RHBA 1QFNA 1OE7A 4F0BA 2VCQA 3FEUA 2DSAA 1VF4A 3R2QA 2E0QA 1OKDA 4K7IA 1HNBA 2LNSA 1GSYA 1HQOA 4Q5NA 3HY2A 1I9DA 4WKWA 2F3MA 2KUCA 1AW9A 2WRTA 1GSDA 6GSXA 2C0GA 1OC9A 1XPVA 2WB9A 3FKFA 1K0CA 2PBJA 3GL3A 4L0UA 4I8BA 5IO2A 2AJQB 1GP1A 1M9AA 3QAWA 5GZZB 1MDKA 2CA8A 1ERUA 4L0WA 5F05A 2H8LA 4ZIJA 4HZ4A 5C04A 2H76A 5D9VA 3H79A 4YAVA 2VL2A 4MP4A 2IMEA 1EV9A 5JWOB 3ZMLA 5D9XA 5FHIA 1V58A 1A23A 2YJHA 1K0OA 1B9YC 2TIRA 3Q74A 3ZITA 2DMMA 3MSZA 1CQGA 5A4UA 1EEJA 3LORA 1K0DA 1O8WA 4DSSB 1BX9A 1VRSD 1XVQA 3GKNA 5IO0A 2YWIA 3A5WA 2H70A 1LU4A 2DMLA 2H6YA 1EV4A 2DJ2A 2GQKA 3VWXA 1U6TA 3VPQA 4HEA2 2C0DA 1GSSA 3EVIA 1JLWA 4POLA 2X99A 2V1MA 1M9BA 3KCMA 1HYUA 3F63A 4I2UA 4TRXA 1OE8A 3VFIA 2I4AA 4KH7A 2GZZA 4AJ7A 2RIIA 3G7IA 1QK8A 1NHYA 5AN1A 3IAS2 4L5LA 1XVWA 3ZVJA 1M2DA 2K6VA 1MDJA 1TRSA 1CQHA 4KDXA 4POBA 4MJAA 2JZRA 1UC7A 3UL3A 2QGVA 4KB3A 5KN3A 4ULXA 4EF0A 4XRAA 1M2BA 1JHBA 4NWYA 4TVEA 5CRHA 3TOUA 3TKRA 2C1YA 1R5PA 1SENA 3H4KA 4HI7A 2C0EA 1K0AA 4ZB8A 2P5QA 5GAND 3DKSA 4PGTA 1H4OA 3TRPA 4AGSA 2O8VB 1ERTA 2E2MA 3HVSA 2N5AA 1KNGA 3CMIA 3LG6A 1XCCA 2G0FA 3QFBC 4K0GA 4MZCA 4XS1A 1V57A 2KP1A 4AJ8A 2NTOA 3HKRA 2L57A 2H1BA 2H75A 2C3QA 3F6FA 2GSQA 4IHUA 3KM6A 4NMUA 3VI7A 4K0NA 4IJIA 2IWTA 1MD3A 1S3AA 5D8IA 4QL9A 5B6MA 4N0ZA 2HFDA 5HFGA 3FZ5A 2KHPA 1QQ2A 2L59A 1TI3A 5A4WA 4NV5A 4ID0A 4IKHA 3L9VA 1Z7PA 1G7OA 1PQNA 3W8SA 2FLSA 4ECCA 4D73A 2NBSA 2VUPA 3A2VA 4RI6A 3ED3A 1ML6A 2JACA 1AUCA 2YN1A 2WDUA 1XW5A 2R6KA 4HDEA 2YCDA 3FY7A 2FGXA 1Z6MA 2H1DA 3BBYA 3CSHA 5DBQA 1XFLA 3PGTA 5JCUA 1KEBA 2OADA 3C1RA 3RPPA 5A4VA 3RDWA 3IV4A 5DAKA 4K7NA 1V2AA 3ZLPA 1SD9A 2L6DA 3TUEA 1EGRA 12GSA 3KGKA 3MDKA 3CSIA 1TRUA 2I3YA 3Q19A 3O3TA 3V1WA 1ZOFA 1YY7A 1DE1A 2B6MA 2C80A 3TKSE 5DALB 2CX3A 1YQ1A 1ZGNA 1A8YA 1XBSA 2OBIA 2OE1A 2RM6A 3ERGA 3UAPA 2YPMA 4G9HA 3J7Yb 1R4WA 4GQFA 3EYTA 1SK0A 3VWWA 2A4VA 1F3AA 3HDCA 3L4NA 2JU5A 5DQSA 2NVLA 3DWVA 3GX0A 3H1NA 4DSQA 5C00A 2H01A 2P31A 3NZNA 4HUAA 3QR6A 2N5FA 4QQ7A 3ZL5A 5J5NA 2HXKA 3LYKA 3S9FA 3TJKA 4NXIA 3ZFBA 4LMWA 4TXOA 3E3EA 4AJ6A 2ZUPA 3W6GA 4KGIA 5DVBA 1SL2B 3KZQA 1Z3EA 1K0MA 5ECKB 1M2AA 3FR6A 4ZB9A 4F9ZA 1USBA 4MZBA 8GSSA 4K8MA 1H75A 4FYCA 3VLNA 3D5JA 2IL3A 3F6DA 3LEFA 1TK8B 1AAZA 2FCHA 3QPMA 4KA0A 3KXOA 3TJBA 1WWJA 5J41A 4ZB6A 4O5RA 6GSVA 3ZREA 3GUSA 3BOAA 3RAZA 1R5AA 1FOVA 2N5BA 3F4TA 4HQSA 5DCGA 2DLXA 1XOBA 4DSRA 4WBRD 1WOUA 4IN0A 2ZNMA 1GTBA 4GWRA 1BQ7A 1T7PB 1O85A 1ST9A 1IYHA 2WCIA 4MCUA 3FR3A 2R4VA 1GTAA 2LJKA 5F06A 2YZHA 4IQ1A 4ZXGA 1SK2A 3KTLA 4ECJA 4ML1A 1SYRA 2C3TA 4MZWA 2GQMA 3LSZA 1SU9A 1T4ZA 4L8EA 1TXXA 4TR0A 2VO4A 1WIKA 2MMAA 1SD8A 1TK5B 1F6MC 3C71A 4JE1A 5DDLA 4HU7A 3UVTA 2GZYA 2PVQA 3VWUA 4DVCA 3FZ9A 2B7JA 1O81A 3O76A 3C1SA 1WRYA 3H8QA 1A0FA 1Y25A 2FNOA 5H5QA 3ZIJA 1G6YA 2DJ3A 4ZL9A 4WF4A 2R3XA 4TR3A 2CZ3A 4Z7XA 5G31A 5J9CA 4EXJA 3GMFA 4ECBA 2P5RA 4IJ3A 2E2GA 3GURA 3NIVA 1A0RP 4GLTA 3M0FA 1YKAA 3DD3A 2R2JA 1EOHA 1KBNA 4PXOA 1JZDA 2I1UA 3NOFA 3IA1A 3QAGA 1W4VA 3IPZA 2O87A 3TRQA 5J3RA 1PL1A 2HZEB 1AIUA 1AQVA 2XHFA 1T4YA 2H0GA 5G1LA 3AY8A 3IK7A 3WYWA 5IMDA 4PQIA 4GXZA 1O7UA 3MAKA 3GL5A 4E8HA 1SKRB 3CTFA 2WULA 3UBLA 3MNGA 3OR5A 2H19A 1PMTA 3EE2A 4TXVA 2DC5A 1G6WA 2TRXA 4OFTA 3D22A 6GSUA 4FO5A 3PR8A 2CAIA 2LRCA 2VCZA 5ELGA 3M9KA 2OE3A 4GRFA 3FYGA 4ML6A 2AAWA 2X8GA 3FRCA 2FUG2 1HNCA 1PKWA 1J08A 3L9UA 3ZRDA 1WE0A 4TN8A 3U6VA 3VK9A 1I5GA 4WR5A 3MWHA 2VIMA 2VLUA 4YAPA 2RM5A 2R37A 1UVZA 3WGEA 4ZBBA 2HSYA 3J7Yk 1JLVA 2QSIA 5L71A 2PU9C 2BTOT 3IR4A 2YANA 3LJRA 4IS0A 1RQMA 4MLYA 2O89A 1VGLA 1TTZA 4YQUA 3P2AA 5IPGA 2CX4A 2X64A 4ZL7A 1GUHA 3UARA 3CTGA 7GSSA 3TJJA 3EMPA 3JCML 1XIYA 3WGDA 4GSNA 3BD2A 3TDGA 3ERFA 3LGCA 2XBIA 2FWHA 4ISDA 5ELAA 1FG4A 4HJ2A 4V2LA 4ZBDA 1GL8A 1TDIA 1F3BA 5B8AA 1JZRA 1GNWA 1YZXA 3KH9A 2H71A 3ZYWA 3GTUB 3DMLA 2IFQA 2IPAA 3D0ZA 5GSTA 3D4TA 2IMKA 2NDOA 3C7MA 3EWLA 4KNDA 4EO3A 1ABAA 2GS3A 2FWGA 4G10A 3KJYA 1TOFA 2VCTA 1DBYA 2B1KA 5KEJA 5DCHA 4I5QA 5F0GA 4WR4A 1GNEA 4BVYA 3HJMA 2V6OA 2L5LA 4N11A 3F4SA 4MJEA 3HYPA 5GSSA 3TKPA 4O7HA 1K0BA 1XXUA 1F9MA 1PL2A 3EU4A 4EUYA 3GIXA 4WEYA 4YQVA 1NSWA 5IMFA 6GSWA 2H1GA 4EKZA 1Z5YE 3WD6A 1OC8A 2M80A 3QOUA 3G7YA 1THOA 4ACSA 1NM3A 3GKKA 2C0FA 1FVJA 1TU7A 3A2XA 3F8UA 5LD0A 1MTCA 4RI7A 1TRVA 4CDOA 1B8XA 2V6KA 2D2ZA 3I6AA 3FZ4A 2HT9A 4G19A 1XWAA 2YV7A 1SKWB 3LXZA 2X8CA 1V98A 4BPYA 4TOPA 3ME8A 4X1UA 3G9BA 4MF5A 3L78A 3ZIVA 1PA3A 1FO5A 1FB0A 4N10A 1HNAA 3CBUA 1C72A 2V41A 1J0FA 2YWOA 1A2MA 1PX6A 4HZ2A 5DQYA 1ZZYA 3FW2A 1W89A 1G7EA 1S3CA 4WETA 1JZOA 2VM1A 1B9XC 3LXTA 3IE3A 1SL0B 4L5OA 3VURA 5ID2A 2MZCA 1O8XA 5IM9A 1V9WA 2CVDA 3DGQA 2RUEA 2OBKA 1ILOA 4YQMA 5KN1A 1O6JA 1EGOA 1EEMA 2B1LA 1SK1A 3EC3A 1OC9B 3C73A 2LS5A 4OD7A 4EDYA 3WT1A 1WMJA 2F8AA 1VF3A 2YNXA 1Y6EA 4KSMA 4MDCA 4EDZA 5IOXA 1U3IA 4OFMA 1X9WB 3C8EA 3KP8A 4OMVA 2K9FA 3TKSC 5AGYA 2VLVA 5FT3A 4FIWA 4G2EA 2AB6A 2LNTA 4WBJA 4MK3A 1YKCA 4IELA 4PURA 2KLXA 3E0UA 3ZTLA 1TJDA 3LFLA 1SKSB 5IIZA 1N2AA 5CRWA 2FA4A 2GGTA 2F8FA 1F2EA 4PNFA 1N8JA 1IYIA 5CYYA 4TR1A 2VCVA 1QMVA 1BYEA 4POMA 1DSBA 2YJ7A 4WF5A 1LJRA 2M72A 3CRTA 4XS4A 4F0CA 4Q5RA 2JZSA 5INYA 5DJMA 3DVXA 2CT6A 1RK4A 1V40A 2H1AA 2J9HA 2VL9A 3KH7A 1XWBA 5ECRB 1U3AA 5B8BA 3F9UA 4V1Ag 4P3YB 2JZTA 3ISOA 1A2JA 1QUWA 3EU3A 4BA7A 6GSTA 1GSUA 3DYRA 4KCEA 1FW1A 2H6XA 4YH2A 2GQLA 2LV3A 3E9JB 5JCWA 3A2WA 3GHAA 3VI5A 1TK0B 3KEBA 5DJLA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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