3CTFA

Crystal structure of oxidized grx2
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
VSQETVAHVKDLIGQKEVFVAAKTYCPYCKATLSTLFQELNVPKSKALVLELDEMSNGSEIQDALEEISGQKTVPNVYINGKHIGGNSDLETLKKNGKLAEILKPVFQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural basis for the different activities of yeast Grx1 and Grx2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutaredoxin-2
molecule tags Oxidoreductase
source organism Saccharomyces cerevisiae
total genus 36
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature ec 1.20.4.1: Arsenate reductase (glutaredoxin).
pdb deposition date 2008-04-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ctfA00
1K0MA 2QKEA 1O81A 3APOA 1XWKA 4KUNA 10GSA 3PR8A 2GLRA 4KSOA 3KM6A 5ECHB 4ILFA 1KNGA 2OE0A 4I97A 1A0RP 1GSYA 2PERA 2HT9A 3AY8A 2X8GA 1EEMA 3ZYWA 2R6KA 3GNJA 3QR6A 3FY7A 2LJAA 3UL3A 4L0UA 3RHCA 4K1FA 5CRHA 2LRCA 4GQFA 1O8XA 3PINA 3VWXA 3FYGA 2V41A 4J56E 4MH3A 4FH8A 2MMOA 1M9AA 3HVSA 3IV4A 1GTBA 1O7UA 2DJJA 1YEPA 1XVQA 5ID2B 4POMA 2VL2C 5DJMA 4E8EA 1A24A 1M9BA 3IK9A 4K8MA 1PL1A 1XWGA 2E2GA 1FG4A 2F51A 2K8SA 2DSAA 2KUCA 2VD1A 4ECIA 2PBJA 4MZWA 1Z7PA 1IYHA 1U3IA 2YZUA 3GKNA 2C3TA 3WYWA 1YZXA 2H72A 4BVYA 5CREA 2FA4A 4MDCA 3TKRA 4EC0A 2NPBA 2VCVA 2CZ2A 4CW9A 1B48A 1K3OA 3IRAA 3VFIA 13GSA 5HFKA 4MMMA 4CHSA 1X5CA 1BJXA 3M3MA 5CRGA 1Z9HA 1S3AA 1GNEA 2EIOA 2BTOT 2CAQA 2L59A 4KDUA 1O8WA 3ZVJA 3PGTA 5IMDA 4AJ8A 2VOCA 2N5FA 2CVBA 1O73A 3D4TA 3RPNA 3Q6OA 2VIMA 4JEDA 2PMTA 2VCTA 2R37A 2V2GA 5J5NA 5EL8A 2CAIA 3VWVA 22GSA 1TRUA 5IMVA 2FUG2 3NOFA 2HI7A 2OADA 1CQGA 2RM6A 1TJDA 2FCHA 3EINA 2WGRA 5IQYA 2C0FA 1FHEA 20GSA 2MBTA 5HQPA 1EP8A 3ZITA 1XWBA 3CSHA 3IAS2 3EVIA 2O7KA 5DBQA 1QUWA 6GSXA 5IPHA 3EURA 3LWAA 2FD3A 3ERFA 4X0XA 2HSHA 1WOUA 2R3XA 3FHKA 2WZ9A 2M46A 3IHQA 1GTIA 3GSTA 2PGTA 1WIKA 3IE3A 4Q5QA 1G7OA 1R4WA 3L78A 1XPVA 1G7EA 1OKTA 1BEDA 1ERWA 1GSUA 2XPDA 3E0UA 2PPTA 1A8LA 1AIUA 2X8HA 4TR0A 1OKDA 5ECQB 2V32A 1F37A 2FA8A 4ZL9A 2JZTA 3QAWA 2CZ3A 4O32A 3L9SA 4NV5A 1R7HA 4PQHA 3MSZA 