3E3EA

Human thioredoxin double mutant c35s,c73r
Total Genus 38
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
38
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
MVKQIESKTAFQEALDAAGDKLVVVDFSATWCGPSKMIKPFFHSLSEKYSNVIFLEVDVDDCQDVASECEVKRMPTFQFFKKGQKVGEFSGANKEKLEATINELV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of human thioredoxin exhibits a large conformational change.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thioredoxin
molecule tags Electron transport
source organism Homo sapiens
total genus 38
structure length 105
sequence length 105
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-08-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3e3eA00
3UBLA 2CA8A 2IFQB 2LQQA 1XZOA 3KD0A 2PBJA 3MSZA 1PSQA 2WFCA 3BOAA 2GSTA 5DVBA 2GZPA 3QFAC 3TCOA 2GQMA 1SYXA 1V98A 3N9JA 4F9ZA 4X43A 4FIWA 1MDKA 3CRTA 1THOA 1G7EA 2C0GA 5ID2A 2OACA 1YF1A 2L4CA 2KOKA 5IM9A 5CREA 2DJJA 2FA4A 2I3YA 3VK9A 4JRRA 5DQSA 1O85A 3UEMA 1OKTA 2E7PA 3C71A 1XW6A 2OKAA 3F4RA 1M2DA 4ISDA 4HI7A 20GSA 1YQ1A 1H75A 1CQHA 2VD1A 3F4TA 3TGZA 1TK0B 3DRNA 1U3IA 3SWLA 2RIIA 4DSSB 2LTKA 1J9BA 1R26A 2NBSA 4NHZA 3MAKA 2LKUA 1PL2A 5B6MA 2VLVA 3DGQA 3AY8A 1GSDA 4YQUA 5CRWA 4BVXA 1FB6A 4KDUA 1R5AA 1M9AA 2CQ9A 4NV2A 4POBA 5E4WA 4G2EA 3FEUA 4LA1A 1EOGA 1XCCA 2WGRA 4G10A 3I69A 4PUFC 4V2MA 1VGLA 4PGTA 4FO5A 4EL1A 2DJKA 4ZILA 1EGRA 3L9UA 2WULA 1URMA 1V2AA 4MF7A 2LSTA 2DMLA 3CRUA 1YZXA 4WEYA 2CVBA 3IE3A 2CZ2A 2H74A 5KN1A 2C4JA 1QGVA 4TR4A 2GLRA 3UARA 3VWWA 1J08A 5E59A 2C80A 1XWGA 2DJ1A 3ERFA 3RBTA 4Q5NA 1XVQA 4HQZA 2IMDA 3HVXA 1GSFA 2LRNA 3D0ZA 5F0GA 1AXDA 2AHEA 3HA9A 2DIYA 5INYA 4BA7A 1GSYA 2IL3A 2YOIA 3Q6OA 3G7JA 1A2LA 4I6XA 2VCWA 3IR4A 4GF0A 1Y6EA 1EWXA 1VF3A 3IA1A 2I1UA 3ZMLA 1HNBA 2H71A 3P2AA 7GSSA 1R5PA 2I81A 1GSQA 2FCHA 3DKSA 2C8UA 3QD9A 1I9DA 2JZRA 1QFNA 2F8FA 3IRAA 1WRYA 1GSSA 3M1GA 5A4WA 4F03A 2VAFA 5ECMB 3MWHA 2QKEA 1E2YA 4IJ3A 2M80A 4MA9A 1XXUA 5G5FA 3ZFLA 1SK0A 3DYRA 5ECSA 3QFBC 1O8XA 1RW1A 3D4TA 1QMVA 4WKWA 1NSWA 1AC1A 2R6KA 4IS0A 1F9MA 4X0XA 4HEA2 2YZHA 3A2WA 1PN9A 2CAQA 2KP2A 2OE1A 5CNWA 4BPYA 2VL9A 5A4UA 1XW9A 2B1LA 1U87A 4GQCA 3HJPA 1LBKA 1DSBA 2IJYA 2VCTA 4JR4A 2DLXA 5A5KA 2N5FA 3U6VA 1B4PA 4RUVA 1B9YC 3HJMA 1FVJA 2WJUA 3IK7A 2WCIA 4AF2A 2V6OA 1XWBA 1TI1A 1FW1A 3BJ5A 3TKPA 1AQXA 3I43A 3Q74A 4HDEA 5DBQA 3UVHA 5CYYA 3FW2A 1PX6A 3M8NA 11GSA 4OO4A 2B5EA 1FO5A 1TXXA 5F06A 3IHQA 5IOWA 4X1UA 1GNWA 3W8SA 1O7UA 2MZCA 1F3AA 2WRTA 3M0FA 3OR5A 2LJRA 3L78A 1OE7A 1PKWA 5IMVA 3O6TA 5G1KA 2RLIA 4WF4A 3FY7A 3LFLA 4HJ2A 1N2AA 1PGTA 2M72A 2XBQA 1W4VA 1DE2A 2DSAA 4AJ6A 2AYTA 1G6YA 3HY2A 4IKHA 4H86A 1X0RA 2E2GA 5B8BA 1WMJA 4V2NA 4MK3A 5H5SA 4DVCA 5AIXA 4IQ1A 3GA4A 4Z7XA 3WD6A 5H5RA 5CAXA 1GTUA 5CO3A 4MZCA 5A4VA 4KDYA 1ILOA 2EIOA 1GSUA 4ILFA 4DEJA 3GX8A 1OKDA 4K7IA 3ISOA 1ABAA 2PU9C 2GSQA 3ZTLA 5ECNB 4WXTA 2HNLA 3KH7A 2X64A 4HZ2A 1FHEA 1VRSD 1OC3A 4MJCA 3E3EA 2ON7A 1GULA 5DQYA 3Q18A 1Z6MA 2LV3A 3GL3A 5IPHA 3H79A 3VPQA 2E2MA 4YQVA 3HD5A 3TUEA 4JR6A 5GSTA 4KH7A 3UJ1A 5CRGA 1T4YA 5JCGA 2OE0A 1XWKA 2JU5A 3KJYA 3A2VA 3EYTA 3S9FA 4K8MA 4FYUA 2H70A 2R3XA 4POMA 4OFMA 3ZYWA 4Q5RA 3LG6A 4NMUA 1HQOA 4J57E 5L71A 2GS3A 2P31A 3BD2A 1MEKA 5ECKB 1Z5YE 2O89A 10GSA 5HR2A 3TOTA 4O92A 2GZZA 1GUHA 3NOFA 1K3LA 2H1BA 4GTUA 3CTGA 4QL9A 1FB0A 3L4NA 3C7MA 4F2IA 4EVMA 2VL3A 4XRDA 1MTCA 1UVZA 3LGCA 13GSA 3M9JA 2GT6A 5IMZA 9GSSA 1PX7A 1WE0A 4ECBA 2C1YA 3H1NA 2I4AA 1GUKA 3H8QA 2YV7A 4G19A 2H0IA 4KSMA 2MMZA 1K0DA 1HNCA 3GX0A 1GH2A 2GDRA 4MZBA 5HFKA 1ZMAA 3KCMA 3E0UA 3WT2A 1WP0A 3TDGA 5JWRB 3D21A 1WPIA 3QOUA 1KTEA 4BWSA 3FKFA 4IHUA 2TIRA 3C73A 3QCPA 4BWQA 3VPTA 1YKAA 2X8HA 3KP8A 4N10A 3QAVA 1EOHA 2M46A 4WETA 3O76A 3LEFA 4Q5QA 1Z6NA 3ED3A 5CRDA 2H8LA 3EURA 3FK8A 4YAPA 1OE8A 3LWAA 4PX1A 2VIMA 3WGDA 4I8BA 2C0FA 2FD3A 3TJKA 3FR3A 3KTLA 4MJEA 3ZVJA 3HVVA 4RI7A 4WBRD 5C04A 3US3A 2RUFA 3FZAA 5J3RA 1XIYA 3W8JA 3GURA 1QQ2A 1X9MB 2MMAA 5D9VA 1Z9HA 2HE3A 2VUPA 4EF0A 6GSTA 4HU7A 1NM3A 1F3BA 1ZZYA 3QPMA 3ZITA 4NAXA 1SD9A 3HZ4A 1X5CA 4JBBA 1O8WA 3D5JA 5HFIA 4V2LA 5G30A 4IJIA 4MPGA 3GKKA 5CRHA 1BX9A 1B9XC 3FR6A 4JZQA 3IBHA 2JADA 1R7HA 2AJQB 3FR9A 4V1Ap 2H75A 1ZGNA 1TU7A 2H66A 3F8UA 1SJIA 5GSSA 3F9UA 4JEDA 1PD21 4LL1B 1NHYA 1EEMA 2P5RA 2Z9SA 1EZKA 4CDOA 2DC5A 3A5WA 1M2AA 2GZYA 2GSSA 4TR3A 1XVWA 4QQ7A 3CXGA 3LORA 4DSRA 3F3QA 3CBUA 4WBJA 3F0IA 4OCFA 3ZRDA 6GSWA 1YEPA 3FHKA 2J9HA 2D2ZA 5ELGA 4GXZA 1AQVA 5DCGA 3DEXA 3QR6A 4WR4A 2VL2C 2KUCA 4TOPA 1E6BA 5C00A 4KX4A 4MPFA 4NV5A 2F51A 4I2UA 5DCHA 3ZMKA 4AGSA 3EU3A 3IAM2 3P7XA 5FHIA 5J4UA 3CMIA 3TJJA 3EMXA 5ABRA 2JSZA 2FY6A 5IMFA 4HS1A 4BL7A 2HZEB 3GRXA 1XW5A 4ML6A 4MABA 2RM6A 3N5OA 4O7HA 3G7IA 1A8LA 3VI7A 2WB9A 4ZIJA 3IAS2 2PGTA 4XS4A 3ZVJD 1ERVA 1VF4A 1F2EA 1A24A 1ZYQB 2O8VB 4GWRA 3L9SA 3IC4A 1KEBA 2AB6A 4N0VA 3GKXA 2A2SA 4GQFA 1B48A 1TOFA 4KSOA 3G7YA 4EDZA 1TRWA 5ID2B 2B5XA 3LYPA 5FWGA 4EXJA 5AIVA 1DUGA 4GLTA 3R2QA 3Q19A 5KN0A 1GLPA 2IPAA 4O5RA 3PH9A 1JHBA 2IMFA 8GSSA 3HVSA 2N5AA 2K8SA 1BYEA 2YP6A 3G9BA 2NDOA 2IMEA 1T4ZA 2WS2A 2MMNA 3EE2A 3GTUA 3HDCA 5GZZB 3TKSC 1V40A 5IOXA 1V58A 2VCXA 2G0FA 3F6DA 4F0CA 1TI3A 2DJ0A 3O3TA 4RQXA 2EC4A 3EINA 4DSQA 6GSYA 2JACA 1Y25A 3P90A 3BCIA 4KE3A 3E9JB 2O85A 4RQRA 3M3MA 5ECIB 2YZUA 4N0ZA 3RPNA 3RDWA 3DIEA 4EO3A 1YF0A 4IN0A 5F05A 3GMFA 1ML6A 2BMXA 5CP1A 3VWXA 2VLUA 5AISA 3QMXA 4YQMA 3L9VA 1ST9A 4K1FA 1ERWA 1TRSA 6GSSA 3A2XA 3KMOA 3ZLPA 1TU8A 1OYJA 2H6XA 4E8HA 2JZTA 5IMAA 2K6VA 3C1RA 4KW6A 4ID0A 2H1GA 4MF5A 1A0RP 4OFNA 2K18A 1T00A 17GSA 4XS4B 2A4VA 2H1DA 5ECHB 1SU9A 1PA3A 2LS5A 1B4QA 3H4KA 4FYBA 1GTBA 2GVPA 4OFTA 2VM1A 2XHFA 1UC7A 2HRNA 3APOA 2P0GA 1SD8A 1OC8A 4AJ7A 2JL4A 2GSRA 1RQMA 2VM2A 1AUCA 3RHCA 3WT1A 2NTOA 1MD3A 4ECIA 4Q5FA 3BCKA 1IYHA 4HU9A 4ZB8A 4I2TA 1UA5A 3TKSE 3DXBA 1XBSA 4TR1A 2L57A 18GSA 2R5GA 4CHSA 4PUAA 2VCVA 2E0QA 3APQA 1Z3EA 1JLWA 2R37A 3KZQA 4J56E 4XS1A 4O32A 1EV4A 2X8GA 2LNSA 1JFUA 2YWIA 4KAEA 1FG4A 4P3YB 2KHPA 3GTUB 4TXOA 2H6ZA 4OO5A 4TN8A 1BEDA 1XWAA 1YEXA 2HRFA 2YNXA 2V2GA 1Z7RA 2IN3A 4GSTA 3WYWA 2C0EA 1SL1B 4D73A 2N5BA 4K7OA 2CT6A 2DJ2A 2H73A 4CW9A 1PKZA 2IMKA 4EC0A 2FA8A 5DALA 1EP7A 3PGTA 2IIYA 3EWLA 2OA7A 1GWCA 1T3BA 1WJKA 