3L9UA

Crystal structure of salmonella enterica serovar typhimurium dsbl
Total Genus 73
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
73
sequence length
199
structure length
199
Chain Sequence
ASAFTEGTDYMVLEKPIPNADKTLIKVFSYACPFCYKYDKAVTGPVSDKVADLVTFTPFHLETKGEYGKQASEVFAVLIAKDKAAGISLFDAKSQFKKAKFAWYAAYHDKKERWSDGKDPAAFIKTGLDAAGMSQADFEAALKDPAVQETLEKWKAAYDVAKIQGVPAYVVNGKYLIYTKNIKSIDSMAELVRELATKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
publication title Structural and functional characterization of three DsbA paralogues from Salmonella enterica serovar typhimurium
pubmed doi rcsb
molecule keywords Disulfide isomerase
total genus 73
structure length 199
sequence length 199
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2010-01-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3l9uA00
1GSDA 6GSYA 2HSYA 1YKAA 2GTUA 3VI5A 4H86A 1T7PB 1GSFA 2FHEA 1XVQA 1QXHA 3VPQA 1ERTA 3LORA 4K2DA 2VD1A 2DIYA 2C3TA 2H6ZA 1AC1A 3VLNA 2WCIA 2I9HA 3EU3A 5GSSA 1HD2A 5ELGA 2EIQA 4K7IA 4PX1A 3Q6OA 1NHYA 3VWUA 12GSA 4WEYA 3HJOA 3HA9A 2X8GA 2QGVA 4XRAA 2DLXA 3QDNA 3L4NA 4DSRA 4ZL8A 4F9ZA 2F8AA 1YF1A 2CX3A 2AV4A 3QAWA 4DSQA 2BJXA 5DALA 5IMZA 2H76A 2AAWA 2YPMA 3RPNA 2CA8A 4PQHA 5LD0A 3WD6A 4QQ7A 4KSOA 1GNEA 3L9UA 4HQSA 1A2MA 1K3YA 1TP9A 5G30A 1WIKA 3ZITA 4JBBA 4K7OA 5B8BA 3I6AA 4MCUA 3UVTA 3DD3A 3GKNA 3TJFA 1JZWA 2XHFA 1KTEA 2H0HA 3KMOA 1EOGA 4OCEA 1OAZA 1XOBA 2EIRA 5FT3A 2N5FA 2L4QA 3VURA 1GTIA 1G0TA 1F2EA 1DSBA 5E4WA 2M80A 5HR0A 2PMTA 3NOFA 4DSSA 1FHEA 1B9XC 16GSA 3GURA 3KH7A 3QFBC 4OWYA 1GSEA 2JZRA 4O92A 1XOAA 3LWAA 1MTCA 2LQQA 3C73A 1PRXA 1SJIA 1XWAA 2YJ7A 2GS3A 2FWHA 3A5WA 4KDXA 2MBSA 3F3RA 3Q19A 4PUFC 3FZ4A 3HVXA 3HD5A 4TXOA 1M7TA 2I1UA 1R5PA 1JZRA 4PQIA 2L57A 4L0WA 2FY6A 3EMPA 4JR6A 4N10A 2YP6A 3QFAC 1K0NA 2DMLA 3G9BA 1FOVA 4TXVA 2H73A 4LL1B 1ZYEA 5G5EA 5CRWA 2X8HA 4MPGA 1DBYA 2FCHA 4MA9A 4TR1A 4I2UA 4POLA 4F2IA 4OFTA 2LTKA 4E8HA 4NPBA 5ECQB 1MEKA 4YQMA 1GTBA 1PSQA 5F05A 2VL2A 3ERFA 4ZIJA 3GHAA 2P0GA 1FW1A 2RLIA 1SYXA 5G1KA 4K7NA 3BBYA 2R2JA 1MD4A 2ES7A 5D93A 3ZZXA 4V1Ap 3IHQA 1K0BA 1ON4A 1Z3EA 1ST9A 2H66A 3RHBA 3GN3A 5LNKe 3GFKA 3LGCA 1XPVA 2GZZA 2IMEA 2RM6A 2IN3A 4KCEA 2O8VB 1WOUA 2WZ9A 3FR6A 5AISA 4MF6A 5DALB 5ECKB 2JSYA 2XPDA 4XCSA 1WJKA 3D6IA 5DAKA 4OO5A 4KE3A 4MDCA 3WGDA 1ZL9A 4GTUA 2C1YA 2PPTA 2IL3A 3KZQA 3TKSC 1BJXA 2FLSA 2VCXA 2H1BA 1N8JA 4YQVA 1XCCA 3UL3A 3F8UA 5D9TA 1XW5A 2CQ9A 2C3NA 3WT2A 4DVCA 4BVXA 3KCMA 1UC7A 2B5EA 3D22A 4HQZA 2FNOA 2IMKA 1YJ6A 3IA1A 1SK2A 3BCIA 1SKSB 5EY6A 3LQ7A 1B4QA 2V41A 3D0ZA 2HFDA 2XPEA 4IN0A 2I4AA 2VO4A 5IOXA 4XS6A 3J7Yk 2R3XA 4LMVA 4RQXA 5CRGA 7GSSA 1AW9A 3KM6A 1X9WB 4GSSA 4DSSB 1K0AA 3Q74A 2E2GA 2QC7A 3UIWA 1QQ2A 3KP9A 5ECHB 3R2QA 3SWLA 1LBKA 1XZOA 4J2FA 4POMA 3FW2A 4TR3A 4LA1A 1GLQA 5IM9A 5ECIB 2R4VA 1PL1A 4FO5A 4ECBA 1FVKA 1QK8A 3ZREA 3ZFBA 2LNSA 4MMMA 1IYIA 1T1VA 2R6KA 3C8EA 3QPMA 3P8WA 4OCFA 1E6BA 4TXOB 4NV5A 2P31A 4KDYA 4GLTA 2N5BA 4F0BA 2CZ2A 3PGTA 4LLRA 4LL4B 2VLVA 4YH2A 1GWCA 3H1NA 1XIYA 2DJJA 2REMA 4TR1B 5B8AA 1ACVA 1F3AA 2H19A 4WF4A 3IC4A 4PUAA 1S3DA 1Z9HA 3RHCA 2VCTA 2DMMA 1U3AA 1CQGA 1GULA 1V9WA 4O5RA 2AYTA 1A8LA 1ZOFA 4ZBDA 3ZIVA 4IP6A 4HU9A 3TJBA 1O8XA 2YNXA 1SU9A 2FWEA 3CYNA 4PURA 5KN0A 2LRNA 4K8MA 2V6OA 1JHBA 4WKWA 2ON7A 2IFQA 4CDOA 3H93A 4I6XA 2VAFA 3L9VA 5CRHA 4GXZA 4KNDA 2YCDA 1GSQA 1EEJA 1EV4A 5A4WA 3RBTA 4PNGA 5J9CA 1F9MA 1TTZA 3P2AA 1K3LA 1SKRB 4KDUA 2H0GA 3WGXA 3BCKA 2BTOT 2C8UA 3KJYA 2DJ3A 4F82A 5DAKB 3CXGA 4MZCA 3K8NA 5ECMB 5ENUA 2HNLA 3M3MA 5ECLB 3A2XA 3ME7A 2H1DA 2OBIA 1M2BA 4EE0A 2E2MA 4EO3A 3F0IA 1THXA 3VWWA 2B7KA 3GNJA 4BVYA 2MMOA 2LRTA 1BEDA 4J56E 1G6YA 2HZEA 2VIMA 2GSTA 3UOMA 3DYRA 3APOA 2YZHA 2C80A 3GMFA 5ECSA 6GSTA 1VF2A 4OD7A 2LNTA 2DJ0A 1ILOA 1T00A 1B8XA 3QAVA 1EP7A 4K1FA 4Q5FA 3IBHA 3JCML 1ZYQB 3D5JA 2C4JA 13GSA 3TRPA 2HYXA 4ZB9A 1TKDB 5IIZA 1EZKA 5COHA 3FYGA 2K9FA 3KD0A 5JCWA 2PU9C 3TDGA 1R7HA 5D9XA 2H1GA 3VFIA 5HQPA 1GH2A 4JU5A 2VM2A 1GUKA 4POKA 1OE7A 1URMA 1SD9A 5G31A 4ULXA 2RUFA 5JCGA 1VF3A 3APQA 3VPTA 2GSQA 3EYTA 1RK4A 1XVWA 4OFMA 5IPHA 8GSSA 6GSXA 2VCQA 1B4PA 3F4RA 1BYEA 5HR1A 1MD3A 2MMAA 5J41A 4G10A 4IJIA 1Q4JA 2VL3A 3ERWA 1USBA 2RUEA 4FH8A 4V2NA 3FR9A 1Z5YE 3QCPA 1GSUA 5JWOB 17GSA 1V98A 3GUSA 1TRUA 3WT1A 5EPFA 4N11A 1XW6A 1N2AA 2V6KA 2J9HA 4YAVA 5H5RA 1MDIA 4TRXA 4OMVA 5B6NA 1XWKA 2D2ZA 2B1LA 3FZAA 4MH3A 2X64A 4MZWA 4OFNA 5CREA 2B3SA 1K0DA 4NWYA 2JSZA 1YQ1A 4EUYA 2JACA 2I81A 3NIVA 5D9WA 3GX0A 3ZMLA 1DE2A 4IKHA 3HZ8A 5DVBA 3ZYWA 3H79A 2IFQB 2XBIA 2K8SA 5DBQA 4AJ7A 5LCZA 1EP8A 5CNWA 1O73A 5A4VA 2GGTA 2GQLA 2HRNA 2O7KA 5D73A 5G2ZA 1AXDA 1O8WA 2KUCA 4EL1A 4ZL7A 2O87A 3F4TA 4GF0A 1HQOA 3HVVA 3CSJA 5IMAA 1WE0A 1LJRA 4TW5A 2HE3A 1BX9A 2YJHA 5F0GA 2J23A 4HZ2A 1TJDA 4E8EA 2A2SA 4PNFA 1KNGA 2PN8A 3RAZA 5DJMA 2HLSA 3WGEA 3DKSA 4G2EA 1CQHA 5ECNB 1T8EB 2B5XA 4OO4A 4XHMA 3GA4A 1TDIA 2HZFA 4KH7A 2CV4A 3BD2A 11GSA 2HZEB 1A0RP 3Q18A 1ML6A 5DDLA 4EVMA 1K0MA 4KCAA 4QL9A 3D4TA 1X9SB 4XTSA 3PR8A 2K6VA 4ML1A 3LG6A 1V58A 3FRCA 4TOPA 2WRTA 1XWCA 3MWHA 3LJRA 5IMVA 3IXRA 1TI3A 3GYKA 2DJ2A 3H8QA 3GH9A 2G0FA 3UBLA 3ZFLA 3QOUA 5AIVA 2B6MA 2DJKA 4O7HA 5KEJA 3EVIA 2BMXA 2WS2A 3A2VA 2F9SA 4X0XA 3TCOA 1JLWA 5FWGA 4ML6A 5G1LA 4MPFA 4EC0A 2E0QA 1YDKA 4ECCA 3M9JA 3CSIA 3FK8A 1MDJA 4Z7XA 2OKAA 3TRQA 2CT6A 4WR5A 2RM5A 3G7IA 1M2AA 5AGYA 1ZMAA 1KBNA 4FYUA 2LJRA 4TVEA 1GUMA 3GTUA 3LYKA 2H8LA 1F37A 1O6JA 5HFKA 1NHOA 4NMUA 2L6CA 3ZMKA 4D73A 3ZVJD 4ISDA 4X1UA 2KHPA 4I8BA 5HFIA 1TU8A 2B7JA 4Q5NA 3GKMA 1C72A 1E2YA 1YEXA 1PGTA 4BL7A 1F3BA 1RQMA 2CVDA 1PX7A 1V40A 3TUEA 3GKKA 3KGKA 2OE0A 5J3RA 3DWVA 1JFUA 2YV9A 4RI7A 1DUGA 1M0UA 2ZUPA 3VWVA 1YKCA 4RI6A 1I5GA 4ECIA 2CAIA 4HZ4A 2LV3A 2OE3A 1XWGA 3EURA 3TKSE 5EVOA 3D21A 3O76A 2IMFA 1WWJA 4XS4A 4F0CA 4TR0A 3IRAA 1AQWA 1VGLA 2HSHA 5CYYA 2VL2C 1Y6EA 2EC4A 3EU4A 4IQAA 4BWSA 2EIOA 3DXBA 1O81A 2LUSA 2KOKA 1HNBA 2YV7A 1O7UA 2C0EA 4ACSA 2Z9SA 3D4MA 1Y25A 1M2DA 3FR3A 5A5KA 5ABRA 4MLYA 3I43A 3N5OA 5HFGA 2H71A 4JE1A 1O85A 3IAM2 5IO0A 2P5QA 4GRFA 1SL1B 1A8YA 3GRXA 3DEXA 4L8EA 2GSRA 2K18A 2H74A 2YWIA 5G5FA 4V1Ag 2QKEA 4HOJA 2TIRA 1A24A 2PERA 1HNCA 5JCUA 3LXZA 1IYHA 1QFNA 5JWRB 1RW1A 1Z6MA 1SKWB 3GL5A 3KH9A 3KIJA 5A4UA 4P3YB 3KP8A 4KAEA 3OR5A 1R4WA 2E7PA 1OYJA 4GWRA 1M9BA 4BA7A 2XBQA 3LEFA 1YZXA 2LJKA 3MSZA 3P7XA 4IHUA 2H01A 2IIYA 4WF5A 1UA5A 1VRSD 1FB6A 4NHWA 3O3TA 5IO2A 2JADA 5DJLA 1T4ZA 2F3MA 3IAS2 1AQXA 4HUAA 1X0RA 2WB9A 2JU5A 1AUCA 2YWOA 4IJ3A 2XC2A 3FZ5A 1QMVA 4IP1A 1BQ7A 4G9HA 4MF5A 1H4OA 3FKFA 1ZGNA 4XRDA 4Q5RA 2OBKA 14GSA 2WJUA 4NHZA 4MJBA 3TJKA 1GRXA 1NM3A 9GSSA 3GTUB 2WFCA 1F6MC 5DCGA 3ISOA 1TOFA 5IQYA 1TW9A 1GSSA 5D8IA 3QR6A 2ALBA 2L5LA 2O85A 3DRNA 5CO3A 3HKRA 4AJ6A 4D73B 2PVOC 2R5GA 4I2TA 2K8VA 1W89A 3IDVA 3UMAA 1EV9A 3GV1A 3F9UA 2VL9A 3A2WA 1GTUA 5DCHA 3VK9A 2L5OA 3IPZA 1VF4A 5B6MA 2M46A 2IMDA 4MJAA 4ZBAA 3HDCA 3H4KA 2AUVA 4K0NA 1V2AA 2IMIA 2DBCA 1LU4A 1FO5A 4J57E 1SJZA 1G6WA 4I5QA 1GL8A 1S3AA 1YEPA 3GIXA 1X5CA 4BWQA 3TJJA 5C00A 2PWJA 4AJ8A 3UEMA 3MNGA 2FUG2 4XS4B 1EOHA 3E9JB 3G7YA 4MF7A 3LSZA 4JRRA 3UAPA 2JZTA 3V1WA 4HDEA 3GH6A 5EL8A 3ZTLA 2KLXA 4IVFA 2OE1A 1WP0A 2PBJA 4FYCA 5GSTA 5KN1A 1Z6NA 2PGTA 5B7CA 3DGQA 4EF0A 1VF1A 2M72A 2FWFA 5ECPB 1AIUA 3TRXA 4WXTA 2ON5A 2PUKC 3ZVJA 4WBRD 5AIXA 3TKPA 1XW9A 1G7EA 4PQ1A 2LJAA 3MAKA 4EDZA 1HNAA 2LQOA 4YQUA 1TXXA 6GSUA 5IOWA 5ID2A 3GL3A 3HYPA 3APSA 4ILFA 4IW9A 3PINA 1ERUA 3IK7A 2B5YA 1QGVA 1V57A 3LFLA 3UBKA 2KP1A 3QD9A 3CBUA 4V2LA 3TKQA 5J9BA 3HJPA 3QAGA 4PGTA 2GZPA 1EWXA 2GT6A 19GSA 1XWBA 2LSTA 3GSTA 5DQSA 4MZBA 5ELAA 3ZL5A 4KUNA 1A0FA 5D96A 2V2GA 3DVXA 1J08A 2H1AA 2GZYA 2MYGA 1FG4A 4DEJA 1BG5A 4CW9A 3ZIJA 2AJQB 4HI7A 2H6XA 3CSHA 4IGJA 2VCZA 1TK8B 2OJLA 3KXOA 3M0FA 3UVHA 3ERGA 3U6VA 3IK9A 3LXTA 1NW2A 1YF0A 1X9MB 1U88A 3F3QA 5CP1A 3U5RE 1THOA 3C7MA 1JLVA 5E59A 3HY2A 4AF2A 1H75A 1X5DA 1PQNA 4ID0A 1K0OA 4FIWA 4NV2A 3HVSA 1OKDA 4CHSA 2GVPA 4X43A 1PN9A 2ZCTA 3BJ5A 4KB3A 1PD21 3MDKA 1K0CA 2L4CA 4K0GA 4MP4A 1SK1A 2CVKA 1BAYA 4L5OA 3EWLA 3J7Yb 3G7JA 1MDKA 4IQ1A 4IS0A 2JL4A 5H5QA 5AN1A 3F4SA 2DIZA 1T3BA 5FHIA 4WR4A 2ZNMA 4XS1A 2VLUA 4HJMA 3W6GA 5D9VA 3IV4A 4EDYA 1B9YC 2GSSA 1EEMA 2NVLA 1TK5B 1A23A 2B1KA 4GQCA 3L0HA 4KGIA 2CX4A 4K9ZA 3N9JA 4LMWA 1XBSA 4WBJA 2HT9A 3US3A 2FGXA 4KX4A 2PVQA 2NTOA 2YANA 4RQRA 1OC9A 6GSVA 1SD8A 3ED3A 1PL2A 2CVBA 1U3IA 2VD0A 3CRTA 5DQYA 4GSTA 4POBA 4ZL9A 5F06A 1Z7PA 4HEA2 5ECRB 5ID2B 3C71A 4TN8A 3TOUA 4IBPA 20GSA 2C3QA 3TKSA 2GDRA 5INYA 2LEGA 2TRXA 2MZCA 1NSWA 3TJGA 3WYWA 4G19A 2OA7A 2NDOA 4O32A 3FEUA 1YY7A 4EXJA 1EGOA 1GLPA 2AHEA 1UN2A 3CRUA 1GSYA 1M99A 2QSIA 4RUVA 3S9FA 3L78A 4F03A 5GAPD 3F63A 1TK0B 4JR4A 2VOCA 2C0FA 2WULA 1GNWA 1Z7RA 3UJ1A 22GSA 2IPAA 2H72A 2G2QA 1W4VA 4QL7A 1OKTA 3M1GA 1R5AA 1J9BA 2VLTA 1ZCPA 3QMXA 3O6TA 1SJ6A 3EE2A 5F8BA 4MABA 1J0FA 2CZ3A 2RIIA 3IR4A 4EKZA 4ZBBA 2O89A 2H0IA 4V2MA 1SK0A 3KEBA 1K3OA 10GSA 2IWTA 1OVNA 5ECOB 4JZQA 2C0GA 2A4VA 4N0ZA 1X5EA 1SL0B 1S3CA 2C0DA 2H75A 2YWNA 3ME8A 3L9SA 2MMZA 1WPIA 1PKWA 4KA0A 3EMXA 4I97A 3FHKA 3CMIA 4MJEA 2WGRA 1QUWA 2FWGA 3PH9A 2V32A 3HJMA 2IJYA 1ERWA 1WMJA 4FYBA 2P5RA 2LRCA 1TRVA 1EGRA 4KW6A 1I9DA 1PX6A 1TU7A 5IMCA 5KN2A 2L59A 1ZZYA 18GSA 3ZLPA 4GCIA 5J4UA 1FAAA 2DJ1A 3A3TA 4NAXA 1A2LA 4PXOA 2FD3A 5IMDA 3GX8A 2YOIA 3IOSA 3ZRDA 2HRFA 2TRCP 2F51A 4HJ2A 3HCZA 4MJCA 3I69A 4ZILA 5HR2A 3DVWA 3TB2A 1A2JA 4GQFA 4N30A 5J5NA 3C1RA 5L71A 3GKXA 4BPYA 2GLRA 3E0UA 1AAZA 2R37A 3P90A 1OC9B 2I3YA 5HR3A 2H70A 1U6TA 3E3EA 1ERVA 1R26A 3C1SA 2NPBA 3KTLA 4MK3A 2WDUA 3M8NA 3VI7A 3EINA 5GAND 3CTFA 3HXSA 2GQKA 3GSSA 3EC3A 2MMNA 4L5LA 2H6YA 4K6XA 3FZ9A 2X99A 2VCWA 4JEDA 1FB0A 3RPPA 3TKRA 2F8FA 1OE8A 4IELA 5CAXA 2KP2A 2VUPA 3VWXA 2AB6A 2LS5A 3F6DA 4YAPA 1XFLA 1SL2B 3LYPA 4ZB8A 3BOAA 3F6FA 4AGSA 1Q98A 2YWMA 2NBSA 5CRDA 4ZXGA 2HI7A 1DE1A 2A2RA 2JZSA 4Q5QA 2CAQA 1T4YA 6GSWA 4ZB6A 3M9KA 3DMLA 4TR4A 2GT5A 2LKUA 4NXIA 4XIHA 1JZOA 2FA8A 3HHVA 1GTAA 2H30A 5KN3A 1OC3A 1WRYA 4HS1A 2N5AA 4HU7A 1OC8A 3UARA 3IE3A 3RDWA 3I9V2 1XXUA 5JWQB 3TGZA 1GP1A 4GSNA 2YZUA 1AQVA 4L0UA 2OADA 2YN1A 1TRSA 1KEBA 1U87A 5IMFA 2MBTA 2GQMA 1B48A 3DIEA 3KTBA 2FA4A 3TOTA 1HYUA 1SYRA 1FVJA 1TI1A 3HZ4A 1JZDA 4TKYA 4KSMA 2OACA 5H5SA 4N0VA 2VM1A 3SBCA 5C04A 1PMTA 6GSSA 1PA3A 2HXKA 1GUHA 1M9AA 5F07A 3CTGA 3AY8A 1PKZA 5GZZB 1G7OA 2X8CA 3KMNA 1TRWA 1SENA 2V1MA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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