3F9UA

Crystal structure of c-terminal domain of putative exported cytochrome c biogenesis-related protein from bacteroides fragilis
Total Genus 46
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
46
sequence length
145
structure length
145
Chain Sequence
EVHAKFDDYDLGMEYARQHNKPVMLDFTGYGCVNCRKMELAVWTDPKVSSIINNDYVLITLYVDNKTPLTEPVKIMENGTERTLRTVGDKWSYLQRVKFGANAQPFYVLIDNEGNPLNKSYAYDEDISKYINFLQTGLENYRKEK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of C-terminal domain of putative exported cytochrome C biogenesis-related protein from Bacteroides fragilis
rcsb
molecule keywords Putative exported cytochrome C biogenesis-related protein
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Bacteroides fragilis nctc 9343
total genus 46
structure length 145
sequence length 145
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2008-11-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13899 Thioredoxin_7 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3f9uA00
3M8NA 1UN2A 3IXRA 4KW6A 2AHEA 2OE3A 4WF5A 2PVOC 5F0GA 3EWLA 4N11A 1B4PA 5IPGA 3M9KA 3F63A 4MH2A 2VO4A 2R37A 2HZEA 5JWOB 2HSYA 1Z7RA 4QL7A 2CAQA 1K0OA 4OMVA 2CZ3A 4AJ7A 3Q6OA 4TXVA 1QFNA 3QD9A 3GKKA 3KD0A 2FA4A 1I5GA 5EVOA 3ZFBA 1PA3A 2CQ9A 5B6NA 3R2QA 1F2EA 4K7OA 2P31A 3ZMLA 3GKXA 3JCML 4JRRA 2BJXA 1UC7A 3IHQA 3D22A 4Q5FA 1FVJA 4PQIA 3ZVJA 1GTAA 4TR4A 5C04A 11GSA 2C0FA 1HD2A 4XS4B 2LRNA 3L9UA 3N9JA 4K7IA 2MMZA 4ULXA 5G2ZA 3FRCA 2V6OA 3BD2A 1X9WB 1EZKA 6GSVA 4LL4B 2RM5A 7GSSA 3C71A 1Z9HA 5IMAA 2B5YA 4EXJA 3LORA 1GTUA 2X64A 2OADA 2MBTA 3EC3A 4V2LA 1TRVA 2IFQA 2VOCA 2MMAA 4OCEA 1J0FA 3TGZA 4EDZA 1WJKA 1EP8A 2IJYA 2YN1A 1XBSA 1MD3A 3Q19A 2HXKA 2B3SA 1T4ZA 1TXXA 3F6DA 2L59A 3BCKA 4XS1A 