3HCZA

The crystal structure of a domain of possible thiol-disulfide isomerase from cytophaga hutchinsonii atcc 33406.
Total Genus 50
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
50
sequence length
147
structure length
147
Chain Sequence
NAPLLLGKKAPNLYMTDTTGTYRYLYDVQAKYTILFFWDSQCGHCQQETPKLYDWWLKNRAKGIQVYAANIERKDEEWLKFIRSKKIGGWLNVRDSKNHTDFKITYDIYATPVLYVLDKNKVIIAKRIGYENLDDFLVQYEKSLKTK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title The crystal structure of a domain of possible thiol-disulfide isomerase from Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406.
rcsb
molecule keywords Possible thiol-disulfide isomerase
molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Cytophaga hutchinsonii
total genus 50
structure length 147
sequence length 147
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-05-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3hczA00
2HYXA 5CRGA 4V2NA 4AJ8A 5HR3A 3RHBA 4HZ2A 4POLA 1XIYA 4J2FA 1WRYA 3IA1A 3LYKA 2RUEA 1VF3A 2GT6A 1N2AA 4MP4A 1PX7A 4V1Ap 4JZQA 3MAKA 4IP6A 2OE0A 1K3OA 4TRXA 3GSTA 4KE3A 4GQCA 2EIQA 3TKSC 4EDYA 2HSHA 2C3NA 4YH2A 3JCML 2MMNA 3F6FA 2GSQA 4YQVA 3EYTA 1B4QA 4DSSA 3DRNA 3EMPA 2VL2A 1ZZYA 5JCGA 2R2JA 2H0HA 4Q5QA 5AIVA 1V2AA 2XHFA 1RK4A 3IDVA 1EV4A 5IPGA 2MBSA 3KGKA 5HQPA 1XWAA 1HD2A 3FZ4A 2HI7A 5ENUA 2NVLA 2VAFA 1EWXA 2JACA 5G5EA 1EGRA 2PMTA 4L8EA 4GRFA 4P3YB 3AY8A 2HZFA 1Y6EA 4G9HA 1ZYQB 1GSFA 5DQYA 1WIKA 3CXGA 1X9WB 4KGIA 4MZCA 2RIIA 4L5LA 2L6CA 4JRRA 2DJ3A 5A4VA 1EZKA 3KP8A 3O3TA 3UOMA 3HVSA 4ISDA 1ON4A 4JR6A 1K0DA 1VRSD 1UC7A 1I9DA 3KMOA 5FWGA 2AB6A 3MWHA 3ZZXA 5GSTA 4PURA 1XW6A 3ZVJD 2JZRA 4E8HA 1H4OA 2ALBA 3DMLA 2GS3A 2PPTA 4HZ4A 1PQNA 2P5QA 4MPGA 2L4QA 2V6OA 4K8MA 3UBKA 2FNOA 2H1AA 2M72A 2F51A 2FCHA 2YN1A 3F8UA 4BVXA 2VOCA 2RUFA 3G7YA 2G2QA 4EE0A 2H19A 3CRTA 2MYGA 3NZNA 1GNWA 3ZITA 3GURA 1R26A 3D0ZA 2A2SA 3E9JB 3UAPA 1UN2A 3IK7A 5D9XA 2GZYA 3EVIA 5ECHB 1I5GA 1Q4JA 6GSXA 3EU4A 3FY7A 2YJHA 2OBKA 4XS4B 3GKKA 3WT2A 2GZPA 2O89A 3GX0A 4V2MA 4JR4A 5J41A 2P31A 5DVBA 2B3SA 3KEBA 5EVOA 5G31A 4N0ZA 3BOAA 4TXVA 2FD3A 3HKRA 4ZL7A 3GKXA 3HVVA 4G10A 3HY2A 3RBTA 2XPDA 2G0FA 2DJKA 2IJYA 2H76A 1SJZA 3FEUA 3ED3A 4K0NA 1B9XC 2PUKC 1Z5YE 4D73A 2FWGA 5ABRA 3TKQA 3Q74A 5DDLA 4MMMA 2VCTA 4OFTA 3A3TA 2N5FA 1FOVA 5CRDA 3M9JA 3GUSA 4ZXGA 1TK0B 2YZHA 1XW5A 2VD1A 3A2VA 3LWAA 5G1KA 4J56E 3FZ9A 1Z6MA 3DVWA 1WOUA 4NV2A 4MA9A 1GUHA 4JBBA 4WBJA 1UA5A 2H0IA 5JWOB 3F6DA 5ECOB 3EURA 1SD9A 2JSZA 3GYKA 1SK1A 2LRCA 3O6TA 2IMFA 3D5JA 2R37A 3IRAA 4X1UA 8GSSA 4AJ6A 1ZOFA 1YEPA 1HYUA 1AUCA 4DVCA 3CSJA 2V32A 2GVPA 3DXBA 1LBKA 5EY6A 1G0TA 4GWRA 2B5EA 1GH2A 4QL9A 1X9SB 3I9V2 2GZZA 3P8WA 18GSA 3D21A 3ZMKA 5F8BA 2PBJA 1GTAA 3ME7A 3HJMA 2I1UA 1HQOA 2KOKA 2EIRA 1K0BA 5IQYA 1TK8B 5DCHA 4Q5NA 3KXOA 1TTZA 1SU9A 2C3QA 3TUEA 3IHQA 5IOXA 1GLQA 1NHOA 4LL1B 5E59A 3MSZA 4QL7A 3M1GA 5DCGA 4KB3A 5KN3A 2O7KA 3EWLA 2WFCA 5ID2A 4MF5A 1OC9B 6GSWA 5JWQB 1PN9A 5DALB 1SKWB 4IQ1A 4PUAA 5AIXA 4HJMA 3RAZA 3F4SA 4PX1A 2LJRA 4F0BA 2VL3A 1XFLA 4MJBA 1TRSA 2REMA 2YWNA 2C8UA 1ZCPA 1GSEA 4IVFA 4O32A 4RI7A 5FT3A 1J0FA 2IL3A 1SJ6A 2YNXA 5IMFA 3TRPA 1GP1A 1GSQA 3NIVA 3KH9A 5D9TA 3P7XA 1W89A 5IMVA 3C8EA 2YP6A 5L71A 4MK3A 1PKZA 3D6IA 4KDXA 1NHYA 3UIWA 4WR4A 1QMVA 2H1BA 4HU7A 2LSTA 4TXOB 2Z9SA 1ACVA 3ZIVA 4WR5A 4NHZA 3DWVA 4GSSA 2JSYA 4RQRA 3ZTLA 3Q19A 4Q5RA 1GTIA 2X8CA 2CV4A 4PQIA 5ECPB 1AQWA 1U3AA 1WPIA 3TKSE 4BWQA 1ERWA 5A4UA 1ZGNA 1BX9A 1QUWA 4IP1A 3VI5A 5D9VA 6GSVA 5KN2A 5H5SA 5A5KA 4K0GA 1JZOA 2DMMA 20GSA 5ECKB 3R2QA 1SJIA 3IR4A 4DSRA 1ABAA 3VK9A 3FZ5A 1EGOA 3A2WA 1OE7A 3PH9A 4X0XA 4NPBA 4ECBA 2L57A 4ECIA 1TKDB 1GUMA 3HYPA 2YCDA 1TJDA 2FUG2 1PGTA 3LXTA 3IAM2 3Q6OA 5D93A 3IE3A 3H1NA 4TR1A 3FZAA 4TW5A 1AXDA 1RQMA 3IPZA 4NXIA 2TIRA 4POBA 4HQZA 3I43A 4IW9A 5COHA 4BA7A 4N10A 5CREA 2DJ1A 5ECLB 2K9FA 4J57E 4ZB6A 4AJ7A 1NM3A 3HJOA 4IKHA 2WZ9A 3O76A 5LD0A 1TXXA 1BQ7A 4KNDA 4CHSA 5D96A 5J3RA 2CVKA 2ZNMA 2X8GA 2LQOA 2FWFA 5HR1A 3LEFA 1O85A 3RPPA 3L78A 1TOFA 4MF7A 4RI6A 1DSBA 2B7KA 4MABA 1VF4A 4H86A 3DYRA 4F0CA 1EEMA 3QFBC 2DSAA 2DJ0A 4EL1A 3K8NA 2LTKA 1GULA 4LMWA 3GTUB 1N8JA 3N9JA 4HOJA 3TKPA 5F07A 5AGYA 4LLRA 4MJAA 5B6MA 1QK8A 5C00A 1GLPA 3UVHA 1XVQA 1NSWA 2H8LA 2VLUA 5IMCA 2HXKA 3LG6A 3APSA 4OCEA 1F3BA 5H5QA 2GQKA 1DBYA 1H75A 5EL8A 4TN8A 2DC5A 1J9BA 1F2EA 2L59A 1ML6A 3L9SA 1X9MB 4EC0A 5GAPD 1PMTA 2H72A 4IGJA 3FR9A 4L0UA 3HHVA 5J9CA 1TI1A 3APQA 2LNTA 3FR6A 2PGTA 2VLTA 4IJIA 3ZYWA 3LSZA 1BJXA 3UEMA 3C7MA 1XOAA 5C04A 3ZRDA 4OO5A 1R5AA 11GSA 2F8FA 1B9YC 1GSDA 3EE2A 5DAKB 2CZ3A 4F82A 3DIEA 4EDZA 2NDOA 4I6XA 2EC4A 2IWTA 1Z7RA 2IFQB 5CRWA 4WXTA 2B1KA 1CQHA 2HZEB 1Z6NA 3P90A 2RM6A 4I5QA 4HEA2 1TDIA 3IK9A 4MJEA 3G7JA 1T1VA 1KEBA 1URMA 1YF0A 2YWOA 1M9AA 3GH9A 4HDEA 2OE1A 3KP9A 1TI3A 1BEDA 2CX4A 4MDCA 3J7Yb 1HNCA 3GN3A 3VFIA 1V58A 3SWLA 3IC4A 1QFNA 2CVBA 1T00A 1IYHA 1YY7A 5CYYA 1PA3A 1MDIA 1EP8A 2AV4A 3DGQA 4NWYA 4EXJA 5CNWA 4L0WA 2KP1A 3CYNA 4K1FA 1SYXA 1OVNA 3F3QA 1LJRA 4G2EA 4HS1A 2WDUA 3VWXA 3IOSA 2E2GA 3GA4A 1SL2B 2H66A 1GRXA 4F2IA 3US3A 3L4NA 4K7IA 4TOPA 4XRDA 2WB9A 5B7CA 3S9FA 1GNEA 2YZUA 3HD5A 1TRWA 4V1Ag 3ISOA 1A0FA 4FH8A 3H4KA 2LEGA 3TRXA 3BCIA 3TJFA 1DE2A 4TKYA 3F9UA 5DBQA 3HDCA 1WMJA 2RM5A 3FKFA 3CSHA 4EUYA 2IMIA 4IQAA 2HNLA 2M80A 2QC7A 1XOBA 2O87A 1DE1A 1U6TA 5F05A 3C1SA 2XBQA 4LMVA 3Q18A 1PL2A 3EINA 4PQ1A 4YAVA 2GSTA 2A4VA 3F4RA 1FW1A 4PXOA 4LA1A 4WEYA 2JL4A 1VGLA 3KJYA 1FB6A 1XWKA 1GSUA 1UVZA 4FIWA 1Q98A 1IYIA 4MLYA 2B5YA 4BVYA 2QGVA 1AQVA 5ECRB 3SBCA 4JU5A 5DQSA 3ERGA 3TCOA 5GSSA 1U3IA 5JCWA 5ELGA 5ECIB 2QKEA 4IHUA 1PKWA 3M9KA 2H6ZA 5F06A 3VWUA 1THXA 1QXHA 2VUPA 4MH2A 4OFMA 1C72A 5DJLA 3G7IA 2YV9A 4ZBDA 2WULA 1CQGA 4XS4A 2LQQA 2OJLA 4F9ZA 2B7JA 2YOIA 2O8VB 2MMOA 3QOUA 1WWJA 1A0RP 5B6NA 1M0UA 4XHMA 4FYCA 2AAWA 3PGTA 4MJCA 3GV1A 4WF4A 2KLXA 2VD0A 1GUKA 1JLWA 5IMZA 3F0IA 6GSYA 1ZL9A 1FO5A 1OAZA 1V98A 2B6MA 2V2GA 1S3CA 2GSRA 1YF1A 2I81A 3H79A 1SK0A 7GSSA 4KX4A 1G7EA 5HFGA 2IMKA 3GMFA 3U6VA 5ECSA 2DBCA 4WKWA 3TB2A 1W4VA 1MD4A 2R4VA 3GH6A 1G7OA 3N5OA 2FHEA 1OYJA 2OA7A 1PL1A 5AN1A 3TGZA 4MZBA 1MDJA 3VWVA 1M2DA 2LRTA 2F8AA 2FLSA 3L9VA 2LKUA 1GL8A 3RHCA 5J5NA 1ILOA 5JCUA 3WGEA 2I9HA 2KHPA 3CTFA 1XWBA 1KTEA 1J08A 3QAWA 5JWRB 3UARA 2H01A 1F37A 3C73A 5CAXA 2CA8A 1EEJA 1K3LA 2H6YA 1XW9A 5D73A 4G19A 1PSQA 19GSA 3IAS2 1VF2A 3MNGA 1WP0A 3TJBA 2I3YA 4MF6A 2P5RA 2OKAA 1XBSA 3NOFA 2PWJA 3IBHA 3FW2A 5CP1A 4JE1A 3VWWA 5D8IA 3HCZA 1B4PA 3KH7A 4IN0A 1GTBA 2YPMA 5IOWA 2JU5A 3KTLA 4OO4A 3EU3A 3MDKA 1TK5B 3HJPA 4WBRD 1QGVA 4E8EA 1AW9A 3TOUA 2ON5A 4GSTA 1FVJA 6GSUA 3TRQA 2C1YA 4IBPA 2MBTA 5CO3A 2JZTA 2DIZA 1YKCA 4BWSA 1SD8A 3LJRA 3UMAA 1A24A 1OC9A 3ZMLA 1SYRA 2FY6A 12GSA 4KAEA 4XIHA 4CW9A 5DALA 1E2YA 2A2RA 2YWMA 1KNGA 4HQSA 3WGXA 1FAAA 1EV9A 16GSA 4K2DA 2HRFA 2HT9A 5HFIA 4KW6A 1NW2A 3ME8A 2QSIA 3LQ7A 2C3TA 2X64A 4OD7A 2AHEA 3L9UA 3FR3A 2FWEA 1K3YA 3VLNA 1S3AA 1M9BA 3RPNA 3UVTA 10GSA 1WJKA 2XPEA 1GTUA 1MEKA 4N0VA 3LGCA 4DSSB 1WE0A 2OBIA 2DJ2A 3CRUA 2GGTA 1YKAA 2BJXA 14GSA 5G30A 3HXSA 1Z3EA 2DJJA 1G6YA 1F6MC 4EF0A 1TU8A 3QMXA 4XTSA 2HRNA 1Z7PA 3QFAC 2IIYA 3GRXA 4O7HA 4KA0A 3I6AA 4XS1A 1O81A 3QCPA 1OKDA 4HU9A 2EIOA 4TXOA 1Z9HA 2E7PA 3VI7A 3HVXA 3GFKA 5INYA 1QQ2A 1A2LA 3J7Yk 4I8BA 3ZVJA 1O6JA 3WGDA 2H70A 4KSMA 1JZRA 2VCWA 3GL5A 2L4CA 3D4MA 3D4TA 2MMAA 2H74A 5KN0A 2AUVA 4TR3A 5J9BA 2H1GA 2MZCA 3TOTA 2J23A 2LUSA 3KD0A 1K0NA 4OFNA 2KUCA 1V57A 4MH3A 3F3RA 3U5RE 2VO4A 5EPFA 3QDNA 2B5XA 2R6KA 2E2MA 2JADA 1EOHA 2YANA 1T4ZA 4QQ7A 3TKRA 2YWIA 1ERTA 5LNKe 1EOGA 3C71A 4ZILA 5B8AA 2CT6A 2VCXA 4GTUA 3DKSA 5J4UA 2YJ7A 1OC8A 1AIUA 4NAXA 2HE3A 2FA4A 1DUGA 3ZLPA 1SKSB 1XWCA 4O92A 4ECCA 1YJ6A 4PUFC 1AAZA 4KUNA 5D9WA 1BAYA 2PN8A 4IJ3A 1YDKA 3CTGA 3H93A 5E4WA 1T8EB 3LXZA 1RW1A 5AISA 3ZFBA 3CSIA 1VF1A 2FA8A 1YZXA 2ZUPA 2TRXA 2LV3A 5IIZA 1A8LA 1ZYEA 3M0FA 4JEDA 4K9ZA 4Z7XA 2WJUA 4K7NA 5G5FA 1OKTA 2K6VA 5GAND 3ERFA 2CQ9A 4ACSA 3GTUA 2ZCTA 2VCVA 1ERUA 3KIJA 4BL7A 1OC3A 3G9BA 1K0AA 2R5GA 4POMA 1SKRB 4I2TA 4EKZA 2GSSA 4ID0A 4N11A 3GKNA 2CVDA 2R3XA 2PVQA 2PVOC 2GLRA 4D73B 4IS0A 4GQFA 3LORA 3BD2A 2IMEA 3WYWA 1XPVA 13GSA 4O5RA 2O85A 3KMNA 2GTUA 4MPFA 3KZQA 2H1DA 4YAPA 2OADA 2N5AA 4AGSA 4ZL8A 4PQHA 3E3EA 2VM1A 2PERA 3IV4A 1XZOA 4EVMA 1FHEA 1X0RA 3HZ8A 2CX3A 3GSSA 2C0DA 1THOA 3EC3A 2VL2C 5G2ZA 3GL3A 2RLIA 4WF5A 4ZBAA 4YQMA 4NMUA 1XWGA 4TR4A 5DAKA 3HZ4A 5LCZA 3CMIA 2VL9A 4PGTA 3KM6A 4KCEA 4RUVA 1BG5A 2VCZA 1K0CA 5G1LA 4POKA 4ZL9A 1FVKA 4TVEA 1JZDA 2IFQA 2LNSA 3WT1A 1EP7A 5IMDA 3GHAA 5CRHA 3ZL5A 2HZEA 1BYEA 4GCIA 1X5EA 3FHKA 3APOA 4TR0A 2YV7A 2IN3A 4ZB8A 1U88A 2P0GA 1YEXA 4K6XA 3FRCA 2VLVA 2C0EA 3L0HA 1YQ1A 1KBNA 4DEJA 3VPQA 4GLTA 2H30A 1AQXA 1SL0B 2VCQA 1GSYA 3DEXA 2WS2A 2DLXA 4XRAA 3ZREA 5ID2B 4NV5A 5HFKA 4ECJA 4HI7A 3A5WA 3VURA 2OACA 4AF2A 1A8YA 1MDKA 3OR5A 3TJKA 3M8NA 1JLVA 3KCMA 1MTCA 4DSQA 3I69A 5H5RA 4Q5FA 4ZB9A 4CDOA 2ES7A 2LRNA 1X5CA 1TP9A 2N5BA 1R4WA 1O73A 4ILFA 22GSA 5ELAA 2D2ZA 3QPMA 1TU7A 1M2BA 2HFDA 4ZBBA 4KSOA 3P2AA 2AYTA 2V1MA 3UL3A 1PRXA 1A23A 2NTOA 1OE8A 2X99A 1O8XA 5HR0A 2JZSA 1X5DA 3HA9A 3LFLA 4RQXA 3F4TA 4NHWA 2FWHA 4LL4B 2H71A 9GSSA 1JZWA 1V40A 3D22A 3PINA 3BJ5A 3GX8A 1R5PA 4KH7A 2H6XA 1A2JA 5FHIA 2IMDA 3DVXA 1S3DA 2X8HA 2CAQA 5B8BA 1SENA 5IO2A 2LJAA 3GIXA 1TRVA 2F9SA 3ZFLA 4OWYA 4ZIJA 1T3BA 3W8JA 2ON7A 3TDGA 3ZIJA 3FYGA 4GXZA 2L5LA 3BCKA 2GDRA 3W8SA 1T4YA 4K7OA 3PR8A 5IPHA 2OE3A 1B8XA 2KP2A 4YQUA 4EO3A 1V9WA 4IELA 2C4JA 2HLSA 4BPYA 3TJGA 2V41A 3V1WA 3IXRA 1Y25A 4I97A 1JFUA 17GSA 3ERWA 5ECMB 3EMXA 4WETA 4GF0A 5HR2A 4TR1B 3QR6A 1F3AA 4FYUA 5ECQB 1G6WA 1B48A 1USBA 3QD9A 2FGXA 5IM9A 3C1RA 1SL1B 1PX6A 4HUAA 4ML1A 2C0FA 4PNFA 1O7UA 4KCAA 5IO0A 1O8WA 1FB0A 4OCFA 3UBLA 5IMAA 4I2UA 1M99A 1SK2A 3DD3A 2F3MA 4F03A 5ECNB 3VPTA 2E0QA 4OMVA 5KN1A 2VM2A 1K0MA 4FO5A 5KEJA 1GSSA 1M2AA 6GSTA 2GQMA 1ST9A 1XVWA 3M3MA 1TRUA 3QAGA 1FG4A 1JHBA 4HJ2A 4ULXA 3RDWA 4X43A 1TW9A 2GT5A 2L5OA 1K0OA 4MZWA 2I4AA 2LS5A 3TKSA 2K8SA 1XXUA 3A2XA 4MCUA 3E0UA 4V2LA 1GWCA 2PU9C 4KDYA 2IPAA 4KDUA 1ZMAA 1AC1A 2MMZA 2VIMA 2GQLA 1PD21 2NBSA 2XBIA 3UJ1A 5A4WA 1HNBA 1MD3A 1E6BA 1U87A 2NPBA 4PNGA 2C80A 1ERVA 2BMXA 2K8VA 2WGRA 3GKMA 4L5OA 3TJJA 2J9HA 3FK8A 2WRTA 3QAVA 2CAIA 2DIYA 2BTOT 4N30A 5F0GA 4GSNA 3LYPA 2WCIA 2K18A 1A2MA 5DJMA 1R7HA 4FYBA 6GSSA 2LJKA 1HNAA 2C0GA 2H73A 4XCSA 1F9MA 1T7PB 2V6KA 4ML6A 2M46A 3KTBA 2XC2A 3BBYA 3H8QA 2HSYA 2B1LA 2L6DA 3CBUA 2H0GA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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