3HVVA

Escherichia coli thiol peroxidase (tpx) peroxidatic cysteine to serine mutant (c61s)
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
SQTVHFQGNPVTVANSIPQAGSKAQTFTLVAKDLSDVTLGQFAGKRKVLNIFPSIDTGVSAASVRKFNQLATEIDNTVVLCISADLPFAQSRFCGAEGLNNVITLSTFRNAEFLQAYGVAIADGPLKGLAARAVVVIDENDNVIFSQLVDEITTEPDYEAALAVLKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli k-12
publication title Structural changes common to catalysis in the Tpx peroxiredoxin subfamily.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol peroxidase
total genus 52
structure length 167
sequence length 167
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-06-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3hvvA00
2DJ2A 4F82A 2H75A 4KUNA 1O73A 2OBIA 3SBCA 3CXGA 2VL3A 5IMVA 3J7Yk 4E8EA 1O7UA 1WMJA 3HZ8A 5DQYA 1OE8A 4KA0A 3Q19A 3WGXA 4WF5A 4X43A 5DVBA 2O85A 1R7HA 3SWLA 1OC9A 4GSNA 5GSTA 3ZIVA 1GSUA 3LJRA 3GTUA 3M1GA 3NOFA 1JZWA 4MPFA 3GUSA 1EOHA 4N11A 4GRFA 3ZMKA 3CYNA 3APSA 1K0NA 1O85A 2X99A 4WBRD 1FAAA 1V57A 1YQ1A 2IMDA 2OADA 1ON4A 2V32A 3C1RA 5ABRA 3IDVA 4LL1B 3MAKA 3IXRA 3F63A 2YJHA 1WP0A 4EC0A 3VK9A 5ID2A 1EGOA 1SD8A 2RIIA 2IN3A 2GVPA 3LSZA 4MPGA 3KTBA 1OC3A 1X5DA 5DJMA 2DJ0A 1V9WA 1ZZYA 1Q4JA 2YWNA 1F9MA 4XRAA 1TU8A 4BWSA 1U3AA 2WDUA 2H73A 1UVZA 1Y25A 1WRYA 2YCDA 4HZ2A 4J56E 2HSHA 1OE7A 4KDUA 3VWWA 1GNWA 1A23A 1SU9A 2FGXA 1XZOA 1FO5A 2JL4A 4J57E 2I1UA 3I6AA 2AHEA 3GKKA 2WZ9A 2XBQA 3LWAA 3RHCA 3TKSA 2H0GA 2IWTA 2L5OA 5LD0A 3RPPA 4MA9A 2CV4A 3APQA 2V41A 1N8JA 3M8NA 4EUYA 3WD6A 1UA5A 5JWQB 5JWOB 3ZIJA 2VLUA 2OA7A 5JWRB 4IELA 3MSZA 3P8WA 2E0QA 4MJEA 1XCCA 4MF7A 3UL3A 2GSRA 1EV4A 4AF2A 3W8JA 5DDLA 2VM1A 2DJKA 1XWBA 3W6GA 1SK1A 5J9CA 1R26A 1XPVA 2R2JA 3WGEA 3HD5A 1TDIA 3H1NA 2GT5A 5D8IA 5IOXA 1PX6A 4PUFC 3CSIA 3EMXA 1TRSA 5GAPD 1FB6A 3ERWA 2C0DA 3O6TA 2B7KA 4HU7A 1O8XA 1EEJA 5CNWA 1ZYQB 5F05A 3H8QA 2KP2A 3UMAA 4JZQA 1AIUA 5G2ZA 1GTUA 2RLIA 4ECCA 3LGCA 6GSVA 3IK7A 4EDZA 1R4WA 2QSIA 3QAGA 3VWUA 2QGVA 3ZL5A 3KM6A 1K0CA 3KP9A 4X0XA 5ECRB 2P5QA 