3LGCA

Crystal structure of glutaredoxin 1 from francisella tularensis
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
89
structure length
89
Chain Sequence
SNAMKVKIYTRNGCPYCVWAKQWFEENNIAFDETIIDDYAQRSKFYDEMNQSGKVIFPISTVPQIFIDDEHIGGFTELKANADKILNKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal Structure of Glutaredoxin 1 from Francisella tularensis
rcsb
molecule keywords Glutaredoxin 1
molecule tags Unknown function
source organism Francisella tularensis subsp. tularensis
total genus 24
structure length 89
sequence length 89
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3lgcA00
3KMNA 3ZYWA 4PUAA 3D22A 2B1LA 1JZOA 4ZB8A 1TRVA 5A5KA 5JCUA 2LRTA 1TK0B 1K0MA 2TRXA 1VF4A 4IJ3A 4MPFA 2GZZA 3BD2A 3GKNA 4DSRA 3F6DA 1XWGA 1ILOA 5L71A 5FHIA 4TKYA 3UVHA 2V1MA 2TRCP 1YEPA 4EO3A 3HJMA 4L0UA 3U6VA 1X9WB 1EEJA 3HD5A 3ERWA 2PGTA 5DQSA 1YY7A 2NPBA 2L6CA 5JWQB 2IMDA 4PNGA 1S3AA 3KP8A 4MF7A 4KDUA 1GSUA 3RBTA 3UOMA 2WB9A 4RI6A 4F82A 2V6KA 3UBLA 5ECRB 5IMVA 5IO0A 4FH8A 2C8UA 3V1WA 4G2EA 2CAQA 3H8QA 2G0FA 5CP1A 1XXUA 4WXTA 4MJCA 2CT6A 2IWTA 4GCIA 1Y25A 1MDKA 4O5RA 1QXHA 3EYTA 1W4VA 2AUVA 3U5RE 2H76A 3L78A 3TB2A 4GWRA 3EC3A 20GSA 1R7HA 2A2RA 2LNTA 5G5FA 3GV1A 3P2AA 3ZMLA 2JZSA 3A3TA 1Q4JA 2VCZA 2I3YA 1G6YA 3F0IA 2YP6A 3PGTA 2IFQB 3CRTA 1OE7A 2YCDA 3IHQA 2NBSA 3F4TA 4IS0A 2GSQA 1MEKA 1A0FA 2EC4A 1XOBA 4YH2A 1TKDB 2A4VA 2CVDA 1HNAA 1GLPA 2HRFA 4V2NA 2ZUPA 1NM3A 5F07A 3QCPA 4GXZA 2C0EA 2PVOC 3GSTA 4GTUA 5GAND 3VWVA 3H1NA 2HE3A 4NWYA 2DJ2A 3J7Yk 3F6FA 3D4MA 2RUFA 3KTLA 2H0IA 1NHOA 4Z7XA 4F0CA 2FWHA 2FWGA 4BL7A 5G1LA 2BMXA 5ENUA 1TXXA 1USBA 4MDCA 4N11A 3O6TA 1PSQA 1XVQA 2FGXA 6GSVA 1G7EA 5G31A 5JCWA 3DGQA 4I2TA 2HLSA 2L59A 3MSZA 1OE8A 3HZ8A 5IQYA 2HZFA 2XPEA 3UBKA 1W89A 1WPIA 4OMVA 5IMAA 4V2LA 1G7OA 1SJIA 1SJ6A 4EC0A 1EV9A 2CAIA 5D9VA 3W8SA 4L5LA 3HY2A 1ZL9A 3RPPA 3IE3A 2FWEA 5D73A 1CQHA 4GSSA 2VM2A 1V40A 1TU8A 5HQPA 1PX6A 3H4KA 2IIYA 3LYKA 1UC7A 3LORA 3BJ5A 5ECNB 3KD0A 5KN2A 1SYRA 4JR4A 1GTIA 2GZPA 