3LGCA

Crystal structure of glutaredoxin 1 from francisella tularensis
Total Genus 24
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
24
sequence length
89
structure length
89
Chain Sequence
SNAMKVKIYTRNGCPYCVWAKQWFEENNIAFDETIIDDYAQRSKFYDEMNQSGKVIFPISTVPQIFIDDEHIGGFTELKANADKILNKK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Crystal Structure of Glutaredoxin 1 from Francisella tularensis
rcsb
molecule keywords Glutaredoxin 1
molecule tags Unknown function
source organism Francisella tularensis subsp. tularensis
total genus 24
structure length 89
sequence length 89
ec nomenclature
pdb deposition date 2010-01-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00462 Glutaredoxin Glutaredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 3lgcA00
3LJRA 1PRXA 1X9MB 2YJ7A 2REMA 3LEFA 2P31A 3WD6A 2KOKA 4KDYA 5HQPA 4PNGA 4K7OA 2HNLA 1G6YA 3WT2A 4FYBA 3GUSA 4BWQA 1FO5A 2L4CA 4PUAA 3N9JA 1VGLA 1ACVA 5KEJA 2H0IA 1NHOA 4NAXA 7GSSA 13GSA 1V58A 2JSYA 1XOBA 4HU7A 2VD0A 2DJ0A 4F9ZA 2VUPA 4GSNA 3TUEA 5DQSA 3TJKA 4PURA 1RQMA 5DALA 1GWCA 2GZZA 2RM6A 2IPAA 5F06A 1MDKA 2IFQA 2IWTA 1PQNA 1DSBA 1U6TA 3L9UA 3FK8A 1M0UA 2TIRA 1XWAA 3MAKA 2D2ZA 5JWRB 2DJ1A 4TRXA 1ABAA 3VURA 1EEJA 3F6FA 1GSQA 1THXA 2IMIA 4EKZA 4ZL8A 4F2IA 5ID2A 5ECNB 6GSTA 1YZXA 1EEMA 3FW2A 1AAZA 1Z7RA 1BYEA 1SENA 1EOHA 8GSSA 4IN0A 1BX9A 4XRAA 2LQQA 3GKMA 1K0NA 1PX6A 2OE0A 4NV5A 4KH7A 3HYPA 3F0IA 3APOA 5JCUA 2O87A 3GFKA 5IMCA 1J0FA 2FCHA 5AISA 5CRHA 4WBRD 5HR2A 2MMOA 5IMAA 2LUSA 5J9CA 2KUCA 4EC0A 4KE3A 2JZTA 4RI7A 2DJJA 4ECCA 1K0BA 3TJBA 2YV9A 4XCSA 5IMDA 5HR3A 4EXJA 1FB0A 18GSA 3O6TA 4KUNA 4MABA 5ABRA 5CRDA 3C1RA 2VLUA 1A8YA 1BJXA 3F4TA 5KN2A 4OFNA 3ZFBA 4X0XA 1V2AA 3WYWA 2XBQA 2FUG2 2GS3A 1OC9B 2NDOA 2IIYA 2K8VA 2WRTA 2FA4A 4JEDA 5IO0A 1B9XC 4MLYA 2F9SA 4TVEA 3GURA 5J9BA 2OADA 2EIRA 1T1VA 5JCGA 3GYKA 2OKAA 2H6YA 5EPFA 2WULA 4YQMA 3TRQA 2C0GA 3RHBA 1V98A 5ECHB 2A4VA 1HQOA 2H30A 2OBIA 1B9YC 2WFCA 2FHEA 3IA1A 5GZZB 3DGQA 3ZVJD 3A2XA 11GSA 1YJ6A 3S9FA 5HR1A 5EVOA 2OE1A 3KH7A 5DBQA 1Y25A 2QKEA 3D6IA 3CBUA 4JRRA 1TU8A 2GT6A 5HFIA 1F6MC 1UVZA 3TB2A 2F8AA 5ECIB 2WDUA 4J2FA 1QQ2A 4KB3A 3LWAA 2VIMA 1NM3A 1WIKA 5G1LA 2XHFA 4F82A 1U88A 6GSUA 4FYCA 2YV7A 2KP1A 2DMMA 1TK5B 1WRYA 5FWGA 5IPGA 3EE2A 2NTOA 3V1WA 4LL1B 3TKSC 2YPMA 4DSQA 2C80A 4OCEA 1GULA 3DD3A 4TXVA 2KHPA 2B1LA 4XS6A 1A2JA 3KCMA 4I8BA 5G5EA 4K2DA 1QGVA 4QL7A 3G9BA 1YF0A 3CXGA 3TGZA 3KEBA 2AAWA 2PERA 3TJJA 1MD3A 4V2LA 4WEYA 1HD2A 3H8QA 3WGDA 2VCVA 3BCIA 2FNOA 4MA9A 4POMA 2LTKA 2L6DA 4ID0A 3E9JB 4POKA 4EDZA 4ZIJA 6GSVA 3BJ5A 3L9SA 2V1MA 4NPBA 3O76A 4GQFA 3U6VA 5HFKA 1SL1B 2LS5A 1GUHA 3L9VA 3J7Yk 5C04A 3QDNA 3ZMLA 2PU9C 3DRNA 2C3QA 2C4JA 3M0FA 4MF6A 2IN3A 4N11A 2H72A 1OAZA 2MMNA 2H71A 4KW6A 1R7HA 5LD0A 2F8FA 4IP1A 1OC9A 1BQ7A 2FGXA 4RQXA 4POBA 3TJGA 3GNJA 2HXKA 4ZB6A 4EVMA 3VWWA 3KTLA 1ILOA 1WJKA 3FZ5A 5JWOB 1WE0A 4GSTA 3UIWA 2AYTA 1TJDA 2BJXA 4QL9A 4K0NA 3IK7A 3P8WA 2CV4A 3QAWA 4N0ZA 1NSWA 1QK8A 2EIOA 2I81A 4HJ2A 1SK0A 1WMJA 3UVTA 2FWEA 3ZYWA 1M99A 4KCAA 2PGTA 2EIQA 3D22A 3KP8A 3KXOA 1YF1A 5IM9A 2K8SA 4K7IA 5LCZA 1A0RP 1U3AA 14GSA 2DJ3A 3I6AA 4K1FA 2VCXA 4MPGA 1SJ6A 2B5EA 1Z9HA 4OO5A 3W8JA 3DVWA 4I6XA 1SYXA 5IMZA 1SKSB 4WR4A 3MWHA 5A4UA 2X8HA 1ON4A 2C0EA 2FA8A 4YH2A 3RPPA 2LRCA 5KN3A 2FD3A 2GLRA 4Q5FA 3LXTA 3EMXA 3UEMA 5DDLA 2VLTA 1GL8A 2CX4A 3GHAA 1SJZA 2H74A 5KN0A 3W6GA 1J9BA 1VF4A 2YN1A 5GSTA 3WGXA 1V9WA 1E2YA 3Q6OA 1U87A 2ZCTA 2L59A 5ECRB 2FWFA 2ALBA 1O73A 1EP7A 4L0WA 1XBSA 2RLIA 3QFBC 1TRWA 3M3MA 4GXZA 5B6NA 1FG4A 4MDCA 4TW5A 4MJBA 4XIHA 3HZ4A 4HU9A 5B8BA 2C1YA 2L5LA 3QAVA 1O7UA 2CVDA 1RW1A 5HR0A 1AW9A 3A5WA 1XFLA 1M2BA 3GX8A 4OWYA 2OBKA 2LRNA 4FYUA 3IAM2 1TI1A 3D4TA 4N30A 1EOGA 2VM1A 3HZ8A 4WXTA 3IV4A 1M2DA 4RUVA 4K7NA 4PX1A 2RUEA 4PQ1A 1JZOA 1PA3A 2YWIA 1F2EA 3OR5A 1TDIA 1EV4A 3QR6A 1VF3A 2GSSA 2IL3A 5D73A 3TCOA 3KZQA 4IS0A 3CYNA 1TK0B 1AQVA 5ECKB 4IKHA 5J4UA 2H75A 1GTAA 4PUFC 2CAIA 2VOCA 4AJ7A 5CNWA 4I5QA 2C3TA 1MDJA 1RK4A 3P90A 3TKRA 1NHYA 1XPVA 4OFTA 1N8JA 5ECSA 2RM5A 2YWMA 4TR4A 1OYJA 2H66A 1PGTA 2DLXA 3MDKA 4KCEA 2VM2A 2J23A 4IW9A 3IDVA 2M80A 1VRSD 3C1SA 5G31A 4O5RA 2I4AA 3FZ4A 2ON5A 4GF0A 4WETA 1MD4A 4O32A 1UC7A 1Z3EA 6GSXA 5AIVA 4IQ1A 4N0VA 1CQGA 2MBTA 2P5QA 4ISDA 3I9V2 2LRTA 3IR4A 4IHUA 2CZ3A 5AIXA 5DJMA 2IMFA 2IMKA 2H0HA 1PSQA 1YDKA 4GWRA 3ISOA 4ACSA 4MF5A 2QSIA 1F37A 2VL9A 5CREA 1CQHA 4PNFA 2MBSA 3WGEA 1G0TA 2V6KA 3F8UA 1O6JA 1Z7PA 3WT1A 1XW5A 3F6DA 1AXDA 1UN2A 2VCQA 2GZPA 5ENUA 3RBTA 3HXSA 3APQA 1V40A 3N5OA 2LJKA 4BVYA 3KMNA 1ML6A 3VK9A 4TKYA 5L71A 2E2GA 1O8XA 4JE1A 10GSA 5FT3A 2LJAA 1OVNA 1FHEA 1ERTA 2CVBA 2GT5A 2LQOA 1B8XA 2TRXA 1GUKA 4HDEA 1FW1A 1USBA 3KIJA 5ELGA 2XC2A 3UAPA 1E6BA 2ZUPA 5IMVA 4IJIA 1AQXA 4TN8A 1Z6MA 2YJHA 4L5OA 2GQLA 4TOPA 2I3YA 3HVSA 1ERWA 1PKWA 1Y6EA 1FOVA 20GSA 4MJEA 3GSSA 3ERGA 3MNGA 4OFMA 4EUYA 1KBNA 1BAYA 2NPBA 4FH8A 1K3OA 1V57A 4XS4B 4XS1A 1EP8A 1KTEA 3EC3A 2HRNA 3BCKA 4MMMA 3ZMKA 3FKFA 1A0FA 1SK1A 5A4WA 1TKDB 1SL0B 5DCHA 5IIZA 4Z7XA 4TR3A 4GSSA 4OCFA 1J08A 2YZUA 3EVIA 1A2MA 1ZYQB 3DWVA 3UL3A 4L5LA 3DVXA 3QPMA 2YP6A 2P0GA 4MF7A 5AGYA 2YWNA 3DKSA 3ZVJA 3UARA 3C73A 2GSRA 2VO4A 3Q74A 4K8MA 3TKQA 4YQVA 5G5FA 3IAS2 4V2NA 5AN1A 1GLPA 2B5XA 5ECLB 3J7Yb 12GSA 5FHIA 1B48A 4HOJA 1GH2A 2YOIA 5GAPD 3BD2A 3VWUA 4KGIA 1MTCA 4MJAA 3E0UA 3IPZA 3F9UA 3EYTA 3LYKA 3QMXA 4IELA 2R5GA 2AHEA 5CP1A 5D8IA 3FZ9A 1EGOA 3IOSA 3VPQA 2H8LA 1AQWA 3I43A 5INYA 3L4NA 3VLNA 3BBYA 2JACA 3HD5A 4ECIA 2OE3A 3TRPA 3CSHA 4WBJA 4ZB9A 4LL4B 4O7HA 2IMEA 3C8EA 4HZ2A 1XCCA 1K0MA 1H4OA 2J9HA 4TXOB 3EMPA 3HJMA 2L57A 1F3BA 2G2QA 1T3BA 5J5NA 3NZNA 4I97A 4EE0A 4IJ3A 2WJUA 2PN8A 3K8NA 3PINA 2XPEA 1X0RA 1PD21 2GDRA 4TR0A 1C72A 2LV3A 3CMIA 2DBCA 2BTOT 3HY2A 5CAXA 1BG5A 3P2AA 2AJQB 4BVXA 1SKWB 2WS2A 4K9ZA 2X8GA 3NIVA 2JU5A 3KMOA 1IYHA 2LNTA 1JLWA 2VL2A 4WKWA 4PQIA 4ECBA 5B8AA 3LG6A 4NXIA 2HSHA 1DE2A 1A23A 3CRUA 2YZHA 2PWJA 4I2TA 4HS1A 2H0GA 2HYXA 1VF2A 3QAGA 3FRCA 2WGRA 1R5PA 3ZRDA 2VCZA 3APSA 2YNXA 1URMA 4TR1B 5CRWA 1T7PB 2DJKA 2VL3A 3HDCA 2PPTA 5F8BA 1GSSA 3QOUA 4WR5A 1GRXA 4AGSA 2GQMA 3KTBA 4LMVA 4HEA2 2E0QA 3H79A 1O81A 1T8EB 1M9BA 4H86A 3ERWA 1WPIA 1YKAA 4KDXA 4ULXA 2GZYA 4GLTA 1LBKA 5ECOB 4MZWA 2B5YA 3GTUB 1ST9A 5DQYA 4ZXGA 2VAFA 3VWXA 3IXRA 2YWOA 4NMUA 5ECPB 5E59A 3GKKA 3D5JA 1QMVA 1R5AA 2HZEB 2R6KA 3GIXA 1NW2A 2IMDA 3G7YA 1I9DA 2FWGA 3ERFA 2F3MA 6GSWA 3KM6A 3UVHA 3F3RA 3TRXA 3HKRA 5D96A 1TP9A 1M7TA 1PX7A 5D9WA 4MCUA 1TOFA 5JWQB 1ZCPA 1ZOFA 3HA9A 2B7JA 2XPDA 1OE8A 1SKRB 1XXUA 4N10A 4LLRA 3ZFLA 3UMAA 3PH9A 1TXXA 1LU4A 1JZRA 2R3XA 3G7IA 4O92A 3CRTA 4TXOA 4NHWA 3UBLA 4KA0A 2H6XA 2MYGA 4HUAA 2P5RA 3TKPA 3ED3A 4F0BA 1MDIA 1XWCA 3US3A 22GSA 2RUFA 4OD7A 1JFUA 2RIIA 3RDWA 5CRGA 2JZRA 1EV9A 4HZ4A 1K0CA 3HCZA 1THOA 4GCIA 5ELAA 4AJ8A 1YEPA 2AV4A 5IPHA 3D0ZA 4JZQA 3PGTA 4PXOA 4YAVA 2XBIA 2GSTA 2DIYA 3ZIVA 3H93A 1H75A 4RQRA 1G6WA 3ZZXA 1F3AA 1WP0A 4K6XA 4YAPA 4XRDA 4HI7A 3TOUA 4TR1A 3EURA 1Q98A 4IGJA 2WZ9A 4IQAA 3FR6A 5F05A 5EL8A 5CYYA 1A8LA 1GTUA 2CA8A 4NHZA 1HYUA 2NBSA 3KJYA 3L78A 3IC4A 3HHVA 2OACA 2K18A 4QQ7A 5G2ZA 3EU3A 2QGVA 3TJFA 4GRFA 1A2LA 3CTFA 4JR6A 1DUGA 4DEJA 3RAZA 1T00A 1SL2B 1EZKA 2WB9A 3ZL5A 4ZL9A 1M9AA 3QD9A 1Z5YE 1HNBA 4DSRA 3NOFA 2X8CA 4MZCA 4F0CA 1GSEA 5KN1A 1QXHA 3MSZA 1S3AA 3GTUA 3F63A 4L8EA 3F4SA 5EY6A 5DAKB 4OO4A 3I69A 1GNEA 5J3RA 1TTZA 2C3NA 3EU4A 3GH6A 1I5GA 3GH9A 2JZSA 2X99A 3QCPA 1X5CA 2O7KA 5B7CA 3CTGA 2HZEA 1EGRA 4KX4A 4IVFA 1KEBA 1PL1A 1BEDA 3M1GA 5G1KA 4GQCA 4L0UA 2H1GA 4D73B 3M9JA 3JCML 4KNDA 3Q18A 4CHSA 2H70A 4WF4A 2MMZA 2O85A 4ML1A 1B4PA 3ZITA 1ZYEA 2GTUA 2OA7A 1XWKA 2DC5A 4I2UA 4EL1A 1ZGNA 2V6OA 3TKSA 5D9VA 2HLSA 5DVBA 1K0AA 2O8VB 3GV1A 2JL4A 2PBJA 2K9FA 3SBCA 3LFLA 1T4ZA 2YCDA 1FVKA 5E4WA 1UA5A 4GTUA 1K0DA 2OJLA 2GVPA 2GSQA 1DE1A 2A2RA 4ILFA 4YQUA 4IBPA 1JZDA 2H1DA 5ECMB 1JLVA 2MMAA 3GSTA 3PR8A 2E7PA 1TK8B 1SYRA 5GSSA 4HQSA 4XHMA 1HNAA 2VCTA 3C71A 3HJOA 2AB6A 3GN3A 3HJPA 1XVWA 1TRUA 6GSSA 16GSA 3A2WA 4EF0A 4JBBA 1XWBA 3ZTLA 4KSOA 3D21A 2F51A 1B4QA 3CSJA 3LORA 1FAAA 3GMFA 2H76A 2H73A 3ZLPA 3FR9A 2L6CA 3LYPA 1N2AA 2LNSA 3RHCA 4ZL7A 2LEGA 4FIWA 3R2QA 2H1BA 4V2MA 2FY6A 1TI3A 2ES7A 2AUVA 3VPTA 1GP1A 2B1KA 4MP4A 1GSYA 4BWSA 1R26A 2V41A 5IOWA 3GKXA 2KP2A 1YY7A 3FY7A 4PQHA 2CX3A 3ME8A 5DCGA 4MPFA 4ZB8A 2V2GA 2O89A 2B7KA 4DVCA 2NVLA 1GTIA 4ZBDA 3IK9A 2TRCP 3C7MA 4CW9A 4Q5RA 1JZWA 5DAKA 4AJ6A 2V32A 3GRXA 1YKCA 1SD9A 5ECQB 3VWVA 5J41A 4J56E 2HT9A 3GL3A 3M8NA 1EWXA 4BA7A 5D9TA 1S3DA 5D9XA 1W4VA 1K3YA 2H6ZA 2G0FA 1TW9A 2CVKA 4KSMA 3DIEA 1XWGA 2H01A 4D73A 2VCWA 4WF5A 9GSSA 1HNCA 4G2EA 2R4VA 2PVQA 1KNGA 3FHKA 4JR4A 3IHQA 1GNWA 1XVQA 2DIZA 2K6VA 3KD0A 3GA4A 2C8UA 2CZ2A 2B6MA 3A3TA 2BMXA 1ZL9A 3A2VA 5JCWA 3UBKA 3TOTA 4HJMA 3P7XA 2HE3A 3EINA 2JSZA 1QFNA 5IO2A 2R37A 1W89A 3F3QA 2DSAA 3RPNA 2FWHA 3HVVA 3FZAA 5B6MA 2QC7A 4V1Ap 3VI5A 4DSSB 3GL5A 2L5OA 3CSIA 2JADA 3H1NA 3ZREA 1K0OA 2C0FA 1GSFA 1TRSA 5H5SA 1G7OA 4EDYA 4BL7A 4PGTA 1R4WA 1O85A 1S3CA 3BOAA 1G7EA 4V1Ag 1OKTA 1GSDA 1ZMAA 5C00A 4G10A 1ERVA 3EWLA 4P3YB 4XTSA 4HQZA 2H1AA 4CDOA 4AF2A 17GSA 3UJ1A 3UOMA 4XS4A 2PUKC 5LNKe 1X5DA 2A2SA 1PN9A 3E3EA 5CO3A 1AC1A 4ZBAA 2GGTA 4MJCA 2DMLA 2LJRA 2HI7A 1DBYA 5H5QA 2C0DA 4ECJA 1OC8A 1MEKA 1Z6NA 3M9KA 2CAQA 2CT6A 1IYIA 3FR3A 1U3IA 2R2JA 2FLSA 3DEXA 1XW6A 2IJYA 3DMLA 19GSA 2KLXA 4F03A 3W8SA 2X64A 1TU7A 1VF1A 2M72A 4NV2A 1SK2A 2YANA 3IBHA 1FB6A 4JU5A 1AIUA 4X43A 1GUMA 1PMTA 5HFGA 3DXBA 4Q5NA 1SJIA 2HFDA 4G9HA 3LGCA 1X9SB 3IE3A 5A4VA 2HZFA 2WCIA 5H5RA 3ZIJA 5GAND 2N5BA 1WWJA 4KDUA 4BPYA 2VLVA 3GKNA 1WOUA 4MH2A 2M46A 5DALB 6GSYA 4KAEA 2IFQB 1O8WA 2PVOC 2Z9SA 3IRAA 2N5AA 1SU9A 4LMWA 4ML6A 4K0GA 4NWYA 1YEXA 5DJLA 4E8HA 2LKUA 1SD8A 3HVXA 3TDGA 3AY8A 3O3TA 1XW9A 2MZCA 5ID2B 5COHA 1ZZYA 5D93A 4G19A 4J57E 2EC4A 1A24A 3KP9A 4MK3A 4FO5A 3DYRA 1JHBA 2DJ2A 3U5RE 4LA1A 4OMVA 4X1UA 2L4QA 2ON7A 4Q5QA 4DSSA 1QUWA 5G30A 3LXZA 1PKZA 2PMTA 5IQYA 5A5KA 4E8EA 1GTBA 3ME7A 3VI7A 4EO3A 3TKSE 1M2AA 1GLQA 2VL2C 1OC3A 4RI6A 4IP6A 1XZOA 1T4YA 4ZBBA 2I9HA 3L0HA 4ZILA 2CQ9A 2HRFA 4MH3A 3G7JA 2I1UA 3VFIA 3H4KA 2E2MA 3Q19A 3KH9A 5IMFA 1PL2A 2ZNMA 1XIYA 5F07A 3LQ7A 1X9WB 1XOAA 1LJRA 1F9MA 2VD1A 1AUCA 3FYGA 2H19A 1YQ1A 1X5EA 4MZBA 3F4RA 2LSTA 1ERUA 5F0GA 1K3LA 3SWLA 1GSUA 3FEUA 3QFAC 2GQKA 3KGKA 2HSYA 2N5FA 1OE7A 4POLA 1FVJA 1TRVA 3GX0A 1OKDA 3LSZA 1Q4JA 3D4MA 2B3SA 5IOXA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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