3WYWA 1TI1A 2G2QA 4GWRA 1OYJA 3FYGA 1XW5A 4FYUA 1YEXA 3HVSA 4KX4A 4TKYA 4IQ1A 4RQXA 4TN8A 1M7TA 5GSTA 3LJRA 2H01A 3QAGA 1YF0A 3GSTA 4WKWA 5IM9A 2RIIA 1V58A 2HNLA 1ERWA 1YDKA 2ZNMA 1YQ1A 5INYA 3KMNA 1QQ2A 2OA7A 3UJ1A 1GTBA 1A2LA 3SBCA 2YANA 1K0BA 2H1DA 2CX4A 3ZTLA 1J9BA 3KZQA 1DUGA 2I3YA 3W8SA 3APQA 1J08A 1PX7A 4BWSA 1O81A 3V1WA 1NW2A 1OAZA 1U88A 2LJAA 3P8WA 5IOXA 13GSA 3RBTA 2DLXA 2EIRA 5HR0A 2IMKA 5CNWA 1ACVA 1W4VA 3FEUA 2IFQB 5AGYA 3VI5A 4O7HA 1GSUA 4MZBA 4L5LA 1GSQA 1FAAA 1QK8A 5IMFA 2B7JA 4F0BA 3ZYWA 4L8EA 1GSFA 3EU4A 5KN3A 2WS2A 1M9AA 5DDLA 2H75A 4ACSA 2LSTA 2O85A 2R3XA 3HJPA 2I81A 2JZTA 3TJBA 1F3BA 1O8WA 4I5QA 5HR2A 4EL1A 2JZSA 1EEMA 1M0UA 2CT6A 6GSUA 3O3TA 2XBIA 2O8VB 2OKAA 1H75A 1X9MB 3MDKA 5ECLB 2H73A 4KSOA 3LGCA 4OFNA 4LLRA 2QKEA 3KCMA 1C72A 2CV4A 4ID0A 3IV4A 1JLWA 3GTUB 2FCHA 5ECMB 4K0GA 2V32A 1SYXA 3IPZA 1PL2A 1FB0A 1T3BA 3DIEA 5JWRB 1G7OA 4GQFA 2XBQA 4X1UA 5J5NA 5EY6A 5E4WA 3US3A 4YH2A 1N8JA 2KLXA 5B6MA 4HDEA 4HUAA 3GSSA 1GL8A 5CRGA 1S3CA 4TOPA 3HDCA 19GSA 1B9XC 4NHZA 3HJOA 4E8EA 4IBPA 2I1UA 3O6TA 1ZZYA 2GT6A 3RHBA 3GH9A 3L9VA 2FA8A 4WXTA 1YKAA 5HFKA 3FR6A 5ECNB 2H8LA 1QXHA 2YZHA 2LS5A 5KN2A 3QFAC 1V40A 3LSZA 1Q4JA 1SKWB 4MP4A 1XXUA 4IJIA 1OVNA 1XVWA 2KP2A 1B4QA 1AQXA 3HXSA 4TR3A 5J9BA 2VD0A 4KCAA 3LYPA 3IRAA 4ECJA 4KUNA 1SL0B 3EURA 4AF2A 3HHVA 4N0ZA 1BG5A 3O76A 1MD4A 2CAIA 3G7YA 1NSWA 3E3EA 1X5DA 1VGLA 4HS1A 2GZZA 1XIYA 2VD1A 4GRFA 4I2UA 2VM1A 1XWBA 3CTFA 1BYEA 1V98A 1W89A 4DVCA 1CQHA 2WCIA 4X43A 3TOTA 2HZFA 2R6KA 3GL5A 3VK9A 3VPQA 3GH6A 2L4CA 5IMZA 2VLTA 1M2DA 1XZOA 2VCVA 3NOFA 2NBSA 1A23A 4IELA 1GRXA 1Y6EA 4JEDA 4EUYA 1YJ6A 1O73A 4G19A 1K0CA 1LBKA 3TOUA 2ON7A 2H0GA 4GTUA 1FHEA 4XRAA 1DSBA 1TK8B 4KE3A 4HZ4A 2AV4A 2A2SA 2P0GA 3QR6A 1N2AA 5ECQB 5H5SA 1SD8A 3ED3A 2XC2A 3KXOA 1DE1A 5KEJA 4MJAA 2E0QA 1R7HA 4X0XA 4TR1A 3WGDA 1Y25A 2Z9SA 3J7Yb 5D9WA 4TVEA 1THOA 3I9V2 2DJJA 2OBKA 1Z3EA 1K0MA 2FY6A 2PGTA 2NPBA 3UMAA 3TDGA 1U3AA 3GN3A 3C8EA 4K6XA 4MZWA 1XOAA 2WB9A 3HD5A 5A4UA 4GXZA 2BTOT 3HVVA 1O7UA 3TUEA 2WDUA 16GSA 2GVPA 3RPPA 3GIXA 5FWGA 1GSSA 4P3YB 4BPYA 1TJDA 2FWGA 2H76A 3FW2A 2E2GA 4I2TA 1SK2A 3ME7A 1AXDA 3RPNA 4YQUA 1T8EB 2GGTA 3G7IA 2M80A 2C4JA 4MK3A 1O8XA 1PL1A 2GQLA 1WIKA 2H6XA 4ECIA 3HCZA 2ZUPA 4ZB9A 4LA1A 4XCSA 3IDVA 4KDYA 5C00A 3EU3A 3ZITA 1ILOA 2M46A 1A2MA 2K6VA 1F9MA 4V2MA 1OE8A 4KNDA 2C3NA 2VL3A 4ZILA 1TU8A 2FGXA 3G9BA 4ZBAA 2LRTA 4TR1B 1NM3A 2DJ2A 2MMOA 4PX1A 6GSYA 3UVTA 2IMDA 3IK9A 1PRXA 2VIMA 1JHBA 1HQOA 1ZL9A 1ZMAA 5IIZA 2CVBA 1O85A 2HI7A 3H93A 1XPVA 1PSQA 1WRYA 4G2EA 3L78A 2JL4A 1EV4A 4HQZA 1A0FA 1FG4A 3WD6A 4V1Ap 5ECPB 5KN0A 2V1MA 1BJXA 4NPBA 5D93A 4RUVA 3F3QA 5AIXA 5ECSA 2I9HA 5H5RA 2REMA 1AUCA 1ON4A 4KDXA 4IP6A 4F9ZA 4ILFA 4LL1B 4J2FA 4GSSA 2CZ2A 3KM6A 5CYYA 1EP7A 2H0IA 2N5AA 1TK0B 4XIHA 4POKA 3UBKA 1G6YA 1FVKA 1XCCA 1XFLA 2KP1A 3ZFLA 4POBA 5D73A 2C0EA 1TKDB 5CRWA 1TRWA 1USBA 4WBRD 3RDWA 5HFGA 4PQHA 2M72A 3FR3A 3ZL5A 1A8LA 2RUEA 3MNGA 3L4NA 2DJ1A 2KUCA 2OJLA 4K1FA 1G0TA 3U6VA 5JWQB 1WWJA 2O87A 2WULA 4PUAA 3FHKA 5AN1A 5CRDA 5ELGA 1TK5B 3D0ZA 1M2AA 1KNGA 1TRUA 4BVXA 2L5LA 4DEJA 1PQNA 3GX0A 2GDRA 2GSRA 1V57A 3OR5A 4KGIA 2MBSA 2YNXA 2P5QA 5D9TA 2C0DA 5ECOB 1ML6A 1H4OA 3QCPA 1OKTA 3C7MA 5IPHA 4GCIA 3KTBA 2GSTA 2PU9C 1VF1A 2LNSA 5IMCA 3FK8A 8GSSA 3KH9A 5IMDA 4GSTA 1GUKA 2F3MA 4OO5A 4N0VA 3CMIA 4G9HA 4YAPA 2LUSA 2DMMA 3EMXA 1PMTA 3PR8A 4IN0A 1U3IA 1JZOA 2HE3A 3CXGA 3D21A 3ZLPA 3HY2A 4EVMA 2WGRA 4LMVA 1HNBA 4EO3A 2WZ9A 1XOBA 3F4RA 4IW9A 4K7NA 2H30A 3P7XA 4ML1A 4IKHA 3TJJA 