3HJPA

The crystal structure of bcp4 from sulfolobus solfataricus
Total Genus 47
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
158
structure length
158
Chain Sequence
MVEIGEKAPEIELVDTDLKKVKIPSDFKGKVVVLAFYPAAFTSVSTKEMSTFRDSMAKFNEVNAVVIGISVDPPFSNKAFKEQNKINFTIVSDFNREAVKAYGVAGELPILKGYVLAKRSVFVIDKNGIVRYKWVSEDPTKEPNYDEIKDVVTKLSLE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Exploring the catalytic mechanism of the first dimeric Bcp: functional, structural and docking analysis
rcsb
molecule keywords Peroxiredoxin, bacterioferritin comigratory protein homolog
molecule tags Oxidoreductase
source organism Sulfolobus solfataricus
total genus 47
structure length 158
sequence length 158
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-05-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3hjpA00
3UIWA 3FZ5A 3P7XA 1F3AA 1UN2A 2RM5A 3FZAA 2NTOA 3TJBA 3IBHA 4FIWA 1J9BA 1XOAA 4DSSA 4NPBA 4HJ2A 5JCWA 2CX3A 3KMNA 3ME8A 4G10A 3D22A 3S9FA 2H19A 3A2VA 5ECLB 3IPZA 3BJ5A 5F0GA 1AAZA 19GSA 1Z6MA 1T4YA 4EDZA 4YQVA 5G5FA 6GSXA 3FR9A 1PA3A 3IV4A 3US3A 2GT5A 4KAEA 3LFLA 4TR0A 5B7CA 2FUG2 4N0ZA 2XBIA 3DXBA 1VGLA 1XVQA 4JRRA 5E59A 1MDJA 3F3QA 3L78A 2HXKA 3IE3A 5F07A 2IFQB 3IAM2 2K6VA 1G6WA 1USBA 1FVJA 4O5RA 2O87A 2OBKA 2OACA 4ACSA 2B7KA 5A5KA 1THOA 3CRUA 1SK1A 5KEJA 5J5NA 3GTUA 4BVYA 2CZ3A 4KSMA 4TVEA 4IQAA 1TI1A 3PINA 2V32A 3HJMA 3D5JA 2LTKA 3CRTA 4G9HA 22GSA 3ERFA 3RHBA 1TOFA 2MMZA 1PN9A 3HJOA 2VAFA 1JHBA 3QCPA 1KEBA 3RDWA 2X8CA 3ZZXA 1WMJA 3CYNA 1OC3A 2DLXA 1FB0A 3HKRA 3DYRA 4KNDA 5EL8A 4XHMA 2L6CA 4K9ZA 3F4TA 2HT9A 3E3EA 1PX6A 3V1WA 5CO3A 3D4TA 4OO5A 5ECNB 4HUAA 5HFKA 4OCEA 4NHZA 2TIRA 3UVHA 4TN8A 2J23A 3F0IA 6GSUA 1ERTA 4I2UA 1R5AA 1XIYA 1GP1A 2HE3A 4DSRA 1B4QA 5IMAA 4BWSA 4K0NA 5J9CA 1A8YA 3TCOA 3UMAA 1F6MC 4HI7A 1NSWA 1U88A 3GH6A 1XBSA 2DJJA 5HFGA 3WYWA 1UVZA 5ECIB 1G7OA 1YF1A 1TU8A 2DMMA 5DJMA 3GA4A 2H1DA 1PMTA 3KTBA 2VL2A 1WE0A 4OFTA 3KZQA 4MP4A 1NHYA 5H5QA 3IHQA 3U6VA 1K0BA 3GURA 3LWAA 2X8HA 2L6DA 3FR3A 3A2XA 1V9WA 2ON5A 4LA1A 2R4VA 2KP1A 4RQXA 2OBIA 1FB6A 3P2AA 2FCHA 2ON7A 2B5YA 4ZL9A 2IMIA 5FT3A 1BAYA 3EC3A 4I2TA 5KN1A 2WCIA 3PH9A 3VI7A 1FAAA 2RUEA 5GAND 3ERWA 4IW9A 2GDRA 4OMVA 4GQFA 4RI6A 4F2IA 4IS0A 1TRWA 1RK4A 1Z3EA 3O6TA 5ENUA 2V6KA 2A4VA 2PN8A 4GCIA 3LQ7A 4NXIA 5G5EA 1IYIA 3P90A 5G1KA 4CDOA 4MMMA 1EEMA 4HDEA 2VLUA 1XW6A 1ZL9A 1EP7A 5EPFA 1H75A 3TRQA 4MLYA 4MZWA 1S3CA 1ZCPA 3R2QA 2VOCA 3QFBC 5DQYA 1PD21 1XVWA 2V2GA 2OA7A 3WT1A 3IK9A 3TKQA 2C1YA 3KEBA 5AISA 1HQOA 4KW6A 1XWGA 2H72A 4K0GA 3L9SA 5IPHA 2IL3A 4F03A 4ZILA 3DMLA 1K0DA 2MMAA 2HRFA 4LL1B 1ZGNA 3HXSA 3CXGA 2H71A 3M3MA 4LL4B 4GQCA 3BOAA 4ISDA 2HI7A 3IA1A 2PMTA 3G9BA 1HYUA 2H1GA 4HQSA 1PSQA 1R4WA 3LEFA 1QMVA 1NW2A 3J7Yk 4QQ7A 3ZMKA 1OKDA 4MH2A 1XOBA 2RM6A 4IKHA 4PUAA 4QL9A 2VLVA 4IP1A 4TR1B 1X0RA 3QR6A 4YQUA 2FWHA 2C3NA 1JZDA 3FR6A 1IYHA 3ZYWA 2M80A 4RQRA 3LXZA 1YDKA 3UBLA 2F9SA 3KH9A 3UOMA 5B8BA 4Q5RA 4YH2A 3LSZA 3UARA 2PVQA 4MK3A 4WF4A 2MBSA 6GSTA 3G7YA 3LYKA 2LJRA 4POMA 2MYGA 2FWEA 2V6OA 1JLVA 1GSEA 1G0TA 1GSDA 3KM6A 3TJFA 1XW5A 4AJ8A 2P5QA 5D9VA 2NDOA 5AGYA 4AJ7A 3GX8A 5JCUA 3TRXA 5ECMB 4O92A 2N5BA 4MA9A 1ILOA 1GUMA 3APQA 5CRGA 2JSZA 2IPAA 4N30A 2I1UA 2KUCA 5IOWA 5A4WA 2H70A 5DBQA 4GWRA 1AXDA 2GQKA 4H86A 2CVBA 3HVSA 1R5PA 1PGTA 1F9MA 3H79A 3TJGA 4GSTA 2YP6A 3TGZA 4OFMA 2QC7A 4G2EA 2D2ZA 5ECRB 1ERVA 1PKWA 3VK9A 4XRAA 1O8WA 3ISOA 1ON4A 16GSA 1T00A 2I9HA 3O3TA 3D21A 3E9JB 