3LGCA

Crystal structure of glutaredoxin 1 from francisella tularensis
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
89
structure length
89
Chain Sequence
SNAMKVKIYTRNGCPYCVWAKQWFEENNIAFDETIIDDYAQRSKFYDEMNQSGKVIFPISTVPQIFIDDEHIGGFTELKANADKILNKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Glutaredoxin 1 from Francisella tularensis
rcsb
molecule keywords Glutaredoxin 1
molecule tags Unknown function
source organism Francisella tularensis subsp. tularensis
total genus 24
structure length 89
sequence length 89
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3lgcA00
4Q5FA 2WB9A 1YF1A 2C0DA 4E8HA 4X43A 2NTOA 2V41A 3ZIJA 4YQMA 2VO4A 4HUAA 4EXJA 2IMFA 3EWLA 3A2VA 3UJ1A 4WKWA 1QMVA 2F8FA 4F0CA 4N30A 1K0NA 2JL4A 2LKUA 5F06A 4TRXA 4ECJA 2PVQA 3FEUA 5J41A 2L4CA 4NMUA 2GSRA 2CX3A 3EINA 1YY7A 4PNFA 4V2NA 3F4TA 1MD4A 2H1GA 1BJXA 1EWXA 3GMFA 2HNLA 2REMA 4CDOA 1TU7A 3TOTA 4XRAA 1GSSA 4HU7A 5D73A 3KTBA 1SYXA 1W4VA 2Z9SA 4P3YB 3ZVJD 5H5QA 2LRNA 2MBSA 1SD9A 3DWVA 3LYKA 2C0EA 2JSZA 1Q98A 3MNGA 3ZL5A 4MH3A 2V1MA 4ID0A 3NIVA 2YPMA 1TXXA 1K0OA 1OVNA 3I43A 1WJKA 3WGDA 2ZUPA 3KM6A 4BPYA 4WBRD 4PURA 2B5YA 2OADA 3GKXA 5AIVA 1QK8A 1PL1A 2CVBA 3C73A 1O8WA 2C80A 1TI3A 1ZOFA 1UVZA 3TGZA 2VL2C 3G9BA 4ML6A 3ZREA 1M2BA 2IFQB 1VRSD 1GSEA 4AJ6A 5DQSA 1YEXA 1XOAA 5C00A 1GTIA 2YOIA 2FUG2 1B8XA 3ZYWA 1J08A 2MBTA 2H71A 3F4RA 2DMMA 3KCMA 5IMZA 1OKDA 3CXGA 5ECPB 2VL9A 3TKQA 1TW9A 1Z9HA 3QR6A 2H6XA 4WETA 4IS0A 3VWUA 1R7HA 1YJ6A 4ISDA 5EVOA 5ABRA 4DVCA 1IYIA 3DGQA 3PINA 4LL1B 2VD1A 5IPGA 4FH8A 1JLVA 1OC9B 5CYYA 2ALBA 1ZZYA 4WEYA 2A2SA 4ACSA 4HEA2 3HA9A 3FR3A 3WT2A 2MYGA 4V2MA 2F9SA 3FR6A 1SK2A 1G6WA 1MD3A 3F63A 2A2RA 4TW5A 3HVXA 1V9WA 5INYA 1NW2A 1LJRA 4TN8A 3DD3A 4XS4A 3PGTA 4L5LA 3ZITA 1OE7A 2VCWA 1K0BA 1Z6MA 2X8CA 4TR4A 4BA7A 3NZNA 3N5OA 1ZL9A 5DCGA 1DE1A 2LNSA 2GZYA 4KW6A 5A4WA 1U6TA 3CYNA 4MDCA 3MDKA 3I69A 3LORA 1A8YA 2DJKA 3A2XA 1WRYA 1O73A 4QL9A 3QCPA 2L59A 2CVKA 4XRDA 4OCFA 1HD2A 3RBTA 2DJ2A 1EV9A 3H1NA 1SJIA 3HDCA 4I97A 5ECSA 1HNBA 3UVTA 5ECIB 3WYWA 2GSQA 2KP1A 1XVQA 2V6KA 5EL8A 2CZ2A 2GZPA 4OCEA 2L57A 5JCWA 2H1DA 2K8SA 1TRUA 2PWJA 2TIRA 4G10A 5H5RA 2WRTA 3QAVA 2V2GA 3CSHA 2EC4A 2B7KA 5ECNB 4N11A 1TRVA 3Q74A 5G5FA 5AN1A 3L9VA 2ES7A 4K1FA 1GSYA 2EIOA 3L9UA 4AJ8A 3TRPA 4N0ZA 2GSTA 2VCTA 2VCZA 5AIXA 3GKNA 4EL1A 3FY7A 4X1UA 4FIWA 2OJLA 2L4QA 4JBBA 5KN2A 3GYKA 4KDUA 1NM3A 3KXOA 3QAGA 3FYGA 1QQ2A 4TKYA 2R5GA 5DALA 5ECMB 4V1Ap 4V1Ag 3FZ4A 1O7UA 2JSYA 5JCGA 1YZXA 1GUKA 12GSA 3IBHA 3VWVA 5HR3A 5IMAA 4PX1A 3I9V2 3QDNA 2V32A 1N8JA 3GX0A 1EOHA 1ERVA 2JZRA 2FWEA 2X64A 1FOVA 5KN1A 1EEMA 3TDGA 3LWAA 4O92A 4PNGA 3ME7A 5FWGA 4N0VA 2DSAA 4DSSA 1SKWB 5IIZA 2MMOA 1GWCA 2RM5A 3EC3A 1B48A 4PQ1A 2O8VB 1AW9A 4TVEA 2GZZA 3FZAA 4IW9A 2H30A 1GLPA 1ZYQB 4TXVA 2HSHA 2E0QA 1N2AA 2OACA 1NHYA 2HXKA 2JADA 3J7Yb 2F8AA 1ILOA 1A8LA 4JE1A 4EO3A 1G6YA 2PPTA 4XS4B 4L5OA 1QFNA 2HFDA 2YCDA 4OMVA 1J0FA 4GWRA 1XPVA 2BTOT 3LG6A 3G7IA 2VM2A 1BEDA 2OKAA 2HRNA 3GSTA 4MF6A 4XCSA 1THOA 2HRFA 9GSSA 5IOXA 2JU5A 1OAZA 4AGSA 1S3AA 3ZIVA 2C3TA 1AXDA 2YJHA 1TDIA 1W89A 2XHFA 1FW1A 4HU9A 2H0HA 1PL2A 3S9FA 1E6BA 1OYJA 1ON4A 1M2DA 3M9JA 4CW9A 2V6OA 2JZTA 1XW9A 2HE3A 1LBKA 1V2AA 4K7IA 3GN3A 3DMLA 2GQKA 1WWJA 3U5RE 2H76A 2KP2A 3MAKA 3LEFA 1PA3A 1QGVA 2VCVA 3VPQA 3TJKA 1K0AA 4IJ3A 1UN2A 3UBLA 5FT3A 1A2LA 1CQHA 3HJMA 1A0RP 2H0IA 4K7NA 2RUFA 2H01A 3A5WA 3L4NA 4PQIA 5JWQB 3P7XA 3QMXA 4BWSA 3HVVA 3ME8A 5AISA 2AYTA 2GTUA 4POBA 5DALB 2C0FA 1MDKA 2R37A 3C71A 2R4VA 3LFLA 1ACVA 1TK0B 2YV9A 3KP9A 3TJGA 2FA4A 4ECIA 3DKSA 3FHKA 3GURA 3BCKA 2YWMA 1K3YA 1MDIA 3KJYA 4JEDA 3UOMA 3O76A 1PD21 4K0GA 1WOUA 2HLSA 3LJRA 2L5LA 2H1AA 1K0CA 1Z7PA 1TKDB 5LCZA 5F8BA 3VI5A 6GSUA 2H73A 3ED3A 6GSTA 5JWRB 5D9XA 4K2DA 4O7HA 2LS5A 1SKRB 4XHMA 16GSA 2FWHA 4F03A 2VM1A 3UARA 3KMOA 3ZMLA 4DSSB 6GSXA 3GIXA 3VWWA 3IAM2 2RLIA 4OO4A 3ERGA 4MABA 3KP8A 2CAIA 4JRRA 3W8JA 4EE0A 5DCHA 3IDVA 3F6DA 5IMCA 4GCIA 1DSBA 3GTUA 1M9BA 2CV4A 2OE1A 1GSDA 4PXOA 1U3AA 3GH6A 3HXSA 3QFAC 1PQNA 2FCHA 2QGVA 1GNWA 2PN8A 2WULA 2WGRA 3GX8A 2P5QA 2NDOA 4IKHA 3FRCA 4GXZA 2GS3A 1OE8A 4BWQA 5ELAA 2FLSA 3H93A 3RHBA 3ZLPA 1ZYEA 2CX4A 3KD0A 5EPFA 1FO5A 1DBYA 2K9FA 2E2MA 1FB6A 1T00A 3GL3A 1JZRA 1GTBA 2XC2A 3GRXA 3LXTA 4ZB9A 3M3MA 1FAAA 3TJBA 3OR5A 1PX7A 2B7JA 4GSTA 1A2MA 1XWAA 1JLWA 4HZ2A 2F3MA 3M8NA 3GKKA 1Q4JA 8GSSA 5DJLA 4H86A 4IP6A 2H8LA 2X99A 3VPTA 3RHCA 3QFBC 1ERTA 1GUHA 1G0TA 2RM6A 5HR1A 1SL1B 3ZFLA 4PUFC 5CNWA 1MDJA 2OA7A 5COHA 1KNGA 4BVYA 2WDUA 2VLVA 4YQUA 2CZ3A 2L5OA 5ECLB 4EF0A 2G2QA 4WF4A 2O89A 2VCQA 4GLTA 3D0ZA 4KE3A 4HOJA 3F3RA 4LL4B 3CRUA 1R5PA 3HZ4A 1ST9A 2IMKA 2GQLA 1WIKA 5J3RA 3CMIA 4OWYA 4AJ7A 1SK0A 2C3QA 3G7YA 3A2WA 5ID2A 2BMXA 1XWGA 2YNXA 3Q6OA 3KH7A 1R26A 3ISOA 2J23A 3UVHA 2GVPA 1XWKA 4HS1A 2J9HA 2P5RA 2EIQA 4LLRA 2VLTA 1TRSA 4XIHA 1X9SB 2FWFA 4F0BA 2MMZA 4G19A 4ECCA 2IMDA 4GTUA 2VUPA 5LNKe 1BX9A 3BD2A 3CSIA 3GFKA 3GL5A 2RUEA 4ZBBA 1TJDA 4YAPA 1XFLA 4WBJA 5G1KA 18GSA 2XPEA 1HQOA 1WMJA 3IK7A 4ZB6A 4EDYA 4WR4A 4WF5A 3O3TA 4IJIA 2ON7A 5DQYA 1Z7RA 3DVWA 17GSA 3VK9A 2YJ7A 5A4VA 3IXRA 4L0WA 3IHQA 1O8XA 1LU4A 3EVIA 3H79A 2VAFA 5HR0A 2VL3A 3W6GA 1YKAA 2R3XA 2GGTA 4KDYA 4DEJA 3US3A 3E9JB 3WT1A 3GTUB 3Q18A 5CREA 3LQ7A 2LNTA 1XCCA 11GSA 2FA8A 4MZWA 3DYRA 1S3DA 5GAND 2LQOA 2H19A 4IELA 2DLXA 1I5GA 3KGKA 1QUWA 1VF4A 2LJKA 1XBSA 2YZHA 1GSQA 1GUMA 3TRQA 1WP0A 1R5AA 2E7PA 3D5JA 2KHPA 3K8NA 2XBIA 1I9DA 1R4WA 2NBSA 3FK8A 4ZIJA 3RPNA 3D6IA 1GTAA 1SKSB 2HYXA 2CAQA 3C8EA 4EKZA 3N9JA 1X0RA 3UMAA 6GSVA 1GL8A 1AQWA 4Q5QA 4EDZA 4BVXA 4RI6A 1U87A 1B9XC 4OFNA 1XOBA 3ZFBA 3R2QA 3IPZA 5D93A 1B9YC 2WZ9A 3FW2A 3VLNA 3BBYA 4EUYA 1F9MA 2O85A 1ERWA 2YN1A 4LMVA 3ZTLA 3IAS2 5ECOB 4ZILA 4J2FA 1RW1A 4KNDA 1B4QA 3CSJA 4ZBDA 1YKCA 2H0GA 3V1WA 4IBPA 3QAWA 3GSSA 4HJ2A 2FWGA 1XVWA 1KBNA 4EC0A 3G7JA 3QOUA 1EP8A 4OFMA 2RIIA 2FGXA 3JCML 5ID2B 3TB2A 5EY6A 2CVDA 3IK9A 4I2UA 2QSIA 1SK1A 5GSSA 1AAZA 3DRNA 2PERA 4TR3A 2AAWA 4KCEA 1H4OA 1MTCA 1VF3A 1YF0A 3C1SA 3EYTA 1T8EB 1DE2A 4AF2A 4O32A 2ZCTA 4IHUA 1X9MB 4NHWA 2XBQA 5ENUA 4MP4A 2FNOA 4FYUA 20GSA 2MZCA 4MJCA 1JFUA 1GNEA 1URMA 5B7CA 1Z3EA 3HD5A 2LRCA 4IQ1A 3GA4A 4O5RA 5G1LA 3KEBA 1C72A 2X8GA 5C04A 4K9ZA 5D9WA 1GSUA 5ECHB 1SU9A 1HNAA 1XZOA 3GKMA 1BYEA 4D73A 1HNCA 1JHBA 2LQQA 2GQMA 2I9HA 3IRAA 2DJ3A 3TKSE 1TOFA 3VFIA 2IN3A 2M72A 3GHAA 3EMPA 2IMEA 4I2TA 2LV3A 3UAPA 3F0IA 2E2GA 5HFIA 4IQAA 3C7MA 2IIYA 4IVFA 5AGYA 1ZGNA 3PR8A 5B8BA 5JWOB 5CO3A 1PX6A 2OBIA 3KMNA 4HI7A 2DJJA 3WGXA 1PMTA 2HI7A 2IPAA 4OO5A 4K6XA 5CRWA 3EURA 4RI7A 1VF2A 2D2ZA 2P31A 2WFCA 2AJQB 1BAYA 5E59A 4KX4A 5D9VA 1ABAA 3P2AA 5B6MA 4L0UA 2IMIA 3CBUA 4POKA 3BOAA 4FO5A 3TKRA 1AQVA 2KUCA 1GRXA 1FG4A 2H75A 3SWLA 1MEKA 4KGIA 2G0FA 3BCIA 1EP7A 1GSFA 5IPHA 3P90A 3J7Yk 3TKSC 1XIYA 5IQYA 5J4UA 1X5EA 1USBA 3D22A 3UL3A 1K0DA 3HKRA 2PUKC 3GNJA 5CRHA 2YWOA 2C3NA 1SYRA 4PUAA 5ELGA 3IC4A 1OC9A 4TOPA 2ZNMA 3DEXA 4G9HA 1IYHA 4HJMA 5KN3A 3A3TA 1BQ7A 2C1YA 4N10A 1Y25A 1CQGA 3QPMA 4WR5A 2DJ0A 3LGCA 4IN0A 4GQFA 4I6XA 4ZXGA 1K0MA 4MF7A 5J9CA 1T4ZA 3IE3A 3BJ5A 2VIMA 5D96A 1F6MC 1H75A 3M1GA 1U88A 2L6CA 2O87A 2H1BA 4GQCA 13GSA 2GT6A 2LTKA 1Z6NA 4JU5A 1JZWA 2YZUA 1NHOA 3FR9A 2X8HA 3H8QA 3VWXA 3APOA 1TRWA 5G31A 2KLXA 4MMMA 4ULXA 4ZL8A 2GSSA 4CHSA 1M9AA 2H66A 4F9ZA 3UBKA 1X5DA 4JR4A 1NSWA 2HSYA 2HT9A 2I4AA 1V58A 2VD0A 3CRTA 1A2JA 2A4VA 2TRCP 1OKTA 3DIEA 4K7OA 4MF5A 2OE3A 3E0UA 22GSA 4POMA 3EMXA 4WXTA 5B6NA 2YWNA 2LJRA 3KTLA 2BJXA 3APSA 3EU3A 1FHEA 1PKZA 1SJ6A 3TJFA 10GSA 1B4PA 2M80A 2CA8A 4NXIA 3WD6A 5D8IA 4D73B 1EGRA 2DBCA 1ML6A 4I8BA 5J9BA 2B5XA 3L0HA 4Q5RA 2QC7A 5DBQA 5ECRB 2LSTA 3VI7A 1FVJA 1YDKA 2YWIA 3CTFA 4TXOA 1O81A 1ERUA 3HZ8A 4KDXA 2IJYA 3C1RA 2FY6A 4YQVA 1JZDA 3HCZA 3TRXA 4E8EA 4IGJA 4HDEA 2C4JA 2OBKA 4J57E 1BG5A 1EGOA 1KTEA 4KCAA 3E3EA 3HY2A 3ZRDA 4F2IA 2C0GA 1YEPA 2YANA 1A0FA 2TRXA 4HQSA 3IA1A 2B1LA 1V98A 3KIJA 2NPBA 2WCIA 2F51A 1K3OA 1WE0A 4QQ7A 3TKSA 5HFKA 1F37A 4Q5NA 4KSOA 6GSYA 4G2EA 2FD3A 3Q19A 5E4WA 5HQPA 1AUCA 3ZZXA 5GSTA 4HQZA 5DAKA 4ZL7A 4OD7A 3MSZA 1A23A 2KOKA 3IOSA 4RQRA 14GSA 4MLYA 4K8MA 5G5EA 3PH9A 2NVLA 5J5NA 5IMFA 3FZ5A 3GUSA 3LXZA 4POLA 1EZKA 1V57A 2L6DA 2VOCA 7GSSA 3DVXA 4TR1A 4TR0A 3NOFA 1KEBA 4J56E 2AUVA 2CQ9A 1T3BA 1TP9A 3M0FA 4ZB8A 5CRGA 2IL3A 5G30A 1F2EA 2I3YA 4OFTA 2FHEA 1TI1A 1PN9A 3QD9A 1XW6A 6GSWA 3TCOA 4GRFA 5CRDA 5L71A 2M46A 1SENA 2B5EA 1OC3A 1T4YA 2HZEA 4ZL9A 2K6VA 3F4SA 2LUSA 1E2YA 1ZMAA 1T1VA 5ECQB 3RPPA 4YAVA 2H72A 1S3CA 4KA0A 1FVKA 1Z5YE 1GH2A 4GF0A 5F0GA 5CP1A 3FZ9A 1PRXA 1UA5A 3TJJA 1M7TA 1SL2B 3ZVJA 1YQ1A 4ECBA 2YP6A 4EVMA 3MWHA 3HJPA 1ZCPA 2N5AA 1JZOA 4V2LA 2WJUA 1VGLA 2H6ZA 4GSSA 4KH7A 3F6FA 1AIUA 4TXOB 2DC5A 2LRTA 2VL2A 1F3AA 5CAXA 4NWYA 1FB0A 3CTGA 4PGTA 1XW5A 3GV1A 4XS6A 2B3SA 4F82A 1PGTA 2EIRA 6GSSA 19GSA 1THXA 4FYCA 4KSMA 4ML1A 3M9KA 1XXUA 1X9WB 2K18A 2B1KA 2YV7A 3HJOA 1PSQA 2ON5A 1K3LA 2OE0A 4I5QA 1SL0B 2HZFA 2O7KA 1O85A 1AC1A 2JACA 2WS2A 1TTZA 1XWBA 2DMLA 2I1UA 4KB3A 1AQXA 1VF1A 1T7PB 2K8VA 4MPGA 2P0GA 3ERFA 3W8SA 3D4TA 3LSZA 3LYPA 5KEJA 3HVSA 3KH9A 2PBJA 3TOUA 4MJAA 1HYUA 3D21A 2PU9C 2DIYA 2LJAA 2CT6A 1XWCA 5IO0A 2H6YA 1PKWA 2PGTA 1GTUA 4XTSA 5DAKB 3I6AA 1TK8B 1M2AA 1DUGA 1M0UA 5G2ZA 5LD0A 5ECKB 1O6JA 2MMAA 3HHVA 3RDWA 4RUVA 4HZ4A 1X5CA 4KAEA 3HYPA 3KZQA 4RQXA 3F9UA 3P8WA 2H70A 1G7EA 3FKFA 4NHZA 2DIZA 2R6KA 4TR1B 1UC7A 3U6VA 3ZMKA 4MJBA 3AY8A 3TKPA 5IO2A 4LA1A 4LMWA 2PMTA 2AB6A 5D9TA 2I81A 4ZBAA 5DJMA 1EV4A 4L8EA 3O6TA 4NPBA 1GLQA 5IMDA 1EEJA 2JZSA 1M99A 2N5FA 3SBCA 1EOGA 1V40A 4MJEA 2B6MA 1A24A 2PVOC 3EU4A 4GSNA 4ILFA 1Y6EA 5IMVA 3DXBA 1SJZA 3L9SA 5HFGA 3D4MA 5A5KA 5F05A 2GLRA 4NAXA 3F8UA 4KUNA 3F3QA 5IOWA 4PQHA 2AV4A 2IFQA 4BL7A 3TUEA 4NV2A 4MZBA 4QL7A 4JZQA 4MCUA 3RAZA 2HZEB 5HR2A 1U3IA 4YH2A 1SD8A 2QKEA 2XPDA 4IP1A 2N5BA 1GP1A 3L78A 2C8UA 2DJ1A 5F07A 1F3BA 2AHEA 2GT5A 1GULA 3IV4A 2LEGA 2VCXA 1G7OA 4JR6A 5DDLA 1OC8A 1RK4A 4NV5A 3WGEA 1TK5B 2VLUA 4MZCA 2GDRA 3UIWA 1WPIA 4DSQA 5JCUA 4MA9A 2MMNA 3ERWA 4FYBA 5H5SA 3VURA 3H4KA 4MK3A 4X0XA 5DVBA 4MH2A 5FHIA 5IM9A 3GH9A 3UEMA 4MPFA 4Z7XA 1RQMA 2R2JA 1QXHA 4K0NA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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