3H79A

Crystal structure of trypanosoma cruzi thioredoxin-like hypothetical protein q4dv70
Total Genus 42
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
42
sequence length
115
structure length
115
Chain Sequence
RPSRVVELTDETFDSIVMDPEKDVFVLYYVPWSRHSVAAMRLWDDLSMSQSQKRNHLTFVAARIDGEKYPDVIERMRVSGFPTMRYYTRIDKQEPFEYSGQRYLSLVDSFVFQNT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of Trypanosoma cruzi thioredoxin-like hypothetical protein Q4DV70
rcsb
molecule keywords Thioredoxin-like protein
molecule tags Unknown function
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 42
structure length 115
sequence length 115
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-04-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3h79A00
1XVWA 4BPYA 1SJ6A 2X64A 1DE1A 3GIXA 3H4KA 1SENA 2DJ0A 1YEPA 5AIVA 3EURA 5EVOA 4AGSA 1XBSA 4F82A 2PMTA 5E4WA 2MMNA 3E3EA 3IK9A 3KTBA 5LCZA 3LJRA 5JWOB 1U3IA 4JR6A 3PGTA 1Z6MA 1B8XA 2VLUA 4AJ6A 3FK8A 1VF3A 3F6DA 2PBJA 1EGOA 1VF1A 2VCZA 1XXUA 2CZ2A 5ECMB 3RPPA 4ULXA 5F05A 3F8UA 1YEXA 3CMIA 4PUAA 5KN0A 1BG5A 3HVVA 3WGXA 1R4WA 2B1KA 2ZNMA 3I69A 4LMWA 1TW9A 3OR5A 5C00A 3DYRA 2RLIA 4ZBAA 4XTSA 1T1VA 4G19A 3ERWA 4HJ2A 3TB2A 5ECNB 1QGVA 1HD2A 3QAWA 5F06A 7GSSA 3ME7A 1VF2A 1O85A 3ZMKA 2KUCA 3C73A 3WD6A 1URMA 2GLRA 1BEDA 2AB6A 2AAWA 2C3NA 5AISA 5AN1A 11GSA 1K0NA 2H1BA 2H66A 3ZZXA 1ABAA 2FWEA 4PX1A 1TRSA 3IHQA 4FYUA 1J08A 1AXDA 3ZIJA 2TRXA 2FWHA 3EU4A 3EVIA 9GSSA 3G9BA 1VF4A 2GQKA 4TXVA 1JZDA 1PX7A 2C8UA 1K0OA 1IYHA 2GVPA 4K7IA 4IBPA 2H73A 3G7IA 2LUSA 3VI5A 2H76A 3GURA 2PPTA 2E2MA 4E8EA 5D9WA 3LSZA 5CAXA 2BTOT 1XVQA 4MZBA 4PXOA 1GUMA 2V1MA 3RHBA 2WS2A 5CYYA 2CAIA 4MDCA 2CVKA 3FYGA 1DE2A 5A4WA 1Y6EA 3TGZA 2JSZA 3JCML 2K9FA 3ME8A 2PVQA 1SU9A 2AJQB 4GSTA 1Q98A 3ISOA 1AQXA 4GSSA 5G31A 2LEGA 2C0DA 2PU9C 3IC4A 4ILFA 4GXZA 1ERWA 4F9ZA 2DJKA 5CREA 3PINA 4NXIA 1EOHA 1GSFA 1EEMA 2X99A 3FZ9A 3RAZA 3FRCA 1MEKA 3BJ5A 5DJLA 1OAZA 2P31A 3QFBC 4J2FA 4IJIA 3RBTA 4DSRA 3IOSA 2ON5A 2F8FA 1BYEA 5EL8A 2DJ1A 2QKEA 1YY7A 3QDNA 2H0GA 3IE3A 1XIYA 1S3CA 4NWYA 3F9UA 1DUGA 1HNAA 3UIWA 2XC2A 5J41A 1T8EB 4PQIA 5EY6A 4K7NA 2H30A 3EWLA 4KGIA 4V2NA 2L5OA 2NBSA 3WGDA 4FH8A 5B6MA 1U6TA 3ZYWA 3GRXA 1Z7RA 3ZMLA 4GF0A 3A3TA 1K0BA 1I9DA 1KEBA 1TRVA 1BQ7A 4EVMA 1G0TA 2H74A 2K6VA 3MSZA 4EXJA 2IPAA 3WGEA 2RM6A 4MJEA 1YKCA 5ECOB 2VL9A 1TI1A 2O7KA 2FWGA 3CSHA 5A5KA 5IMDA 4AJ8A 2VCWA 4POBA 2N5AA 1R5PA 4ZB8A 4ZBBA 1V58A 5ECPB 3QAVA 1OC3A 3F4TA 2HE3A 1I5GA 3GX8A 2O85A 3G7JA 3A2WA 3LEFA 4EDZA 3QCPA 2DMLA 2FNOA 4HDEA 4BVXA 2WFCA 2WGRA 2H0HA 1Q4JA 1E6BA 2KLXA 2OADA 1OKTA 3DVWA 1EV4A 4IP1A 1FOVA 1GULA 3DKSA 1ZZYA 1TK5B 1U88A 3P8WA 4Q5FA 10GSA 4TN8A 3TJFA 1O8WA 4IS0A 1T4ZA 5CRWA 4N30A 5HR0A 5ECKB 2CX3A 3DIEA 5HFGA 1UVZA 2OKAA 1N2AA 4I6XA 2V6KA 1U87A 3L9UA 4YAVA 4YH2A 3DWVA 4KNDA 4HU7A 2N5FA 4OCFA 2IMDA 5HFKA 1TU8A 3D5JA 2OE3A 3APQA 3WYWA 4OFMA 3KH7A 3CBUA 2FA8A 5ELAA 4K1FA 1GUHA 4XHMA 4ACSA 1M99A 1YZXA 3L4NA 2O87A 3HXSA 2IWTA 5IO2A 5AIXA 2GS3A 3H8QA 3HVXA 4EKZA 2HRNA 3LQ7A 3FKFA 4CHSA 4QL7A 2VAFA 2LRTA 2IIYA 2VCXA 2FWFA 2OJLA 1R5AA 2ALBA 2E2GA 2LS5A 3VLNA 3CTGA 1XPVA 1O7UA 1WOUA 3GH9A 5IPGA 1H4OA 2CQ9A 1XWKA 2C1YA 4JEDA 3UMAA 3HZ4A 3DEXA 5HR1A 3H1NA 4V1Ap 5ECLB 2YP6A 19GSA 2FCHA 2HNLA 3E0UA 2KHPA 1O6JA 2DMMA 4K6XA 3KH9A 3KIJA 1NM3A 1R26A 1CQHA 2K18A 3GX0A 3GA4A 2A2SA 5JCGA 2K8VA 4FYCA 1G7OA 2OE0A 3GSSA 4CW9A 1A2LA 2AUVA 2ES7A 1HNBA 3VK9A 1V40A 3QD9A 4IW9A 2DLXA 4NV5A 3NZNA 1A8YA 3P2AA 4ZB6A 4ZB9A 4I2TA 3M3MA 5IMAA 3NOFA 3TCOA 3WT2A 1WJKA 4WETA 2PERA 1T00A 2LTKA 1G7EA 1ZCPA 4K9ZA 1S3DA 5A4VA 14GSA 2E7PA 3C1RA 1X9SB 3VPQA 1GTAA 2OE1A 3EC3A 1SL2B 1KTEA 4LA1A 3TKQA 2BMXA 2V32A 4XS1A 5JWRB 5JCWA 2YZHA 1QUWA 1USBA 2IL3A 2C3TA 2A4VA 1XWGA 2L4CA 4DSSA 2CX4A 2QC7A 3Q19A 2GSQA 1GSYA 4OFTA 4ZL8A 4MH3A 2WB9A 2C3QA 2XBIA 4K0GA 4KAEA 4IJ3A 2YCDA 4WR5A 5D9VA 2OBKA 3GH6A 2GZZA 3VI7A 1HQOA 3GN3A 4J57E 4IKHA 4I97A 2YOIA 1ZYQB 2YJHA 4F0BA 2LRCA 2QGVA 2F51A 1Z5YE 1X5DA 4K8MA 2YANA 3I43A 5DALA 2NTOA 3FR9A 1VRSD 4MPFA 4JU5A 2OA7A 3LYPA 2KP2A 1PKWA 2O8VB 2Z9SA 1SD9A 1VGLA 1M2DA 4Q5RA 4RI7A 4L5OA 4DVCA 5FWGA 4HZ4A 1SL1B 1PGTA 2LNTA 5FT3A 5DDLA 3S9FA 1TXXA 4HOJA 1GTUA 13GSA 2JZTA 1AIUA 3GTUA 1PA3A 2XPDA 2VCVA 4AJ7A 3C1SA 2GZPA 3GHAA 3HA9A 5GSSA 2REMA 4MABA 2YPMA 4CDOA 3RDWA 1V98A 2R4VA 4EDYA 4WF5A 5B6NA 1B4PA 1KBNA 1ZL9A 4PNFA 1T3BA 1EP8A 1U3AA 3IAM2 3FZ5A 5L71A 22GSA 3TJKA 4L8EA 3TKSC 2VL3A 1XFLA 2PGTA 4KDXA 3GNJA 1GTBA 2VL2C 2C4JA 5IOXA 1GNEA 1YDKA 2YN1A 1TOFA 2WCIA 5FHIA 5DALB 4PQHA 1EZKA 3DXBA 2MZCA 3LWAA 3ZIVA 3DVXA 1A2JA 5ELGA 3M9JA 1PD21 4LMVA 3RHCA 3RPNA 2GQLA 3W8SA 4PGTA 3C7MA 3P90A 3ZFBA 3GTUB 4EC0A 2R37A 1TK8B 2F9SA 4NHWA 3CSIA 4Z7XA 4EF0A 5KN1A 2L59A 5ECQB 5IIZA 2X8HA 1OE8A 1OKDA 2EIRA 5CO3A 4JZQA 5COHA 1JZWA 1PSQA 4G9HA 5DJMA 2M46A 1WP0A 2G2QA 4E8HA 2HXKA 2XHFA 3QR6A 3EMXA 1F37A 2MYGA 4IELA 2DIZA 3CSJA 2H19A 5HR2A 4MJAA 1TU7A 2C80A 1F9MA 2AV4A 3APSA 4IVFA 5B8AA 3IXRA 2GSRA 2LSTA 1BJXA 3KEBA 3MAKA 3F0IA 4ZILA 3KP8A 4NHZA 3ZITA 1M9AA 5DQYA 1EOGA 1J0FA 2FGXA 4YQUA 3BOAA 1JZRA 6GSVA 4OD7A 4P3YB 5GSTA 2AHEA 1A23A 2K8SA 1EEJA 3D0ZA 4O5RA 2N5BA 12GSA 3IRAA 17GSA 3HYPA 2VO4A 1B48A 1MDIA 2TRCP 3AY8A 1GLQA 4KE3A 4DEJA 3KD0A 2WRTA 4H86A 3Q6OA 1TDIA 3UOMA 1QFNA 5DCHA 2GSTA 4KA0A 2P5QA 2JL4A 3A2XA 4TKYA 20GSA 2GZYA 2H75A 3KXOA 2HSHA 1RW1A 2R5GA 3O76A 4MA9A 1XW5A 2WDUA 3EYTA 6GSWA 4KCEA 2CVBA 4WR4A 2EIOA 1UC7A 4PNGA 1H75A 3ERFA 2I3YA 4AF2A 2V2GA 1SYXA 4EO3A 2B5XA 5CRGA 4L0UA 4LL4B 2V41A 4XS6A 3US3A 3LG6A 4HQSA 4ISDA 5G30A 2HZEA 2VLTA 1GSSA 1ZMAA 1V9WA 3F4RA 5ID2A 4MP4A 2LQQA 3FR6A 4KDUA 2F8AA 1XW9A 3GKKA 5KEJA 2L6DA 2YWIA 2IFQA 1T4YA 2HT9A 3F3RA 5IMZA 1Z3EA 1LBKA 3BBYA 2YWMA 3TJJA 5HQPA 3FW2A 3ZFLA 3M9KA 3TRXA 3TKPA 3CTFA 6GSXA 3VWWA 1BX9A 1GSDA 4MF5A 1Z9HA 3D6IA 1GWCA 2DBCA 4N0ZA 2CA8A 4K2DA 2DJJA 3KP9A 1W4VA 4F0CA 2B1LA 2H1DA 3C8EA 1O73A 3UJ1A 4KSMA 5H5QA 1GUKA 4Q5QA 1AAZA 5DVBA 4ZIJA 1GSUA 2LKUA 1W89A 3V1WA 2JSYA 3VURA 2B5EA 2X8GA 3N9JA 1Z7PA 2HZEB 5HFIA 2YJ7A 2GGTA 4D73A 2JZSA 2MBSA 6GSTA 2I1UA 5ID2B 1FVJA 1S3AA 5B7CA 3IAS2 4F2IA 5JWQB 5C04A 2RM5A 3DGQA 1MDJA 1NW2A 3FEUA 3HHVA 5AGYA 3H79A 3MNGA 2HRFA 1ML6A 5KN2A 4ML1A 2EC4A 4KDYA 3ZRDA 1FB0A 3LXZA 4MCUA 3ZTLA 1OC8A 2MMOA 4MF6A 1SL0B 2VIMA 2IN3A 2DC5A 4KX4A 4V1Ag 5DCGA 4TRXA 4MF7A 3M1GA 2VCTA 1RK4A 5IMVA 3TKRA 3J7Yb 1K0MA 3HD5A 5DQSA 4IHUA 5IQYA 1THOA 4MJCA 5D9XA 1TP9A 1HNCA 4HI7A 4WF4A 5D96A 5F07A 1PL2A 1FHEA 3F4SA 3GYKA 2MMZA 5ECHB 2C0EA 3M8NA 2YV9A 3QPMA 4GWRA 4RUVA 5CP1A 4Q5NA 4PUFC 2F3MA 1TRWA 4KUNA 4JR4A 1XWCA 1NSWA 3ED3A 2X8CA 1NHOA 4HEA2 3TRPA 2H6YA 1ILOA 4V2MA 1TRUA 3UVHA 2XBQA 2B7KA 1C72A 2YNXA 18GSA 4WKWA 3IV4A 4F03A 1MD4A 2H1AA 2PN8A 1OYJA 3J7Yk 4QL9A 4TR1A 4HQZA 3K8NA 3A2VA 1WRYA 1SJIA 1OC9A 2LJRA 5J4UA 2WJUA 2VD0A 1PMTA 1ERVA 3APOA 2LV3A 1FG4A 4TXOA 2H6ZA 5G1LA 2BJXA 2PWJA 3GSTA 1EV9A 2P5RA 3ZLPA 3BCIA 1DBYA 2D2ZA 5HR3A 3N5OA 3TDGA 1MTCA 1JZOA 2I81A 2E0QA 1QMVA 3QFAC 4ECIA 4DSQA 3IA1A 1R7HA 1K0AA 2MBTA 5D8IA 2VLVA 4WBRD 1F2EA 4O7HA 1JLVA 1G6YA 4OO4A 5ECRB 1PQNA 3G7YA 1QK8A 4FIWA 2GQMA 2L6CA 4YQVA 3A5WA 2R2JA 1LU4A 2YZUA 1XWAA 1E2YA 4G10A 3DRNA 1M9BA 5D93A 2VUPA 2JADA 1O81A 1DSBA 1XWBA 2NPBA 4ECBA 3TJGA 2GDRA 2GTUA 3I6AA 1SKWB 4POKA 4TR1B 4MLYA 3QMXA 3F3QA 1OVNA 3LYKA 1YF1A 1M2AA 1OC9B 2B6MA 5CRHA 3SWLA 3UAPA 4TXOB 4X1UA 4BA7A 3QAGA 5ECIB 3HZ8A 5DBQA 5G5FA 5H5SA 3TRQA 3TOTA 1GSEA 4DSSB 2FUG2 1K0DA 5GAND 3VPTA 1EGRA 4IGJA 3GL3A 4HZ2A 3HJPA 4MZCA 5CNWA 16GSA 1AQVA 2MMAA 2O89A 6GSUA 2PUKC 4K7OA 1F3BA 5DAKA 5INYA 4ZL9A 2KOKA 5F8BA 3SBCA 3FHKA 1F3AA 3KMOA 3EMPA 4KCAA 5GZZB 1GL8A 2CT6A 2ZCTA 3KGKA 3HJOA 1A0RP 8GSSA 3BCKA 3CXGA 4ZL7A 5J5NA 1BAYA 2B3SA 1A8LA 3L78A 5IM9A 1PKZA 5J9BA 5A4UA 5ENUA 5IMFA 1XZOA 3ZREA 1GP1A 4N0VA 4I5QA 2DJ3A 4O92A 3IDVA 3VFIA 1NHYA 3CRTA 2HZFA 1ST9A 3UL3A 3LFLA 4NMUA 1EP7A 5G1KA 2CZ3A 3M0FA 2DIYA 1K3LA 3MDKA 3EU3A 4XCSA 2IMIA 2IMEA 3PR8A 4LLRA 3KMNA 3GFKA 1PN9A 3LXTA 1PRXA 2CV4A 2ZUPA 4J56E 1MDKA 3UBLA 3WT1A 5DAKB 2FA4A 2FHEA 1TI3A 1N8JA 2H0IA 4JBBA 3IK7A 2WZ9A 1SK2A 2CVDA 2KP1A 2CAQA 1V57A 3EE2A 3TKSA 1LJRA 1QXHA 1THXA 3D4MA 4OWYA 2VL2A 3E9JB 3VWUA 2L57A 2IMKA 2JU5A 1WIKA 2ON7A 1YF0A 3CRUA 3GKXA 3LORA 3O6TA 2JZRA 3FY7A 1J9BA 5B8BA 3ZVJD 3IBHA 4GSNA 2H8LA 2RUEA 4MH2A 3HJMA 3FZAA 3D22A 1JFUA 4TW5A 4BL7A 5G5EA 4MK3A 2DSAA 4N11A 6GSSA 4HUAA 4V2LA 1K3OA 4WEYA 3DD3A 3U5RE 4MJBA 4X0XA 4G2EA 3GL5A 5H5RA 4HJMA 1X5CA 2M80A 3D21A 4GQFA 3VWXA 4HU9A 1ZOFA 5GAPD 4L5LA 4RQRA 4IQ1A 3W8JA 2QSIA 1TKDB 4TR3A 3Q74A 1XOBA 2HYXA 1KNGA 2IJYA 3D4TA 2LJAA 5IOWA 2R3XA 2OBIA 3U6VA 4JE1A 3TOUA 1SJZA 1K3YA 5E59A 4MMMA 2NDOA 1ON4A 2RIIA 4XRDA 2DJ2A 1GH2A 1XOAA 3R2QA 1RQMA 3UBKA 1X9WB 2FD3A 2J9HA 1TK0B 4POMA 1GNWA 5J3RA 4IQAA 1X0RA 1YQ1A 2PVOC 3FR3A 5IPHA 4HS1A 3L9VA 1GSQA 3LGCA 2B7JA 2P0GA 2YV7A 4XIHA 4NPBA 1T7PB 1X9MB 2VM1A 1HYUA 2VM2A 5D9TA 2YWOA 1YKAA 4OO5A 2AYTA 1O8XA 2GT5A 1UN2A 3I9V2 1A0FA 1AUCA 3DMLA 1JLWA 1JHBA 2J23A 5D73A 3O3TA 2WULA 4LL1B 3TKSE 1CQGA 3L9SA 1A24A 4NV2A 3ZVJA 2HSYA 2IMFA 4MPGA 3F6FA 2GT6A 4N10A 3UARA 3PH9A 4OFNA 2I9HA 2XPEA 1IYIA 4OMVA 4KSOA 1AQWA 1Z6NA 2H70A 3KZQA 4KH7A 3HDCA 1A2MA 1FVKA 3GUSA 4YQMA 4PQ1A 4I2UA 3W6GA 4WBJA 3Q18A 2LNSA 3KM6A 5F0GA 2M72A 4ZBDA 1FB6A 1ZGNA 2RUFA 2A2RA 4GLTA 1PL1A 4MZWA 4YAPA 1SYRA 1WE0A 2LQOA 3NIVA 3QOUA 4XRAA 5IMCA 2TIRA 4X43A 4GCIA 2B5YA 4EL1A 4ID0A 1F6MC 2GSSA 4JRRA 1K0CA 1ZYEA 4K0NA 4FO5A 5IO0A 2L5LA 2IFQB 1SK1A 5G2ZA 3IR4A 2OACA 2H01A 4RQXA 2HLSA 2EIQA 4NAXA 4IP6A 3GKMA 4O32A 1ERTA 1GLPA 1B4QA 4EE0A 2R6KA 5J9CA 4XS4A 1AW9A 3P7XA 1WMJA 4EUYA 1SK0A 1OE7A 1WWJA 2V6OA 3C71A 3HY2A 4ZXGA 1TJDA 1XCCA 1B9XC 1ERUA 1XW6A 1WPIA 2HI7A 4ECJA 5EPFA 3L0HA 5ABRA 3MWHA 4POLA 2C0GA 3F63A 4OCEA 4BWQA 3H93A 3CYNA 5CRDA 4BVYA 4I8BA 2I4AA 1QQ2A 2C0FA 4QQ7A 2HFDA 2VCQA 2LJKA 3UVTA 4D73B 1Y25A 1GRXA 2NVLA 1AC1A 3GMFA 1M7TA 4WXTA 3HKRA 3HCZA 1G6WA 3GV1A 3KCMA 5LNKe 2G0FA 3KTLA 4ECCA 4ML6A 3KJYA 1X5EA 2JACA 2VD1A 3TUEA 2VOCA 4TR4A 2H6XA 2H1GA 3ZL5A 6GSYA 1SD8A 5KN3A 1SKSB 4RI6A 4GTUA 4L0WA 2LRNA 4TVEA 3IPZA 1M2BA 4XS4B 3HVSA 3TJBA 5JCUA 1FAAA 2YWNA 1M0UA 3UEMA 1EWXA 3VWVA 2L4QA 4TOPA 4KB3A 3EINA 1YJ6A 2FLSA 4TR0A 4GQCA 4FYBA 4BWSA 1SKRB 1V2AA 4GRFA 3BD2A 1FO5A 2H72A 4IN0A 2FY6A 3GKNA 1FW1A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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