3E3EA

Human thioredoxin double mutant c35s,c73r
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPSKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASECEVKRMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of human thioredoxin exhibits a large conformational change.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
molecule tags Electron transport
source organism Homo sapiens
total genus 38
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-08-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3e3eA00
2DC5A 4HEA2 4OFNA 3O3TA 2IMKA 4N0VA 1XWBA 2C3QA 1RW1A 3NOFA 4L5OA 2IMIA 1PSQA 1M99A 5DALA 4YAVA 3GSTA 6GSYA 3ERWA 1XXUA 1PN9A 2VM2A 1S3DA 3M9JA 4TXOA 4ECJA 2X8CA 1R26A 2TRCP 3APQA 4MJBA 4YH2A 4MP4A 4EDZA 2R2JA 4NMUA 1MD3A 1T3BA 1F37A 3FR6A 3UAPA 3M9KA 2OJLA 6GSXA 3CSHA 4PX1A 4PUAA 4RQXA 2CAIA 1GULA 1TRUA 2CX4A 3IK9A 4OO5A 2QGVA 3TCOA 5GAPD 3ZVJA 2P5QA 1O8WA 2OKAA 4LLRA 3N5OA 1X5EA 4K9ZA 4AGSA 5DQYA 3TRQA 3TB2A 2ZNMA 8GSSA 3APOA 3DEXA 4PQ1A 1BG5A 3ZL5A 4G2EA 1TI1A 3BCIA 1A8LA 3KEBA 1Y6EA 3VWWA 4TN8A 2E7PA 2P31A 3FKFA 3W8JA 1SU9A 3ISOA 3PH9A 2KOKA 1F6MC 1SD9A 4I2UA 4F82A 2GSSA 3L78A 2DIYA 2IMEA 3W6GA 4F9ZA 3FYGA 3GMFA 5ECHB 2FUG2 3DVWA 5FWGA 4GSTA 2V41A 5GZZB 3HYPA 2IFQB 16GSA 1UA5A 5D93A 3W8SA 1OAZA 3DD3A 1X9SB 2L6CA 3FR9A 5F05A 3RAZA 4HQSA 1EEJA 1EP8A 5B7CA 2HFDA 3A2WA 4TR1B 9GSSA 3H8QA 2WGRA 1KTEA 3QPMA 2I9HA 2WULA 2CVKA 4O7HA 3KMOA 1DBYA 2V1MA 2HE3A 2XBIA 2ON5A 2V6KA 1EGRA 2CZ2A 2R5GA 5L71A 2O8VB 5GAND 4IQAA 3TGZA 3EU4A 2FLSA 5ELGA 2GLRA 1AW9A 3TKRA 2B5YA 2O85A 2GZYA 4PXOA 5D9WA 2A2SA 2LRCA 1AIUA 2GSRA 2LQQA 12GSA 3UVHA 2FY6A 2WB9A 4XS1A 1ML6A 4WKWA 3ZTLA 4EKZA 4KW6A 1TK5B 2C3NA 6GSTA 1JLWA 2H71A 3HHVA 3PGTA 4GXZA 2R4VA 3Q19A 4PURA 4EUYA 1G0TA 5ECMB 3F6DA 1M9BA 2HRNA 4OFTA 3ME7A 4OD7A 2OADA 2YWOA 3FY7A 4D73B 4Q5FA 3HA9A 3ZMKA 3LXZA 2CA8A 5DJMA 4K7OA 1EOHA 5J5NA 3VFIA 1YKCA 1QUWA 4KDUA 4MA9A 2WCIA 3D0ZA 2LJKA 4YQUA 1I5GA 1GLQA 5IMFA 1KNGA 4N10A 2YCDA 1FVKA 4KUNA 13GSA 