3QMXA 4N0ZA 2KHPA 3HDCA 5KN0A 2IPAA 5D73A 1ABAA 12GSA 3GRXA 5A4VA 4HU9A 4MH2A 5EVOA 1QMVA 3MNGA 1J0FA 1TU7A 1DUGA 1TU8A 1X5EA 4DSRA 2TRCP 2CT6A 5ID2A 2OA7A 2F8FA 2H30A 1VF3A 3KH9A 2YP6A 3CTGA 2QSIA 5B8BA 2YOIA 3LYPA 5GAND 4F03A 4KA0A 4KE3A 3TKPA 1R26A 4EO3A 3GA4A 1K0DA 3RHBA 1XBSA 4MLYA 2C80A 1FAAA 4ZB8A 3F3RA 5A5KA 1S3CA 1YJ6A 2P0GA 4XIHA 2B6MA 5FT3A 1G0TA 3RPPA 1YQ1A 4GSSA 3E3EA 4JR4A 1TK0B 4IVFA 2WJUA 3IR4A 5G30A 4Q5RA 4P3YB 1HNAA 5B6MA 2WS2A 5JWOB 2GT5A 2PUKC 4PNGA 1OYJA 3IOSA 3ZREA 5ABRA 3K8NA 2MZCA 3FR9A 5ECLB 3LJRA 2TIRA 4QQ7A 4MJCA 2YWIA 3KMNA 4NXIA 3TJKA 1QGVA 1XVWA 4BA7A 1GSSA 3JCML 3CSIA 2A2RA 3Q19A 1EV9A 3ZVJD 4K9ZA 4LMVA 2HXKA 1OE8A 3P90A 4HJMA 4O92A 4POLA 1K0AA 4TOPA 5G1LA 4L5LA 3ZLPA 1AAZA 3QPMA 2L4QA 4TR1B 1OVNA 3FW2A 2IJYA 4RQRA 5IOXA 2NBSA 4IP1A 4KAEA 1JZDA 2GQKA 3IC4A 1TI1A 3PH9A 2WCIA 2CX4A 4OMVA 2EC4A 1PA3A 2H1DA 5J9BA 1SL2B 4I5QA 3KTLA 4BWQA 4HZ4A 4WEYA 1X9SB 3MDKA 1Z3EA 5CRDA 1B8XA 2FY6A 2DIYA 2RIIA 4ZBAA 3G7YA 3H93A 2FWFA 2OE1A 1F3AA 2XHFA 3HKRA 4FO5A 4KB3A 1AC1A 5G5FA 5CAXA 3C8EA 5IM9A 1W89A 4AJ6A 1Z6NA 1K0OA 1UVZA 3V1WA 4NPBA 3C1RA 1V2AA 3HZ8A 1PKWA 2RM5A 2I4AA 1X9WB 2JZRA 2VD0A 1GTAA 3HA9A 2HZFA 4CDOA 2CVKA 4WKWA 4EE0A 1MEKA 3UMAA 4QL7A 1GH2A 2VCQA 2GSRA 4PQ1A 3L9UA 2K8VA 4FIWA 3KEBA 1XIYA 4KGIA 1GSFA 1U6TA 3FZAA 2JADA 4D73B 2E7PA 2BJXA 1FVKA 3ME8A 4HI7A 1EP7A 4K0GA 2H1GA 4I8BA 2DBCA 3P8WA 3LG6A 7GSSA 2R4VA 4PGTA 2OE3A 3BBYA 3QDNA 2H01A 1GULA 1U87A 3TKSA 2QC7A 2D2ZA 3GKKA 1A2JA 2ALBA 3CXGA 1JZOA 2IWTA 5ECOB 2DJ0A 2L5OA 3HVXA 1R5AA 5JCWA 1GTUA 1SK1A 1QQ2A 2YJ7A 3C71A 2KLXA 3TCOA 3D22A 3TUEA 4H86A 1ERTA 4PNFA 2VCWA 5LD0A 3FR6A 2LJRA 1M2BA 4IP6A 3TKSE 1M2AA 4HQZA 3GYKA 3ZIVA 4GXZA 2B7JA 2GSTA 2RUFA 1T4ZA 4HZ2A 1U88A 2AV4A 4MK3A 3UAPA 2JZSA 3GKMA 2V6OA 1ZZYA 4IBPA 3LXZA 2NTOA 1PX7A 3O76A 1LBKA 3VPQA 1TI3A 1Z5YE 2FHEA 2KP2A 5KN2A 3F63A 4KX4A 1YF1A 2DIZA 2MMAA 3QD9A 4MF7A 1YEXA 4TXVA 4YAPA 4XCSA 1I9DA 2DLXA 2G2QA 4N10A 5D8IA 2PVOC 4KDYA 3UVTA 2HRFA 1AQWA 5HR2A 5A4UA 3F6DA 4LLRA 4Z7XA 2NDOA 