3HY2A

Crystal structure of sulfiredoxin in complex with peroxiredoxin i and atp:mg2+
Total Genus 53
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
53
sequence length
185
structure length
185
Chain Sequence
SGNAKIGHPAPNFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYVVFFFYPLDFTFVDPTEIIAFSDRAEEFKKLNSQVIGASVDSHFEHLEWVNTPKKQGGLGPMNIPLVSDPKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITVNDLPVGRSVDETLRLVQAFQFTDKHGEVSPAGWKPGSDTICPD
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Protein Engineering of the Quaternary Sulfiredoxin-Peroxiredoxin Enzyme-Substrate Complex Reveals the Molecular Basis for Cysteine Sulfinic Acid Phosphorylation
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Homo sapiens
molecule keywords Peroxiredoxin-1
total genus 53
structure length 185
sequence length 185
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-06-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3hy2A00
1YQ1A 3SBCA 2GZZA 3D21A 4MLYA 5G30A 1XWGA 2JADA 2H8LA 2LV3A 3H93A 5ECOB 3FZAA 2M72A 2LSTA 1GUMA 3PINA 3HA9A 4OCFA 1SD9A 5ECIB 4TKYA 2F9SA 4HS1A 4MH2A 1YEXA 5IO0A 1U3AA 4EC0A 3FZ9A 4G2EA 1MD4A 3F63A 3UARA 3IAS2 1JZWA 3KD0A 2V1MA 3GL3A 1NM3A 2XC2A 2FA4A 5H5SA 1R5AA 4JZQA 1X0RA 5HFIA 5ECNB 4HZ4A 4L5OA 2H74A 3EU4A 4IKHA 2MMZA 3IV4A 1VF2A 3ISOA 4ZILA 1SENA 1WJKA 2K6VA 11GSA 2PN8A 3ZFLA 2G2QA 2X8CA 1EGRA 4YAVA 4MF5A 5FT3A 1JHBA 5HR1A 3TJGA 1WP0A 1ERVA 1RK4A 1YKCA 4XS4A 3BCIA 4MK3A 3VFIA 2HI7A 3FKFA 2JZTA 2MZCA 5JWRB 2NDOA 2VM2A 1U87A 3M8NA 3FHKA 1GSDA 2P5RA 1A2MA 2PU9C 4ILFA 5DAKB 1USBA 2VL9A 3RPPA 3KH7A 1A2JA 3GKMA 3ZRDA 1G7OA 3EMXA 1V9WA 2A2SA 2N5FA 2XPEA 2E2MA 1MD3A 4GCIA 2H0IA 4FO5A 4X0XA 3QFBC 4JR6A 4NV2A 2L4QA 5IMFA 2DMLA 2NBSA 1GP1A 5F8BA 1ZYQB 1MDKA 4QL9A 2DSAA 3KGKA 14GSA 1EZKA 3FR3A 1GRXA 2H70A 1QK8A 2DIYA 4CW9A 1R26A 1QXHA 4PGTA 5ENUA 3G7YA 4G19A 1KEBA 5AGYA 2RM5A 2NVLA 4KDYA 1K3OA 2IMFA 3D22A 4IVFA 4KE3A 3SWLA 4JR4A 3MDKA 3TGZA 2H0GA 2CQ9A 5DCHA 4LA1A 2CZ2A 4J2FA 5GAND 5LCZA 5KN2A 1EEJA 3J7Yb 6GSXA 2OJLA 2O7KA 2LEGA 4KA0A 1XZOA 5DALA 2VIMA 2CVKA 2VCQA 4NHWA 1ACVA 3IAM2 1F3BA 4BWQA 4Q5RA 4DSSA 3IK9A 4JRRA 2J23A 4IGJA 1XWAA 5GSSA 1PMTA 1URMA 2CA8A 5JCWA 2AAWA 1SU9A 4WETA 3HJMA 2RLIA 3EC3A 4CHSA 3EWLA 4BWSA 4YQUA 5CRDA 8GSSA 4MPFA 3VWWA 4ZB6A 1U3IA 1THXA 4POMA 1JLVA 5J3RA 6GSSA 1Y6EA 5J5NA 2R5GA 5KN1A 4EDZA 2ALBA 3UVHA 4TR0A 4HU9A 4DSRA 1GLPA 5IM9A 5G1LA 1XWCA 1RQMA 3CSIA 1O73A 3KIJA 4GSSA 3FR9A 4HU7A 1O8XA 4PUAA 1TJDA 2HYXA 4ECJA 4WR4A 3DXBA 4TR4A 2IMIA 4GTUA 1G7EA 18GSA 3VPQA 5A4VA 3L78A 2HNLA 1OKDA 1K0MA 2YP6A 5IPHA 2JZRA 3LFLA 1XWBA 1EWXA 3KM6A 4AF2A 3UAPA 3MSZA 4AJ8A 4KAEA 3US3A 2H1DA 4WF4A 4NAXA 1GTBA 1WWJA 3DRNA 1JZRA 2VUPA 2GSQA 3AY8A 4IQ1A 1TI1A 4L0WA 1B9YC 3F0IA 1GTUA 2X99A 2F8AA 1FB0A 2DBCA 3I9V2 4V1Ag 5EL8A 2HZEB 4MABA 2H66A 2FY6A 5J9CA 2CX3A 2GQLA 1TU8A 1TP9A 5B7CA 2REMA 4KW6A 1J0FA 1F6MC 1JLWA 2GZYA 2C3TA 2LJAA 3EMPA 2WJUA 4GQFA 3Q19A 1PL1A 3UBLA 1B48A 5ECMB 4QQ7A 2IMDA 2GTUA 3GTUB 3VPTA 5DQSA 4J57E 2PVOC 2H1AA 1XVWA 3EVIA 3CRUA 4ISDA 3A3TA 3ZTLA 1XW5A 4N11A 4TXVA 4PX1A 1PA3A 3TJKA 1ZL9A 3C8EA 2FA8A 1FHEA 3DWVA 1XWKA 1MEKA 4IW9A 2YPMA 5ECQB 4KDUA 2B6MA 4IQAA 1NSWA 2B7JA 1X5DA 3BOAA 4E8EA 1SD8A 3C7MA 2IL3A 4XRDA 3EINA 3U5RE 3TOUA 4RI6A 1OC8A 5KN0A 2L4CA 3KP9A 3TRXA 3TKSE 3LORA 2GDRA 1S3CA 1Q4JA 2H6XA 4F0CA 4V2LA 19GSA 4KNDA 1U6TA 2AB6A 4IHUA 2X8GA 2MMOA 1A8YA 1M9BA 4MF6A 4GRFA 2OE1A 4O32A 3QOUA 5E59A 4L8EA 2YJ7A 1F2EA 4KCAA 3ZIJA 4HJ2A 1V98A 2N5AA 4J56E 17GSA 22GSA 4ZBBA 2HE3A 3UMAA 2HFDA 3LSZA 4L0UA 3BD2A 5B8AA 1ZCPA 3APSA 2VL2C 5JWQB 4MJCA 5EVOA 4L5LA 4GSNA 2I9HA 1DBYA 3E0UA 3CMIA 1TRUA 3ME8A 4ZB9A 4WEYA 2OBIA 4N10A 4XCSA 3LGCA 2LRTA 1G6YA 5HR2A 4PQ1A 2PPTA 4XS4B 1XOBA 1BX9A 1YF0A 1S3DA 1R7HA 1M2DA 1CQHA 1K0OA 1YJ6A 4P3YB 1GUHA 1SL2B 1SL0B 3HHVA 3WD6A 3VK9A 3TB2A 1B9XC 2GQKA 4NXIA 1B4PA 1PN9A 1BYEA 3H1NA 1T1VA 1SJIA 2PERA 4XS6A 1X5CA 2E2GA 2C8UA 3EU3A 1UA5A 4K1FA 2H1GA 3IE3A 1GSSA 1Z7RA 5HQPA 4TRXA 3UL3A 4Z7XA 2O87A 5E4WA 3UOMA 2IFQA 1FVJA 3GFKA 4IBPA 3KH9A 3P8WA 1HYUA 2B5XA 4F9ZA 1V40A 1QQ2A 5DCGA 2H72A 1ERWA 5LD0A 2VL3A 3CXGA 4OD7A 1TU7A 3QPMA 3ZREA 1ABAA 3APOA 3Q74A 1JFUA 4MJBA 4IN0A 3KEBA 4TVEA 3F3QA 2E0QA 2YJHA 1X5EA 3CRTA 2VLUA 2R2JA 5D9VA 2WB9A 3W8SA 5IOXA 4KUNA 3VLNA 3A2VA 4TR3A 4DEJA 1K0BA 2OE0A 5F06A 2DJJA 2F51A 2PBJA 3IDVA 3HZ4A 2BJXA 5J4UA 3L4NA 3GHAA 5DALB 1SYRA 3NOFA 5A4UA 4TXOA 3H79A 3VWXA 4V1Ap 2DIZA 4DSSB 2TRCP 3QDNA 3GKNA 4MF7A 1V58A 2HXKA 2AHEA 2LRNA 5KN3A 4OWYA 3PGTA 3A5WA 4XIHA 2JL4A 2IMEA 2HT9A 1DUGA 2BTOT 1GTIA 4HEA2 3ZVJA 4NPBA 2LKUA 2KP2A 2EIOA 5C04A 4XRAA 3GIXA 2VL2A 1U88A 4N0VA 2KLXA 3F4TA 2CZ3A 1BJXA 1AAZA 3HDCA 1AUCA 5INYA 2FGXA 4WKWA 3LJRA 3DMLA 1HQOA 2OE3A 4F2IA 4ECIA 1J08A 4K0GA 1IYHA 2LQOA 5FWGA 1AQWA 3ERGA 4QL7A 3TJJA 3F9UA 1K3LA 2IJYA 4Q5NA 4HUAA 4LMVA 3C73A 3HJPA 4ACSA 5J41A 3QFAC 3TKQA 4Q5QA 4ML6A 4WR5A 2YV7A 3R2QA 3IR4A 1M2AA 3VI7A 2YZUA 1M9AA 3W6GA 5JCGA 2PMTA 6GSUA 1UVZA 3L9SA 2PWJA 5D96A 2YANA 1BQ7A 4O92A 5DJMA 4I8BA 4EVMA 3GH6A 1SKWB 12GSA 4TOPA 1XXUA 4K7NA 2HRNA 3ZLPA 3GL5A 4F82A 3ZL5A 2K8SA 4I2UA 3I6AA 2XPDA 5ECPB 2ZNMA 3M3MA 5IMCA 5JWOB 1AW9A 2VD1A 4ZBDA 1NW2A 4RQRA 2YWIA 4CDOA 2DJ1A 3GKKA 1M7TA 4WXTA 2WRTA 2GGTA 1VF3A 2MYGA 3GRXA 2GT6A 1SKRB 3TKSC 1OVNA 2CX4A 2D2ZA 1E2YA 1O6JA 4HDEA 2XBQA 1VRSD 2K8VA 1CQGA 3KTBA 4XTSA 3RHBA 1BAYA 4YQMA 4IELA 3O76A 1GSQA 1GNEA 4ZIJA 1R5PA 1OE7A 3WYWA 3E3EA 4YH2A 1OYJA 2VCXA 2LQQA 1C72A 2P5QA 1M99A 3F6FA 2LNSA 4TR1A 4HQZA 4O5RA 2WGRA 1T4YA 2CAQA 4LLRA 3G9BA 5AN1A 2AJQB 1XFLA 3ERFA 3RPNA 2KUCA 1A8LA 2VCWA 4EO3A 1SJ6A 1SK0A 1YEPA 2R4VA 3H8QA 3TRQA 2I81A 3GH9A 2B5YA 4KCEA 1QMVA 2VCTA 1YZXA 3IK7A 1EOHA 2OBKA 1PQNA 2IPAA 1W89A 2K18A 4HOJA 1LJRA 4K8MA 1ERTA 5ELGA 1HNCA 5ECLB 4HQSA 3P2AA 1TRWA 2P31A 5D8IA 4ID0A 2WULA 4IP1A 3M1GA 2DJ2A 2HSYA 4YQVA 1N2AA 3TDGA 3WGXA 16GSA 1OC3A 2WDUA 3IRAA 4ML1A 2I1UA 2R3XA 1ZMAA 5A4WA 5CP1A 2LRCA 2C0FA 4ZB8A 1J9BA 5A5KA 2B1LA 3TRPA 5EY6A 1HNBA 1XVQA 1AXDA 1F37A 4X43A 1SK1A 3HCZA 4TW5A 2TRXA 4KGIA 2PVQA 2IWTA 2FWHA 3FRCA 3H4KA 5IMZA 2L5LA 3P7XA 3F6DA 3VWUA 3Q18A 2L57A 3CSHA 3CSJA 4V2NA 2HSHA 5DJLA 3GMFA 2YN1A 2OACA 5HFKA 4OO5A 3M0FA 5G5EA 4OCEA 3FY7A 2LTKA 2OKAA 2QKEA 2VAFA 3VI5A 1GTAA 3FW2A 2IFQB 2JSYA 3DGQA 1GWCA 1X9SB 2GLRA 2YV9A 2LUSA 4O7HA 1ON4A 2H76A 3C1RA 2F3MA 3I43A 3PH9A 2V6OA 3IPZA 1A0RP 3ED3A 4FH8A 3HD5A 3P90A 2DLXA 5ABRA 2JZSA 3GN3A 4GLTA 3DIEA 5IMAA 4OFTA 2VLVA 3WT2A 5IMVA 1JZDA 2LS5A 1GSUA 2MBTA 2L59A 3A2XA 2L6CA 1LU4A 3F4SA 3QAWA 1VF1A 3G7IA 4OMVA 1IYIA 3RDWA 1GLQA 4FYBA 1FVKA 2CVDA 1MTCA 2OADA 1EEMA 4TXOB 2VM1A 2R6KA 3LYKA 4E8HA 3DD3A 4X1UA 4AJ7A 4OFMA 4BVYA 1T00A 4RQXA 3TKPA 4OO4A 1K0NA 1F9MA 3KXOA 1DSBA 1GL8A 2H0HA 1ILOA 2F8FA 5AISA 1PKZA 4POBA 2GS3A 3I69A 5CRGA 1A0FA 1UC7A 3CYNA 3RAZA 3NZNA 2LNTA 2K9FA 1EOGA 5CO3A 3ZVJD 3GNJA 1YKAA 3DYRA 2YWNA 4MZWA 5ID2A 2GSTA 1FAAA 3GYKA 1Z6NA 5CREA 4JU5A 5IO2A 5L71A 3UJ1A 3E9JB 3BCKA 3IC4A 3GV1A 3MAKA 2PUKC 2WZ9A 4HZ2A 1TK8B 1A2LA 1SK2A 1OC9A 3KCMA 4ECCA 4LL1B 4NMUA 1EP8A 3GX8A 2B3SA 2I3YA 6GSVA 1K0DA 2MMAA 3ME7A 2RUEA 4PQHA 1SJZA 4ZL7A 6GSYA 1EGOA 4F0BA 2C0DA 5IIZA 1YY7A 4NWYA 4MPGA 6GSTA 5AIXA 5H5QA 3GURA 4PNGA 5B6MA 2VCZA 3QMXA 5J9BA 1DE2A 3F3RA 1FO5A 1GH2A 2DJ3A 5D9TA 4BA7A 1XIYA 3LXTA 1XPVA 3GSSA 3BBYA 2ON7A 7GSSA 2JSZA 3C1SA 3DVXA 3ZFBA 1FG4A 1OE8A 4K6XA 3U6VA 3GKXA 4LL4B 2V6KA 4I97A 2RIIA 1MDIA 5G31A 1KNGA 4MZCA 4H86A 3GUSA 4MCUA 1EV4A 3F4RA 4IP6A 1QUWA 3Q6OA 1SKSB 3RHCA 5ECRB 1WPIA 2IN3A 5D9XA 2H30A 3ZIVA 5LNKe 2VD0A 4KX4A 1T4ZA 3WGEA 3KJYA 4EKZA 3QCPA 2H01A 5D9WA 3L0HA 4N30A 2ZUPA 2AV4A 1VF4A 3DVWA 5DBQA 4GXZA 5F07A 1V57A 4K7IA 2QSIA 5D73A 2HRFA 1A23A 2H1BA 5ECHB 4BL7A 2H6YA 3O6TA 2N5BA 4MP4A 3WGDA 1EP7A 1TRSA 3LWAA 4Q5FA 3VURA 1TOFA 4FIWA 4GWRA 1PGTA 4KH7A 4KSMA 1SYXA 1I5GA 4TR1B 1Z6MA 1TW9A 1N8JA 3G7JA 2ON5A 4I5QA 4POLA 4MJAA 2C3QA 3CBUA 3V1WA 1PRXA 13GSA 1W4VA 2PGTA 2FCHA 1XOAA 2E7PA 3UIWA 4BPYA 5D93A 2AUVA 2I4AA 4PURA 5IMDA 4EE0A 4TN8A 4N0ZA 2G0FA 2OA7A 3M9JA 3IXRA 2M46A 2GSSA 1PSQA 1A24A 3TOTA 3ZMKA 2C1YA 2L6DA 5HR3A 1WE0A 1O85A 1O8WA 3ERWA 2C0EA 3NIVA 4K9ZA 3IA1A 4EF0A 1AIUA 1TXXA 2NTOA 2H19A 1S3AA 1AQXA 1Y25A 2ES7A 2CAIA 2RUFA 2FWFA 3F8UA 3FR6A 4HI7A 3L9VA 1ZZYA 5DQYA 4K0NA 1WRYA 2V2GA 1R4WA 2WS2A 4PXOA 2O85A 2YOIA 3ZITA 2KOKA 4FYUA 1M0UA 2B1KA 3FK8A 1PD21 2VCVA 5B8BA 2FD3A 4KB3A 2VLTA 1ZYEA 10GSA 1FB6A 1TTZA 4I6XA 3EE2A 5JCUA 2EC4A 2M80A 4AGSA 3KTLA 4DSQA 3KP8A 2YWMA 3MWHA 2X64A 3FZ5A 2FNOA 1LBKA 2O8VB 5ELAA 3D6IA 1JZOA 5EPFA 2IMKA 4EUYA 2AYTA 5ECSA 5GSTA 5G5FA 1XW6A 5KEJA 1T3BA 2NPBA 4POKA 3LEFA 2GVPA 1PKWA 4NV5A 2HZFA 1YDKA 2LJKA 4WBRD 2YZHA 2H75A 2A2RA 3LG6A 4OFNA 3HY2A 4MA9A 3FEUA 3ZYWA 4PUFC 3ZZXA 1TRVA 1Z5YE 4KSOA 3W8JA 2H71A 5F0GA 3N5OA 3MNGA 1AC1A 5GZZB 2YNXA 4XS1A 3UEMA 4EL1A 2QGVA 5DAKA 3WT1A 2GQMA 5CNWA 3FYGA 5G1KA 1T8EB 3QAVA 2DC5A 3JCML 4NHZA 4ULXA 3N9JA 5CAXA 5CRWA 1FW1A 2IIYA 1I9DA 1GNWA 1XW9A 1DE1A 1Q98A 2FWEA 3HZ8A 4MH3A 1WMJA 3EURA 2GZPA 2P0GA 1Z9HA 2CVBA 4JBBA 4ZL9A 3EYTA 2JU5A 2JACA 5IOWA 2TIRA 3QAGA 1GUKA 2R37A 2VO4A 2FHEA 1K0CA 4DVCA 3GSTA 4YAPA 1GSEA 1BG5A 5IQYA 1O81A 4ZXGA 5HR0A 2DJ0A 2FWGA 3TUEA 1VGLA 3L9UA 2VOCA 1K3YA 2WCIA 4MMMA 1B4QA 5ID2B 3BJ5A 3QD9A 1NHOA 3TCOA 4WF5A 2V41A 3D4TA 4GSTA 3HXSA 2HLSA 5GAPD 5H5RA 3DKSA 4ZL8A 1OC9B 3CTGA 3VWVA 1X9WB 1PL2A 1NHYA 4ECBA 4IS0A 4K7OA 4PNFA 3PR8A 1V2AA 3IOSA 1Z7PA 3RBTA 3HJOA 3TKSA 2A4VA 2C3NA 3HVSA 4WBJA 5ECKB 4G9HA 3HYPA 2DMMA 1WIKA 1F3AA 1TKDB 1H75A 3OR5A 5AIVA 3LQ7A 1PX6A 1E6BA 1QFNA 4HJMA 2WFCA 1OAZA 4D73B 1X9MB 3C71A 1GSYA 4MJEA 2H73A 1O7UA 2C0GA 2B5EA 1TK0B 1TI3A 1TK5B 3S9FA 3LYPA 3D4MA 2FLSA 1Z3EA 3M9KA 4MZBA 3LXZA 3HVVA 1PX7A 4EXJA 3APQA 4XHMA 2H6ZA 4BVXA 3IHQA 5B6NA 1HNAA 5HFGA 2Z9SA 1G0TA 3CTFA 4RI7A 5CYYA 2YCDA 2MBSA 2DJKA 2KHPA 3A2WA 2L5OA 9GSSA 2YWOA 4IJ3A 1H4OA 2EIRA 1G6WA 3TJFA 1ST9A 2GSRA 2EIQA 3UBKA 3D0ZA 3QR6A 2LJRA 3J7Yk 2HZEA 2V32A 4KDXA 1AQVA 2ZCTA 5F05A 3DEXA 5FHIA 1GULA 4MDCA 5DVBA 2CV4A 4I2TA 2X8HA 1THOA 2XHFA 1YF1A 2QC7A 6GSWA 4F03A 2J9HA 1K0AA 4GF0A 4G10A 3KZQA 3HKRA 4IJIA 1ZGNA 4V2MA 4JE1A 2KP1A 2MMNA 1BEDA 1ML6A 1FOVA 4GQCA 1T7PB 2RM6A 3GTUA 5G2ZA 3TKRA 2CT6A 4K2DA 3TJBA 3KMNA 1RW1A 1OKTA 1ZOFA 3ZMLA 3O3TA 4ZBAA 4AJ6A 3UVTA 2XBIA 20GSA 1SL1B 3D5JA 1B8XA 5CRHA 3GX0A 5IPGA 4FYCA 1UN2A 2C4JA 1TDIA 3K8NA 3FZ4A 1XBSA 2B7KA 2GT5A 3GA4A 1KTEA 2O89A 5COHA 3HVXA 4LMWA 1MDJA 4PQIA 1GSFA 4D73A 1QGVA 1WOUA 4RUVA 4JEDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite