3GL5A

Crystal structure of probable dsba oxidoreductase sco1869 from streptomyces coelicolor
Total Genus 78
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
78
sequence length
237
structure length
234
Chain Sequence
HMRVEIWSDIACPWCYVGKARFEKALAAFPHRDGVEVVHRSFELDPGRAKDDVQPVLTMLTAKYGMSQEQAQAGEDNLGAQAAAEGLAYRTRDRDHGSTFDLHRLLHLAKERGRHEALLDAFYRGNFADERSVFNDDERLVELAVGAGLDAEEVRAVLADPAAYADEVRADEREAAQLGATGVPFFVLDRAYGVSGAQPAEVFTQALTQAWGERTPLKLIDAEACGPDGCAVPG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of probable DsbA oxidoreductase SCO1869 from Streptomyces coelicolor
rcsb
molecule keywords Putative DsbA oxidoreductase SCO1869
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Streptomyces coelicolor a3(2)
total genus 78
structure length 234
sequence length 237
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-03-11

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3gl5A01
4OCFA 1XIYA 3P90A 3LORA 1YZXA 3LYPA 5IMAA 2C0GA 4GF0A 2GLRA 3LJRA 20GSA 2HZEA 5G5FA 3U5RE 1PGTA 3QAGA 2XBIA 3IHQA 3KH7A 5CO3A 3GL5A 2TRXA 1QUWA 1VRSD 5D73A 5GAPD 1A8LA 2B1LA 5IMVA 1S3CA 1XOBA 4YAPA 1GUMA 4K7OA 3VWWA 5D9WA 2G0FA 4AJ7A 1VF3A 1JFUA 2NVLA 5ECHB 4TVEA 5KN1A 2BMXA 2H1AA 3MAKA 1VGLA 2JACA 4YQVA 5JCGA 2L57A 1XWBA 2LKUA 2LV3A 2TIRA 1XXUA 1X5CA 4E8HA 2OBKA 1K3YA 3DIEA 4GXZA 2VM2A 3IR4A 3EU3A 3QFBC 3NZNA 1GSEA 1GUHA 3M3MA 1M9BA 2VL2A 4ECCA 1U6TA 4OFTA 5FHIA 3ZTLA 2O89A 4KDUA 5ECRB 1YY7A 2I1UA 2VOCA 1MTCA 3F0IA 1E2YA 3TRQA 1EP8A 2V6OA 4MPGA 3CSIA 3HD5A 1N8JA 2X8HA 4GSNA 2V2GA 2CVKA 4ZL9A 5D8IA 3CTFA 1YKCA 1I5GA 1K0MA 2A2RA 2C0FA 2H70A 3W6GA 2FCHA 2H0HA 1WIKA 4TN8A 4FH8A 5B8BA 2LNSA 3RBTA 2LTKA 2DJ3A 1Y6EA 3EURA 2C0EA 1O81A 3NIVA 5H5QA 1XW5A 2P5RA 