3C73A 4TR1A 2GSSA 3TKQA 3DKSA 1EGRA 1RQMA 1F2EA 4YQUA 3CTFA 4JE1A 4XS4B 1NM3A 3M9JA 1WWJA 3F4TA 3OR5A 2J9HA 1HD2A 3QAVA 3IPZA 4MJAA 1OC9B 4HUAA 3UJ1A 3FR3A 1DE1A 1LU4A 4NMUA 3GL5A 3KJYA 3VK9A 3F6FA 2AHEA 4BPYA 3UVHA 2H0GA 5FHIA 2GT6A 2VM1A 1E6BA 1F3BA 2J23A 3LXTA 3L0HA 4OFMA 3EU4A 4ZB9A 1PKZA 5IO0A 1RW1A 4MF5A 4K0NA 3GHAA 3D6IA 2DJ1A 3VWUA 5J9CA 2AUVA 3UIWA 2H70A 3HD5A 2YJHA 4IELA 1N8JA 4OO5A 3EMXA 4L8EA 5ECIB 1FB0A 1O85A 4POBA 5ENUA 4IQAA 5DCHA 2H6XA 2O89A 3M8NA 3ZRDA 3GX0A 2ON7A 1H75A 14GSA 2YCDA 3GIXA 4XHMA 2XBIA 5COHA 4V1Ag 4MJEA 4K7IA 3DWVA 1ZCPA 4MF6A 4LL1B 1Q98A 4D73A 1PN9A 2JU5A 4HU7A 2VL2A 2PU9C 5HR3A 4TRXA 1UA5A 4MP4A 5B7CA 4F9ZA 5CP1A 1V57A 5LCZA 1FVJA 1EOHA 1NW2A 5C04A 1VGLA 4V2LA 1A2MA 3CMIA 3CBUA 4WR5A 1U3AA 5CNWA 2YWMA 1THXA 4FYUA 4I2TA 4HOJA 1B9YC 5DDLA 2LJKA 5G2ZA 3VWWA 2E2MA 1THOA 3M9KA 1JFUA 1OAZA 3FZ4A 3P2AA 1SU9A 2A4VA 2KP1A 1PRXA 1ILOA 3VPTA 3TB2A 1YDKA 2GVPA 6GSVA 3IBHA 3TJBA 1GLPA 1MDKA 3WT2A 2OJLA 4WBJA 1GUKA 2GGTA 4ACSA 1X5DA 4X43A 2HFDA 3GH6A 1IYIA 4Q5FA 4DVCA 3FZ5A 5D9XA 2YV9A 1X0RA 5DJLA 4OCFA 1WJKA 1TTZA 3D4MA 4IJIA 3HCZA 2LV3A 2GZYA 2AYTA 2LTKA 2DC5A 5HR1A 2IMDA 4V1Ap 3E9JB 3DVWA 2H66A 3O6TA 1J08A 1RK4A 5ECRB 1AW9A 4HS1A 4N30A 1K0NA 2HNLA 1TKDB 3RDWA 18GSA 3HYPA 5H5SA 3H4KA 1C72A 2L4CA 1JLVA 4L5OA 9GSSA 4XS1A 4MCUA 4PQIA 4ECBA 4XS4A 2K18A 2O85A 2L6DA 4GSTA 4DEJA 2C3NA 2M80A 1TRSA 1PQNA 1ZGNA 4POKA 5GZZB 6GSSA 1OC9A 2H6YA 2C4JA 3WGDA 2H0IA 2MMZA 2GDRA 2JSZA 1JHBA 2V6KA 1V58A 2YPMA 1XW5A 1XCCA 5AGYA 1QXHA 2C0EA 4ZBBA 2OACA 1V98A 3BCIA 5IMFA 3KD0A 4DSSB 1XXUA 1TW9A 2H0HA 2FNOA 1MTCA 1V9WA 4V2NA 2JSYA 3GH9A 4V2MA 3ZL5A 6GSWA 3IK7A 4MZCA 2YN1A 2HZEB 2V1MA 2IFQB 2M72A 1WMJA 4AGSA 2IMFA 5HR0A 3F4RA 3ED3A 1W4VA 1M0UA 4HDEA 1T00A 1KBNA 1J9BA 5IMAA 5D9TA 4PUFC 3ZFBA 2VO4A 2CA8A 2H6ZA 1T7PB 1BQ7A 5F06A 1Y25A 3KIJA 2VLUA 3GN3A 2YNXA 1KEBA 4EVMA 5EPFA 5IMZA 4TR4A 2HRNA 2GZZA 2WRTA 2ON5A 3LORA 1JZWA 2FGXA 2PN8A 4HQSA 3GV1A 4K2DA 4Q5NA 3R2QA 5GSTA 2K6VA 2B3SA 3HXSA 2OBIA 3C7MA 3KP8A 4BVXA 1GSEA 1XWAA 