3L9VA

Crystal structure of salmonella enterica serovar typhimurium srga
Total Genus 57
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
57
sequence length
182
structure length
182
Chain Sequence
AEWESITPPVVDAPAVVEFFSFYCPPCYAFSQTMGVDQAIRHVLPQGSRMVKYHVSLLGPLGHELTRAWALAMVMKETDVIEKAFFTAGMVEKRLHSPDDVRRVFMSATGISRGEYDRSIKSPAVNDMVALQERLFKEYGVRGTPSVYVRGRYHINNAAFGAFSVENFRSRYAAVVRKLLAG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural and functional characterization of three DsbA paralogues from Salmonella enterica serovar typhimurium
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Salmonella enterica subsp. enterica serovar typhimurium
molecule keywords Putative thiol-disulfide isomerase or thioredoxin
total genus 57
structure length 182
sequence length 182
chains with identical sequence B, C, D, E
ec nomenclature ec 5.3.4.1: Protein disulfide-isomerase.
pdb deposition date 2010-01-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01323 DSBA DSBA-like thioredoxin domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3l9vA00
5IMZA 3KIJA 5G2ZA 2FWEA 5E4WA 3C1RA 4IHUA 3TGZA 1Z5YE 3K8NA 3HY2A 2N5FA 1THXA 1GLQA 4XS4B 4JRRA 1EEJA 1TW9A 1TTZA 1UVZA 1U88A 1TU8A 2B1KA 2FCHA 2NDOA 1K3OA 1SKWB 2A2RA 3H4KA 3CRUA 4ZIJA 1WWJA 2V41A 2DIYA 4Q5RA 2MZCA 4K7NA 1K3LA 4ECCA 3E0UA 1X5DA 6GSTA 4EUYA 3A3TA 5KEJA 3CMIA 3EU4A 3J7Yb 1NHYA 3LEFA 2FGXA 5IMCA 2CAQA 4XCSA 3MDKA 2K8VA 4NV5A 4GSTA 4FYUA 2F9SA 3IE3A 5CAXA 2FA4A 2WULA 5J4UA 3UEMA 2AV4A 1MD3A 2CQ9A 2XHFA 1GUHA 4MCUA 3M8NA 4GQFA 1RW1A 1TK8B 2EIRA 4I2TA 5DJLA 5CRGA 2RLIA 3LQ7A 2M46A 3QMXA 4LL4B 3IC4A 3HJPA 1PX6A 5GSTA 2PERA 2YWMA 5D9XA 1M2BA 5LCZA 3KJYA 3ISOA 3GSTA 1CQHA 4GSSA 3APOA 1UC7A 2VCVA 2H1GA 5EVOA 4WBRD 5D9VA 3ED3A 4KDYA 3TKQA 1G6YA 4QQ7A 3FKFA 4K6XA 5ENUA 1YJ6A 3CBUA 4KSMA 4IBPA 4NMUA 10GSA 5AIXA 5G1KA 3RPPA 4TKYA 1K0BA 4FO5A 4ML1A 5J41A 1HNBA 1RK4A 1R4WA 2WCIA 4ML6A 2LTKA 1TP9A 1XW6A 14GSA 3QFAC 1XBSA 3TRQA 3M3MA 17GSA 1VF1A 3C1SA 4KCAA 3PGTA 4NHZA 2NPBA 1OE8A 3A2VA 3EMXA 1GH2A 4RQRA 1T7PB 2BJXA 2OKAA 1JZOA 1A24A 4TR1B 3C71A 2VL2A 2X8GA 2O7KA 3Q6OA 1U6TA 1A8YA 1ST9A 5F06A 3QFBC 1B8XA 3IHQA 1PN9A 4OFNA 1IYHA 2OE3A 2PN8A 3APQA 2P5RA 2H6ZA 4YH2A 2RIIA 2DJJA 2B6MA 5ECLB 2FHEA 3F0IA 4BPYA 3HZ8A 2DMLA 4GTUA 1T8EB 4I5QA 4D73B 1NM3A 4AF2A 2IMFA 2LJKA 4BL7A 1QQ2A 5IPHA 3U5RE 4WXTA 1U3AA 3TUEA 5D93A 3F9UA 2GSTA 3CSJA 5B6MA 4PQHA 4MZBA 2KUCA 3EE2A 5JCUA 4IQ1A 13GSA 3GSSA 4IGJA 3A2WA 4POKA 4Q5FA 1FB6A 2K6VA 3ME7A 3QAGA 2L5OA 5IMAA 3DRNA 3BJ5A 3GMFA 4RUVA 3MWHA 4H86A 2QSIA 1SL2B 3D6IA 4KW6A 5IMDA 3GX8A 4GF0A 2E0QA 5G5FA 4IJIA 3IV4A 3OR5A 1YQ1A 1ABAA 1SK2A 2L4CA 2HNLA 4K9ZA 1MDIA 5IO2A 2R5GA 4FIWA 4HJMA 4HU9A 1TRSA 3E3EA 4WR4A 1Z7PA 1WRYA 3QCPA 1GTIA 2H1BA 3ZFBA 3GURA 5KN0A 4IS0A 1GSDA 3ZREA 3I9V2 2FWGA 2XC2A 4XS4A 4KB3A 4V2NA 4EE0A 2WZ9A 1T00A 2C0EA 1E6BA 3EURA 1EV9A 4HZ2A 2HI7A 4F03A 5CP1A 4N11A 1T4ZA 4RQXA 4IJ3A 1YF0A 3TJKA 5D96A 2H8LA 4MK3A 3P7XA 3LG6A 5D8IA 5ECSA 5FHIA 5INYA 3TKSC 1NHOA 2O89A 20GSA 4GWRA 4FH8A 2IIYA 4O92A 1YEPA 1GTUA 2H76A 3FR6A 3TB2A 2LRCA 2GSQA 2F3MA 3D21A 4O32A 1FAAA 3MNGA 2YPMA 4KH7A 1AQXA 4PQ1A 3IBHA 3DIEA 3FRCA 2VD1A 3KCMA 1FVKA 2JZTA 2VAFA 5D9TA 3FR9A 2I81A 3CXGA 4ID0A 3GV1A 3EINA 5DAKB 2B7JA 2C0FA 2JADA 2I9HA 2E2MA 1Z3EA 2A2SA 1T1VA 5IQYA 1FHEA 3ZLPA 1VRSD 3FR3A 2A4VA 1XWGA 4HI7A 2QKEA 1QGVA 1O73A 1OE7A 4ZL7A 1YEXA 3L78A 1MEKA 3H79A 4EF0A 2MMAA 4POBA 3UAPA 3LYPA 5LNKe 3G7JA 2CA8A 4OCFA 1IYIA 1U87A 3ERFA 1HD2A 4DSSA 3KM6A 2K9FA 5AN1A 4ZL8A 2P5QA 1DUGA 3GKXA 19GSA 1ON4A 4JR4A 2NVLA 4HQZA 4Q5QA 1ZOFA 3LSZA 1SYRA 4XS6A 5IIZA 1PQNA 4K1FA 1XWKA 1LU4A 1R26A 2VUPA 1CQGA 3LJRA 2VO4A 2L57A 5GSSA 4POMA 1K3YA 4IP6A 1SK0A 4EXJA 3TKSE 1M0UA 1YDKA 1O6JA 3M0FA 3FYGA 2L4QA 3WYWA 1EWXA 2GZYA 1SJZA 3IAS2 5GAND 1G7EA 2H6XA 1OC3A 1TKDB 2WGRA 4PNGA 5D9WA 5C00A 4TR1A 2B5YA 3IXRA 1GP1A 1QMVA 3BCIA 1I9DA 4MJAA 3L9SA 2YWNA 2C0GA 2LRNA 3VFIA 5CYYA 5KN1A 3EYTA 1AIUA 5G5EA 2GQMA 5EPFA 1V58A 4PGTA 3KTLA 4D73A 2H1DA 1Z9HA 1GNEA 5B8BA 2C3QA 3HJMA 2LQOA 4JR6A 1G7OA 1K0MA 3GYKA 3E9JB 2FNOA 2VL2C 3LFLA 1BX9A 5F07A 4ZL9A 2XBQA 2EC4A 2KP2A 2WJUA 4J57E 3QOUA 5ECMB 1M9AA 3GL3A 4HZ4A 3DKSA 3UJ1A 2C80A 3A2XA 3DEXA 2XPDA 4QL7A 3CTGA 3C8EA 1G0TA 1GSYA 4IKHA 4ECIA 1B48A 3GKKA 3ZVJD 2L5LA 3Q19A 2V1MA 5DCGA 1HQOA 3D5JA 5G30A 4WR5A 1I5GA 2H0IA 4MF7A 5CO3A 5ECNB 1H4OA 1F6MC 2FLSA 1YZXA 2H30A 4EL1A 2CX4A 4IP1A 2VD0A 3V1WA 2IJYA 2VM2A 4TN8A 3N5OA 4G10A 1EV4A 2H19A 3RDWA 2LQQA 1XVWA 5ECOB 1ZCPA 5LD0A 2VCQA 5IOWA 4J56E 2F51A 5DQYA 2HFDA 5IOXA 4GQCA 1TI1A 4HUAA 2RM5A 1VF4A 2DJ2A 1A8LA 2DLXA 3VI5A 4RI6A 3W8SA 1FO5A 4MF6A 2HYXA 1Z7RA 3EU3A 1N8JA 1SJIA 3F3QA 5J9CA 2R37A 4V1Ap 3KP9A 4V1Ag 2KHPA 3ME8A 1WPIA 1PA3A 4X0XA 3F3RA 3DYRA 2PVQA 2IMEA 2HRFA 3ZZXA 5DAKA 2LV3A 2M80A 2YZHA 6GSSA 2MMNA 4KDUA 4KX4A 1GSSA 2L6CA 1FOVA 2GZPA 4PXOA 2GLRA 4KUNA 3CSIA 1QUWA 3FZ4A 3KXOA 5G31A 1ZYQB 4LL1B 5ECKB 3D4TA 5DJMA 1PD21 3F8UA 2KLXA 4KNDA 1XW5A 2WB9A 3VWXA 4O7HA 4XRDA 4DEJA 3IA1A 2P31A 3HCZA 3O76A 3TDGA 4JE1A 1XWCA 1XFLA 4G9HA 2YZUA 2MBTA 4HQSA 4DSSB 2CVBA 2ON7A 2AAWA 3GL5A 4KAEA 1PL2A 2HT9A 2GTUA 3CRTA 4JEDA 1SKSB 4MP4A 1RQMA 3ZITA 1XPVA 1A2JA 1XXUA 1LBKA 2B3SA 1XW9A 5KN2A 4MPFA 1FW1A 3GUSA 3AY8A 3QAVA 1J0FA 2NBSA 2PUKC 4OWYA 1AW9A 2HLSA 3LORA 3QAWA 2FY6A 1GSEA 2H66A 1QXHA 2CVKA 1ZYEA 1MDKA 5IMFA 5HFIA 1WE0A 1GTAA 1YF1A 6GSVA 4PQIA 4CHSA 1M99A 4ACSA 1SYXA 4TW5A 4EKZA 4PUAA 2VCTA 9GSSA 1O8XA 2HSYA 2REMA 3UIWA 2C8UA 2CZ2A 4F82A 2VL3A 1THOA 1SJ6A 1V98A 1J9BA 1O85A 2LS5A 1OAZA 3F6DA 3GH9A 3Q74A 2P0GA 2KOKA 3G7IA 3WD6A 1Z6MA 3QR6A 2GGTA 5C04A 2YJ7A 4HU7A 4I6XA 3RAZA 1URMA 2GVPA 5L71A 1QK8A 4IQAA 5FWGA 5GZZB 3W6GA 1PGTA 4AJ8A 3M1GA 3DGQA 5A4VA 4L5OA 4IVFA 1XOBA 1A2MA 4MH2A 3HKRA 5DCHA 2ALBA 1PKWA 4ZBBA 3WT1A 5DBQA 5HFKA 3RPNA 1PSQA 2DC5A 1GLPA 1X0RA 3WGDA 4KDXA 2VLUA 4HEA2 1KTEA 1TOFA 1MDJA 1T3BA 1OKDA 2LEGA 4XTSA 2H0GA 1HNAA 3APSA 2I1UA 4MLYA 2GZZA 1USBA 4MH3A 3EVIA 3TJBA 2XBIA 3A5WA 3F63A 1GSFA 2V32A 5B8AA 2RUEA 1EGOA 1SU9A 1ILOA 5A4WA 3QPMA 3FEUA 2VIMA 2WDUA 3EMPA 2LNTA 4EVMA 4K0NA 1W89A 3UBKA 3F6FA 3F4SA 1V9WA 2EIQA 1MD4A 4JU5A 2PVOC 1WIKA 4YQVA 3F4RA 3DVXA 1JLWA 3ERWA 1AXDA 3S9FA 3IR4A 2JZRA 2R2JA 3TRXA 3DWVA 1GL8A 3HJOA 3GX0A 1A23A 1Q98A 4L0UA 5D73A 1PL1A 4XS1A 4ECJA 3ZMKA 4IN0A 4L8EA 2J23A 1B9XC 3F4TA 3TCOA 3GA4A 2Z9SA 3ZIVA 3C7MA 4MA9A 2YN1A 1SL0B 1XCCA 5ECIB 2FA8A 1R7HA 3G9BA 1N2AA 2LKUA 4GXZA 2GSSA 5ECHB 2OA7A 2VCZA 1A0RP 1SD9A 2IL3A 2IMKA 1BG5A 1Y25A 3CYNA 5AGYA 4E8EA 2LRTA 4TRXA 2HZEB 1V40A 2LUSA 2GQKA 4NPBA 2VLVA 3VWWA 3VWVA 1K0AA 2DJKA 3HZ4A 1SL1B 1B4QA 4GRFA 5H5RA 4DVCA 4K7OA 2ZCTA 4N0VA 1BQ7A 1GUKA 2AHEA 3KMNA 1ERVA 3FK8A 5A4UA 2JZSA 4WBJA 5HR1A 3P2AA 2AB6A 2OBKA 2VCXA 2F8FA 2OE1A 3RBTA 2H0HA 2IMDA 2VCWA 4HDEA 2X8HA 3P8WA 4JZQA 2IMIA 3ZVJA 1OYJA 1ACVA 3HA9A 2E2GA 1TRUA 2FWHA 1GSQA 5JWQB 4TR3A 2K18A 2IPAA 2N5AA 4YQMA 1T4YA 4QL9A 4MDCA 5F0GA 1PKZA 4TXOB 1K0NA 2NTOA 3ZTLA 4ZB8A 4MF5A 1VF3A 3RHCA 1W4VA 3US3A 4AJ6A 3ZL5A 1F3AA 4ILFA 2X64A 1GWCA 4CDOA 4F9ZA 4HJ2A 3VURA 2B1LA 2H75A 5J3RA 1ERWA 4O5RA 3WGEA 1QFNA 2M72A 2LSTA 4PX1A 2AJQB 5ECQB 4LMWA 3JCML 4MMMA 1EP8A 4CW9A 4DSRA 1TRVA 3I69A 1O8WA 3G7YA 4I97A 1X5EA 2GDRA 2V2GA 1JZDA 2DJ3A 5HR0A 2HE3A 3ERGA 1G6WA 2IN3A 2FWFA 5CRWA 1JZWA 1TI3A 4AJ7A 4MABA 1DE2A 4N0ZA 2VLTA 4EDZA 3DD3A 3GN3A 2BMXA 5CNWA 1WJKA 1XVQA 1S3AA 5ELGA 3BD2A 1VF2A 1X5CA 4ZBAA 3MSZA 1Q4JA 3TJGA 4I2UA 5H5SA 3U6VA 2VM1A 3TRPA 4KA0A 4ZB9A 2I4AA 3SBCA 1AUCA 4F2IA 1M7TA 3D4MA 3J7Yk 1GUMA 1EEMA 2KP1A 2YV9A 2H71A 2IFQB 2I3YA 1PX7A 3BCKA 4K2DA 2LNSA 3NIVA 1O7UA 4TR4A 4BWSA 2N5BA 4V2MA 3UL3A 4LA1A 3GKMA 2ES7A 3VK9A 3DVWA 1SD8A 3LXZA 6GSWA 3NOFA 5ABRA 1F3BA 4YAPA 1FVJA 2H01A 4L5LA 4BVYA 5ID2B 3HVXA 2QC7A 5CREA 3KH9A 1B9YC 3VPTA 1XOAA 3IK9A 2DBCA 2PWJA 3I43A 1OKTA 3KEBA 2YCDA 3BOAA 1WOUA 3GHAA 1S3CA 5EY6A 4NWYA 1TK0B 4WF5A 3L0HA 2HSHA 5DDLA 4WKWA 4G2EA 4NXIA 3UVTA 3H1NA 4MJEA 2V6KA 4Z7XA 4ZB6A 4OO4A 5AISA 2X99A 5B6NA 2HZEA 4ISDA 1GTBA 3CSHA 3HHVA 2WS2A 6GSYA 5HQPA 1M2DA 3GTUB 1AAZA 1SKRB 3MAKA 3FZAA 2IWTA 1XWAA 2VOCA 3HDCA 4E8HA 1YKAA 2PMTA 1ZZYA 2G0FA 1GULA 5CRDA 3EWLA 1TU7A 4LMVA 2OBIA 2PGTA 3PR8A 1Z6NA 1K0CA 5JCWA 4ZBDA 5ECPB 1ZGNA 3ZMLA 3DXBA 1F37A 4I8BA 4OO5A 2GSRA 2B5XA 2PU9C 3P90A 4PNFA 4ULXA 3H8QA 4GLTA 2ON5A 1KEBA 5EL8A 3Q18A 3SWLA 1MTCA 3IRAA 4MZWA 4POLA 4LLRA 2V6OA 3VI7A 4TXOA 2X8CA 1TXXA 4DSQA 3FZ9A 6GSUA 4K7IA 2OJLA 3EC3A 4MJBA 1JLVA 1O81A 2D2ZA 3I6AA 3KZQA 3KD0A 1NSWA 2HRNA 3L9UA 2XPEA 2MMOA 2MMZA 3ZIJA 4K0GA 1PMTA 2TIRA 2BTOT 1B4PA 4ECBA 1JZRA 4YAVA 2AYTA 1F2EA 3C73A 1H75A 6GSXA 1XWBA 3LWAA 4OFTA 5F8BA 1LJRA 5DALB 4FYCA 2YOIA 2HXKA 3FZ5A 3TOTA 2CV4A 3UBLA 1ZL9A 2R3XA 4MZCA 2JACA 4EC0A 1KNGA 2G2QA 1C72A 3LXTA 5FT3A 5HFGA 3HXSA 1X9WB 1TK5B 3GFKA 2L6DA 1HNCA 2WRTA 1X9MB 4ZXGA 3O6TA 4FYBA 5F05A 1ML6A 1F9MA 2OACA 3LGCA 2JSZA 5HR3A 3NZNA 2HZFA 5AIVA 1R5PA 2CAIA 1AQVA 4F0CA 2O87A 2C0DA 5H5QA 2AUVA 4XIHA 1BEDA 3VLNA 18GSA 3O3TA 2VL9A 4NHWA 5JWOB 3WGXA 2MBSA 3HYPA 2ZNMA 3GKNA 3FW2A 22GSA 4V2LA 4EDYA 4P3YB 3R2QA 4IELA 1EGRA 3IPZA 1BYEA 7GSSA 1TJDA 1Y6EA 4N10A 1OC9B 2H72A 2CVDA 4RI7A 1V57A 5G1LA 4Q5NA 2IFQA 2PPTA 2K8SA 4TVEA 2WFCA 2CZ3A 1E2YA 1FG4A 12GSA 2YJHA 4K8MA 1GNWA 2QGVA 5DQSA 2O8VB 3IOSA 4OCEA 3W8JA 2ZUPA 3HD5A 2GT6A 5DVBA 1EOHA 2H1AA 3D22A 2H74A 4OMVA 3L9VA 1ZMAA 3TKRA 3GH6A 2L59A 5IO0A 5ID2A 3L4NA 4MPGA 2TRXA 4J2FA 1KBNA 1GSUA 4KGIA 2EIOA 5HR2A 3LYKA 3FHKA 1FB0A 5JWRB 2OADA 3M9JA 2C4JA 4X43A 2GS3A 2R4VA 3KGKA 4G19A 1SENA 4MJCA 1BAYA 1SK1A 5E59A 1AC1A 3IAM2 5ECRB 1YKCA 3KMOA 2DIZA 5IPGA 2YANA 3WT2A 3GTUA 1VGLA 4HS1A 2LJAA 2C3NA 5ELAA 3VWUA 1BJXA 4JBBA 3QD9A 2H6YA 2E7PA 5JCGA 2CT6A 4TOPA 1DE1A 2PBJA 2YWOA 1EZKA 4BVXA 1M2AA 4XHMA 1A2LA 2RM6A 1S3DA 2O85A 3BBYA 2JU5A 1K0OA 4N30A 8GSSA 3UARA 5GAPD 1UA5A 2FD3A 1HYUA 3TJFA 2GQLA 2H70A 3QDNA 2LJRA 2J9HA 2YNXA 5IM9A 2C3TA 2YP6A 3IK7A 1GRXA 4TXVA 2H73A 5J9BA 1OVNA 1WMJA 1TDIA 3KH7A 1V2AA 3TOUA 4BWQA 5IMVA 3RHBA 4F0BA 2DJ1A 1R5AA 1A0FA 2CX3A 3CTFA 2OE0A 4WEYA 3ZFLA 3UOMA 1DSBA 4YQUA 4IW9A 1ERUA 2JSYA 4KSOA 2B7KA 4BA7A 5A5KA 2YWIA 1EOGA 4X1UA 2FUG2 1XZOA 3FY7A 3HVVA 1DBYA 3M9KA 1J08A 1JFUA 4HOJA 3TKPA 4L0WA 4KE3A 5DALA 1PRXA 1YY7A 1JHBA 1UN2A 4OFMA 4ZILA 16GSA 4XRAA 1OC8A 3TJJA 3IDVA 3UMAA 2DMMA 4EO3A 1NW2A 2C1YA 4OD7A 3VPQA 2RUFA 4WETA 1K0DA 4NV2A 3PINA 2MYGA 2B5EA 3KTBA 3ZRDA 5KN3A 1ERTA 5CRHA 3HVSA 1AQWA 2GT5A 4AGSA 3GRXA 5B7CA 1U3IA 2F8AA 3UVHA 2DJ0A 4KCEA 4PUFC 2R6KA 3DMLA 1XIYA 5J5NA 4NAXA 3GNJA 1TRWA 3ZYWA 1M9BA 11GSA 1X9SB 2JL4A 1WP0A 5COHA 2TRCP 2YV7A 4TR0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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