4HJMA 2DJKA 2IWTA 5CRWA 1SU9A 1THOA 2YNXA 1HQOA 4BVYA 2P31A 2LRCA 4FIWA 4MP4A 2PN8A 5KN2A 2GT6A 3EMPA 5HFIA 1OC8A 4DSSA 4K0NA 4K6XA 5HR1A 1M0UA 3PR8A 3QAVA 2X99A 2EIQA 1A0RP 5IIZA 5J9CA 5ECPB 1Z6MA 3FK8A 1WP0A 4MMMA 1O8WA 1H4OA 2VUPA 5IMZA 5JWQB 2XC2A 3QMXA 3CXGA 4ZBBA 3ZITA 3M0FA 2VCZA 2AYTA 1G6WA 3SWLA 2F9SA 2H1BA 1X9SB 3KCMA 2DJ1A 1C72A 6GSSA 3A2VA 2B7KA 2TRCP 1Z6NA 2N5BA 2R4VA 4PQHA 5IMCA 4NHWA 1AAZA 1TRVA 3VI7A 5AGYA 3KZQA 3PH9A 2C3TA 2I9HA 3KJYA 1FVKA 4WF5A 4LMVA 4RI6A 4KDXA 1YJ6A 4NV5A 5COHA 2WZ9A 4TKYA 1J0FA 1U3AA 2E2MA 2V1MA 1JZDA 1TK5B 2JL4A 4GQCA 1XWKA 4E8EA 1T4ZA 1FB0A 1BX9A 4NV2A 2O85A 3VWXA 1EZKA 1FG4A 5LD0A 4D73B 4N30A 2H76A 3US3A 1QMVA 3HVSA 3M9JA 4IJIA 2R2JA 1KNGA 4MJAA 5G31A 2WFCA 4QL7A 5AN1A 4PXOA 5FWGA 2HI7A 1GH2A 2ZUPA 1CQHA 4POBA 3G7YA 1NM3A 2O87A 4XRAA 2E0QA 1XW9A 5DAKA 2OA7A 3GFKA 1G7OA 1G6YA 3O76A 3HHVA 2VL2C 5G1LA 1UA5A 1W89A 4RI7A 1Y25A 3GN3A 1OAZA 4Q5RA 2KP1A 1FAAA 2E7PA 4ZIJA 2H75A 4ZL7A 3D0ZA 2KOKA 3TKSE 1YDKA 3GRXA 2K18A 2JSYA 1XPVA 3HVXA 1GSUA 4I2TA 1WE0A 5KN0A 4GWRA 1MDJA 1ZL9A 5DCGA 2MMAA 2LQQA 4WR5A 4I2UA 1SKRB 1YF1A 3KD0A 1X5DA 5E59A 4I8BA 3ZIJA 2P0GA 4WR4A 1PRXA 3TOTA 2C3NA 1SL2B 1TDIA 3E9JB 4IJ3A 3GSTA 3C1RA 1HD2A 1Z7PA 4POMA 2B5EA 4K7IA 1AQWA 3FZ5A 2I4AA 3TKSA 4O92A 4X43A 3PGTA 1SKSB 4GSSA 2A2SA 4KGIA 4CHSA 4KA0A 2GDRA 4XRDA 4ZL8A 4IBPA 4HOJA 4NAXA 1U88A 1M9AA 2L6DA 1X0RA 4V2LA 4ZB9A 2B7JA 3BBYA 5GZZB 4YH2A 1RK4A 5ECIB 3TUEA 4ZB8A 2B3SA 3Q18A 3D22A 2X8GA 2MZCA 1Z3EA 2NPBA 3DVWA 2MMZA 3A3TA 5H5RA 2PUKC 3I69A 3VPQA 2VD1A 1SKWB 2YOIA 3P8WA 3TJJA 2ES7A 2HZEB 3G7JA 1WOUA 3D4MA 2KLXA 3TDGA 4LL4B 2MMOA 3WT1A 4J2FA 4BA7A 1WJKA 2EIOA 1JLWA 1A23A 1JLVA 4EC0A 1X5EA 3H1NA 3L4NA 1Q98A 5A4WA 2C3QA 4XS4B 3FY7A 1TI3A 1FOVA 3LFLA 3QAWA 1PD21 3IDVA 2WGRA 1G0TA 5J3RA 4BL7A 3FW2A 2VO4A 2WCIA 5F0GA 2GTUA 4FYBA 2H30A 4TXVA 1B4PA 3DMLA 2IPAA 5GSSA 1EGOA 4PQ1A 1XWAA 1X9WB 2RM6A 1VF4A 1TJDA 3GIXA 4K2DA 1GTUA 1FVJA 3C8EA 3A5WA 4K0GA 1I9DA 1S3DA 5B8AA 1J9BA 2C1YA 2LEGA 2R37A 3GX8A 3GTUA 4MDCA 1BG5A 2GT5A 3QR6A 2CX4A 4JR6A 2GZZA 4YQMA 3Q19A 4XCSA 2QSIA 3D6IA 1EP7A 2V6KA 1O73A 2H66A 2GSSA 1W4VA 4EF0A 2IMDA 1SK0A 2R6KA 2VCWA 4MH2A 3LWAA 1BQ7A 1OC9A 1F6MC 2FLSA 3FEUA 4PUFC 2LJAA 1EGRA 3MSZA 3C7MA 5E4WA 1TI1A 4IP1A 1JZWA 3TKSC 4PGTA 3EYTA 2IFQA 3FRCA 4BWQA 4DSSB 1XVWA 1EEMA 4XS4A 4BVXA 2K6VA 2FWHA 2IMKA 1M2BA 2LS5A 1TOFA 3QPMA 2L5OA 1SL0B 2IIYA 2PGTA 3GKMA 3HJPA 1CQGA 2LUSA 1R7HA 3APOA 1QGVA 5CRGA 1OE8A 3TB2A 1RQMA 1IYHA 2H0IA 5D93A 2QKEA 1TTZA 3CYNA 4N11A 2VD0A 2GGTA 1J08A 1NW2A 2F3MA 1XCCA 1GULA 2DBCA 4K8MA 4GRFA 1JHBA 1V2AA 3VURA 5G30A 1G7EA 4ACSA 1YQ1A 3CRUA 2OBIA 8GSSA 2FA4A 1ZYQB 4MF7A 4L0WA 1PA3A 2F8FA 3N5OA 1PSQA 3RAZA 5A4VA 1ST9A 3TOUA 4Q5QA 3D5JA 3HZ4A 1M2AA 4F2IA 3ZMLA 2LSTA 3TRXA 1B9YC 1XWGA 1TXXA 4I5QA 5H5SA 5F06A 4KE3A 3HZ8A 3AY8A 4P3YB 2HXKA 1EEJA 1QK8A 1OKDA 3P7XA 1K0OA 3F4TA 1V9WA 3A2XA 2KUCA 1AW9A 5DALA 5DAKB 1K0DA 4KSMA 2CT6A 5DJLA 2X64A 4TR3A 2VL3A 3GHAA 2NDOA 1YEXA 2J9HA 2B1KA 1DBYA 2FY6A 3F3RA 1TU7A 3GKKA 2HZFA 1GRXA 3KP9A 5F8BA 4Z7XA 4IS0A 2YJ7A 4L5LA 5ECKB 1GP1A 1B8XA 3TJKA 4OFNA 1T4YA 4NMUA 2GZPA 5IMDA 5HFGA 2HSYA 3TCOA 4N0ZA 3C71A 3FR3A 3KXOA 4HS1A 1ML6A 4QQ7A 4RQRA 4KH7A 1FO5A 2M80A 4LLRA 4LA1A 2REMA 1A2MA 2FGXA 3H93A 3ED3A 3HYPA 3H79A 1PKZA 2D2ZA 4IVFA 3F6FA 3FR9A 1UC7A 3A2WA 1K0NA 1T00A 3EWLA 4KAEA 3VWVA 4JR4A 3TJBA 5D9XA 4MZWA 4QL9A 5ELAA 1Z7RA 3H4KA 2CV4A 3BJ5A 1GSDA 2H1GA 4J56E 2YP6A 4X0XA 5IQYA 1OC3A 1AC1A 4TR1A 3UARA 3C1SA 4HQZA 2MMNA 3GKNA 4WXTA 1VF1A 5KN3A 5ID2A 3L78A 3IPZA 3SBCA 3WGXA 2B5XA 4G9HA 1ZYEA 16GSA 4TR0A 4BWSA 1B9XC 1R26A 1ABAA 3EVIA 2WRTA 3BD2A 4ISDA 5ECNB 3KM6A 4ILFA 3JCML 3IK7A 4TXOA 4GQFA 1RW1A 1EWXA 4MCUA 2PERA 2HRNA 1GSQA 4L0UA 4K7NA 1HNAA 3FHKA 1FHEA 4ID0A 3S9FA 3KMOA 3TRPA 3NOFA 2F51A 3UAPA 2DJ2A 2K8SA 1M7TA 2VCVA 2V32A 1N2AA 2CAIA 2IMIA 2LJKA 2FHEA 1KTEA 3CRTA 4ML1A 3HKRA 4F9ZA 2WJUA 1F3AA 4MK3A 4IGJA 2HRFA 3BOAA 1EV9A 4YAVA 4O32A 6GSXA 1H75A 2XHFA 2YWOA 1JZOA 3VWUA 3E0UA 2CAQA 2WDUA 3ZYWA 3GL3A 4GSTA 4DEJA 3GA4A 3KTBA 1SENA 5DBQA 2HT9A 1MD4A 5EVOA 1OVNA 4JU5A 1V57A 5HR2A 1TK0B 4L8EA 1AXDA 4NWYA 2CQ9A 4V1Ap 2H73A 3UEMA 1ZZYA 1WWJA 3HA9A 3LGCA 2AB6A 1GL8A 11GSA 3ZFLA 4PNGA 3L9VA 2YZHA 4KW6A 3O3TA 2H74A 1GSYA 4G10A 2V41A 4HUAA 3UOMA 5CYYA 2PVQA 3ERWA 3UIWA 1K3LA 3ZVJA 2VLTA 13GSA 2C8UA 1O8XA 5IPGA 2IMEA 5HFKA 2CA8A 1MEKA 3DD3A 2YJHA 3EINA 3IAS2 2HE3A 3L9SA 1GLQA 4FYUA 4IQAA 1URMA 2LQOA 4JZQA 5IO0A 3GTUB 4JRRA 2NBSA 4POLA 4KSOA 2L6CA 4OMVA 1NSWA 5ECQB 4ZXGA 4K9ZA 3O6TA 3W8JA 4AGSA 3ZLPA 5DVBA 2K8VA 2PU9C 5J9BA 4RUVA 2R3XA 1MD3A 1F3BA 2M46A 3TGZA 3MWHA 1V98A 4I97A 3QDNA 5C04A 2L4CA 1A24A 1GLPA 3E3EA 3KIJA 1OC9B 1LBKA 2FA8A 3MDKA 4XS6A 1SYRA 5ECOB 1M99A 1MDKA 1TW9A 1GNEA 1EOHA 3I6AA 4IP6A 1UN2A 2PBJA 2YN1A 2GZYA 3IXRA 2FUG2 1AUCA 2IFQB 3CTGA 3HJMA 5C00A 5A5KA 4PURA 1TU8A 4WETA 4AF2A 2I3YA 3QOUA 3IC4A 3LSZA 4WBRD 2MBSA 2Z9SA 4FO5A 19GSA 3W8SA 2JADA 2JZRA 1YF0A 3IAM2 3QFAC 2XPEA 2EC4A 2YWIA 4TRXA 1A0FA 5CREA 3BCKA 4MZBA 4F03A 4OD7A 3KGKA 3GMFA 4JE1A 4DVCA 5D9VA 2B6MA 2AV4A 1ZOFA 3IK9A 3F9UA 2C80A 4XTSA 3F3QA 3IE3A 3DEXA 4HI7A 4GLTA 4EO3A 3EMXA 4X1UA 3UVTA 3FZ9A 1SJZA 1ILOA 2H01A 4EDZA 5HR0A 3DKSA 3ZFBA 4Q5NA 5J4UA 1ZMAA 1AQVA 4DSQA 3APSA 4HU9A 4EDYA 1NHYA 4I6XA 4NPBA 4FYCA 2BTOT 1Z5YE 2VAFA 3TKPA 4N0VA 3GX0A 3J7Yk 2AAWA 1XZOA 5AISA 4EE0A 5HR3A 2MYGA 5DCHA 1ON4A 2ON7A 3DYRA 1T8EB 2GS3A 4ULXA 2RIIA 3GKXA 3LEFA 3VK9A 1U3IA 2QGVA 4EXJA 1PN9A 2VM1A 2KHPA 3ZRDA 2OE3A 14GSA 3GV1A 5LNKe 4MJCA 5CP1A 2DIYA 2M72A 4L5OA 2ZNMA 3CBUA 5DALB 3RDWA 1OE7A 2H71A 4F0BA 5IOXA 4MLYA 5ECLB 5CNWA 4MA9A 2LNTA 2K9FA 3FYGA 1JZRA 4CW9A 2N5FA 2PWJA 2GQMA 3ZMKA 2XBQA 1KEBA 2L59A 1A8YA 2OJLA 4HZ2A 4MH3A 1TRWA 4O5RA 2HFDA 1MDIA 4HDEA 3F4SA 1HYUA 1S3AA 3ERGA 5DJMA 4IELA 4OFMA 4IKHA 2IMFA 1OKTA 3F6DA 6GSWA 1B48A 2VCTA 4LMWA 3DGQA 2VCQA 2LJRA 4HZ4A 2KP2A 3MNGA 4MJEA 5IO2A 1ACVA 3RHBA 3CMIA 2XPDA 2H19A 3LXTA 3IBHA 4GTUA 3RPNA 3M1GA 1DUGA 3ME7A 3OR5A 5AIXA 1DE1A 5J41A 5D96A 4OO5A 4DSRA 3I9V2 4J57E 5HQPA 1BJXA 4KDYA 4G19A 1NHOA 4MF5A 3P2AA 3G7IA 4TR1B 4HEA2 1HNCA 4G2EA 2G2QA 1T1VA 5ID2B 3UJ1A 4BPYA 1BAYA 1UVZA 4PQIA 3DVXA 4LL1B 3FZ4A 2YPMA 2OE1A 5AIVA 5EL8A 3HCZA 2VCXA 2HYXA 3Q6OA 4AJ8A 4EL1A 1XFLA 2N5AA 2L5LA 1BEDA 2ALBA 5D9TA 4TXOB 2J23A 1PKWA 4ECJA 1WPIA 3ISOA 3GYKA 3TKQA 3WYWA 2CZ2A 4N10A 4YQUA 2B5YA 3WGEA 2HNLA 2P5QA 3M8NA 3HVVA 3G9BA 2L4QA 3K8NA 3KMNA 2PMTA 2R5GA 2YWMA 5KEJA 1A2LA 3EE2A 4H86A 3TJGA 1GSFA 1A2JA 2OACA 6GSYA 1TKDB 1ERTA 1TP9A 4KCEA 2HLSA 1GUKA 3GUSA 1EOGA 4MZCA 4CDOA 2O8VB 1XOAA 3ZZXA 5DDLA 3ZIVA 5JWOB 5L71A 4POKA 4XHMA 3IRAA 5FT3A 4TR4A 2DMMA 4HQSA 1OYJA 3F8UA 1M2DA 2WULA 4PUAA 4RQXA 3I43A 1R5PA 22GSA 2C0DA 1THXA 1SJIA 5ENUA 2H72A 4ZB6A 4HJ2A 4EVMA 3ZL5A 1K0CA 4KNDA 2A4VA 3DRNA 2DJ0A 1O6JA 3WGDA 4KX4A 2YZUA 1XW6A 2FWFA 5CRDA 3GSSA 5EPFA 5GAND 1QQ2A 4KB3A 3N9JA 4OCEA 2O7KA 4ZBDA 4TW5A 4XS1A 1PMTA 1GTAA 3BCIA 2AUVA 2H6ZA 3UVHA 1SD8A 3Q74A 1ZCPA 4ZILA 3LG6A 4V1Ag 2GSTA 4WKWA 3CSJA 2LRNA 3V1WA 4ZBAA 2YV9A 5J5NA 4PX1A 2FWGA 3M9KA 2RUEA 2MBTA 3C73A 1WRYA 1GTIA 3WT2A 1SJ6A 2YV7A 3RHCA 2GSQA 4MABA 4JEDA 4EUYA 3DXBA 3KEBA 3PINA 2CZ3A 4MF6A 3VI5A 1K3OA 2VLVA 2VL9A 2H6XA 5INYA 2IJYA 1GNWA 2ZCTA 3TJFA 1F2EA 1FB6A 18GSA 3D4TA 3GNJA 1O85A 2ON5A 3FKFA 4K1FA 1YEPA 3IA1A 1F37A 1BYEA 4NXIA 4IHUA 2DC5A 3F63A 5A4UA 4ECBA 1ERUA 4MJBA 3FZAA 1ERWA 1K0AA 1XWCA 1SD9A 3J7Yb 4IW9A 2CX3A 1Q4JA 2H8LA 2VLUA 5CRHA 3ZREA 1X9MB 1PL1A 5JCUA 3H8QA 5CAXA 1ERVA 1XBSA 2OKAA 3TKRA 2C4JA 4OO4A 1DSBA 5JCWA 3VPTA 4ML6A 1GSSA 1GTBA 5DQSA 1SYXA 3QCPA 2RLIA 4F0CA 3L0HA 2IN3A 3VLNA 1PX6A 1AQXA 4WBJA 5GSTA 5F05A 3WD6A 2PPTA 2CVBA 3HDCA 2JZSA 3QD9A 1QXHA 1LJRA 4IN0A 5ECMB 5B7CA 3KH9A 17GSA 3LYKA 3L9UA 1EV4A 2JU5A 3LXZA 2DMLA 4Q5FA 2AJQB 4D73A 3UMAA 1T3BA 4WEYA 4KCAA 2OADA 4TOPA 2DJJA 1XVQA 1V58A 3APQA 5LCZA 2YANA 12GSA 3HJOA 3IOSA 5ABRA 1E6BA 5B6NA 2F8AA 2H1DA 1T7PB 2JZTA 5G5EA 2I81A 3EC3A 3ME8A 1QFNA 2FWEA 3HXSA 4EKZA 3KTLA 2QC7A 2WS2A 2OE0A 5IM9A 2GVPA 1U87A 2JSZA 6GSTA 1V40A 1TRUA 3KP8A 2FNOA 2RUFA 4V2MA 3UBKA 5JWRB 5IPHA 3HY2A 3GH6A 3ERFA 2CVDA 2GSRA 1FW1A 1SK1A 1KBNA 4V2NA 2NTOA 1LU4A 4O7HA 1USBA 5F07A 1PQNA 2YCDA 1DE2A 2GQLA 4MPFA 1PX7A 2FD3A 3LQ7A 2DSAA 2H6YA 2HSHA 5IOWA 2H0GA 4XIHA 3GH9A 1AIUA 6GSUA 2X8CA 1K0BA 4GCIA 2E2GA 3DWVA 1IYIA 2LRTA 4WF4A 3U6VA 1Z9HA 1TK8B 3UBLA 2GQKA 1B4QA 5G2ZA 4HU7A 1ZGNA 2EIRA 3ZVJD 1R4WA 4IQ1A 3FR6A 5ELGA 1SL1B 2RM5A 1R5AA 2PVOC 5DQYA 4AJ6A 1F9MA 5IMFA 1YKAA 2IL3A 4PNFA 1TRSA 1O7UA 1VF2A 3IV4A 2AHEA 5EY6A 4JBBA 3RPPA 4NHZA 3GURA 5G1KA 1SK2A 4ECIA 4F82A 6GSVA 2WB9A 9GSSA 5ECSA 3EU4A 4KUNA 1PL2A 2VIMA 2DLXA 10GSA 3R2QA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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