1VF2A 2YWNA 4WF4A 3QCPA 4EDZA 1FOVA 3QOUA 4MA9A 2B1LA 1Z6MA 2VUPA 2LUSA 2R2JA 2LRNA 2LRTA 1AQXA 1YKCA 4EUYA 3KZQA 3M0FA 3S9FA 2GZPA 4F82A 4LMWA 3IDVA 2I3YA 2FLSA 1T3BA 1T1VA 2GQMA 3GMFA 2LSTA 3LEFA 1K0BA 1HYUA 2VAFA 1YF0A 4FYBA 1ERVA 3FRCA 2DJ3A 1SL0B 1GUMA 4TN8A 1PL2A 5EY6A 2JACA 3CRTA 3TOUA 4I6XA 2B5EA 2ZCTA 1XOAA 5JCGA 4WBRD 2HSYA 2VL9A 3WT1A 3HJMA 2HE3A 2CQ9A 1K0CA 1R5PA 1MDIA 3CSJA 3DGQA 1E2YA 2XBQA 2VCZA 4HJ2A 2IMIA 2IMKA 2F3MA 4MPFA 2FWHA 4KCAA 4GWRA 5A4WA 3GUSA 1WRYA 3KTBA 4TW5A 2H19A 5L71A 4K6XA 2GQLA 4F2IA 4XS6A 5J4UA 4ID0A 2GTUA 3APQA 3UOMA 3WD6A 2H76A 5E4WA 3Q74A 5FWGA 3GL3A 3WGEA 1SYXA 2A2SA 1VRSD 5B6NA 2IL3A 2YANA 3TRPA 1HNBA 5DALB 5G5EA 3ZMLA 3GFKA 4J2FA 5J41A 2I9HA 5JWQB 3GTUB 5GSSA 5ECSA 1PGTA 3F9UA 4MZBA 1ZOFA 1LJRA 1USBA 4DSSA 2C0GA 3I69A 2VLVA 1MD3A 1GP1A 1N2AA 1TK8B 2VCXA 3VLNA 2O87A 4TXOB 5ECMB 1ZYQB 2H8LA 1URMA 5B8AA 1SKSB 4PUAA 2HZEA 3LFLA 2IFQA 4ECJA 1T8EB 3P7XA 1WE0A 5D9VA 4MABA 1FB6A 5H5RA 3DYRA 3BOAA 4ZBDA 3UBKA 2N5BA 3KXOA 3G7IA 1DBYA 3I6AA 4ZL8A 1F9MA 3UARA 1HNCA 3TGZA 3GX8A 3HJPA 1JZRA 1JLWA 2OKAA 4IS0A 4OO4A 3GSSA 3HZ4A 2REMA 3G9BA 1AUCA 5DQSA 3J7Yb 1GWCA 3O3TA 2TRXA 2C1YA 3DXBA 1VF1A 4OWYA 1TXXA 3APSA 4ML1A 2HYXA 2I1UA 1A2LA 1EOGA 2B5YA 4NHZA 3DEXA 2P5QA 3W8JA 2C0DA 1XWCA 4MJBA 1S3DA 5ELGA 1NSWA 5IIZA 4OCEA 5INYA 2EIQA 5KN3A 3EE2A 2ES7A 2RLIA 1OE7A 2E0QA 2LNSA 3VURA 3M1GA 2MMNA 3C1SA 4RI6A 1SD8A 2X8CA 1EWXA 4GQCA 4F0BA 4J57E 5IO2A 3ZIJA 5DVBA 2DMLA 3Q18A 3ERWA 2QGVA 4ZB6A 4IKHA 1KTEA 3KGKA 3L4NA 3A2WA 4WXTA 2YWOA 3TRQA 2VM2A 1K3LA 1OC8A 8GSSA 3N5OA 2F8AA 16GSA 4F0CA 4N0VA 1MD4A 4MPGA 4G2EA 4TVEA 3BJ5A 3EC3A 3QFAC 4YQMA 5IMCA 1V40A 4X1UA 4JBBA 19GSA 1UN2A 3NIVA 3ZMKA 4JRRA 3BD2A 1XW6A 4NHWA 2KOKA 3I43A 4JU5A 4LL4B 5ECKB 4EKZA 5F05A 2EIRA 2L5LA 2WB9A 3LYKA 4RUVA 4ECCA 3I9V2 1BAYA 1NHOA 3BCKA 4GCIA 4ISDA 1I5GA 5ECNB 2VL3A 4NV2A 4PX1A 4OD7A 2PVQA 2H1BA 4G19A 5AIXA 3U5RE 1ON4A 1K3YA 3UBLA 6GSYA 1M99A 2H71A 3MAKA 4NWYA 1G6YA 5DAKB 2B5XA 5JCUA 1A0FA 5DALA 4KCEA 1AXDA 3A5WA 1ZL9A 1B9XC 2ZNMA 5C00A 5DCGA 5CRWA 2WFCA 3GTUA 4XTSA 1PSQA 3ERGA 3VI7A 4BL7A 1YY7A 3CYNA 3L9VA 5CYYA 5G1KA 3IXRA 4KH7A 3WGXA 4TXOA 5D9WA 3CRUA 3IA1A 4GRFA 5DQYA 1G6WA 6GSTA 3W6GA 5HFGA 5AN1A 3QFBC 1ML6A 2DJKA 5G31A 1Z7RA 1H4OA 1SK0A 1ST9A 3EMPA 3SWLA 1ZYEA 2X64A 3KH7A 1XOBA 2NVLA 3A2VA 1GSDA 4AF2A 1TK5B 4XRAA 3ZTLA 2C8UA 4KDXA 4RQXA 1SYRA 1B4QA 11GSA 4HEA2 5F07A 1XFLA 2IIYA 5HFIA 3ISOA 3TRXA 3DRNA 2IMEA 5AISA 2AAWA 1SL1B 1WPIA 2F9SA 3D0ZA 2CX3A 1AQVA 1GLQA 4O7HA 1Y6EA 3UEMA 4KNDA 3TOTA 1M2DA 2H75A 1OC3A 4I2UA 5KN1A 1SK2A 3RAZA 5IOWA 2PWJA 3F0IA 5D93A 4IHUA 2RUEA 4GF0A 4IGJA 2JL4A 2B7KA 1DSBA 4YQVA 4K7OA 3FKFA 4YH2A 1XZOA 4KW6A 5ECPB 1VF4A 3HJOA 1O6JA 1EEJA 3RBTA 17GSA 3VI5A 2ZUPA 3DVXA 3LSZA 3QAGA 4OFTA 2R5GA 4ZXGA 2VLTA 3GURA 4K7NA 2LNTA 5J3RA 1MDJA 4OFNA 3LQ7A 3A2XA 3G7JA 4TKYA 4EXJA 2I81A 4G9HA 1GL8A 2FWEA 2C3QA 1CQHA 1FW1A 1SD9A 2B1KA 3N9JA 1SKWB 1SJIA 4IQ1A 3NZNA 5F0GA 2DMMA 1TOFA 3EYTA 3H1NA 2LKUA 1NHYA 2HLSA 4ZILA 2CV4A 3TJGA 2MYGA 4JR6A 2XC2A 1X9MB 1SJ6A 5D96A 2OBKA 3A3TA 1A8YA 6GSUA 1T4YA 3MWHA 2GSQA 4GSNA 4GLTA 2P5RA 4N11A 4XRDA 4EDYA 1TDIA 3DIEA 3TJJA 1EGOA 4YAVA 5CO3A 3HVVA 1A23A 5AIVA 5GAPD 2G0FA 2CVDA 1BG5A 1PX6A 4IN0A 5E59A 4RI7A 4LA1A 1Q4JA 2Z9SA 3D21A 2WDUA 3IAM2 1BYEA 1TRVA 4WF5A 4WR4A 3SBCA 4IJ3A 2LS5A 3HY2A 3J7Yk 3TKSC 2H74A 2L6CA 5H5QA 5DAKA 1QFNA 2FWGA 4ZIJA 4GTUA 3F8UA 4ML6A 1ZMAA 2YV7A 1SENA 4BWSA 2N5AA 2AJQB 5JWRB 1GNWA 1YKAA 3KMOA 3TDGA 2YZHA 3TJFA 2LEGA 3FEUA 3ME7A 4WETA 2IN3A 3FZ9A 3H8QA 2K9FA 4PXOA 3FK8A 1M7TA 1FO5A 3D5JA 4IW9A 4DSQA 1XW9A 1F6MC 5KEJA 3W8SA 1SKRB 5ELAA 4KSMA 1GSQA 1DE2A 1TP9A 2X99A 3EU3A 1WP0A 3HHVA 1B4PA 3KCMA 1GRXA 4AJ7A 4G10A 2XPEA 1PD21 3ZFLA 4PURA 2L57A 2WULA 3F3QA 2LQOA 2P31A 1SJZA 2H73A 3EWLA 3KP9A 5IPGA 1QK8A 3U6VA 4ULXA 3GKXA 4E8HA 1BX9A 4EF0A 4FYCA 4QL9A 5F8BA 4NAXA 3DD3A 2H1AA 3F4SA 2GS3A 3LGCA 5LNKe 1GUHA 3US3A 2O8VB 2DJ2A 1ERUA 2BMXA 4L0WA 4JZQA 4EL1A 1ACVA 1HQOA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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