1XVQA 4I6XA 2VCZA 3QFAC 5J5NA 2YN1A 4Q5NA 3FRCA 1QUWA 2RUEA 3C71A 3ISOA 5G5EA 5IO2A 2GGTA 4AJ7A 2O8VB 3HJMA 2KP1A 3F3RA 2L6CA 1M2AA 3G7IA 2MBSA 3KEBA 3PH9A 2LKUA 3FR6A 4TXVA 3HJPA 1K3YA 5EY6A 4V2LA 4FIWA 4G19A 2GSSA 4IJ3A 4N0VA 1BEDA 2H19A 5C04A 1SJZA 3M9JA 14GSA 5ECKB 4JEDA 3UJ1A 4PNGA 4IHUA 5ECIB 1WWJA 3PR8A 2AB6A 3IC4A 4WF4A 1T7PB 4XRDA 2LJKA 4POLA 1DUGA 4KB3A 4TXOB 5CRHA 1M9BA 1TOFA 2I4AA 2CVBA 2N5BA 2HT9A 1OKTA 1XFLA 3EMPA 1YEXA 5D9TA 5KN3A 2M72A 1B48A 3BBYA 5DCGA 4IW9A 3FW2A 2VIMA 4CDOA 5ECNB 5B6NA 4GCIA 2H30A 2K9FA 4LL4B 1KEBA 1SD9A 3HCZA 6GSXA 3ZTLA 3GH9A 1B4QA 4O7HA 1VRSD 3O76A 3ZLPA 3DD3A 2X8GA 1JZRA 1Y6EA 3QAWA 3IPZA 2B5EA 2VCTA 2L59A 1AQXA 2O89A 4XTSA 1TRUA 1SL0B 1B8XA 4HI7A 5COHA 4ML1A 3D6IA 5CP1A 2F9SA 2WJUA 5J9BA 5F07A 4FO5A 3ZITA 1S3AA 5IMDA 4PURA 3GKXA 3LFLA 2QKEA 1A8YA 2HE3A 1ABAA 2VUPA 1JZDA 5F06A 3TJFA 3APOA 1K0OA 4XHMA 2LSTA 4D73B 3UBKA 4ZL8A 1X9WB 2PBJA 4WETA 1A2JA 4V1Ap 2ALBA 5KN0A 3GV1A 5G30A 3IBHA 1TK5B 2GT6A 1GNEA 2QC7A 3IA1A 1GTBA 5D9WA 5G1KA 1NW2A 1RK4A 1K0BA 1J0FA 4POBA 5E59A 1YY7A 3QPMA 1IYHA 4MF6A 5CRDA 1JHBA 4OCFA 1M7TA 2VLTA 4KE3A 5DALB 1VF4A 2CQ9A 5ECSA 1SKSB 1G6WA 4L0WA 4GWRA 3QD9A 4DSSB 2C80A 2H0IA 2IIYA 5ECPB 3IAS2 2MYGA 3ZVJD 3BCIA 1AQVA 1TP9A 2TIRA 2E2GA 2B1KA 2YP6A 4N10A 2I81A 4NHZA 1TK0B 2HZEA 1FHEA 1OVNA 4PGTA 3FYGA 2IFQB 1T4ZA 1BX9A 4IGJA 3OR5A 2EIOA 4GSTA 3DKSA 4BL7A 2F51A 4N30A 8GSSA 2JU5A 4GF0A 1YJ6A 4K0NA 1XIYA 5KEJA 1K0MA 2CZ2A 2ZNMA 4I2UA 2TRCP 1K0DA 1Z5YE 4WKWA 1PRXA 1FW1A 1XWCA 2OACA 3CMIA 5IQYA 4YQVA 3ME8A 2PUKC 3TUEA 5HR0A 3UEMA 5J4UA 1WPIA 3EURA 1WOUA 1U88A 6GSUA 1Z7RA 2PN8A 4V2MA 3FKFA 1XW6A 1EP8A 1FG4A 4XS4A 4IP6A 3A2XA 3JCML 1GUMA 1B9YC 2H6XA 2MZCA 5LNKe 1HD2A 4L5LA 1F3BA 2KLXA 2C3QA 4NV5A 3IV4A 1OC8A 3L9VA 1RQMA 4MZBA 2AV4A 2GZPA 4ISDA 5EPFA 1EP7A 1I9DA 2FY6A 1A0FA 4DSRA 5A4VA 2OBKA 3PGTA 3UOMA 2MMZA 5HQPA 1KNGA 1EGRA 1XW9A 5IM9A 3HDCA 4G9HA 3TOUA 1BG5A 3G9BA 11GSA 3I43A 1M0UA 3FZ5A 3DEXA 1GSYA 1OAZA 1TK8B 5JCWA 5A4UA 3TJKA 3F4RA 2CT6A 5EL8A 4IKHA 1PL2A 3QCPA 4KW6A 3EYTA 2ES7A 1QQ2A 1GSQA 2LJAA 4CHSA 4IN0A 2PU9C 4TN8A 1GLQA 2G2QA 2C0EA 3ZFBA 1SYRA 4ECBA 5A4WA 2NDOA 2CVDA 3FEUA 4K0GA 1SL2B 2YV9A 2LJRA 3A5WA 3VFIA 5J3RA 3RPNA 3HXSA 3NIVA 2N5AA 3VPQA 2REMA 1G0TA 2H8LA 3DGQA 2XPEA 2CX3A 1YKCA 4HS1A 2L57A 3DWVA 3TKRA 2FLSA 1NSWA 1F6MC 2HRFA 2OJLA 5F8BA 1FVKA 1MDKA 3F6DA 1T3BA 2IL3A 1Z9HA 2EIRA 4ZXGA 1ZGNA 2AUVA 4LMWA 2YANA 3QDNA 4L8EA 1X9SB 4MDCA 5IPHA 2LNTA 1OC9B 3GA4A 2M46A 1TU7A 4GTUA 1EEMA 2E7PA 2FA8A 1IYIA 3DMLA 5CRWA 3VURA 1Z6MA 4OCEA 5JCUA 3LXZA 3IR4A 2VD1A 4TR1B 1EZKA 4RI7A 4WBJA 2K6VA 2YV7A 2IMKA 4O92A 1XW5A 2PGTA 1ERTA 3EU3A 2BTOT 3KJYA 2F8AA 2LUSA 10GSA 5IMCA 3KXOA 20GSA 3TKQA 4G2EA 5DJLA 4BPYA 2GLRA 4MABA 2OE3A 4OFMA 1KBNA 3S9FA 4TKYA 1GSFA 3LG6A 4EL1A 3RAZA 1MDIA 1DE1A 2FWEA 2V6OA 3GNJA 5EVOA 2C3NA 3KZQA 1MTCA 4WEYA 5H5SA 4IJIA 2GS3A 3O3TA 1TW9A 4PXOA 3UVHA 3DYRA 3GRXA 2A4VA 2C8UA 2VOCA 3HY2A 3QAVA 1SK2A 4HUAA 5CO3A 4JRRA 2LQOA 1NHYA 2CZ3A 2RM5A 2H1GA 2B6MA 2GQKA 3UAPA 1V40A 2B5YA 4EO3A 1Z3EA 2PVQA 2FD3A 2GDRA 1X5CA 2FNOA 2B7JA 3KD0A 3E0UA 1DBYA 3A3TA 4NXIA 3GSSA 3QR6A 1ILOA 1THXA 4ZL9A 3VLNA 3VWVA 2CAIA 5J41A 1J9BA 1ZMAA 4AGSA 1EWXA 4MJCA 3K8NA 4F03A 4TXOA 3CTFA 4F0BA 2EC4A 3TDGA 4EKZA 1T00A 2B1LA 2E2MA 2MMAA 1VGLA 1AW9A 4TR0A 5IIZA 3D5JA 4LLRA 3VI7A 3WT1A 1Q98A 2JADA 4JR4A 1NM3A 2OKAA 1GSDA 3L0HA 5IOWA 5D96A 4XS6A 5B7CA 2H1BA 4PNFA 2D2ZA 4IP1A 2YWMA 3UBLA 2HZFA 2DMMA 1THOA 2WS2A 16GSA 1BJXA 1UC7A 2JSYA 1E2YA 2YJ7A 4OO4A 4HDEA 1AAZA 4TR3A 4K2DA 2DIYA 4NHWA 2AJQB 2KHPA 4BA7A 1BAYA 3IHQA 1VF3A 3ZZXA 3C1SA 1X5EA 4MLYA 2JZTA 4K9ZA 1PD21 2DMLA 4FH8A 1GH2A 4ZL7A 3WGDA 2WULA 1T4YA 3Q74A 4D73A 4CW9A 4LMVA 1CQHA 1U3IA 1G7OA 2J23A 2IPAA 1SJ6A 4HZ4A 2YPMA 2AYTA 4K8MA 1MD4A 2DBCA 3TKPA 3TJBA 2F3MA 5FT3A 1K3OA 1W4VA 2HI7A 4HEA2 2XPDA 3CSJA 3F8UA 1XWKA 2ZCTA 4KDXA 2YWIA 1JLVA 2RM6A 5C00A 1TTZA 1HNAA 5KN1A 3KMOA 3A2VA 3FZAA 2R5GA 2X8CA 3F4TA 2IMEA 2C3TA 4QQ7A 2HXKA 5ELAA 6GSSA 5ECOB 3D0ZA 3IK9A 1PGTA 4ML6A 3P90A 5FHIA 3N9JA 6GSWA 1OYJA 3N5OA 2VCVA 4KSOA 2LQQA 2HRNA 5H5QA 2G0FA 3BJ5A 4ZBAA 3FR3A 2IMFA 5ECHB 3U5RE 4IS0A 3ZREA 3TKSC 5KN2A 3PINA 5FWGA 2R3XA 1PSQA 2IFQA 1QXHA 3DVXA 3GX0A 3FY7A 1GSEA 4TR4A 2VM2A 2XC2A 1AUCA 1TRVA 4K1FA 1K0AA 2LS5A 2JZSA 3R2QA 5HR1A 3TRXA 2ON7A 4PUAA 3HHVA 4DEJA 1JFUA 3GN3A 4KNDA 5GAND 5D9XA 5IMFA 3UVTA 5DCHA 4NWYA 4ZIJA 1QFNA 3G7YA 2X64A 4TOPA 5IMZA 4AJ6A 3V1WA 1HYUA 3US3A 2B3SA 2LNSA 4MZWA 5D73A 1U6TA 3LORA 1PL1A 2C0FA 2LEGA 3G7JA 3FK8A 2I3YA 3FZ9A 1MEKA 1ST9A 1GWCA 3GKMA 9GSSA 3H4KA 4WR4A 5ECMB 3GURA 5DAKA 2L4CA 3EC3A 2WRTA 3ERFA 2DJJA 2YWOA 1T8EB 4I5QA 4ACSA 1FB0A 5E4WA 1NHOA 4PQIA 4ZB6A 2VL9A 2PVOC 2GZZA 4OD7A 3FHKA 2C1YA 4I2TA 2XHFA 1ACVA 2R4VA 3ZFLA 1A0RP 4EDYA 1RW1A 5GZZB 1F3AA 4RQXA 1LU4A 1UN2A 2YZUA 2VLVA 3LYKA 1X9MB 1ERWA 2X8HA 2MMNA 4KX4A 3RBTA 3I69A 5AIVA 2HZEB 3HVXA 4H86A 1VF1A 2YNXA 5IPGA 2ZUPA 2GQLA 5CREA 4Z7XA 1TI1A 13GSA 1SJIA 1FVJA 2FWFA 2MMOA 3RDWA 3W8SA 4ILFA 4HQZA 3IE3A 1O81A 4IBPA 4KDYA 3ME7A 4JBBA 2PPTA 1R5AA 1DE2A 3IRAA 4OO5A 3TOTA 2VAFA 3UIWA 5ECQB 3F3QA 4I8BA 1ERVA 1JLWA 3J7Yb 4EF0A 4ECIA 2V6KA 2OE1A 2GZYA 2H70A 3A2WA 1H4OA 3EWLA 2DC5A 4GQFA 2H01A 4E8HA 2A2SA 1S3DA 4NPBA 3CRUA 4F9ZA 2BJXA 2CAQA 4EVMA 2K8SA 3M3MA 4PX1A 4XS4B 1AQWA 5AGYA 1PA3A 3MWHA 1URMA 5AISA 3KMNA 3HJOA 4TVEA 1U87A 4GSSA 4TR1A 3ZVJA 2Z9SA 2PERA 1K3LA 3BD2A 4MF5A 4OWYA 3F9UA 2FA4A 1AC1A 1XXUA 1EOGA 1XOAA 3Q18A 4ECJA 3CBUA 4IQ1A 3GSTA 3HVSA 5CRGA 3HVVA 1SKRB 1M2DA 4GQCA 1USBA 5ENUA 5H5RA 1A8LA 4K7OA 4DSQA 2IJYA 4XS1A 2H6YA 1QK8A 1V2AA 3GKNA 5INYA 3TJGA 2L4QA 4MH2A 2GTUA 1GTIA 4K6XA 4MK3A 3GTUB 3MDKA 1X0RA 3AY8A 4L0UA 1GLPA 1ZYEA 4POMA 2WB9A 3E3EA 2B5XA 1TI3A 1SENA 1GUHA 1PKZA 2NVLA 17GSA 2V2GA 1TJDA 1PX7A 3WYWA 2LRNA 4KAEA 2H1DA 4HJMA 2M80A 1CQGA 2CVKA 3TCOA 1GSSA 2P5RA 4Q5FA 2V1MA 2LRCA 4ZILA 2DJ1A 4KCAA 2EIQA 1GULA 3NZNA 2VL2A 4XIHA 2FHEA 2TRXA 5ID2B 1C72A 2O7KA 3E9JB 1DSBA 2K8VA 2LRTA 1WE0A 5DBQA 3IOSA 2FWGA 4N0ZA 1F2EA 5B8BA 19GSA 2A2RA 1SK0A 1SKWB 1YKAA 2JACA 4G10A 2JSZA 1M2BA 5ELGA 2NTOA 2VCXA 3P2AA 3I9V2 2DSAA 1OKDA 2FCHA 4NMUA 5ECLB 1H75A 4FYCA 4Q5QA 4OMVA 3GX8A 5AN1A 4OFNA 2GSTA 