3L9SA

Crystal structure of salmonella enterica serovar typhimurium dsba
Total Genus 67
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
67
sequence length
185
structure length
185
Chain Sequence
ISDGKQYITLDKPVAGEPQVLEFFSFYCPHCYQFEEVLHVSDNVKKKLPEGTKMTKYHVEFLGPLGKELTQAWAVAMALGVEDKVTVPLFEAVQKTQTVQSAADIRKVFVDAGVKGEDYDAAWNSFVVKSLVAQQEKAAADLQLQGVPAMFVNGKYQINPQGMDTSSMDVFVQQYADTVKYLVDK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and functional characterization of three DsbA paralogues from Salmonella enterica serovar typhimurium
pubmed doi rcsb
molecule keywords Thiol:disulfide interchange protein
molecule tags Oxidoreductase
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
total genus 67
structure length 185
sequence length 185
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2010-01-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3l9sA00
1OKTA 2H71A 4HU7A 3CYNA 3GIXA 2CX4A 3QCPA 4POLA 3UBKA 2H73A 1W4VA 3EMXA 3TRPA 1A8LA 2VCVA 3HYPA 2DJ3A 2PERA 1F3BA 2HRFA 5DQSA 3KH7A 1A8YA 4DSSB 1XWCA 1PX6A 2GQLA 1DE2A 4MA9A 2H72A 2P31A 1XIYA 3HJOA 4HOJA 4QQ7A 3TKRA 3KZQA 1URMA 1SYXA 2QGVA 3QD9A 1UC7A 1R7HA 4OO4A 5LCZA 1OVNA 1AC1A 1OYJA 19GSA 4DSQA 3LJRA 1WPIA 4QL7A 5G30A 1G6YA 1SK0A 1PKWA 3APOA 2VOCA 18GSA 2LSTA 3F6DA 2PUKC 2C0GA 1OE8A 3QDNA 3GX8A 1ACVA 1V58A 3GMFA 4WETA 1FB0A 3MNGA 3FW2A 4O7HA 1G6WA 4MCUA 2DIZA 5CP1A 1WWJA 2OE1A 4K2DA 1PD21 1JZOA 4HZ2A 5ECSA 4L5LA 3HZ8A 3ZMLA 2K18A 4G9HA 2ON5A 1PN9A 2HSYA 3CTFA 2XHFA 1VGLA 1TU8A 1Q98A 2RUEA 1NM3A 1FB6A 2MYGA 2GVPA 4RQRA 1K3YA 2F3MA 3GA4A 4MP4A 3LEFA 2FCHA 4CHSA 4MF5A 3UJ1A 2NDOA 2O87A 5HFGA 1IYHA 1YQ1A 5CRWA 4ECIA 2IFQB 5KN0A 5D96A 3F8UA 4DVCA 3KMNA 2G0FA 3F0IA 4DSSA 1WE0A 3O6TA 3IBHA 1F6MC 4CDOA 4V2NA 3FR9A 4WBRD 3DYRA 2VLVA 5IMVA 1XWBA 1RK4A 5JWOB 3GKNA 1TRUA 1GSEA 3HD5A 4PURA 2R5GA 1M0UA 1EEMA 1ON4A 2OA7A 3Q6OA 3ERWA 2V6KA 1H75A 4FYUA 5CAXA 3HVSA 2V32A 1I5GA 3EU3A 6GSTA 5INYA 2PBJA 2YNXA 4MZWA 4MDCA 4MMMA 2CX3A 1QGVA 3F4RA 4PXOA 3IAM2 1TI1A 3ZFLA 1EP8A 2GT5A 3GTUA 2MBTA 2F9SA 1ZMAA 5C04A 2FWGA 3F4TA 4YH2A 5A5KA 4AF2A 2R3XA 1OC8A 1ERWA 4JEDA 2X99A 4AJ6A 3MAKA 4TKYA 1V2AA 4K7OA 3CRTA 1SJ6A 4NHWA 3CMIA 1F3AA 3DEXA 4D73A 2VM2A 1VF1A 4ML6A 3D0ZA 1GSYA 2X8HA 1DUGA 2IIYA 2GSSA 3TKSA 12GSA 4KX4A 3VI5A 1GNEA 1GSUA 1XW5A 2GS3A 5JCUA 4EC0A 5JWRB 4XS1A 2FA8A 4ULXA 3MWHA 2YWOA 4ZL9A 1R5AA 2L6DA 4IJIA 3EC3A 3RHCA 3TOUA 3D22A 1EOHA 4F9ZA 5J4UA 4KGIA 5DDLA 2VIMA 1YKAA 5G1LA 3C8EA 3CSHA 22GSA 3E0UA 2NTOA 1UVZA 2VL3A 2A4VA 3DXBA 5D9WA 4OFNA 1SKRB 1FAAA 1K0CA 4DSRA 3LQ7A 2JZSA 3R2QA 3WGDA 1XOBA 4XCSA 4XIHA 3HJMA 1LU4A 3RHBA 3EURA 3L9VA 6GSWA 2ZNMA 1K0OA 3BBYA 3KTLA 3ZITA 1T7PB 1PQNA 2IMFA 2E2GA 2RM6A 3HHVA 2B7KA 3ZFBA 4GTUA 3TUEA 2L6CA 2LRNA 4K0GA 2CZ3A 2LEGA 3ISOA 4EO3A 1WRYA 4PQIA 3GH9A 1PSQA 2JU5A 3FR3A 3NZNA 1B4QA 1OAZA 3P2AA 4TR1A 1B48A 3GKKA 3OR5A 2YZHA 1TU7A 4J2FA 2CVDA 4TXOA 1E2YA 4KSMA 5KN2A 5GAND 3KCMA 2KUCA 2H0HA 5ENUA 5IO0A 4NMUA 2KLXA 4YQVA 2JZRA 2M72A 3LFLA 1HYUA 4WEYA 1FOVA 4F82A 10GSA 3ZRDA 3LSZA 2FA4A 3QAGA 3G7IA 1XW9A 2VCXA 1A0FA 1YEXA 2I1UA 1EGRA 4HEA2 5G31A 4MH2A 1K0MA 13GSA 1WJKA 4IBPA 4JE1A 1M9AA 5CRDA 1MEKA 1F9MA 4GXZA 3D21A 4MZCA 4J56E 4MLYA 3KD0A 1DE1A 1U6TA 4WF4A 1I9DA 5C00A 4IVFA 1USBA 1PA3A 2PN8A 3FZ9A 3P90A 3QOUA 5D73A 1MDJA 5D93A 3VWXA 1T4YA 4NWYA 1TK0B 2D2ZA 3U5RE 5IMAA 3A3TA 3N5OA 4FIWA 1SKWB 1MTCA 1LBKA 2EC4A 3HVVA 5CREA 3WT1A 3E9JB 5GSTA 1EGOA 3U6VA 3GNJA 1TI3A 2AUVA 2ZUPA 2L5OA 3HZ4A 3IE3A 4MF6A 5ECOB 2ALBA 2PWJA 3L4NA 3NOFA 2GT6A 2R6KA 5DALA 2LRTA 3DD3A 4LA1A 2MZCA 2LJKA 3DMLA 3I43A 3TJJA 2L4QA 4AGSA 2OACA 1GULA 5ECPB 2H1BA 2OADA 3VK9A 2L5LA 4PUFC 1PX7A 3A2WA 2G2QA 3LYKA 5G5EA 1FW1A 1SKSB 3M8NA 2P5RA 3ME7A 1ABAA 4AJ7A 2I3YA 1A2JA 3D4MA 2YN1A 2R2JA 4X0XA 4EE0A 5DJMA 5DVBA 3K8NA 5GSSA 2IMKA 3FY7A 4KUNA 3GKXA 2HI7A 4NPBA 14GSA 4RI7A 4WXTA 1PL1A 1UA5A 1NW2A 3ZMKA 1RQMA 2F51A 1U3IA 4ZIJA 4X43A 4FH8A 5G2ZA 2LJAA 2L4CA 5EL8A 4N0VA 1TRWA 3DVXA 1ZL9A 4ISDA 1GUHA 2VCQA 2RLIA 1MD4A 3KP9A 1V57A 4YQUA 1DSBA 4GRFA 4PNFA 3M3MA 1WP0A 2MBSA 2HFDA 1X5CA 2C0EA 4NXIA 2B5EA 1TK5B 3A5WA 1M7TA 5IO2A 3CBUA 3D5JA 1O8WA 1Z7RA 1ZOFA 3HCZA 2LUSA 4L0UA 4XS4A 4GCIA 2LJRA 1QUWA 1B9YC 1NHOA 3WD6A 3IA1A 1AQWA 3RPPA 1T1VA 2CVBA 3KMOA 2H6XA 2OE0A 1VF4A 5ECKB 3L9SA 2EIRA 2LNSA 1TRVA 3FRCA 5AISA 3A2VA 4AJ8A 5KN3A 4WF5A 5EVOA 4LL1B 1OC9B 2VL2C 2IJYA 2KP1A 5CRGA 2O89A 4IN0A 2FY6A 4ZB6A 2WB9A 1X9SB 3KTBA 3IV4A 1B8XA 5CNWA 2LS5A 1XBSA 5J9BA 4TVEA 2C3TA 3G7YA 2VO4A 2YWNA 1JZWA 1PL2A 3VURA 5G1KA 4NAXA 4ZB9A 2JSZA 5D8IA 3QPMA 3QAWA 4BVYA 4TOPA 2GZZA 5ID2B 1SENA 4DEJA 2NVLA 1GSFA 5FWGA 5DQYA 4IS0A 3H79A 1JZRA 3LORA 2OBKA 1H4OA 5ABRA 5DCGA 1M99A 2HLSA 2BTOT 2KP2A 2WDUA 4ZB8A 1PRXA 2DJJA 3VPQA 1FVJA 4Z7XA 3E3EA 3G7JA 2AAWA 5DAKA 4IP1A 2A2RA 3LXTA 2C0DA 2C0FA 5B8AA 1XWGA 4QL9A 5LD0A 3KGKA 1XCCA 4OD7A 3HDCA 4Q5RA 1YDKA 2AYTA 1AW9A 5IOXA 2CV4A 1TTZA 3GN3A 3LYPA 2GQMA 4EDZA 2IWTA 5FHIA 1K0AA 2B5YA 1EZKA 2M80A 2CAIA 4K8MA 3IK9A 2X64A 4BA7A 3GFKA 3F9UA 2VCWA 3SWLA 3C1RA 3O76A 4EL1A 1N2AA 2B1LA 5E59A 1YEPA 1DBYA 2IL3A 5HR0A 2P5QA 4ZXGA 4GQFA 5D9TA 4KAEA 2X8CA 4TR4A 4O92A 2GZYA 3O3TA 1YKCA 4KSOA 3KH9A 4WBJA 2B5XA 2QKEA 1X9MB 5IM9A 1Q4JA 3RAZA 2N5FA 3D4TA 4E8HA 2H30A 3A2XA 1O81A 3F3QA 5IQYA 1V40A 4K1FA 2BMXA 3H4KA 4L5OA 4ZL8A 1OE7A 1WOUA 1BX9A 2F8AA 3AY8A 4MZBA 3TJFA 4ZL7A 4NV2A 2DSAA 1O85A 3P8WA 2B3SA 4P3YB 2VLUA 3V1WA 2WFCA 2FWHA 1TJDA 2H66A 1V9WA 5ECLB 2I4AA 5F0GA 1HNBA 1G7OA 3EWLA 3HVXA 2PPTA 3VPTA 1O6JA 1QXHA 1SJZA 4K0NA 5B6NA 3ZL5A 1GSQA 1THXA 5AIVA 4PGTA 2LQOA 4HUAA 3US3A 1K3OA 3M9KA 4GWRA 6GSYA 3ZVJA 2IFQA 2YP6A 1XPVA 4OWYA 3EE2A 1B9XC 4Q5NA 1M2DA 2LKUA 3BOAA 2R37A 1GSSA 2HZFA 3GKMA 3GRXA 3IDVA 1XVQA 4KDXA 3BD2A 2VCTA 4F0CA 3FZAA 4FYCA 1X9WB 2GGTA 1Z9HA 4YQMA 5DCHA 2J23A 2YANA 1GLQA 2V1MA 1GLPA 1J9BA 4PNGA 2ON7A 2HXKA 1YF1A 2EIOA 1TOFA 4BVXA 1NSWA 3LGCA 2FWEA 1JLVA 3CXGA 2YWIA 3H8QA 4IJ3A 4TW5A 3GV1A 3HKRA 3ZZXA 2KHPA 2O8VB 3FZ4A 4PUAA 5B7CA 3JCML 2B7JA 3M9JA 3QFAC 4F03A 1LJRA 4MPGA 4N11A 2AB6A 3TKSE 2CZ2A 1YJ6A 2WS2A 2RIIA 4Q5QA 2J9HA 4ECCA 2YZUA 2JSYA 20GSA 4HJ2A 2GSQA 2FUG2 5ECNB 3Q18A 5F06A 3DVWA 1FO5A 2H1DA 4E8EA 3QFBC 2V41A 2XBIA 1QK8A 2GDRA 3W6GA 3Q74A 3DRNA 3FYGA 3PH9A 4XS6A 1EP7A 1X0RA 2Z9SA 5IPHA 1SL0B 2AHEA 2LV3A 1T3BA 3UL3A 2M46A 4FO5A 1JHBA 3C1SA 3UOMA 2DIYA 3APSA 3TKSC 1K3LA 3FR6A 3IOSA 3TDGA 2VM1A 4MK3A 1MD3A 4KNDA 2TIRA 1TDIA 1BG5A 2L59A 1XOAA 2GSTA 4K6XA 5F07A 3IR4A 3SBCA 3RBTA 1THOA 1Z6NA 4HI7A 4OCFA 1AIUA 1G7EA 1SU9A 1JLWA 1ZZYA 5H5RA 3TJKA 2GSRA 1B4PA 3CSIA 3ZLPA 5LNKe 5KEJA 2IMEA 3KEBA 4MJAA 1ILOA 3KIJA 5H5SA 2IMIA 4EDYA 2C3NA 2C4JA 1VF2A 2E2MA 2YWMA 3BCIA 4V2LA 4LMWA 2QSIA 2HNLA 4KCEA 1EOGA 3ZREA 2H1GA 2H6YA 7GSSA 1J08A 3I9V2 3TJBA 2H8LA 1EWXA 2ZCTA 3CSJA 3EYTA 5F8BA 1A0RP 4BWSA 1J0FA 3P7XA 1M9BA 3UVTA 3LXZA 4OO5A 4TN8A 1GNWA 1GTUA 2OBIA 1A24A 3TOTA 5FT3A 3FK8A 2P0GA 3FHKA 1YF0A 1BJXA 5ECRB 1FHEA 5IIZA 4GQCA 2VL9A 4J57E 2MMNA 2XPDA 4PX1A 2H76A 4RUVA 1U3AA 1EEJA 2XPEA 4MH3A 1EV9A 1F37A 3W8SA 3CTGA 2O85A 2H0IA 4HS1A 2IPAA 4HU9A 3ZIJA 1WIKA 3UVHA 3IRAA 2DJ1A 1KEBA 3L9UA 4POKA 2C3QA 5E4WA 5G5FA 1GTAA 3UAPA 4I5QA 2PGTA 4K7IA 1Y25A 1V98A 1OC3A 1PGTA 1SL1B 6GSXA 2CVKA 1SJIA 4I2UA 2AJQB 2H0GA 4HQSA 1Z6MA 4N0ZA 1KTEA 4WR4A 2L57A 3ERGA 1T00A 2MMAA 3I6AA 4KW6A 4MJBA 2FHEA 3MDKA 2K8SA 4YAPA 3DIEA 5IMDA 2TRCP 2WZ9A 5H5QA 2H01A 2MMOA 2YOIA 1ZCPA 4IKHA 1XWKA 2VD1A 3TKQA 1GL8A 3RDWA 3WGXA 1BEDA 2NBSA 4JRRA 2DJ2A 3M0FA 3TCOA 1TRSA 1MDKA 9GSSA 1M2BA 1JZDA 5HR2A 1KNGA 4EVMA 3EINA 3ERFA 4ZILA 4CW9A 3L78A 4KE3A 3MSZA 3DKSA 4KDUA 2YPMA 3VWVA 2TRXA 3GHAA 4KH7A 1ML6A 3IC4A 2K6VA 4ILFA 1TP9A 2FGXA 5F05A 1TXXA 4HQZA 3Q19A 16GSA 4EKZA 4L8EA 1G0TA 3QAVA 1K0DA 1SK1A 5CRHA 2JACA 4HDEA 1Z5YE 3IK7A 3PGTA 2V6OA 6GSVA 3IAS2 1XZOA 5JCGA 3GSTA 5CYYA 3HXSA 2VCZA 3WYWA 1X5EA 1C72A 3GTUB 1PMTA 2CAQA 4BPYA 3GYKA 4IELA 1IYIA 2FNOA 4YAVA 1QFNA 4POBA 3TRXA 2CA8A 4WR5A 4POMA 4PQHA 5KN1A 1GSDA 2GZPA 3F4SA 3PINA 4F0BA 3F63A 1A23A 4NHZA 3G9BA 5HFKA 4D73B 3UMAA 1KBNA 1ERUA 4L0WA 4BL7A 5J5NA 5J9CA 2V2GA 2HT9A 4MJEA 1PKZA 4ZBBA 1O7UA 2HZEB 3VFIA 1MDIA 1K0NA 1OC9A 1XW6A 4KDYA 1WMJA 4N30A 3D6IA 5DJLA 4JBBA 3EMPA 2HE3A 3I69A 4GSNA 5A4VA 2H6ZA 2OJLA 2JADA 2BJXA 5GAPD 2C80A 2WJUA 2VAFA 1BYEA 2PVOC 2DJ0A 1SD9A 4GF0A 3PR8A 4TXVA 4EF0A 2DMMA 8GSSA 3C71A 2YJHA 1R4WA 2YV7A 3GH6A 4IHUA 4JR6A 5ID2A 1SL2B 3ZIVA 3C73A 4IQAA 5HR1A 4LL4B 1R5PA 5ELGA 3LG6A 2XC2A 4JZQA 1UN2A 1BAYA 2H1AA 2ES7A 3APQA 4KA0A 3VWWA 1K0BA 3GURA 3TRQA 2NPBA 2DLXA 1HD2A 3TJGA 2WRTA 2XBQA 3GL3A 2GQKA 1YZXA 2VUPA 2FWFA 3KM6A 17GSA 4OMVA 4TR1B 3L0HA 1A2LA 1TW9A 4EUYA 4TXOB 3NIVA 2KOKA 1ERVA 2B1KA 3VI7A 2A2SA 4ID0A 4IW9A 3TB2A 2K9FA 4I97A 5AIXA 3HY2A 4K9ZA 2B6MA 3QR6A 2DC5A 1EV4A 4HZ4A 5A4WA 3TGZA 1SD8A 1T4ZA 2LQQA 3GX0A 2HZEA 4OCEA 5AN1A 5B8BA 3UBLA 4G10A 1FVKA 3TKPA 5J41A 3H93A 3CRUA 1O8XA 1HQOA 2FLSA 4V1Ap 3W8JA 5IMZA 1QMVA 3KXOA 1GP1A 3IPZA 3VLNA 5JCWA 5L71A 4IQ1A 2N5AA 2CT6A 2JL4A 3DGQA 1O73A 5D9XA 1Z7PA 4O5RA 3GL5A 4TR3A 2OE3A 4Q5FA 2PU9C 3IHQA 1XXUA 4N10A 3FKFA 2HYXA 4MJCA 3EU4A 2I9HA 4V2MA 1AUCA 2MMZA 2RUFA 4XRDA 1CQHA 1R26A 1NHYA 4ACSA 3UARA 1AQVA 1FG4A 1OKDA 4LLRA 5ECIB 4XTSA 1GWCA 4V1Ag 3J7Yk 3ME8A 1AQXA 1TKDB 2PMTA 5DALB 1ST9A 6GSSA 3FEUA 1TK8B 3KJYA 1S3CA 2LTKA 3DWVA 2F8FA 2IN3A 5D9VA 4I2TA 3IXRA 3EVIA 1S3AA 4X1UA 1Y6EA 4IP6A 4OFMA 2H75A 2EIQA 4JU5A 3C7MA 1ZYQB 1XFLA 1GH2A 3LWAA 2DMLA 3M1GA 4JR4A 4K7NA 4GSSA 5GZZB 2C8UA 4MF7A 3ED3A 3GSSA 4H86A 1HNAA 1U87A 5IOWA 2VD0A 2VLTA 5IMCA 1Z3EA 4LMVA 1VF3A 4RQXA 2WULA 5CO3A 1HNCA 2X8GA 4F2IA 3RPNA 2WCIA 4EXJA 4BWQA 2K8VA 2E0QA 3UEMA 2GLRA 2DBCA 4KB3A 2QC7A 2CQ9A 4FYBA 6GSUA 1ZYEA 5IMFA 3BJ5A 5COHA 2HSHA 1VRSD 3FZ5A 4MABA 1W89A 2I81A 5ECQB 1M2AA 1XWAA 4ZBAA 1GRXA 2YJ7A 4WKWA 2O7KA 1U88A 5HFIA 1E6BA 2LRCA 4XS4B 5ELAA 4ZBDA 1F2EA 1SYRA 3VWUA 2HRNA 3ZTLA 3F6FA 4MPFA 1GTIA 4GLTA 5AGYA 1GUMA 2VL2A 3N9JA 2REMA 5HQPA 5J3RA 1X5DA 2H70A 5ECHB 2E7PA 1AAZA 4I6XA 1GUKA 4ECBA 1A2MA 1GTBA 11GSA 4OFTA 2PVQA 2H19A 2FD3A 1QQ2A 2LNTA 2OKAA 3BCKA 2YV9A 4GSTA 3HA9A 2R4VA 3WGEA 1CQGA 4IGJA 2H74A 2RM5A 1ZGNA 1S3DA 2YCDA 5IPGA 5HR3A 5EY6A 3UIWA 3GUSA 2C1YA 1T8EB 3J7Yb 5A4UA 4KCAA 4HJMA 5JWQB 4PQ1A 5DBQA 3QMXA 3F3RA 4O32A 2GTUA 1BQ7A 4XHMA 4I8BA 5ECMB 1SK2A 1N8JA 3H1NA 1AXDA 2N5BA 4G19A 5EPFA 2WGRA 3WT2A 3ZYWA 4RI6A 4ML1A 4ECJA 2AV4A 2IMDA 3KP8A 3ZVJD 4G2EA 1JFUA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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