5CRDA 4IELA 5AIXA 3TKSA 3GSTA 6GSVA 3EYTA 1A2LA 4KCEA 1XPVA 2XHFA 3IDVA 2GT6A 1MEKA 4ECCA 2MZCA 2PWJA 3D6IA 1AC1A 2OJLA 2XPEA 2YWOA 7GSSA 4EVMA 1E6BA 3L4NA 1O81A 3SWLA 3HD5A 5DAKA 3DRNA 3GSSA 2DC5A 1A0FA 2TRCP 2GSRA 2H6ZA 2WB9A 1M2BA 4KA0A 2FWFA 1GH2A 4KDXA 2MMNA 1G6YA 2EIQA 3PR8A 1B4PA 4ULXA 1QQ2A 3ZMLA 1HNCA 4KDYA 2CQ9A 2HZEB 2WULA 3E0UA 2GSSA 1RQMA 5HR2A 1M0UA 3MNGA 1OC9A 4PNGA 3F8UA 2X64A 1FW1A 3GH9A 3TOTA 4DSSB 2ZCTA 4POBA 3EURA 5IMDA 1F2EA 4MDCA 2PVOC 2CT6A 2IWTA 1QXHA 2O89A 2VCQA 1TTZA 2IIYA 3RHCA 3ERGA 2YV9A 2FY6A 1R26A 2LRNA 2H6YA 2A2SA 3HCZA 4PXOA 1AW9A 3OR5A 3K8NA 2QKEA 5LNKe 4X43A 3APSA 3C73A 1OKTA 3GFKA 1PRXA 3CSHA 3SBCA 2V41A 1SKRB 3GKNA 3LG6A 5ECKB 1A2MA 5COHA 5A4VA 2H75A 4MF5A 2X99A 4EKZA 3I69A 3ZREA 2LNSA 1QUWA 1YEPA 4ECBA 5DVBA 1V98A 2RLIA 1ABAA 5ECHB 5H5RA 3FZ4A 1BEDA 2HSYA 5J4UA 3GTUB 1JZOA 1ST9A 4I6XA 4MPFA 4LMVA 3GL3A 3WGEA 4K1FA 1FHEA 4O7HA 4PX1A 3TJJA 2I4AA 1XXUA 1EGRA 5D9TA 4FH8A 3CMIA 3O76A 5IQYA 3H4KA 2HNLA 3QAGA 2Z9SA 2EIRA 5G2ZA 3ZVJD 3I43A 2LUSA 3TRPA 2CVKA 5JWOB 2AB6A 3H8QA 4TR3A 2KP2A 4HOJA 3H93A 2YCDA 5C04A 1GUHA 3UAPA 1DBYA 4MZCA 1KBNA 2ZUPA 1GUKA 4RI7A 1X5EA 5DCGA 5INYA 1W89A 4X0XA 2LJAA 1CQGA 1EOGA 4MJBA 2R2JA 2J9HA 2DJKA 5F06A 4RUVA 1O7UA 1SD9A 2EIOA 2R37A 2VCVA 1YKCA 2NBSA 2YN1A 4ECIA 3HHVA 4OD7A 4K7IA 2IMKA 2HZFA 3DKSA 4EUYA 5LCZA 2L4QA 1UA5A 2YZUA 5JWRB 5ID2A 3KIJA 4POLA 4HU7A 1GTAA 1U6TA 5HR3A 1SD8A 4IJ3A 3FY7A 4FYCA 2VO4A 4FYUA 4JBBA 3EVIA 3DD3A 4ZBDA 1U3AA 2L57A 4KX4A 3U5RE 4CW9A 2PUKC 3GKMA 4MCUA 2F8FA 1TK5B 4ZB9A 2KLXA 2DJ1A 3DEXA 1K0MA 3M1GA 3W6GA 10GSA 1TRUA 1I9DA 3FW2A 1YEXA 2M46A 4GSNA 1XFLA 1QGVA 3CSJA 2MMOA 2YNXA 1N2AA 1M2DA 2C4JA 4N10A 2HFDA 2VUPA 5IMCA 2B1KA 1SJ6A 2C0DA 5IMVA 4TOPA 4MF7A 5CRHA 4TW5A 1K3YA 3IAS2 1DSBA 1M7TA 1K3OA 1YKAA 5ECOB 4IQ1A 1B48A 5B6MA 6GSWA 1NHOA 4KDUA 4F0BA 4L8EA 4J2FA 4E8EA 1O8XA 2X8GA 4X1UA 1TXXA 2PGTA 1AQWA 1B9XC 1SKWB 3ZIJA 1T7PB 2YOIA 3EU4A 5D96A 4WR4A 1TU7A 4I97A 2GZPA 4V2LA 2H0IA 2YWNA 2PERA 1GULA 2FNOA 1A24A 2H73A 3VURA 4FYBA 2P31A 2LS5A 4EC0A 3F4SA 4F0CA 3L9UA 4NV5A 1HNBA 2H1AA 1CQHA 1BG5A 1GTUA 3HZ4A 4YQMA 4JZQA 4XRDA 1FO5A 4BPYA 5J9BA 3C71A 4KH7A 4POKA 4WKWA 3FZ9A 1M99A 5G31A 2BMXA 2GVPA 2G2QA 2GTUA 4N0VA 1GSYA 2WDUA 1ZYEA 3Q18A 1GSSA 1OC8A 2FWGA 4OO4A 4HZ2A 1XWCA 3HDCA 3W8JA 2YV7A 3F3RA 2M72A 2B6MA 3HVXA 2VM1A 1T3BA 3VFIA 1ERUA 2XC2A 2BTOT 4EF0A 3VLNA 2A2RA 3M9KA 2B3SA 4HJMA 4I5QA 1FOVA 1SU9A 4EDYA 2LSTA 4IBPA 1V40A 3ZFBA 2GQMA 3TJKA 5JCGA 2L4CA 1O73A 3N5OA 5IO2A 3EU3A 2OE1A 1K3LA 5F05A 3TKSE 2LV3A 1WIKA 1UC7A 1E2YA 3RPPA 1SYRA 4Q5NA 3KCMA 1Z6NA 1MDIA 5G30A 4WBJA 3LGCA 4D73B 3RPNA 4XS4A 3I6AA 5HQPA 4NAXA 4MJCA 2YJHA 4IGJA 1TK8B 2XPDA 4OWYA 2PPTA 1J08A 4GLTA 3QD9A 5D73A 1K0NA 3HY2A 5GSSA 2OADA 4EO3A 4ZBAA 3FRCA 1R7HA 4D73A 4Q5QA 2VCTA 5CYYA 1ZYQB 1YJ6A 1Z7RA 3J7Yb 2WJUA 3MSZA 5ELAA 3GYKA 1ZZYA 5AN1A 2B1LA 3KP9A 5CAXA 5L71A 1GNWA 5JWQB 1VF4A 3BD2A 2B7JA 3M0FA 1W4VA 1XZOA 3F4RA 2C3TA 5C00A 3BBYA 3C1RA 5DALA 2E2MA 2H6XA 2LJKA 4L0WA 1KTEA 4XTSA 5IMZA 3VPQA 1WPIA 4CHSA 3NIVA 1GLPA 4K7OA 1A0RP 4L5OA 1WOUA 1KNGA 1S3DA 5FWGA 2OE3A 5ABRA 1GSUA 5IOXA 4ZBBA 2G0FA 1M2AA 2H0HA 1F3BA 3GX0A 4TXOA 3HYPA 2H8LA 3GV1A 3HZ8A 3C7MA 5IPGA 4E8HA 1AQXA 5DAKB 4V2NA 2QSIA 3ZRDA 4ZB8A 2V1MA 1BYEA 2R5GA 4K8MA 4GRFA 2WS2A 2L5LA 3N9JA 3GMFA 3ZIVA 1SYXA 1SL1B 5B6NA 4MZBA 4ID0A 1FG4A 4YAPA 2ZNMA 3RAZA 4J56E 4DEJA 5FHIA 2GZZA 2HLSA 3L9VA 2L5OA 1XWAA 4PNFA 1V57A 1YY7A 4F9ZA 1EOHA 5CP1A 4BVXA 1LBKA 4ML1A 1OC9B 5HR1A 2DJ2A 3CTGA 1MD4A 1OE7A 1OE8A 3GNJA 3A3TA 3KMOA 3TDGA 1K0AA 4MF6A 3NZNA 2GS3A 3TB2A 2AUVA 4KB3A 1FVKA 1PQNA 3GL5A 4EE0A 2C0EA 2VD0A 4K2DA 3LXTA 4BA7A 2WRTA 1GWCA 2VCWA 3ZFLA 4O32A 1PX7A 4XCSA 1I5GA 1A2JA 1ACVA 3TKRA 2VL2C 2JSYA 5G1LA 1Y6EA 3QAWA 2DMLA 2LQOA 3ZLPA 3CSIA 2YPMA 3EINA 2C0FA 3GKXA 5ECQB 3CTFA 1B8XA 6GSSA 2JU5A 2I81A 1TW9A 1GTIA 1LU4A 1DUGA 4HQZA 2WFCA 4HZ4A 1WP0A 3UEMA 4V2MA 4JR6A 4KSOA 2H30A 1TRSA 2O8VB 4PURA 4N11A 4L0UA 3Q19A 5GAPD 3KXOA 2E7PA 2VL3A 2H66A 3CBUA 2RUFA 3KTLA 4WF5A 2B5XA 1EV9A 4MPGA 3HVVA 3DVXA 1T4ZA 3VWUA 5ELGA 4WEYA 1AIUA 4ZL7A 2K8VA 2FHEA 1Q98A 5IIZA 1SL2B 5KN3A 3QPMA 3APOA 2JZTA 4AJ6A 1GTBA 1B9YC 3UVTA 2YJ7A 2C0GA 3QAVA 3IR4A 4TKYA 2CA8A 5DCHA 4WETA 3KH7A 3JCML 5J3RA 5IO0A 3ED3A 3VPTA 3IRAA 1J0FA 5DDLA 3F63A 4XS1A 1YQ1A 1PKZA 1URMA 2B5EA 3A5WA 1GSFA 1A23A 4DSQA 1ZOFA 2IMDA 4NHWA 1JZRA 3GIXA 4WR5A 1XCCA 2IFQA 3IOSA 4KGIA 1JZWA 4DVCA 2AJQB 11GSA 1GL8A 5B8AA 2KOKA 1C72A 4JU5A 1O85A 4HS1A 1Z7PA 2H74A 5ID2B 2YWMA 2DJ0A 2ES7A 2IJYA 1MD3A 2N5AA 2I3YA 3DGQA 2JZRA 1GNEA 2CV4A 3WGDA 3FEUA 1T1VA 3EE2A 4YAVA 5KN2A 2MBTA 5E4WA 1X5CA 2VM2A 1Q4JA 2E0QA 1Y25A 1BQ7A 1EGOA 1EV4A 1AQVA 4WXTA 4XIHA 1SENA 14GSA 4I8BA 5CNWA 4HU9A 1PL1A 3VWXA 3ME7A 4IN0A 2GLRA 4PGTA 4KUNA 2HYXA 1WRYA 3GKKA 2IMFA 2FLSA 1GSQA 4GXZA 4AGSA 2DIYA 2WZ9A 4G19A 1VF2A 3EWLA 2GZYA 2KHPA 3KGKA 3P8WA 3WD6A 5CRWA 1SL0B 4ECJA 4L5LA 1EEJA 1MTCA 1JFUA 1VRSD 2L59A 4PQ1A 4IP6A 4ZL8A 1Z9HA 3UL3A 2P5RA 4Z7XA 5KN0A 1K0CA 1MDKA 2YANA 5GZZB 2PBJA 1XW9A 1PL2A 1V58A 2LRCA 4V1Ap 1S3AA 2N5FA 3DWVA 4Q5FA 4JR4A 9GSSA 4IHUA 1A8LA 2AV4A 2FA8A 2C8UA 1QK8A 2LKUA 2QGVA 2P0GA 2LQQA 3G7IA 1X9SB 1AUCA 4QL7A 3ZVJA 2K18A 2AYTA 4BWQA 3TKSC 3QOUA 2AHEA 2H01A 1WWJA 4EL1A 1X9WB 1SK2A 1U87A 3GRXA 4WBRD 3M9JA 6GSYA 4MJEA 2F3MA 3ZITA 1SKSB 5ECPB 1ZMAA 2K9FA 1XWBA 2TRXA 3Q6OA 1TJDA 3KJYA 12GSA 1WJKA 2CVDA 2CX4A 3TKPA 2WGRA 3MWHA 5H5SA 2C3QA 5F8BA 4TXVA 1OYJA 4V1Ag 4MJAA 2CAQA 4BL7A 2PU9C 5GSTA 2LNTA 2O7KA 2FGXA 3H1NA 3GUSA 3VWVA 1EZKA 1GRXA 2GGTA 4K7NA 1YF0A 2JL4A 1G7EA 3MAKA 1YZXA 3F6FA 3VWWA 1M9BA 4AF2A 4F82A 2VCXA 2AAWA 5HR0A 2VD1A 3F9UA 2BJXA 3QMXA 3GHAA 1F37A 5D9WA 2CAIA 3G7JA 1T8EB 5ECSA 4XS4B 2FA4A 2IMEA 4NWYA 3IK7A 1DE1A 2NPBA 2CZ2A 2LRTA 3WT2A 2OKAA 2F8AA 1X5DA 1TKDB 3DVWA 4K6XA 1ML6A 1EWXA 2VL9A 1N8JA 5D9XA 4KE3A 1DE2A 3AY8A 1M9AA 8GSSA 4GTUA 4JEDA 4J57E 4ZIJA 3D0ZA 3I9V2 1O6JA 2GSQA 3FK8A 1ERWA 1NM3A 3VI5A 1SJIA 2GQLA 2EC4A 2XBQA 4FO5A 4OFNA 3GN3A 4NV2A 5DALB 4KCAA 3L0HA 4ZXGA 1XWKA 3C8EA 5HFIA 4TR1A 3WGXA 5D8IA 1K0OA 3KP8A 4XS6A 3IXRA 1TDIA 1LJRA 2IN3A 4P3YB 1H4OA 3W8SA 3LJRA 3UJ1A 1HNAA 2LEGA 4TRXA 2H0GA 2OE0A 3LYPA 1SJZA 1TI3A 3LORA 4TXOB 4JE1A 2YWIA 2F51A 5IMFA 3BCKA 2JADA 1VF1A 3IC4A 17GSA 4HEA2 4EXJA 2DSAA 3FKFA 18GSA 3A2WA 2O85A 3PGTA 4GSSA 4PUFC 4PQIA 3TUEA 3FYGA 4ZB6A 4OCFA 2FD3A 1THXA 1SK0A 5AIVA 4MH3A 3HA9A 2DJ3A 4MABA 1HD2A 2RIIA 1RW1A 13GSA 4IJIA 2DBCA 1GLQA 3ZTLA 3UBKA 3HJPA 3C1SA 2R3XA 2K8SA 1VF3A 4IVFA 4NMUA 3QDNA 1V2AA 4ILFA 3M8NA 2ALBA 3DIEA 1TP9A 2GSTA 5D93A 3D4MA 3QFAC 2H76A 2JACA 2VCZA 2NVLA 3KD0A 2JZSA 2C80A 4LMWA 3ZL5A 1U3IA 4PQHA 2YZHA 1QFNA 5LD0A 3F6DA 2DIZA 2E2GA 4LLRA 5J41A 2HRNA 2VLTA 1BX9A 1TRVA 2H1BA 5IM9A 5DQSA 5EY6A 2HSHA 1Z5YE 2VIMA 20GSA 1BJXA 1X9MB 3BCIA 3NOFA 4GF0A 1OVNA 5A4UA 1JLWA 3Q74A 5EVOA 4ML6A 5DJLA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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