3I43A

Escherichia coli thiol peroxidase (tpx) wild type disulfide form
Total Genus 55
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
55
sequence length
167
structure length
167
Chain Sequence
SQTVHFQGNPVTVANSIPQAGSKAQTFTLVAKDLSDVTLGQFAGKRKVLNIFPSIDTGVCAASVRKFNQLATEIDNTVVLCISADLPFAQSRFCGAEGLNNVITLSTFRNAEFLQAYGVAIADGPLKGLAARAVVVIDENDNVIFSQLVDEITTEPDYEAALAVLKA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural changes common to catalysis in the Tpx peroxiredoxin subfamily.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol peroxidase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli k-12
total genus 55
structure length 167
sequence length 167
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 2009-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3i43A00
4WBJA 1HYUA 1OC9B 4NPBA 2X64A 2LS5A 1X5EA 3ZLPA 2I4AA 2X8GA 2YV7A 5ID2B 2N5AA 4NHZA 5CAXA 3C7MA 1HNBA 3D5JA 3QAGA 4K1FA 1T4ZA 3WT1A 2VM1A 2C3TA 1B4PA 2FCHA 2MZCA 3LGCA 4PQIA 3BCIA 2I1UA 5F8BA 5KN0A 4ZB9A 1Z9HA 4IP1A 4YQUA 1GSQA 5D8IA 3C8EA 4IJ3A 1G6YA 3ZRDA 4KNDA 2VIMA 4HDEA 4DSQA 3TUEA 1GTAA 1T00A 1GNEA 3TKPA 2JADA 1FG4A 5DDLA 4HZ2A 3WGDA 2MBSA 4Q5FA 1EWXA 2YP6A 4PXOA 3ZVJD 1BYEA 4N10A 5ENUA 3NZNA 4MJEA 3KEBA 1DE2A 2L57A 2CVBA 1GSEA 1B9YC 5DBQA 3ZITA 2C0GA 1XWAA 2HYXA 1SK2A 3M0FA 3AY8A 17GSA 1AQVA 4HEA2 3VK9A 3A5WA 4TXOB 5IMAA 3GL5A 2L4QA 1U3IA 1Z3EA 3FEUA 4Q5RA 2LV3A 2X8CA 3KTBA 4F0CA 5ECKB 1CQHA 2KLXA 3E0UA 5HFGA 6GSYA 1EP8A 4LL1B 5ECHB 1QXHA 1YDKA 2R3XA 3GYKA 1I9DA 1GUKA 3QFBC 5DALA 4FYCA 5D9TA 2ZCTA 2TIRA 2M46A 2VO4A 5ECSA 2M72A 3TDGA 3ZMKA 4ZXGA 2QSIA 5F07A 2IMKA 1VF1A 4ZILA 2H30A 1GTBA 1O6JA 2F51A 4ZB6A 4TOPA 5DCGA 4WXTA 1V57A 1PQNA 3QPMA 1V58A 4DSRA 1RQMA 4K7OA 4GTUA 4ZIJA 1BG5A 3V1WA 4POKA 2FD3A 4BVYA 1A23A 3TJBA 1T8EB 2P31A 4ID0A 1XZOA 2OE0A 4WR5A 3FRCA 5KN2A 1MTCA 3ZREA 4MK3A 3D4TA 4HI7A 1H75A 2E7PA 1YEPA 3HVSA 2AAWA 2HZFA 5HFIA 3LYKA 2IMEA 3DKSA 1OAZA 4Q5QA 2CT6A 3L9SA 3D22A 3GL3A 5G2ZA 3UEMA 5JWOB 1AAZA 2GSTA 4NV5A 3VI5A 1FVJA 3RPPA 1G7OA 4ML6A 4F03A 4KA0A 2YPMA 3QAVA 2QGVA 4EO3A 5HR0A 4AGSA 3EWLA 3M9KA 1JFUA 4BL7A 4JZQA 1BEDA 1ML6A 3EU4A 2C1YA 4TR4A 3CYNA 2H1AA 2DJ0A 4EL1A 4GCIA 2OJLA 1XFLA 2Z9SA 1SKWB 2EIOA 2YANA 1R4WA 1SJZA 3IDVA 3TRXA 3GIXA 2VCTA 3DWVA 4O5RA 22GSA 3A2XA 1BQ7A 2XPDA 3F9UA 3RBTA 3HZ8A 1MEKA 1K0OA 1GUMA 1FHEA 1ZGNA 3VPTA 2HXKA 1GSFA 4XS1A 1TK5B 1T7PB 1O8WA 2PN8A 1N8JA 1FW1A 4L0UA 1LJRA 3KJYA 2B1LA 3GHAA 1GULA 3C1RA 4MH2A 2ZUPA 1EOHA 2R4VA 4GSNA 4HU7A 4I8BA 4K8MA 3A2VA 2RM5A 2CQ9A 3D0ZA 2AYTA 2C0EA 2V6KA 2LJAA 3C71A 3LYPA 3EINA 5COHA 1GSYA 4V1Ap 4ECBA 2GQLA 3H8QA 4NAXA 4YAPA 2PPTA 3FY7A 6GSUA 4EUYA 5IOXA 3TJGA 3MNGA 5JCWA 5CREA 2HSHA 3WD6A 4TR3A 2H0IA 3N5OA 2LTKA 3CRUA 2F9SA 2HLSA 5DALB 4WF5A 5HR2A 1U87A 3MAKA 1YEXA 2IMDA 3S9FA 3ED3A 2HZEA 5A4WA 3CBUA 3CRTA 2K8VA 3CTGA 1WRYA 5AIXA 2KOKA 4FYUA 3KH9A 4GQCA 2OBKA 3ZZXA 1FB6A 4G2EA 4KSOA 1WP0A 4PX1A 1F3AA 1PGTA 2WDUA 3BD2A 5DJLA 1MDKA 2JACA 3HY2A 1XW6A 3MWHA 1ZCPA 3APSA 4N30A 1FAAA 4KUNA 1T1VA 3I9V2 4I2UA 2ON5A 4MF5A 1OE8A 3HD5A 1YZXA 3P90A 4IHUA 1SK1A 5C00A 4MABA 4MZCA 2AB6A 4E8EA 1NW2A 3TJJA 5AISA 1W4VA 1Y25A 3IV4A 3FR3A 1EP7A 4OO5A 2LEGA 4MPGA 4PQ1A 4ZBBA 1B48A 1G6WA 2PBJA 3UIWA 1GLPA 2VCVA 1A0FA 2TRCP 4L5LA 1B8XA 1O73A 2MMAA 1MD4A 1A0RP 4Q5NA 4K0GA 4EKZA 4IP6A 1OYJA 2NTOA 11GSA 2N5FA 2OKAA 4EXJA 1TU8A 5HR3A 1DBYA 3C1SA 3O76A 1UN2A 4ZL7A 1SU9A 2GVPA 2H72A 3IPZA 1GTIA 3N9JA 1OKTA 4MCUA 2XBQA 4MMMA 1Y6EA 4OCEA 4DSSA 2GT6A 2C8UA 2J23A 1SKRB 2H1GA 1XW5A 3F8UA 3HZ4A 18GSA 4GF0A 3ZMLA 1GSSA 4AJ7A 3E9JB 3G7JA 5F05A 2O85A 5C04A 4CDOA 5F0GA 1O81A 3WGXA 2L5OA 3U6VA 3H79A 3APQA 2JSYA 4YQVA 5CRDA 3KIJA 3FKFA 4PUAA 2FA8A 4OFTA 1JHBA 3IR4A 1PL1A 2I9HA 3D21A 1SD8A 4IJIA 4HOJA 1VGLA 2D2ZA 1XXUA 2K6VA 4IN0A 4RI6A 2YWMA 2VCXA 5KN1A 4N0VA 4KCAA 4G9HA 3ME8A 2X99A 2REMA 1GL8A 3LEFA 2DIYA 3F63A 4OMVA 1YQ1A 3GKKA 5IPGA 3OR5A 4V2LA 3RDWA 2OADA 2VL3A 3M1GA 1A8LA 1URMA 1PA3A 1ZZYA 4D73A 1R5PA 1DE1A 3KXOA 4J57E 5D93A 1VRSD 3VFIA 3TGZA 1TTZA 2JZSA 1JLVA 2LRCA 3RAZA 1Q98A 1O8XA 2YCDA 1MDJA 2RM6A 1SL2B 2HZEB 1XWBA 3TOUA 5D96A 2MMOA 4POMA 3TJFA 4WETA 3IXRA 2GQKA 10GSA 2CZ3A 2VM2A 1R5AA 3H4KA 1ABAA 5G1LA 4JR4A 5DCHA 4WR4A 1SL1B 5FT3A 1GSUA 2YN1A 3IOSA 2LSTA 3IC4A 2A2RA 1XWKA 2O89A 3KM6A 1WWJA 3ZL5A 5ECRB 1QK8A 2F8AA 4KGIA 1M9BA 5B8AA 1XWCA 2JSZA 3Q74A 3UBKA 4MJBA 2ON7A 4MJAA 4MJCA 2IFQA 2E0QA 1WPIA 5LNKe 8GSSA 3TOTA 1OE7A 3FZAA 4OO4A 2VLUA 1BX9A 2CV4A 1ERVA 2B3SA 2WJUA 4ISDA 3LG6A 1GTUA 3GFKA 3D4MA 1KTEA 5EVOA 4KDXA 3UVTA 3QR6A 2VUPA 4IVFA 1XBSA 3TRQA 4TRXA 3IAM2 1K0MA 4ECJA 3F4TA 2VCQA 4MH3A 1YKAA 1PL2A 1B4QA 3ZYWA 4DSSB 2FHEA 6GSVA 3TKSA 3TCOA 2AJQB 1V9WA 3ZFBA 1ON4A 2C0DA 1IYHA 1WE0A 3FW2A 3KGKA 4PUFC 1AUCA 5IOWA 2L5LA 1TU7A 1TK0B 2NBSA 2CZ2A 3EURA 2HE3A 2DJ3A 2YZHA 6GSTA 3SBCA 5IPHA 1JZWA 5JCUA 3D6IA 1LU4A 1TJDA 1Z6NA 4KX4A 1HNAA 5GAND 5G5FA 4ZL9A 3DIEA 1E2YA 5E4WA 1EGRA 4I6XA 3ZTLA 1VF4A 4YQMA 5CYYA 1ZYEA 5IO0A 4KCEA 1OC3A 5EY6A 1R7HA 5CO3A 2ES7A 3HXSA 2G0FA 3UMAA 2R37A 2YZUA 2FUG2 4OFMA 3KH7A 1Z7RA 1G7EA 4D73B 1SJIA 4BPYA 1JLWA 1G0TA 4POLA 5J5NA 4ULXA 2FWFA 1DSBA 5DVBA 5IMDA 5AN1A 2H1BA 3A2WA 5DQSA 4EC0A 4XRDA 4JRRA 1KNGA 2O7KA 3L9UA 1WIKA 2IN3A 2R6KA 1TXXA 3GKMA 3Q19A 5DJMA 2WRTA 1K0CA 4FO5A 2RUEA 5G30A 5B6MA 4P3YB 3W8JA 2XBIA 3TRPA 4H86A 2WCIA 3HHVA 1M2BA 2M80A 3BBYA 3L78A 4ILFA 2L6DA 2EIRA 3GH9A 2VCZA 2L4CA 2G2QA 1X5CA 3VI7A 3GN3A 3RPNA 2BJXA 1PKWA 2C3QA 1I5GA 1O7UA 2IL3A 4N0ZA 1Z6MA 4GWRA 1QFNA 1N2AA 2IFQB 5G31A 1J0FA 5DQYA 4F9ZA 2WB9A 12GSA 2V41A 1ST9A 3QDNA 4GRFA 4G19A 4V2NA 3UOMA 5E59A 4F2IA 4RQXA 5D73A 4TXVA 2FNOA 5IMFA 2C80A 1YY7A 2KP2A 2CVDA 2XC2A 3Q18A 1EEJA 1M0UA 1AIUA 2C3NA 5DAKA 1QMVA 4TVEA 4FIWA 3GKNA 1K3OA 3QCPA 3UL3A 2H0GA 2H19A 2HFDA 5B7CA 2CA8A 2HRNA 4LL4B 3ZVJA 4JU5A 1F3BA 4XS4A 2C4JA 1AQXA 2LNTA 3DMLA 4FH8A 2PVOC 2VL2A 3A3TA 3F4RA 3M3MA 3DRNA 3LWAA 2H6XA 2LJRA 2LKUA 3WYWA 1CQGA 3VWWA 5B8BA 3GNJA 2DSAA 1FOVA 1V98A 1XOBA 1F6MC 1A8YA 2YV9A 1GH2A 3O6TA 4I5QA 5KEJA 3APOA 5ABRA 1KEBA 1GUHA 2LNSA 1S3AA 2YJ7A 2H71A 3CSIA 3LSZA 5CRWA 3VURA 1A2LA 1EOGA 4LA1A 3WGEA 1ZYQB 1DUGA 5JWQB 2DMLA 1JZRA 4OCFA 4L5OA 4CHSA 4ML1A 4WF4A 2EIQA 3FR9A 4XRAA 2QKEA 1V40A 1XWGA 1XCCA 5D9XA 1X9SB 2N5BA 3JCML 3VWVA 2R2JA 1HQOA 5IQYA 2FGXA 2B5EA 2IIYA 4I97A 2B5XA 3HVVA 2GLRA 2GZYA 3IRAA 4GXZA 2H73A 1KBNA 2B6MA 2YOIA 1ERUA 4K7NA 1X5DA 2FWEA 2X8HA 4OFNA 13GSA 3HCZA 3CMIA 1BAYA 1WJKA 1K3LA 2GT5A 2GSQA 3HYPA 2P5RA 6GSSA 4TKYA 2LQOA 4IGJA 4LMWA 4BVXA 1TDIA 2HT9A 3DGQA 3IBHA 2IWTA 3GA4A 1M99A 2GSSA 5ECIB 2WS2A 4ZL8A 5HFKA 3DD3A 1EV4A 1T3BA 4I2TA 4N11A 3EC3A 1PX7A 2CX3A 16GSA 2YWOA 1OKDA 1WMJA 1C72A 2RLIA 4TXOA 1ACVA 3WT2A 4K0NA 3ISOA 2V32A 3J7Yb 3FZ4A 4GQFA 3NIVA 4PGTA 2P0GA 1OC8A 2IMIA 4HQSA 2FY6A 5GZZB 4NV2A 5CRHA 4QL9A 2WULA 5A5KA 1AQWA 5J4UA 2B1KA 5DAKB 5G5EA 4BA7A 2B5YA 4YAVA 4KAEA 4NHWA 1BJXA 4F82A 3VWUA 4IKHA 2GTUA 3DVXA 4XIHA 19GSA 3LXTA 4NWYA 4XS6A 3HDCA 3UBLA 9GSSA 1V2AA 3IA1A 2MBTA 2VL9A 4X1UA 1AXDA 3F0IA 3H93A 3ERFA 3LQ7A 4LMVA 1PMTA 4PNFA 3R2QA 2A2SA 4O7HA 2FWGA 2AUVA 4XS4B 3E3EA 3M8NA 4F0BA 3LXZA 4HS1A 5CNWA 5GSTA 2DJ1A 1XVQA 1U3AA 3P8WA 2JZRA 2XPEA 2K18A 1R26A 2OE3A 5ECMB 3U5RE 2PVQA 3CSHA 3RHCA 3PR8A 4DVCA 1K0AA 4KDUA 3W8SA 1M9AA 1ERWA 1J9BA 2PMTA 5ELGA 1PD21 5G1KA 2GSRA 5ECLB 5GSSA 5ELAA 1SENA 3KCMA 1NM3A 4HJ2A 1UC7A 2H70A 2OACA 4RI7A 2H01A 1THXA 2IPAA 2V1MA 4O92A 3DEXA 1QGVA 2DBCA 4E8HA 3F3QA 1B9XC 4KSMA 5HR1A 5J9BA 2RUFA 3EMXA 3L0HA 1PX6A 2B7KA 1YKCA 3I69A 4HJMA 5KN3A 1FO5A 1SJ6A 6GSWA 2HI7A 1EZKA 3MSZA 5JCGA 5IO2A 2JL4A 3CSJA 1LBKA 3FR6A 1J08A 1YF1A 3KZQA 2C0FA 2H1DA 4HUAA 5B6NA 1YF0A 2XHFA 3QFAC 2E2GA 4RQRA 1U6TA 4MA9A 4WBRD 3TB2A 4V1Ag 4X0XA 1XVWA 3TKQA 3UVHA 2ALBA 4TW5A 2JZTA 3CXGA 2BMXA 3FZ5A 4QQ7A 1VF3A 2DMMA 1SK0A 2DJ2A 1E6BA 2F8FA 3MDKA 1UA5A 2E2MA 4POBA 3TKSE 3G7IA 2CVKA 4LLRA 2DJKA 4KE3A 5IMVA 4IBPA 5FHIA 2IMFA 1M7TA 4TN8A 1JZDA 2OBIA 1XOAA 2H75A 1O85A 5A4UA 1IYIA 2HRFA 2MMZA 4EE0A 4JR6A 1TRSA 3LFLA 5A4VA 1X0RA 1TOFA 4WKWA 5FWGA 1VF2A 4K7IA 3W6GA 4KH7A 4MDCA 5CRGA 4IQ1A 2DJJA 2NDOA 3BCKA 3CTFA 5IMCA 3ZFLA 3FK8A 2LRTA 4KB3A 4EDYA 5CP1A 1M2AA 3US3A 4BWQA 3EU3A 4NXIA 4ZBDA 4GLTA 3F6DA 5GAPD 4PNGA 1K0BA 2HSYA 2LUSA 1USBA 5IIZA 4PURA 5J41A 3RHBA 2PU9C 4QL7A 3GV1A 2AHEA 3L9VA 3KP9A 1JZOA 3P2AA 4TR1A 1EGOA 2RIIA 1K0NA 4ECIA 4KW6A 4WEYA 3EVIA 1YJ6A 5AIVA 4HZ4A 1X9WB 4J56E 1T4YA 3KD0A 4XHMA 1FVKA 2H66A 2VCWA 2L59A 1TW9A 2J9HA 3TJKA 1PKZA 3HJMA 3C73A 2L6CA 1XW9A 4EF0A 1A2JA 1THOA 5ECNB 1WOUA 2VLVA 3GTUA 3TKRA 3TKSC 20GSA 1S3CA 14GSA 4MPFA 3VWXA 4FYBA 1K0DA 3IHQA 1GP1A 5EL8A 5ECPB 2PWJA 1ZL9A 3FZ9A 4Z7XA 1F37A 2FA4A 2MYGA 3IE3A 1TK8B 4MZBA 5D9WA 4MZWA 6GSXA 4GSSA 2KP1A 3DVWA 2H6YA 3QD9A 3K8NA 2H0HA 1XIYA 2GZZA 1GLQA 4IW9A 3F3RA 3PINA 1MDIA 4MF7A 2I3YA 2WZ9A 2VD0A 4XCSA 4AJ8A 2AV4A 2A4VA 5ECOB 3P7XA 1TI3A 3HJPA 4IS0A 1PSQA 3I43A 4X43A 1GWCA 2LJKA 1TRVA 3GX8A 3QAWA 4DEJA 1UVZA 1NSWA 1ERTA 4PQHA 2H74A 2LRNA 4IQAA 5H5RA 3F6FA 1ZMAA 3GH6A 1TRWA 3NOFA 3GSTA 3HJOA 1AC1A 2I81A 2LQQA 1ILOA 4MP4A 4HU9A 3GMFA 4EVMA 3Q6OA 2CAQA 1Z5YE 3BJ5A 4G10A 5L71A 1GNWA 2V6OA 5IMZA 1GRXA 1FB0A 2KHPA 1S3DA 4GSTA 1TP9A 2VOCA 4JE1A 2JU5A 2WGRA 1W89A 2QC7A 3IAS2 5EPFA 1K3YA 3DXBA 2V2GA 3UAPA 3EE2A 1PRXA 5IM9A 2DLXA 2GQMA 5JWRB 2YNXA 2DC5A 3LORA 1SYXA 3GSSA 1SL0B 1QUWA 2O8VB 1M2DA 3ME7A 2HNLA 1X9MB 3ZIVA 4J2FA 4KDYA 1OC9A 7GSSA 1OVNA 1MD3A 2OA7A 3L4NA 3J7Yk 3FYGA 4XTSA 5ID2A 5H5SA 3GX0A 4JBBA 3O3TA 2O87A 5HQPA 3ERGA 1QQ2A 4AJ6A 1Q4JA 3H1NA 4OD7A 3EMPA 1A2MA 3KMNA 2VAFA 1NHOA 5AGYA 4CW9A 1F9MA 3UJ1A 1SYRA 5F06A 4JEDA 2IJYA 4TR1B 3QMXA 1XPVA 3VPQA 2CX4A 4K9ZA 2H8LA 4NMUA 3GUSA 5LD0A 5D9VA 1PN9A 1TI1A 4ACSA 2F3MA 4RUVA 3KP8A 3G7YA 2VLTA 3GTUB 2NVLA 3HVXA 2VD1A 2P5QA 2OE1A 5ECQB 3GKXA 2GZPA 1EV9A 1RK4A 2YWIA 3ERWA 3EYTA 4TR0A 1HNCA 2GGTA 5H5QA 2H76A 4L0WA 3F4SA 2K9FA 4ZBAA 3SWLA 3G9BA 2VL2C 1H4OA 3DYRA 4L8EA 1U88A 3VLNA 2PGTA 3ZIJA 2KUCA 3UARA 1A24A 5J9CA 1ZOFA 3FHKA 2YWNA 3KMOA 5LCZA 1SD9A 3IK9A 1AW9A 1GSDA 2MMNA 4K6XA 4OWYA 2FWHA 1NHYA 4MLYA 2PUKC 2GDRA 2H6ZA 2K8SA 2ZNMA 4ZB8A 1HD2A 3GRXA 2CAIA 4AF2A 2R5GA 1RW1A 4K2DA 2B7JA 2YJHA 4MF6A 3I6AA 1SKSB 2WFCA 2FLSA 1TRUA 4V2MA 2GS3A 2TRXA 1Z7PA 3QOUA 4YH2A 2EC4A 1TKDB 1F2EA 3IK7A 4ECCA 2NPBA 4HQZA 3PGTA 3HKRA 3BOAA 3M9JA 4BWSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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