3L9SA

Crystal structure of salmonella enterica serovar typhimurium dsba
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
185
structure length
185
Chain Sequence
ISDGKQYITLDKPVAGEPQVLEFFSFYCPHCYQFEEVLHVSDNVKKKLPEGTKMTKYHVEFLGPLGKELTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEAVQKTQTVQSAADIRKVFVDAGVKGEDYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADLQLQGVPAMFVNGKYQINPQGMDTSSMDVFVQQYADTVKYLVDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and functional characterization of three DsbA paralogues from Salmonella enterica serovar typhimurium
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 67
structure length 185
sequence length 185
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2010-01-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3l9sA00
4LL1B 4POKA 5L71A 2IMIA 2YPMA 3C1SA 1DE2A 1OKDA 2H1DA 4MMMA 1EWXA 1Z6MA 3BJ5A 4ACSA 2H76A 2PN8A 2PVOC 2B1KA 1FAAA 4K1FA 4PUFC 1SYRA 3C73A 1EOHA 3VWWA 3ZTLA 4JRRA 2NDOA 2CAIA 4PQIA 1XVWA 1RK4A 1A2JA 4K2DA 3IV4A 3W8SA 5IO0A 2PPTA 1HNCA 1O8XA 1PN9A 2B5YA 5DJLA 4L0WA 2DBCA 2VL9A 3CYNA 2G0FA 1SJ6A 5DDLA 4HU7A 2YOIA 5A4UA 3N9JA 1MDIA 2DMLA 2J9HA 2LQOA 3CRUA 3A5WA 4KUNA 3QDNA 3ED3A 4IW9A 3W8JA 2XBQA 1SK1A 3PINA 1SK0A 3GUSA 3FZAA 5ECKB 1SK2A 2L4QA 4K7IA 16GSA 3U6VA 5F05A 1A8LA 1CQGA 5IMZA 1KTEA 4L5OA 5D96A 3TJKA 3IC4A 2L6CA 2HFDA 4HZ2A 4NAXA 2CAQA 1KEBA 1XBSA 1EV4A 4O92A 1QK8A 4GSTA 1EGRA 4MZBA 4WXTA 5J9BA 2X8CA 1IYIA 5CRHA 3HZ8A 1ERTA 2AV4A 4MH2A 1E6BA 4NXIA 3UVHA 4ML6A 4TXOA 2V1MA 4ZBDA 1GLQA 1XWAA 3M3MA 3O76A 2B7KA 4WF4A 5INYA 4MP4A 2KLXA 3GL5A 3QOUA 1DBYA 4D73B 1R5AA 3TKSA 1W4VA 1TDIA 2F3MA 1AUCA 3C1RA 3Q18A 3TDGA 1LBKA 2FCHA 2IMFA 1UVZA 1OE8A 5ECPB 3TRPA 2FGXA 4HDEA 2I1UA 4ZBAA 2BJXA 2OADA 2DJ1A 4F2IA 4LA1A 2RUFA 2X8HA 1HNAA 1MEKA 2OJLA 3WYWA 1RW1A 1OE7A 4MCUA 4Q5RA 3KP9A 2CT6A 2PERA 4TKYA 3GX8A 1S3DA 3L9VA 4IJ3A 5B6NA 4OFNA 2JZTA 1OC9A 1F6MC 3ZITA 4HJMA 1M2DA 4N0VA 2KOKA 2X64A 1H75A 2F8FA 5D8IA 4NPBA 2LJAA 3EE2A 2CV4A 3IBHA 4WBJA 5C04A 2KP1A 3D5JA 2PVQA 1ON4A 2ES7A 