3EWLA

Crystal structure of conserved protein bf1870 of unknown function from bacteroides fragilis
Total Genus 34
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
34
sequence length
138
structure length
138
Chain Sequence
SNAGMKAADFTYVTVHGDNSRMSRLKAQYTMLFFYDPDCSNCRKFEKLFAEIPAFVEMVENGTLRVLAIYPDENREEWATKAVYMPQGWIVGWNKAGDIRTRQLYDIRATPTIYLLDGRKRVILKDTSMEQLIDYLAT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Conserved protein BF1870 of Unknown Function from Bacteroides fragilis
rcsb
molecule keywords uncharacterized conserved protein BF1870
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Bacteroides fragilis
total genus 34
structure length 138
sequence length 138
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-10-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ewlA00
5G2ZA 4G9HA 4WXTA 3ME8A 5G1LA 4HOJA 2HFDA 1HQOA 4V1Ag 3HZ4A 3F4TA 1B9YC 4MPFA 4O7HA 1PX7A 5ECOB 2NVLA 5HQPA 1Z6NA 2K18A 5JWQB 3TOTA 3QFAC 4XS4A 2H1GA 2AJQB 4XS1A 4MA9A 2PWJA 4LMWA 5AIXA 1F3BA 2TRCP 2H0HA 4POBA 4TRXA 3WYWA 5KEJA 3VWUA 3ME7A 3OR5A 2JZSA 5GSTA 4TXOA 5LCZA 2LQOA 1TTZA 1WMJA 3GNJA 1CQGA 2PBJA 3WT1A 2VM1A 1WE0A 4F0BA 3HCZA 3IHQA 1F6MC 2L4QA 5H5SA 3IAS2 2QGVA 1GNWA 1A8YA 3F6FA 1CQHA 2QC7A 4HJ2A 3O3TA 3IA1A 1RK4A 3GL3A 2JACA 2GSSA 4JR4A 4D73B 5DJLA 2WULA 3GL5A 5EL8A 2MBTA 3WT2A 6GSSA 3IOSA 4YH2A 2L5OA 1VGLA 3HKRA 1ON4A 1K3LA 1LU4A 2LNSA 1F37A 1GSEA 3H79A 3GYKA 4HEA2 2WRTA 1PN9A 1ZYQB 4WBJA 3BBYA 3BCKA 5GZZB 3IE3A 2H6XA 2X8GA 3WGDA 4KSOA 5A4WA 2K8SA 3LJRA 3D22A 1U3AA 4EUYA 3Q18A 3P8WA 5B8BA 3TRQA 3LEFA 3L9VA 3CBUA 3EVIA 1HNCA 2FUG2 3M3MA 1RW1A 2L57A 5B8AA 2O85A 1I5GA 2HRNA 2I1UA 2JZRA 2R3XA 2YV9A 1X9SB 3ZMLA 2B7KA 1IYIA 2MMZA 8GSSA 5CRHA 2K6VA 4TKYA 3KGKA 5ID2B 1Z9HA 1U6TA 3DD3A 1ZL9A 3NIVA 1SJ6A 4F2IA 1XVQA 1PRXA 4N0VA 2YNXA 4L8EA 2PVQA 2VCVA 4H86A 5L71A 3W8JA 1A2LA 2CVDA 2IFQA 4HZ2A 4X43A 3HY2A 1YF1A 2XPDA 4K0NA 3TRPA 4Q5NA 1H4OA 1O8XA 2VL9A 1U87A 2IMEA 3FR9A 4ULXA 4J2FA 2JADA 4PURA 1S3CA 1Z3EA 3DIEA 3LYKA 9GSSA 4ILFA 2H6YA 3ISOA 4PX1A 1DUGA 1SL1B 3M8NA 5D9TA 1XZOA 2P0GA 4IP1A 3IC4A 5GAND 5J9BA 5DALB 4NPBA 5LD0A 2IWTA 1VF2A 2GDRA 1JLVA 5DBQA 1N8JA 1XIYA 1SL2B 4PGTA 4MH3A 1KBNA 2PU9C 2KP2A 1SKRB 3A2WA 1FHEA 5D73A 1GLPA 3GN3A 3FZ9A 3UIWA 2DC5A 2VLUA 5J41A 1JFUA 1FW1A 2B5XA 2H8LA 1ZZYA 4GF0A 4BA7A 4TXOB 3H8QA 2E2GA 3LSZA 3KD0A 3FW2A 2LJAA 4KCEA 2X64A 4MK3A 1NHOA 2CZ3A 2REMA 5JWRB 4LMVA 4RI6A 2PVOC 2O89A 3PH9A 2C0FA 1YJ6A 1M2AA 3I43A 1XW9A 2ON7A 4DVCA 1TU8A 16GSA 2R4VA 3C7MA 3UOMA 2C3NA 1O6JA 2GSRA 19GSA 3L9UA 5IQYA 1EGOA 2TRXA 3IV4A 2WJUA 5D96A 2RIIA 3TJKA 2RM6A 4ECJA 3LFLA 1VRSD 1A2JA 1WRYA 3F63A 3F0IA 5G5EA 2I3YA 1V9WA 3HVXA 2FGXA 3RAZA 4YAVA 2IIYA 3GH9A 1XOAA 3L4NA 4POMA 3RPPA 2PUKC 2B5YA 2WGRA 1TKDB 3IAM2 1A24A 5CRGA 1THOA 3EINA 3U5RE 2LUSA 1TK0B 2P5QA 3FR6A 3G7YA 1GSDA 4IP6A 1QMVA 2XC2A 1GULA 2EIQA 3APQA 3HYPA 4PQHA 4F82A 4POLA 2AAWA 5IOWA 1XBSA 2HZEA 4F9ZA 1F2EA 1EV9A 1BEDA 2OE3A 2VCWA 5DAKB 1JZDA 1OVNA 4X0XA 3MAKA 1SKWB 3J7Yk 4TR4A 5IPHA 1USBA 3GFKA 4F0CA 1TRVA 3RBTA 1TXXA 2LRCA 3O6TA 3HJPA 4KUNA 3HZ8A 3ZRDA 1YY7A 4HQSA 2C0EA 1K0CA 1OC3A 4FO5A 4OD7A 4K1FA 1TK8B 2WDUA 4MCUA 2JU5A 1FVKA 4K0GA 4PXOA 3GX8A 4K9ZA 1TRSA 2AB6A 4IJIA 5IMAA 2NPBA 3QAGA 4RI7A 4EL1A 4O5RA 4BWSA 2CAIA 3QAVA 5ECHB 5EY6A 3EE2A 3TKQA 4GQCA 1PL2A 4PQIA 5DCGA 1E2YA 2AHEA 2H6ZA 5EVOA 4NV5A 2C0DA 5JCWA 2DLXA 2JL4A 1XWAA 4YQUA 5ENUA 1X0RA 1ZGNA 2O8VB 3AY8A 1J9BA 2OBIA 4FYUA 2GT5A 13GSA 3LQ7A 2L4CA 2PGTA 2HE3A 3QOUA 3UBLA 2BMXA 4O32A 4OCEA 3DVXA 3M0FA 1R4WA 1F9MA 1Q4JA 1EOHA 3EURA 1SU9A 2MBSA 4ZIJA 2F8FA 3NZNA 2GZPA 2YWOA 5IMVA 5IMZA 3C8EA 1O85A 3GKXA 4ZB8A 4KSMA 3UL3A 2E2MA 1YKCA 1PL1A 3GHAA 2IL3A 1V40A 2GSTA 2J23A 2X8HA 1V58A 3RHBA 5CYYA 1MEKA 4AF2A 4ZILA 2VCXA 3EU4A 2DJ0A 3V1WA 1QUWA 3UJ1A 5DQYA 1EOGA 1R26A 2CQ9A 1B8XA 5B6NA 3QD9A 2O87A 3CRTA 1TW9A 2VCTA 5FWGA 3ED3A 2XBIA 1VF1A 1NW2A 3KZQA 1Q98A 3VK9A 4HU9A 5F0GA 2H0GA 3G9BA 3N5OA 1EZKA 4ZL7A 2VIMA 5IO0A 4XHMA 2H30A 4V2LA 1TU7A 3FZAA 3RHCA 1EWXA 5DQSA 3ZMKA 4JZQA 2OA7A 3H4KA 2PPTA 1PKWA 1ZOFA 2MMOA 4ZB9A 3W6GA 4MDCA 3GKKA 1XVWA 2HRFA 1AUCA 4HI7A 1AAZA 2GSQA 1MDIA 3PGTA 3VI7A 2L5LA 4KGIA 4ZBDA 1SK2A 3CTFA 3KP9A 2GT6A 3GSTA 5AN1A 2YWNA 2AV4A 3UBKA 5DJMA 2CZ2A 1PX6A 2HNLA 14GSA 1G6YA 3ZVJA 1A0FA 4WR4A 3ZIVA 1FB6A 1GSUA 1TRWA 1ILOA 1K3OA 3CSIA 5IMFA 5G1KA 5IM9A 1FAAA 2CV4A 2KOKA 3GTUA 3GUSA 4EKZA 1GTBA 3VURA 3FKFA 2GS3A 4EDZA 5GSSA 4EF0A 20GSA 1XOBA 2L6DA 2F8AA 1TK5B 4J57E 4ACSA 4BVXA 5CNWA 1OAZA 5IMDA 2VD1A 4MH2A 3IK9A 2YOIA 2A4VA 2OADA 2AUVA 5DVBA 4ZXGA 2DJ1A 2V6OA 2V41A 3DWVA 2EIOA 3PINA 1TI1A 4KDUA 3GSSA 3M9KA 1AQVA 1WJKA 4OCFA 3IPZA 2GQMA 2GZZA 2ES7A 1OKTA 1YEXA 2H1AA 3LG6A 5DDLA 3LGCA 2XBQA 5AISA 1TP9A 4XS6A 4JE1A 1PA3A 2ZNMA 1XFLA 4KDYA 2RLIA 17GSA 3HVSA 3TJGA 5HFGA 5AIVA 3GRXA 3D4TA 1GSYA 4YAPA 2G2QA 4YQMA 4RQRA 2MMAA 1FOVA 2LNTA 5KN0A 1AQXA 4NV2A 3KP8A 2H1BA 3KIJA 1ERWA 4XCSA 2XHFA 2CA8A 1Z7PA 1ST9A 5F06A 3F4SA 3TKSE 1ERTA 3C71A 1A0RP 4OFMA 4E8HA 4TR1B 5COHA 1JZOA 2DIZA 3M1GA 3TJFA 2V1MA 4GTUA 4MZWA 1LJRA 4E8EA 3ZL5A 4K7IA 4V2MA 1K0MA 2H74A 1UC7A 1K0OA 2BTOT 2HYXA 2N5BA 1T3BA 2BJXA 1OC9A 4OMVA 1GP1A 3BD2A 1AQWA 1S3AA 3D5JA 4FYBA 4WKWA 3C1RA 2RUFA 2JZTA 3DKSA 1R5AA 5ECMB 2O7KA 3FZ4A 4PUAA 2EC4A 6GSXA 3QDNA 1HYUA 4QL7A 3I6AA 2DIYA 2ON5A 2H1DA 4LL1B 3WGEA 2WCIA 1GRXA 4N30A 1OE8A 1O7UA 5CREA 4EE0A 3G7IA 2HXKA 5ECLB 3P90A 2FWEA 5CRDA 1UVZA 4PUFC 3R2QA 2GTUA 4P3YB 4G19A 3L0HA 4GCIA 2IMIA 1V2AA 2K9FA 4I8BA 4IVFA 1HNAA 3DYRA 2NDOA 4L5LA 4XS4B 2PMTA 1ERVA 5F05A 6GSYA 2LKUA 1ZYEA 3FY7A 3ZVJD 3A2VA 5HR0A 5JCUA 1XWKA 4WF4A 1M2BA 5IO2A 3LYPA 2IMKA 4XIHA 2HLSA 5HR1A 3GX0A 18GSA 2PERA 2L59A 1O73A 2FWGA 1JZWA 4LLRA 3UMAA 3L9SA 4AJ8A 1QXHA 5J4UA 4OO5A 4ZBAA 1OYJA 2KHPA 3VI5A 2GGTA 2R2JA 5A5KA 1ACVA 5F8BA 1MD3A 4BWQA 4KW6A 3GV1A 1U3IA 4Q5FA 2H19A 5B7CA 1DSBA 4NHWA 4AJ7A 1M0UA 1B4QA 1GSQA 2GQLA 4G10A 3LXTA 1Z5YE 2WFCA 4EO3A 5DCHA 2C0GA 1JLWA 2J9HA 4HU7A 5LNKe 3D21A 3Q6OA 1BJXA 2YJHA 1DBYA 4EDYA 3IRAA 1BG5A 2GZYA 3C73A 3TB2A 2H0IA 4HJMA 4K7OA 5H5QA 3GKMA 3M9JA 3UARA 1VF4A 3VFIA 3GKNA 4NAXA 1BYEA 5HFIA 1ZCPA 4BVYA 2YPMA 1SJZA 1EP7A 2R6KA 5ECNB 5A4UA 1XW5A 5KN2A 3EC3A 4I5QA 5ECRB 5EPFA 3HXSA 1SYXA 1G7EA 1YDKA 5J9CA 2X8CA 1GWCA 4JEDA 1T4YA 3MNGA 4GRFA 3F4RA 2FLSA 4PNFA 1XXUA 2KUCA 2GVPA 1V57A 1AIUA 1NSWA 2LQQA 2RM5A 4FIWA 2F9SA 1B9XC 2H71A 3KCMA 3GMFA 2G0FA 1K0DA 3QFBC 3HJOA 4ZB6A 4JBBA 3KEBA 2VLTA 3CSJA 4K8MA 5ELGA 1GSFA 1GNEA 4JRRA 22GSA 2B6MA 2WB9A 1G7OA 1WWJA 2QSIA 2IFQB 2WS2A 2M46A 3KM6A 3VWWA 4KH7A 4ISDA 1OC9B 2RUEA 1W89A 4MJCA 1H75A 2YWMA 3DRNA 1J08A 2C1YA 2ALBA 4IKHA 1O8WA 4MF7A 2R5GA 4QQ7A 2WZ9A 2L6CA 4AJ6A 4IGJA 6GSTA 3LXZA 4CHSA 1YEPA 4I97A 3CXGA 1K0BA 5GAPD 5B6MA 2ZCTA 1XW6A 4MP4A 3ERGA 2IMFA 3WGXA 1JZRA 2FNOA 1U88A 4L0UA 4KX4A 1SK0A 4KAEA 1FVJA 4K2DA 3Q74A 1GUMA 1UA5A 2E0QA 1OKDA 2K8VA 1X5DA 1EEJA 3TKSC 1E6BA 4KB3A 1Y25A 3TDGA 1IYHA 1WP0A 3ERWA 2YZHA 4CDOA 2N5AA 5HR3A 2VCZA 4BL7A 2N5FA 2FY6A 5E4WA 3MDKA 1XWCA 4RUVA 1F3AA 4NHZA 3FR3A 3NOFA 2OKAA 1K0NA 1O81A 5ELAA 3L78A 5KN1A 2EIRA 4G2EA 1PSQA 3APSA 5KN3A 2YJ7A 2DMLA 1GTIA 2PN8A 5J5NA 4ID0A 4LA1A 2C80A 2QKEA 4WEYA 1J0FA 3TKSA 2I4AA 1TRUA 3F3QA 1PD21 3EU3A 1SD9A 4GQFA 3HHVA 3KXOA 5CP1A 1YF0A 3D6IA 3P2AA 4MJAA 4YQVA 3F6DA 5ABRA 3KH9A 3ZITA 2B5EA 4GLTA 3EMXA 4DSQA 3HA9A 2YV7A 5D9XA 4IN0A 2TIRA 4LL4B 5DALA 4Z7XA 3A5WA 6GSUA 1GUHA 2HI7A 4IJ3A 3EWLA 4QL9A 4ML6A 5CO3A 3ZFLA 1FB0A 1B48A 5JWOB 2CX4A 3VLNA 4CW9A 5A4VA 1XPVA 3LORA 1QK8A 1TOFA 2M72A 2B1LA 4GWRA 4KNDA 3IXRA 1GTUA 2VAFA 3Q19A 3ERFA 3GA4A 3DGQA 1W4VA 10GSA 1ML6A 3CSHA 4MMMA 4OWYA 2F51A 1XCCA 4ECIA 1SENA 3K8NA 4XTSA 4FYCA 1YZXA 2HZEB 3E3EA 2IMDA 4HQZA 2FD3A 1R5PA 3TCOA 1MDKA 4TR0A 3MWHA 1NHYA 1M9BA 4MF6A 2I9HA 4O92A 2MMNA 1M7TA 1SJIA 4IQ1A 2OE1A 2AYTA 2HSYA 4L0WA 2A2SA 2CX3A 3BJ5A 3KTBA 4I6XA 3ZIJA 3FRCA 1MDJA 2H72A 1X9MB 1THXA 3FHKA 1K3YA 5D93A 1X5CA 2OE0A 1V98A 2CAQA 1Z7RA 1I9DA 3F9UA 3RPNA 3GH6A 3UAPA 1X5EA 2LRNA 4V1Ap 2XPEA 3TOUA 3DVWA 5IMCA 1C72A 6GSWA 2C4JA 3GIXA 4Q5QA 3SWLA 3CMIA 1SYRA 1T4ZA 2KLXA 4EXJA 5ECPB 1XWBA 2H70A 2H73A 4NWYA 1WOUA 4DEJA 3A3TA 3A2XA 3D4MA 5C04A 1M2DA 3E0UA 4K7NA 4K6XA 4MF5A 2FWFA 2A2RA 3CTGA 3APOA 3KJYA 1YKAA 5DAKA 1SL0B 4HS1A 1X9WB 2IJYA 3FK8A 6GSVA 4HUAA 5CRWA 3ZTLA 3BCIA 1A23A 1AW9A 1B4PA 1TJDA 4DSSA 4ECBA 1T8EB 2IN3A 1DE2A 1N2AA 5HFKA 3CRUA 1T00A 4MJEA 4PNGA 1SK1A 4N0ZA 2HSHA 4WBRD 3VPTA 2VOCA 5H5RA 4OFTA 5ECSA 2FCHA 2FWHA 4F03A 5ECKB 1KEBA 3QMXA 2VD0A 2V2GA 1ERUA 4NMUA 4GSTA 2DJJA 4AGSA 2M80A 4KE3A 5E59A 4WETA 1BQ7A 3S9FA 1GLQA 1G6WA 3KTLA 4MZCA 4EVMA 1OE7A 3IBHA 4ML1A 3I69A 3D0ZA 2F3MA 3TKRA 1GL8A 1T1VA 4N10A 1VF3A 3ZREA 3H93A 4DSRA 2LRTA 2DMMA 5D9VA 5D9WA 3US3A 3O76A 1GTAA 4IQAA 1QGVA 2LEGA 2LS5A 1AC1A 3FYGA 2CT6A 4KDXA 1QQ2A 3LWAA 2LTKA 4XRDA 3P7XA 3ZZXA 2C8UA 5JCGA 12GSA 4MLYA 1R7HA 3IDVA 5FT3A 2CVBA 4TN8A 3C1SA 1T7PB 1EGRA 4TOPA 1PGTA 2HZFA 2MYGA 1PMTA 2HT9A 3W8SA 3QCPA 3E9JB 1URMA 3TGZA 1ABAA 3N9JA 3GTUB 3H1NA 2VLVA 4GXZA 4EC0A 4X1UA 4FH8A 4GSSA 2MZCA 3RDWA 4MZBA 3HDCA 5G31A 3DMLA 1KTEA 5D8IA 5ECIB 4I2UA 2NBSA 3KH7A 3HVVA 4TVEA 4MPGA 1GUKA 4IBPA 5HR2A 1HNBA 3DXBA 5C00A 4V2NA 1EEMA 2P31A 1JHBA 2YCDA 1WIKA 3ZLPA 4IW9A 4ZBBA 2LJKA 3PR8A 5F07A 1A8LA 5ECQB 1XWGA 2VL2C 4OFNA 4WF5A 3U6VA 4WR5A 2B1KA 4NXIA 2DBCA 2FA8A 3FZ5A 4MJBA 1HD2A 2P5RA 3ZFBA 2GQKA 4ZL8A 2KP1A 2DJ2A 2FA4A 4MABA 1DE1A 7GSSA 5IIZA 5IOXA 1LBKA 2JSZA 5G5FA 3VPQA 3I9V2 5CAXA 4IELA 1MD4A 1OC8A 4TR3A 1AXDA 2VL3A 2VL2A 4POKA 1WPIA 3UVTA 3F3RA 4OO4A 1FG4A 1Z6MA 3ZYWA 4D73A 1EP8A 4KA0A 2DJKA 2GLRA 3TKPA 2NTOA 2X99A 4GSNA 2C3TA 4TXVA 2B7JA 1EV4A 4N11A 3TUEA 3IR4A 2JSYA 5INYA 2E7PA 2VO4A 1GH2A 1RQMA 4TW5A 5G30A 1YQ1A 3G7JA 1TI3A 2VM2A 3SBCA 4DSSB 2OACA 3CYNA 2DJ3A 1TDIA 4I2TA 4IS0A 3GURA 2Z9SA 4HDEA 1BX9A 1KNGA 2VCQA 2ZUPA 3KMOA 5FHIA 1QFNA 1SKSB 3EYTA 3HJMA 5AGYA 2H76A 3QAWA 2H75A 3UVHA 4RQXA 1MTCA 4JR6A 4ECCA 2IPAA 2R37A 2CVKA 3QR6A 4L5OA 1FO5A 4IHUA 3TRXA 2FHEA 3BOAA 3DEXA 3EMPA 3VWVA 2V6KA 1GSSA 3VWXA 4Q5RA 3MSZA 2LSTA 4JU5A 4TR1A 5ID2A 1PQNA 2DSAA 1NM3A 3UEMA 1M99A 3IK7A 3QPMA 2C3QA 2H01A 1SD8A 3KMNA 3HD5A 4KCAA 2D2ZA 1M9AA 2LV3A 3FEUA 2YZUA 1K0AA 4PQ1A 2OJLA 2VUPA 2YN1A 1Y6EA 4J56E 2H66A 4XRAA 1BAYA 3J7Yb 3TJJA 1PKZA 4ZL9A 2LJRA 1ZMAA 2YANA 1UN2A 2YP6A 1G0TA 3TJBA 4HZ4A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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