4JE1A 1G6WA 2VCXA 4JZQA 1ZZYA 2GSQA 1A8YA 4ZB8A 3IXRA 1U6TA 4TR0A 2PN8A 5AIXA 3RDWA 1B48A 2MMOA 1K0CA 3TRPA 2YV9A 5LD0A 2DIZA 4F03A 2H70A 1M9AA 5ELAA 1URMA 1XWAA 1O6JA 1V9WA 1ON4A 3WT2A 3KGKA 1TI3A 3GL3A 4V2LA 2YZUA 2H6YA 1ZOFA 4RI7A 2VOCA 2GZZA 2MZCA 3DMLA 5ID2B 3CSIA 1GTIA 3BCKA 4I6XA 3GV1A 4ZL7A 4IJIA 3P2AA 3D4MA 1O73A 3IBHA 4J56E 3D5JA 3U6VA 3DYRA 4ILFA 4NHZA 2B7KA 2N5BA 1U88A 3FHKA 3GHAA 1OC3A 18GSA 3TJJA 2AYTA 1PX6A 1YY7A 3F63A 2BTOT 4KX4A 5HQPA 1FOVA 5G5EA 1O85A 5CP1A 4N0ZA 5E4WA 4MABA 3FEUA 3C71A 2OE3A 5A4UA 2H0HA 1DE1A 4GSNA 3TKSC 1WOUA 5COHA 4K6XA 4MJAA 3O76A 4V2MA 1ZYEA 3QMXA 4IELA 4ZILA 1Z7RA 2YV7A 1PQNA 5D9TA 4FIWA 2VAFA 1PMTA 3MDKA 5J41A 3HVVA 1F3AA 4ZL8A 1USBA 3KJYA 3ZLPA 3D21A 2I3YA 1SL2B 1BJXA 5LNKe 3QOUA 1TU8A 4QQ7A 4GF0A 1PA3A 1CQHA 3N9JA 3ZREA 1X0RA 4KH7A 4FYBA 2ZUPA 1JZOA 1AC1A 2CX3A 4KAEA 4WBJA 4ML1A 2YJ7A 1K0NA 3G7JA 3WGXA 1XVQA 1SYRA 3GSSA 1MDJA 1K3LA 2M46A 5CAXA 6GSVA 5DDLA 3EYTA 1GTUA 1AQXA 1WIKA 2F8AA 3F9UA 1EWXA 3HCZA 4JU5A 5ECPB 1JLVA 2QC7A 3KP9A 1UVZA 1SK2A 2H75A 2AB6A 3VWUA 4BL7A 3G7YA 4IP6A 3ED3A 2NDOA 1GH2A 5ECNB 3ZFBA 1OE8A 2WS2A 2VCQA 2NPBA 4K7IA 4MJEA 3KD0A 3H4KA 4KE3A 5IPHA 3HVXA 2ON7A 2FD3A 5H5SA 2CT6A 1JZWA 1ERWA 5G1KA 4G10A 1S3CA 2M72A 3IE3A 4KA0A 5IM9A 2X99A 4CDOA 3D6IA 1QMVA 1X9WB 1YEXA 2L5LA 1TRSA 3UJ1A 1DSBA 3EURA 4WR4A 3KMNA 3GNJA 1M7TA 1MD4A 1Z3EA 4RQRA 2CVBA 5HFIA 1A2MA 5CNWA 1H4OA 3DIEA 4MMMA 4KDYA 2YOIA 2IN3A 2F9SA 3M0FA 3GA4A 5GSSA 5F0GA 1TK8B 2GZPA 1SENA 3UEMA 1FAAA 4GCIA 3IHQA 2WJUA 1M2AA 2X64A 4ZB9A 1PKZA 1KBNA 1WE0A 4IGJA 1Z5YE 2O87A 3LGCA 2RIIA 1OKTA 1K0DA 1V58A 4ZBAA 1XW5A 11GSA 4EXJA 1XZOA 1JFUA 4ECCA 3GH6A 5IO2A 1MDKA 5CREA 1TTZA 3CBUA 17GSA 3HJOA 4RI6A 2R37A 4EL1A 2NVLA 1FW1A 4ML6A 3CTFA 4WR5A 1YF1A 2GQLA 4JEDA 2GGTA 2VD0A 5IO0A 2HYXA 3UOMA 3FZAA 5IMAA 3WGDA 4EVMA 2HRFA 3KIJA 3CXGA 2DBCA 2MBSA 4MF7A 2VL3A 3HXSA 3ERGA 3QD9A 3FR3A 2H1AA 2E0QA 3CRTA 2PU9C 3ZMLA 3TOUA 2D2ZA 2YPMA 3HVSA 4BWSA 3LEFA 2MMAA 2GDRA 4GTUA 1O7UA 1GLPA 2RM5A 2JL4A 2DJJA 4O92A 3F6FA 3SBCA 2RM6A 1SL0B 2LV3A 1Y25A 2R6KA 3LYPA 3RBTA 1QQ2A 2FWEA 2MMZA 4K0GA 1E2YA 5ECIB 2YNXA 2J9HA 4PQIA 4XS4A 4JR6A 4EO3A 4IHUA 4NXIA 1N8JA 2IMFA 3LXTA 2L57A 3KH9A 3ZIJA 3HD5A 5AISA 1V98A 2P5RA 10GSA 3L4NA 4LL1B 1PKWA 4ZIJA 1A0RP 1QFNA 1U3IA 5B6MA 1XW9A 3KP8A 2KP2A 4GWRA 4TR3A 3J7Yk 4E8EA 2NBSA 4X0XA 4HJ2A 4L0UA 5ECKB 1Q98A 3F4SA 3EE2A 1FVJA 3I69A 1HNBA 4XRAA 2QSIA 3M3MA 1IYIA 2I1UA 3ZITA 2FHEA 3RHCA 5G30A 1EV4A 3PR8A 5C00A 3VPTA 2CZ3A 5D9VA 3WT1A 5HR1A 1EV9A 4GQFA 2L59A 4TW5A 1NSWA 4HZ2A 1EP7A 5F07A 2C3TA 4LA1A 5EVOA 2DJKA 3Q6OA 5EL8A 7GSSA 1TU7A 2F3MA 4K1FA 3LFLA 1AXDA 5AGYA 2OE1A 19GSA 1GP1A 5JWQB 2VLVA 3D22A 2E2GA 2JACA 4OWYA 1T8EB 2EIQA 4L8EA 2OA7A 2JSYA 2Z9SA 3L9VA 1K0MA 2YZHA 3JCML 3LJRA 2H6XA 4LMVA 3EMXA 4LMWA 5B8AA 4WEYA 4BPYA 2DJ1A 4FH8A 1LBKA 4MZCA 2LJRA 1PL2A 1QXHA 1PRXA 2K8SA 4WBRD 2F51A 2IPAA 2EC4A 4CHSA 2HSYA 1XOAA 2A4VA 3TRXA 2G2QA 4F0BA 5D73A 4LL4B 5C04A 4OFMA 1YZXA 2V2GA 5HR2A 1K0AA 6GSSA 3GL5A 4IQ1A 2WRTA 4YQVA 2L4CA 1TDIA 4ECIA 3RPPA 5H5QA 5DCGA 1V40A 1G6YA 3HZ4A 3KCMA 3Q74A 3QAVA 2MMNA 1BYEA 3S9FA 2I81A 4JR4A 1PD21 2HT9A 1T4ZA 2JZSA 4AJ6A 4ULXA 4HJMA 3TKPA 1XWKA 1GUKA 1QK8A 1GNWA 3KZQA 4TRXA 3VI7A 1N2AA 4MF5A 1HQOA 2H1DA 2H1GA 4POKA 1GTBA 2AJQB 1F9MA 2FWHA 3MAKA 3IV4A 4EC0A 2FA8A 1M2BA 2LSTA 3KXOA 5DQSA 1SJIA 2FA4A 4L5LA 1R7HA 4KCEA 1OVNA 5ECOB 2B7JA 1J9BA 4G9HA 4OO4A 2B5EA 1UC7A 2L5OA 2VL2A 3IPZA 1G7EA 5IMZA 2H6ZA 1NHYA 3F8UA 2GQKA 3A3TA 2NTOA 3DWVA 3H79A 4BWQA 1YDKA 3TJKA 1VF4A 2C1YA 2VUPA 1O81A 2L4QA 2VLTA 2WZ9A 3UMAA 2C0FA 1MTCA 3VK9A 2JU5A 3L9SA 2O89A 2B3SA 4YAPA 2H73A 2G0FA 2VLUA 5DAKA 5JCGA 4NWYA 3FRCA 4V1Ag 3A2VA 3CSJA 4ACSA 2B1LA 1UN2A 5IOXA 3M1GA 3C1SA 2AHEA 2LTKA 1VF1A 3WYWA 3ERFA 4MZBA 2H0GA 3UARA 3EC3A 2RUFA 5D9XA 4WF4A 3KTLA 3GKNA 3TJFA 3KH7A 5CO3A 3TJBA 22GSA 3VWXA 4HQZA 4IJ3A 2YJHA 2C4JA 4IBPA 5KN3A 2CQ9A 3ZRDA 2XHFA 2CV4A 1T7PB 2OBKA 2PWJA 2GTUA 2H74A 3F3RA 4TKYA 1O8XA 3RPNA 3P7XA 3UBLA 2H76A 5J3RA 4ISDA 4K2DA 2DSAA 3FZ4A 4XS4B 