1GRXA 3L78A 2L6DA 5AIXA 1F37A 4LA1A 7GSSA 2WGRA 2H66A 2WFCA 1ML6A 2HSYA 1GP1A 1BYEA 5GSSA 2KOKA 3L4NA 2H6ZA 1A2MA 5G1LA 2YOIA 4BVYA 1TXXA 3DXBA 4FYBA 3DRNA 4RQRA 3D4MA 3L9UA 4WXTA 3D22A 3CTGA 2JZRA 3H93A 4GXZA 2CA8A 1GUKA 4F2IA 12GSA 4RI6A 1ZL9A 4QL9A 1M9AA 3FZ4A 3ZYWA 1GTAA 1ZOFA 4NAXA 3BCKA 3C8EA 3KTLA 1E6BA 5F0GA 2H0HA 4F0CA 3TRQA 2O87A 2R37A 2HNLA 1PN9A 2I9HA 3GFKA 1YF1A 4J2FA 4WR5A 3QMXA 5A5KA 3GIXA 2FUG2 1YF0A 4PQHA 5IMAA 1PMTA 3CSHA 1XWAA 3EU4A 2XBIA 3GL5A 2RUFA 1ZCPA 4FYUA 2P0GA 4IQAA 1N2AA 3GMFA 2HLSA 4V2NA 2J9HA 4KCEA 4K7IA 5HFGA 4KH7A 1W89A 3KCMA 4HQSA 4K7NA 4EXJA 1TKDB 2H74A 3RHBA 1Z6NA 3KH7A 6GSYA 1WJKA 2VCQA 1MD3A 2K18A 18GSA 1B4PA 3VWXA 3EINA 4OFTA 5G31A 4MZCA 3TRPA 1JZOA 4GLTA 3KP8A 3ERGA 5LCZA 4ZBBA 3VI5A 1G6YA 4YQUA 1A24A 3QOUA 2WCIA 4O5RA 2NPBA 1LBKA 2F8FA 3M0FA 4BVXA 1Z7PA 1A2LA 1PKWA 4O32A 4Q5RA 2H71A 5HR3A 3CRTA 4HU9A 2DIZA 3KH9A 4KGIA 1I5GA 4NV2A 2IMIA 5DALA 4HJ2A 4MJAA 5HFKA 3GYKA 2DLXA 3GHAA 4V1Ag 1YEPA 1LJRA 4DSSA 2N5FA 1PQNA 2C4JA 1TRWA 5D9VA 1GL8A 1HQOA 5JCGA 22GSA 5DQSA 1VF2A 3LEFA 4X1UA 6GSTA 1S3CA 1XWGA 3TGZA 5L71A 1MDJA 2VD0A 1QMVA 3IAM2 3TKSE 2H76A 2NBSA 3WT2A 1EV9A 5CYYA 1SYXA 4IVFA 5D93A 4YH2A 1HNBA 3UARA 3DVWA 4HOJA 4MMMA 3F6FA 1SL1B 2VL2C 1XVWA 3DIEA 2GSQA 4TW5A 4MCUA 4ID0A 4RUVA 1G7EA 3EVIA 2P31A 3HZ4A 4TRXA 4JU5A 2C0GA 5HFIA 2H1AA 3KGKA 4MH3A 2KUCA 1B9XC 2L5LA 2YZHA 4ZB8A 2VCWA 3HA9A 4XCSA 5IO0A 4DVCA 2LV3A 1YZXA 3D4TA 3BOAA 2R6KA 1KTEA 3M9KA 3MNGA 5CAXA 4YAPA 3D21A 3F4SA 1V98A 2HYXA 4EE0A 4AJ8A 5G5FA 3KIJA 3ED3A 4JE1A 4ZB9A 3LQ7A 2FWHA 2VO4A 3GH6A 2BMXA 3QFBC 3EE2A 3VPTA 5B6MA 3P7XA 2DJ3A 1V58A 3TJJA 3Q6OA 1O6JA 2CX4A 2PMTA 3L9SA 1AXDA 4MP4A 2PWJA 1FOVA 2HFDA 2AAWA 3GL3A 3LYPA 4P3YB 1J08A 1HNCA 2H72A 1XOBA 4JR6A 4ULXA 3HKRA 4MJBA 4POKA 4ZBDA 3ZMLA 3C7MA 4L5OA 3F0IA 1XBSA 2MBTA 3FR9A 4YAVA 3TB2A 4KSMA 5HR2A 2GQMA 1ERUA 4BWQA 1YDKA 1T1VA 1M99A 4PQ1A 4QL7A 4I97A 3U6VA 5DAKB 2OE0A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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