3KH9A

Crystal structure of the periplasmic soluble domain of oxidized ccmg from pseudomonas aeruginosa
Total Genus 47

The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
47
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
RGSHMLDPSELPSALIGKPFPAFDLPSVQDPARRLTEADLKGKPALVNVWGTWCPSCRVEHPELTRLAEQGVVIYGINYKDDNAAAIKWLNELHNPYLLSISDADGTLGLDLGVYGAPETYLIDKQGIIRHKIVGVVDQKVWREQLAPLYQQLLD

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
EMPTYTI2 (33-36)3H1 (28-30)AH1 (75-90)TIV1 (98-101)S1 (38-39)TI6 (123-126)S2 (44-46)S6 (119-123)TI5 (71-74)3H2 (57-60)TI3 (47-50)S5 (94-99)S3 (54-56)TVIII1 (48-51)S4 (65-70)AH2 (103-112)TVIII2 (117-120)S7 (139-143)TII1 (35-38)TI1 (31-34)TI4 (50-53)S8 (148-154)TI7 (144-147)AH3 (127-132)Updating...
connected with : NaN
molecule tags Oxidoreductase
source organism Pseudomonas aeruginosa
publication title Structural and functional characterization of CcmG from Pseudomonas aeruginosa, a key component of the bacterial cytochrome c maturation apparatus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein dsbE
total genus 47
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature
pdb deposition date 2009-10-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF08534 Redoxin Redoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3kh9A00
1C72A 3BBYA 1SL2B 2E2GA 2F8AA 4OFMA 1VGLA 4HQZA 4J2FA 4MP4A 2MYGA 3ZMKA 3Q74A 3C8EA 5G5FA 2I3YA 3I9V2 2CX4A 5HR3A 1GP1A 1MD4A 3H8QA 3QFBC 5ID2A 3UMAA 2VCXA 4KW6A 2LJAA 3PH9A 2ES7A 2KUCA 3IK7A 2N5AA 1FVKA 4POBA 2C0DA 4GSNA 2AUVA 4OWYA 4JE1A 3UJ1A 5ECMB 3FW2A 4WETA 4IQAA 1V2AA 2A4VA 4NWYA 5IM9A 2PUKC 3ZIJA 5D8IA 4ZIJA 3A5WA 1FW1A 4HJMA 2PBJA 5F8BA 1FAAA 3WGDA 4EDYA 4KCAA 5CAXA 3N9JA 3H79A 3LSZA 4WR4A 2H1AA 5D73A 5IPHA 4XRDA 2PERA 1ZYEA 4G19A 2GSSA 2KP2A 4IJIA 2DJ3A 2OJLA 4N11A 3TRPA 2IN3A 4TXOB 2H8LA 3UBKA 4I5QA 2RUFA 3MAKA 3TKSC 4GQCA 4MABA 1TDIA 2F9SA 4RI6A 1T1VA 2VCWA 1VRSD 5FT3A 5J5NA 1VF3A 2HI7A 4MK3A 3DWVA 3F63A 4K9ZA 3M8NA 1DSBA 3EMXA 1MTCA 2YWOA 1GSQA 5HFGA 2K6VA 2XHFA 3BOAA 4JR6A 2L5LA 4POMA 2IMKA 2LQOA 3MDKA 1EP8A 2H1GA 4BL7A 1WOUA 5IQYA 4P3YB 4XS1A 3IAM2 2HZEB 4HDEA 3TOTA 4WEYA 2JSYA 2H66A 3H93A 2CQ9A 1XIYA 2BMXA 3AY8A 3E9JB 5J41A 5KN2A 1UVZA 2LJKA 2QKEA 1JFUA 3ERFA 3GA4A 4Q5RA 2AAWA 2WB9A 3CSHA 3GKNA 4MA9A 4BPYA 3UVTA 1THOA 4V1Ap 1YEPA 1WWJA 1AW9A 2IIYA 3HJPA 1XPVA 3NIVA 1WJKA 5IOXA 3IHQA 1MDKA 1VF4A 3CTGA 4KSOA 4DSSA 3GV1A 2XPEA 4YQMA 6GSSA 4WBRD 1TI3A 4HJ2A 2H0HA 2TIRA 3IA1A 3IC4A 3HZ8A 1V58A 5HR0A 1PKWA 1K0OA 4O7HA 4YAPA 1SJIA 4NAXA 4E8EA 4OFTA 2ZNMA 1T3BA 5B6MA 1V9WA 2IPAA 3QCPA 3FYGA 4EUYA 4EE0A 1G6WA 4OO5A 3PGTA 1TRUA 4EF0A 3O76A 2I9HA 3ZREA 4OD7A 1XOAA 4KH7A 2H1DA 3WGEA 2I1UA 1HYUA 1NW2A 2YANA 2DIZA 3VWWA 2MBTA 3VURA 7GSSA 2OE0A 3DGQA 2FCHA 5A4VA 1U3AA 4ZL9A 1JHBA 4V2LA 2B7KA 4WF5A 1M9BA 1SENA 2DBCA 1Z9HA 3FR6A 3KTBA 3GFKA 1R7HA 1KEBA 2H70A 2VM2A 4MH3A 2I4AA 1BX9A 1FB0A 4IBPA 2DJ1A 1VF1A 5EL8A 3ZYWA 3G7IA 4X0XA 1UN2A 4K6XA 2MMAA 4PNFA 1GSSA 3EWLA 5G1LA 2YJHA 1GTAA 1G6YA 1FHEA 1O81A 2C0FA 4IS0A 1KBNA 2V6KA 3P8WA 1NHOA 2GQMA 4ILFA 1TTZA 1TK5B 4FH8A 4BWSA 2HT9A 3GTUA 2Z9SA 3EMPA 1TOFA 2JACA 1WMJA 5A4UA 1F3BA 4DEJA 3UOMA 3F4TA 1JZDA 4EVMA 1N8JA 3LEFA 5JWRB 3UAPA 2M80A 5CRWA 3FR9A 2WDUA 4KA0A 2KOKA 1ZL9A 4IHUA 2M72A 3IAS2 3KH9A 2OA7A 1Z5YE 2OACA 2L6CA 3GMFA 4HUAA 1SK1A 1GNEA 5EPFA 2YN1A 2VL2A 1GL8A 3F6FA 1YZXA 5G31A 1I9DA 4PGTA 4POKA 2IMFA 3KM6A 1X5CA 2YWNA 5FHIA 2DC5A 5GAPD 3UEMA 3GRXA 9GSSA 1PX6A 5JCWA 4IQ1A 4EC0A 12GSA 1PL1A 2AV4A 4BA7A 4GXZA 4K7OA 2H6ZA 2X8GA 1K0BA 1PL2A 1XWGA 3CRTA 1OVNA 2MMZA 4IVFA 3FK8A 1GTIA 5ELAA 1BEDA 4JEDA 3KJYA 4QL9A 1EV9A 2ZCTA 3H1NA 1EEMA 2LJRA 2LV3A 1SKSB 2BTOT 1A0RP 5F05A 5JCUA 1OC8A 1T7PB 5ENUA 4WKWA 5CREA 1WIKA 1X9SB 2H74A 1A2LA 2C3TA 2YP6A 3IV4A 5DJMA 1Z7RA 3LXZA 1XW5A 1K3OA 1NHYA 2MMOA 1YEXA 3F3RA 1U88A 2FHEA 1X5EA 3KGKA 4AGSA 3A2WA 5GSSA 2QC7A 3PINA 4Q5NA 2NTOA 5D93A 4MMMA 4V2NA 4TOPA 2B5YA 2N5FA 2FA8A 2C0EA 1XWKA 3GURA 4NMUA 5ECPB 4PX1A 3HZ4A 3L9SA 1FVJA 2L4QA 1XOBA 4L0UA 3CMIA 2PPTA 2GTUA 1S3DA 2CT6A 4FYUA 3Q19A 2R2JA 5DQYA 5DQSA 2R5GA 2YOIA 3M3MA 3J7Yk 1SK0A 1X0RA 1G7EA 2IL3A 3DEXA 1O85A 2LNTA 4BVXA 4L8EA 3QDNA 1PD21 2FGXA 3CBUA 4KGIA 4OO4A 3L78A 2H6XA 1SL1B 4MDCA 2L59A 1A8YA 5CRDA 2V6OA 3KIJA 3DIEA 3EVIA 2GSTA 1ZGNA 2LRTA 4MF6A 3FKFA 1RQMA 1WPIA 4MJEA 4O32A 3VWVA 4ML6A 5G30A 2VLTA 2GZZA 5KN1A 4NHWA 2RM5A 4XS4B 4GLTA 3RBTA 3L9UA 3DYRA 4TXVA 4GTUA 4AJ7A 4GCIA 2YZUA 1AXDA 3P90A 2DMLA 4ZBBA 2HRFA 2YPMA 5AISA 2LNSA 5GSTA 2XPDA 1GUKA 4EL1A 3CSJA 2HE3A 3CRUA 3GKXA 1YY7A 1E6BA 1O7UA 5IMCA 3APSA 1UA5A 3CTFA 4N0VA 2DJ0A 1AQVA 2FWGA 2EIRA 1TXXA 3D6IA 4TXOA 3TUEA 1QXHA 4AJ6A 2P5QA 11GSA 4LL4B 1BAYA 3US3A 4JU5A 4PUFC 2H6YA 3WGXA 3NZNA 1HD2A 3GNJA 1SL0B 3EINA 1PMTA 3C71A 3DVWA 4HU9A 2LRCA 1PSQA 1ERVA 2VCZA 1TKDB 1YQ1A 3EU4A 4OMVA 4GQFA 1DE1A 4HS1A 3TKRA 5HFIA 2JZRA 1GLPA 1PX7A 2G2QA 1J08A 4NHZA 1B9YC 3V1WA 4V1Ag 2AHEA 1K0CA 1A8LA 2YJ7A 2OBKA 5FWGA 2CA8A 2TRCP 3U5RE 1ZOFA 1A24A 3GH6A 3TJKA 1IYIA 1F2EA 1XFLA 3KZQA 8GSSA 3MNGA 2GSRA 3GSTA 2F8FA 3F4SA 4MLYA 1SJ6A 3QMXA 2VLUA 3EE2A 2XBQA 1K0AA 3MSZA 2PVQA 4JR4A 2X99A 1V57A 1T8EB 4KDXA 2V2GA 4RQRA 1KNGA 5DALA 3E0UA 2O8VB 5DVBA 4KUNA 3ZLPA 5KN3A 3DRNA 6GSYA 3ZTLA 4MPGA 1O6JA 3OR5A 1SYRA 1X9WB 2L4CA 3HD5A 1GSYA 4F0CA 3RPNA 2GS3A 2MBSA 3GYKA 3ZIVA 3EURA 1MD3A 1R4WA 5AGYA 3VK9A 2P5RA 3P7XA 4TN8A 3LGCA 4ZB8A 1GSEA 3WYWA 2CZ3A 3ZFBA 3KTLA 1GUHA 4FIWA 1K3YA 3HJMA 17GSA 1AQXA 4GWRA 4KE3A 4PQ1A 1HNAA 2YV9A 4ZL7A 6GSUA 1TRSA 1QFNA 2O7KA 3GX8A 5H5RA 4WF4A 5INYA 4KAEA 4XCSA 5KEJA 1HQOA 5G1KA 3P2AA 4K0NA 3F4RA 5A5KA 1M2BA 2F3MA 1I5GA 3H4KA 4YAVA 1B4PA 5AIVA 3DMLA 2GZYA 4RUVA 1DE2A 2C0GA 3IPZA 1H75A 3W6GA 1PA3A 5ECSA 2DIYA 5J9CA 1ST9A 1FOVA 4NPBA 4I8BA 3KD0A 2KLXA 2EIOA 1ML6A 2EC4A 1NM3A 1R5PA 1T4YA 5DDLA 2E7PA 4K1FA 1OKTA 4CHSA 2FUG2 4KCEA 4O5RA 4PURA 1GSDA 2I81A 3WT2A 2KHPA 1ZMAA 3F3QA 2AB6A 1CQGA 5DCGA 2O87A 3HY2A 2RUEA 5CO3A 3VFIA 2LKUA 1H4OA 4J56E 2P0GA 1K0NA 1MDJA 1SD9A 2R37A 3GKMA 4IN0A 4IP1A 3ZZXA 1R5AA 3KH7A 3ME7A 3GKKA 2A2RA 4V2MA 3EYTA 2HLSA 3APOA 1GTBA 3DD3A 3Q18A 1GUMA 3CSIA 1Z6MA 1O73A 2FWHA 1M7TA 2C8UA 1Q4JA 3HHVA 2C4JA 1FB6A 1DBYA 3R2QA 3QPMA 4LMVA 2YWMA 4MJBA 4IW9A 2IFQB 2OBIA 3PR8A 3IOSA 3LG6A 3SWLA 4MJCA 1HNBA 1PN9A 2H1BA 1SK2A 5IPGA 3KXOA 1XBSA 2ON7A 4TR0A 1U3IA 3IRAA 3FRCA 1JLVA 4AF2A 3W8SA 1F37A 4HOJA 3VPTA 4E8HA 22GSA 3SBCA 1SJZA 5GZZB 4ZB9A 4PQIA 3HYPA 4PNGA 4L5LA 5EY6A 1SU9A 2LQQA 5IMVA 3FZ4A 1UC7A 1LU4A 3ZMLA 2WGRA 3GX0A 2AJQB 2B1LA 1GLQA 2RIIA 1SD8A 3L4NA 2YV7A 2LSTA 3TRQA 1BQ7A 1V40A 5CRHA 4OFNA 13GSA 3IK9A 3IDVA 2CAQA 1G0TA 1W89A 2BJXA 2HYXA 4RQXA 2H01A 1OC9B 3NOFA 3QAGA 4EO3A 3F8UA 1S3CA 3HJOA 1AQWA 3GN3A 3U6VA 1J0FA 1TI1A 2HNLA 4IELA 1NSWA 1A2JA 4J57E 2WCIA 4OCFA 4DSQA 2JZSA 5J4UA 6GSVA 3LYKA 3APQA 3WD6A 4XHMA 1F3AA 4TR1A 4QL7A 2FNOA 2VOCA 1V98A 3VWXA 2E2MA 4HU7A 1Q98A 1WP0A 2CVKA 3M0FA 3TDGA 2B5XA 4DSRA 5DAKA 2XBIA 1EGRA 1OAZA 4GSTA 4IJ3A 1WE0A 2F51A 2MMNA 5IMAA 2B3SA 2C1YA 3ZL5A 2GLRA 4WBJA 1TRVA 3TKSA 20GSA 1O8XA 2H73A 5HR2A 2HRNA 4L5OA 2K8VA 2H76A 3KEBA 4JZQA 3ZFLA 1XWBA 1THXA 1EGOA 18GSA 1OE7A 4GRFA 4QQ7A 5C04A 3FZ5A 3F6DA 4YQVA 3RHCA 1F6MC 2VCTA 3QR6A 3HKRA 2IMIA 4RI7A 1A0FA 3FR3A 4NXIA 4HZ4A 5EVOA 4K2DA 5CNWA 1U6TA 3KMNA 3K8NA 4LL1B 3S9FA 5IIZA 1Z3EA 4K7IA 2QSIA 4NV2A 3D22A 4IKHA 2CVBA 2WZ9A 2NVLA 3D5JA 4I2TA 2OKAA 2YNXA 3MWHA 1FG4A 2VUPA 1Y6EA 2J23A 2FWFA 1G7OA 1EWXA 1EOGA 2GQKA 3ISOA 4XS4A 2LEGA 2WS2A 1AAZA 3CXGA 1XW9A 3UVHA 3EU3A 4ACSA 2IWTA 3L0HA 3I43A 4Q5QA 2WULA 2WRTA 5COHA 2L57A 2DLXA 1ILOA 3D21A 3QD9A 2VM1A 4MZWA 3GSSA 2H0GA 4D73B 2FWEA 2HSHA 1SYXA 3E3EA 3BCKA 3IE3A 2VL2C 5HR1A 5L71A 3JCML 3F0IA 5ECIB 4DVCA 5E4WA 5IMDA 2K18A 2LUSA 3VLNA 1CQHA 3TCOA 1DUGA 3GL5A 2CZ2A 3GL3A 2KP1A 3FHKA 3UL3A 4HZ2A 3FZ9A 1Y25A 4ID0A 3A3TA 3ZRDA 1PQNA 3LXTA 5F0GA 5ELGA 5ID2B 2C80A 2JU5A 2C3NA 3FY7A 2RLIA 3O3TA 2LTKA 14GSA 1ERTA 2V41A 1OKDA 1M2DA 5HFKA 1A2MA 1K0MA 4ZILA 4HI7A 2HSYA 3BCIA 2WFCA 3LORA 3HVVA 3QFAC 4KX4A 3VPQA 3EC3A 4GSSA 3M1GA 3A2XA 3L9VA 4CDOA 5B8BA 1JZOA 1TK0B 2LS5A 5ECLB 3LQ7A 1LBKA 5JWQB 4LMWA 1PRXA 16GSA 5ABRA 3F9UA 1ERUA 5F07A 2HZEA 4PQHA 5D96A 4IP6A 3RDWA 3VWUA 2ON5A 1KTEA 2K9FA 1OE8A 3C7MA 4MF7A 3TRXA 1PKZA 1QQ2A 4JBBA 5G5EA 2TRXA 3J7Yb 1GNWA 4XTSA 1JZWA 2H75A 2B7JA 10GSA 1T00A 2J9HA 4X43A 3HVXA 4I97A 3HDCA 4G2EA 5ECNB 1E2YA 5DCHA 2QGVA 1YKAA 4F2IA 4N30A 3ERWA 2FY6A 4BWQA 1FO5A 2VCVA 1F9MA 3D0ZA 1TJDA 1XVWA 3IBHA 19GSA 4I2UA 4EDZA 5IO0A 5JWOB 2ALBA 3RAZA 1M0UA 2H71A 4ZXGA 2HXKA 3QOUA 2DJJA 1XXUA 1YJ6A 1YF0A 5B6NA 2GGTA 4FYCA 2JSZA 1XWAA 3RHBA 4TKYA 2GZPA 1M2AA 2ZUPA 2H72A 5H5SA 1TU7A 2X8CA 5C00A 2IMDA 1B9XC 2LRNA 4ML1A 2YZHA 2NBSA 2PMTA 1EV4A 3UIWA 4N0ZA 1B48A 2VL9A 3I6AA 2PGTA 4H86A 4MCUA 4NV5A 2NDOA 1K3LA 2G0FA 3GUSA 4Q5FA 5D9XA 1LJRA 2HFDA 5DALB 3ZVJD 5ECKB 4LLRA 2GVPA 4YH2A 2VLVA 2GT5A 1GH2A 1AIUA 3GH9A 2OADA 5B7CA 1AUCA 4DSSB 5AIXA 2GDRA 4K8MA 3ERGA 4WXTA 2CAIA 1O8WA 3TJGA 5F06A 1OC3A 1QGVA 4ECCA 3C1RA 2CX3A 2GT6A 3D4TA 3C73A 4N10A 4O92A 3LWAA 1YKCA 2M46A 5D9TA 4OCEA 3TB2A 1TK8B 5IOWA 4F9ZA 5IMZA 2VL3A 1ACVA 1GSUA 4F0BA 1ERWA 2X64A 3ED3A 3N5OA 2N5BA 1BJXA 3KCMA 4TR4A 3KP8A 1N2AA 3DKSA 2VD1A 5AN1A 4MF5A 5A4WA 3HA9A 1SKWB 1SKRB 4EKZA 1HNCA 3W8JA 1J9BA 2VD0A 1M99A 1QMVA 2X8HA 1T4ZA 4EXJA 3TKQA 1B8XA 3O6TA 5G2ZA 2PU9C 3A2VA 6GSWA 3HCZA 4F82A 2V1MA 1GSFA 2PVOC 1BG5A 1JLWA 2E0QA 1EOHA 5D9VA 2VCQA 5H5QA 5ECHB 1YDKA 2VAFA 4JRRA 2A2SA 5CRGA 5IMFA 4GF0A 5LD0A 1S3AA 4ISDA 5J3RA 3M9JA 2IFQA 4ZBAA 3I69A 1ABAA 4L0WA 1U87A 4K7NA 5E59A 4HEA2 1ON4A 3DXBA 1X9MB 2YWIA 1TRWA 3C1SA 1QK8A 3Q6OA 1USBA 6GSXA 2L6DA 1EEJA 2O89A 3GTUB 3G9BA 3HXSA 4I6XA 3QAWA 5KN0A 5ECQB 4BVYA 1RW1A 3FEUA 2JL4A 2YCDA 1IYHA 4TRXA 4KNDA 4KSMA 3BD2A 4ECJA 2JZTA 3M9KA 2JADA 1MEKA 3WT1A 1OYJA 1A23A 2FD3A 4IGJA 1TU8A 1OC9A 1B4QA 1ZCPA 1GULA 2FA4A 4MPFA 2R6KA 5B8AA 4XIHA 4F03A 2R3XA 3TKPA 3FZAA 5LCZA 3D4MA 4FO5A 2IJYA 4TW5A 3TGZA 4AJ8A 1X5DA 4MZCA 3UBLA 4G10A 4KB3A 2VO4A 3GIXA 2GQLA 1W4VA 5IO2A 1ZYQB 5DBQA 2C3QA 2DJ2A 5CYYA 1GRXA 2VIMA 2B6MA 3BJ5A 5ECRB 4K0GA 3IXRA 2H19A 3IR4A 3RPPA 2R4VA 2CVDA 5J9BA 5JCGA 3CYNA 3KP9A 4TR3A 2CV4A 3ME8A 1Z7PA 2PWJA 1K0DA 4MJAA 1EZKA 1QUWA 4ECBA 2NPBA 4KDYA 3GHAA 3TJFA 3LYPA 2XC2A 4KDUA 1JZRA 4ZBDA 2H0IA 2REMA 3UARA 2PN8A 3KMOA 5LNKe 1Z6NA 4FYBA 2EIQA 1WRYA 2HZFA 2MZCA 3TOUA 3LJRA 2GSQA 1R26A 3G7JA 2FLSA 1XVQA 2D2ZA 4WR5A 2RM6A 3HVSA 2DMMA 4TR1B 1URMA 2O85A 2V32A 4POLA 2DJKA 5CP1A 2OE3A 1ZZYA 3QAVA 5HQPA 4XS6A 1XW6A 1GTUA 5DAKB 4MH2A 2B5EA 1EP7A 1XWCA 2IMEA 3G7YA 1MDIA 4MZBA 2OE1A 4ZL8A 1PGTA 3TKSE 3DVXA 4ZB6A 4ECIA 4YQUA 2WJUA 1YF1A 3VI5A 2L5OA 1XZOA 4PUAA 2P31A 5ECOB 2B1KA 3TJBA 4CW9A 1AC1A 1TW9A 4G9HA 1M9AA 4TVEA 5D9WA 4X1UA 1VF2A 2K8SA 1BYEA 1RK4A 1GWCA 4HQSA 5DJLA 4D73A 2H30A 4XRAA 4PXOA 4LA1A 5GAND 4Z7XA 3LFLA 3TJJA 6GSTA 1TP9A 1XCCA 2AYTA 3ZVJA 3ZITA 2DSAA 3VI7A 4ULXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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