3HVXA

Escherichia coli thiol peroxidase (tpx) resolving cysteine to serine mutant (c95s) with an intermolecular disulfide bond
Total Genus 52
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
52
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
SQTVHFQGNPVTVANSIPQAGSKAQTFTLVAKDLSDVTLGQFAGKRKVLNIFPSIDTGVCAASVRKFNQLATEIDNTVVLSISADLPFAQSRFSGAEGLNNVITLSTFRNAEFLQAYGVAIADGPLKGLAARAVVVIDENDNVIFSQLVDEITTEPDYEAALAVLKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli k-12
publication title Structural changes common to catalysis in the Tpx peroxiredoxin subfamily.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol peroxidase
total genus 52
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence B, C, D
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-06-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3hvxA00
3TGZA 1SK1A 2OADA 4ZB8A 2V6KA 3GSTA 2V41A 3IC4A 2LNTA 3I9V2 1N8JA 2LJRA 1V2AA 2WZ9A 1TOFA 3GN3A 1CQGA 3BD2A 1S3DA 3FY7A 3GKNA 4IVFA 1A2LA 3TKQA 3KD0A 4ZB9A 3US3A 1GULA 2HLSA 2X99A 3KEBA 1NHYA 4FIWA 1XXUA 4XS6A 4PURA 3ZREA 2JSZA 3QFAC 5DQSA 1EOHA 2CA8A 4JU5A 3LXTA 4OCFA 2F8AA 2VLVA 3GL5A 5D9TA 3ZVJD 4KCAA 5G31A 1VGLA 2L4CA 1KTEA 3ZIVA 2C0EA 4DSRA 5IMCA 1OAZA 2JADA 5ECSA 3VWVA 3WGEA 2ZCTA 4JZQA 2IL3A 1PMTA 1EWXA 3KXOA 4WR5A 2KHPA 4POMA 5DVBA 2DMMA 2FWEA 3WGXA 3CYNA 2ES7A 2XBIA 1EEJA 3LORA 3ZZXA 3FW2A 2F3MA 3IAS2 5HR1A 2KOKA 4FYBA 1TRUA 1OKTA 2JU5A 3DGQA 3ZMKA 2GSTA 3Q74A 3GYKA 2WDUA 2K6VA 1TK8B 1WOUA 3V1WA 3IA1A 1FVJA 1XWKA 2C4JA 2C80A 2GZZA 4GLTA 4WF4A 8GSSA 4MF6A 4TRXA 2YN1A 2YP6A 4TW5A 5DAKA 2HFDA 4RI6A 4NHWA 2EIRA 2OE0A 1KNGA 4DEJA 4GSSA 1OYJA 2QGVA 2IMKA 4HU7A 2LJKA 1ERUA 1H4OA 1TKDB 1QQ2A 4K9ZA 1JZWA 5A4VA 5JWOB 2YZUA 3C71A 4V2LA 2WULA 1SL0B 3QAVA 3DKSA 4OMVA 5G2ZA 3TOTA 4YAPA 3KP8A 3QAGA 2I1UA 4EUYA 2R4VA 4HUAA 1J9BA 3FR6A 3HCZA 2CX3A 1SENA 2OE1A 4NV2A 1DE1A 1R7HA 4Q5QA 2VLUA 4IQ1A 1AAZA 5GAPD 4XCSA 1XOBA 4HOJA 1O6JA 1ABAA 1FOVA 3VWWA 3EINA 1SK0A 2XC2A 2HYXA 2O89A 5ECHB 3ERFA 5J4UA 3M8NA 4KSOA 4CDOA 1PRXA 4IP1A 3L9SA 2J23A 3HYPA 1K0CA 1WE0A 1M2BA 5J5NA 2HRFA 2LUSA 2MMOA 2M72A 1G7EA 2R5GA 4XS1A 4JEDA 4N10A 2QC7A 1V98A 5IMDA 5D9XA 1ERWA 2HI7A 2YOIA 3APOA 14GSA 3HY2A 5HFGA 3DEXA 3K8NA 4F0BA 3I43A 1SJ6A 2H1DA 3HD5A 4N30A 4TKYA 1SYXA 2YWMA 3M9JA 1JLWA 1ST9A 1XW6A 5ELAA 5A5KA 4KNDA 4L8EA 4HZ4A 2A2SA 3TB2A 5AISA 2L5OA 6GSVA 3GSSA 4G9HA 1OC3A 1R26A 1K0OA 3TCOA 1ERTA 5E59A 2QSIA 3BCIA 2AV4A 2DC5A 1V58A 3TRPA 2FHEA 2H76A 2YJ7A 2C0FA 1PA3A 1XVQA 3RPNA 3QD9A 5D8IA 4ZIJA 4PQHA 1XWBA 1TK5B 5LD0A 3ME7A 1M9BA 2AB6A 1GNEA 5D9VA 5IMFA 2P5QA 1PSQA 1A2JA 1GSYA 3F63A 3KP9A 3P7XA 5ECOB 2X8CA 22GSA 4JBBA 1MD3A 4YH2A 2YCDA 2CZ3A 1XZOA 3DIEA 1YKCA 5ABRA 5IMVA 2C0DA 5FHIA 2AJQB 5D9WA 4WXTA 4PXOA 2I81A 2VCXA 2GVPA 5CRDA 3VPQA 3IOSA 1ILOA 10GSA 5LNKe 3P8WA 4X43A 3CMIA 3GL3A 1A8YA 4POBA 4BVYA 2GQLA 3KMOA 2CZ2A 5B6NA 2YZHA 1G6YA 1GLQA 1U3AA 4EXJA 3W6GA 4GSNA 2GLRA 4YQUA 2REMA 3N9JA 2IMIA 3GX0A 1VF1A 1GRXA 2IMFA 2PERA 2GQKA 4IELA 4XIHA 1KBNA 1K0NA 1LU4A 1S3CA 3QDNA 2MYGA 4MK3A 4P3YB 2EIOA 1HNCA 1ZMAA 2Z9SA 4EC0A 4KE3A 4FYCA 4HQSA 4EE0A 4JR6A 1GWCA 1Z6MA 5ECRB 1GSFA 1EV4A 12GSA 3KJYA 3GNJA 4BL7A 1XBSA 2XBQA 2KP1A 5H5SA 3U6VA 5IPGA 1BYEA 2HZFA 1PL1A 4IBPA 1M99A 1SD9A 5IPHA 3HZ4A 2R3XA 3O76A 1OC8A 5IMAA 3LWAA 2VD1A 1Q4JA 4HU9A 1B4PA 2BTOT 3L78A 2HZEA 1Y25A 2MMNA 3WGDA 4GWRA 1NW2A 5B8AA 2FY6A 2JZRA 2CVKA 4PQIA 1FB0A 1PKWA 1XIYA 4RI7A 