2OJLA 3PR8A 3HYPA 3EVIA 5G1LA 4MLYA 3ERGA 5IMDA 16GSA 1R4WA 1H4OA 2YWNA 4JU5A 4KNDA 1EEJA 2DMMA 4TRXA 2RUEA 5ECRB 4TKYA 3W6GA 3ME7A 4HJMA 4TR0A 3TOUA 2HLSA 4G9HA 5H5QA 3CSIA 1K0OA 5B7CA 2FLSA 2YANA 1XPVA 1A23A 1HNAA 3KEBA 2YJ7A 4EE0A 2WZ9A 4KB3A 4L5OA 3TB2A 2DJ3A 3DVXA 1U6TA 4PNGA 3CTFA 3J7Yb 1Q4JA 2GQLA 1ZOFA 2DBCA 2C3NA 5FT3A 3GSTA 1I5GA 3RHBA 5ENUA 3TJGA 1KNGA 4XHMA 2X99A 2L5OA 2KP1A 1VF1A 2H72A 2HI7A 3KGKA 3KP9A 2WDUA 1QK8A 4K0NA 2VD0A 3KIJA 1TK5B 3HZ8A 2B7KA 1PL1A 2HYXA 1JZOA 1MDJA 5ECLB 2YN1A 4K7NA 2XBIA 4TR1B 5IPGA 2GGTA 1PRXA 2FWEA 4KCAA 2H19A 3TJBA 1YDKA 1K0NA 1SL0B 1BAYA 2B7JA 1X5EA 4MH3A 4F82A 2CVDA 5IO0A 5AN1A 1WWJA 4KDXA 4MMMA 2V32A 4MJAA 5B6NA 4ZB9A 19GSA 1V57A 4OCEA 4ZL8A 3IDVA 5IMCA 1DBYA 1X9WB 2XC2A 3I9V2 4MH2A 4IELA 2CVKA 2GT5A 2YJHA 3H93A 2C3QA 4ML1A 4PQ1A 4POKA 4TVEA 5DALB 4MDCA 4HUAA 1GTAA 1AAZA 4KGIA 3IPZA 2PVOC 1V9WA 1GL8A 5HR0A 1BJXA 2VCQA 3GUSA 5D96A 3TRXA 3VFIA 3CSHA 5ELAA 4IVFA 1TK8B 3D22A 2YCDA 1JZWA 12GSA 1JLVA 2LUSA 1GP1A 3ZL5A 1SKWB 2LEGA 4NXIA 1SKSB 3LQ7A 3QDNA 2VCZA 1ZL9A 2CAIA 3UIWA 3ZIJA 2FNOA 5J41A 2A2RA 2PMTA 3IOSA 3MDKA 1K3OA 4K6XA 1QUWA 4XIHA 3HCZA 4PXOA 5F07A 2IMIA 3K8NA 4ECCA 1BG5A 4GCIA 3FZ4A 3UVTA 4HOJA 1GTIA 1OAZA 3GN3A 5D9TA 1FOVA 1YKCA 2MMOA 4GSSA 4RI6A 2TRXA 5F8BA 1TW9A 2LRCA 3EMPA 5ECOB 4MJBA 4XCSA 2PVQA 4ZL7A 4K0GA 1GLQA 2X8CA 2BJXA 1QXHA 2H30A 1A2JA 2YWMA 3DMLA 2CZ3A 3TRQA 1O81A 1F37A 1S3DA 4LMVA 2ON5A 2F9SA 1TJDA 1YY7A 1KBNA 4HQSA 3KTBA 3NIVA 3GYKA 4N30A 4IBPA 5DDLA 1A8YA 1X5DA 1TP9A 1EP8A 5D8IA 4LLRA 1MDIA 2VO4A 3A3TA 4LL4B 5HQPA 4BVYA 1EV9A 1AW9A 3APSA 14GSA 1BQ7A 4XRAA 5JWQB 5KN2A 4MCUA 5GAND 1M0UA 2OE3A 4FH8A 5HFGA 4PQIA 1O73A 2BTOT 4ECJA 2KLXA 1SJ6A 4IGJA 1M2BA 4NWYA 4F0BA 4WF5A 3CYNA 2H0GA 4L5LA 1NHOA 2VOCA 3VLNA 2F8AA 2PWJA 2HZFA 6GSUA 2NVLA 1PQNA 1JZRA 2K8VA 5JCWA 1UN2A 5IQYA 1U88A 4OWYA 4YAVA 2H76A 4OMVA 2L5LA 4MF6A 5J9BA 1M7TA 2HT9A 5IO2A 2LRTA 3GH9A 3DD3A 3GL5A 1K0MA 1T1VA 4MZWA 3F4SA 3D4MA 1SKRB 2XPDA 4L0UA 3TKQA 1RK4A 1T8EB 1ON4A 3DWVA 1TDIA 1M9BA 2OADA 