1N2AA 4JU5A 4X1UA 4DSQA 1A0RP 2JSZA 4CHSA 1XZOA 4TW5A 2K6VA 2JU5A 4FYBA 2WZ9A 3DWVA 1GP1A 2PN8A 1EGRA 2LSTA 1QGVA 2X8CA 2VOCA 2AYTA 4K6XA 2KP1A 4ACSA 1SL2B 5IPHA 3VPTA 2EIRA 3HZ4A 1JLVA 4BWQA 4NPBA 2GDRA 2I9HA 2H70A 2HYXA 4TOPA 4LMWA 2P0GA 4H86A 1OC8A 4IN0A 1TRWA 1XPVA 3CSIA 2LNSA 1OYJA 3QPMA 3CMIA 2VLVA 5FWGA 1M9AA 4MK3A 3TDGA 2WJUA 3UMAA 4O32A 3UIWA 1A23A 3F4SA 1T00A 3UEMA 2KLXA 1AQXA 2J9HA 2LQQA 2RM5A 3ZREA 2AV4A 18GSA 2HZEB 3L4NA 1GUKA 2H8LA 5HR0A 1EOGA 3LQ7A 3G7YA 4JE1A 1XWBA 4ECJA 2IN3A 2OBIA 1ACVA 1A2MA 3FEUA 4QQ7A 1ERUA 3EMPA 4POKA 1DSBA 5DBQA 2MBSA 3EVIA 3IA1A 4KA0A 4MZCA 2IFQA 2GGTA 1O6JA 4XS4B 2ZNMA 4XCSA 3A2XA 4WBJA 5CREA 2EIOA 2DBCA 3K8NA 4IELA 5B7CA 3NOFA 1OC3A 3GMFA 2H74A 1WWJA 5IOXA 3LYPA 3ZLPA 4E8EA 2O7KA 5DJLA 3F3RA 3GA4A 1M2BA 1OKDA 2QGVA 3C1RA 2FHEA 3D0ZA 1ZGNA 4K0GA 1T4YA 2GTUA 3APOA 1FB0A 1K3LA 12GSA 3LG6A 5J4UA 4BVXA 1F2EA 3G7JA 1O85A 2H01A 3D21A 3VFIA 3ZVJA 4NV2A 4MP4A 5GZZB 1AUCA 1SD8A 3KH9A 1ERVA 1MDIA 3HCZA 3QAVA 5H5RA 2YANA 2PMTA 4MJBA 2IMFA 2VAFA 2CVKA 4GF0A 3ZIVA 1X0RA 2YV9A 5F06A 5AIXA 3HA9A 3KXOA 1X9MB 1WOUA 1SK2A 2TIRA 2VUPA 3TKRA 5IO2A 4XTSA 3GKMA 4YQUA 3IC4A 2CA8A 4ML1A 1FG4A 1TOFA 2MMOA 2GLRA 5A4WA 4RI7A 3QAGA 2GSRA 3ZRDA 1GL8A 2C3NA 1V57A 2CV4A 1DE2A 1QUWA 1ABAA 4MJEA 1PN9A 1BX9A 2F3MA 2BJXA 2YV7A 3O76A 1SD9A 5C00A 1TW9A 4J57E 4N0ZA 4N10A 1GLQA 4MABA 1XWAA 3QR6A 1XCCA 4HQZA 1PRXA 2C0GA 4D73B 5IMZA 1YJ6A 5IPGA 3F63A 4EVMA 1SU9A 2C80A 4WKWA 3A5WA 1GSSA 3FR9A 1K0BA 2FA4A 3FHKA 4KB3A 5LNKe 2PWJA 2JL4A 4ULXA 1J9BA 2C1YA 4K2DA 1U88A 3OR5A 3W6GA 1VF3A 4KSMA 4L0WA 5A4VA 1EV4A 2MBTA 4RQRA 2YWMA 2VL3A 5FT3A 4K7OA 1QQ2A 2P31A 1PGTA 3KIJA 1NSWA 2QC7A 1G6WA 3WT2A 2DJ1A 4NV5A 3FZ4A 3I9V2 1U3AA 5CRGA 2IMEA 5DJMA 2HZEA 2L4CA 3GIXA 1YKAA 2AHEA 4PURA 2NTOA 4V1Ag 2IJYA 2JSYA 1E2YA 10GSA 1Z6MA 3CYNA 2GZYA 4EDYA 2DSAA 1PKWA 3FK8A 2B6MA 4ZBAA 2HSHA 3N5OA 2LTKA 4HJMA 2LEGA 3DXBA 3LGCA 2NDOA 3GUSA 2M46A 2REMA 2YNXA 1YEXA 3DEXA 2Z9SA 2YWNA 1ML6A 4RUVA 2LJRA 4XS4A 4WF4A 2WFCA 2E2GA 2HFDA 3KZQA 4YQMA 4HOJA 3GKXA 2G2QA 5GSTA 8GSSA 4AJ6A 1B9XC 2OKAA 3TKQA 2GVPA 2H1DA 3ME8A 4TR0A 3QOUA 1SL1B 1XIYA 4AJ7A 1B8XA 4ZILA 2E0QA 2K18A 2HT9A 2O85A 4ILFA 3US3A 4PNFA 1EEMA 4OO4A 1KBNA 1KNGA 4KDXA 2NVLA 3H93A 2CX3A 1TRUA 3ZZXA 5HR1A 5HR3A 2M72A 1YKCA 1JFUA 1WRYA 1IYIA 2R6KA 1ZMAA 3HJPA 3LFLA 4IKHA 1RK4A 4PXOA 1XFLA 3HKRA 4ISDA 3DIEA 1V98A 2DJ3A 2K9FA 2GT5A 3RHBA 2C3QA 2VCVA 1X5DA 2OE1A 1GWCA 1OC9A 2YZUA 3CXGA 5J41A 6GSUA 4MPGA 3HVSA 4HJ2A 1FO5A 2H75A 4JEDA 6GSXA 1EGOA 3LXTA 5ECOB 4HQSA 3TRXA 5J3RA 4TR1A 1SKSB 3D4TA 1A24A 3MNGA 1HYUA 5LCZA 4F9ZA 5KN3A 1N8JA 1QFNA 1TRSA 2GSTA 2H30A 2P5QA 1VRSD 2OACA 3KGKA 2I4AA 2PUKC 1TP9A 2B5EA 1GTAA 3RHCA 5EY6A 4LLRA 2VIMA 5JWRB 3GX0A 4NHWA 3VLNA 1FAAA 2LQOA 2FD3A 4EKZA 1KEBA 3I69A 3LSZA 4HZ4A 2X64A 2N5BA 3PH9A 5F0GA 3LXZA 1AQVA 5H5QA 4I5QA 3KH7A 5AGYA 1MDJA 2C0DA 3EMXA 1YF1A 1UVZA 4ZB6A 3QFBC 4PUFC 3ZTLA 1PL1A 3FYGA 2PU9C 1BJXA 2H71A 3IOSA 2QKEA 5DDLA 4KH7A 2MZCA 3KJYA 4XRDA 5F8BA 3TKSE 1GUMA 1WJKA 4D73A 2AB6A 2B7KA 2LUSA 2QSIA 4HU7A 3GRXA 3MDKA 5D9XA 2B7JA 1BQ7A 4WR5A 1GSEA 2LJAA 2DMLA 5B6NA 1FHEA 3C1SA 1O8WA 2VLTA 1J08A 1Z5YE 1K0NA 1GSFA 3TKSC 3F4RA 4EL1A 3GFKA 2YPMA 1H4OA 4OD7A 1AIUA 4MLYA 2B1KA 3W8JA 2VL9A 3F8UA 1BG5A 3Q74A 3LJRA 5ECHB 13GSA 2DIZA 3IK7A 3PINA 1WIKA 3R2QA 2VL2C 4IP1A 3N9JA 5KN0A 4ZBBA 3GN3A 1F3AA 2OBKA 2OJLA 3FZ9A 1GULA 2YWIA 2H1GA 4KSOA 1ON4A 1YF0A 4O92A 1F9MA 3M9JA 1VF2A 3M3MA 1ZYQB 1K0OA 3WYWA 2GQMA 5CAXA 1XBSA 2LS5A 3L9UA 4X0XA 3IAM2 4KCAA 3A2WA 3EWLA 4NAXA 4F2IA 1MD3A 3HYPA 5HFGA 2JADA 2EIQA 3WGDA 3VI7A 2XC2A 2KOKA 4ML6A 2PPTA 1WMJA 3CRUA 1SL0B 5G5EA 3JCML 1TI1A 1Q98A 3GH6A 2WGRA 2MMAA 4O7HA 4PQIA 3P8WA 5IMFA 1QMVA 2HXKA 2H66A 1T8EB 1HD2A 1C72A 1B48A 3AY8A 4DSSA 3DMLA 2WS2A 5G2ZA 5E4WA 2H6YA 4Q5FA 4PQ1A 4ECIA 2VO4A 2FA8A 4V1Ap 5ID2A 2L6DA 4OFTA 4IW9A 5EPFA 4V2MA 2FUG2 4I8BA 5ECLB 3TKSA 2I1UA 3GYKA 2OE3A 1R4WA 2VLUA 3KMOA 1Z3EA 3CTGA 5ABRA 1O81A 1X5CA 4X43A 1T4ZA 1TI3A 2L5LA 3QFAC 3D5JA 1GSDA 2OE0A 3TJBA 3P90A 4G10A 6GSWA 1V58A 5D96A 1T3BA 1AC1A 2VL2A 3H79A 1GRXA 1PA3A 4ID0A 1SJZA 5IM9A 5DQYA 1PMTA 1URMA 4WBRD 14GSA 3ZVJD 2ON7A 3D6IA 1OC9B 2V41A 1GSQA 3TGZA 1FVKA 3J7Yb 4L5OA 4IQ1A 4POBA 4AF2A 1HQOA 1EP7A 5GAPD 4AJ8A 2F51A 2ES7A 4TR1B 3IBHA 4LMVA 7GSSA 4YAPA 1JHBA 2JACA 3BOAA 2MMNA 4KX4A 4TRXA 1M2DA 3ZIJA 5AN1A 3TOTA 2YZHA 2WCIA 4QL9A 1RQMA 3DKSA 2RIIA 1O7UA 3SBCA 1EP8A 1OKTA 1M2AA 1PKZA 3ERGA 2HI7A 4OWYA 3VI5A 1WE0A 2L57A 4BA7A 3BCIA 4LA1A 2BTOT 4TR4A 1FOVA 1LBKA 3DVWA 2OA7A 3GURA 4K7IA 2R4VA 2LV3A 4TVEA 3CSHA 1O8XA 3LWAA 1YQ1A 4IJIA 1JZRA 5ECPB 3IAS2 4HDEA 2KP2A 4IVFA 4WR4A 1DE1A 3DYRA 2N5FA 1DBYA 5INYA 3FKFA 1ZZYA 1UA5A 4Q5RA 5ECIB 3APSA 4TXVA 4OO5A 2LRNA 1M99A 3ED3A 4NHZA 5IIZA 3L9VA 5CYYA 1U6TA 6GSTA 3CTFA 5ECQB 4ZXGA 2H73A 1F6MC 2B3SA 2R2JA 4JBBA 4TXOA 3GL5A 2JZRA 2H72A 2HNLA 3HJOA 1U3IA 4IBPA 5ECKB 3WD6A 5ECMB 3Q18A 4HU9A 5CO3A 5IOWA 4KDYA 5A4UA 4EUYA 2CQ9A 4POLA 5G1KA 5F05A 1O73A 3C71A 4N0VA 2F8AA 1K3OA 3VK9A 1LU4A 2IMKA 1TK5B 4J2FA 1AW9A 2GT6A 5JWOB 1K3YA 1JLWA 2R5GA 1GTBA 1ERWA 3TJFA 3TCOA 2LRCA 5B8BA 2CVBA 2AAWA 4MA9A 3KTBA 4YAVA 1K0DA 5DAKB 1GNEA 2PVQA 1XW5A 3GTUA 2M80A 1OVNA 2FY6A 3RAZA 1IYHA 3KP9A 4GRFA 1I9DA 5D9WA 4ZL9A 2DJ0A 2WRTA 1ERTA 3IK9A 16GSA 1THOA 3EU4A 4I2UA 3UARA 1B9YC 4EE0A 4JZQA 4MMMA 4OCEA 1EOHA 4FYCA 3IRAA 1TK8B 1FW1A 2XBIA 3I43A 1GH2A 4GQCA 2KUCA 4Q5QA 2D2ZA 3M1GA 4FO5A 1AXDA 17GSA 2ZCTA 3QDNA 2PBJA 4EDZA 4OCFA 1SK1A 4NXIA 1Y6EA 1Z6NA 3FY7A 2YJ7A 3C73A 5HFIA 4RQXA 5J5NA 4ZIJA 3HVXA 5JCGA 1A8LA 4HS1A 3EINA 2JZTA 2DJKA 4NMUA 2X8HA 4WF5A 1XW6A 1TJDA 1GSYA 4KGIA 4DSSB 1EWXA 3EE2A 4HI7A 4Q5NA 2GSSA 1X5EA 2XHFA 1TDIA 3WGEA 1M7TA 3G7IA 1I5GA 4N30A 3TJGA 5ID2B 1FVJA 5B6MA 3NIVA 3M9KA 1SKWB 2VCTA 1YDKA 1K0CA 4K7NA 1H75A 1R5PA 1JZWA 4K9ZA 4ZBDA 2RM6A 4IP6A 4ZB9A 1NHYA 3HXSA 5HR2A 3RDWA 2HRNA 1Z7RA 4MCUA 4F0BA 2H1BA 5DALB 3ZITA 1KTEA 1X9SB 2X99A 2VM1A 3VURA 2FWFA 4CDOA 1Z7PA 3ISOA 4EXJA 2ALBA 4GQFA 3IV4A 2F8FA 5LD0A 3P7XA 1BYEA 2H1AA 2XPDA 3GKKA 2F9SA 1SENA 1DUGA 1T7PB 4MZWA 3IXRA 4K8MA 1LJRA 3VPQA 2C4JA 3LEFA 3F9UA 2IMIA 3L0HA 4KAEA 1YZXA 3DRNA 2O87A 2C0FA 1SK0A 5IMDA 3EURA 5KEJA 4TN8A 3PR8A 2VD1A 3VWWA 2YOIA 4TR3A 1XW9A 3IDVA 2IL3A 1HNBA 2P5RA 2PERA 4G9HA 1B4PA 2VCWA 4XIHA 3SWLA 3NZNA 1ZCPA 2V2GA 2O8VB 3TJKA 2R37A 2YWOA 3Q19A 3E0UA 1WP0A 4K0NA 4FIWA 3FZ5A 1A2LA 4POMA 5ELGA 1ZYEA 3GX8A 5DCGA 2OADA 3GSSA 1SYXA 1VF1A 4G19A 1CQGA 5AIVA 2I81A 2E7PA 2DIYA 2KHPA 1A2JA 5CRWA 1VGLA 4EF0A 3ZL5A 22GSA 5D93A 1AAZA 1R26A 3DD3A 3UAPA 3TRPA 2GS3A 2ON5A 3M0FA 4TXOB 5E59A 3HDCA 4MH2A 5DAKA 2H0HA 4I97A 3G9BA 1RW1A 1F37A 1TTZA 3GHAA 4HZ2A 3TUEA 1MD4A 1E6BA 2H6XA 1B4QA 2L5OA 4KW6A 4OFMA 3CSJA 3UJ1A 3QMXA 4GSTA 1V2AA 4ECCA 2LJKA 3E3EA 1GNWA 4L8EA 4XS1A 2H6ZA 2WDUA 1S3CA 2C3TA 4I6XA 3HVVA 9GSSA 3FW2A 2H19A 3TJJA 2GQLA 2V6OA 5GSSA 3GTUB 1MTCA 4QL7A 5J9CA 1K0AA 4LL4B 2CZ3A 5ELAA 5J9BA 4KNDA 1PX7A 2MYGA 3KM6A 1BEDA 11GSA 5D9TA 3ERFA 2FCHA 3F3QA 2RUEA 5B8AA 1M0UA 3ME7A 2IPAA 3BBYA 4XRAA 5G30A 4WETA 3TRQA 5D8IA 4ZL7A 3TOUA 3L9SA 3C8EA 4WEYA 4GSNA 6GSYA 3MAKA 1THXA 4IGJA 3RPNA 4JRRA 2V32A 5COHA 2VCXA 1UN2A 1XWKA 4AGSA 4PQHA 2RLIA 2E2MA 4DVCA 4XS6A 1ST9A 1G0TA 5CRDA 5C04A 5H5SA 5AISA 2L4QA 3ZMKA 5DALA 4MH3A 5KN1A 4DEJA 1TU7A 4BVYA 5IMCA 3KCMA 4MJAA 4MF5A 1ZOFA 1JZDA 4MZBA 1AQWA 3CBUA 4CW9A 3GNJA 1R5AA 2YN1A 4BWSA 1A8YA 4FYUA 3HHVA 1PQNA 3VWUA 2DLXA 2AJQB 1HNCA 1F3BA 3BCKA 4KCEA 1EZKA 4LL1B 3GL3A 4KE3A 2FLSA 3UL3A 6GSSA 1Z9HA 5EVOA 1PD21 2CZ2A 3FR3A 2WULA 2X8GA 5CNWA 3QAWA 3A2VA 3E9JB 4ZL8A 2B5XA 5DCHA 5DVBA 2DC5A 2N5AA 4KUNA 4IQAA 2XBQA 2K8VA 4J56E 3WGXA 1GUHA 1SKRB 5ECSA 2HSYA 1NW2A 2A2SA 4BPYA 2VD0A 4PGTA 5EL8A 4P3YB 4F03A 2K8SA 4GLTA 2VCQA 2CX4A 3FZAA 1BAYA 3MWHA 2YJHA 2DJJA 4PX1A 3EU3A 3S9FA 2H0GA 2FNOA 1XOAA 2B5YA 3ZFLA 1S3DA 3I6AA 3TKPA 3O3TA 4E8HA 1XVWA 1T1VA 2MMZA 3WT1A 4XHMA 1J0FA 3IR4A 3GH9A 5CRHA 5HFKA 1QK8A 3FRCA 3C7MA 3DVXA 3KEBA 2J23A 3QD9A 4HEA2 2GQKA 1FB6A 4OFNA 2DMMA 2LKUA 1GTUA 3VWXA 1U87A 1OAZA 4JR6A 3ZFBA 3M8NA 4YQVA 4IHUA 1V9WA 19GSA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite