3EURA

Crystal structure of the c-terminal domain of uncharacterized protein from bacteroides fragilis nctc 9343
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
140
structure length
140
Chain Sequence
AKNRLGTKALNFTYTLDSGVKGTLYQFPAEYTLLFINNPGCHACAEMIEGLKASPVINGFTAAKKLKVLSIYPDEELDEWKKHRNDFAKEWTNGYDKELVIKNKNLYDLRAIPTLYLLDKNKTVLLKDATLQKVEQYLAE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the C-terminal domain of uncharacterized protein from Bacteroides fragilis NCTC 9343
rcsb
molecule keywords uncharacterized protein
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Bacteroides fragilis
total genus 44
structure length 140
sequence length 140
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-10-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13905 Thioredoxin_8 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3eurA00
3DYRA 5B8AA 1M2DA 3GYKA 3UMAA 3M1GA 1GSFA 4RUVA 3D6IA 2GT5A 3KH9A 3VLNA 1WOUA 2HZFA 4K7IA 4AJ7A 1GUKA 4XS6A 4OFTA 2JZTA 3F9UA 1B9YC 2G2QA 4TXOB 4ZL9A 2F51A 4L0UA 1TK0B 2TRCP 3N9JA 1T4YA 2PU9C 1VGLA 3RPPA 1EV9A 3VPTA 4CW9A 2LJRA 5E59A 2CX4A 4IHUA 1T1VA 2LNSA 1HYUA 4QL9A 5DQSA 3TUEA 3KIJA 5J9CA 4EUYA 4DSSA 5EVOA 1XWBA 1XWAA 1MD4A 3GRXA 1VF4A 2X8CA 4FYUA 3GA4A 2CVDA 3G7YA 2LRTA 2GT6A 2E7PA 2VIMA 3MDKA 4F0CA 3US3A 3EU4A 1O8WA 1Y25A 4K9ZA 4G10A 3TJJA 3Q18A 2M80A 4I8BA 3ERGA 2FA8A 1PGTA 5B7CA 1RW1A 4TXVA 3FR6A 1M99A 2RUFA 1J08A 5DAKB 4HQSA 1VF2A 4ML1A 1T00A 1VF1A 2VM2A 1ST9A 3M9JA 3WYWA 3H93A 3GSSA 2L5LA 1SL0B 1X9MB 1X9WB 8GSSA 5H5RA 1GULA 3PINA 3H79A 2FWEA 1PMTA 2DSAA 3H8QA 2JZRA 3PR8A 4J56E 1QXHA 2EIRA 1YKCA 3LXZA 1JZOA 4TR1B 2K9FA 3A2WA 3A2XA 2XHFA 5B8BA 3TOTA 2NVLA 3FZ4A 3ZIVA 2GZPA 2OACA 2P0GA 3IK9A 5ECMB 3IV4A 3QFAC 4LMVA 2VD1A 3WGEA 5IMFA 3FW2A 1BEDA 2FD3A 4TW5A 5G1LA 3IXRA 2JSYA 2LUSA 1ON4A 3EC3A 3O6TA 5LD0A 3KMNA 2C0FA 5D9TA 3GTUB 3E3EA 4PQIA 4OCFA 1K0MA 5HR1A 2PPTA 5ID2B 2B7KA 4ZB6A 3TCOA 2OA7A 1OAZA 3VURA 4JE1A 3TKQA 2GQMA 2CT6A 5IQYA 4MMMA 2B5YA 2V32A 5C00A 4ID0A 2J23A 2XPDA 5C04A 3H1NA 3GHAA 2ZNMA 2G0FA 3IHQA 1FVKA 5D73A 1GTAA 1ZGNA 1FAAA 1GLQA 5F0GA 1IYIA 4POBA 1S3AA 5ECRB 11GSA 3TDGA 4NV2A 1ZL9A 1V40A 3KTLA 1UVZA 4MDCA 1FO5A 2FHEA 1ZYEA 4OCEA 1JFUA 1Z7RA 3O3TA 2M46A 4ZL7A 3DXBA 3ZMLA 3Q19A 2LS5A 3KD0A 4N0ZA 4NAXA 1QMVA 3ZMKA 3I43A 3PGTA 2NBSA 5JCGA 1VRSD 5EY6A 2E0QA 4ZXGA 1KNGA 4WR4A 4IBPA 5D9XA 4ECJA 5IPGA 1TKDB 1YJ6A 2IWTA 2VL3A 2GSQA 4KNDA 5G5FA 1SD9A 1RK4A 2K18A 2FWGA 3EYTA 4WEYA 4POLA 5AN1A 4BVXA 5INYA 2KUCA 2L59A 2VCTA 3L9VA 2KLXA 1XZOA 4HI7A 3G7IA 1FB6A 3FR9A 2H19A 3D5JA 5FWGA 1EP8A 2ON5A 3FRCA 4HZ2A 2A4VA 3NZNA 5GSTA 1O73A 2O87A 5D96A 2CQ9A 2H0IA 4MZBA 1T3BA 2GQKA 3GX0A 4KH7A 1MDJA 3D4TA 3WT2A 2YANA 3GKKA 2GSTA 2H74A 1EOGA 2F9SA 5GAPD 1Z5YE 3RBTA 2WRTA 2HZEA 1OE8A 1SJZA 3DMLA 2VLTA 1CQGA 4BPYA 1O7UA 4AJ6A 2LKUA 3BJ5A 1FOVA 5DALA 3F4TA 3VWVA 2VUPA 4J57E 1ZYQB 1RQMA 1A8LA 2DJ3A 1DSBA 5JWOB 3TKSE 1SYXA 1J0FA 2B5XA 1XW9A 5IMDA 5DQYA 2RIIA 3S9FA 1HNBA 20GSA 3QAGA 5IPHA 5G31A 5HFKA 5ELGA 5ECIB 2O85A 4MH2A 2C80A 1AQVA 3KTBA 4HZ4A 4IS0A 1ZOFA 4OD7A 1R5PA 4V2LA 2IIYA 3FZ9A 4EL1A 4JEDA 2QKEA 3D22A 4IP1A 4MJBA 4K0NA 3ZREA 2CVKA 3FHKA 4DSRA 4V2NA 1FG4A 3M3MA 5G30A 1U3AA 1U88A 2P5RA 3C1RA 4I5QA 2HYXA 1SKWB 2VD0A 1OKTA 4POKA 3HCZA 5IOXA 4TN8A 1K0OA 1GSUA 4Q5RA 3E9JB 2CAQA 1Z6NA 5EL8A 5KN2A 5FHIA 2FA4A 1QK8A 2VO4A 1NW2A 2FGXA 2JU5A 4YH2A 4GRFA 4OFMA 2H71A 2HI7A 4EO3A 2K8VA 3TRPA 5B6NA 1SKSB 3ZYWA 1TRUA 4MJEA 3TOUA 2IN3A 3IPZA 2I1UA 3JCML 3ISOA 1DBYA 5G2ZA 3WD6A 1OC8A 3MSZA 4HJ2A 2JL4A 3P8WA 3QCPA 1XW6A 1HNCA 4EDYA 2C1YA 2MYGA 4G19A 4MABA 3WGDA 5ECLB 1EEMA 4KB3A 17GSA 1TU7A 2VL2A 4BWSA 4NPBA 4KCAA 1TI1A 3IAS2 4Z7XA 1SD8A 5ECHB 1PN9A 3TJKA 5G5EA 5CRHA 3C71A 4YQUA 1G7OA 4KW6A 1B8XA 2YOIA 3NOFA 4E8HA 3VWWA 2WDUA 1F37A 2LJKA 3SWLA 1W4VA 1M9BA 2E2GA 4GTUA 3Q74A 2FUG2 2O8VB 2C0EA 3GKXA 5GAND 3VWUA 4LMWA 4O7HA 2IPAA 3H4KA 5AIVA 5D9WA 3NIVA 1TK5B 2CV4A 1K0NA 2H1BA 4L8EA 1NSWA 2XC2A 4AF2A 2KHPA 2AV4A 4DEJA 4EDZA 2R6KA 4IP6A 5D93A 3UOMA 3BD2A 1DUGA 4WETA 1T7PB 4KUNA 1BJXA 3KP8A 4NMUA 2X64A 3FEUA 4F03A 2V6KA 4PUFC 3CXGA 16GSA 4HOJA 4O5RA 3FK8A 1A23A 5D8IA 2DC5A 3HA9A 4ZB8A 2XBQA 4BL7A 2LJAA 4KE3A 4WKWA 2N5FA 3LYPA 4XS1A 4CHSA 2LRNA 2PN8A 2AHEA 3ZIJA 1TP9A 4N30A 3LFLA 2R37A 5HFIA 4HUAA 2MMAA 2C3NA 5IIZA 1R5AA 4KA0A 4ZBDA 1SK1A 4TR0A 2HNLA 3CSIA 3HVXA 4KDUA 1EP7A 4XRAA 3FKFA 3QAWA 5EPFA 3J7Yk 5FT3A 1ZZYA 4WF5A 5F8BA 5ELAA 1PL2A 3ZZXA 2TIRA 7GSSA 2CZ2A 1OVNA 1TDIA 1SL1B 1A8YA 2VAFA 1WMJA 1WP0A 1YF0A 3LJRA 3C7MA 2GSRA 2AYTA 2C4JA 1ZCPA 2BTOT 3KJYA 3BCIA 3A5WA 1XWKA 2MBSA 1ABAA 5IO0A 1FW1A 3A2VA 1GLPA 2HXKA 2CX3A 5HR0A 3VFIA 2ON7A 4MZWA 2VCXA 2KOKA 4G2EA 1UC7A 3HJPA 1V2AA 2M72A 2I3YA 4ML6A 3DVWA 4KDYA 1PD21 2MZCA 3IC4A 4FH8A 4E8EA 1WPIA 4DSSB 2WB9A 3KMOA 2LRCA 3UEMA 3FYGA 1FVJA 3Q6OA 2JSZA 4WR5A 3APOA 4N10A 3L78A 1O8XA 3P2AA 4Q5NA 1WIKA 3K8NA 3ERFA 1IYHA 3HKRA 2LQOA 1M0UA 2EIOA 5D9VA 4QL7A 1BQ7A 1M2AA 3TRQA 1JZRA 1MTCA 2WS2A 4IJIA 4XRDA 5ABRA 2MMOA 1THOA 4XS4A 4N11A 2JACA 3RDWA 3HDCA 1YZXA 4HU7A 3CRUA 1VF3A 1GUHA 4MJCA 3UVHA 1GSQA 1K0CA 3TKRA 3TKPA 4D73A 1AAZA 2PVOC 1F3BA 1SK0A 4EXJA 4XIHA 3KM6A 6GSSA 22GSA 2IJYA 1USBA 1J9BA 4K7OA 2GZYA 1XCCA 2PERA 4TVEA 1S3CA 4MF7A 5JCWA 3KGKA 1SK2A 18GSA 4GSSA 4EE0A 2F3MA 4GSTA 4O92A 2IMEA 1YDKA 4V2MA 4YQVA 2AAWA 1A0FA 3GKNA 2N5AA 4MPFA 3UIWA 3HZ4A 2H0GA 1EOHA 3VPQA 3RAZA 3OR5A 4K6XA 2VL9A 4MF6A 2H0HA 2DIZA 3KXOA 4LLRA 2YZHA 1GSSA 4I97A 5COHA 1OC9A 4GLTA 1MDKA 3UBKA 3CTFA 2HLSA 4F82A 1Y6EA 3G9BA 4IJ3A 3GN3A 1TK8B 5ECQB 4IVFA 2LSTA 3GH6A 2FNOA 3DIEA 5DJMA 5AISA 1KEBA 5ECKB 2VM1A 5A4VA 3ERWA 3LGCA 1TRSA 3CBUA 4FYBA 1EV4A 5CO3A 2FWFA 2MBTA 1YEPA 2YCDA 2H1AA 1S3DA 3KZQA 4PNFA 4EVMA 1YKAA 4HJMA 6GSWA 3G7JA 2K8SA 4ECCA 2WULA 14GSA 1A24A 3FZ5A 3QD9A 4ULXA 1X5DA 2O7KA 1JLVA 2V41A 2N5BA 2HRFA 4GQCA 6GSUA 1GP1A 4DSQA 2O89A 3EMXA 3IAM2 3RHCA 3GL3A 1WWJA 4IQAA 2REMA 3HY2A 2ALBA 2H30A 1B48A 2X8GA 4L5OA 5DVBA 3HHVA 1ACVA 3F6FA 1JHBA 4PXOA 3DD3A 2EC4A 4GF0A 3KCMA 3HD5A 1HNAA 2H6ZA 2VL2C 3L0HA 3UBLA 1X5CA 5DCHA 5DJLA 1X0RA 5F05A 4JZQA 4MP4A 1NHYA 2VCQA 5AGYA 4I2UA 4MZCA 2PBJA 2CZ3A 4CDOA 3GFKA 3GV1A 1X9SB 1TRWA 2YWOA 3BCKA 3DKSA 1SJ6A 5ENUA 3LXTA 2WZ9A 3TJGA 4XCSA 1SU9A 3WT1A 4G9HA 2HZEB 2QGVA 2RUEA 3GMFA 2IFQA 4X0XA 2DBCA 2DJ0A 4WF4A 4J2FA 2A2RA 2MMNA 2PMTA 4K1FA 1ERVA 5DBQA 4I6XA 5ECNB 3GURA 1PX7A 4HS1A 1Z9HA 3HJMA 5DALB 1SYRA 3BOAA 2GS3A 4P3YB 3QFBC 2HT9A 4NV5A 5KN3A 2F8FA 2VLUA 3TGZA 4K8MA 5H5SA 3IBHA 1XW5A 1F6MC 4XHMA 1M9AA 1XWCA 4YQMA 2YWIA 6GSVA 3HYPA 1JZWA 2DMMA 4EC0A 1AW9A 1N2AA 2PVQA 5JWRB 3DRNA 5J4UA 3MNGA 3TB2A 1C72A 3IOSA 4FYCA 2B5EA 5KN1A 1AUCA 1I9DA 2X99A 2BMXA 5LCZA 1PSQA 2OKAA 3UARA 3VK9A 1E2YA 4K2DA 3QDNA 3EURA 4WBRD 1XBSA 1PQNA 5E4WA 2YZUA 1GNEA 2NTOA 1WRYA 2OE1A 5J5NA 2YJHA 5HR3A 1OYJA 5CP1A 1EGOA 1T8EB 2C3QA 5IMVA 5A4UA 2B1LA 5DCGA 4F9ZA 3EWLA 3QOUA 3VWXA 1BG5A 3M9KA 3RPNA 2L57A 3VI5A 3ED3A 4WXTA 4MPGA 4OO4A 2P31A 2K6VA 3KEBA 1A2LA 3EVIA 1GNWA 3N5OA 1MD3A 4N0VA 1ERWA 3IRAA 5CNWA 2B1KA 2R3XA 2EIQA 3D21A 4JR6A 3D0ZA 4GQFA 1FHEA 3F6DA 2CVBA 2B3SA 1YY7A 3CMIA 3HJOA 3HVSA 3ZL5A 1V58A 1M7TA 3TKSC 5HQPA 2MMZA 2JADA 3QR6A 3GIXA 2V1MA 3C73A 2X8HA 2L4CA 4PGTA 4OMVA 5CREA 1N8JA 3LWAA 1Q98A 1XIYA 2H75A 4TXOA 1K0BA 4DVCA 1I5GA 1QQ2A 1V57A 2QSIA 1GTIA 2YV9A 3GL5A 4HU9A 2IL3A 1TU8A 4F2IA 3LQ7A 2FCHA 4X43A 1TW9A 1U87A 3APQA 2NPBA 4ILFA 5KEJA 4NXIA 1ML6A 5ECOB 3ZRDA 2JZSA 3CSHA 2WCIA 4IN0A 1PA3A 2YPMA 4MA9A 4TRXA 3V1WA 1O81A 1TRVA 2YWMA 4GSNA 4YAVA 2DLXA 3ZITA 1YQ1A 5GSSA 2OE0A 3IA1A 3F8UA 3ME7A 2C8UA 2GZZA 1TTZA 5IO2A 1FB0A 5DAKA 4JRRA 1BX9A 1XPVA 4PUAA 1R4WA 5DDLA 2PUKC 4WBJA 4KAEA 2FLSA 2J9HA 4L0WA 2OADA 4POMA 2YV7A 4Q5QA 3LYKA 4LL1B 1JZDA 2B6MA 4IELA 4ZBBA 4OO5A 2VCVA 1K0AA 5HR2A 2VLVA 3F3RA 4TR1A 2DMLA 3U5RE 3A3TA 1K3YA 1X5EA 4PX1A 5CRDA 4IW9A 4YAPA 3TJBA 3TRXA 1OE7A 2LTKA 1AQXA 1LBKA 3TKSA 13GSA 1Z6MA 5A4WA 2GDRA 2H70A 5CYYA 2FWHA 5B6MA 1GWCA 2B7JA 3UL3A 4BA7A 3GTUA 2ZUPA 3ZLPA 4HDEA 4BWQA 1WE0A 1G0TA 1DE2A 4NWYA 4PQ1A 5ID2A 3I9V2 3M8NA 4GXZA 1AQWA 5LNKe 4JR4A 3SBCA 2I9HA 3I6AA 3LORA 2ES7A 1H4OA 3UJ1A 4RQRA 3F4RA 1EZKA 3L9SA 2H72A 2R2JA 1AIUA 2CA8A 5A5KA 1A2JA 2DJ2A 3P7XA 2C3TA 2V6OA 4I2TA 1GSDA 1MDIA 3UVTA 3ZVJD 1YF1A 3GNJA 3HVVA 4LL4B 1HQOA 1GTBA 3CYNA 2E2MA 2GTUA 1XVQA 2IMDA 19GSA 2C0DA 2DJJA 3ZFBA 3C1SA 3W8SA 1U6TA 2H6XA 4GCIA 2FY6A 2H66A 2GGTA 1ZMAA 5ECPB 5CRGA 1PL1A 1UA5A 4F0BA 4OWYA 1UN2A 3GX8A 2GLRA 6GSTA 3O76A 4X1UA 3CRTA 1R7HA 3EE2A 3ZFLA 3ZVJA 2PWJA 2RM6A 1OKDA 2YWNA 3DWVA 2HRNA 3IE3A 1TOFA 2F8AA 1GTUA 4HEA2 3QMXA 5HFGA 4OFNA 2I81A 2DIYA 4TKYA 2YJ7A 1TXXA 1QFNA 4XS4B 3EINA 2H76A 2VCWA 1XOBA 2ZCTA 2H73A 5IOWA 3FZAA 2H1GA 4H86A 2I4AA 1BYEA 1BAYA 1GL8A 1B9XC 2H8LA 3CTGA 1XXUA 1E6BA 3ME8A 3DEXA 1O85A 4D73B 4ECBA 4KCEA 2V2GA 9GSSA 4ZB9A 2XBIA 2XPEA 1QGVA 4RI6A 2GSSA 1EEJA 2IMFA 4L5LA 3QPMA 4RI7A 3EMPA 2WJUA 4MLYA 1ILOA 4V1Ag 2P5QA 1GH2A 2NDOA 2Z9SA 3QAVA 3U6VA 4AJ8A 1GSYA 1OC3A 2TRXA 1LJRA 2WGRA 4ZIJA 1XFLA 4HQZA 1V9WA 4TOPA 5F07A 1B4QA 1AC1A 1LU4A 5G1KA 1U3IA 2GVPA 3CSJA 2WFCA 1PKWA 3BBYA 4IKHA 4MF5A 1OC9B 5CAXA 2D2ZA 4FIWA 2CAIA 10GSA 3I69A 1A2MA 4QQ7A 1PKZA 2OJLA 1HD2A 1PX6A 1XVWA 1GSEA 3DVXA 2L6DA 2AB6A 2IMIA 3EU3A 4PURA 4Q5FA 5IMAA 2RLIA 3RHBA 1ERUA 3KP9A 3L4NA 1G6YA 3IDVA 1SENA 4FO5A 3LSZA 4ZBAA 1G7EA 5J41A 1DE1A 2QC7A 4MCUA 1YEXA 4NHZA 5IMZA 3DGQA 4BVYA 3IK7A 3P90A 4ACSA 4IGJA 1TI3A 1XOAA 1KTEA 1K3LA 2L4QA 3D4MA 2DJKA 2YNXA 1W89A 2HSYA 1K0DA 2YP6A 2OBKA 2H1DA 3J7Yb 1KBNA 1CQHA 2VOCA 2AUVA 1R26A 3MAKA 5CRWA 4IQ1A 4MJAA 1ERTA 1Q4JA 1WJKA 4KDXA 3HZ8A 2AJQB 6GSXA 1F3AA 5ECSA 2KP1A 2R4VA 3UAPA 4KSMA 1TJDA 3R2QA 4NHWA 1JLWA 3MWHA 3LEFA 4KGIA 3F63A 3F4SA 4MK3A 1URMA 1B4PA 5JCUA 4AGSA 1EWXA 5F06A 4JU5A 3W6GA 3TJFA 1THXA 5J3RA 1SL2B 3E0UA 5IM9A 2IFQB 3W8JA 4PNGA 2GQLA 2OE3A 4ZL8A 2HFDA 2OBIA 5GZZB 1A0RP 2IMKA 1SKRB 3AY8A 4EF0A 4KSOA 2BJXA 4KX4A 3WGXA 4RQXA 1QUWA 1T4ZA 2C0GA 3GH9A 4V1Ap 3HXSA 2LNTA 4K7NA 2H01A 1M2BA 4TR3A 1Z3EA 5KN0A 1O6JA 3L9UA 4K0GA 1F2EA 3F0IA 1EGRA 2LEGA 1F9MA 1Z7PA 4PQHA 3C8EA 5H5QA 3GUSA 3VI7A 1G6WA 3ZTLA 2DJ1A 2LV3A 5AIXA 3IR4A 2HE3A 4TR4A 3FY7A 1NM3A 4XTSA 2LQQA 4O32A 4EKZA 4ISDA 3LG6A 5J9BA 4ECIA 6GSYA 1H75A 4JBBA 2R5GA 3M0FA 1GUMA 2A2SA 2KP2A 2L5OA 5IMCA 3FR3A 1V98A 2RM5A 1GRXA 4GWRA 1MEKA 1AXDA 3GKMA 4ZILA 5JWQB 2PGTA 3PH9A 4LA1A 3APSA 3GSTA 2HSHA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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