1OKDA 5ENUA 3CTGA 5F06A 4MPGA 1TXXA 2FWGA 2MYGA 5J4UA 3DRNA 1ZMAA 3GKKA 1DE2A 3HY2A 2H8LA 3MSZA 5DBQA 2LNSA 3LSZA 1A2LA 5B6NA 2XPDA 1I9DA 1X5CA 2KLXA 3ZIVA 4ID0A 2FGXA 3QCPA 3I9V2 4Q5QA 2GT6A 3G7IA 3IAM2 1Z9HA 4XHMA 5A4WA 3ZZXA 5IMDA 3WGEA 2H72A 1PX7A 4V1Ap 2MBTA 1NW2A 5D96A 1GSQA 1XFLA 3C8EA 1B8XA 1M0UA 3HDCA 5GSTA 1TP9A 4IVFA 4IS0A 1GL8A 3F4TA 3IOSA 1HNCA 2H30A 1GSYA 3Q18A 1PL1A 2LEGA 3E3EA 5ECSA 3UVTA 1EGOA 2QKEA 1GSEA 2PMTA 2N5FA 1SJ6A 3LQ7A 1SJZA 4QL9A 2WFCA 4K8MA 3KM6A 4BVYA 5CRGA 5KN1A 3IC4A 3AY8A 4HI7A 3C7MA 3APSA 1WMJA 2K18A 3D4TA 1J0FA 1XPVA 5IPGA 5A4VA 4JRRA 1AQWA 1F2EA 2AUVA 5LCZA 4KNDA 3MWHA 1H75A 1SK1A 1DUGA 1A2JA 2VCVA 3SWLA 2LNTA 1YEPA 2A2RA 3R2QA 4PNGA 1FHEA 3H93A 2VL9A 3U5RE 4FYCA 2V6OA 3GUSA 2LKUA 3FW2A 4KSMA 4N30A 2RUEA 2PERA 4IW9A 1GRXA 5DVBA 2C0DA 4K0NA 4RUVA 1ZL9A 1IYHA 3HJMA 1FB0A 4AJ7A 2FWFA 4NV2A 4NPBA 1XW6A 1KEBA 5INYA 3P8WA 4BA7A 2PUKC 1A23A 1F3BA 4MF6A 2GS3A 1TJDA 4H86A 4O5RA 4X1UA 3VPQA 1BAYA 4MPFA 4GSSA 3CMIA 1EOGA 1TK0B 4KGIA 4FO5A 2HZEB 1RQMA 5E59A 1ILOA 4L0WA 1XIYA 1W4VA 3GTUA 4OMVA 5HFKA 2E2MA 2XBQA 5ECRB 3EU3A 3LORA 4HOJA 4N11A 2VO4A 2FNOA 1AAZA 4ZBBA 2VM1A 1ST9A 1AQVA 1TW9A 1OE7A 2B6MA 2H66A 1OC9A 5G31A 2HLSA 1M2DA 1JZDA 2HXKA 5J9BA 3IAS2 3GH9A 1XBSA 5F8BA 3G9BA 2JADA 1JZRA 1T00A 2YWNA 1Q4JA 3GRXA 2B1KA 2H1BA 1ZYQB 2VL2C 4NV5A 1Z6MA 4AJ8A 1THOA 3QDNA 2F8FA 3NIVA 3A5WA 2C0EA 1X9MB 2OBIA 3GX8A 1GSUA 3WD6A 1T1VA 4FYUA 2KUCA 4IN0A 3EVIA 2YANA 1ZGNA 5G1LA 1SL1B 2PVQA 1BX9A 1YKAA 3L0HA 4HZ4A 3TKQA 5DAKB 4MZWA 3GN3A 1SKRB 2DJ2A 3LG6A 1E6BA 5CRHA 2XPEA 1G7OA 3KTBA 3F0IA 5DJLA 2X8GA 4HS1A 4PGTA 4PUFC 1NM3A 5HR0A 1WJKA 2RLIA 1TOFA 5AIVA 1ABAA 4O32A 3BJ5A 2LRTA 2VIMA 1Z7PA 4J57E 3NZNA 1OC8A 4I8BA 2YWIA 3VI5A 2O7KA 3LYKA 3I43A 4XCSA 5ECQB 5EPFA 2J23A 2TRXA 4DSSB 2YWMA 2WDUA 4E8HA 2V32A 4TVEA 2LQOA 3ZFLA 3ZYWA 3FZ9A 2C0GA 3VWVA 2P0GA 1XWCA 1U3AA 3HJPA 5IMCA 1VGLA 4OCEA 1R4WA 1VF2A 4XRDA 3BBYA 5KEJA 3GX0A 1HD2A 4J2FA 3RHBA 4POLA 1K3OA 2IWTA 2DLXA 3IRAA 4KB3A 2H01A 