3HA9A

The 1.7a crystal structure of a thioredoxin-like protein from aeropyrum pernix
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
161
structure length
161
Chain Sequence
NAPRAAGHSEEVLEREASFSLTTIDGEVISLNNVGGDVVILWFMAAWCPSCVYMADLLDRLTEKYREISVIAIDFWTAEALKALGLNKPGYPPPDTPEMFRKFIANYGDPSWIMVMDDGSLVEKFNVRSIDYIVIMDKSSNVLYAGTTPSLGELESVIKSV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Aeropyrum pernix
publication title The 1.7A Crystal Structure of a Thioredoxin-like Protein from Aeropyrum pernix
rcsb
molecule keywords uncharacterized Thioredoxin-like protein
total genus 51
structure length 161
sequence length 161
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-05-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3ha9A00
1F6MC 3QFAC 3I69A 4KUNA 1N2AA 2IFQB 1WJKA 1GL8A 2A2RA 4DSQA 1ZYEA 3KMOA 4ECJA 5G2ZA 4FH8A 2BJXA 2E2MA 4V2MA 3GA4A 2ON7A 4MZBA 1TKDB 3A2VA 2RM5A 4BVXA 5B6NA 4GQFA 4MABA 4PQIA 4O7HA 5IO2A 4K0NA 3RBTA 4WETA 3LXTA 1AW9A 1C72A 4RQRA 2OBIA 4RQXA 1GSFA 4IQ1A 6GSTA 1XVWA 5HR3A 4DVCA 2VCTA 2B1LA 2RUFA 4LMWA 4J56E 5F8BA 2ZCTA 4TXVA 4KDUA 3M9KA 2H19A 2XHFA 1ML6A 3IA1A 3LSZA 2YV9A 3EMPA 1OYJA 3Q18A 4Q5NA 4OFNA 5D96A 1SKSB 3HVVA 3D4MA 1XW5A 1GH2A 5D8IA 4E8HA 2GDRA 2V6KA 4NWYA 2M72A 2LTKA 3F9UA 4Q5RA 7GSSA 5GAND 3MSZA 1O81A 5D9WA 4KDYA 3EURA 2CZ3A 1M2AA 1ERUA 1X9SB 4HS1A 3KTLA 4IVFA 4GRFA 1XZOA 2HYXA 11GSA 5D9TA 5AIXA 5ECNB 3TDGA 1EGRA 2RM6A 3NIVA 5LD0A 3MAKA 3P90A 3TCOA 2VCXA 3F0IA 1QGVA 4DSSA 2YPMA 2H6ZA 5CO3A 5DCHA 1NSWA 2JL4A 5C00A 1X5EA 5AISA 2LRCA 4V2NA 1JFUA 4OFTA 1R7HA 1VF2A 2OKAA 1GSEA 2LJRA 3F6DA 4G10A 2DMMA 2PVOC 1EV4A 2V1MA 2DIZA 5IOXA 4JRRA 3QFBC 2VUPA 1OE7A 2VOCA 3CSJA 3D4TA 4LLRA 2OE3A 3I6AA 1Z5YE 2DJ2A 2HZEA 2YV7A 4ZL7A 1BX9A 1XPVA 3UOMA 3ZVJD 2EIQA 2H74A 2H8LA 2GZYA 1FW1A 3VWUA 5ECLB 1SYRA 2ALBA 3F4SA 1SL2B 3HJOA 1EGOA 1XWBA 2FUG2 5HQPA 2C3NA 1TU8A 3GKNA 1PX7A 1M7TA 5CRHA 2P5QA 4ZIJA 3GIXA 4XCSA 3FW2A 4HQZA 2DC5A 1A2JA 2GS3A 4WBJA 3APOA 2HRNA 1K3YA 3TB2A 2DJKA 2FWHA 3M9JA 1FVJA 4PX1A 1EP7A 5DALB 1TJDA 3QOUA 1M9BA 3C1SA 4MDCA 4HJMA 3HCZA 1A8YA 3ME8A 4V2LA 2GQKA 4HZ2A 1XWKA 2ON5A 1F9MA 3HDCA 4K7IA 2H73A 1Z7PA 3WGXA 2VCVA 1FAAA 1U87A 3D21A 3GHAA 4LA1A 2N5AA 2B1KA 4XS4B 2X8GA 2PUKC 2TRXA 4IQAA 2AHEA 3N9JA 5CRDA 4WXTA 3LORA 3TUEA 3HVSA 2B7JA 3APQA 1M0UA 2L6DA 4I97A 5KN3A 5JWRB 1V2AA 4MPGA 3BJ5A 1B4QA 3KTBA 3SBCA 1YEXA 5ECSA 2K8SA 1NHOA 2GQLA 4X43A 1CQHA 2ZUPA 1TRSA 1GSSA 2K8VA 2DJ0A 5KN1A 2LQQA 3J7Yk 1SL1B 3M3MA 1MEKA 2HE3A 4O5RA 2F8FA 1LU4A 3TRQA 3DVWA 2TIRA 3VI7A 3GKMA 3DYRA 3W6GA 1YEPA 1YKCA 1R26A 3RHBA 3GN3A 4L0WA 4N11A 3A2WA 6GSSA 3FEUA 4TVEA 2MMNA 3EU3A 2AJQB 3GMFA 1GUMA 4YAPA 2NDOA 2QSIA 1GTBA 5IMVA 4F0BA 1YQ1A 3ZRDA 4WBRD 1PQNA 4HJ2A 2XBQA 1EZKA 3WT2A 5COHA 2VIMA 4CW9A 4KCAA 1RK4A 1ABAA 4PNGA 4AF2A 2QGVA 4MPFA 5EL8A 4MH3A 4BA7A 2I4AA 1QK8A 2A4VA 3JCML 4KA0A 5AN1A 2H72A 3QCPA 4QL9A 3UAPA 1THOA 2LNSA 2QKEA 4YQMA 5FT3A 4ID0A 2OE1A 4HZ4A 4POKA 3IK7A 2N5BA 1DBYA 2VD0A 2HT9A 3QDNA 4AJ8A 2PPTA 1FO5A 1AAZA 2WJUA 2IMDA 3IDVA 18GSA 1M2DA 3KP9A 4NMUA 1KEBA 3FR6A 2L5LA 2VM2A 2FY6A 3RPPA 3R2QA 1XCCA 4D73B 1AC1A 1OAZA 4FIWA 2K6VA 4LL4B 3RHCA 4BWSA 3KH7A 4POBA 1YF1A 2IJYA 3TOTA 2C3QA 1U3AA 2VLUA 3QPMA 2CAQA 2MMAA 1V9WA 5ELAA 3VWWA 3P2AA 1AQVA 3TJGA 1U3IA 4J57E 4HU9A 1GLPA 2A2SA 1WOUA 2YWMA 4EKZA 1HNBA 1AIUA 1GLQA 5HR1A 3RDWA 3RPNA 2WFCA 2I81A 5HFIA 2DBCA 3F4TA 2IL3A 1O7UA 3G9BA 2MMZA 1F3AA 2AB6A 5IPGA 5HR2A 4EF0A 1SJIA 5J9CA 3ZREA 1USBA 2M46A 1B4PA 2OADA 2E7PA 1HNAA 5F07A 4WF4A 1GSYA 3O6TA 1G7EA 2VM1A 2LS5A 3E0UA 2FWGA 4IS0A 1ZYQB 2VD1A 3IPZA 1DSBA 1XWAA 1HD2A 5DBQA 4RUVA 1SK2A 2OACA 3HHVA 2WS2A 3IK9A 2JACA 4EDZA 2OA7A 5ECHB 2C0GA 3DGQA 4KGIA 4I2TA 1SYXA 2FHEA 1MTCA 4OCEA 3FR3A 2RLIA 2H6YA 4ZB6A 1XOAA 2L5OA 4KSOA 1EWXA 6GSVA 4ZB9A 1AXDA 2C0EA 4MJAA 4MCUA 1SL0B 4TR4A 2CVDA 3FZ5A 4GCIA 3L9VA 1PRXA 4PGTA 3UBKA 2DSAA 3CSHA 2YOIA 1TDIA 3KM6A 1GRXA 1A0RP 1ZOFA 3P8WA 4CDOA 3UEMA 1T4ZA 4MLYA 4RI7A 2DJ1A 1VGLA 1MD3A 4I6XA 4EVMA 2H1BA 3LWAA 4P3YB 2BTOT 1HQOA 3GH9A 5HR0A 1PN9A 3PGTA 4MH2A 3KGKA 1HYUA 4HQSA 3H93A 2PVQA 3WGDA 4NHZA 2P0GA 4Z7XA 1A8LA 4EXJA 1PD21 5KEJA 4KDXA 2NTOA 1Y6EA 2GT6A 4G19A 4N30A 5J4UA 1LBKA 1BEDA 5H5RA 2HZEB 3G7IA 4FYUA 1K0NA 1X9WB 4KX4A 5ID2B 3IAS2 4L8EA 1YKAA 1T3BA 2GZPA 1DE1A 5ECMB 1T7PB 4IELA 4K7NA 1DUGA 4HOJA 3ZL5A 4EE0A 3ZTLA 2C3TA 1ERTA 2LSTA 2B5XA 5A4WA 1Q98A 4ML6A 2LQOA 1JZWA 5DVBA 3KXOA 1BJXA 1PA3A 4N10A 4MA9A 2DMLA 3IOSA 1W89A 1O8XA 2K18A 4EC0A 2AYTA 2WCIA 5IO0A 1CQGA 2LV3A 3DXBA 2FLSA 3M1GA 4ECBA 3TKRA 3LFLA 1X0RA 4BVYA 2MMOA 1ST9A 1OC8A 3F3QA 1AUCA 4I2UA 2F8AA 4NPBA 4HDEA 3MWHA 1LJRA 1O8WA 2JSYA 4O92A 3GKKA 1M2BA 1S3CA 4KE3A 2OJLA 1B48A 3L0HA 3DVXA 3OR5A 2PN8A 4MF6A 3TKSC 1F2EA 2WDUA 5KN0A 1SKRB 2C8UA 1XIYA 2R4VA 1GTUA 5D73A 3I9V2 22GSA 1TXXA 4WR4A 4PUAA 3UIWA 4JE1A 3UL3A 1WRYA 2H30A 2YWNA 4XRAA 1RQMA 4KAEA 3PR8A 2RIIA 1JLVA 1QMVA 2O87A 5ABRA 3CBUA 5IOWA 4TR0A 3C71A 3RAZA 1XW6A 1K3OA 3GX0A 1PL1A 2NVLA 1K0DA 3HY2A 2MBSA 1GSQA 1G6YA 3VPQA 3F4RA 2IMFA 1J9BA 1WPIA 2IN3A 4KCEA 2GSSA 5LNKe 1XOBA 2P5RA 2HRFA 1ERWA 1FB0A 1YF0A 2JSZA 3PH9A 4TXOA 2KOKA 4PURA 2LRTA 5F0GA 5IM9A 3TGZA 