3IOSA

Structure of mtb dsbf in its mixed oxidized and reduced forms
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
134
structure length
134
Chain Sequence
TVPAQLQFSAKTLDGHDFHGESLLGKPAVLWFWAPWCPTCQGEAPVVGQVAASHPEVTFVGVAGLDQVPAMQEFVNKYPVKTFTQLADTDGSVWANFGVTQQPAYAFVDPHGNVDVVRGRMSQDELTRRVTALT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title An extracellular disulfide bond forming protein (DsbF) from Mycobacterium tuberculosis: structural, biochemical, and gene expression analysis.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Disulfide bond forming protein (DsbF)
molecule tags Oxidoreductase
source organism Mycobacterium tuberculosis
total genus 40
structure length 134
sequence length 134
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-08-14
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3iosA00
1TI1A 5DQYA 5CRHA 2ZNMA 3DKSA 2AUVA 2VCQA 3GKMA 4KSOA 1GNEA 4WBJA 2O8VB 4KA0A 3UBLA 4HJ2A 4N0VA 2GT6A 2VM2A 2MMZA 4IQ1A 3KH7A 1A23A 1ZOFA 4JR6A 1WJKA 1VRSD 3LSZA 1UN2A 2DJJA 4GSNA 2JZRA 1USBA 5ECHB 4JZQA 2KUCA 4EF0A 2LSTA 4POLA 4MZBA 1Z7PA 3C71A 3FZAA 3RPNA 1QMVA 1JLVA 3TJFA 1XOBA 4TVEA 2V41A 2VUPA 3U5RE 2EIOA 3WD6A 4EUYA 2H76A 2LS5A 2M80A 1GP1A 1O6JA 1V57A 1CQGA 1O81A 1H4OA 6GSYA 5B8AA 4JU5A 2VL3A 2MMAA 4MLYA 4IN0A 3WGEA 2VL2C 4LMWA 1BX9A 1WWJA 3NOFA 3TB2A 1SKSB 3IPZA 3U6VA 4ML6A 4E8HA 1W4VA 3J7Yk 3L9UA 1YQ1A 3CTFA 1XWCA 1XWGA 1MTCA 3ZFLA 3VPQA 3UIWA 5DAKA 5F05A 5D8IA 5G5EA 2YANA 1B9YC 3I69A 2BMXA 11GSA 2H1GA 2H1AA 2GSSA 4FO5A 3J7Yb 1UC7A 4X1UA 5EY6A 1OC8A 3A2WA 5IMDA 9GSSA 5IMZA 1SL2B 5GZZB 4K1FA 2HYXA 1SL1B 4KX4A 3TKQA 5G30A 3QAVA 4MH2A 2PVQA 4X0XA 4TR1A 2LJRA 1TK8B 1B8XA 4OCFA 4HOJA 4MJBA 2VLVA 1J08A 4IKHA 1PA3A 2M72A 2RUFA 1XW6A 1TW9A 2OE0A 4XS4A 3KMNA 2HRFA 2FWGA 2WJUA 1S3CA 1BAYA 2JADA 5IMFA 1K0NA 3FW2A 4JEDA 1CQHA 2FGXA 3KD0A 4E8EA 3GRXA 3LFLA 3KEBA 4O92A 2VIMA 5F07A 5ABRA 3GA4A 4ML1A 5CAXA 3LXTA 3C1SA 1OAZA 5D93A 3P2AA 4HZ4A 3I43A 4Q5QA 1WP0A 1IYHA 1O7UA 2CAQA 1GLPA 3VI5A 3US3A 5IOXA 2OBKA 1DSBA 4FYBA 4ZB9A 3F0IA 3ERWA 4TR3A 2B1KA 2YV7A 3R2QA 1GSEA 2TRCP 3W8SA 2H1DA 3FZ9A 5HR0A 1TDIA 1PQNA 2YWNA 2OA7A 2PN8A 2FUG2 2OKAA 1HYUA 3C7MA 1PMTA 3VFIA 3CXGA 3HVSA 4L5LA 1Z9HA 3RDWA 3CSJA 4CW9A 1M2AA 4WETA 2HT9A 3FEUA 4JRRA 2D2ZA 3EINA 3EMPA 3IRAA 1YZXA 1O73A 2LKUA 5B8BA 1Z7RA 2NPBA 4EKZA 2GDRA 3QAWA 2CV4A 4EO3A 3IHQA 1R5AA 1F2EA 2OJLA 2WDUA 4NV5A 4ZBBA 3IBHA 1QGVA 5G31A 1F9MA 2H0GA 1GUMA 3DWVA 1HQOA 3DXBA 1EEMA 5COHA 5KEJA 3NIVA 2VD1A 4MJCA 4HU9A 1M99A 3VK9A 3C73A 2O89A 1J9BA 4HI7A 2YWMA 5DAKB 3F4RA 2CZ2A 5HFGA 4GF0A 2J23A 2R4VA 1IYIA 1XOAA 2J9HA 5IM9A 1F3AA 4RI7A 4JE1A 4ZXGA 1JZWA 5DJMA 2H19A 2C3TA 2FHEA 1XFLA 3DD3A 2ES7A 2OE3A 4WXTA 4O5RA 5HFIA 1FB0A 4K7IA 2IFQA 2MMNA 4MPGA 3KCMA 4KAEA 2GLRA 1PRXA 1XWAA 3EYTA 4PX1A 5GAND 1ML6A 5J9BA 5CYYA 1TP9A 1X0RA 3ME7A 4KSMA 3Q6OA 4BWQA 4TR1B 1WMJA 2XPDA 3VPTA 3EU4A 1KTEA 2H73A 4MMMA 3VURA 3VWWA 1E6BA 5J41A 4XS4B 3ZFBA 3UARA 4BWSA 4OFNA 4XRDA 1JFUA 1X9SB 5GSSA 4OO5A 2IMIA 3TKRA 4GTUA 5AIXA 3EVIA 3ZYWA 4HEA2 4ZBDA 3H79A 4I2UA 2WRTA 5F06A 2A2RA 1NHOA 1XBSA 1DBYA 1GNWA 2AB6A 2CT6A 4GSTA 1Z3EA 3G7YA 3GX8A 3HJMA 1MD3A 2QGVA 2JACA 2FWHA 2I81A 4XTSA 1PL2A 2ALBA 4NXIA 2HLSA 5INYA 1ZCPA 3GH6A 1LU4A 4LL4B 2DMMA 2CA8A 1G7OA 1OVNA 3F4SA 2GVPA 1ZYQB 4XS1A 3N5OA 1K3YA 1ZZYA 1PGTA 4HZ2A 4F9ZA 1ERUA 1OE8A 3M8NA 2C0FA 2MYGA 3LYPA 3GN3A 2GSQA 4TXOA 4NWYA 1GH2A 4KE3A 5G5FA 2HFDA 2K18A 3HVXA 4K7NA 4HQSA 3NZNA 2EIQA 2PGTA 5HFKA 4O32A 3QMXA 4WBRD 1B4QA 1O85A 4GCIA 3O3TA 2XPEA 2YNXA 3KGKA 4WR5A 4WR4A 2F8AA 3WGXA 5DDLA 5J4UA 2EIRA 1MDIA 3UAPA 4YAPA 3GYKA 3APQA 3SWLA 2L6CA 4BPYA 3VWUA 3GKXA 2LUSA 2K8VA 3HD5A 4FYCA 2Z9SA 4NPBA 1G6WA 2RM6A 5DCHA 1WPIA 1GSYA 2HZEA 2L57A 1M2DA 2C4JA 4ECIA 3BOAA 2L4QA 2PWJA 4WKWA 4MJEA 5CREA 3EWLA 2YV9A 4OCEA 3E3EA 2JZSA 5HQPA 2DLXA 1OC9A 1TU8A 1NM3A 3BCIA 1BQ7A 3FHKA 3ZZXA 1FG4A 5CRGA 1AXDA 3ED3A 1SD8A 3I6AA 4K9ZA 5DCGA 4OWYA 4JBBA 4I2TA 1TU7A 4MPFA 1FO5A 1FAAA 4J57E 2WCIA 1O8XA 1TRWA 2LNTA 2TRXA 1AAZA 4KDXA 1W89A 5GSTA 2I1UA 2IIYA 3S9FA 2DJ3A 1QUWA 4PURA 1NW2A 2RLIA 3GURA 5CP1A 4XCSA 2L5OA 4Q5NA 3JCML 5IO0A 2CX3A 4ECBA 4OMVA 3UJ1A 4QL7A 1THOA 1GSSA 3TKSC 3HDCA 2H6ZA 2VCZA 1ON4A 3HHVA 4TXVA 1TI3A 1Z5YE 3BCKA 4KNDA 2LQQA 1U88A 4ZB6A 1PD21 1NSWA 7GSSA 5JCUA 2L4CA 22GSA 2YWIA 2YZUA 5IO2A 1Z6MA 5KN1A 3GKKA 2JZTA 4FH8A 4Z7XA 1TTZA 3ZIVA 3N9JA 4I5QA 3D0ZA 2HSYA 5HR1A 3CYNA 4F0CA 1S3AA 3BD2A 1XPVA 1XZOA 2PVOC 3L4NA 1SK0A 3DRNA 1V2AA 2VCXA 1F37A 5A4UA 5J9CA 1EP7A 2HI7A 4N10A 2VO4A 1GSFA 4IVFA 4TXOB 2DIZA 1ILOA 3FY7A 1AIUA 2GZPA 2PUKC 4K2DA 5ECLB 2C3NA 3MNGA 2B5XA 4F82A 3PH9A 2AAWA 3Q18A 4RQXA 4AJ6A 1SL0B 5JCGA 5GAPD 1ST9A 2GQLA 6GSXA 2KP1A 3P7XA 4KUNA 4TW5A 2EC4A 2IPAA 5AIVA 4TN8A 2VCTA 1R26A 1UA5A 4H86A 4TRXA 3MDKA 1XW9A 1JZRA 4IP1A 3IR4A 5AGYA 3UEMA 14GSA 4MF6A 4LMVA 4PGTA 1I9DA 1ERTA 4IBPA 1A8LA 4L0UA 2HZEB 1JZOA 5DJLA 5ENUA 5D96A 4EVMA 1TRSA 4OO4A 1R5PA 1A2JA 2B7KA 2QKEA 4POKA 1PSQA 3IXRA 3ZITA 3VI7A 1K0OA 20GSA 1FHEA 4MZCA 1GULA 1OC9B 3GSTA 1MDJA 3DIEA 2CAIA 3FKFA 1LBKA 2B7JA 4MCUA 1V98A 1YF0A 1GRXA 2GZYA 4BL7A 2DIYA 2VAFA 2L5LA 5IMVA 4EL1A 5DQSA 3L9VA 1J0FA 2H75A 4BVYA 3KTBA 1HD2A 3WYWA 3KTLA 1RK4A 4I97A 1TRVA 1BEDA 3UMAA 4HJMA 3APSA 13GSA 2A2SA 2CVBA 2K6VA 3MSZA 3F9UA 1M7TA 2FA4A 1TOFA 4HQZA 4KCEA 1BG5A 1M9AA 5LCZA 2PU9C 4ILFA 5IPGA 3TUEA 4YH2A 1HNBA 1SK1A 4WF4A 1K3OA 5ELAA 1PKWA 3QCPA 2X8GA 2DBCA 2DC5A 3TJBA 2IWTA 2NVLA 2XBQA 2WFCA 3HYPA 4NMUA 2QC7A 1K0CA 3K8NA 2R5GA 1M9BA 4K6XA 1DE1A 2H30A 3O76A 3ZIJA 3Q74A 2IMEA 2H70A 2KOKA 4ZILA 3KZQA 2DJKA 4KB3A 2H0HA 1EV4A 3GMFA 4QQ7A 2H0IA 1V58A 2C0GA 2P5RA 2VL9A 2GS3A 2C8UA 2AJQB 1AQWA 4ACSA 5JCWA 1YKCA 5C00A 2F8FA 2YZHA 1A2MA 1A0RP 2JL4A 1WE0A 4YQVA 2KP2A 2RUEA 2V32A 2PPTA 3PGTA 2WS2A 1URMA 1GTBA 1B4PA 1N2AA 1ERWA 3F3QA 3DVWA 1OKTA 2CZ3A 1O8WA 3AY8A 4OFMA 1JLWA 5H5SA 3BBYA 2FWEA 3GUSA 3TGZA 3M9KA 5IOWA 1G7EA 4G2EA 3CRTA 5HR2A 5ECKB 1H75A 4K0GA 3LJRA 5EVOA 1M0UA 3M0FA 3FR9A 3HCZA 3ZREA 2H74A 5CRDA 2CX4A 1MEKA 3CSIA 4EDYA 3IE3A 2H6XA 3D4MA 2GT5A 2OBIA 3FR6A 3EU3A 2O87A 2REMA 1AQVA 3E9JB 2FCHA 1WIKA 2B1LA 3D4TA 3Q19A 1XVWA 1SYXA 2P5QA 4TR4A 2K9FA 1T8EB 1EZKA 4IGJA 3UVTA 3RPPA 5IMAA 1QQ2A 18GSA 2IMKA 5E59A 2WZ9A 2NTOA 1SENA 2LJKA 2VM1A 1X9MB 3GKNA 3EURA 2ON7A 4MF7A 4NHZA 1Q4JA 2JSZA 3HJPA 1K0DA 5KN3A 4MP4A 2PBJA 2LTKA 1NHYA 5J5NA 4V1Ag 3LYKA 1U87A 2HNLA 2WGRA 3FR3A 3F6DA 1ZGNA 5KN0A 2YN1A 3TRXA 2QSIA 2HZFA 3VWVA 1PN9A 5E4WA 4EXJA 4QL9A 4KW6A 5ID2B 1SKRB 1TJDA 1ZL9A 3H8QA 3LEFA 3WGDA 2DSAA 4ZL9A 3G7JA 3KJYA 4GQCA 4IQAA 3ZTLA 1QFNA 2IMDA 4ID0A 5D73A 5FT3A 4L0WA 4AGSA 4EDZA 3D5JA 3F6FA 2B6MA 2RIIA 1GLQA 3RAZA 2LQOA 1R7HA 3G7IA 2JU5A 1SYRA 1DE2A 5ELGA 1HNCA 1V9WA 2F51A 6GSVA 1VGLA 2BTOT 1ZYEA 3IAS2 2MMOA 3KP8A 3RBTA 2O85A 3ERGA 1YDKA 1VF2A 3LWAA 4L8EA 1SJ6A 2B5YA 2P31A 3HZ8A 1XWKA 1V40A 1EWXA 5A5KA 2R37A 4ECCA 1U3IA 2C80A 4KH7A 4V2LA 4IJ3A 1EV9A 2I3YA 17GSA 5CRWA 3A2VA 2LRTA 3KH9A 4POMA 1Z6NA 3HKRA 3WT1A 1OYJA 3UOMA 3FZ4A 1MDKA 2GZZA 2F3MA 2B3SA 2XBIA 3GTUA 1XW5A 2E2MA 1GUKA 3M9JA 2KHPA 2FY6A 2ON5A 2H1BA 2TIRA 3GNJA 4HDEA 1YKAA 4EE0A 4IW9A 2AV4A 1EGOA 1K0BA 5G2ZA 3KIJA 3C1RA 4ECJA 4IP6A 1XIYA 3L78A 2X8CA 2E2GA 4KGIA 1A2LA 2ZUPA 4NV2A 1YJ6A 1T7PB 3UBKA 1FW1A 4PQIA 19GSA 3G9BA 2LRNA 2N5FA 3TJGA 5J3RA 3LGCA 4N0ZA 1PX7A 5FHIA 2R2JA 2OE1A 3LXZA 3TDGA 4GXZA 5JWOB 3VLNA 3FYGA 1VF1A 5F8BA 4DSRA 2HXKA 1XWBA 1ABAA 3WT2A 1N8JA 2DJ1A 3D22A 6GSTA 2L59A 1SKWB 5IIZA 3TJJA 1SK2A 2B5EA 1GSQA 4I6XA 4EC0A 4G10A 3QPMA 3IK9A 3D21A 4AJ7A 5ECSA 3BJ5A 3KXOA 4JR4A 3LQ7A 3OR5A 4K0NA 3HA9A 2C0DA 2IL3A 2A4VA 3GX0A 3QAGA 2HE3A 4V2MA 1A24A 1T3BA 3QFAC 2H72A 3RHCA 2X8HA 3F4TA 4MJAA 3GIXA 2X64A 3HZ4A 1ACVA 2WB9A 4FIWA 2PMTA 3MWHA 1FB6A 1OKDA 5ECOB 1GWCA 5EPFA 4YQUA 1DUGA 4CHSA 1T4ZA 5G1LA 4MH3A 2M46A 16GSA 2XC2A 2YCDA 2H6YA 1AW9A 4FYUA 4XRAA 2G0FA 1K0MA 5G1KA 5ECQB 4ULXA 6GSSA 1VF4A 3V1WA 1GSUA 5C04A 2PERA 3GFKA 5IQYA 4Q5FA 2V1MA 2YJ7A 3ZL5A 3E0UA 1X5DA 4L5OA 1X5CA 3A2XA 4ZL7A 4PNFA 1FVKA 2VLTA 5CO3A 1OC3A 4F0BA 1A0FA 4K7OA 1YY7A 1EOHA 1T1VA 2LJAA 4P3YB 2LEGA 5IMCA 1F3BA 3IOSA 4ZBAA 3HVVA 4N11A 4D73B 3GTUB 1YF1A 4AF2A 3D6IA 4DEJA 3TKSE 4MABA 3IDVA 3QR6A 2C1YA 3F8UA 3CMIA 2X99A 3H4KA 1QXHA 2OACA 3RHBA 4KCAA 1F6MC 4GQFA 5JWQB 4PNGA 5AISA 1EOGA 1FVJA 3FZ5A 1I5GA 1Y6EA 3A5WA 4MA9A 1U6TA 3CTGA 2ZCTA 4PQHA 1SJZA 1C72A 3GL5A 4ZB8A 2VOCA 1XVQA 5A4WA 4DSSB 3M1GA 4I8BA 1R4WA 5ECMB 2GSTA 1E2YA 2C0EA 3M3MA 3ERFA 2FLSA 2FWFA 4ISDA 3F3RA 3CSHA 3GSSA 5ID2A 2FNOA 3O6TA 2H8LA 4KDUA 1XCCA 3L0HA 4O7HA 3GL3A 3VWXA 4J56E 3TRQA 2VD0A 5DALA 4F2IA 2WULA 1YEPA 3GV1A 5B7CA 2HRNA 1QK8A 5D9TA 2YPMA 5ECPB 3IC4A 3UL3A 2VCWA 3ISOA 1GTUA 3QOUA 1GTAA 1U3AA 4XIHA 3KP9A 5H5RA 3MAKA 4WEYA 3ZRDA 4Q5RA 1ZMAA 2I9HA 5DBQA 3DGQA 1PX6A 2N5BA 4LA1A 1K3LA 1X5EA 2CVDA 3W8JA 6GSWA 2DJ0A 5ECNB 6GSUA 12GSA 4DSQA 2DMLA 4POBA 2LNSA 3TKSA 1WRYA 5B6MA 3LORA 2N5AA 2CVKA 4KDYA 1T4YA 4PXOA 1VF3A 1OE7A 3TOUA 4YAVA 4RI6A 3DYRA 3EE2A 3HJOA 4XHMA 4ZL8A 5CNWA 2L6DA 3DVXA 8GSSA 2MBTA 4NAXA 5L71A 3GH9A 2IJYA 2O7KA 4TR0A 2GQMA 2BJXA 2MBSA 2R6KA 2FA8A 4LLRA 4WF5A 4F03A 4G19A 5DVBA 1RW1A 5LNKe 3CRUA 2OADA 1G0TA 3P8WA 1T00A 3IK7A 2P0GA 1B48A 4DVCA 1Q98A 4CDOA 3HY2A 2VL2A 1EEJA 1AQXA 1BYEA 4MDCA 2G2QA 2YWOA 5EL8A 1YEXA 3TRPA 4K8MA 1SD9A 1THXA 1TXXA 4RQRA 1S3DA 4MK3A 10GSA 2CQ9A 3DEXA 3EMXA 3TJKA 3ME8A 1AUCA 5AN1A 4OFTA 2LRCA 4BVXA 4HS1A 2I4AA 3HXSA 3IV4A 4HUAA 1KEBA 1ERVA 1TKDB 2F9SA 1HNAA 4BA7A 3EC3A 2YJHA 2AYTA 2IMFA 1LJRA 5ECIB 1WOUA 4RUVA 4ZIJA 2FD3A 4J2FA 2C3QA 2NBSA 1PL1A 3QD9A 4TOPA 4PQ1A 3GHAA 4PUFC 3P90A 3APOA 4GRFA 3TCOA 1K0AA 5JWRB 1B9XC 4G9HA 4IELA 3KM6A 5H5QA 3H1NA 2E0QA 1GUHA 3LG6A 5ECRB 5D9XA 2H71A 5DALB 4GLTA 3ZMLA 2H66A 1GTIA 4V1Ap 3F63A 3TKPA 2R3XA 5IPHA 2KLXA 4N30A 1UVZA 2IN3A 4AJ8A 1SU9A 4IHUA 4MF5A 2VLUA 2XHFA 2RM5A 2E7PA 1JZDA 5LD0A 3L9SA 3QFBC 2VCVA 1AC1A 2V2GA 3SBCA 4IS0A 5FWGA 2GGTA 3I9V2 4LL1B 3PR8A 4GWRA 3IA1A 3PINA 4NHWA 3ZVJD 2K8SA 3FRCA 2JSYA 4PUAA 1KNGA 3KMOA 5HR3A 3H93A 3W6GA 2YOIA 1JHBA 2HSHA 2GTUA 3C8EA 5D9WA 1FOVA 1A8YA 2AHEA 3IAM2 5D9VA 4YQMA 2GSRA 1PKZA 1X9WB 3CBUA 4D73A 4XS6A 1TK5B 1EGRA 1MD4A 3ZVJA 2YP6A 1G6YA 2V6OA 1BJXA 2V6KA 1Y25A 2GQKA 3UVHA 3DMLA 1EP8A 1XXUA 4IJIA 4V2NA 3TOTA 1M2BA 2IFQB 5B6NA 2H01A 3FK8A 4MZWA 4X43A 4TKYA 4GSSA 3A3TA 4OD7A 1SJIA 3QDNA 1GSDA 1KBNA 2LV3A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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