2OE0A 4KDXA 1PGTA 5FHIA 2LJAA 3MNGA 1FO5A 2LRNA 1V2AA 2HZEA 4V2NA 3QR6A 1LJRA 3BD2A 1WRYA 5HFGA 1ERUA 4PNFA 2IMDA 1K3YA 3QFBC 2DJ0A 2DMMA 4ZBDA 1YJ6A 3TOTA 1FB6A 4MH2A 1Z6NA 2JSZA 4AF2A 4WXTA 4TOPA 1C72A 3FZ5A 2ALBA 2HI7A 1GUMA 2PBJA 3UIWA 1JHBA 3C1RA 3CRUA 1GSSA 1CQGA 1GNEA 4XTSA 3VLNA 2B5XA 1GSFA 5H5RA 2H0IA 5ECLB 4IKHA 1ACVA 1VRSD 4EF0A 4ZXGA 2DJ3A 1LU4A 2PGTA 4NHWA 4MJCA 2LUSA 1ERTA 4HU7A 4GQCA 4DEJA 3K8NA 2REMA 1SYXA 2I4AA 2X8HA 3GFKA 4K7NA 1TRWA 2KP1A 3P90A 2CAQA 2OACA 3FK8A 1HYUA 3HZ8A 2IFQA 3IDVA 5JCWA 2VCZA 1J08A 5KN2A 1SKSB 1X5DA 1S3AA 3QAGA 5A5KA 2JZTA 2GT5A 4TR1A 3QFAC 5CRDA 3EMPA 3F4RA 3DKSA 1TKDB 1B4PA 3TKSE 5AN1A 2C8UA 3E0UA 1A0FA 4I5QA 3EINA 3H1NA 2KHPA 1SK0A 1B9YC 1EEMA 2YN1A 1MEKA 2EIOA 3BOAA 3IK7A 1K0BA 5DCHA 5HR3A 4EDYA 2H19A 4BVXA 2IL3A 1VF3A 4POMA 3DXBA 4IP1A 5IMVA 4Q5RA 5B8BA 2K9FA 3GURA 3DVXA 2C80A 2HSHA 1BQ7A 1U87A 3E9JB 4DSSA 2YP6A 1YQ1A 1YF0A 1ERVA 5JCUA 1WWJA 4JBBA 5KN0A 5DALB 2PVOC 1V57A 2K8VA 4XIHA 5D8IA 3PINA 3UL3A 4G19A 2AV4A 2DMLA 3GYKA 3F3QA 4D73A 4TXOB 4DSQA 4ZL9A 1GUHA 2IJYA 2ZCTA 2LS5A 3GTUB 4Z7XA 2GSTA 4F0CA 4EE0A 2N5AA 4ZB6A 3UBKA 2FCHA 4XS6A 4X43A 4F2IA 5G5FA 4ECBA 1OC9B 3ME8A 2HZFA 6GSUA 3GIXA 4PQHA 1WP0A 1QGVA 2BJXA 2PPTA 3V1WA 2CVDA 2JZRA 3LWAA 5IOWA 4POBA 3CYNA 4GLTA 4TR4A 4MH3A 2TIRA 4P3YB 1WPIA 14GSA 4YQMA 5J9CA 4HUAA 2XC2A 2BMXA 4I2TA 4HDEA 1GWCA 1XWGA 2HNLA 4OCFA 4WF5A 4CW9A 1SKWB 3TDGA 2L6DA 3HKRA 1FG4A 3C73A 2K6VA 3IA1A 4DVCA 1R5AA 3TUEA 4Q5NA 5ID2A 3ZVJD 4GRFA 1GSDA 1MDIA 1K0OA 3L9UA 1HNAA 2VCTA 5IIZA 1XCCA 1RK4A 3GKMA 5JWOB 1TRVA 4QL7A 3TJGA 1AUCA 1XVWA 4KSOA 5ABRA 1W89A 3I6AA 3US3A 1T4YA 4WETA 3J7Yb 4MDCA 3EWLA 2AAWA 4HU9A 2R3XA 3A2XA 2VD1A 1BEDA 1EZKA 3QAWA 3VURA 3M8NA 4DSRA 3DGQA 4I97A 4MK3A 1B4QA 2GQMA 3O6TA 5CYYA 3TKSA 1XOBA 1OYJA 1R5PA 2EIRA 5JWRB 4TXVA 1SD8A 1B9XC 3OR5A 20GSA 2IIYA 3GKXA 2VCWA 4NAXA 5G2ZA 1A24A 4MLYA 4MCUA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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