4E8EA 1GNEA 1GRXA 2GQKA 2AUVA 2B6MA 5B8AA 4IP6A 1ACVA 3IV4A 3L0HA 5J9CA 5G31A 3LJRA 3GV1A 3FZ5A 1W89A 1WOUA 2VL2A 1GSEA 3HJOA 2TRCP 2O7KA 3SBCA 2H01A 2FHEA 4IW9A 4ULXA 5DJMA 5HR1A 3GHAA 1M99A 3UL3A 4L8EA 1SYRA 2LQOA 4HZ4A 3ME8A 2LJAA 5DAKA 2L59A 1HD2A 1WIKA 3CSJA 3P8WA 1K0BA 1TKDB 2K9FA 3LYKA 1LU4A 1JZDA 3LXZA 1THXA 1FVKA 3FYGA 2FGXA 2ZNMA 3LSZA 2B5YA 2JZSA 3EU4A 4JE1A 4PURA 2DIZA 3ZZXA 1C72A 1F6MC 3GIXA 1ZYEA 2HFDA 3WGXA 2QC7A 2G2QA 3UMAA 3WGEA 1XOBA 4NPBA 2PERA 4QL7A 5G2ZA 4ACSA 2FUG2 4I97A 1S3CA 2OBKA 1K0AA 1VF2A 2L6DA 1ERUA 2LNTA 2FWFA 4YH2A 3UOMA 3DVWA 4TW5A 2R4VA 3PINA 3GNJA 1G6WA 3GKMA 1NW2A 5DJLA 3TRPA 6GSVA 5ECQB 3KM6A 3QAWA 2H1AA 5GAPD 2PPTA 1ZCPA 2B3SA 3C1SA 2REMA 4ZBBA 3U5RE 1HYUA 1XFLA 1DE1A 5G5EA 3ZREA 6GSXA 3M9KA 1B8XA 3TKSA 4EUYA 2QSIA 4KUNA 4GRFA 2YV9A 1U3AA 2FWHA 2C0DA 3QAGA 3VI5A 4L0WA 5EL8A 3TJFA 3IK9A 2PUKC 5JCUA 3GKNA 4ZL9A 4ZBDA 2VLTA 3F63A 2CX3A 2ZCTA 2LJKA 1AIUA 5D9WA 1K0CA 3TKRA 1SK1A 1X9SB 1LJRA 1MD4A 2NPBA 2HXKA 3ZFBA 2F3MA 3FRCA 1T7PB 4EDYA 1N8JA 3EC3A 4WR5A 2V6KA 1OC9A 5IIZA 2ES7A 3V1WA 5DAKB 2ZUPA 2CV4A 1PMTA 2IFQA 2AV4A 1SK2A 4ZB6A 1XWCA 4NHWA 4N11A 3RPPA 5J5NA 22GSA 3D6IA 5EVOA 4ZXGA 3UAPA 3NZNA 4GSNA 2OBIA 2YWOA 3FZ9A 2MYGA 3KXOA 2FWGA 4K9ZA 1CQGA 4EKZA 5EPFA 2MBTA 5D9XA 4XS6A 2B1KA 3HXSA 2J23A 2RM5A 1Q98A 1OVNA 4I5QA 1TRVA 3LXTA 5KEJA 2PN8A 2GTUA 4AJ8A 4LMWA 4TXVA 2CX4A 5LNKe 2L6CA 2YPMA 3JCML 1TRUA 3F6FA 3F3RA 4V1Ag 3ERWA 3VWUA 1G7OA 2EIRA 4FYCA 5EY6A 4K2DA 2O87A 1SL2B 5D93A 5KN3A 2I9HA 3HHVA 3BBYA 4PQHA 3GFKA 2QGVA 5D73A 4ZBAA 4DSSA 2P5QA 4IQAA 1SENA 1YJ6A 3UBKA 1USBA 4KCEA 4J2FA 3VURA 1SJZA 2V1MA 2R2JA 2JSYA 2ALBA 2IWTA 2V41A 3I6AA 2HSHA 1J0FA 1AQWA 2XPEA 2MBSA 4IP1A 2L4QA 5COHA 3GH6A 5LD0A 2C3TA 2H6YA 1S3AA 4KA0A 3C8EA 5AGYA 1GUMA 2HSYA 1Z7PA 4XTSA 1ERTA 5LCZA 4TXOB 1A0FA 3ZIVA 4MP4A 3J7Yk 2EIQA 1XOAA 5HR3A 3KMNA 3VWVA 4POLA 5ECPB 1O6JA 2HZEA 4D73B 3RAZA 5JWOB 1IYIA 4OD7A 1FAAA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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