3GV1A

Crystal structure of disulfide interchange protein from neisseria gonorrhoeae
Total Genus 44
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
44
sequence length
140
structure length
140
Chain Sequence
MSLDKAIKEVRGNGKLKVAVFSDPDCPFCKRLEHEFEKMTDVTVYSFMMPIAGLHPDAARKAQILWCQPDRAKAWTDWMRKGKFPVGGSICDNPVAETTSLGEQFGFNGTPTLVFPNGRTQSGYSPMPQLEEIIRKNQQE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title The crystal structure of disulfide interchange protein from Neisseria gonorrhoeae
rcsb
molecule keywords Disulfide interchange protein
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Neisseria gonorrhoeae
total genus 44
structure length 140
sequence length 140
chains with identical sequence B, C
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13098 Thioredoxin_2 Thioredoxin-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3gv1A00
4D73B 2DJ1A 1TP9A 1GL8A 2IMEA 4J2FA 2H75A 3GL5A 3DD3A 3LYKA 4XTSA 1EV9A 3W6GA 1LJRA 3IA1A 1QMVA 4PNGA 3IAS2 4MDCA 4GCIA 3ZRDA 3DVWA 2H6XA 5G30A 2MZCA 4MP4A 1X5DA 3APOA 4HS1A 2P0GA 3JCML 4NXIA 5HR0A 1FB6A 1XPVA 4F2IA 1ZL9A 4POMA 2A4VA 5JWQB 1O7UA 5E59A 5IO0A 3KH7A 1Z6MA 3NIVA 4N10A 4FH8A 2TRXA 1GULA 3WT2A 4N0ZA 2KUCA 4EKZA 3C1RA 2K18A 2GT5A 4JZQA 4WF5A 4K7NA 3IPZA 2JL4A 1XW9A 4IVFA 4ILFA 3FR3A 2OE0A 3LXZA 5J4UA 2H71A 2B5EA 4YQUA 5H5RA 2OA7A 3VFIA 4HQZA 1PX6A 1SK2A 1TOFA 2E0QA 2H1GA 6GSWA 2DBCA 1K3LA 1UA5A 4TOPA 1V9WA 1CQHA 2VUPA 3ZVJA 2RM5A 3KH9A 3GA4A 5AISA 2FWHA 3GN3A 2NBSA 3QMXA 2MBTA 2ON5A 2YPMA 4Q5QA 4WR4A 1GUHA 1K3OA 2GQKA 3LG6A 1XWBA 2J23A 2AAWA 1EGOA 1R26A 4MF7A 1O6JA 2DJJA 2V41A 2OE3A 1ZCPA 4KDXA 4KGIA 2OBKA 3WGXA 5G5FA 3RPNA 2GVPA 2GTUA 3QDNA 4JRRA 3TCOA 4GQCA 1JZRA 3UAPA 3WGEA 2LNSA 4PURA 3S9FA 4KDYA 3ZL5A 1XVQA 2NTOA 2O8VB 1AUCA 1GSFA 3D21A 3GYKA 4RQRA 2H76A 3M3MA 2VLVA 5A4UA 5D73A 1TK5B 3C73A 1XOAA 5CNWA 2AJQB 1ZZYA 4FYCA 5ECPB 4BWSA 1FHEA 1SJ6A 3IK9A 5DAKA 2L6DA 2H6YA 1G7EA 4BL7A 3KCMA 1T00A 2WB9A 3M1GA 3BD2A 1A0FA 6GSSA 2LQOA 4MK3A 1GNWA 2C80A 4I8BA 3KZQA 3UARA 4K0GA 4NMUA 2WDUA 3IBHA 2PN8A 3M0FA 1V98A 5ECHB 4TR1A 3TKSC 2N5AA 3MSZA 1W89A 2HSHA 3IC4A 4MJCA 4PQHA 2H01A 4MH2A 1WMJA 4BVYA 2WS2A 4AGSA 3ME8A 2KOKA 3KTBA 5J9CA 2BJXA 1WE0A 1DSBA 3Q19A 3PR8A 2K8SA 3F63A 3F6FA 1GSQA 1BEDA 1PSQA 4G10A 1XZOA 5HR2A 1XWAA 1TK8B 4ZBBA 3IOSA 1T4ZA 3FW2A 1WIKA 2FHEA 4QL9A 4LA1A 2YJ7A 5F07A 3IDVA 2R6KA 1XOBA 1U87A 5D9VA 3U5RE 1G7OA 1TU7A 4EUYA 3FR6A 2TIRA 1K0AA 2N5BA 1ILOA 5CRGA 1F6MC 4O32A 1OKDA 4IN0A 2CAIA 4ZBDA 2O85A 4N0VA 3BOAA 3ERGA 1UC7A 1B4QA 1A2LA 5IMVA 1ST9A 1G6WA 2ZUPA 2C0EA 1TRWA 1R5AA 2VOCA 1SKWB 2YZUA 2VCXA 2B3SA 3MDKA 1MD4A 4X43A 1VF4A 4I97A 1WJKA 1LBKA 3M9JA 1IYHA 2J9HA 1OC9A 5D8IA 1O81A 2FY6A 18GSA 3HJMA 3IR4A 1UN2A 4X1UA 2OACA 1DUGA 4MLYA 2GGTA 2OJLA 2XBIA 3DGQA 2REMA 4JR6A 5ELAA 2LQQA 1E2YA 4QQ7A 4EE0A 1SYXA 4V1Ap 2G0FA 4RUVA 5GSSA 3KGKA 14GSA 4IQ1A 3GFKA 4OFMA 5JWRB 4D73A 2VCQA 2O89A 13GSA 4GSSA 2HZEA 1Z7PA 1A8YA 3EINA 4GF0A 2HE3A 4JEDA 3SBCA 2H0HA 1ACVA 2L5LA 3MAKA 1A8LA 1ZYQB 2OADA 3EU3A 2MYGA 2VL2A 3TGZA 11GSA 3EVIA 4MJBA 4KE3A 2AHEA 2CV4A 4IP1A 2E7PA 2R5GA 4TW5A 1EEJA 2F51A 3FKFA 2MMOA 5H5QA 1FOVA 5ECLB 5DQYA 3IRAA 2K8VA 3L9SA 2AYTA 5ECIB 4KW6A 1YZXA 5KEJA 3M8NA 4K7OA 5ECNB 1JZOA 1XIYA 1WPIA 2B1LA 2LNTA 4ECIA 2HFDA 2VCVA 1V58A 1YKCA 4GWRA 4P3YB 5A5KA 3GH9A 5DALA 1FB0A 2C0FA 4PNFA 2FWEA 3U6VA 4HUAA 4GTUA 2F3MA 4HZ4A 4MCUA 3KMOA 2VCTA 3IV4A 5CRHA 2BMXA 1Q4JA 2V32A 4PUFC 2IN3A 1B48A 2YNXA 2WZ9A 3L9VA 2C8UA 5IMCA 5ECMB 5AN1A 5CYYA 1JLWA 1FG4A 2IIYA 3UMAA 1M9BA 1Y6EA 4CDOA 7GSSA 1T4YA 3TJKA 3W8SA 2XPDA 2FNOA 4O7HA 1QQ2A 3O3TA 2GQLA 4MABA 1XBSA 1Z6NA 3ZMLA 3H8QA 1SD8A 2YN1A 1LU4A 1SENA 5C04A 1K0CA 3HZ8A 2F8FA 1XVWA 4YAVA 2H0IA 3F8UA 5IMZA 2GZYA 1RW1A 4TN8A 4PUAA 2C3NA 1X9SB 1YDKA 2O7KA 2HSYA 1H4OA 1N8JA 5CRWA 1GSSA 3HXSA 1BQ7A 4ECJA 3BCIA 4OO5A 4L0WA 3RHBA 3V1WA 2CZ3A 4IBPA 2B5XA 1EOHA 2LJKA 4PX1A 1TXXA 4ZB8A 2H70A 1VF3A 5B8AA 2B1KA 1M99A 2YWMA 4BPYA 1OC3A 1TTZA 3RHCA 1Z7RA 2VLTA 3C8EA 5GZZB 5HFIA 1U6TA 5CRDA 4IW9A 4DSQA 2R4VA 2R2JA 3CSHA 3HY2A 5IMFA 3MNGA 4J56E 4NAXA 1B9XC 1A0RP 5J5NA 4WXTA 1KTEA 1OVNA 1QXHA 4J57E 1SL2B 4O5RA 4IKHA 4E8HA 4GLTA 4OFNA 1PL1A 3GKNA 2GSQA 2VD0A 3D5JA 4BVXA 1EZKA 3L9UA 4RI6A 4NV5A 2G2QA 2YP6A 5EL8A 5KN3A 3GUSA 3HJOA 3BBYA 6GSYA 4V1Ag 5ID2A 3UVHA 3CTFA 4EDYA 4Q5RA 4K2DA 2IWTA 1GLQA 3FZAA 2VAFA 2YWIA 4XS4A 1GSYA 3TB2A 4CHSA 2K9FA 3A3TA 3KJYA 5J3RA 1GH2A 3A2WA 1DE2A 2KP2A 2V2GA 1Z3EA 5H5SA 4DSSA 2YWOA 1U3AA 4XHMA 2ZNMA 2EIQA 1BJXA 5IPHA 3VWVA 5G1LA 4V2MA 1UVZA 5DJLA 3CMIA 3TKSA 2QGVA 1SYRA 3TKPA 1WWJA 4AJ8A 2B7JA 1XFLA 5FHIA 5G2ZA 2NDOA 3PH9A 1PMTA 1NHYA 4G2EA 4MF5A 3L4NA 3ERWA 2JADA 5B8BA 4WR5A 1HNBA 3LYPA 3NOFA 2LTKA 1MDIA 1XCCA 4MMMA 4ACSA 2ON7A 4K0NA 5IO2A 3RPPA 4ZL8A 3LEFA 3D6IA 1AQWA 4RI7A 4F82A 3FY7A 4MJAA 3GRXA 1TJDA 3GTUA 2C3TA 5ABRA 1M0UA 4DEJA 2JSZA 2OKAA 2NPBA 3ZREA 2CVBA 4NHWA 1K0NA 1OYJA 4XS1A 4GXZA 4ULXA 2YZHA 2GS3A 2BTOT 2CT6A 5FT3A 4EC0A 2RUEA 3ZZXA 5GAPD 3D22A 5C00A 2VM2A 1HYUA 2F9SA 1ON4A 3O6TA 2EIOA 2GQMA 3GIXA 1FO5A 4WBJA 3EE2A 16GSA 3KP8A 2H0GA 5D9XA 3DRNA 3E9JB 3TKSE 2DJ2A 1XWCA 1AQXA 1B8XA 1ZGNA 2M46A 4MH3A 4PGTA 1TKDB 2QC7A 5IIZA 1PN9A 5ECRB 3ZVJD 2VLUA 3ZFBA 1S3CA 1GTBA 2HLSA 5ELGA 1X5CA 3A2VA 3P8WA 4MF6A 4IELA 1NHOA 4MJEA 4OMVA 2L59A 4F0CA 3UBKA 2IFQA 5CP1A 3QFAC 1JZWA 5HR1A 1R4WA 2DJKA 1SL0B 4MZWA 2X99A 3DEXA 3HYPA 3HJPA 4PXOA 4G19A 2LRTA 2HT9A 3WYWA 2F8AA 4F03A 2YOIA 4YH2A 5AGYA 4ML6A 2LUSA 4WETA 5D93A 1YJ6A 4LL4B 1M2AA 5E4WA 2IPAA 4KSOA 2XHFA 1WOUA 3HCZA 1HNAA 1H75A 1AIUA 5COHA 2LSTA 3CSJA 3KM6A 2FUG2 3BCKA 1M2BA 4K7IA 3GMFA 5A4VA 4NWYA 3Q6OA 2YANA 3KTLA 3CYNA 3VWUA 1OE7A 4RQXA 2C0GA 3E3EA 2AB6A 5DDLA 3TRXA 4JBBA 3UBLA 1SJZA 1PRXA 1ZMAA 3APQA 5KN0A 2P5QA 1A2JA 3GKKA 1PKZA 5JCUA 2IMDA 1EGRA 3Q74A 3I43A 1T8EB 2JZRA 2GSRA 4BA7A 3F4TA 3ME7A 5INYA 3EWLA 2X8HA 1YEPA 1JHBA 1N2AA 3IHQA 4L8EA 2JZSA 2RLIA 4KB3A 2DSAA 4HI7A 2PPTA 5FWGA 2KP1A 4OO4A 4ZB9A 1GSEA 1DBYA 4KCEA 2VL3A 2CX4A 1K0DA 1QK8A 3ZIJA 1G6YA 3TKRA 2RM6A 3EMXA 4YAPA 5LNKe 2PGTA 3UVTA 4FIWA 3QD9A 1PD21 3GV1A 1F3AA 3IE3A 1ERWA 3EC3A 3K8NA 12GSA 2DMLA 3I6AA 3FYGA 1KNGA 2VIMA 2C4JA 3QAWA 3HD5A 3EURA 3J7Yb 5L71A 1AQVA 2HYXA 2QKEA 4IS0A 3ISOA 4TR4A 4XCSA 4Z7XA 1T7PB 1CQGA 2V6KA 3GHAA 19GSA 5EVOA 4TXOB 4EL1A 1WRYA 2XC2A 2GT6A 5IQYA 4FO5A 5DBQA 1GTIA 2EC4A 2LRCA 3GSTA 5J9BA 2HI7A 3GURA 1R5PA 2KLXA 4YQMA 1AW9A 2YV7A 4F9ZA 5ECSA 2GDRA 3HVSA 2WULA 5IM9A 3GSSA 1XW6A 3W8JA 2L4CA 2OE1A 1GP1A 2DJ3A 5JCGA 5D9TA 4HOJA 5EY6A 3FK8A 3WD6A 3F0IA 5CREA 4JU5A 1A2MA 1HQOA 2VL9A 5B6MA 1SL1B 1TDIA 2JACA 1RQMA 1NM3A 1AAZA 1F2EA 1ERUA 1PGTA 3UEMA 3H4KA 2IL3A 3QCPA 2M80A 3HHVA 3QR6A 4HJ2A 3TJBA 3KMNA 5G1KA 1SKSB 5F06A 1TU8A 3IXRA 2TRCP 3CXGA 1S3AA 5ENUA 3GKXA 20GSA 1OAZA 1GWCA 1VF1A 3CRTA 3BJ5A 1MD3A 2WCIA 3R2QA 3VWWA 1GTUA 2L57A 4K6XA 2YV9A 2HRNA 4LLRA 4EF0A 4OCEA 2GSSA 2LEGA 3F6DA 1VGLA 1TRSA 3VK9A 1OE8A 1TRVA 2R3XA 2RUFA 2WFCA 1T1VA 3WT1A 4HU7A 3IAM2 2L6CA 3L0HA 2B5YA 1OC9B 5JCWA 2ZCTA 1U3IA 5B7CA 3J7Yk 2H66A 3ERFA 2VL2C 1SU9A 1R7HA 5D96A 3VPQA 1GLPA 2MMNA 1V2AA 2XBQA 3LXTA 22GSA 3FZ9A 3HVVA 1EV4A 1GUMA 2K6VA 2DC5A 5F8BA 3LQ7A 1BYEA 2A2RA 3ED3A 2CQ9A 3HA9A 3UJ1A 4MPGA 3F4SA 3GX8A 3SWLA 3UL3A 1X9WB 5J41A 4XRDA 2I4AA 1B4PA 1M2DA 4HU9A 1BX9A 1BAYA 2HZEB 2I81A 2I9HA 3UIWA 2HRFA 4EO3A 4KUNA 3ZIVA 3DYRA 1HNCA 2O87A 5LCZA 1FW1A 4MPFA 4IP6A 2M72A 4I6XA 2MMZA 2H1AA 2VO4A 2CVKA 3F3RA 5F0GA 1QUWA 1THXA 2LJAA 3F4RA 2WRTA 3EMPA 4NPBA 1J08A 3F9UA 2L4QA 3KEBA 1I9DA 2PWJA 4HJMA 3KXOA 2B6MA 3CRUA 1TK0B 3QFBC 4OWYA 5DALB 3DXBA 3DVXA 3HDCA 2CX3A 3CBUA 2LJRA 1RK4A 3HVXA 3NZNA 1A24A 3GL3A 1YKAA 4ZILA 1PKWA 4ZIJA 4N30A 4FYUA 3P2AA 2N5FA 3QAGA 2B7KA 2PERA 1EOGA 5HFGA 2XPEA 3ZYWA 3HKRA 3TOTA 1FVKA 2FA4A 4XIHA 1M9AA 3HZ4A 2X8CA 2H19A 2V6OA 4WKWA 4AJ7A 3VLNA 1MEKA 1XXUA 2C3QA 1K0MA 2MBSA 3PINA 3N5OA 3LFLA 4GSTA 4WEYA 3TDGA 1ML6A 4IQAA 3TRQA 5KN2A 4BWQA 2X8GA 2CZ2A 1YF1A 2H73A 1F3BA 3VPTA 5D9WA 1QFNA 4EVMA 2PVOC 3EU4A 2H6ZA 4V2NA 2I1UA 4QL7A 2KHPA 3DKSA 4LMWA 4ID0A 1FVJA 4TXVA 1TW9A 2IMFA 3AY8A 1X5EA 3P90A 4LMVA 4GRFA 4K8MA 4IGJA 1MDJA 3ZLPA 4POBA 1URMA 1PQNA 1IYIA 3F3QA 4IJIA 5DCHA 5KN1A 4E8EA 1SK0A 1HD2A 1ERVA 4JE1A 3VWXA 1FAAA 4AF2A 4ZBAA 4Q5FA 1Y25A 4IHUA 4XS6A 4AJ6A 4ISDA 5IMDA 4ZXGA 1YEXA 4ML1A 4HQSA 5JWOB 2FGXA 1SKRB 2AUVA 2ES7A 4TR3A 1ERTA 1Z9HA 2L5OA 2IMIA 4I5QA 1DE1A 1PA3A 2DJ0A 2VM1A 1F37A 4ZL9A 2PBJA 3FR9A 4FYBA 2H1BA 3DMLA 1BG5A 4GSNA 3C71A 4MA9A 4TXOA 5DQSA 3CSIA 3PGTA 1GTAA 10GSA 5IPGA 3RAZA 5DCGA 3D4TA 4KNDA 5ID2B 3TRPA 3G7JA 3QPMA 1ABAA 4CW9A 2LV3A 4IJ3A 3I9V2 3DWVA 3ZFLA 2IJYA 2JZTA 4XS4B 4TR0A 2FWGA 2H74A 4KCAA 3FHKA 5IMAA 1U88A 4DSSB 3VURA 5GAND 3QAVA 3KD0A 4TVEA 4GQFA 1EEMA 2Z9SA 1EP7A 1NW2A 5CO3A 5CAXA 3US3A 4JR4A 17GSA 2E2MA 3C7MA 5DVBA 4H86A 3IK7A 1C72A 2NVLA 4KX4A 9GSSA 4OCFA 4Q5NA 4NV2A 2X64A 3TJJA 2DIZA 2GLRA 3Q18A 1PX7A 4N11A 1J9BA 3H79A 1JFUA 4HDEA 3KP9A 4EDZA 2DLXA 2HXKA 3GH6A 1QGVA 2OBIA 4L5LA 2PUKC 1AXDA 1I5GA 2JU5A 5AIVA 4HEA2 3TJFA 2VD1A 3LSZA 1KEBA 4MZCA 5HR3A 6GSTA 2DIYA 2GZPA 2C1YA 3KIJA 4F0BA 2E2GA 2DMMA 4OFTA 1XWGA 3D4MA 1YY7A 3GTUB 2WJUA 4LL1B 5HFKA 3I69A 2C0DA 1MDKA 1G0TA 4MZBA 1ZYEA 2RIIA 4PQIA 2P31A 4ZB6A 4L5OA 3FEUA 5IOXA 1YQ1A 1OC8A 3G7IA 2I3YA 3LORA 2P5RA 2CAQA 4NHZA 2R37A 1W4VA 2EIRA 5IOWA 3LJRA 3DIEA 1XWKA 5ECOB 5DAKB 3TKQA 1O8XA 2MMAA 1THOA 1SJIA 2YJHA 2GSTA 1Q98A 4K1FA 1T3BA 4L0UA 1X9MB 2LRNA 2V1MA 5ECQB 1A23A 3LWAA 3OR5A 6GSVA 3TUEA 1TI3A 3H1NA 3N9JA 5G5EA 4OD7A 5DJMA 4TR1B 4DVCA 2PU9C 2GZZA 1K0OA 3E0UA 2FA8A 4TRXA 1VRSD 3GX0A 3CTGA 2FLSA 1PL2A 3EYTA 1OKTA 5F05A 4XRAA 5A4WA 2H1DA 1Z5YE 1KBNA 2IFQB 4KAEA 2FD3A 3TOUA 4K9ZA 1K3YA 3C1SA 3FRCA 1V57A 3M9KA 5GSTA 4DSRA 1M7TA 3TJGA 2CA8A 3ZITA 4ZL7A 1SD9A 1USBA 5HQPA 3P7XA 4POLA 5AIXA 4I2UA 2ALBA 2JSYA 1K0BA 2HZFA 3GKMA 3MWHA 3RBTA 3G9BA 2A2SA 2AV4A 6GSUA 5ECKB 3ZMKA 3G7YA 4POKA 4X0XA 1E6BA 1GSDA 4KSMA 2YWNA 3WGDA 5B6NA 2VCZA 1EWXA 1GNEA 3UOMA 3VI7A 2FCHA 1F9MA 1J0FA 1AC1A 4I2TA 3D0ZA 3GNJA 1JLVA 2CVDA 3L78A 3QOUA 4PQ1A 2YCDA 1WP0A 1JZDA 2H30A 2PMTA 4KDUA 1GSUA 1YF0A 4YQVA 1VF2A 2FWFA 3FZ4A 3LGCA 5G31A 4EXJA 4G9HA 1NSWA 1O73A 4ECCA 4KH7A 3ZTLA 2WGRA 2D2ZA 1B9YC 3VI5A 2PVQA 1O8WA 1O85A 4ECBA 1XW5A 1SK1A 4KA0A 4V2LA 3APSA 4TKYA 3A5WA 2VCWA 1ZOFA 2IMKA 4WBRD 4O92A 1EP8A 3A2XA 3FZ5A 1TRUA 3H93A 2QSIA 4HZ2A 1X0RA 2H72A 5LD0A 1MTCA 6GSXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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