4YH2A 1T1VA 5HFIA 3C7MA 1QGVA 1THXA 3F0IA 5HR1A 3RDWA 1K0CA 1B9YC 4ULXA 4ECJA 4TXVA 1V2AA 4XS4A 4KH7A 2VM1A 1GULA 2LRNA 4V1Ag 1PGTA 3IA1A 2OBKA 1AQVA 1NSWA 3BCIA 5F0GA 3VPQA 1ZL9A 4ZL8A 4XHMA 1LU4A 1WOUA 2DLXA 2BMXA 1J08A 4L0UA 3APOA 2JSYA 2IL3A 3TCOA 5B8BA 2K9FA 2TRCP 4YQMA 4YAPA 2P5RA 4KDUA 1Q4JA 4ISDA 1F3AA 4K6XA 2PU9C 3LYPA 3IHQA 4ID0A 4GLTA 4K9ZA 5G5FA 4DSQA 4DVCA 3KP8A 3F8UA 2NVLA 3FHKA 2VAFA 2WS2A 1VF2A 3ZRDA 5GSSA 3IDVA 2P31A 1O85A 2OE0A 3M1GA 3G9BA 2MZCA 4BWQA 1TI3A 3L0HA 4ZL9A 2LV3A 1SKSB 1EGOA 1X9SB 3FZ4A 3QAVA 1FB0A 3HVXA 2CA8A 2VM2A 2X99A 3CSJA 5AN1A 9GSSA 4TR0A 1O7UA 5JCWA 2A4VA 4MF7A 3BD2A 1CQHA 4ECCA 2XC2A 4KCEA 5F8BA 3FR9A 2CVBA 3CMIA 1JZWA 4IQ1A 4AJ7A 1O81A 2WRTA 1RQMA 1PA3A 4KGIA 3ZMLA 1JLWA 4DSSB 1BJXA 4CDOA 2MMNA 3NOFA 4IQAA 2GT6A 4XS6A 2N5BA 1V58A 5H5RA 5IIZA 1SKRB 2WCIA 3ZIJA 2O87A 1GNWA 3DEXA 2LTKA 2VCZA 1K0OA 5KN3A 3IRAA 4JZQA 5DAKA 1EEJA 4F0BA 4WKWA 2GSTA 3US3A 3H4KA 2H71A 4ZILA 1GP1A 1TRUA 6GSTA 4IJIA 2E0QA 12GSA 2L5LA 2AB6A 4BWSA 4N10A 2K6VA 2MBSA 4POLA 1SL0B 1U3AA 1SL2B 1A8YA 2OACA 3V1WA 3MDKA 6GSWA 1GSFA 3TGZA 4NHZA 1K3LA 5J9CA 3WGXA 4AJ8A 4WEYA 5GSTA 3VFIA 6GSYA 4IS0A 2LRTA 1MD3A 4Q5FA 1TRSA 3GRXA 4FYCA 5DJMA 2LUSA 20GSA 3P8WA 2OE1A 3KH7A 5ID2A 2MMOA 1Z9HA 1THOA 1OVNA 5IMCA 4L8EA 3MWHA 5AIXA 5CREA 2WFCA 3NZNA 1T4YA 4QQ7A 3UEMA 2GQLA 1YQ1A 5AGYA 14GSA 2VIMA 1A2LA 5G5EA 3KD0A 1W89A 3EWLA 2LKUA 2GGTA 2GZYA 4PX1A 1JFUA 4POBA 5JCGA 3F4TA 3VPTA 4EUYA 3ERGA 3EU4A 3IPZA 1UN2A 1WMJA 3L78A 4BVYA 1H4OA 2KP2A 1EV9A 2FWEA 5JWQB 4HOJA 3HVVA 4Q5NA 3F4RA 5ECHB 5HFGA 1WRYA 2GSSA 4HQSA 2JACA 1A2MA 2HXKA 2V6KA 1BEDA 1J0FA 5E59A 4G2EA 2HYXA 2R4VA 5IMDA 3CRTA 1TI1A 3DIEA 5G1LA 4TVEA 2MBTA 5IMFA 1F37A 3KTLA 2KHPA 2V6OA 5D9TA 3GYKA 5GZZB 5IO2A 3KGKA 2M46A 2VCVA 1GTIA 1GLPA 2OA7A 2TIRA 1XOAA 3IE3A 1X5EA 4WETA 2VCXA 3TJBA 1HQOA 3GSTA 4K8MA 3EYTA 2YNXA 3APQA 2LSTA 1XW5A 1AW9A 5F07A 2YWMA 5G2ZA 3J7Yb 2H0GA 4TR3A 1QQ2A 2FWGA 1SD9A 3SWLA 3KH9A 1O73A 4GQFA 1XWBA 2EIOA 3VWXA 1G7OA 5HR2A 2WB9A 4JR4A 4I5QA 3DMLA 1FG4A 4HS1A 3D4TA 1QMVA 1TU8A 2C8UA 4PURA 3E9JB 3EU3A 5D9VA 1HYUA 4D73A 3LEFA 3F3RA 1AC1A 3M9KA 4ZBBA 2B7JA 3EMPA 5IQYA 2GS3A 2K8SA 3F3QA 2WGRA 3I43A 4ZB8A 6GSUA 4PGTA 5CRDA 18GSA 4BVXA 3QPMA 2ALBA 5F06A 1T7PB 3F63A 3ZIVA 3TKRA 1B4PA 1AAZA 5CRGA 3IAM2 4KDYA 4JE1A 3F9UA 5GAPD 4OMVA 2JZSA 2RM5A 1M99A 4N11A 5JWOB 2GSQA 2H19A 4J2FA 1Q98A 2MMZA 3TOTA 2H8LA 4PQHA 1WIKA 2ON7A 2VL2C 4MDCA 2JU5A 3KM6A 2AYTA 2C3TA 3LJRA 3VURA 3RBTA 3TJJA 2GVPA 3A2WA 3ZREA 2IFQB 2VCWA 4DEJA 2BTOT 2VO4A 5IOWA 4OFMA 2R2JA 3HY2A 4K7NA 2GQKA 4OWYA 5LCZA 3WGEA 3LWAA 5IM9A 1FHEA 4MZCA 2LQQA 4O32A 2GQMA 3I69A 3ZVJD 2AAWA 2VLTA 4KCAA 1OKTA 5DCHA 3RPNA 1YEPA 4JU5A 3ME8A 3Q6OA 4JBBA 1GSYA 1Z7RA 3GKKA 2REMA 3TJFA 1AQWA 5IOXA 2V2GA 4E8EA 4EXJA 4HU9A 3LG6A 1G0TA 4MJBA 3J7Yk 3HVSA 3N5OA 4ZXGA 1TU7A 3GTUB 1X0RA 1VF3A 2DJ2A 2RIIA 2R6KA 3WD6A 2C0GA 4OD7A 1V57A 2H6ZA 5J41A 5H5QA 2R37A 3PGTA 3GX0A 1WE0A 2K18A 4GCIA 1BAYA 4IVFA 3GKMA 3ZL5A 2L57A 3KMNA 3FW2A 1B48A 2B3SA 2J23A 1XW9A 2Z9SA 4I97A 1TXXA 1F3BA 3H1NA 3QCPA 2LNTA 3RHCA 4YAVA 3FYGA 5J3RA 3R2QA 4BPYA 2PWJA 1GSDA 4EL1A 1ZMAA 2H75A 3UBKA 2I9HA 4IELA 1T8EB 4F82A 1WJKA 3HHVA 1TKDB 2FA8A 3HJMA 8GSSA 2OBIA 3DYRA 1U6TA 2FWHA 3QFAC 3ZYWA 5ECNB 4I2TA 5ENUA 1ZYEA 3CSHA 1B4QA 2B6MA 2DSAA 3HD5A 4OFTA 4QL9A 3A3TA 5HFKA 3WGDA 3DVXA 5ECMB 1G6WA 4J56E 2AHEA 2CVDA 4V1Ap 2XPDA 4I6XA 4Q5QA 1UC7A 2G2QA 3S9FA 2ZCTA 4EF0A 3DVWA 2JZRA 2ON5A 3MAKA 1V98A 5HR0A 4DSSA 4G10A 5C00A 2FLSA 1YZXA 3FEUA 3HZ4A 3VK9A 3VLNA 1FO5A 3LSZA 1ZZYA 2HRNA 4LL4B 5AIVA 3G7IA 3A2VA 2HI7A 4JEDA 4LMVA 1R26A 7GSSA 3MSZA 1EZKA 5B8AA 3HJPA 3KJYA 3W6GA 1JZDA 5G31A 3LORA 5A4WA 2C0FA 2LJKA 1G7EA 2DMMA 2GSRA 3HYPA 1Y25A 1PMTA 3QMXA 1M9AA 4KW6A 4RQRA 1ML6A 3QAWA 1O8WA 4V2NA 2GZPA 2JSZA 1ZOFA 5COHA 1K0DA 5CNWA 4FYBA 2NTOA 3FZ9A 1SU9A 2E2GA 3GIXA 1BQ7A 4OO5A 2P5QA 4XRAA 3BBYA 4H86A 3UBLA 3HA9A 4CHSA 5CO3A 4ECBA 1XXUA 1YKCA 4EO3A 2E2MA 3QD9A 3M8NA 3WT1A 4AJ6A 4FIWA 4MJAA 3L4NA 2CX3A 4EVMA 3VI7A 1SKWB 2FA4A 2WZ9A 2YCDA 1DUGA 4FYUA 1XFLA 3IR4A 1SJZA 2QSIA 5J4UA 2IIYA 4HEA2 3WT2A 1N2AA 3EVIA 5DBQA 5G1KA 3ZFBA 4OO4A 1K0AA 2RLIA 3HCZA 1ST9A 3FY7A 3G7JA 5D93A 4RI7A 2VL3A 1XIYA 2CQ9A 1J9BA 1HD2A 1ILOA 2HSYA 5CRWA 4MABA 1A23A 1PQNA 3PR8A 2YV7A 6GSSA 1TJDA 3ISOA 1JLVA 3CXGA 1X5CA 2FWFA 2FUG2 3APSA 2PMTA 2YZHA 2C3NA 4ZL7A 1A0FA 1BYEA 1YJ6A 5DVBA 4MH3A 3GNJA 3C8EA 3CTFA 1IYHA 2I3YA 2VLUA 2CZ3A 1XVQA 1GTAA 3M9JA 1F9MA 3ZVJA 5IPGA 2HNLA 3KEBA 3D6IA 2WJUA 2DC5A 3EC3A 2F51A 1JZOA 3I6AA 2HT9A 2VCTA 3F4SA 2MYGA 1Z3EA 3LFLA 2R3XA 2QC7A 2OE3A 5A5KA 5ECRB 1GRXA 3HJOA 5KN2A 2IMEA 4WBRD 2AJQB 5JWRB 11GSA 3FKFA 4YQUA 1VF1A 1TTZA 2JADA 5B7CA 2IMDA 3DWVA 2HLSA 3KIJA 1GWCA 1YKAA 4MZWA 4KDXA 2DJ0A 5FT3A 2M72A 3QFBC 2H1AA 1Z5YE 4KX4A 5ECQB 3TKPA 3GMFA 5DALB 3IXRA 2WDUA 3GH9A 5D9WA 4IGJA 3DGQA 2L6DA 4EC0A 1NM3A 1VGLA 2H0HA 3CTGA 5CYYA 2C0DA 4K7OA 2YWOA 4FH8A 4CW9A 3ZFLA 1PRXA 4N0ZA 5GAND 1TW9A 2HZFA 2HZEB 1S3AA 5AISA 4N30A 2GT5A 1X9WB 1KNGA 2CVKA 2EIRA 1X5DA 1Z7PA 2DJJA 5JCUA 2F9SA 4MA9A 1PKZA 3GL3A 4TR1B 3FZ5A 2IFQA 4K0NA 1XWKA 2VD0A 4NHWA 1FVJA 5ECOB 5KN1A 2TRXA 4RUVA 3D21A 2L5OA 3Q74A 1G6YA 3TRXA 1F2EA 2FD3A 3GURA 4V2MA 3ZMKA 2C0EA 3H79A 17GSA 1ERUA 3H8QA 3M0FA 4MJCA 3PH9A 1X9MB 4KSMA 4XIHA 4POMA 1AQXA 3EINA 3ERWA 4PNFA 1DSBA 4KAEA 3UOMA 1GUKA 4TR4A 3FRCA 2H6YA 3FR3A 3CSIA 1GSUA 4X1UA 3P2AA 4KNDA 5CP1A 1VF4A 3GTUA 3LYKA 4NV2A 1BG5A 3D4MA 3GN3A 4WF5A 1GUMA 3UAPA 1R4WA 3UVTA 2GZZA 3GA4A 3F6FA 2X8GA 2HE3A 4HUAA 4XCSA 2YJHA 3VWVA 4EKZA 1K0MA 2WULA 4AGSA 6GSVA 4IP6A 3UL3A 3QAGA 1PL1A 2CZ2A 4MF6A 3SBCA 5B6MA 3U5RE 3G7YA 2VLVA 2RUEA 4GSSA 3KCMA 1WP0A 3UARA 2VL2A 1T4ZA 4OCFA 1JZRA 4HQZA 19GSA 2V32A 2K8VA 3TKSC 1TK8B 1FW1A 2FY6A 2C3QA 5EY6A 1T3BA 2YWNA 1ACVA 1R5PA 2B5XA 2GTUA 3IK7A 1S3CA 4L5LA 5DQYA 4BA7A 5ELGA 2YJ7A 1UA5A 3E3EA 3TRQA 3JCML 1XWGA 1KBNA 1GSSA 2FHEA 4NV5A 2FNOA 3D0ZA 2HRFA 4YQVA 4FO5A 3GV1A 1M2BA 5E4WA 4QL7A 4EDZA 1QXHA 3LGCA 4PQ1A 1USBA 2A2SA 1XCCA 1FB6A 4ML1A 2OKAA 3P7XA 2V41A 4EDYA 4V2LA 1YEXA 1OAZA 4ILFA 1SYXA 1GSQA 4HI7A 4KSOA 4Z7XA 1M7TA 1NHYA 3TKQA 1M9BA 4MPFA 4F9ZA 2H6XA 5ABRA 4ZIJA 4X43A 1GTUA 2R5GA 3E0UA 22GSA 2IWTA 2LJRA 4P3YB 1B9XC 2C4JA 3BOAA 5A4VA 1XPVA 3KXOA 1QUWA 2AUVA 2KUCA 1MTCA 2YN1A 4AF2A 4EE0A 5IMVA 4TN8A 3EMXA 1K3YA 4J57E 1QFNA 5ECSA 2DIZA 1XOBA 3TJGA 4OCEA 5FHIA 1EP8A 1YF0A 3AY8A 4TXOB 2JL4A 2H1BA 4PUAA 3DXBA 1TK0B 2B5EA 4XTSA 1OYJA 4RQXA 1T00A 3HKRA 3VWUA 2VOCA 4O5RA 3TUEA 2DJKA 1JHBA 1GH2A 2LS5A 2PBJA 1OC3A 4DSRA 2RM6A 4XS1A 4KE3A 2MMAA 4LMWA 3HDCA 4KB3A 3CBUA 5KN0A 2ZUPA 3RHBA 3HXSA 4HZ4A 2H30A 1PX6A 1TRVA 1SL1B 1TP9A 1GNEA 2D2ZA 3O3TA 2O7KA 10GSA 4XRDA 1VRSD 1C72A 2IJYA 1PX7A 5LNKe 1A24A 4MPGA 3ZZXA 2IPAA 3EURA 2H01A 4I2UA 3ZLPA 3GH6A 4KA0A 4NMUA 2YV9A 3H93A 1OC9B 4GQCA 3LQ7A 2C80A 3O6TA 1Y6EA 1ABAA 2PGTA 3RPPA 1BX9A 1O6JA 5HR3A 4JR6A 5IPHA 2VUPA 4WR5A 1U88A 5CAXA 1I9DA 3K8NA 5HQPA 4ZB9A 2H66A 1TRWA 4GTUA 5D73A 1PSQA 1ZGNA 3MNGA 4IN0A 1Z6NA 2YP6A 3ME7A 3BCKA 5D9XA 3GKNA 1SENA 1XZOA 4NWYA 1U87A 2CX4A 3P90A 1EEMA 4XS4B 1XWCA 4TW5A 1ZYQB 1TOFA 3LXTA 4PNGA 4F0CA 2O85A 1ERWA 4G19A 4IBPA 1DE1A 3KMOA 1U3IA 2IMKA 1E2YA 3FR6A 3NIVA 2A2RA 3UMAA 4GWRA 2H72A 3I9V2 1K0NA 2B1LA 3GKXA 3VI5A 1PKWA 1V40A 1NW2A 3L9SA 5H5SA 4GF0A 4MJEA 2GDRA 2H0IA 4I8BA 2LRCA 2M80A 2YWIA 1MDKA 2HSHA 5ELAA 3IOSA 1URMA 5DCGA 2C1YA 5DQSA 1ZCPA 2QGVA 3OR5A 3QR6A 5DALA 1V9WA 1LJRA 2VD1A 2EIQA 1GSEA 3RAZA 1ERVA 1M2AA 3DD3A 1GL8A 2EC4A 5EL8A 4HJ2A 3KZQA 1XW6A 1SD8A 1A0RP 2ZNMA 4MK3A 4TRXA 4O7HA 3IAS2 2HZEA 5FWGA 4E8HA 2DJ3A 2H73A 3FK8A 3DKSA 1GUHA 3L9UA 4G9HA 1N8JA 2N5AA 6GSXA 1WWJA 5G30A 5ECLB 3DRNA 1OC8A 1HNBA 2L59A 2LEGA 4TR1A 3GHAA 2IN3A 1PL2A 1YDKA 2I4AA 3UJ1A 1SJIA 4LLRA 1TK5B 4RI6A 4MF5A 1AIUA 1YY7A 3D22A 2LNSA 2VCQA 4F03A 3Q19A 2O89A 5IMAA 2QKEA 3GFKA 5DAKB 4BL7A 4X0XA 2DIYA 13GSA 4K0GA 3GSSA 4PXOA 1NHOA 2P0GA 2H70A 3TOUA 2O8VB 1R7HA 5LD0A 1B8XA 3UIWA 2GLRA 3C71A 1K3OA 1FOVA 4GSNA 1EOGA 5J5NA 3F6DA 2NPBA 3ERFA 2N5FA 2NBSA 4GRFA 4MLYA 3KTBA 4TOPA 3TB2A 5KEJA 1EP7A 4IP1A 1K0BA 1FVKA 1PD21 5EVOA 4ECIA 3TKSE 1MD4A 5EPFA 1WPIA 2H74A 5ID2B 2I81A 2XHFA 2H1GA 3IK9A 2PUKC 4ZB6A 1YF1A 2YZUA 4IHUA 1MDJA 1I5GA 3A2XA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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