4JBBA 2X99A 1G6WA 1QXHA 2VLTA 2GLRA 2OBKA 2X8CA 1G7OA 1K0CA 1DE2A 5CP1A 4POLA 3TJBA 3D5JA 3TJKA 3CRUA 4YQVA 3VPTA 1OC9A 3G7JA 5INYA 4OMVA 2E0QA 3F63A 3ZLPA 3TKPA 3IBHA 4OO4A 5IMZA 4K7OA 3F3RA 5J9BA 3HJPA 4EUYA 3EYTA 2H0IA 5HFKA 2JZRA 2DIYA 1JZDA 4K6XA 1E6BA 1FB6A 3D0ZA 2YWOA 4NV2A 4OO5A 3HA9A 2VAFA 4HEA2 4WEYA 4YH2A 1A2MA 3Q74A 2HZFA 1GSUA 3UVHA 1QUWA 1IYIA 1G0TA 4H86A 2JZSA 4WR5A 1K0OA 4BWQA 4AJ6A 5IMDA 3ERWA 4XHMA 3VWVA 4HUAA 4KH7A 1X5CA 3FY7A 5DJLA 3UJ1A 2REMA 1GSDA 4QQ7A 3ERGA 3GUSA 3IXRA 3ME7A 2B5YA 1TW9A 2GTUA 1M99A 1XFLA 4I8BA 3ZZXA 3GURA 1F37A 5D9VA 4G9HA 4ZB8A 1OKDA 2O89A 5B7CA 2HFDA 4JR6A 2F51A 5A5KA 4X0XA 2KP1A 1TP9A 3LGCA 4LL1B 3APSA 4WF5A 5EY6A 2FGXA 1O6JA 1TRUA 3L4NA 4ZILA 3WGEA 3LEFA 3D22A 3H8QA 3O3TA 1U88A 3TKSE 5GSTA 1GTIA 4PQHA 3LG6A 3Q6OA 4POMA 3F8UA 3LYPA 2C4JA 3TKQA 4OFMA 3M0FA 1GP1A 4DSRA 2EIRA 3GSTA 1V98A 4XS6A 2PBJA 2IMEA 1WMJA 4ZBDA 3VK9A 2CX4A 1AQWA 4V1Ap 2XPDA 5FHIA 5GSSA 2BMXA 1T1VA 5ECIB 5D93A 3SWLA 3ZYWA 3KIJA 4MP4A 2FA4A 3U6VA 3I43A 4YAVA 3ED3A 4PNFA 4QL7A 1M9AA 5F05A 1EEMA 3UARA 3BOAA 5JWQB 5ENUA 3EE2A 4PUFC 3PINA 3KH9A 3BCIA 1BG5A 3C8EA 3A5WA 3FK8A 3TJJA 1IYHA 5CRWA 4MZCA 4IN0A 1WE0A 3EU4A 4PXOA 1F3BA 1WIKA 1B9YC 1SU9A 4E8EA 1Q4JA 2PGTA 4F03A 2CAIA 3EMXA 4GSSA 3FKFA 1V40A 5G31A 4O32A 1ON4A 4K1FA 1EEJA 5JCWA 1SKWB 1Z3EA 3QMXA 5B6MA 2L4QA 4L0UA 3KEBA 3KP8A 3H79A 4I5QA 4GTUA 2H75A 3C73A 3GTUA 2O8VB 4MZWA 2HXKA 1H4OA 3AY8A 1ZZYA 2B3SA 2GSTA 4GSNA 13GSA 1YZXA 1ZCPA 1N8JA 3M8NA 4Q5FA 3L9UA 4XRDA 5G5EA 3ZFBA 2V2GA 2FNOA 4K2DA 5DQSA 5CAXA 1PMTA 2ZNMA 2YANA 3ZIVA 5IMCA 2TRCP 4MK3A 3IC4A 1S3DA 4MF7A 4ZL8A 1VF3A 3HZ8A 2F9SA 5A4UA 3DWVA 2YJ7A 2LUSA 2YZUA 3C7MA 4NAXA 5D9XA 4RI6A 4OCFA 1K0AA 1OVNA 2EIOA 2X64A 3Q19A 2IPAA 3GRXA 3O76A 2FWEA 1FG4A 5IMFA 1TU7A 2B7KA 5DCGA 5E4WA 1UN2A 5G5FA 4MJCA 4ULXA 2GT5A 2CV4A 3L9SA 2P31A 3GSSA 3GKXA 1ZMAA 3HJMA 2VCWA 3DKSA 1O73A 2DJJA 2JZTA 5C04A 3FRCA 4DSSB 1QFNA 3ZIJA 1ZL9A 2YNXA 4HI7A 2GZZA 4IP6A 2V6OA 3TRPA 3TRXA 5IMAA 5DAKA 3UVTA 5EVOA 5CYYA 5IIZA 1WP0A 2FCHA 4BPYA 5JWOB 3BBYA 3WD6A 1YY7A 3VURA 4LMVA 3GL3A 3KD0A 4XS1A 3K8NA 2O7KA 5F06A 1NW2A 2JU5A 2V32A 2YZHA 3CTGA 2J9HA 3HXSA 4L5LA 2LNTA 4EDYA 3VLNA 4TR1A 3CRTA 1OE8A 5KN2A 1A24A 3ZITA 4ISDA 1UA5A 4YQUA 2KHPA 3MDKA 16GSA 1UVZA 3QR6A 4MF5A 1GNEA 2HLSA 1VRSD 1OKTA 5AGYA 1PSQA 4NXIA 3IV4A 1ZGNA 1GULA 3S9FA 1V57A 3CMIA 3CTFA 5DQYA 3EVIA 4HU7A 3L78A 5E59A 2H76A 1A0FA 3KMNA 3IHQA 1Z6MA 2LJAA 3E9JB 3DEXA 3VI5A 4ML1A 4IW9A 2OE0A 2IIYA 4TXOB 3G7YA 4ILFA 3HD5A 1XWCA 2C0FA 1J0FA 3HZ4A 1X5DA 4L5OA 2N5FA 3QAGA 2F3MA 2B5EA 2AV4A 1NHYA 1TI3A 5EPFA 1EP8A 1JZOA 4IJ3A 4XIHA 4IJIA 1XW9A 5GAPD 1OC9B 4ECIA 4ZXGA 1WWJA 3DIEA 3FZ4A 2HSYA 2GVPA 2B6MA 4IHUA 1Y25A 3F6FA 2MZCA 4TOPA 2YWIA 2IFQA 1JHBA 2KLXA 5ECPB 2WULA 2WB9A 2CX3A 3WYWA 2VCQA 2C80A 3W8JA 1PKZA 5H5QA 5ECOB 3CSIA 1VF1A 2O85A 3IE3A 3H4KA 4ACSA 3FZ9A 4JU5A 4MMMA 4JR4A 2FA8A 1THXA 3UBLA 5A4VA 1PGTA 2CQ9A 2GQMA 2HSHA 1K0MA 4N0VA 2X8HA 2H66A 4FYCA 2NBSA 2V41A 2M80A 5G1LA 14GSA 2KP2A 2Z9SA 4KB3A 2VL9A 6GSWA 4FYBA 3HYPA 5CREA 5J3RA 1HNCA 1K3LA 19GSA 2I1UA 2H01A 4NHWA 4NV5A 1KNGA 1ERVA 3IAM2 5L71A 1Z7RA 4KNDA 1PX6A 5ID2A 3LJRA 2E2GA 6GSXA 1R5AA 2IMKA 2VL3A 1TRWA 2VLVA 4TKYA 3P7XA 3MNGA 4GLTA 2K9FA 1MD4A 1UC7A 1A23A 1T4YA 2CVKA 1GNWA 4F9ZA 2H0HA 12GSA 4GXZA 5FWGA 1FOVA 5ECRB 4J2FA 1XBSA 1B8XA 3ZVJA 3EINA 2PERA 4F2IA 4IBPA 1SENA 4TN8A 2H1AA 2C0DA 2H1DA 1R4WA 1VF4A 3EC3A 1H75A 2YJHA 3GFKA 1I9DA 2ES7A 4K0GA 2FD3A 4IGJA 3TJFA 2R37A 3UMAA 2AAWA 4EO3A 1YDKA 1TK0B 4OD7A 3EWLA 4IKHA 3TKSA 3NZNA 2XPEA 4MJBA 2MBTA 2CT6A 4GQCA 3W8SA 3TOUA 9GSSA 1TK8B 1AQXA 1TRVA 2KUCA 1TTZA 5HFGA 4V1Ag 4ZL9A 2G0FA 3DD3A 2J23A 1NM3A 2R5GA 4GWRA 1J08A 2YCDA 4TW5A 3N5OA 2L59A 3LQ7A 1EOGA 1O85A 2NPBA 5DJMA 2H6XA 5GZZB 2PMTA 2I3YA 3HKRA 3ZMLA 5CNWA 3FHKA 1BAYA 2H70A 1SJ6A 1SD9A 6GSUA 1SK0A 1TOFA 3ZFLA 2VL2C 3GH6A 4F0CA 3ZMKA 4AGSA 2L6CA 2WRTA 4EL1A 1X9MB 2CA8A 3C1RA 5ECQB 3WT1A 2VO4A 1A2LA 1Z6NA 1K0BA 1JLWA 3FYGA 4IP1A 4ZBBA 4CHSA 3QD9A 4GSTA 2XBIA 2HNLA 1T00A 2YP6A 2CVBA 2R6KA 5DALA 1XXUA 3GTUB 3KCMA 3LYKA 2LJKA 2FWFA 4TR3A 5IPHA 4BL7A 1V58A 4Q5QA 2RUEA 1QQ2A 1SD8A 1B9XC 5AIVA 5G30A 4ECCA 1Z9HA 4XS4A 1W4VA 3ERFA 3GX8A 4N0ZA 2LRNA 1YJ6A 4JEDA 4JZQA 1PKWA 3A3TA 2JADA 2D2ZA 5DDLA 1PL2A 2G2QA 1SJZA 1GTAA 1MDJA 4F82A 1FHEA 2GGTA 1URMA 8GSSA 1U6TA 1GUKA 2H71A 4GF0A 4OWYA 1I5GA 2I9HA 6GSYA 5IQYA 3KZQA 1BQ7A 2IMIA 1XVQA 5B8BA 2L57A 5J5NA 1ACVA 4AJ7A 2LKUA 4K8MA 2VL2A 2EC4A 4MJEA 3DMLA 1E2YA 3BD2A 5B8AA 3VWXA 4K9ZA 3GYKA 2DLXA 4DEJA 2H0GA 5DAKB 1RW1A 2PU9C 1EOHA 1MDIA 3US3A 1R5PA 2DJ3A 1TK5B 3H1NA 4KW6A 1BYEA 5ELGA 2VCZA 3V1WA 1FVKA 5CRGA 4WKWA 4G2EA 4X1UA 4ZBAA 5JCGA 1EV9A 3VFIA 3IRAA 2H1GA 2R3XA 5JCUA 4TRXA 3D6IA 4PQ1A 4TR1B 5G1KA 3CYNA 3NOFA 3E3EA 5J41A 1MDKA 2IWTA 3ISOA 1GWCA 2YN1A 2WZ9A 5LCZA 2MYGA 1S3AA 2C1YA 2LEGA 1XWGA 2R2JA 1SK1A 4XTSA 3IR4A 3HVXA 3GL5A 3U5RE 2QC7A 1TI1A 2GSRA 1ILOA 4FO5A 3BCKA 3A2XA 3GNJA 1T8EB 1OC3A 3CXGA 3QAWA 5H5SA 10GSA 4KSMA 3LXZA 2WGRA 2XC2A 3GV1A 1KBNA 20GSA 3FR9A 3DRNA 1KTEA 5ECKB 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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