3GTUA 2H1BA 4MCUA 20GSA 4HJ2A 4ZBDA 1KBNA 4F2IA 1QGVA 3DRNA 2BMXA 2C8UA 2VCXA 4F82A 4HJMA 4YQMA 2LEGA 3IOSA 3GMFA 4BVYA 10GSA 2HRNA 4WBJA 4J56E 3QPMA 3DMLA 1GWCA 5DBQA 4JE1A 2C1YA 3QDNA 4OO4A 2XHFA 2WRTA 3TCOA 1HYUA 2VCTA 4IHUA 2ZCTA 1ST9A 3U5RE 2IMEA 2OACA 3CSHA 1U6TA 4WR5A 5D8IA 2C80A 5DVBA 2XPDA 1SJZA 2PN8A 3TKPA 3C73A 5AIVA 1JLVA 1ZYQB 5DQYA 1OC8A 1PGTA 2H6ZA 2L5OA 4FH8A 4I97A 1X9SB 4Z7XA 2YWIA 3L0HA 4HU7A 2GZYA 4I6XA 1SK0A 3DXBA 4OCFA 4V2NA 4XTSA 4XS6A 2DJKA 4XHMA 1R5AA 3ZIJA 2FNOA 1SKSB 5E59A 4HOJA 4L0WA 5COHA 5CO3A 1BEDA 3IAS2 3EMPA 4ZB8A 3ZIVA 4CDOA 4WETA 4D73A 1FOVA 4E8HA 4CHSA 1AAZA 2WFCA 3HVXA 2H19A 4MMMA 3GKNA 3H1NA 3UOMA 5FT3A 1WE0A 3Q18A 1ZGNA 3DD3A 2F51A 4NV2A 4WR4A 4LMWA 4BA7A 3VI7A 5F06A 1X5EA 3DEXA 3GKMA 2L57A 1MEKA 1WPIA 3E9JB 4EE0A 2FLSA 1WOUA 1YEPA 1PD21 4HEA2 1AQVA 2F8FA 6GSTA 2GSSA 3KGKA 2LJKA 1SK1A 2JADA 4NXIA 5G31A 2DJ0A 4PNGA 3LQ7A 2H1AA 2FWFA 1Z5YE 3PH9A 5G1KA 1ZCPA 5LD0A 3MSZA 3APOA 3KTLA 1R4WA 4AJ8A 2R4VA 2E7PA 5D96A 2IMFA 1RW1A 2MMNA 1M99A 3A2VA 3TRPA 3UIWA 3EYTA 5IOWA 3FY7A 1CQGA 3UBLA 3I69A 3BJ5A 3ZZXA 1V2AA 4MABA 4D73B 1B9YC 1SL1B 3HZ8A 3FZAA 2VUPA 4ZBBA 3DKSA 2YCDA 2RLIA 3M9JA 2E2MA 2VCWA 5DQSA 3QAVA 5FHIA 2V2GA 3FZ5A 1XWCA 1DBYA 2H71A 4F03A 3P90A 3LYKA 3A3TA 2LTKA 2GQMA 1VF3A 1K0AA 2PVQA 1SYRA 5DJLA 2MYGA 5ELAA 4PUFC 2TIRA 2H6YA 1V9WA 3GURA 3W8JA 2GQKA 1GSDA 5H5QA 1PKWA 4MJCA 3DWVA 3GL3A 4ZL7A 2O89A 5JCWA 3CSIA 1T7PB 4TRXA 4OWYA 2H1GA 4WF4A 2VL9A 3TKQA 2CVDA 1GUHA 2V41A 1YZXA 2PMTA 3KIJA 1U87A 4NAXA 2LKUA 2YWOA 3LXTA 2GS3A 2C3QA 3UAPA 4MJEA 3C1SA 1QMVA 4PQ1A 2ON5A 2F9SA 3IK7A 5DCGA 3WGEA 1MTCA 1AQWA 2CA8A 1Z6NA 5ENUA 3SWLA 4CW9A 5J3RA 4F0CA 2HLSA 2N5FA 1RK4A 2DMLA 1K0DA 3K8NA 1URMA 2ALBA 4EC0A 1ERTA 1E2YA 4L5OA 2HT9A 5CAXA 3CYNA 3LG6A 2VCQA 4ZXGA 4Q5NA 3IBHA 5ECIB 3F6FA 5ECHB 1SKRB 2NVLA 2IIYA 3J7Yk 1Z6MA 4KH7A 2B7KA 3MWHA 1AC1A 5HR3A 3G7JA 1EEJA 3ERGA 2P5RA 2VCZA 3VPTA 1HNAA 2B1LA 3QOUA 4HZ2A 4GF0A 1XVQA 4MLYA 2EC4A 4MPFA 4N10A 5ID2A 1AIUA 3CBUA 1SJIA 4WEYA 4N30A 4QL9A 1K0NA 4MDCA 4KDUA 3UVHA 2AB6A 3S9FA 2GSQA 1G6WA 2VLUA 5EPFA 1GSYA 3M0FA 2F8AA 1M2BA 5J4UA 2H72A 5DAKA 1FO5A 3KP8A 3MAKA 3F3RA 4GQCA 2PWJA 3EVIA 3HYPA 4JZQA 1G7EA 3ISOA 5F07A 5DALB 3VLNA 3IC4A 2OE1A 4IJ3A 2B5XA 5A4WA 2HRFA 4YQVA 2B5EA 4MF6A 2GZPA 1OC9A 4KAEA 2YWNA 3IE3A 4I8BA 3FZ4A 3GUSA 3HZ4A 2GLRA 4ECCA 1UA5A 4IVFA 2LJRA 4GSNA 1TDIA 3F4SA 1VRSD 3IR4A 2NTOA 5G5FA 1EOGA 1SD9A 2H70A 3KJYA 5GAPD 3HKRA 3ZMKA 1FB6A 3CRTA 2PBJA 4JR4A 1VF4A 5J9CA 5A4VA 3TKSA 2AAWA 1X5CA 2HFDA 3L9SA 1MDIA 4PGTA 2DBCA 5ID2B 3M1GA 4HU9A 3E0UA 4BWQA 5LCZA 1NHYA 5IO2A 4JBBA 2A4VA 5JCUA 3N5OA 3TRQA 4MF5A 1LJRA 2OBIA 1T1VA 1K3OA 3ZRDA 4EKZA 5DAKB 3ZREA 3TKSC 4OFTA 2CX3A 5B8AA 2AJQB 2DSAA 1Z7PA 1VF2A 2J23A 5G5EA 2TRCP 3BCIA 4RI7A 2A2RA 1BQ7A 1HNCA 3ERFA 1OC9B 2JSYA 3FZ9A 4FIWA 3ERWA 2EIQA 1XW6A 4K8MA 5IO0A 2HZEB 5DJMA 4K9ZA 2YZUA 3A2XA 1ZOFA 4G10A 2JACA 2L4QA 1YY7A 4DSRA 1B8XA 3UL3A 1SL2B 3UEMA 1TRSA 4ECBA 1GNWA 4Q5QA 5GZZB 5G30A 3LWAA 2NDOA 2N5BA 5IQYA 1TI3A 1YKCA 4OFMA 4MPGA 2DIZA 3A5WA 3TJKA 3VWXA 2C3TA 2GT5A 5IMVA 2DC5A 4PNFA 2I4AA 1PKZA 3P2AA 3F4TA 1IYHA 2JU5A 2R5GA 4EF0A 3VWWA 1JZWA 1PX6A 4IP1A 1K3LA 3I6AA 4HI7A 2H74A 1OC3A 3TKSE 3LFLA 5F05A 1R26A 14GSA 4L0UA 3ZVJD 4IS0A 4NMUA 1E6BA 1SENA 3I43A 2D2ZA 1EGOA 3FR9A 1XWKA 4PURA 1KTEA 4O5RA 3VWVA 3KMOA 1GP1A 3D4TA 3F9UA 3QAWA 1M9BA 1WP0A 1TTZA 5D9VA 1XW9A 3HJMA 2FHEA 9GSSA 4KSMA 1O6JA 1XWAA 2XPEA 5D9XA 2IPAA 3GYKA 5F8BA 5KN1A 3AY8A 2WJUA 1AW9A 4AGSA 3GA4A 1EWXA 2FD3A 2DIYA 4YAVA 1GLQA 1F3AA 2HYXA 3DVWA 4TW5A 2VLVA 1A0RP 4IQAA 1TOFA 4OD7A 3BBYA 3NIVA 1EGRA 1JFUA 4QQ7A 2X8GA 4K0NA 5G1LA 4HQSA 6GSXA 5HR1A 1JZDA 3TKRA 1A2JA 2VL2A 1LU4A 2QC7A 4ML6A 1UVZA 5ECKB 1TU7A 2H66A 2RM6A 2PPTA 2L6DA 3KEBA 1DE2A 3BOAA 2YJ7A 4MZCA 3IA1A 2PUKC 2LV3A 4RQRA 3CTGA 5HFIA 1THXA 2IMIA 1SU9A 1GLPA 3APSA 4BL7A 4DSSA 5DCHA 2FUG2 2X8CA 2VL2C 4ZL9A 4RI6A 2OE0A 1T00A 3WGXA 4POLA 4TXOA 17GSA 1GH2A 2IN3A 3A2WA 3LXZA 4FO5A 1SJ6A 3CRUA 2LQQA 1A24A 2G0FA 3F0IA 3DYRA 3F8UA 4NHWA 1F6MC 1GNEA 3PINA 5B8BA 4Q5RA 1XWGA 3GRXA 5LNKe 2B1KA 3RAZA 22GSA 1S3AA 4PXOA 3Q74A 3WT1A 2VAFA 4JU5A 2H0HA 5EL8A 4NWYA 1RQMA 3GX8A 3EE2A 3KH7A 3TRXA 3GFKA 4ZIJA 1EOHA 5ECRB 3RHCA 3M3MA 1NHOA 4FYBA 1QUWA 3VFIA 1MDJA 1OE7A 4J57E 2K9FA 2VM2A 3D4MA 5B7CA 4MH3A 1TW9A 3QMXA 5JCGA 3NZNA 2QGVA 1ZYEA 2PERA 5CREA 3H79A 3LEFA 1JZRA 4KCEA 2V6KA 4FYCA 2YP6A 4DSSB 4H86A 3CSJA 2YV9A 3GHAA 2IWTA 3KP9A 3ME8A 3VURA 5L71A 1Q98A 4ZB6A 4TXOB 2K18A 2EIOA 2B6MA 3PGTA 1I9DA 1MDKA 3TJGA 3IAM2 4JR6A 1ERUA 3VWUA 4K2DA 4KB3A 1T4YA 3DVXA 1PN9A 2LQOA 4MF7A 1BAYA 3FKFA 2R2JA 2ES7A 4MA9A 3TB2A 3H8QA 1GUMA 12GSA 5GSSA 1R5PA 3D6IA 3C1RA 4GLTA 2L6CA 2FWEA 2X8HA 2JSZA 5DALA 4NV5A 2DJ3A 2QSIA 1ERVA 2LNTA 2AUVA 2KOKA 2MZCA 4POMA 2YV7A 5A5KA 2CVKA 2HSHA 3DGQA 1ABAA 4O32A 4O92A 2RUFA 5J41A 18GSA 4DSQA 4KA0A 1EV9A 2K8VA 2IL3A 2LRCA 1FW1A 5CP1A 2YPMA 3WT2A 6GSSA 4XRDA 2K8SA 1A8YA 2JZRA 5CRHA 6GSWA 1TP9A 4ZL8A 1WMJA 1BX9A 1YF1A 2FWHA 5ABRA 2KHPA 1B48A 5GAND 3D5JA 1GTIA 2AYTA 2O7KA 3H4KA 2TRXA 4ISDA 2C0GA 1X0RA 4EDYA 2YWMA 1F37A 4TR0A 4AJ6A 4IGJA 2X99A 4MJBA 2GTUA 4V1Ag 4XS4A 3EINA 2YOIA 1GULA 3UARA 3GNJA 1GSEA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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