3H8QA

Crystal structure of glutaredoxin domain of human thioredoxin reductase 3
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
MAREELRRHLVGLIERSRVVIFSKSYCPHSTRVKELFSSLGVECNVLELDQVDDGARVQEVLSEITNQKTVPNIFVNKVHVGGCDQTFQAYQSGLLQKLLQEDLAYDA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Crystal structure of glutaredoxin domain of human thioredoxin reductase 3
rcsb
molecule keywords Thioredoxin reductase 3
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
total genus 36
structure length 108
sequence length 108
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.8.1.9: Thioredoxin-disulfide reductase.
pdb deposition date 2009-04-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3h8qA00
1A0RP 2GZYA 3H79A 2HXKA 1PRXA 4MH3A 1BAYA 3ERGA 2FWHA 4ZXGA 3ME7A 3CRUA 4IS0A 4EL1A 2IFQB 1KNGA 3RHBA 3WYWA 1F6MC 1K0BA 1H75A 2GSRA 2O8VB 2YWNA 1EGOA 1TRSA 2RUFA 4NHWA 3KM6A 2HRFA 3EMPA 8GSSA 2JACA 4GRFA 3HVVA 1PKWA 3MSZA 3ED3A 3F6FA 4JU5A 3MWHA 1G7OA 5DCGA 6GSUA 1DE1A 3KMOA 3KJYA 1UA5A 4ZB8A 2PUKC 3FEUA 3KD0A 1OC9A 1ERVA 4KSMA 1JZDA 1AXDA 2VLVA 5G5FA 2E0QA 1WIKA 2VLTA 2GQMA 1AIUA 2AYTA 3HZ8A 1USBA 3DIEA 1GTIA 4N10A 4PQIA 2TRXA 4TR3A 2QGVA 5ECOB 3CBUA 2KUCA 5ECPB 5AN1A 2HZEB 5G1LA 4TKYA 1XVWA 1SL0B 1FB6A 5CREA 5CRDA 2VLUA 2E2GA 3UVHA 1V2AA 1RQMA 2A2RA 1S3CA 4EF0A 2I4AA 4JZQA 4K7IA 4KA0A 2IWTA 5GAND 3FK8A 1KEBA 1WPIA 4GXZA 6GSXA 2WJUA 1O73A 4IGJA 1OE7A 4DSQA 4ECBA 4MZCA 5D73A 2ALBA 2MYGA 4XCSA 1GUKA 4ZL7A 1FB0A 3WGXA 4AF2A 2YCDA 4ZBBA 4MJEA 3CSJA 5J41A 1YY7A 9GSSA 2PWJA 1QGVA 2WZ9A 3L4NA 2OA7A 1ZYQB 3KTBA 1T3BA 2VL3A 3FZ4A 2PGTA 4Z7XA 5B7CA 1GSUA 4ECCA 3O6TA 2LQOA 3HD5A 2OBIA 4GQCA 4MJCA 2VD1A 3ERWA 1U3AA 2FD3A 3RBTA 4KDYA 4QL7A 2H6YA 4KH7A 1X9SB 3C8EA 4TR0A 1SK0A 5ID2B 5EVOA 5GZZB 2C0GA 2C0DA 4J57E 2CX4A 4E8EA 1YKAA 3GX8A 4GTUA 3LWAA 4GF0A 3GIXA 1G6YA 2X64A 4IHUA 3IAM2 3IE3A 2YP6A 3VI5A 1V9WA 3FR3A 4JEDA 4MLYA 3DD3A 1WE0A 2VAFA 1AQWA 4EKZA 3F0IA 1G7EA 2JZSA 5JCUA 1OYJA 1TK5B 3F4TA 4X43A 1MD3A 1MDJA 1GTBA 1YJ6A 1IYHA 2H70A 4JR6A 5IOXA 2N5AA 2CVBA 1GSYA 4LA1A 5DALB 3TCOA 2E7PA 1FG4A 5JWQB 4WBRD 1EEJA 2RIIA 4AGSA 4MCUA 2IMIA 1J0FA 1GSFA 2C4JA 2LUSA 5KN2A 4D73A 4HEA2 2TRCP 2CX3A 3EMXA 3C1SA 4V2LA 2FY6A 1AC1A 4EXJA 4KCAA 3P2AA 1NSWA 3I69A 4PUFC 4HJMA 5DDLA 1M99A 5IMDA 4OFMA 2LRCA 2O7KA 2RLIA 1NW2A 4IVFA 5DAKA 2CZ2A 2H0GA 4WEYA 2CT6A 3VI7A 2N5BA 3GYKA 3KH9A 1R26A 2IMDA 3CSIA 4CDOA 2ES7A 1FVJA 2GDRA 3TB2A 2B6MA 1X5EA 1VGLA 3TDGA 1VF2A 4MP4A 2C8UA 1DE2A 3I9V2 2MBSA 4YAPA 1ERTA 1RK4A 5IO0A 5IOWA 2BTOT 2IMFA 1OC9B 3RAZA 2F9SA 1HYUA 1K0MA 1M7TA 1OC3A 1I9DA 1XWCA 5ECMB 5HFIA 4F9ZA 5D9WA 3F6DA 3ZIJA 3MNGA 1OKTA 1PX7A 3VK9A 2R6KA 4HU9A 4IELA 4KE3A 2V32A 2OJLA 1XWAA 4AJ7A 4MDCA 4AJ6A 1QXHA 4NWYA 1N2AA 5CRGA 3IK7A 3F3RA 4YQUA 3UOMA 5IMVA 3S9FA 2H71A 5AIXA 5F05A 1XW5A 2DJKA 5CYYA 2DJ3A 2VCXA 3R2QA 3Q18A 2XBIA 3GL3A 3TJBA 1G0TA 2X8GA 1U6TA 3DEXA 1XWGA 1XWKA 3C73A 1PA3A 3FKFA 1XWBA 4IQ1A 4YAVA 2NVLA 5HR1A 4XRDA 2JU5A 4IJIA 1WP0A 5J4UA 1I5GA 5D9VA 1YF1A 1SD9A 4HDEA 1OE8A 1TU7A 3D22A 2H8LA 4ILFA 2C1YA 3UAPA 5IQYA 1A0FA 1EWXA 4LLRA 3IRAA 3M9KA 2K8VA 2Z9SA 3ISOA 3DXBA 3GMFA 19GSA 1K0CA 4ML6A 4IKHA 1Z7PA 4MABA 2H75A 1SJZA 1A8LA 4FYUA 2L4QA 4KSOA 3VWXA 2WDUA 2DBCA 5CRWA 2WB9A 4KUNA 2CA8A 2R37A 4MA9A 1Z9HA 5E4WA 1M9AA 2IMEA 4ZB6A 3VLNA 3GSSA 4FYCA 3OR5A 3UIWA 2GTUA 2PN8A 2BJXA 5LD0A 5ECHB 5ECNB 2IMKA 2B5EA 14GSA 1GSSA 4NAXA 3I6AA 4IQAA 3J7Yk 2FCHA 3LEFA 1MD4A 3WGDA 3IR4A 1EOGA 4IP6A 4QQ7A 1SD8A 3ZVJD 1M2BA 3D5JA 2PPTA 2VO4A 1Z6NA 3LFLA 2I9HA 2FGXA 2LTKA 2H6XA 1N8JA 2VIMA 2H0IA 1SK2A 3ZYWA 4LMWA 2TIRA 1X5CA 1PMTA 3IDVA 3NIVA 16GSA 2H1AA 4ZBAA 5ECQB 4D73B 1NHOA 4MPFA 4TVEA 5D96A 3ZMKA 2RM5A 1A23A 2GQKA 4ULXA 5IPHA 4NMUA 1WWJA 2CVKA 4K0GA 3F8UA 5FT3A 4KNDA 5F8BA 1GUMA 2KP2A 2REMA 2DC5A 5CNWA 2L6DA 4KAEA 4KW6A 3APOA 5H5QA 5DAKB 2PBJA 4PGTA 3VPQA 2DMMA 2HI7A 2IN3A 4EDYA 4V1Ag 3WD6A 2LRNA 5EY6A 1DUGA 1T4ZA 1LBKA 2GZPA 4E8HA 3LG6A 1B9XC 4ZIJA 3BD2A 5IMZA 1PL1A 1XFLA 3APSA 3W6GA 3FR9A 2FLSA 4EVMA 2GT6A 3H8QA 4EO3A 1TI3A 4POKA 1YQ1A 4K7NA 3F9UA 4L5OA 4QL9A 1X0RA 3EYTA 1R7HA 1RW1A 3IOSA 5J3RA 2E2MA 3FYGA 1Y25A 2V2GA 3HCZA 2VOCA 1TI1A 1GLQA 5AISA 3EVIA 3UBKA 2XC2A 1O7UA 4F03A 4XTSA 2CAIA 2JL4A 1W89A 3M3MA 5D9XA 1SL2B 2F51A 5ELAA 2FHEA 3UARA 1SK1A 2K9FA 4FO5A 2HNLA 3TRXA 1XZOA 2YWIA 3TJJA 1M9BA 1FHEA 2H30A 1ZCPA 5FWGA 1VF4A 4JRRA 3TKPA 4I97A 4BA7A 1FVKA 5HFGA 3A2XA 2P0GA 2QC7A 5HQPA 5ECRB 3FZAA 3IA1A 1TP9A 4NXIA 2KLXA 2HT9A 1VRSD 3NZNA 3N9JA 3ME8A 4KDXA 4L0WA 1SYRA 4GCIA 2N5FA 3IV4A 4LMVA 4MJAA 4RI7A 3GN3A 2B7KA 3D0ZA 4RUVA 2JZRA 1E2YA 2LEGA 1XOBA 3L9SA 4IJ3A 2C0EA 3P8WA 2B7JA 3EINA 1ERUA 4L5LA 4LL1B 4BL7A 3HKRA 1GSEA 2L4CA 3UJ1A 3WT2A 3SWLA 3ZIVA 2OE1A 3I43A 2F8FA 4ECIA 2IIYA 2OACA 3EURA 1F3BA 5ECSA 1XVQA 2I1UA 5AGYA 5J9BA 2KHPA 1ZOFA 4XRAA 2LNTA 4Q5RA 1SJIA 3G7JA 3LJRA 3US3A 1THXA 2DLXA 1OKDA 2M46A 1A2MA 1VF1A 2YZUA 4PUAA 4Q5FA 3L9VA 4POBA 3LSZA 4ID0A 5DJMA 2LSTA 5L71A 1EGRA 1JFUA 2H1DA 1O81A 2WULA 1MTCA 17GSA 2DIYA 2V1MA 2L59A 1Z5YE 3CMIA 4LL4B 3P90A 4TXOA 3O3TA 2PMTA 2GS3A 4GWRA 3DMLA 4I5QA 4O5RA 2ZCTA 1YKCA 1YDKA 5IMFA 1B4QA 1AUCA 3CTGA 2OE0A 4H86A 1C72A 1GNWA 4MZBA 3GFKA 2WS2A 3KEBA 4G10A 3HA9A 4IBPA 5IO2A 1TJDA 2MZCA 5AIVA 4NV5A 1TK8B 4OWYA 4F2IA 1THOA 4L8EA 1XW6A 3IXRA 4TRXA 5H5SA 2HLSA 3GKNA 2D2ZA 3F63A 2JSZA 1SL1B 3D4TA 3VFIA 3TRPA 4F0CA 1X9MB 2CVDA 2BMXA 2KP1A 1R4WA 2FWEA 3TOTA 2GSQA 5ECLB 2GLRA 5DVBA 1WOUA 22GSA 3BOAA 5A4UA 2DSAA 1TTZA 1OAZA 4X0XA 3HVXA 2NTOA 1PX6A 3GSTA 1Z6MA 3QAVA 2H66A 1TRVA 1F9MA 1YEPA 1A8YA 5ELGA 1ZMAA 4MPGA 3QFBC 3U6VA 5KN0A 4RQRA 4ZBDA 20GSA 3M0FA 1B8XA 3L9UA 2OBKA 1PN9A 2H1GA 2WRTA 2GSTA 4WR5A 4FIWA 3ZLPA 1QK8A 4HQSA 3FW2A 4HI7A 3TKQA 5KEJA 5DCHA 1TRUA 2LV3A 4CW9A 5J5NA 3J7Yb 2HFDA 3IPZA 4POLA 4DVCA 3E3EA 4O32A 4V2MA 2DIZA 1AAZA 4OO5A 1JZRA 2K6VA 2B1LA 2H73A 5B8BA 1GULA 2AJQB 3KP9A 4OCEA 11GSA 1FO5A 3A2WA 3G7IA 3G9BA 5CO3A 3E9JB 1X9WB 3GKKA 4HZ4A 3TKSC 2OKAA 2NPBA 1G6WA 1LJRA 6GSTA 3GRXA 2PVOC 3VWVA 1PQNA 2JZTA 3GH6A 3ZREA 1UC7A 6GSWA 3GUSA 2H19A 2B1KA 2H01A 2F8AA 2AUVA 3GURA 2YJHA 7GSSA 4PNFA 3GV1A 1K3LA 3F4SA 3HYPA 4NHZA 4K2DA 4XIHA 4XS4A 4BWQA 1NM3A 1ZZYA 1MDIA 1O85A 2JADA 1J9BA 3VWWA 3HVSA 4MF5A 4TXVA 2FA4A 2QSIA 2CZ3A 3GKXA 1EP7A 5J9CA 2M80A 1SENA 2GGTA 3PINA 2X99A 5A4VA 3HDCA 3IK9A 2IL3A 2VCZA 2AHEA 5GAPD 3QR6A 1EOHA 2QKEA 3VWUA 4G19A 1AW9A 2V41A 2DJ1A 2EIOA 1EZKA 2VUPA 3KZQA 1JHBA 2HRNA 4MZWA 5IMCA 1Z3EA 3DYRA 4OFTA 2H74A 5A4WA 5KN1A 5D9TA 4YQVA 4TXOB 5G31A 1XCCA 2YN1A 2R5GA 4DEJA 3DRNA 2RUEA 3TRQA 4GSNA 2VL2A 2HE3A 2EIQA 3A5WA 4MK3A 2MMAA 4RQXA 2JSYA 1BG5A 1UVZA 4EC0A 5E59A 2YPMA 3KMNA 3LYPA 1V40A 4K0NA 4FYBA 5CAXA 1JLWA 3CSHA 2FNOA 2XPDA 1GTUA 3ZTLA 3SBCA 1K3YA 2GQLA 1WMJA 3E0UA 2GZZA 5IPGA 5ABRA 4ZL8A 4I2TA 2WGRA 4HJ2A 4KCEA 4WF4A 4X1UA 4BWSA 3H1NA 4N0VA 1UN2A 3LXZA 1FW1A 3QDNA 1KBNA 2YOIA 4F82A 4JBBA 4TR4A 4ISDA 2B5XA 1WRYA 3A2VA 2YV7A 3O76A 2GSSA 2KOKA 1BYEA 5ECKB 1QUWA 4ZL9A 2MMOA 3ZVJA 3W8SA 5D93A 1U88A 3ZITA 5JCWA 10GSA 2PERA 4CHSA 3CRTA 4WETA 5COHA 1YEXA 4MF6A 3P7XA 2LS5A 3CTFA 3NOFA 1XBSA 3FZ5A 1B4PA 3H93A 1XXUA 2AB6A 4BVYA 1CQGA 3QAGA 2G2QA 1B48A 1BX9A 1ILOA 2VCTA 2MBTA 1ML6A 3GX0A 2NBSA 4MH2A 3GTUA 3ZZXA 5IM9A 1F37A 1YZXA 2MMZA 1BEDA 4AJ8A 2ZNMA 4YQMA 2H6ZA 5LNKe 5EL8A 2ZUPA 1M2AA 3DVXA 1AQXA 3W8JA 3KXOA 1NHYA 3QPMA 2J9HA 5HR2A 3HJMA 1GNEA 2B3SA 3LQ7A 3D21A 2LRTA 1HQOA 1SKWB 2YZHA 2LNSA 1JZWA 3ZFBA 3AY8A 1EV4A 1XW9A 4K6XA 4DSRA 2VM2A 3C7MA 3BBYA 2HZFA 3HXSA 1K0AA 4KB3A 4EDZA 3HZ4A 4YH2A 5G5EA 4HQZA 2FWGA 4IN0A 3EE2A 3BCKA 2L5LA 3IC4A 4PQ1A 1TOFA 2R3XA 3H4KA 1TRWA 1HNAA 1R5AA 4XS4B 1HNBA 1ACVA 4F0BA 1ST9A 1U87A 4N30A 1SJ6A 2H0HA 3F3QA 3BCIA 3G7YA 4TN8A 1ZYEA 2AV4A 2XBQA 4J2FA 3TKSE 3F4RA 2ON5A 4N0ZA 5C00A 1EP8A 1A2JA 1EEMA 3GHAA 4PXOA 4XHMA 3K8NA 1K0OA 2FA8A 4PNGA 4ZILA 2X8CA 2YV9A 2B5YA 4ACSA 3ERFA 5A5KA 2R4VA 1U3IA 2YNXA 4HZ2A 1TK0B 2VCWA 1JLVA 4K9ZA 2XHFA 1O6JA 2P5RA 1QMVA 4DSSA 2IJYA 3EU3A 1M2DA 4WR4A 2P31A 3ZL5A 4G2EA 2C3QA 1MEKA 1A2LA 1K3OA 1OC8A 5KN3A 2CQ9A 5C04A 1PD21 2EC4A 3D4MA 3KGKA 4L0UA 1MDKA 1S3AA 3MDKA 4Q5QA 1SU9A 1KTEA 5ENUA 1O8WA 3RPPA 4BVXA 4XS1A 2CAQA 4NPBA 1OVNA 4O7HA 5DBQA 2G0FA 5HFKA 3PGTA 3Q74A 1GH2A 3D6IA 3QOUA 2HSYA 3IAS2 3UBLA 6GSVA 2H76A 3MAKA 3TJGA 5INYA 3HJOA 1T1VA 2VCQA 5JWOB 4JE1A 3HJPA 3WT1A 3TKRA 3VPTA 1JZOA 3UL3A 2I3YA 4OCFA 4K8MA 2MMNA 5B6NA 3V1WA 2V6KA 1WJKA 4XS6A 5HR0A 2M72A 4HUAA 2ON7A 1PKZA 2A4VA 1M0UA 4G9HA 1W4VA 2I81A 4V2NA 1Z7RA 5DQSA 1SKSB 4PURA 2C3TA 4GLTA 3UMAA 3QMXA 3GKMA 1GSDA 3KH7A 3UEMA 4BPYA 12GSA 1Y6EA 1FOVA 2LJKA 5IIZA 2DJ2A 2C80A 3GNJA 4WKWA 1GSQA 3DWVA 3EWLA 3GA4A 2LJAA 5DJLA 2YANA 1BQ7A 1A24A 3LXTA 4I8BA 3QFAC 2F3MA 5HR3A 1V98A 2DMLA 3TUEA 1PSQA 2NDOA 5G30A 3GTUB 1FAAA 1ABAA 1QFNA 1GTAA 4TR1A 5FHIA 5EPFA 3PR8A 5JCGA 1V58A 4HOJA 3LGCA 5LCZA 3M8NA 3KTLA 1H4OA 1XIYA 2LQQA 2PU9C 3L78A 4TOPA 6GSSA 4OMVA 5DQYA 3LYKA 4WXTA 1HNCA 3RHCA 5F0GA 2YJ7A 5F06A 1F2EA 1YF0A 2VL9A 1ON4A 2AAWA 4NV2A 2PVQA 3JCML 2H1BA 4GSTA 3DVWA 5CP1A 1URMA 4MMMA 3EU4A 3TJKA 4Q5NA 4WBJA 3A3TA 5ECIB 1BJXA 2VM1A 3DGQA 4OO4A 3FHKA 1ZL9A 3ZRDA 1PGTA 2VL2C 3U5RE 4MJBA 5H5RA 3ZMLA 2IFQA 4V1Ap 1PL2A 1J08A 1T4YA 4OFNA 2FUG2 1CQHA 13GSA 4ML1A 4KDUA 1GP1A 1GUHA 1T00A 3TJFA 1AQVA 1LU4A 1X5DA 4O92A 4HS1A 3Q19A 3QD9A 1QQ2A 2R2JA 3HHVA 2DJJA 1O8XA 4IP1A 4ECJA 3M9JA 1Q4JA 3FRCA 4DSSB 1DSBA 2OE3A 3M1GA 4IW9A 4GSSA 3FR6A 3C71A 2DJ0A 5B8AA 2A2SA 3C1RA 3GL5A 5F07A 3QAWA 5JWRB 1K0NA 2YWMA 1SKRB 1TW9A 4TW5A 4JR4A 1SYXA 3WGEA 2FWFA 5IMAA 1GRXA 3IHQA 3EC3A 2HZEA 1GLPA 3KP8A 4KX4A 3KIJA 3N5OA 1GL8A 1TXXA 5G2ZA 6GSYA 1K0DA 2XPEA 1ERWA 3FZ9A 3HY2A 2YWOA 3TOUA 3VURA 2EIRA 2HSHA 3L0HA 3GH9A 1B9YC 2OADA 4J56E 1DBYA 2H72A 1IYIA 5GSTA 4EUYA 2V6OA 3QCPA 1TKDB 3BJ5A 18GSA 2HYXA 4K7OA 2VCVA 2GT5A 2O85A 3UVTA 5CRHA 3Q6OA 1T8EB 2J23A 3DKSA 4PX1A 1VF3A 3FY7A 4FH8A 4I2UA 2K8SA 3IBHA 4GQFA 2O89A 5D8IA 4N11A 2L5OA 3APQA 3RPNA 2L57A 2LKUA 1HD2A 3TKSA 1T7PB 2RM6A 4EE0A 5ID2A 4HU7A 5G1KA 3LORA 1R5PA 1GWCA 2C3NA 2C0FA 4I6XA 2GVPA 3PH9A 3CYNA 2WCIA 4POMA 4KGIA 1TDIA 2K18A 3CXGA 4TR1B 1F3AA 2LJRA 1XPVA 1S3DA 4OD7A 4MF7A 5B6MA 4K1FA 1TU8A 4RI6A 1XOAA 2WFCA 1ZGNA 4P3YB 4PQHA 5GSSA 2X8HA 3ZFLA 1V57A 2L6CA 3TGZA 2VD0A 5DALA 1E6BA 2P5QA 3RDWA 2CV4A 4ZB9A 1Q98A 1EV9A 4WF5A 2IPAA 3KCMA 2O87A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite