3IOSA

Structure of mtb dsbf in its mixed oxidized and reduced forms
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
134
structure length
134
Chain Sequence
TVPAQLQFSAKTLDGHDFHGESLLGKPAVLWFWAPWCPTCQGEAPVVGQVAASHPEVTFVGVAGLDQVPAMQEFVNKYPVKTFTQLADTDGSVWANFGVTQQPAYAFVDPHGNVDVVRGRMSQDELTRRVTALT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title An extracellular disulfide bond forming protein (DsbF) from Mycobacterium tuberculosis: structural, biochemical, and gene expression analysis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Disulfide bond forming protein (DsbF)
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 40
structure length 134
sequence length 134
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3iosA00
2L6DA 1ACVA 1O7UA 3HYPA 2G2QA 2R37A 1WWJA 2H6YA 2ZUPA 4MJCA 1SK2A 5FWGA 1THXA 4IJ3A 22GSA 3F3RA 4XTSA 1XWBA 3F6FA 5ELGA 1K0CA 3ZMKA 1QXHA 5A4WA 1PMTA 5J9BA 4DSQA 2HZEB 1TK0B 1PX7A 3CRUA 3ZL5A 5J4UA 5B7CA 2GZPA 3UEMA 1TU8A 1UN2A 1GL8A 2XPDA 1O6JA 1ON4A 1EZKA 2LRNA 1U88A 4TVEA 1AIUA 1OE7A 2PUKC 2DJ2A 2FWEA 2M80A 2TRCP 3HZ4A 20GSA 4TXVA 3Q6OA 2VL2C 2IFQB 1HQOA 4MJEA 4MP4A 3QD9A 5DAKB 1BJXA 3O76A 5G5FA 2ZNMA 4F9ZA 2C3TA 4PUAA 3VWVA 1SKWB 4MABA 3KGKA 5A5KA 4JRRA 2IMEA 3FR9A 5IOXA 3V1WA 3MSZA 2JZSA 1X9SB 2H1AA 2YWNA 3EU4A 3BBYA 3SWLA 4GSNA 1OKTA 4OFNA 3TRXA 4TW5A 3QFAC 5H5QA 2P0GA 4Q5RA 3W8SA 4JE1A 2MYGA 2H76A 4IELA 1WOUA 2A2RA 1U87A 4L8EA 5ABRA 2VCQA 3G7IA 1XOAA 2VCVA 4HDEA 4HZ4A 4D73B 2JSZA 3GH6A 4EL1A 3GHAA 2O8VB 4TKYA 18GSA 2MMZA 2VCZA 3BOAA 1R26A 1Z9HA 5ENUA 2VD0A 4XRAA 2LQOA 2CVBA 4JR4A 4ZBAA 2LJAA 2V6KA 2QKEA 4JU5A 1G6YA 1X5CA 1Z7RA 4K1FA 2MBTA 3UAPA 4PUFC 4ZL9A 4BVXA 1K0AA 1USBA 1PSQA 1ERUA 3GL3A 5LD0A 5DCHA 4I8BA 2WFCA 3FZ5A 3H4KA 4F82A 2LV3A 3GTUB 1MDJA 4HEA2 2B7JA 3ZZXA 2FWHA 1S3AA 5G31A 4Q5QA 4N0VA 5DALB 4RI7A 5CRDA 2GQKA 2X8GA 3US3A 3F4RA 4KUNA 2H6XA 5J9CA 2DIYA 1TRVA 3RHCA 4NPBA 2X64A 3WD6A 1F2EA 1YZXA 1X9WB 3LXZA 4EDYA 4PNFA 5G30A 2H0HA 2NTOA 4TR1B 4KA0A 2GTUA 4ZB6A 5DJMA 3TJGA 4KSMA 2LKUA 3L9SA 4F0BA 3GIXA 5A4UA 2H75A 3UIWA 4XS6A 1IYHA 1R5PA 1XVQA 2PVQA 3H1NA 4BWQA 2IN3A 2X99A 4J56E 2JZTA 3TKSE 2WRTA 1OYJA 2VL9A 3QFBC 3VWXA 2OADA 1XW6A 2CVKA 1WMJA 3FKFA 4Z7XA 5CAXA 1TDIA 3LSZA 3TKQA 2N5AA 3FR6A 5IMDA 1GTUA 5C04A 5AIVA 1AQWA 4V2NA 1GUMA 1TU7A 3WGEA 1VGLA 2KLXA 2XBQA 3LJRA 4NV5A 3UVHA 1V57A 2R2JA 2VIMA 2F8FA 3HY2A 4MZCA 4IGJA 4XS1A 1LBKA 3HJOA 3BD2A 3HDCA 1TOFA 1TP9A 2NVLA 4O32A 2YWIA 3FRCA 3C1RA 1TKDB 3N9JA 1Q98A 1PKZA 3LXTA 5J3RA 5KN2A 3IK9A 4IS0A 5FHIA 2CAQA 4GQFA 3WGDA 1JLVA 1Z3EA 1T8EB 5JCGA 5HFKA 3P7XA 2GZYA 3UBKA 2FA4A 2YANA 5ELAA 1KNGA 1PQNA 3JCML 2GSSA 2XBIA 1EGOA 1X0RA 4ML6A 5AISA 2JADA 3ZIJA 1KTEA 5ECSA 2IFQA 2HZFA 4Q5FA 4BL7A 5KN3A 1Z5YE 1XFLA 3TOUA 1EP7A 1O8WA 4NHWA 4KDYA 1XIYA 1V58A 2Z9SA 6GSTA 2FA8A 2DMLA 4MCUA 4O7HA 2IMIA 4FYUA 2EIQA 1TW9A 2CX3A 4IJIA 3LORA 3P2AA 3J7Yb 1K3LA 1F3BA 4DEJA 6GSUA 2GT5A 4OD7A 1XBSA 5F0GA 2LNTA 3IV4A 1PL2A 4ECJA 3GN3A 5AGYA 3DEXA 2JL4A 4V2LA 3CTFA 2VM2A 5J41A 4K9ZA 2FD3A 4K0NA 2B1LA 5IMFA 2RUEA 3A2VA 4D73A 1GTAA 2D2ZA 3A2XA 3CYNA 4MH2A 3C7MA 2IWTA 3AY8A 3WYWA 2I81A 1B8XA 2V41A 4OFMA 3TCOA 3APSA 3GSTA 4K7OA 5G1LA 2IPAA 2DJJA 2KP1A 5IO2A 4XIHA 2OBIA 2YP6A 3KIJA 1YDKA 1SL1B 4L0UA 2I3YA 1CQHA 2WULA 1ZMAA 4L0WA 1B48A 4PXOA 4BWSA 3QCPA 5AIXA 5GZZB 3KEBA 1BQ7A 4POKA 2HI7A 3EWLA 1C72A 1V40A 2MMNA 3S9FA 4YQUA 2V2GA 3R2QA 2WJUA 1XOBA 2K8SA 1THOA 1XW5A 1GUKA 3D0ZA 4K2DA 2B7KA 3E9JB 3E0UA 3CMIA 1ERWA 4MPGA 4TR1A 4NWYA 2MBSA 1PKWA 1HNCA 2G0FA 3LQ7A 3TKPA 2HNLA 3M9KA 2V32A 4IKHA 2H0GA 2ZCTA 3EC3A 3FY7A 1EGRA 3SBCA 3L4NA 2K18A 2YCDA 1O81A 3UBLA 3NOFA 5JWQB 2F9SA 3KJYA 4AGSA 2E0QA 5D73A 4YQMA 3C71A 1SD8A 4IW9A 1KBNA 2FCHA 1AW9A 2RM6A 1GSDA 1ZYEA 4QQ7A 1Q4JA 1SK0A 3CSIA 1RK4A 2WCIA 3CTGA 1NHYA 2LUSA 4K0GA 3KD0A 5CP1A 4YAVA 1SENA 3P90A 3KTLA 4POLA 3EE2A 1OAZA 4G9HA 4PGTA 1BX9A 7GSSA 4ILFA 5ECQB 4ZIJA 1K0NA 1VF4A 4LMWA 1IYIA 3VWUA 3F0IA 3RPNA 2FY6A 5GSTA 4HI7A 5JWRB 4LL4B 2GSRA 2TRXA 4POMA 3ED3A 3APOA 1GULA 2EC4A 4CHSA 1MD3A 2C3QA 3U5RE 2DMMA 5A4VA 2H8LA 1SKSB 3DKSA 3L0HA 3QMXA 3G9BA 4I2UA 2HFDA 3L9UA 3DXBA 4TR3A 2VM1A 1T7PB 1SD9A 4ID0A 5DQYA 4HU7A 1GP1A 1HD2A 1FVKA 1T4ZA 3QOUA 3D4MA 2VO4A 4BPYA 3IOSA 4EKZA 3KTBA 5GAPD 4E8EA 3FZ9A 4ULXA 2WZ9A 1JZWA 5IIZA 4XHMA 5EL8A 3W6GA 4ZB8A 2CVDA 1S3DA 4KE3A 5ECMB 2PN8A 1OVNA 2IJYA 1GWCA 3TRPA 4EXJA 1K0DA 1J0FA 4F03A 3ME8A 5J5NA 5E59A 4TR0A 3F4SA 2GSQA 4K7NA 4DSSA 4K6XA 1KEBA 3VK9A 5G1KA 3TDGA 2OA7A 5ECOB 4POBA 5COHA 2YOIA 2FWGA 2H0IA 2GT6A 1NW2A 3CSHA 1LU4A 3TRQA 1U3IA 2VUPA 4PQIA 2L4CA 1PA3A 3GV1A 1TK8B 1SJ6A 3NIVA 2WB9A 2CX4A 4MLYA 4K8MA 5ECRB 3FW2A 3IK7A 4WF4A 5DCGA 3VPTA 4RQRA 1ZL9A 4X43A 1M9AA 1MDKA 3MAKA 1JZDA 2YPMA 4GRFA 4PNGA 1DE2A 2AB6A 1EOHA 3G7JA 1PD21 5E4WA 1XPVA 3ERFA 2TIRA 3FHKA 2FGXA 3GX8A 2X8CA 1XVWA 3J7Yk 3MDKA 2WGRA 5CRGA 1MEKA 3MNGA 3UL3A 3GUSA 1UC7A 2OE1A 3VI5A 3QAVA 5B6NA 3I69A 3DVXA 1X5DA 3ZRDA 2OJLA 3HZ8A 3FEUA 1TRUA 3Q74A 1PL1A 2HRNA 3FYGA 4MH3A 5HFGA 5ECNB 5IMCA 3PGTA 3ZLPA 3D6IA 2NPBA 1B4QA 3EVIA 5HQPA 5CRHA 5DBQA 3IDVA 2M46A 3LFLA 5JCWA 2ON5A 2IL3A 3TJJA 4AF2A 4NV2A 1TI1A 4XS4B 4G2EA 2AV4A 2IIYA 4PQHA 2PU9C 3TOTA 19GSA 1FW1A 5JWOB 3DVWA 1Z6MA 2RUFA 3DGQA 3WGXA 5IMZA 1QGVA 3KZQA 1QK8A 1GH2A 1R7HA 1TXXA 2OBKA 4Q5NA 5ECKB 2YWMA 4MJBA 1BAYA 5IPGA 3DD3A 1ST9A 4NMUA 2VD1A 2AYTA 6GSXA 2C0EA 3GKNA 1F3AA 5CRWA 3O3TA 2L5OA 1FO5A 10GSA 2AUVA 1FAAA 1OE8A 1ERVA 3TGZA 2PGTA 1ILOA 3H79A 5DDLA 4KDXA 2PBJA 4KX4A 1ZCPA 3EINA 5D96A 3VFIA 1OC3A 1S3CA 2YV9A 1DBYA 2H73A 11GSA 5ECHB 4J57E 2PPTA 2H30A 4LA1A 2HSYA 2R6KA 1EEMA 2YWOA 2C4JA 5G2ZA 4HQSA 2LJRA 1M2BA 4E8HA 2R4VA 3LGCA 1VRSD 2LEGA 3GSSA 1FHEA 2CV4A 4QL9A 3F9UA 2FLSA 4ECIA 5B8AA 4MF5A 4IP6A 5D9WA 3F3QA 2RM5A 2JACA 1U3AA 1WRYA 5LNKe 2E2GA 3Q18A 5HFIA 4ML1A 5LCZA 5IMVA 1TRWA 3DRNA 3OR5A 5EY6A 1K3OA 1GNWA 3UOMA 2CZ3A 1FOVA 1G7EA 4WR5A 1T00A 1XWAA 4RUVA 3F8UA 1R5AA 4ECCA 2LJKA 2HRFA 1HNBA 3U6VA 3D4TA 4DVCA 4DSSB 1AXDA 3IC4A 2DIZA 2GLRA 1GSSA 1EOGA 2WS2A 4WR4A 3GX0A 1XWKA 1B9YC 2OE3A 5JCUA 1GRXA 3NZNA 1E6BA 2L59A 4MJAA 2YZHA 3LYKA 3HHVA 3L9VA 5B8BA 2VAFA 1FVJA 5H5SA 4K7IA 1DUGA 1F9MA 2DLXA 3C73A 3P8WA 1ERTA 1VF3A 4GQCA 4WBJA 8GSSA 6GSSA 1B9XC 2N5FA 1A23A 2VLUA 3RBTA 1XWGA 4H86A 4V1Ag 4HU9A 4WKWA 2EIOA 1DE1A 6GSYA 2J9HA 6GSWA 3HJPA 5ECIB 3LEFA 4PQ1A 2V6OA 2PERA 2C3NA 3H93A 3BCKA 2EIRA 4GXZA 3HXSA 1SU9A 16GSA 3TUEA 4TRXA 1ZYQB 3GKXA 1TK5B 1YY7A 3UMAA 2NDOA 4IN0A 1F37A 1PX6A 4I6XA 1WJKA 4TXOA 2P5RA 4X1UA 1AAZA 13GSA 2FWFA 4NXIA 3GRXA 3I6AA 2F3MA 2YNXA 1A2JA 2GS3A 2GQMA 2GZZA 2OE0A 4I2TA 1AUCA 2FUG2 3UJ1A 3F63A 3WT1A 1T1VA 3HVSA 3FZ4A 1K0MA 1SKRB 3HVXA 5CREA 1QFNA 2R5GA 5IPHA 3GFKA 1W89A 2I4AA 3HKRA 2DJKA 4MMMA 2L5LA 1TJDA 4ZL8A 4KCEA 1A2MA 2H71A 1GLQA 1X5EA 1ZZYA 1VF2A 2BJXA 1I5GA 2H01A 3KMNA 5ECPB 2LS5A 1AQXA 3F4TA 2HYXA 3ZREA 1HNAA 1Z6NA 1JFUA 4N0ZA 4WF5A 1VF1A 4XS4A 3IR4A 2C0DA 2LQQA 5ID2B 1F6MC 2CZ2A 4ZXGA 5KEJA 3GA4A 17GSA 4GTUA 3I9V2 4FYBA 5D9TA 1G0TA 4HS1A 2YZUA 1FB0A 1FG4A 1XZOA 1QUWA 3DYRA 1QMVA 3GH9A 4ACSA 3HVVA 1W4VA 1NHOA 3CRTA 3PINA 4EVMA 2CQ9A 2WDUA 2C0GA 1YKAA 1WIKA 4G19A 4WBRD 2YJHA 2A2SA 4XCSA 2XC2A 3VURA 1A0RP 3C1SA 3UARA 4EDZA 4ZBBA 3ERWA 1GSFA 2H1DA 3BJ5A 3G7YA 5GAND 1O85A 2E7PA 2DJ0A 3CXGA 1ZGNA 4ZILA 2OKAA 4EF0A 3ERGA 1G6WA 3HD5A 1K0BA 1XXUA 3KH7A 3KH9A 2NBSA 4LL1B 1T3BA 4IHUA 2QSIA 2RLIA 3RAZA 3ME7A 5KN1A 1LJRA 2MMOA 4TOPA 2GDRA 2RIIA 3UVTA 3ZTLA 5L71A 4YQVA 2I1UA 2VCWA 4N10A 1XCCA 1Y25A 2PMTA 4OCFA 2LNSA 1ZOFA 1OC9B 5EVOA 3LYPA 3M1GA 1EV9A 1YEXA 4FYCA 5D9VA 3IXRA 2V1MA 4OCEA 2HLSA 2P5QA 4MZBA 2JU5A 1SL0B 2C80A 1JLWA 1A0FA 4JBBA 1MTCA 5HR1A 3FR3A 2O89A 2VLVA 3TKSA 5KN0A 3N5OA 1JZOA 2VCTA 5F05A 4JEDA 3VWWA 2DBCA 3A5WA 2H19A 3KP8A 2QC7A 3HA9A 2E2MA 1GSEA 4GSTA 2B5EA 3M9JA 5D93A 2BTOT 4EUYA 3RPPA 1JZRA 2I9HA 3O6TA 4GF0A 2B5XA 4OMVA 1E2YA 3TJBA 2L57A 3CBUA 4MZWA 1HYUA 4IVFA 3IAM2 3D21A 4FIWA 2ALBA 1YEPA 4ZL7A 3CSJA 2O87A 1XWCA 5C00A 2MMAA 4GSSA 3I43A 1O8XA 2MZCA 12GSA 2M72A 4TXOB 1SJZA 1WE0A 3KM6A 5AN1A 3TKSC 1NSWA 3ISOA 2H72A 5INYA 1BEDA 3GYKA 3GURA 5ECLB 1B4PA 3EU3A 1V9WA 1GSUA 3VPQA 3APQA 4KW6A 4FH8A 3IRAA 4IP1A 4IQ1A 1X9MB 3DMLA 4KSOA 2CT6A 4AJ8A 1PN9A 2VOCA 2N5BA 1GTIA 2LTKA 3C8EA 3IE3A 2JZRA 5DVBA 2X8HA 3TJKA 4AJ7A 5IM9A 3QAGA 4EC0A 5G5EA 2GGTA 4NHZA 1SL2B 1PGTA 1AC1A 4G10A 3MWHA 2KOKA 1J08A 3QR6A 3A3TA 3KXOA 2B3SA 2C1YA 1T4YA 3W8JA 4PURA 4DSRA 4F0CA 4YAPA 1PRXA 5IO0A 4P3YB 5F07A 2C0FA 3ZYWA 2HT9A 4BVYA 4EE0A 1NM3A 2K9FA 2DJ3A 4JZQA 1OKDA 1FB6A 1BYEA 1U6TA 4KDUA 1OC8A 4OWYA 4HUAA 1GSQA 5GSSA 1TRSA 4CDOA 6GSVA 2R3XA 1MD4A 4TR4A 1YJ6A 4V1Ap 1XW9A 4XRDA 4GWRA 1MDIA 4KGIA 5ID2A 2YV7A 2HE3A 2H1BA 2CAIA 1YQ1A 1J9BA 5D8IA 4KH7A 2IMDA 2F8AA 4NAXA 2KP2A 4KCAA 3IA1A 2H6ZA 2DC5A 2YJ7A 3QPMA 4HJ2A 4IBPA 14GSA 3TB2A 5F06A 4RQXA 5CYYA 4RI6A 4PX1A 2PVOC 3ZFLA 2C8UA 5DQSA 2H74A 3GKKA 1K3YA 4MF6A 1EP8A 1SYRA 1BG5A 2IMFA 5FT3A 2K8VA 1YF1A 3D5JA 3RHBA 5CO3A 3GMFA 3L78A 4I97A 4GLTA 1R4WA 1GLPA 1ABAA 3HCZA 2REMA 4TN8A 4CW9A 4ISDA 2B6MA 3ZMLA 5HR0A 2PWJA 1A24A 4V2MA 2L4QA 1GSYA 4J2FA 1QQ2A 1A8YA 1EEJA 2LRCA 3PH9A 3IHQA 1M0UA 4JR6A 4HZ2A 4OO4A 3IBHA 1SK1A 3M0FA 2O7KA 2AHEA 2HZEA 1N2AA 1WP0A 1WPIA 4KNDA 4L5OA 3ZIVA 4OFTA 3EYTA 2P31A 2JSYA 3HJMA 3VLNA 1OC9A 3DWVA 1A8LA 4IQAA 1M2DA 1M7TA 1Y6EA 2GVPA 5D9XA 1G7OA 3EMXA 1DSBA 1SJIA 2GSTA 5DJLA 5IOWA 1EWXA 2B1KA 1Z7PA 1YKCA 2H66A 5DAKA 3Q19A 4LMVA 1V98A 2ES7A 3ZFBA 2XPEA 1GTBA 3EURA 4L5LA 1M99A 1O73A 2LRTA 5IQYA 5CNWA 3IPZA 4WETA 2VL3A 3PR8A 2FHEA 1JHBA 1M9BA 4LLRA 4ECBA 4I5QA 9GSSA 1M2AA 3FK8A 3E3EA 2H1GA 3GKMA 4HOJA 4MF7A 2B5YA 2OACA 4GCIA 3TJFA 2DSAA 3A2WA 5H5RA 4OO5A 3WT2A 1SYXA 2AJQB 2KHPA 1UA5A 3M8NA 5HR3A 1AQVA 4KAEA 1H75A 3QAWA 3VI7A 2K6VA 2HXKA 5B6MA 4O5RA 3H8QA 2HSHA 4F2IA 4FO5A 2XHFA 3KP9A 5EPFA 4HJMA 4YH2A 2GQLA 1RW1A 2H70A 1RQMA 1EV4A 3BCIA 5IMAA 3K8NA 1TTZA 4BA7A 1TI3A 4AJ6A 4QL7A 3IAS2 2ON7A 4EO3A 2YN1A 1ML6A 2IMKA 3GNJA 4WXTA 3GL5A 4KB3A 1N8JA 2F51A 5F8BA 4HQZA 1V2AA 2FNOA 2VLTA 1UVZA 4MK3A 3D22A 3GTUA 2L6CA 2CA8A 3ZVJA 3EMPA 2AAWA 3KMOA 5DALA 3ZVJD 1GNEA 1CQGA 1YF0A 2BMXA 2QGVA 4MDCA 4MPFA 1I9DA 3FZAA 3KCMA 1GUHA 3M3MA 3LWAA 4X0XA 4ZBDA 2DJ1A 2A4VA 3RDWA 4N11A 3F6DA 1K0OA 3DIEA 1H4OA 5HR2A 2O85A 4WEYA 2J23A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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