3EVI | Genus

Total Genus 35

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	35
sequence length	118
structure length	118
Chain Sequence	KFGELREISGNQYVNEVTNAEEDVWVIIHLYRSSIPMCLLVNQHLSLLARKFPETKFVKAIVNSCIQHYHDNCLPTIFVYKNGQIEAKFIGIIECGGINLKLEELEWKLAEVGAIQTD

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of the thioredoxin-fold domain of human phosducin-like protein 2 pubmed doi rcsb
molecule keywords	Phosducin-like protein 2
molecule tags	Unknown function
source organism	Homo sapiens
total genus	35
structure length	118
sequence length	118
chains with identical sequence	B
ec nomenclature
pdb deposition date	2008-10-13

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	3eviA00

4FO5A 4GXZA 3L0HA 1KTEA 3CMIA 4ML6A 1KEBA 1T00A 1VF2A 4L8EA 3ZIJA 1O81A 2E7PA 3TJJA 2V6KA 2DIYA 2RIIA 3DYRA 2GTUA 2H6YA 1XW5A 5ECQB 3A3TA 3D5JA 1XVQA 5G30A 1ACVA 1Y6EA 1LJRA 3ED3A 4GRFA 3BCIA 2LNTA 2NDOA 5D9TA 5IO2A 2H0HA 3H93A 5ECLB 2HFDA 1ERWA 1TW9A 5C00A 1GUMA 4TR3A 1AAZA 1K3OA 2IMEA 1BG5A 4OCEA 3M1GA 2O8VB 4HUAA 2PN8A 2YWOA 1JHBA 3FR3A 1WWJA 4HZ4A 3FEUA 5DALB 3GURA 4XIHA 2J23A 1F37A 2YCDA 1GP1A 3ERWA 3TJGA 1EGOA 1MD4A 4KA0A 6GSXA 2PVOC 2WZ9A 5IMDA 1YQ1A 3I6AA 4WBRD 5J41A 1GUKA 1PMTA 3HKRA 3GN3A 3J7Yb 2CX3A 4KSMA 1QK8A 2GS3A 2VL3A 1OC9A 5B8AA 2VL2A 2JZTA 4PX1A 5AISA 4V2LA 1RK4A 3K8NA 1V58A 3ZZXA 2HXKA 3N9JA 1NSWA 4V2MA 2K8VA 2ON7A 4ML1A 3LXTA 4TXVA 1A8YA 3GRXA 5ECPB 2YZUA 5GSSA 1Z6MA 4LMWA 2ES7A 3BJ5A 2JZRA 1IYHA 4FIWA 3F4SA 2TIRA 3M8NA 3MDKA 2PERA 2EIQA 3QFBC 4RQXA 3DKSA 1DE2A 2PPTA 5IIZA 4KDXA 2MMOA 3KP9A 2M46A 3I43A 3ME7A 2KLXA 3WT2A 2C3NA 5E4WA 4AJ6A 4I97A 3LORA 1URMA 4ZBAA 2X64A 3QAGA 1ERTA 3L9SA 4K0NA 4OD7A 17GSA 3KH7A 3TJFA 1B9YC 4MF5A 3LYKA 4LMVA 5D9VA 1SL1B 3DXBA 3FKFA 4GSNA 5AIXA 5G5EA 2MMZA 3O3TA 2LKUA 4PGTA 5AGYA 2IMDA 1QMVA 7GSSA 4YH2A 1SK0A 3KTBA 4ZILA 1TRWA 4F2IA 3EE2A 1GL8A 2N5FA 2X8CA 3F6FA 2XPEA 1ST9A 4HU7A 3ZVJA 3F63A 2KP2A 2HZFA 3GKNA 4EDZA 2AB6A 3DIEA 5A5KA 1FO5A 1Y25A 3PINA 5CO3A 1SK2A 1DE1A 2P5QA 1FAAA 3P7XA 1FVJA 4WBJA 4X0XA 4NMUA 2VLUA 4IN0A 4K1FA 2FA8A 4LL4B 2FGXA 1U6TA 3V1WA 2I3YA 1ABAA 2YANA 1M0UA 3QOUA 5ECMB 4XS4A 3BBYA 4POLA 3GX8A 1FW1A 2PVQA 1OYJA 1TI1A 3GNJA 3HVXA 4OCFA 2VM2A 4NXIA 4RUVA 2L4CA 3GTUA 1B8XA 3TB2A 4J56E 3O76A 2HYXA 3HA9A 4MA9A 1OAZA 2VD1A 1A8LA 3CRTA 3FZAA 1VF1A 2VL9A 1WP0A 2R5GA 1SKWB 2CAIA 3GA4A 3GHAA 3ME8A 1X9SB 3D21A 2K9FA 4MDCA 4MJBA 3DD3A 4Q5QA 4V1Ap 5CYYA 3VWWA 2LV3A 2YV9A 1F9MA 1YKAA 4L5OA 4HQZA 5DAKB 3W8SA 4IP6A 4HJ2A 3MAKA 4NHZA 2XBIA 2DJ1A 1NHYA 4GCIA 1AUCA 4ECCA 4ZB8A 1G6YA 2FWFA 1W89A 1BEDA 4GQCA 4JZQA 1TK0B 1Z9HA 5CRGA 4I6XA 1XIYA 1K0AA 2YV7A 2FUG2 3GX0A 1N2AA 2H0IA 2NBSA 1WRYA 5IMFA 2RUEA 4F82A 3PR8A 3EURA 4ZL7A 1ILOA 2VCTA 4P3YB 2OBIA 5D9XA 4OFNA 3F3QA 2H74A 2LRNA 1ZYEA 3E0UA 1O85A 1GRXA 3D4MA 3UL3A 5IMCA 2C0FA 1EGRA 2CX4A 3FY7A 4TR4A 4K0GA 3MWHA 4I2UA 4BVYA 2C0EA 5GAPD 1I5GA 4OFMA 4KDUA 2RUFA 3QD9A 3LXZA 4K8MA 5F06A 4EKZA 4YQVA 1T7PB 2HE3A 1U3AA 3SBCA 4EC0A 4MPFA 1SL0B 2O85A 4KB3A 2F8AA 4H86A 4L0WA 1SJ6A 5EY6A 4X43A 2IMKA 3IRAA 2PBJA 3UJ1A 5CP1A 4MZWA 4MK3A 19GSA 3VFIA 1XOBA 3I9V2 2I4AA 5L71A 4LA1A 3M0FA 1GLQA 2WS2A 5EL8A 3GH6A 1A2MA 1DSBA 2VCWA 3OR5A 1N8JA 5ELAA 2GQKA 3N5OA 5ABRA 2EIRA 1G7EA 1Z3EA 2IFQB 3GSTA 3C7MA 3ERGA 3Q18A 4L0UA 3O6TA 1R7HA 2F3MA 3TGZA 1RQMA 4IVFA 5DALA 1G7OA 1K3YA 1K0CA 1FB6A 2LQQA 3PH9A 2RM5A 1EV9A 4E8EA 2CA8A 2LS5A 2FCHA 5HFIA 3HYPA 1MTCA 2L59A 4MZBA 2H72A 4O92A 1TU8A 4YQMA 2B5XA 10GSA 2LSTA 1DUGA 1PGTA 3EINA 2IIYA 3A2VA 3RBTA 4QL9A 4GSTA 1AQXA 3QAWA 2VM1A 4XS1A 5FHIA 3ZFLA 5D9WA 3CXGA 4HJMA 4I8BA 3TKSE 4DVCA 2J9HA 4L5LA 4YQUA 3VWXA 4KAEA 1U88A 3U6VA 2AHEA 2GSSA 2L5LA 2X99A 2K6VA 4NV5A 1R5PA 3IBHA 5C04A 3W6GA 4JR4A 2VIMA 4J57E 1PRXA 3CTGA 1MD3A 3IAS2 2IL3A 4PURA 1XWKA 3LFLA 1GTUA 3R2QA 3D22A 1ERUA 5IMVA 3VPQA 3IHQA 1MEKA 1XW9A 2LJKA 2H0GA 4N11A 1SJZA 3TRQA 4LLRA 1ON4A 1HD2A 4OMVA 4GWRA 4XS6A 1X9MB 1HNAA 1OC8A 1K0MA 3GIXA 1QUWA 3DRNA 2O89A 4PQ1A 4DSSB 2P0GA 3CRUA 4DSRA 18GSA 4ULXA 2H76A 1CQHA 4EDYA 3WGEA 3G7YA 4RQRA 3ZRDA 5D8IA 5G2ZA 2DJKA 2JSZA 5H5SA 5DBQA 2VD0A 3CYNA 4Z7XA 3GKMA 5DCGA 4K7IA 2WB9A 1NM3A 1B9XC 1V9WA 2IMIA 2OE0A 1H4OA 4F03A 1GUHA 5JCUA 2BTOT 4ECIA 1XWAA 4HQSA 3TKRA 1M7TA 1SYXA 3UBLA 5DQSA 3IR4A 3ZLPA 4MH2A 4V1Ag 5HR1A 5JWOB 3S9FA 4CHSA 1A0FA 1DBYA 1W4VA 5DJMA 3W8JA 2Z9SA 3LEFA 5G1LA 4TR1B 5CREA 2V32A 4OFTA 1T4ZA 1AQWA 2G2QA 3H8QA 3IA1A 3TKQA 3ZITA 1S3CA 1YEXA 2DMLA 4K7OA 4N30A 1PX6A 2MZCA 4BVXA 4JRRA 2O87A 3VURA 4TRXA 2JU5A 4IQAA 4JE1A 1EOGA 5IMZA 2C3TA 3HXSA 5DJLA 1X5CA 4MF7A 4WF4A 5IQYA 1PL2A 3C8EA 5ECHB 4F0BA 2C4JA 2REMA 1FVKA 3WD6A 1QGVA 4ID0A 2H70A 5EVOA 1O73A 4GF0A 2MMNA 3P2AA 4IS0A 2DJ2A 5B8BA 1NHOA 1EV4A 3WGXA 4DEJA 3FR9A 4WEYA 1TRVA 3IPZA 1QXHA 3EC3A 1IYIA 2KHPA 1YDKA 1GTAA 1THOA 2V2GA 1K0OA 1BAYA 4POKA 1GLPA 2HI7A 4EL1A 2PGTA 4IELA 2L6CA 2R4VA 5DAKA 3SWLA 4ZBDA 1SYRA 2OE1A 2QKEA 1UVZA 2R3XA 1VGLA 3TJBA 3H79A 2DLXA 4PQHA 4WR4A 3L9UA 2C1YA 5CRWA 3APOA 1XZOA 3LG6A 22GSA 3RHBA 3HVSA 2FNOA 2M72A 4EUYA 2OJLA 3J7Yk 16GSA 1PN9A 4NAXA 2VCZA 3TJKA 2KP1A 3F0IA 2WGRA 3GH9A 5GSTA 1Z7RA 4XRDA 1ERVA 3IC4A 6GSYA 3GV1A 1GULA 3GL5A 2HSYA 2YWMA 2LTKA 3ZFBA 3GSSA 2NTOA 2R6KA 3Q74A 5INYA 1M2AA 3TCOA 2VOCA 2R37A 3L4NA 1YF1A 4TVEA 4IP1A 2I81A 2VCXA 11GSA 3FK8A 2YWIA 1HQOA 3QDNA 4KCAA 3RHCA 1SKRB 3KTLA 2ALBA 2H75A 3VWVA 3HZ4A 1UN2A 2A4VA 1A2LA 2TRXA 6GSTA 3LGCA 2NPBA 5G31A 1M9BA 2NVLA 1BQ7A 3D6IA 4KW6A 2CVBA 1AC1A 1XOAA 5CNWA 1ZGNA 1TXXA 4NPBA 1XPVA 1V57A 5J5NA 2BJXA 5IOXA 4ZB9A 2DIZA 3CSHA 4K9ZA 2EIOA 2IFQA 5AIVA 2B1KA 2FLSA 3AY8A 1T1VA 2I1UA 1Z7PA 3C1RA 3FRCA 5J9CA 3VI5A 2WJUA 4D73B 3IAM2 3LSZA 1SENA 2XHFA 1F3BA 1JZOA 2AJQB 4HS1A 4QQ7A 5KN3A 1PSQA 1AW9A 2IN3A 5A4WA 1K0NA 2F51A 3FHKA 2L5OA 5HR2A 3RDWA 2HZEB 4EO3A 4ZL9A 1J08A 5H5RA 4TXOB 2JZSA 2YNXA 2PU9C 1ZZYA 1X9WB 3GFKA 2PWJA 2E2GA 1EEJA 5DDLA 2FD3A 1T4YA 3F4TA 3G7JA 2N5BA 2YWNA 5F0GA 13GSA 1LBKA 3GYKA 4POBA 5DVBA 1XW6A 1EOHA 3IK7A 4KNDA 2FHEA 3G9BA 2OBKA 1GH2A 2ON5A 3ERFA 3UVTA 2F9SA 4MJAA 3HCZA 3LQ7A 2FA4A 4ECJA 4PQIA 4XRAA 3UMAA 1S3DA 3IDVA 4O32A 4IGJA 5JCWA 3NIVA 4WKWA 5H5QA 5ELGA 3ZMLA 1Q4JA 2GGTA 1TP9A 3BOAA 2VUPA 3QCPA 5FT3A 4K7NA 2MBSA 4DSSA 2HRNA 5E59A 4PUFC 3UEMA 4G19A 2DJ0A 3L9VA 4O5RA 1VF3A 4FYBA 5ENUA 1V98A 3DVXA 4PNFA 1Q98A 2RM6A 4AGSA 1TI3A 3CSIA 5ECSA 3TOTA 3UBKA 3F8UA 4DSQA 3QPMA 1FG4A 2HNLA 4V2NA 3EMPA 2B5YA 5KN1A 4F0CA 1WE0A 4TKYA 1OVNA 1TK5B 3NZNA 4I2TA 1ZL9A 4TR1A 2FWGA 5ECOB 2H30A 1EWXA 12GSA 3TDGA 5COHA 3HJPA 1PKZA 2P31A 3E3EA 3FZ4A 4GQFA 4N0VA 3A2WA 2C8UA 5ECNB 1S3AA 2YJ7A 1XWBA 5ECKB 2R2JA 1O7UA 1VF4A 3EMXA 1USBA 1WJKA 4PNGA 2H6XA 2WDUA 3GL3A 2VCQA 1M2BA 3FZ5A 2GLRA 3VPTA 2M80A 2IPAA 2B1LA 4TW5A 3TRXA 4NWYA 14GSA 2QC7A 5HFKA 1OKTA 4ECBA 3FYGA 2OADA 1T3BA 5J3RA 3UVHA 1TRUA 1GTBA 3ISOA 4NHWA 2GQMA 1UC7A 3VLNA 2V6OA 4MLYA 4OO5A 4BA7A 2YPMA 1JZDA 2ZNMA 2H71A 2GZYA 1JZRA 3DWVA 2YP6A 5FWGA 1B48A 1F3AA 1EZKA 2GSTA 3WGDA 3IXRA 4G9HA 3KM6A 1ZCPA 1HNBA 3NOFA 2K8SA 5CAXA 3IV4A 3Q6OA 2GSRA 5CRHA 4EVMA 1YY7A 2VLTA 3ZMKA 2OKAA 1SU9A 3KMOA 5B6NA 3KH9A 3HY2A 4WETA 3L78A 4TR0A 3APSA 5F05A 2OE3A 4WR5A 5DQYA 1JLWA 2V1MA 4LL1B 1XXUA 4MF6A 2X8GA 1YEPA 2AAWA 2DJJA 1A24A 2C3QA 1XBSA 2VCVA 2VO4A 4K6XA 3GKXA 2VLVA 1EP7A 3QFAC 4G2EA 1QFNA 1SD9A 5ID2B 1HYUA 1TK8B 2L57A 2WULA 1V2AA 2P5RA 2YJHA 3FR6A 4JR6A 2JL4A 1E2YA 1WIKA 9GSSA 2CZ2A 1XCCA 2CQ9A 2CVKA 3ZTLA 2A2RA 2JSYA 1GNEA 4ZB6A 2IMFA 3KD0A 3P90A 1X5EA 1J9BA 2CV4A 2CVDA 1NW2A 1KBNA 4RI6A 2PMTA 1K0DA 4KSOA 5ECIB 2OACA 4KDYA 2O7KA 5A4UA 3IE3A 2D2ZA 4KGIA 2KUCA 2FY6A 3ZVJD 1TTZA 4WXTA 5GZZB 1O8XA 4GLTA 4HI7A 5HFGA 1WOUA 2WRTA 4NV2A 1M2DA 3HDCA 4N0ZA 2QSIA 2C80A 2CAQA 4AF2A 4GTUA 4YAVA 3H1NA 3APQA 1YF0A 1PX7A 1J0FA 5F8BA 4MH3A 1GSYA 2LNSA 1R5AA 4BWSA 2GZZA 3VI7A 3UIWA 4EE0A 4D73A 1AIUA 1U87A 3EWLA 1ML6A 1TJDA 2B6MA 2DJ3A 1TRSA 3MNGA 1K3LA 1Z5YE 2L6DA 4MJCA 3BD2A 3TRPA 1XWCA 4BPYA 3LWAA 2XC2A 2B7JA 4JBBA 2HZEA 4ZL8A 4TXOA 3KGKA 2DMMA 3MSZA 2H1BA 4FH8A 2A2SA 1A0RP 2LRTA 3C71A 4MJEA 3HJOA 4E8HA 3TKSC 3HJMA 1VRSD 1K0BA 5LD0A 2L4QA 3US3A 2H1DA 4ACSA 1A2JA 3EU3A 5JCGA 1OE8A 4G10A 2H6ZA 3A2XA 1O6JA 2LQOA 3QMXA 4MP4A 1JFUA 1YKCA 5IPGA 2ZCTA 5D96A 3CBUA 2HRFA 3F3RA 4IJIA 1B4PA 1G0TA 2IJYA 1A23A 4BWQA 1KNGA 1T8EB 2YOIA 1PL1A 4ZXGA 2VAFA 1GSQA 4Q5FA 3FW2A 2JADA 3EU4A 4XCSA 1X0RA 2CZ3A 2HLSA 3F4RA 4EXJA 1FOVA 1EP8A 2LUSA 3EYTA 4EF0A 1TU7A 4KX4A 4MPGA 4PUAA 4TN8A 5B7CA 6GSWA 3KIJA 1BX9A 5JWQB 2B5EA 4FYUA 6GSSA 4ZBBA 3PGTA 1YJ6A 1OC9B 2TRCP 2HSHA 5IO0A 2PUKC 4MABA 4MZCA 3RPPA 3KCMA 5D73A 5F07A 1SD8A 1GSDA 1R4WA 2MBTA 3E9JB 1GSSA 2AYTA 1EEMA 6GSVA 2MMAA 2H66A 3JCML 2VL2C 1SKSB 3ZYWA 1Z6NA 3DVWA 3GUSA 5D93A 3Q19A 3VK9A 3UAPA 3WYWA 1TDIA 1M99A 3IK9A 3U5RE 2B7KA 3HHVA 1PA3A 6GSUA 3QR6A 4GSSA 3KEBA 2GSQA 1GSEA 5A4VA 3HD5A 3D0ZA 4J2FA 2H8LA 1PQNA 4POMA 1F6MC 1F2EA 1FHEA 1O8WA 2DC5A 1MDJA 2AUVA 3F6DA 2GQLA 4O7HA 3BCKA 5LNKe 2JACA 3CSJA 2LJAA 1THXA 2FWHA 3QAVA 4IKHA 3H4KA 5GAND 3M9JA 1QQ2A 3D4TA 2GT5A 1FB0A 1XFLA 2GT6A 1OE7A 5AN1A 3TOUA 1BYEA 5HR3A 5J4UA 8GSSA 5IMAA 3RPNA 3KZQA 1B4QA 1ZYQB 3TKPA 5LCZA 3UARA 2AV4A 3GMFA 1E6BA 1PD21 2XBQA 2H19A 5ECRB 4HU9A 1U3IA 4ILFA 4IHUA 2YZHA 5IM9A 5B6MA 1C72A 4HEA2 1WMJA 4IW9A 1OC3A 3G7IA 3KP8A 4KUNA 3ZIVA 2BMXA 3VWUA 2CT6A 5KN0A 3WT1A 2MYGA 4AJ7A 1MDIA 3C73A 4Q5NA 4XHMA 1JZWA 3DMLA 4ZIJA 5G5FA 3KMNA 4HZ2A 2LEGA 3IOSA 20GSA 2H1AA 2X8HA 1PKWA 3HZ8A 2RLIA 3UOMA 2IWTA 1HNCA 1UA5A 1X5DA 1JLVA 2N5AA 4AJ8A 3ZL5A 1I9DA 2G0FA 5JWRB 4JU5A 1GWCA 5HQPA 1ZOFA 2YN1A 2WCIA 3KXOA 1XWGA 1TKDB 4RI7A 4FYCA 4YAPA 1RW1A 1H75A 2GVPA 4WF5A 2ZUPA 3P8WA 3HVVA 4HDEA 3EVIA 1GTIA 1SL2B 4IBPA 1G6WA 4QL7A 4OO4A 2OA7A 2HT9A 2C0GA 4F9ZA 1CQGA 4KE3A 4XS4B 5ID2A 2GDRA 3FZ9A 4BL7A 2KOKA 4X1UA 5CRDA 3GTUB 2DSAA 1WPIA 3I69A 2DBCA 1OKDA 5DCHA 2H01A 2WFCA 1GNWA 3A5WA 3TUEA 2C0DA 5G1KA 4XTSA 2F8FA 2QGVA 1AQVA 1M9AA 4MCUA 5J9BA 1GSFA 2H1GA 4Q5RA 4IQ1A 4N10A 2K18A 5IPHA 5KN2A 4CDOA 4HOJA 3KJYA 1V40A 2LJRA 2I9HA 3LJRA 1ZMAA 3DEXA 3CTFA 2GZPA 1LU4A 4K2DA 1AXDA 4KH7A 1R26A 3M9KA 4OWYA 3DGQA 4IJ3A 1SK1A 4I5QA 1MDKA 3M3MA 2V41A 5EPFA 1BJXA 3GKKA 5IOWA 2E2MA 2H73A 1SJIA 5KEJA 4CW9A 1GSUA 2FWEA 3TKSA 4JEDA 5HR0A 4KCEA 3RAZA 1TOFA 4MMMA 4ISDA 4PXOA 2E0QA 2LRCA 3ZREA 3C1SA 4TOPA 1YZXA 2B3SA 2EC4A 2XPDA 3LYPA 3F9UA 1XVWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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3EVIA

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Chain Sequence

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