1GTIA 1MDKA 1A0FA 3NIVA 5G30A 1W89A 5IQYA 1SU9A 3EU3A 3KZQA 1XWGA 2D2ZA 1WWJA 2LEGA 2F8FA 2BMXA 3P90A 5HR2A 1XFLA 4ML6A 5ECLB 3CSHA 4IKHA 3DVXA 3GRXA 2H72A 1N2AA 4HDEA 4KGIA 4OO4A 3IXRA 1VF4A 1SL1B 1T7PB 2MMAA 3GHAA 3VURA 3A5WA 1SKWB 1VF2A 4WETA 1JZRA 2V32A 2WCIA 1BG5A 4OWYA 1TU7A 3CTGA 1Z7PA 2TIRA 3HJOA 5COHA 3ZMLA 1G7OA 4XS4B 3RHCA 1V57A 1EV9A 2LNSA 2H6XA 4I2TA 5GSSA 2LTKA 3G9BA 4KDUA 4PNGA 3KTLA 2GS3A 5EVOA 2RIIA 4E8HA 2GSSA 4IW9A 4ZBDA 2B1KA 1YEPA 3IRAA 4ZB6A 13GSA 3F6FA 3RDWA 4XRDA 4MF5A 5J41A 3UAPA 1UN2A 3OR5A 1V9WA 3VLNA 1OE8A 1ZZYA 2TRCP 3ME8A 1E2YA 6GSWA 6GSSA 5CRGA 3HA9A 4L0WA 2RUEA 2K9FA 5DQYA 5B8BA 4TVEA 4GF0A 1NHOA 2J9HA 1AUCA 3LQ7A 3MNGA 5ELGA 2BJXA 5F0GA 4X0XA 2N5FA 4PQ1A 2OBIA 3ED3A 4CW9A 1JZDA 1GSEA 3C1SA 3P2AA 3TKPA 1W4VA 4ECJA 3GUSA 3FZAA 3TRXA 4XS4A 5CAXA 5IOXA 3WYWA 4EF0A 4ECCA 2EC4A 2FA8A 3RBTA 2G0FA 3FEUA 2VCQA 3MDKA 5KN3A 1XWAA 1PGTA 2WFCA 1U6TA 2CVBA 4YQVA 2V2GA 5GZZB 3HVSA 4G10A 5F05A 1TU8A 4POLA 4L0UA 4KX4A 3D22A 3BBYA 4POKA 5DAKB 17GSA 4JR4A 2O85A 3SBCA 4NXIA 3J7Yk 1K0DA 4BPYA 4QQ7A 3FR9A 1VRSD 2L6CA 1WJKA 3EVIA 2LRNA 4EDZA 1F3AA 4ZL8A 2GTUA 2MZCA 4K2DA 3EMXA 1FW1A 4L5LA 2OE3A 4NHZA 3Q18A 1AXDA 3GX8A 3EC3A 4TXOB 3F8UA 3LYPA 5EL8A 1ML6A 1SJZA 1NM3A 1TI1A 1EEMA 4BA7A 4TR0A 4OFMA 1T00A 2H0IA 1BJXA 2L57A 2B7KA 4OD7A 4FYUA 2YV9A 2C3TA 3HZ8A 1SKRB 4LMWA 2HT9A 5DALB 5KEJA 3FKFA 4MF7A 1A23A 3TRQA 3LJRA 4NV5A 3FZ5A 3U5RE 1DBYA 5ID2B 5J3RA 3VK9A 1YKAA 2X8HA 5F07A 2L59A 4E8EA 2FGXA 2FD3A 3FK8A 4O92A 5HQPA 2R37A 4MJCA 2VO4A 5JWQB 5D93A 4EVMA 3D4MA 5A4UA 1ZGNA 1F2EA 5AIVA 1XOAA 4WBJA 1WP0A 2HSHA 1OC9B 4TXOA 2TRXA 3O3TA 2GSQA 4YAVA 3UVTA 4Q5RA 3QFBC 5INYA 2PWJA 3JCML 1USBA 1DUGA 2GT6A 2NTOA 1GUHA 1WPIA 1ACVA 5G5FA 3F6DA 4J56E 1XVWA 4HJ2A 1A24A 4HS1A 3UL3A 5DALA 2AAWA 2R6KA 3GH9A 5B6MA 2QKEA 5ID2A 5HR0A 1X5DA 3GIXA 4WF5A 4EDYA 5JCWA 1FAAA 3H93A 3M1GA 4MCUA 2AHEA 3IDVA 1K0AA 5G1LA 2GDRA 6GSYA 2FA4A 4MABA 3F3QA 2H75A 5DDLA 3EYTA 4PUFC 4MZBA 1FHEA 2JSYA 3TKSA 3TJFA 4AJ6A 1OC9A 2H01A 2H1GA 5CNWA 5E4WA 4D73B 1MDIA 3BOAA 3L9VA 2VOCA 4KDXA 1SJIA 3F4RA 3VPTA 1JZOA 3M3MA 2ZNMA 1QUWA 2CAIA 4I2UA 1BX9A 3GFKA 3H4KA 3DXBA 4GTUA 6GSUA 3EU4A 1ZCPA 5C04A 4IN0A 1WMJA 3QR6A 1TI3A 2X8GA 1GNWA 4V2MA 2H71A 3F4SA 2L6DA 3TOUA 2VAFA 1RK4A 5B7CA 3ZIJA 3EE2A 2HRNA 1ZYQB 1TRSA 2DJJA 1GP1A 1YF1A 3IAM2 2OKAA 2ALBA 2K8SA 3GKKA 3NOFA 3J7Yb 4O5RA 1XW5A 4IP6A 5JCGA 1SKSB 4O7HA 2DLXA 1X9MB 5F8BA 2CQ9A 4TN8A 1AIUA 5J9BA 1X9SB 3E9JB 5IO0A 3CBUA 4Z7XA 4OCEA 3GA4A 1GTAA 1HYUA 1G6WA 2VM1A 4LMVA 2YWOA 3KH9A 1X5EA 3GKMA 1Z3EA 1Z6NA 2WS2A 2C0GA 5AGYA 4D73A 5CP1A 3AY8A 1YF0A 1GTUA 1QGVA 1OE7A 3F9UA 4ACSA 5J9CA 1K0BA 2O8VB 4XTSA 2B6MA 1K3LA 1QFNA 4OFTA 4F03A 2VM2A 5ECMB 4AGSA 2HZEB 1MD4A 2B5YA 3IR4A 5KN0A 2PVOC 1GL8A 1O81A 1URMA 1MDJA 2PPTA 2PU9C 3KIJA 5DCGA 3GTUB 4F2IA 1LJRA 2H30A 2RLIA 3ZYWA 1JHBA 4K7OA 2A4VA 18GSA 3BCKA 3ZL5A 2KUCA 2DMLA 4ID0A 5AN1A 3F0IA 2DJKA 3VI5A 3HVVA 2VCVA 2HXKA 4LA1A 4MJEA 3QAWA 1DSBA 1GSQA 4DSQA 2OJLA 2I4AA 2IJYA 2E2MA 1F37A 2NBSA 2VL9A 4OO5A 1GH2A 4ECIA 1PD21 1YY7A 1OKDA 2VLTA 2B5XA 5EY6A 1U87A 3TUEA 1PL2A 2HNLA 4MLYA 2G2QA 2YPMA 3ZLPA 5CRWA 11GSA 3E0UA 1J08A 3ERWA 3VWXA 2OACA 3M0FA 1SL2B 4FO5A 3CRUA 2E0QA 1NSWA 3GTUA 3UARA 3QPMA 1B4QA 4OFNA 5KN2A 4J2FA 3TJKA 2GGTA 4KUNA 2CVDA 4NAXA 3FYGA 1X5CA 2DJ1A 1ZYEA 2KP2A 3EURA 2H0HA 2CX4A 3Q19A 3G7IA 5FT3A 2DSAA 3TKRA 5D73A 5IOWA 2LV3A 3LXZA 3UEMA 2KLXA 1X9WB 2DJ0A 4I6XA 1XCCA 2O87A 2YANA 3WD6A 4PGTA 2GZYA 2FLSA 5CYYA 2FUG2 1F6MC 2HE3A 4MZWA 2LKUA 3HXSA 1HNAA 1VF3A 4ZILA 4GXZA 4KCEA 5HFIA 1H75A 3IV4A 2I9HA 3A2WA 2RM5A 2NDOA 5IMZA 2DIYA 3PINA 4WEYA 3LFLA 2DJ2A 1UC7A 4TOPA 1T3BA 1M9AA 1EGOA 4NPBA 1PX7A 2IWTA 4X1UA 2C3QA 2NVLA 4F0CA 2OBKA 2IIYA 3PH9A 4HI7A 3FZ9A 5DCHA 1OVNA 3F4TA 1GSSA 3UIWA 1Z9HA 4ULXA 3DRNA 2LSTA 1RQMA 2VD0A 2P31A 4Q5NA 1RW1A 4ILFA 4PX1A 3RAZA 3N5OA 4HZ2A 3C73A 2H73A 1U3IA 2H70A 4V2NA 5H5QA 4MJAA 3H79A 3FRCA 4K7NA 2GZPA 1X0RA 3O6TA 1HNBA 4LL4B 4KH7A 3ZITA 3LYKA 1FO5A 5H5RA 3D5JA 4ML1A 2VL3A 4F82A 2IFQB 1T1VA 1G0TA 2YJHA 5C00A 2LS5A 3QOUA 2E7PA 4IS0A 5FWGA 2VUPA 3IPZA 3EWLA 2LRCA 3IBHA 4QL7A 4FH8A 19GSA 1B9YC 4KDYA 5DJMA 3D6IA 4ZXGA 3GKXA 3VI7A 4XHMA 2OA7A 1PQNA 4G2EA 1TDIA 1HD2A 2FWGA 1E6BA 5ENUA 2I3YA 4BWQA 3CSJA 3S9FA 4XRAA 1WRYA 5ECIB 3HVXA 3SWLA 2R2JA 1AW9A 1XPVA 3VWUA 4I5QA 1ZL9A 4PNFA 1FVKA 4AF2A 7GSSA 4YQMA 1YDKA 3TJGA 4IGJA 2XHFA 4EL1A 1GLPA 1I9DA 2PUKC 1PX6A 1K3OA 5CREA 1ON4A 2B1LA 4EO3A 4IHUA 4WKWA 2IFQA 1K3YA 1SK2A 5HFKA 4G19A 3LSZA 2WGRA 1LBKA 2JL4A 2K18A 1M2AA 5IIZA 2H6ZA 3DWVA 16GSA 4GCIA 3EMPA 2FCHA 3GURA 4KW6A 1TP9A 2HSYA 3VFIA 1J0FA 20GSA 1UVZA 2H8LA 1TK0B 2CV4A 3G7YA 5KN1A 3KH7A 1M0UA 1JLVA 1A8LA 5ECKB 3D0ZA 1Q98A 1M2DA 3ISOA 4LLRA 1R5AA 1F9MA 4MPGA 4WBRD 5HR3A 3L4NA 3C1RA 3C8EA 4IJ3A 1ZOFA 2H19A 1M7TA 1DE2A 4GRFA 1F3BA 2IMEA 3I6AA 3DYRA 1C72A 3E3EA 4EKZA 3G7JA 5DJLA 2YV7A 4K8MA 2L5LA 1EZKA 3TKSE 3RHBA 2IPAA 2C1YA 1BAYA 4GQFA 2PGTA 2H6YA 1I5GA 2JACA 2WJUA 5F06A 3MSZA 2CAQA 2GQMA 3A3TA 2XPDA 3A2XA 5A4WA 3FHKA 4MDCA 3H1NA 2H0GA 3H8QA 3FZ4A 4I8BA 3D4TA 1FG4A 3PGTA 3TKSC 1YZXA 1S3AA 4KSMA 2EIQA 3UBKA 1BQ7A 1ERVA 3W8JA 3ZVJA 1MEKA 1Z5YE 1B48A 5CO3A 2C8UA 1TJDA 4MPFA 2FWFA 1O8WA 4K0NA 4V1Ap 2H66A 4DSSB 2FNOA 1PN9A 2JZTA 2P0GA 3L9UA 5L71A 3DVWA 1B9XC 3LEFA 1O7UA 1BEDA 6GSXA 4N0VA 2VCTA 1MTCA 1GSUA 2YWIA 1QK8A 4TR4A 1QXHA 1UA5A 1EGRA 1T8EB 4AJ8A 3KMNA 1AQXA 4N11A 2M46A 2RUFA 3HJMA 2YNXA 2X64A 2K8VA 3ERGA 4NMUA 2N5AA 5ECQB 1Y6EA 4ZBAA 1TRWA 2LQQA 5IM9A 4GSTA 4ZBBA 4RUVA 2MBTA 6GSTA 1T4ZA 4K1FA 1O73A 3KTBA 2DIZA 1B8XA 1IYHA 1T4YA 4MH3A 2V1MA 2O7KA 4TXVA 1Z7RA 4DSSA 3IK7A 2WB9A 5G1KA 3HKRA 3IK9A 3IE3A 1EOGA 1TTZA 2IMDA 1THXA 2LRTA 3ZRDA 3MAKA 3D21A 4MP4A 1A0RP 2XPEA 1JFUA 2B5EA 1AQVA 5JCUA 3MWHA 3QCPA 3GH6A 3TDGA 1HQOA 3CTFA 4GQCA 1IYIA 4QL9A 4BWSA 3UOMA 1SYRA 2H1BA 1WIKA 3KGKA 4WR4A 2V6OA 3UBLA 5GAND 3NZNA 2H74A 3FR3A 3QMXA 3ZFBA 2VCZA 5GSTA 3UMAA 2L4QA 4ZL9A 4MH2A 1SD8A 1QMVA 2PVQA 3IHQA 4RQXA 5ECPB 2C3NA 2AYTA 4H86A 3BJ5A 3C7MA 2VCWA 3I69A 5LCZA 5IO2A 9GSSA 1YQ1A 2E2GA 1YJ6A 4JE1A 1AC1A 4J57E 5G5EA 3HHVA 2F9SA 5CRHA 2AUVA 4KB3A 4TR1B 2FWHA 1GSDA 3ZTLA 3TJBA 1K0MA 3DD3A 4Q5FA 1O8XA 3GV1A 1GTBA 4HQZA 1EP8A 4HEA2 4MA9A 1TRVA 5EPFA 4NWYA 3APQA 3RPPA 2H1AA 2IN3A 1R5PA 3LGCA 4MZCA 3UJ1A 3HDCA 4BVXA 2VL2C 4O32A 3LG6A 2ON7A 3ZFLA 5AIXA 4N0ZA 2CT6A 3Q6OA 4IQAA 2VL2A 4ECBA 4ZL7A 2LQOA 2VIMA 1XW9A 1XWCA 4LL1B 1TW9A 3L0HA 1CQHA 3R2QA 4L5OA 2GSRA 1V40A 1AQWA 3KCMA 2LJAA 3UVHA 4TR3A 3CSIA 4CHSA 4RQRA 3WT2A 2A2RA 1GUKA 3A2VA 2F51A 1A2MA 3M9KA 3W8SA 1O85A 3WT1A 1GUMA 4K0GA 2M80A 1THOA 2YWNA 4KAEA 3HJPA 4JRRA 4TR1A 5DBQA 2RM6A 4PUAA 5D96A 4IJIA 1KEBA 3DMLA 3GMFA 2GT5A 1PKZA 4KA0A 2N5BA 2ZUPA 2NPBA 3PR8A 1FB6A 4MMMA 2DJ3A 1TXXA 4MJBA 2ON5A 2WRTA 4DVCA 3APSA 4AJ7A 2DBCA 2B3SA 4HJMA 3CRTA 4I97A 2PBJA 2P5RA 2PMTA 2B7JA 1EP7A 5JWRB 3CXGA 4F9ZA 2JZSA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite